FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1122, 1028 aa 1>>>pF1KA1122 1028 - 1028 aa - 1028 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0751+/-0.00114; mu= 14.3920+/- 0.069 mean_var=125.3004+/-24.963, 0's: 0 Z-trim(106.2): 68 B-trim: 16 in 1/50 Lambda= 0.114577 statistics sampled from 8772 (8837) to 8772 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.616), E-opt: 0.2 (0.271), width: 16 Scan time: 3.430 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS47101.1 SMARCAD1 gene_id:56916|Hs108|chr4 (1028) 6713 1121.9 0 CCDS3639.1 SMARCAD1 gene_id:56916|Hs108|chr4 (1026) 6689 1117.9 0 CCDS58914.1 SMARCAD1 gene_id:56916|Hs108|chr4 ( 596) 3907 657.9 1.8e-188 CCDS7419.1 BTAF1 gene_id:9044|Hs108|chr10 (1849) 874 156.9 3.7e-37 CCDS35329.1 ERCC6L gene_id:54821|Hs108|chrX (1250) 730 133.0 4e-30 CCDS73164.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 700) 675 123.7 1.3e-27 CCDS73165.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 714) 674 123.5 1.5e-27 CCDS7434.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 838) 674 123.6 1.8e-27 CCDS35072.1 ERCC6L2 gene_id:375748|Hs108|chr9 ( 712) 600 111.3 7.4e-24 CCDS73162.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 884) 567 105.9 3.9e-22 CCDS10071.1 INO80 gene_id:54617|Hs108|chr15 (1556) 521 98.5 1.2e-19 CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16 (3230) 526 99.5 1.2e-19 CCDS73163.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 740) 505 95.6 4.1e-19 CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4 (1052) 461 88.4 8.4e-17 CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1058) 453 87.1 2.1e-16 CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2302) 453 87.3 3.9e-16 CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2581) 453 87.4 4.3e-16 CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1905) 445 86.0 8.5e-16 CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1912) 445 86.0 8.5e-16 CCDS34204.1 CHD1 gene_id:1105|Hs108|chr5 (1710) 440 85.1 1.4e-15 CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15 (1828) 439 85.0 1.6e-15 CCDS7229.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10 (1493) 436 84.4 1.9e-15 CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1 (1954) 435 84.3 2.7e-15 CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1613) 431 83.6 3.7e-15 CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1614) 431 83.6 3.7e-15 CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1616) 431 83.6 3.7e-15 CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1617) 431 83.6 3.7e-15 CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1647) 431 83.6 3.7e-15 CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8 (2997) 435 84.4 3.8e-15 CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (1966) 431 83.7 4.3e-15 CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2000) 431 83.7 4.4e-15 CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2059) 431 83.7 4.5e-15 CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20 (2715) 428 83.2 7.9e-15 CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2881) 427 83.1 9.3e-15 CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2897) 427 83.1 9.3e-15 CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1514) 420 81.8 1.2e-14 CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1572) 420 81.8 1.3e-14 CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1590) 420 81.8 1.3e-14 CCDS58022.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 616) 408 79.5 2.3e-14 CCDS58021.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 693) 408 79.6 2.6e-14 CCDS72882.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 797) 408 79.6 2.9e-14 CCDS927.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 897) 408 79.6 3.2e-14 CCDS31929.2 EP400 gene_id:57634|Hs108|chr12 (3123) 382 75.7 1.7e-12 CCDS75768.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8 ( 726) 368 73.0 2.6e-12 CCDS6262.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8 ( 910) 368 73.0 3.2e-12 CCDS532.1 RAD54L gene_id:8438|Hs108|chr1 ( 747) 364 72.3 4.2e-12 >>CCDS47101.1 SMARCAD1 gene_id:56916|Hs108|chr4 (1028 aa) initn: 6713 init1: 6713 opt: 6713 Z-score: 6000.6 bits: 1121.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6713; 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CCDS74 YKLHGILCDDMGLGKTLQSICILAGDHCHRAQEYARSKLAECMPLPSLVVCPPTLTGHWV 1290 1300 1310 1320 1330 1340 570 580 590 600 610 pF1KA1 REVNLWCPT--LKVLCYYGSQEERKQIRFNIHSRYEDYNVIVTTYNCAISSSDDRSLFRR ::. .: :. : : : :: ... .. . .:.::..:. . .: ..:: CCDS74 DEVGKFCSREYLNPLHYTGPPTERIRLQHQV----KRHNLIVASYDVV---RNDIDFFRN 1350 1360 1370 1380 1390 620 630 640 650 660 670 pF1KA1 LKLNYAIFDEGHMLKNMGSIRYQHLMTINANNRLLLTGTPVQNNLLELMSLLNFVMPHMF .:.:: :.::::..:: . . . ..:: :..:.:::.:::.::: ::..:.:: .. CCDS74 IKFNYCILDEGHVIKNGKTKLSKAVKQLTANYRIILSGTPIQNNVLELWSLFDFLMPGFL 1400 1410 1420 1430 1440 1450 680 690 700 710 720 730 pF1KA1 SSSTSEIRRMFSSKTKSADEQSIYEKERI------AHAKQIIKPFILRRVKEEVLKQLPP .. . :. . : : .: .... : .:.. ::.:::.::.::..::: CCDS74 GTERQFAARYGKPILASRDARSSSREQEAGVLAMDALHRQVL-PFLLRRMKEDVLQDLPP 1460 1470 1480 1490 1500 1510 740 750 760 770 780 790 pF1KA1 KKDRIELCAMSEKQEQLYLGLF-NRLKKSINNLVTEKNTEMCNVMMQLRKMANHPLLHRQ : . :..: : ::: . .: : .... :. . . .: : ..: . : CCDS74 KIIQDYYCTLSPLQVQLYEDFAKSRAKCDVDETVSSATLSEETEKPKL-KATGHVFQALQ 1520 1530 1540 1550 1560 1570 800 810 820 830 840 850 pF1KA1 YYTAEKLKEMSQLMLKEPTHCEANPDLIFEDMEVMTDFELHVLCKQYRHINNFQLDMDLI : .:: . :.: : : : . : . :... :: . . . :: .: CCDS74 YL--RKLCNHPALVLT-PQHPEFKTTA--EKLAVQNS-SLHDIQHAPKLSALKQLLLDCG 1580 1590 1600 1610 1620 860 870 880 890 900 pF1KA1 LDSGKFRVLGCILSELKQKGDRVVLFSQFTMMLDILEV-LLKHHQHR--YLRLDGKTQIS : .:. : .: :...: :. ::::.: ::: : ::::::. . CCDS74 LGNGSTSESG---TESVVAQHRILIFCQLKSMLDIVEHDLLKPHLPSVTYLRLDGSIPPG 1630 1640 1650 1660 1670 1680 910 920 930 940 950 960 pF1KA1 ERIHLIDEFNTDMDIFVFLLSTKAGGLGINLTSANVVILHDIDCNPYNDKQAEDRCHRVG .: ....::.: .: :.::.:..::::.:::.:..:.. . : ::. : :: :: ::.: CCDS74 QRHSIVSRFNNDPSIDVLLLTTHVGGLGLNLTGADTVVFVEHDWNPMRDLQAMDRAHRIG 1690 1700 1710 1720 1730 1740 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KA1 QTKEVLVIKLISQGTIEESMLKINQQKLKLEQDMTTVDEGDEGSMPADIATLLKTSMGL : . : : .::..::.::... ... :... . . . .... :: .: CCDS74 QKRVVNVYRLITRGTLEEKIMGLQKFKMNIANTVISQENSSLQSMGTDQLLDLFTLDKDG 1750 1760 1770 1780 1790 1800 CCDS74 KAEKADTSTSGKASMKSILENLSDLWDQEQYDSEYSLENFMHSLK 1810 1820 1830 1840 >>CCDS35329.1 ERCC6L gene_id:54821|Hs108|chrX (1250 aa) initn: 697 init1: 307 opt: 730 Z-score: 654.4 bits: 133.0 E(32554): 4e-30 Smith-Waterman score: 749; 32.4% identity (61.7% similar) in 527 aa overlap (500-991:99-596) 470 480 490 500 510 520 pF1KA1 TKQVTMLTGNGGGWNIEQPSILNQSLSLKPYQKVGLNWLALVHKHGLNG-ILADEMGLGK .:: :. .: ... : .: ::::.::::: CCDS35 ELAEQGDDEFTDVCNSGLLLYRELHNQLFEHQKEGIAFLYSLYRDGRKGGILADDMGLGK 70 80 90 100 110 120 530 540 550 560 570 580 pF1KA1 TIQAIAFLAYLYQEGNNGPHLIVVPASTIDNWLREVNLWCPTLKVLCYYG-SQEERKQIR :.: ::::. ... . . :...:.. :..:..: : : ..: ..: :..:: . CCDS35 TVQIIAFLSGMFDASLVNHVLLIMPTNLINTWVKEFIKWTPGMRVKTFHGPSKDERTR-- 130 140 150 160 170 180 590 600 610 620 630 640 pF1KA1 FNIHSRYEDYNVIVTTYNCAISSSDDRSLFRRLKL--NYAIFDEGHMLKNMGSIRYQHLM :.. . .::.:::. :.. .. : :: .. .:.:.::.: .:. .. CCDS35 -NLNRIQQRNGVIITTYQMLINNWQQLSSFRGQEFVWDYVILDEAHKIKTSSTKSAICAR 190 200 210 220 230 240 650 660 670 680 690 700 pF1KA1 TINANNRLLLTGTPVQNNLLELMSLLNFVMPHMFSSSTSEIRRMFSSKTKSADEQSIYEK .: :.:::::::::.:::: :: ::..:. . .. . .. . . : :.. CCDS35 AIPASNRLLLTGTPIQNNLQELWSLFDFACQGSLLGTLKTFKMEYENPITRAREKDATPG 250 260 270 280 290 300 710 720 730 740 pF1KA1 ERIAHAK------QIIKPFILRRVKEEVLKQL---P--------PKKDRI-ELCAMSEK- :. : ::::..:::.::.: :. : : : : :. ..:.: CCDS35 EKALGFKISENLMAIIKPYFLRRTKEDVQKKKSSNPEARLNEKNPDVDAICEMPSLSRKN 310 320 330 340 350 360 750 760 770 780 790 pF1KA1 -----------QEQLYLGLFNRLKKSINNLVTEKNTEMCNVMMQLRKMANHPLLHRQYYT ::..: : : . :..:. : . . .. . :.:. .:: : CCDS35 DLIIWIRLVPLQEEIYRK-FVSLDH-IKELLMETRSPLAELGV-LKKLCDHPRLLSA--R 370 380 390 400 410 420 800 810 820 830 840 850 pF1KA1 AEKLKEMSQLMLKEPTHCEANPDLIFEDMEVMTDFELHVLCKQYRHINNFQLDMDLILDS : : ... . .. .. : .::. : ::.. : :. .: CCDS35 ACCLLNLGTFSAQDGNEGEDSPDV---------D-----------HIDQVTDDT-LMEES 430 440 450 860 870 880 890 900 910 pF1KA1 GKFRVLGCILSELKQKGDRVVLFSQFTMMLDILEVLLKHHQHRYLRLDGK-TQISERIHL ::. : .:..:...: ....::: ..:.:.: :::... . ::.:: :.. :: . CCDS35 GKMIFLMDLLKRLRDEGHQTLVFSQSRQILNIIERLLKNRHFKTLRIDGTVTHLLEREKR 460 470 480 490 500 510 920 930 940 950 960 970 pF1KA1 IDEFNTDMDIFVFLLSTKAGGLGINLTSANVVILHDIDCNPYNDKQAEDRCHRVGQTKEV :. :. . : ::::.:..::.:..::.:. :.. : . :: .: :: :: .:.:: ..: CCDS35 INLFQQNKDYSVFLLTTQVGGVGLTLTAATRVVIFDPSWNPATDAQAVDRVYRIGQKENV 520 530 540 550 560 570 980 990 1000 1010 1020 pF1KA1 LVIKLISQGTIEESMLKINQQKLKLEQDMTTVDEGDEGSMPADIATLLKTSMGL .: .::. ::.::.. . CCDS35 VVYRLITCGTVEEKIYRRQVFKDSLIRQTTGEKKNPFRYFSKQELRELFTIEDLQNSVTQ 580 590 600 610 620 630 >>CCDS73164.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 (700 aa) initn: 1136 init1: 508 opt: 675 Z-score: 608.9 bits: 123.7 E(32554): 1.3e-27 Smith-Waterman score: 1139; 36.2% identity (64.9% similar) in 619 aa overlap (410-1001:4-606) 380 390 400 410 420 430 pF1KA1 VMEDGYKGKILHFLQDASIGELTLIPQCSQKKAQKITELRPFNSWEALFTKMSKTNGLSE :..:.: . :. : . :.:: : CCDS73 MQVKRSQEILSVAKKNKKENEDENSSSTNLCVE 10 20 30 440 450 460 470 480 490 pF1KA1 DLIWH--CKTLIQER-DVVIRLMNKCEDISNKLTKQVTMLTGNGGGWNIEQPSILNQSLS :: . ...:..: . ..: .: . . . : :: ..::. .. .. CCDS73 DLQKNKDSNSIIKDRLSETVRQNTKF--FFDPVRKC------NGQPVPFQQPKHFTGGV- 40 50 60 70 80 500 510 520 530 540 550 pF1KA1 LKPYQKVGLNWLALVHKHGLNGILADEMGLGKTIQAIAFLAYLYQEGNNGPHLIVVPAST .. :: :..:: .. ..:.:::::::::::::.: :: .: . :.: :: :. : :: CCDS73 MRWYQVEGMEWLRMLWENGINGILADEMGLGKTVQCIATIALMIQRGVPGPFLVCGPLST 90 100 110 120 130 140 560 570 580 590 600 610 pF1KA1 IDNWLREVNLWCPTLKVLCYYGSQEERKQIRFNIHSR---YEDYNVIVTTYNCAISSSDD . ::. : . . : . .. :.:.::::... ::..: . . :..:... :. : CCDS73 LPNWMAEFKRFTPDIPTMLYHGTQEERQKLVRNIYKRKGTLQIHPVVITSFEIAMR---D 150 160 170 180 190 200 620 630 640 650 660 670 pF1KA1 RSLFRRLKLNYAIFDEGHMLKNMGSIRYQHLMTINANNRLLLTGTPVQNNLLELMSLLNF :. ... .: : :::: .::: ..: .::.:.:::::::.:::: :: ::::: CCDS73 RNALQHCYWKYLIVDEGHRIKNMKCRLIRELKRFNADNKLLLTGTPLQNNLSELWSLLNF 210 220 230 240 250 260 680 690 700 710 720 pF1KA1 VMPHMFSSSTSEIRRMFSSKTKSADEQSIYEKER---IAHA-KQIIKPFILRRVKEEVLK ..: .:.. : .. :. . : ..: ::: . : .::. ::.:::.: .: CCDS73 LLPDVFDDLKS-FESWFDITSLSETAEDIIAKEREQNVLHMLHQILTPFLLRRLKSDVAL 270 280 290 300 310 320 730 740 750 760 770 780 pF1KA1 QLPPKKDRIELCAMSEKQEQLYLGLFNRLKKSINNLV--TEKNT-EMCNV---MMQLRKM ..:::.. . .:.::: .: .. :: .: :. .::.: :. . . :: CCDS73 EVPPKREVVVYAPLSKKQEIFYTAIVNR---TIANMFGSSEKETIELSPTGRPKRRTRKS 330 340 350 360 370 790 800 810 820 830 840 pF1KA1 ANHPLLHRQYYTAEKL-KEMSQLMLKEPTHCEANPDLIFE-DMEVMTDFELHVLCKQYRH :. . ::: .... . .: . :.: . : ...... . : : .. . CCDS73 INYSKIDDFPNELEKLISQIQPEVDRERAVVEVNIPVESEVNLKLQNIMMLLRKCCNHPY 380 390 400 410 420 430 850 860 870 880 890 pF1KA1 I---------NNFQLDMDLILDSGKFRVLGCILSELKQKGDRVVLFSQFTMMLDILEVLL . ..:..: .:. .:::: .: .: :::..: .:.::::.: ::::: CCDS73 LIEYPIDPVTQEFKIDEELVTNSGKFLILDRMLPELKKRGHKVLLFSQMTSMLDILMDYC 440 450 460 470 480 490 900 910 920 930 940 950 pF1KA1 KHHQHRYLRLDGKTQISERIHLIDEFNTDMDIFVFLLSTKAGGLGINLTSANVVILHDID . .. . ::::. . ::: . . :::: ..:.::.::.:::::::::.:..::..: : CCDS73 HLRDFNFSRLDGSMSYSEREKNMHSFNTDPEVFIFLVSTRAGGLGINLTAADTVIIYDSD 500 510 520 530 540 550 960 970 980 990 1000 1010 pF1KA1 CNPYNDKQAEDRCHRVGQTKEVLVIKLISQGTIEESMLKINQQKLKLEQDMTTVDEGDEG :: .: ::.:::::.:::: :.: .:.. .::...... : :::. CCDS73 WNPQSDLQAQDRCHRIGQTKPVVVYRLVTANTIDQKIVERAAAKRKLEKLIIHKNHFKGG 560 570 580 590 600 610 1020 pF1KA1 SMPADIATLLKTSMGL CCDS73 QSGLNLSKNFLDPKELMELLKSRDYEREIKGSREKVISDKDLELLLDRSDLIDQMNASGP 620 630 640 650 660 670 >>CCDS73165.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 (714 aa) initn: 1136 init1: 508 opt: 674 Z-score: 607.9 bits: 123.5 E(32554): 1.5e-27 Smith-Waterman score: 1137; 38.0% identity (66.9% similar) in 547 aa overlap (479-1001:82-620) 450 460 470 480 490 500 pF1KA1 IQERDVVIRLMNKCEDISNKLTKQVTMLTGNGGGWNIEQPSILNQSLSLKPYQKVGLNWL :: ..::. .. .. .. :: :..:: CCDS73 NKDSNSIIKDRLSETVRQNTKFFFDPVRKCNGQPVPFQQPKHFTGGV-MRWYQVEGMEWL 60 70 80 90 100 110 510 520 530 540 550 560 pF1KA1 ALVHKHGLNGILADEMGLGKTIQAIAFLAYLYQEGNNGPHLIVVPASTIDNWLREVNLWC .. ..:.:::::::::::::.: :: .: . :.: :: :. : ::. ::. : . . CCDS73 RMLWENGINGILADEMGLGKTVQCIATIALMIQRGVPGPFLVCGPLSTLPNWMAEFKRFT 120 130 140 150 160 170 570 580 590 600 610 620 pF1KA1 PTLKVLCYYGSQEERKQIRFNIHSR---YEDYNVIVTTYNCAISSSDDRSLFRRLKLNYA : . .. :.:.::::... ::..: . . :..:... :. ::. ... .: CCDS73 PDIPTMLYHGTQEERQKLVRNIYKRKGTLQIHPVVITSFEIAMR---DRNALQHCYWKYL 180 190 200 210 220 630 640 650 660 670 680 pF1KA1 IFDEGHMLKNMGSIRYQHLMTINANNRLLLTGTPVQNNLLELMSLLNFVMPHMFSSSTSE : :::: .::: ..: .::.:.:::::::.:::: :: :::::..: .:.. : CCDS73 IVDEGHRIKNMKCRLIRELKRFNADNKLLLTGTPLQNNLSELWSLLNFLLPDVFDDLKS- 230 240 250 260 270 280 690 700 710 720 730 740 pF1KA1 IRRMFSSKTKSADEQSIYEKER---IAHA-KQIIKPFILRRVKEEVLKQLPPKKDRIELC .. :. . : ..: ::: . : .::. ::.:::.: .: ..:::.. . CCDS73 FESWFDITSLSETAEDIIAKEREQNVLHMLHQILTPFLLRRLKSDVALEVPPKREVVVYA 290 300 310 320 330 340 750 760 770 780 790 pF1KA1 AMSEKQEQLYLGLFNRLKKSINNLV--TEKNT-EMCNV---MMQLRKMANHPLLHRQYYT .:.::: .: .. :: .: :. .::.: :. . . :: :. . CCDS73 PLSKKQEIFYTAIVNR---TIANMFGSSEKETIELSPTGRPKRRTRKSINYSKIDDFPNE 350 360 370 380 390 400 800 810 820 830 840 pF1KA1 AEKL-KEMSQLMLKEPTHCEANPDLIFE-DMEVMTDFELHVLCKQYRHI---------NN ::: .... . .: . :.: . : ...... . : : .. .. .. CCDS73 LEKLISQIQPEVDRERAVVEVNIPVESEVNLKLQNIMMLLRKCCNHPYLIEYPIDPVTQE 410 420 430 440 450 460 850 860 870 880 890 900 pF1KA1 FQLDMDLILDSGKFRVLGCILSELKQKGDRVVLFSQFTMMLDILEVLLKHHQHRYLRLDG :..: .:. .:::: .: .: :::..: .:.::::.: ::::: . .. . :::: CCDS73 FKIDEELVTNSGKFLILDRMLPELKKRGHKVLLFSQMTSMLDILMDYCHLRDFNFSRLDG 470 480 490 500 510 520 910 920 930 940 950 960 pF1KA1 KTQISERIHLIDEFNTDMDIFVFLLSTKAGGLGINLTSANVVILHDIDCNPYNDKQAEDR . . ::: . . :::: ..:.::.::.:::::::::.:..::..: : :: .: ::.:: CCDS73 SMSYSEREKNMHSFNTDPEVFIFLVSTRAGGLGINLTAADTVIIYDSDWNPQSDLQAQDR 530 540 550 560 570 580 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KA1 CHRVGQTKEVLVIKLISQGTIEESMLKINQQKLKLEQDMTTVDEGDEGSMPADIATLLKT :::.:::: :.: .:.. .::...... : :::. CCDS73 CHRIGQTKPVVVYRLVTANTIDQKIVERAAAKRKLEKLIIHKNHFKGGQSGLNLSKNFLD 590 600 610 620 630 640 pF1KA1 SMGL CCDS73 PKELMELLKSRDYEREIKGSREKVISDKDLELLLDRSDLIDQMNASGPIKEKMGIFKILE 650 660 670 680 690 700 >>CCDS7434.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 (838 aa) initn: 1136 init1: 508 opt: 674 Z-score: 606.9 bits: 123.6 E(32554): 1.8e-27 Smith-Waterman score: 1137; 38.0% identity (66.9% similar) in 547 aa overlap (479-1001:206-744) 450 460 470 480 490 500 pF1KA1 IQERDVVIRLMNKCEDISNKLTKQVTMLTGNGGGWNIEQPSILNQSLSLKPYQKVGLNWL :: ..::. .. .. .. :: :..:: CCDS74 NKDSNSIIKDRLSETVRQNTKFFFDPVRKCNGQPVPFQQPKHFTGGV-MRWYQVEGMEWL 180 190 200 210 220 230 510 520 530 540 550 560 pF1KA1 ALVHKHGLNGILADEMGLGKTIQAIAFLAYLYQEGNNGPHLIVVPASTIDNWLREVNLWC .. ..:.:::::::::::::.: :: .: . :.: :: :. : ::. ::. : . . CCDS74 RMLWENGINGILADEMGLGKTVQCIATIALMIQRGVPGPFLVCGPLSTLPNWMAEFKRFT 240 250 260 270 280 290 570 580 590 600 610 620 pF1KA1 PTLKVLCYYGSQEERKQIRFNIHSR---YEDYNVIVTTYNCAISSSDDRSLFRRLKLNYA : . .. :.:.::::... ::..: . . :..:... :. ::. ... .: CCDS74 PDIPTMLYHGTQEERQKLVRNIYKRKGTLQIHPVVITSFEIAMR---DRNALQHCYWKYL 300 310 320 330 340 350 630 640 650 660 670 680 pF1KA1 IFDEGHMLKNMGSIRYQHLMTINANNRLLLTGTPVQNNLLELMSLLNFVMPHMFSSSTSE : :::: .::: ..: .::.:.:::::::.:::: :: :::::..: .:.. : CCDS74 IVDEGHRIKNMKCRLIRELKRFNADNKLLLTGTPLQNNLSELWSLLNFLLPDVFDDLKS- 360 370 380 390 400 410 690 700 710 720 730 740 pF1KA1 IRRMFSSKTKSADEQSIYEKER---IAHA-KQIIKPFILRRVKEEVLKQLPPKKDRIELC .. :. . : ..: ::: . : .::. ::.:::.: .: ..:::.. . CCDS74 FESWFDITSLSETAEDIIAKEREQNVLHMLHQILTPFLLRRLKSDVALEVPPKREVVVYA 420 430 440 450 460 470 750 760 770 780 790 pF1KA1 AMSEKQEQLYLGLFNRLKKSINNLV--TEKNT-EMCNV---MMQLRKMANHPLLHRQYYT .:.::: .: .. :: .: :. .::.: :. . . :: :. . CCDS74 PLSKKQEIFYTAIVNR---TIANMFGSSEKETIELSPTGRPKRRTRKSINYSKIDDFPNE 480 490 500 510 520 800 810 820 830 840 pF1KA1 AEKL-KEMSQLMLKEPTHCEANPDLIFE-DMEVMTDFELHVLCKQYRHI---------NN ::: .... . .: . :.: . : ...... . : : .. .. .. CCDS74 LEKLISQIQPEVDRERAVVEVNIPVESEVNLKLQNIMMLLRKCCNHPYLIEYPIDPVTQE 530 540 550 560 570 580 850 860 870 880 890 900 pF1KA1 FQLDMDLILDSGKFRVLGCILSELKQKGDRVVLFSQFTMMLDILEVLLKHHQHRYLRLDG :..: .:. .:::: .: .: :::..: .:.::::.: ::::: . .. . :::: CCDS74 FKIDEELVTNSGKFLILDRMLPELKKRGHKVLLFSQMTSMLDILMDYCHLRDFNFSRLDG 590 600 610 620 630 640 910 920 930 940 950 960 pF1KA1 KTQISERIHLIDEFNTDMDIFVFLLSTKAGGLGINLTSANVVILHDIDCNPYNDKQAEDR . . ::: . . :::: ..:.::.::.:::::::::.:..::..: : :: .: ::.:: CCDS74 SMSYSEREKNMHSFNTDPEVFIFLVSTRAGGLGINLTAADTVIIYDSDWNPQSDLQAQDR 650 660 670 680 690 700 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KA1 CHRVGQTKEVLVIKLISQGTIEESMLKINQQKLKLEQDMTTVDEGDEGSMPADIATLLKT :::.:::: :.: .:.. .::...... : :::. CCDS74 CHRIGQTKPVVVYRLVTANTIDQKIVERAAAKRKLEKLIIHKNHFKGGQSGLNLSKNFLD 710 720 730 740 750 760 pF1KA1 SMGL CCDS74 PKELMELLKSRDYEREIKGSREKVISDKDLELLLDRSDLIDQMNASGPIKEKMGIFKILE 770 780 790 800 810 820 >>CCDS35072.1 ERCC6L2 gene_id:375748|Hs108|chr9 (712 aa) initn: 719 init1: 389 opt: 600 Z-score: 541.8 bits: 111.3 E(32554): 7.4e-24 Smith-Waterman score: 703; 29.6% identity (59.7% similar) in 554 aa overlap (488-997:127-662) 460 470 480 490 500 510 pF1KA1 LMNKCEDISNKLTKQVTMLTGNGGGWNIEQPSILNQSLSLKPYQKVGLNWLALVHKHGLN : .:. :. ::. : .: . :: . CCDS35 DEDLEKPYFPNRKFPSSSVAFKLSDNGDSIPYTINRY--LRDYQREGTRFLYGHYIHGGG 100 110 120 130 140 150 520 530 540 550 pF1KA1 GILADEMGLGKTIQAIAFLA-YLYQEG------NNGPH-------------------LIV ::.:.::::::.:.:.::: :...: :: :. ::: CCDS35 CILGDDMGLGKTVQVISFLAAVLHKKGTREDIENNMPEFLLRSMKKEPLSSTAKKMFLIV 160 170 180 190 200 210 560 570 580 590 600 610 pF1KA1 VPASTIDNWLREVNLWCPTLKVLCYYGSQEERKQIRFNIHSRYEDYNVIVTTYNCAISSS .: :.. :: :.. : ..: .:.... . :: ...: . . .:::. 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CCDS35 YKTNSHGETVKTLYLSYLT-VLQKVANHVAL---LQAASTSKQQETLIKRICDQVFSRFP 450 460 470 480 490 850 860 870 880 890 pF1KA1 NF-QLDMDLILD-------SGKFRVLGCILSELKQKGDRVVLFSQFTMMLDILEVLLKHH .: : . : .. :::..:: .:.. ... :.:.::: : .::.:. 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