FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1124, 1711 aa 1>>>pF1KA1124 1711 - 1711 aa - 1711 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.3468+/-0.000646; mu= -30.8409+/- 0.040 mean_var=1054.5060+/-220.524, 0's: 0 Z-trim(119.8): 1170 B-trim: 0 in 0/60 Lambda= 0.039496 statistics sampled from 32887 (34149) to 32887 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.699), E-opt: 0.2 (0.4), width: 16 Scan time: 16.950 The best scores are: opt bits E(85289) NP_006026 (OMIM: 614062) serine/threonine-protein (1711) 11304 662.1 1.2e-188 XP_011542609 (OMIM: 603412) PREDICTED: serine/thre (1810) 6993 416.5 1.1e-114 XP_005273379 (OMIM: 603412) PREDICTED: serine/thre (1754) 6671 398.2 3.5e-109 XP_006711897 (OMIM: 603412) PREDICTED: serine/thre (1816) 6648 396.9 9e-109 XP_005268286 (OMIM: 614062) PREDICTED: serine/thre (1685) 6437 384.8 3.6e-105 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1290 1300 1310 1320 pF1KA1 GLYVIEVTRDVIVRAADCKKVHQIELAPREKIVILLCGRNHHVHLYPWSSLDGAEGSFDI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 GLYVIEVTRDVIVRAADCKKVHQIELAPREKIVILLCGRNHHVHLYPWSSLDGAEGSFDI 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KA1 KLPETKGCQLMATATLKRNSGTCLFVAVKRLILCYEIQRTKPFHRKFNEIVAPGSVQCLA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 KLPETKGCQLMATATLKRNSGTCLFVAVKRLILCYEIQRTKPFHRKFNEIVAPGSVQCLA 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KA1 VLRDRLCVGYPSGFCLLSIQGDGQPLNLVNPNDPSLAFLSQQSFDALCAVELESEEYLLC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 VLRDRLCVGYPSGFCLLSIQGDGQPLNLVNPNDPSLAFLSQQSFDALCAVELESEEYLLC 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KA1 FSHMGLYVDPQGRRARAQELMWPAAPVACSCSPTHVTVYSEYGVDVFDVRTMEWVQTIGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 FSHMGLYVDPQGRRARAQELMWPAAPVACSCSPTHVTVYSEYGVDVFDVRTMEWVQTIGL 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KA1 RRIRPLNSEGTLNLLNCEPPRLIYFKSKFSGAVLNVPDTSDNSKKQMLRTRSKRRFVFKV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 RRIRPLNSEGTLNLLNCEPPRLIYFKSKFSGAVLNVPDTSDNSKKQMLRTRSKRRFVFKV 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 pF1KA1 PEEERLQQRREMLRDPELRSKMISNPTNFNHVAHMGPGDGMQVLMDLPLSAVPPSQEERP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 PEEERLQQRREMLRDPELRSKMISNPTNFNHVAHMGPGDGMQVLMDLPLSAVPPSQEERP 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 pF1KA1 GPAPTNLARQPPSRNKPYISWPSSGGSEPSVTVPLRSMSDPDQDFDKEPDSDSTKHSTPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 GPAPTNLARQPPSRNKPYISWPSSGGSEPSVTVPLRSMSDPDQDFDKEPDSDSTKHSTPS 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KA1 NSSNPSGPPSPNSPHRSQLPLEGLEQPACDT ::::::::::::::::::::::::::::::: NP_006 NSSNPSGPPSPNSPHRSQLPLEGLEQPACDT 1690 1700 1710 >>XP_011542609 (OMIM: 603412) PREDICTED: serine/threonin (1810 aa) 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:..:::.::::.::::::::::::::.:.:.::::::::::::::. .:::::::::::: XP_011 YLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGT 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 PDYISPEILQAMEDGMGKYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHEER ::::::::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: XP_011 PDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHKER 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 FQFPSHVTDVSEEAKDLIQRLICSRERRLGQNGIEDFKKHAFFEGLNWENIRNLEAPYIP ::::..::::::.:::::.:::::::.::::::::::::: :: :..:.:::: :::::: XP_011 FQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPYIP 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KA1 DVSSPSDTSNFDVDDDVLRNTEILPPGSHTGFSGLHLPFIGFTFTTESCFSDRGSLKSIM .::::.:::::::::: :.:.: .:: .::.::: ::::.:::.:. .:::. :. XP_011 EVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHLPFVGFTYTSSCVLSDRSCLRVTA 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KA1 QSNTLTKDEDVQRDLEHSLQMEAYERRIRRLEQEKLELSRKLQESTQTVQSLHGSS-RAL ..: : .::: :...: :::::::.:::::::::::::::::::::.:. :. . XP_011 GPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAYERRIKRLEQEKLELSRKLQESTQTVQALQYSTVDGP 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 pF1KA1 SNSNRDKEIKKLNEEIERLKNKIADSNRLERQLEDTVALRQEREDSTQRLRGLEKQHRVV ....: :::.:.::::.:......:..::.:::.. :.::: .:. ..... ::: ... XP_011 LTASKDLEIKNLKEEIEKLRKQVTESSHLEQQLEEANAVRQELDDAFRQIKAYEKQIKTL 490 500 510 520 530 540 540 550 560 570 580 590 pF1KA1 RQEKEELHKQLVEASERLKSQAKELKDAHQQRKLALQEFSELNERMAELRAQKQKVSRQL .::.:.:.:.::.::::::.:.::::::: :::::.::: :.:::..::..::::..:.. 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XP_011 EWIQTLPLKKVRPLNNEGSLNLLGLETIRLIYFKNKMAEGDELVVPETSDNSRKQMVRNI 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KA1 RSKRRFVFKVPEEERLQQRREMLRDPELRSKMISNPTNFNHVAHMGPGDGMQVLMDLPLS .:::. :.::::::.:::::::::::.:.:.:::::::::.::::::::.:.: :::. XP_011 NNKRRYSFRVPEEERMQQRREMLRDPEMRNKLISNPTNFNHIAHMGPGDGIQILKDLPMP 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KA1 AVP-PSQEERPG--PAPTNLARQPPSRNKPYISWPSSGGSEPSVTVPLRSM-SDPDQDFD . : :: ... : .: :. . . .. : . .: . :::. . :. XP_011 GFPYPSPHHHSGLISSPINFEHIYHMTVNSAEKFLSPDSINPEYSPSLRSVPGTPSFMTL 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KA1 KEPDSDSTKHSTPSNSSNPSGPPSPNSPHRSQLPLEGLEQPACDT ..: . .. .. : :: : : ::. :: XP_011 RNPRPQESRTVFSGSVSIPSITKSRPEPGRSMSASSGLSARSSAQNGSALKREFSGGSYS 1680 1690 1700 1710 1720 1730 XP_011 AKRQPMPSPSEGSLSSGGMDQGSDAPARDFDGEDSDSPRHSTASNSSNLSSPPSPASPRK 1740 1750 1760 1770 1780 1790 >>XP_005273379 (OMIM: 603412) PREDICTED: serine/threonin (1754 aa) initn: 6269 init1: 2496 opt: 6671 Z-score: 2081.0 bits: 398.2 E(85289): 3.5e-109 Smith-Waterman score: 7104; 61.1% identity (83.8% similar) in 1744 aa overlap (1-1698:1-1740) 10 20 30 40 50 pF1KA1 MSAKVRLKKLEQLLLDGPWR-NESALSVETLLDVLVCLYTECSHSALRRDKYVAEFLEWA ::..:::..:::..:::: . : . .:::::::.:.::: ::..: :::.: . :.:::: XP_005 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEYLEWA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KA1 KPFTQLVKEMQLHREDFEIIKVIGRGAFGEVAVVKMKNTERIYAMKILNKWEMLKRAETA ::::. ::.:.::::::::.:::::::::::::::.::.....::::::::::::::::: XP_005 KPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKRAETA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 CFREERDVLVNGDCQWITALHYAFQDENHLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDKLPEDMARF ::::::::::::: .:::.:::::::.:.::::::::::::::::::::::.:::::::: XP_005 CFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPEDMARF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 YIGEMVLAIDSIHQLHYVHRDIKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLKMNDDGTVQSSVAVGT :..:::.::::.::::::::::::::.:.:.::::::::::::::. .:::::::::::: XP_005 YLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGT 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 PDYISPEILQAMEDGMGKYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHEER ::::::::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: XP_005 PDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHKER 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 FQFPSHVTDVSEEAKDLIQRLICSRERRLGQNGIEDFKKHAFFEGLNWENIRNLEAPYIP ::::..::::::.:::::.:::::::.::::::::::::: :: :..:.:::: :::::: XP_005 FQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPYIP 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KA1 DVSSPSDTSNFDVDDDVLRNTEILPPGSHTGFSGLHLPFIGFTFTTESCFSDRGSLKSIM .::::.:::::::::: :.:.: .:: .::.::: ::::.:::.:. .:::. :. 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XP_005 QQEREDLNKELVQASERLKNQSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINERLTELHTQKQKLARHV 550 560 570 580 590 600 600 610 620 630 640 650 pF1KA1 RDKEEEMEVATQKVDAMRQEMRRAEKLRKELEAQLDDAVAEASKERKLREHSENFCKQME ::::::.... :::...:::.::.:. .::::.. . .:::::.:::::.::.. ::.: XP_005 RDKEEEVDLVMQKVESLRQELRRTERAKKELEVHTEALAAEASKDRKLREQSEHYSKQLE 610 620 630 640 650 660 660 670 680 690 700 710 pF1KA1 SELEALKVKQGGRGAGA-TLEHQQEISKIKSELEKKVLFYEEELVRREASHVLEVKNVKK .:::.:: :: . . :. ..::::::.:.:..:::: .:::::: .::. :. :.::.:: XP_005 NELEGLKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDLEKKSIFYEEELSKREGIHANEIKNLKK 670 680 690 700 710 720 720 730 740 750 760 770 pF1KA1 EVHDSESHQLALQKEILMLKDKLEKSKRERHNEMEEAVGTIKDKYERERAMLFDENKKLT :.::::..::::.:::..:::::::..:: ..: :: . .:..::::...: .:::::: XP_005 ELHDSEGQQLALNKEIMILKDKLEKTRRESQSEREEFESEFKQQYEREKVLLTEENKKLT 730 740 750 760 770 780 780 790 800 810 820 830 pF1KA1 AENEKLCSFVDKLTAQNRQLEDELQDLAAKKESVAHWEAQIAEIIQWVSDEKDARGYLQA .: .:: .. ..:. .:.:::.:..::: ::::::::::::.:::::::::::::::::: XP_005 SELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADKKESVAHWEAQITEIIQWVSDEKDARGYLQA 790 800 810 820 830 840 840 850 860 870 880 890 pF1KA1 LASKMTEELEALRSSSLGSRTLDPLWKVRRSQKLDMSARLELQSALEAEIRAKQLVQEEL :::::::::::::.::::.:. : ::.:: ::::::::::::::.::::::: .:::: XP_005 LASKMTEELEALRNSSLGTRATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQSALDAEIRAKQAIQEEL 850 860 870 880 890 900 900 910 920 930 940 950 pF1KA1 RKVKDANLTLESKLKDSEAKNRELLEEMEILKKKMEEKFRADTGLKLPDFQDSIFEYFNT ::: .:. : :::::: :: ::: :.: : : :: .:.. :.. : : :.. ..:: XP_005 NKVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEE-LRSEKGIEHQDSQHSFLAFLNT 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 pF1KA1 APLAHDLTFRTSSASEQETQAPKPE---ASPSMSVAASEQQEDMARPPQRPSAVPLPTTQ : : :.:. . . . :. . : : : ..: . : . . : .: :: . XP_005 PTDALD-QFETDPVENTYVWNPSVKFHIQSRSTSPSTSSEAEPVKTVDSTPLSVHTPTLR 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA1 ALALAG-----PKPKAHQFSIKSFSSPTQCSHCTSLMVGLIRQGYACEVCSFACHVSCKD . : :: :.::: .:::..::.: .:::::::::::: .::::.:.::..: . XP_005 KKGCPGSTGFPPKRKTHQFFVKSFTTPTKCHQCTSLMVGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVN 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KA1 GAPQVCPIPPEQSKRPLGVDVQRGIGTAYKGHVKVPKPTGVKKGWQRAYAVVCDCKLFLY :: .::.::::.: :::.: :.::::::.:::..:::.::::::::: :.::: ::::: XP_005 KAPTTCPVPPEQTKGPLGIDPQKGIGTAYEGHVRIPKPAGVKKGWQRALAIVCDFKLFLY 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KA1 DLPEGKSTQPGVIASQVLDLRDDEFSVSSVLASDVIHATRRDIPCIFRVTASLLGAPSKT :. :::..::.:. :::.:.::.:::::::::::::::.:.::::::::::: :.: .. 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