Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1132
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1132, 2053 aa
1>>>pF1KA1132 2053 - 2053 aa - 2053 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.4503+/-0.00159; mu= -9.7108+/- 0.096
mean_var=527.9252+/-110.410, 0's: 0 Z-trim(110.8): 142 B-trim: 486 in 1/52
Lambda= 0.055820
statistics sampled from 11747 (11878) to 11747 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.663), E-opt: 0.2 (0.365), width: 16
Scan time: 5.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8384.1 DSCAML1 gene_id:57453|Hs108|chr11 (2113) 13696 1119.8 0
CCDS42929.1 DSCAM gene_id:1826|Hs108|chr21 (2012) 8229 679.5 3.8e-194
CCDS43041.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3 (1026) 795 80.6 3.8e-14
CCDS30956.1 HMCN1 gene_id:83872|Hs108|chr1 (5635) 779 79.9 3.3e-13
CCDS33790.1 CNTN3 gene_id:5067|Hs108|chr3 (1028) 735 75.8 1.1e-12
CCDS54424.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (33423) 764 79.3 2.9e-12
CCDS74610.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (34350) 764 79.4 3e-12
CCDS59435.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (35991) 764 79.4 3.1e-12
CCDS44755.1 ROBO3 gene_id:64221|Hs108|chr11 (1386) 663 70.1 7.5e-11
CCDS2557.1 CNTN6 gene_id:27255|Hs108|chr3 (1028) 657 69.5 8.4e-11
>>CCDS8384.1 DSCAML1 gene_id:57453|Hs108|chr11 (2113 aa)
initn: 13696 init1: 13696 opt: 13696 Z-score: 5978.1 bits: 1119.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 13696; 100.0% identity (100.0% similar) in 2053 aa overlap (1-2053:61-2113)
10 20 30
pF1KA1 MWLVTFLLLLDSLHKARPEDVGTSLYFVND
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GGWERAERGRGAAARPATGPPPRRIGPLYGMWLVTFLLLLDSLHKARPEDVGTSLYFVND
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 SLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALRWYLATGDDIYDVPHIRHVHANGTLQLYPFSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALRWYLATGDDIYDVPHIRHVHANGTLQLYPFSPS
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 AFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVKAVFREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 AFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVKAVFREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPS
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 SVQEYVSVVSWEKDTVSIIPENRFFITYHGGLYISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQ
:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SVQEYVSVVSWEKDTVSIIPEHRFFITYHGGLYISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQ
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 SNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAGHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAGHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADS
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 RWTKRITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RWTKRITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGS
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 TVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPDEAISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPDEAISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATR
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 KAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 KAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVR
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 DGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 DGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRA
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 MRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFENGTLKLTDVQKGMDE
580 590 600 610 620 630
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 GEYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GEYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLIQPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITW
640 650 660 670 680 690
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 RKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSVSLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPP
700 710 720 730 740 750
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 RFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPPKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNS
760 770 780 790 800 810
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 SLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNC
820 830 840 850 860 870
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 TARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAI
880 890 900 910 920 930
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 NSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDS
940 950 960 970 980 990
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 WDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 WDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPP
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 MDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEV
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 YTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 YTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVIS
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 WSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 WSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAY
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 TQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 TQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSS
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA1 PGSGQPAPSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PGSGQPAPSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPA
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KA1 KIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 KIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLL
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KA1 RAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGG
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KA1 SSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEII
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KA1 EAKTHGREPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 EAKTHGREPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRA
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KA1 NSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPPIKSAQGEGDDVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPPIKSAQGEGDDVK
1600 1610 1620 1630 1640 1650
1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KA1 KLFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 KLFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPP
1660 1670 1680 1690 1700 1710
1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KA1 QGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLI
1720 1730 1740 1750 1760 1770
1720 1730 1740 1750 1760 1770
pF1KA1 QSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVG
1780 1790 1800 1810 1820 1830
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KA1 SQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFE
1840 1850 1860 1870 1880 1890
1840 1850 1860 1870 1880 1890
pF1KA1 ITECFISDSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ITECFISDSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIP
1900 1910 1920 1930 1940 1950
1900 1910 1920 1930 1940 1950
pF1KA1 HRANKSDYCNLPLYAKSEAFFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 HRANKSDYCNLPLYAKSEAFFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPAS
1960 1970 1980 1990 2000 2010
1960 1970 1980 1990 2000 2010
pF1KA1 KSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 KSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEP
2020 2030 2040 2050 2060 2070
2020 2030 2040 2050
pF1KA1 PRAGGPHTKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 PRAGGPHTKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
2080 2090 2100 2110
>>CCDS42929.1 DSCAM gene_id:1826|Hs108|chr21 (2012 aa)
initn: 4634 init1: 2654 opt: 8229 Z-score: 3599.0 bits: 679.5 E(32554): 3.8e-194
Smith-Waterman score: 8253; 59.8% identity (82.7% similar) in 2067 aa overlap (1-2053:1-2012)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MWLVTFLLLLDSLHKARPEDVGTSLYFVNDSLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALRWY
::... : :..:. .. ::. .:::::: :::.:.:.:..:..::::::: : ..::::
CCDS42 MWILA-LSLFQSFANVFSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 LATGDDIYDVPHIRHVHANGTLQLYPFSPSAFNSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVK
::::..::::: ::::: :::::..:: ::.:...:::: :.::::: .::::: ....:
CCDS42 LATGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 AVFREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPENRFFITYHG
::.:::::::::::..::::::::::.:::::. :..::::::::::.. .::.:: :
CCDS42 AVLREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 GLYISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVTDPAESIPTILDGFHSQEVWAG
.:::.:::.::.: .:::::.:.:.:::::::.::: :.:::.: :.::::: ... ::
CCDS42 ALYIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFDHRKAMAG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 HTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWTKRITGLTISDLRTEDSGTYICEVTNTF
. ::::: : :.: : :::::. :: ..:. : .::: : ..: :::.:.:::.: .
CCDS42 QRVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRY
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 GSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYRNTELVLPDEA
:.:.. : :.: .::..:..:.:.:...:: : :::..::. . . :::: :.. : .
CCDS42 GTAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKN
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 ISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTPRIVSSFSEKVVN
. : :...:.:.. :: .::::::. . .:::.. ..::::::.:.:.::::::.
CCDS42 VRITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVS
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 PGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTISHMNVTGPQIRDG
:.: :::: .::.: ::.::.:::.::.. :::: .:. :.:...:..:... :.:::
CCDS42 PAEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDG
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 GVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRAMRNITAVAGRDTLINCRVIGYPYYSIKWYK
::::::: : .: . :::::::::: ::: :.::::.::::: :.:::::::::::::::
CCDS42 GVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYK
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KA1 DALLLPDNHRQVVFEN-GTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSVHVAVKVPPLI
.. ::: :::::.::: :::::.:::: .::::: :.::.::::: ::::::.:::::.:
CCDS42 NSNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFI
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 QPFEFPPASIGQLLYIPCVVSSGDMPIRITWRKDGQVIISGSGVTIESKEFMSSLQISSV
:::::: :::: ..::::: :::.:: :::.:::. : .. ::::.. .: :::.::..
CCDS42 QPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNL
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 SLKHNGNYTCIASNAAATVSRERQLIVRVPPRFVVQPNNQDGIYGKAGVLNCSVDGYPPP
:: ::::::::: : ::.: .. ::::::::.::::: .:::::::: .::::..::: :
CCDS42 SLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVP
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 KVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISK
..:: .::.: :: ..:. :.::::.: :.::::.::.::: :::::..:: ::.:.::
CCDS42 TIVWKFSKGAGVPQ-FQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSK
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 SMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAI
::.:::::::::::.::::.: .:. ::..:::.::.:::.:::: : .:.:. . :: .
CCDS42 SMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPE-MARYLV
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 ATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPELEIREVK
.::. :.::.:::.. :. : :: :::::::::::::::.:::::::::::::.::..::
CCDS42 STKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVK
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 ARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYS
::...::::. ::::: :::.::: :::::::: : :...:: .:.:.:.:.::.:.::
CCDS42 ARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYS
900 910 920 930 940 950
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pF1KA1 IRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVI
::::. :.::.::::.::::...::::::::..: :.:..::::.::::::::.::::.:
CCDS42 IRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGII
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 RGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSS
::::::::: : :.: :..:. . ..:::::::::::.::.:::.:::: :::::::::.
CCDS42 RGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQ
1020 1030 1040 1050 1060 1070
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:: .:::::::: :::::.:.. . . :::: . .:::.:.:.:::.:. .:::
CCDS42 EIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGEL
1080 1090 1100 1110 1120 1130
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pF1KA1 GEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKA
::..:::::. .:: :.::.::::.::::.:.::::::: .. .:::::::::::.::
CCDS42 GEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKA
1140 1150 1160 1170 1180 1190
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pF1KA1 VPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQPAP-SEYETSPEQLFYRIAHLNRG
. .::: : :::::: : ::.:::::.::: : :. ::.:.::... ::: .:.:.
CCDS42 AAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHP---YPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRN
1200 1210 1220 1230 1240 1250
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pF1KA1 QQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPA
.:: .::.:::::::::::: .:.:: .::::.:..:.::::::::::. :::..::::.
CCDS42 RQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPS
1260 1270 1280 1290 1300 1310
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pF1KA1 PAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNL
::::: :::. . :..::.: : .::....:.:::::::::.: :.:. : : ::.::
CCDS42 PAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNL
1320 1330 1340 1350 1360 1370
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pF1KA1 LVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFISSSER
:::::::::::::::..:::::.:.:::::::::::..:::: ::::.: . :: :::
CCDS42 QVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSER
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:..:..:::::::: :.:.:.:: ::::::::::: :.::.:::.:.::. ::.:..::
CCDS42 SYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRL
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pF1KA1 NLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQ-GLRANSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSA
:: :::.::::::...::::: :: .: . :.. : .: .:.:::::::.::.::::
CCDS42 NLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSA
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pF1KA1 GCGNETAQFATLDYDGSTIPP-IKSA-QGE-----GDDVKKLFTIGCPVILATLGVALLF
::... :.::::.:::::::: :::. :.: .. .: : ::.: .. . : .::.
CCDS42 GCAEKQANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLL
1560 1570 1580 1590 1600 1610
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pF1KA1 IVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKE
.::..:.:.:::::::::::::::.:::.:. :: : : :.::::::.:::::...
CCDS42 VVRRRRREQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSK-QQQTLRMHIDIPRAQLLIEERD
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pF1KA1 GIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCTGVSLHHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVS
.. . ::..:. .:::.:..:.. .:. . ..:. .. :.::::.:.:: ::::::..
CCDS42 TMETI-DDRSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTT
1680 1690 1700 1710 1720 1730
1740 1750 1760 1770 1780
pF1KA1 RKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRTVGSQHGVTVT-ESDSYSASLSQ
:.:.:.. ..::::.:::::.. . . :.:::.::: . . .: ::::::.: ::
CCDS42 RRNAKAGPTARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQ
1740 1750 1760 1770 1780 1790
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pF1KA1 DTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHAKFEITECFISDSSSDQMTTGTN
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CCDS42 DTDRARSSMVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTN
1800 1810 1820 1830 1840 1850
1850 1860 1870 1880 1890 1900
pF1KA1 ENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDADRGKNVAVPIPHRANKSDYCNLPLYAKSEA
: .::.:: ::::: ::::::::::::::. : :.::: :: . : .:: : . .
CCDS42 EYTDSLTS-STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPG--DLIHLPPYLRMD-
1860 1870 1880 1890 1900
1910 1920 1930 1940 1950 1960
pF1KA1 FFRKADGREPCPVVPPREASIRNLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPHPGAPAAASTATL
:. . : : .. :.:. :: :.: .:: : .: :.
CCDS42 FLLNRGG-------P---GTSRDLSLG---QA---CLEP-QKSRTLKRP-------TVLE
1910 1920 1930 1940
1970 1980 1990 2000 2010 2020
pF1KA1 PQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPTPAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAG---GPHTKMGGSRDS
: .: :..: . . : : : .: : : : : .::..:..:
CCDS42 P-----IPMEAASSA--------SSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELGQAAKMSSSQES
1950 1960 1970 1980 1990
2030 2040 2050
pF1KA1 LLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYTLV
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CCDS42 LLD------SRGHLKGNNPYAKSYTLV
2000 2010
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CCDS43 DFRYSVVEGSLLINNPNKTQDAGTYQCTATNSFGTIVSREAKLQFAYLDNFKTRTRSTVS
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CCDS43 ---VRRGQGMVLLCG----PPPHSGELSYAWIFNEYPSYQDNRRFVSQET-------GNL
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. .. : . ..: ..: : .: : . :. . . :. :: :.. . :. : :
CCDS43 TVPTAKGATVKLECFALGNPVPTIIWRRADGKPIARKARRHK-SNGILEIPNFQQ-EDAG
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: : . . ..... . : :: .. ... . .. : ... : :
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:.:. ... . . ::. ..:.:. :.:. : : :.: : ... . .: .. : :
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: ... . . :.. :..:. . : : :: :: .. . :: :
CCDS43 DFSRTLLKRVTLVKVGGEV-VIECKPKASPKPVYTWK--KGRDILKENE------RITIS
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...: : .: . : : : : :.: :: :.. :.:: :. . :.. . :..
CCDS43 EDGNLRIINVTKSDAGSYTCIATNHFGT-ASSTGNLVVKDPTRVMVPPSSMDVTVGESIV
460 470 480 490 500 510
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: : . .. :.. : . .:: :: . .. .:. :: .. ...:: : .
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. : . .: . . .: :. :: ::: . : :. . .: : :..: :: .
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:. .. : .: :.. .. :. :..: :.: : .: . : :: .:::.
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640 650 660 670 680
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:::: :. : .:. ... . .::.. .::::: :: ...: :.
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. : .: .. :. .... :. . : : .:: : :: : . . :. :..::
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.. : :.. .:. :. :. : ... : ..::.: .: . : : . . :. .. ..
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. ... . : . : ::..:: : :... . :.. :. : : :: :.....:
CCDS43 ITNLKGSVLYHLAVKAYNSAGTGPSSATVNVTTRKPPPSQPPGNIIWNSSDSKIILNWDQ
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. .. .. : .. . : . : ::. .. : ..:.. . ...
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CCDS43 GDGSSSEQIRIPKISNAYARGSGASTSNACTLSAISTIMISLTARSSL
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10 20 30 40 50
pF1KA1 MWLVTFLLLLDSLHKARPEDVGTSLYFVNDSLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALR
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:: .: : . :.. . :.: :. .. . .. ..: : : :.::. . :..
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.. :. : ... ... . ... : ... ...: :. : . . .
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.: : :. :. :. ..: ::... : . .. ::. : :.. . .
CCDS30 LSGGSKLQIARSQHSDS-GNYTCIASNM---EGKAQKYYFLSIQVP----PSVAGAEIPS
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pF1KA1 EVWA--GHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWTKRITG----LTISDLRTEDS
.: . :..::: :.:.: : : :.:::::.:. . :... :.: : :.
CCDS30 DVSVLLGENVELVCNANGIPTPLIQWLKDGKPIASGETERIRVSANGSTLNIYGALTSDT
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: : : .:: : . : : . : .:: : . ... . : ::.: :
CCDS30 GKYTCVATNPAGEEDRIFNLNVYVTPTIRGNKDEAEKLMTLVDTSINIECRATGTPPPQI
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pF1KA1 RWYRNTELVLPDEAISIRGLS-NETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALED
: .: : :: . :: :. .... :. :: : ..: : :. .: . . . .
CCDS30 NWLKNG-LPLPLSS-HIRLLAAGQVIRIVRAQVSDVAVYTCVASNRAGVDNKHYNLQVF-
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. : . .:. .:.. : : . :. : . :.: :...: : .:. : .: : . .
CCDS30 APPNMDNSMGTEEITVLKGSSTSMACITDGTPAPSMAWLRDGQPLGLD-AHLT---VSTH
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pF1KA1 GTTISHMNVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRA---MRNITAVAGR
: ... ... . .:.: : : : : .: . . ..: :: : . ..:.....
CCDS30 GMVLQLLKA---ETEDSGKYTCIASNEAGEVSKHFILKVLEPPHINGSEEHEEISVIVNN
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..: . : : .. :.::. ::.. . .. .: .:... .: : :.: : .
CCDS30 PLELTCIASGIPAPKMTWMKDGRPLPQTDQVQTLGGGEVLRISTAQV-EDTGRYTC-LAS
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.: . .. : :.::: : . : .. .. . . : .. :. ::: ..:.
CCDS30 SPAGDDDKEYLVRVHVPPNIAGTDEPRDITVLRNRQVTLECKSDAVPPPV-ITWLRNGER
3610 3620 3630 3640 3650 3660
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CCDS30 LQATPRVRILSG--GRYLQINNADLGDTANYTCVASNIAGKTTREFILTVNVPPNIKGGP
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.. . .:. ::.: ..: : :.. :.. : .:: : .: .:: :. : :
CCDS30 QSLVILLNKSTVLECIAEGVPTPRITWRKDGAVLAGN----H-----ARYSILENGFLHI
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. . : : :::.:.:..::: . . : :..: :. :.. .: . : : : :
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pF1KA1 ERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYG
: :.:. ... :. . . ..:. :. ..:. :.. . : . :. :
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pF1KA1 EDRGLIQLTVQEPP---DPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSI-ITGFDIEYKNKSDS
.:. ..:::: :: : : . .: .. .. :: : :. ..:.
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. : .: . ..:. :. :. . : : .. ...:. ..: : :
CCDS30 Y------RILSSGAIEILATQLNHAGRYT--CVARNAAGSAH--RHVTLHVHEP-PVIQP
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pF1KA1 MDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEV
. :. . .. : . .: . : . : :. : : .... . :..
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: . : :.: : :::. .. ..:. . . . : : :.. .. .
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. :: . : : . ::. . . :.:: : :.:. :.
CCDS30 DGLPPPD-----------ITW--HKDGR----AIVESIRQRVLSSG-------SLQI-AF
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.: ::. . : .: : ::.:. .. .:: . .. .::. .:
CCDS30 VQPGDAGH----YTCMAANVAGS--------SSTSTKLTVHVPP-RIRSTEGHYTVNENS
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pF1KA1 ----P--GSGQPAPS---------------EYETSP--EQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAA
: ..: :.:. .: . : : .. .. . : . .:
CCDS30 QAILPCVADGIPTPAINWKKDNVLLANLLGKYTAEPYGELILENVVLEDSG---FYTCVA
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pF1KA1 VTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDS
..::. . . ..:.. :. . . : :. ...:: :...: : : . :: .
CCDS30 NNAAGEDTHTVSLTVHVL---PT-FTELPGDVSLNKGEQLRLSCKATGIPLPKLTWTFN-
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pF1KA1 EDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQP
.. ::. .:. .. .. :... :. :::: :.::: :. :: : . :. ::
CCDS30 -NNIIPAHFDS---VNGHSELVIERVSKEDSGTYVCTAENSVGFVKAIGFVYVKEPP---
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pF1KA1 RLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQYSVDNSEEW--KDVFISSSERSFKLDSL
: : . : .:: ::..: . .. . . .: : : : : : .. .:
CCDS30 ---VFKGDYPS---NWIE-PLGGNAILNCEVKGDPTPTIQWNRKGVDI---EISHRIRQL
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pF1KA1 KCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHGREPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNN
:. . ......:. :: . : :.. .. . .. ... .: :
CCDS30 GNGS-LAIYGTVNEDAGDYTCVATNEAGVVERSMSLTLQSPPIITLEPVETVINAGGKII
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pF1KA1 GGCPITAIVLEYRPKGTWAWQGLRANSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQ
.: :. : .: ::. ::
CCDS30 LNCQATG---EPQPTITWSRQGHSISWDDRVNVLSNNSLYIADAQKEDTSEFECVARNLM
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.: . ::: : . : .: .: : : .: .. . :. :.:. . :
CCDS33 TDSGMFQCIAENKHGLVYSSAELKVVASAPDFSKNPMKKLVQVQVGSLVSLDCKPRASPR
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pF1KA1 PKVMWKHAKGSGNPQQYHPVPLTGRIQILPNSSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDIS
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CCDS33 GYEVRYWNGGGKEESSSKMKVAGNETSARLRGLKSNLAYYTAVRAYNSAGAGPFSATVNV
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CCDS33 TTKKTPPSQPPGNVVWNATDTKVLLNWEQVKAMENESEVTGYKVFYRTSSQNNVQVLNTN
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CCDS33 HPMSSYMPIVLFLIVYVLW
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CCDS54 KKLEPSRIVKQDEFTRYECKIGGSPE--IKVL-WYKDETEIQESSKFRMSFVDSVAVLEM
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CCDS54 LECELQGTPPFHVSWYKDKRELRSGKKYKIMSENFLTSIHILNVDAADIGEYQCKATNDV
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:: .: . . : . . . ..: .:. : :. .. :. ... :... :.: ..
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:. :. .: :.. :.: .. : : . .. : :.: .: . .: ... .
CCDS54 KVTTGDTCTLECTVAGTPELSTKWFKDGKELTSD-----NKYKISFFNKVSGLKIINVAP
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:..:.... . .... :... ..: :: .. . : :.: : : ... :. :.
CCDS54 ISVSWFHEGNEISSGRKYQTTLTDNTCALTVNMLEESDSGDYTC---IATNMAGSDECSA
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..:. :: ..: . . : . . .:. : :. ..: : .. .. :. .. .
CCDS54 PLTVREPPSFVQKPDPMDVLTGTNVTFTSIVK-GTPPFSVSWFKGSSELVPGDRCNVSLE
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CCDS54 DSVAELELFDVDTSQSGEYTCIVSNEAGKASCTTHLYIKAPAKFVKRLNDYSIEKGKPLI
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CCDS54 LEGTFTGTPPISVTWKKNGINVTPSQRCNITTTEKSAILEIPSSTV-------EDAGQYN
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CCDS54 CYIENASGKDSCSAQILILEPPYFVKQLEPVKVSV-GDSASLQCQLAGTPEIGVSWYKGD
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CCDS54 TKLRPTTT--YKMHFRNN----VATLVFNQVDINDSGEYICKAENSVGEVSASTFLTVQE
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CCDS54 QKLPPSFSRQLRDVQETVGLPVVFDCAISGSEPISVSWYKDGKPLKDSPNVQTSFLDNTA
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CCDS54 TLNIFK-TDRSLAGQYSCT--ATNPIGSASSSARL-ILTEGKNP--PFFDIRLAPVDAVV
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CCDS54 GESADFECHVTGTQPIKVSWAKDSREIRSG--GKYQISYLENS----AHLTVLKVDK-GD
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CCDS54 -VEETEGNSFKLEGRVAGSQPITVAWYKNNIEIQPTSNCEITFKNNTLVLQVRKAGMNDA
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CCDS54 GLYTCKV--SNDAGSALCTSSIVIKEPKKPPVFDQHLTPVTVSEGEYVQLSCHVQGSEPI
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CCDS54 RIQWLKAGREIKPSDRCSFSFASG--------TAVLEL-RDVAKADSGD-YVCKASNV--
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CCDS54 CKVDGTPEIRISWYKEHTKLRSAPAY--------KMQFKNNVASLVINKVDHSDVGEYSC
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CCDS54 DGVLLKDDANLQTSFVHN------VATLQILQTDQSHIGQYNCSASNPLGTASSSAKLIL
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CCDS54 SEHEVPPFFDLKPVSVDLALGESGTFKCHVTGTAPIKITWAKDNREIRPGGNYKMTLVEN
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CCDS74 IRPGGNYKMTLVENTATLTVLKVGKGDAGQYTCYASNIAGK---DSCSAQLGVQEPPRFI
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CCDS74 QTDLSHSGQYS-------CSASNPLGTASSSARLTAREPKKSPFFDIKPVSIDVIAGESA
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..:.:.: : ...: : .: .. .:. : . :: . .. :: . : :
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: : . .: : :.: .: . . ..::. :. : : .: :
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pF1KA1 EPPD-PPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQSTRNISPTI
::: .:: .. . . : .. :. : . ..:. . . : . :
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pF1KA1 NQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSE-PSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQPVTSQSI
... ..... :. . : . : ... :. . ::. . . ::. .. :.. ...
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pF1KA1 QVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSP-GSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNLKKFAQY
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..: . :: .: : ... : ... .: .: .: ...: . . ..
CCDS59 IEGAQPIFV------QWLKEKEEVIRESENIRITFVE-----NVATLQFAKA-EPANAGK
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: :.: : .. .. .:.: : . : . :. :. :. . . :
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. :: .. :: :: ..: . . ...:... . : . .
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:. .. . ::.. . . : :. .:. .: : . : . : :: .. .
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.. :: : .. . : : :::.:.:..: : . : :: :: . : :
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CCDS59 VLPGKNVTFTSVIRGTPPFKVNWFRGARELVKGDRCNIYFEDTVAELELFNIDISQSGEY
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...:..:.. . . .: ::. : : .: : . :.. .: ::.
CCDS59 TCVVSNNAGQASCTTRLFVK----EPAAFLK--RLSDHSVEPGKSIILESTYTGTLPIS-
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.. : ..:: :.::.: : .:. :
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:: : ... . . :. . . . . : :: ..: :: .: .. .: :
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CCDS59 SEHEVPPFFDLKPVSVDLALGESGTFKCHVTGTAPIKITWAKDNREIRPGGNYKMTLVEN
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CCDS44 RPRPNIEWYKNGARVATVRE-DPRAHRLLLPSGALFFPRIVHGRRARPDEGVYTCVARNY
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CCDS44 LGAAASRNASLEVAVLRDDFRQSPGNVVVAVGEPAVLECVPPRGHPEPSVSWRKDGARLK
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CCDS44 EEEGRITIRGGKLMMSHTLKS-DAGMYVCVASNMAGERESAAAEVMVLERPSFLRRPVNQ
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. . . .. : :. :: : :. :::. . .: :.: . :: :. :: . .
CCDS44 VVLADAPVTFL-CEVK-GDPPPRLRWRKEDGELPTGR-YEIRSDH---SLWIGHVSAEDE
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CCDS44 K-EGSQVLLFPSQSLQP---TGRFSVSPRGQLNITAVQRGDAGYYVCQAVSVAGSILAKA
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CCDS44 QFKTMA---NG-----TLYIANVQEMDMGFYSCVAKSSTGEATWSGWLKMREDWGVSPDP
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CCDS44 PTEPSSPPGAPSQPVVTEITKNSITLTWKPNPQTGAAVTSYVIEAFSPAAGNTWRTVADG
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CCDS44 VQ--LETHTVSGLQPNTIYLFLVRAVGAWGLSEPSPVSEPVRTQDSSPSRPVEDPWRGQQ
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CCDS44 GLAEVAVRLQEPIVLGPRTLQVSWTVDGP-VQ--LVQGFRVSWRVAGP-EGGSWTMLDLQ
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