Result of FASTA (ccds) for pF1KA1139
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1139, 1202 aa
  1>>>pF1KA1139 1202 - 1202 aa - 1202 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.1339+/-0.00134; mu= -17.9239+/- 0.081
 mean_var=780.2012+/-164.930, 0's: 0 Z-trim(117.0): 121  B-trim: 659 in 2/53
 Lambda= 0.045917
 statistics sampled from 17624 (17740) to 17624 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.789), E-opt: 0.2 (0.545), width:  16
 Scan time:  6.110

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11723.1 CASKIN2 gene_id:57513|Hs108|chr17      (1202) 8162 556.9  1e-157
CCDS45775.1 CASKIN2 gene_id:57513|Hs108|chr17      (1120) 7661 523.7 9.7e-148
CCDS42103.1 CASKIN1 gene_id:57524|Hs108|chr16      (1431) 1780 134.2 2.2e-30


>>CCDS11723.1 CASKIN2 gene_id:57513|Hs108|chr17           (1202 aa)
 initn: 8162 init1: 8162 opt: 8162  Z-score: 2944.8  bits: 556.9 E(32554): 1e-157
Smith-Waterman score: 8162; 99.9% identity (99.9% similar) in 1202 aa overlap (1-1202:1-1202)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MGREQDLILAVKNGDVTGVQKLVAKVKATKTKLLGSTKRLNVNYQDADGFSALHHAALGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MGREQDLILAVKNGDVTGVQKLVAKVKATKTKLLGSTKRLNVNYQDADGFSALHHAALGG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 SLELIALLLEAQATVDIKDSNGMRPLHYAAWQGRLEPVRLLLRASAAVNAASLDGQIPLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SLELIALLLEAQATVDIKDSNGMRPLHYAAWQGRLEPVRLLLRASAAVNAASLDGQIPLH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 LAAQYGHYEVSEMLLQHQSNPCLVNKAKKTPLDLACEFGRLKVAQLLLNSHLCVALLEGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LAAQYGHYEVSEMLLQHQSNPCLVNKAKKTPLDLACEFGRLKVAQLLLNSHLCVALLEGE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 AKDPCDPNYTTPLHLAAKNGHREVIRQLLRAGIEINRQTKTGTALHEAALYGKTEVVRLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AKDPCDPNYTTPLHLAAKNGHREVIRQLLRAGIEINRQTKTGTALHEAALYGKTEVVRLL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 LEGGVDVNIRNTYNQTALDIVNQFTTSQASREIKQLLREASGILKVRALKDFWNLHDPTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LEGGVDVNIRNTYNQTALDIVNQFTTSQASREIKQLLREASGILKVRALKDFWNLHDPTA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 LNVRAGDVITVLEQHPDGRWKGHIHESQRGTDRIGYFPPGIVEVVSKRVGIPAARLPSAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LNVRAGDVITVLEQHPDGRWKGHIHESQRGTDRIGYFPPGIVEVVSKRVGIPAARLPSAP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 TPLRPGFSRTPQPPAEEPPHPLTYSQLPRVGLSPDSPAGDRNSVGSEGSVGSIRSAGSGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TPLRPGFSRTPQPPAEEPPHPLTYSQLPRVGLSPDSPAGDRNSVGSEGSVGSIRSAGSGQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 SSEGTNGHGPGLLIENAQPLPSAGEDQVLPGLHPPSLADNLSHRPLANCRSGEQIFTQDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSEGTNGHGPGLLIENAQPLPSAGEDQVLPGLHPPSLADNLSHRPLANCRSGEQIFTQDV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 RPEQLLEGKDAQAIHNWLSEFQLEGYTAHFLQAGYDVPTISRMTPEDLTAIGVTKPGHRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RPEQLLEGKDAQAIHNWLSEFQLEGYTAHFLQAGYDVPTISRMTPEDLTAIGVTKPGHRK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 KIASEIAQLSIAEWLPSYIPTDLLEWLCALGLPQYHKQLVSSGYDSMGLVADLTWEELQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KIASEIAQLSIAEWLPSYIPTDLLEWLCALGLPQYHKQLVSSGYDSMGLVADLTWEELQE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 IGVNKLGHQKKLMLGVKRLAELRRGLLQGEALSEGGRRLAKGPELMAIEGLENGEGPATA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IGVNKLGHQKKLMLGVKRLAELRRGLLQGEALSEGGRRLAKGPELMAIEGLENGEGPATA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 GPRLLTFQGSELSPELQAAMAGGGPEPLPLPPARSPSQESIGARSRGSGHSQEQPAPQPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GPRLLTFQGSELSPELQAAMAGGGPEPLPLPPARSPSQESIGARSRGSGHSQEQPAPQPS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 GGDPSPPQERNLPEGTERPPKLCSSLPGQGPPPYVFMYPQGSPSSPAPGPPPGAPWAFSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GGDPSPPQERNLPEGTERPPKLCSSLPGQGPPPYVFMYPQGSPSSPAPGPPPGAPWAFSY
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 LAGPPATPPDPPRPKRRSHSLSRPGPTEGDAEGEAEGPVGSTLGSYATLTRRPGRSALVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LAGPPATPPDPPRPKRRSHSLSRPGPTEGDAEGEAEGPVGSTLGSYATLTRRPGRSALVR
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 TSPSVTPTPARGTPRSQSFALRARRKGPPPPPPKRLSSVSGPSPEPPPLDGSPGPKEGAT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS11 TSPSVTPTPARGTPRSQSFALRARRKGPPPPPPKRLSSVSGPSPEPPPLDESPGPKEGAT
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 GPRRRTLSEPAGPSEPPGPPAPAGPASDTEEEEPGPEGTPPSRGSSGEGLPFAEEGNLTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GPRRRTLSEPAGPSEPPGPPAPAGPASDTEEEEPGPEGTPPSRGSSGEGLPFAEEGNLTI
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA1 KQRPKPAGPPPRETPVPPGLDFNLTESDTVKRRPKCREREPLQTALLAFGVASATPGPAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KQRPKPAGPPPRETPVPPGLDFNLTESDTVKRRPKCREREPLQTALLAFGVASATPGPAA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 PLPSPTPGESPPASSLPQPEPSSLPAQGVPTPLAPSPAMQPPVPPCPGPGLESSAASRWN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PLPSPTPGESPPASSLPQPEPSSLPAQGVPTPLAPSPAMQPPVPPCPGPGLESSAASRWN
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA1 GETEPPAAPAALLKVPGAGTAPKPVSVACTQLAFSGPKLAPRLGPRPVPPPRPESTGTVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GETEPPAAPAALLKVPGAGTAPKPVSVACTQLAFSGPKLAPRLGPRPVPPPRPESTGTVG
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA1 PGQAQQRLEQTSSSLAAALRAAEKSIGTKEQEGTPSASTKHILDDISTMFDALADQLDAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PGQAQQRLEQTSSSLAAALRAAEKSIGTKEQEGTPSASTKHILDDISTMFDALADQLDAM
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

         
pF1KA1 LD
       ::
CCDS11 LD
         

>>CCDS45775.1 CASKIN2 gene_id:57513|Hs108|chr17           (1120 aa)
 initn: 7661 init1: 7661 opt: 7661  Z-score: 2765.8  bits: 523.7 E(32554): 9.7e-148
Smith-Waterman score: 7661; 99.9% identity (99.9% similar) in 1120 aa overlap (83-1202:1-1120)

             60        70        80        90       100       110  
pF1KA1 LHHAALGGSLELIALLLEAQATVDIKDSNGMRPLHYAAWQGRLEPVRLLLRASAAVNAAS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45                               MRPLHYAAWQGRLEPVRLLLRASAAVNAAS
                                             10        20        30

            120       130       140       150       160       170  
pF1KA1 LDGQIPLHLAAQYGHYEVSEMLLQHQSNPCLVNKAKKTPLDLACEFGRLKVAQLLLNSHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LDGQIPLHLAAQYGHYEVSEMLLQHQSNPCLVNKAKKTPLDLACEFGRLKVAQLLLNSHL
               40        50        60        70        80        90

            180       190       200       210       220       230  
pF1KA1 CVALLEGEAKDPCDPNYTTPLHLAAKNGHREVIRQLLRAGIEINRQTKTGTALHEAALYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CVALLEGEAKDPCDPNYTTPLHLAAKNGHREVIRQLLRAGIEINRQTKTGTALHEAALYG
              100       110       120       130       140       150

            240       250       260       270       280       290  
pF1KA1 KTEVVRLLLEGGVDVNIRNTYNQTALDIVNQFTTSQASREIKQLLREASGILKVRALKDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KTEVVRLLLEGGVDVNIRNTYNQTALDIVNQFTTSQASREIKQLLREASGILKVRALKDF
              160       170       180       190       200       210

            300       310       320       330       340       350  
pF1KA1 WNLHDPTALNVRAGDVITVLEQHPDGRWKGHIHESQRGTDRIGYFPPGIVEVVSKRVGIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WNLHDPTALNVRAGDVITVLEQHPDGRWKGHIHESQRGTDRIGYFPPGIVEVVSKRVGIP
              220       230       240       250       260       270

            360       370       380       390       400       410  
pF1KA1 AARLPSAPTPLRPGFSRTPQPPAEEPPHPLTYSQLPRVGLSPDSPAGDRNSVGSEGSVGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AARLPSAPTPLRPGFSRTPQPPAEEPPHPLTYSQLPRVGLSPDSPAGDRNSVGSEGSVGS
              280       290       300       310       320       330

            420       430       440       450       460       470  
pF1KA1 IRSAGSGQSSEGTNGHGPGLLIENAQPLPSAGEDQVLPGLHPPSLADNLSHRPLANCRSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IRSAGSGQSSEGTNGHGPGLLIENAQPLPSAGEDQVLPGLHPPSLADNLSHRPLANCRSG
              340       350       360       370       380       390

            480       490       500       510       520       530  
pF1KA1 EQIFTQDVRPEQLLEGKDAQAIHNWLSEFQLEGYTAHFLQAGYDVPTISRMTPEDLTAIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EQIFTQDVRPEQLLEGKDAQAIHNWLSEFQLEGYTAHFLQAGYDVPTISRMTPEDLTAIG
              400       410       420       430       440       450

            540       550       560       570       580       590  
pF1KA1 VTKPGHRKKIASEIAQLSIAEWLPSYIPTDLLEWLCALGLPQYHKQLVSSGYDSMGLVAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VTKPGHRKKIASEIAQLSIAEWLPSYIPTDLLEWLCALGLPQYHKQLVSSGYDSMGLVAD
              460       470       480       490       500       510

            600       610       620       630       640       650  
pF1KA1 LTWEELQEIGVNKLGHQKKLMLGVKRLAELRRGLLQGEALSEGGRRLAKGPELMAIEGLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LTWEELQEIGVNKLGHQKKLMLGVKRLAELRRGLLQGEALSEGGRRLAKGPELMAIEGLE
              520       530       540       550       560       570

            660       670       680       690       700       710  
pF1KA1 NGEGPATAGPRLLTFQGSELSPELQAAMAGGGPEPLPLPPARSPSQESIGARSRGSGHSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NGEGPATAGPRLLTFQGSELSPELQAAMAGGGPEPLPLPPARSPSQESIGARSRGSGHSQ
              580       590       600       610       620       630

            720       730       740       750       760       770  
pF1KA1 EQPAPQPSGGDPSPPQERNLPEGTERPPKLCSSLPGQGPPPYVFMYPQGSPSSPAPGPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EQPAPQPSGGDPSPPQERNLPEGTERPPKLCSSLPGQGPPPYVFMYPQGSPSSPAPGPPP
              640       650       660       670       680       690

            780       790       800       810       820       830  
pF1KA1 GAPWAFSYLAGPPATPPDPPRPKRRSHSLSRPGPTEGDAEGEAEGPVGSTLGSYATLTRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GAPWAFSYLAGPPATPPDPPRPKRRSHSLSRPGPTEGDAEGEAEGPVGSTLGSYATLTRR
              700       710       720       730       740       750

            840       850       860       870       880       890  
pF1KA1 PGRSALVRTSPSVTPTPARGTPRSQSFALRARRKGPPPPPPKRLSSVSGPSPEPPPLDGS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS45 PGRSALVRTSPSVTPTPARGTPRSQSFALRARRKGPPPPPPKRLSSVSGPSPEPPPLDES
              760       770       780       790       800       810

            900       910       920       930       940       950  
pF1KA1 PGPKEGATGPRRRTLSEPAGPSEPPGPPAPAGPASDTEEEEPGPEGTPPSRGSSGEGLPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PGPKEGATGPRRRTLSEPAGPSEPPGPPAPAGPASDTEEEEPGPEGTPPSRGSSGEGLPF
              820       830       840       850       860       870

            960       970       980       990      1000      1010  
pF1KA1 AEEGNLTIKQRPKPAGPPPRETPVPPGLDFNLTESDTVKRRPKCREREPLQTALLAFGVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AEEGNLTIKQRPKPAGPPPRETPVPPGLDFNLTESDTVKRRPKCREREPLQTALLAFGVA
              880       890       900       910       920       930

           1020      1030      1040      1050      1060      1070  
pF1KA1 SATPGPAAPLPSPTPGESPPASSLPQPEPSSLPAQGVPTPLAPSPAMQPPVPPCPGPGLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SATPGPAAPLPSPTPGESPPASSLPQPEPSSLPAQGVPTPLAPSPAMQPPVPPCPGPGLE
              940       950       960       970       980       990

           1080      1090      1100      1110      1120      1130  
pF1KA1 SSAASRWNGETEPPAAPAALLKVPGAGTAPKPVSVACTQLAFSGPKLAPRLGPRPVPPPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SSAASRWNGETEPPAAPAALLKVPGAGTAPKPVSVACTQLAFSGPKLAPRLGPRPVPPPR
             1000      1010      1020      1030      1040      1050

           1140      1150      1160      1170      1180      1190  
pF1KA1 PESTGTVGPGQAQQRLEQTSSSLAAALRAAEKSIGTKEQEGTPSASTKHILDDISTMFDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PESTGTVGPGQAQQRLEQTSSSLAAALRAAEKSIGTKEQEGTPSASTKHILDDISTMFDA
             1060      1070      1080      1090      1100      1110

           1200  
pF1KA1 LADQLDAMLD
       ::::::::::
CCDS45 LADQLDAMLD
             1120

>>CCDS42103.1 CASKIN1 gene_id:57524|Hs108|chr16           (1431 aa)
 initn: 2685 init1: 1651 opt: 1780  Z-score: 659.0  bits: 134.2 E(32554): 2.2e-30
Smith-Waterman score: 2810; 44.4% identity (62.0% similar) in 1267 aa overlap (1-1067:1-1230)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MGREQDLILAVKNGDVTGVQKLVAKVKATKTKLLGSTKRLNVNYQDADGFSALHHAALGG
       ::.::.:. :::  ::  .:.:. . .  :.:::::::..:::.:: :::::::::::.:
CCDS42 MGKEQELVQAVKAEDVGTAQRLLQRPRPGKAKLLGSTKKINVNFQDPDGFSALHHAALNG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 SLELIALLLEAQATVDIKDSNGMRPLHYAAWQGRLEPVRLLLRASAAVNAASLDGQIPLH
       . :::.:::::::.:::::..::::::::::::: ::..:.:.:..:::  : .:.::::
CCDS42 NTELISLLLEAQAAVDIKDNKGMRPLHYAAWQGRKEPMKLVLKAGSAVNIPSDEGHIPLH
               70        80        90       100       110       120

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pF1KA1 LAAQYGHYEVSEMLLQHQSNPCLVNKAKKTPLDLACEFGRLKVAQLLLNSHLCVALLEGE
       ::::.:::.:::::::::::::.:... ::::::::::::. :.::::.:..:.:::: .
CCDS42 LAAQHGHYDVSEMLLQHQSNPCMVDNSGKTPLDLACEFGRVGVVQLLLSSNMCAALLEPR
              130       140       150       160       170       180

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pF1KA1 AKDPCDPNYTTPLHLAAKNGHREVIRQLLRAGIEINRQTKTGTALHEAALYGKTEVVRLL
         :  ::: :.:::::::::: ..:: ::.:::.::::::.::::::::: :::::::::
CCDS42 PGDATDPNGTSPLHLAAKNGHIDIIRLLLQAGIDINRQTKSGTALHEAALCGKTEVVRLL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 LEGGVDVNIRNTYNQTALDIVNQFTTSQASREIKQLLREASGILKVRALKDFWNLHDPTA
       :..:.....::::.:::::::.:::::::::::::::::::. :.::: ::. : .: :.
CCDS42 LDSGINAHVRNTYSQTALDIVHQFTTSQASREIKQLLREASAALQVRATKDYCNNYDLTS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 LNVRAGDVITVLEQHPDGRWKGHIHESQRGTDRIGYFPPGIVEVVSKRVGIPAARLPSAP
       :::.:::.:::::::::::::: ::... :.::.:::: .. :.. ::.:  :.  :: :
CCDS42 LNVKAGDIITVLEQHPDGRWKGCIHDNRTGNDRVGYFPSSLGEAIVKRAGSRAGTEPSLP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390           400       410      
pF1KA1 TPLRPGFSRTPQPPAEEPPHPLTYSQLPRVGL----SPDSPAGDRNSVGSEGSVGS--IR
            : : .  : :  ::. .   . : .:     : .. :: :.: :    .::  ..
CCDS42 Q----G-SSSSGPSA--PPEEIWVLRKPFAGGDRSGSISGMAGGRGSGGHALHAGSEGVK
                   370         380       390       400       410   

          420       430       440       450       460       470    
pF1KA1 SAGSGQSSEGTNGHGPGLLIENAQPLPSAGEDQVLPGLHPPSLADNLSHRPLANCRSGEQ
         ..  :.....  :::    ..   :  :   :  . .::     ..:   :.   :::
CCDS42 LLATVLSQKSVSESGPG----DSPAKPPEGSAGVARS-QPP-----VAH---AGQVYGEQ
           420       430           440             450          460

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pF1KA1 IFTQDVRPEQLLEGKDAQAIHNWLSEFQLEGYTAHFLQAGYDVPTISRMTPEDLTAIGVT
          . ..: .  :::...:. .::. :::. :. .:..::::.:::::::::::::::::
CCDS42 P-PKKLEPAS--EGKSSEAVSQWLTAFQLQLYAPNFISAGYDLPTISRMTPEDLTAIGVT
                 470       480       490       500       510       

          540       550       560       570       580       590    
pF1KA1 KPGHRKKIASEIAQLSIAEWLPSYIPTDLLEWLCALGLPQYHKQLVSSGYDSMGLVADLT
       :::::::::.::. ::: .::: . :..:  ::  .:: ::.: ::..::... ...:.:
CCDS42 KPGHRKKIAAEISGLSIPDWLPEHKPANLAVWLSMIGLAQYYKVLVDNGYENIDFITDIT
       520       530       540       550       560       570       

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pF1KA1 WEELQEIGVNKLGHQKKLMLGVKRLAELRRGLLQGEALSEGGRRLAKGP---ELMAIEGL
       ::.:::::..::::::::::.:..::::...     :  :::    :.:   :.::::. 
CCDS42 WEDLQEIGITKLGHQKKLMLAVRKLAELQKAEY---AKYEGGPLRRKAPQSLEVMAIESP
       580       590       600       610          620       630    

              660        670       680                690       700
pF1KA1 ENGEG-PATA-GPRLLTFQGSELSPELQAAMAGG---GP---EP---LPLPPARSPSQES
          :  ::   .:.. ::: :::: ::::::.:    ::   .:   ::  :  .  :.:
CCDS42 PPPEPTPADCQSPKMTTFQDSELSDELQAAMTGPAEVGPTTEKPSSHLPPTPRATTRQDS
          640       650       660       670       680       690    

               710                          720                    
pF1KA1 -IGARSRGSGHSQE-----QPAPQ--------------PSGGDPS---------------
        .:.:.:  . :::      :.:.              :. : :                
CCDS42 SLGGRARHMSSSQELLGDGPPGPSSPMSRSQEYLLDEGPAPGTPPREARPGRHGHSIKRA
          700       710       720       730       740       750    

              730          740                750                  
pF1KA1 --PP---QERN-LPEGTER--PPKL-CSSLPG--------QGPPPYVF------------
         ::   . :. :: :: .  ::.   .. ::        .:: : .             
CCDS42 SVPPVPGKPRQVLPPGTSHFTPPQTPTKTRPGSPQALGGPHGPAPATAKVKPTPQLLPPT
          760       770       780       790       800       810    

           760                           770        780       790  
pF1KA1 ---MYPQGSPSSP--------------------APGP-PPGAPWAFSYLAGPPATPPDPP
          : :.. :.::                    :::: :: .: :   :  :: .  .: 
CCDS42 ERPMSPRSLPQSPTHRGFAYVLPQPVEGEVGPAAPGPAPPPVPTAVPTLCLPPEADAEPG
          820       830       840       850       860       870    

            800       810       820       830       840       850  
pF1KA1 RPKRRSHSLSRPGPTEGDAEGEAEGPVGSTLGSYATLTRRPGRSALVRTSPSVTPTPA-R
       :::.:.:::.: . .... : . :  : .. : :::. :: :::  ::.     :. : .
CCDS42 RPKKRAHSLNRYAASDSEPERD-ELLVPAAAGPYATVQRRVGRSHSVRA-----PAGADK
          880       890        900       910       920             

             860       870       880              890              
pF1KA1 GTPRSQSFALRARRKGPPPPPPKRLSSVSG-------PSPEPPPLDGSPGPKE-------
       .. ::::::.: :.:::::::::: ::. .       : :.  : ::  : .        
CCDS42 NVNRSQSFAVRPRKKGPPPPPPKRSSSALASANLADEPVPDAEPEDGLLGVRAQCRRASD
      930       940       950       960       970       980        

              900            910              920                  
pF1KA1 -------GATGPRRRT-----LSEPAG-------PSEPPGPPAPAGP---------ASDT
              :..:  .       ::  .:       : :    : ::.:         ::  
CCDS42 LAGSVDTGSAGSVKSIAAMLELSSIGGGGRAARRPPEGHPTPRPASPEPGRVATVLASVK
      990      1000      1010      1020      1030      1040        

     930       940                          950       960       970
pF1KA1 EEEEPGPEGTPPSR-------------------GSSGEGLPFAEEGNLTIKQRPKPAGPP
       ..:  :: :   .:                   : :..  ::.:.:  : .:::.  :: 
CCDS42 HKEAIGPGGEVVNRRRTLSGPVTGLLATARRGPGESADPGPFVEDG--TGRQRPR--GPS
     1050      1060      1070      1080      1090        1100      

                                      980       990      1000      
pF1KA1 PRETPV--PP----------------------GLDFNLTESDTVKRRPKCRERE-----P
         :. :  ::                      .. : :::::::::::: .:::     :
CCDS42 KGEAGVEGPPLAKVEASATLKRRIRAKQNQQENVKFILTESDTVKRRPKAKEREAGPEPP
         1110      1120      1130      1140      1150      1160    

            1010      1020      1030      1040       1050      1060
pF1KA1 LQTALLAFGVASATPGPAAPLPSPTPGESPPASSLPQPEP-SSLPAQGVPTPLAPSPAMQ
          ..   :....   ::.   .:     ::  . : :   . ::    :   : .:: .
CCDS42 PPLSVYHNGTGTVRRRPASEQAGPPELPPPPPPAEPPPTDLAHLPPLPPPEGEARKPA-K
         1170      1180      1190      1200      1210      1220    

             1070      1080      1090      1100      1110      1120
pF1KA1 PPVPPCPGPGLESSAASRWNGETEPPAAPAALLKVPGAGTAPKPVSVACTQLAFSGPKLA
       ::: : :                                                     
CCDS42 PPVSPKPVLTQPVPKLQGSPTPTSKKVPLPGPGSPEVKRAHGTPPPVSPKPPPPPTAPKP
          1230      1240      1250      1260      1270      1280   




1202 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 01:21:18 2016 done: Fri Nov  4 01:21:19 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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