Result of FASTA (ccds) for pF1KA1170
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1170, 758 aa
  1>>>pF1KA1170 758 - 758 aa - 758 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8015+/-0.000804; mu= 14.4673+/- 0.049
 mean_var=110.0206+/-21.890, 0's: 0 Z-trim(111.1): 12  B-trim: 2 in 1/50
 Lambda= 0.122275
 statistics sampled from 12090 (12096) to 12090 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.711), E-opt: 0.2 (0.372), width:  16
 Scan time:  3.790

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS47709.1 STRIP2 gene_id:57464|Hs108|chr7        ( 758) 5010 894.7       0
CCDS34752.1 STRIP2 gene_id:57464|Hs108|chr7        ( 834) 4969 887.5       0
CCDS59197.1 STRIP1 gene_id:85369|Hs108|chr1        ( 742) 2097 380.8 4.3e-105
CCDS30798.1 STRIP1 gene_id:85369|Hs108|chr1        ( 837) 2097 380.8 4.7e-105


>>CCDS47709.1 STRIP2 gene_id:57464|Hs108|chr7             (758 aa)
 initn: 5010 init1: 5010 opt: 5010  Z-score: 4777.3  bits: 894.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5010; 100.0% identity (100.0% similar) in 758 aa overlap (1-758:1-758)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MEDPAAPGTGGPPANGNGNGGGKGKQAAPKGREAFRSQRRESEGSVDCPTLEFEYGDADG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MEDPAAPGTGGPPANGNGNGGGKGKQAAPKGREAFRSQRRESEGSVDCPTLEFEYGDADG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 HAAELSELYSYTENLEFTNNRRCFEEDFKTQVQGKEWLELEEDAQKAYIMGLLDRLEVVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HAAELSELYSYTENLEFTNNRRCFEEDFKTQVQGKEWLELEEDAQKAYIMGLLDRLEVVS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 RERRLKVARAVLYLAQGTFGECDSEVDVLHWSRYNCFLLYQMGTFSTFLELLHMEIDNSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RERRLKVARAVLYLAQGTFGECDSEVDVLHWSRYNCFLLYQMGTFSTFLELLHMEIDNSQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 ACSSALRKPAVSIADSTELRVLLSVMYLMVENIRLERETDPCGWRTARETFRTELSFSMH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ACSSALRKPAVSIADSTELRVLLSVMYLMVENIRLERETDPCGWRTARETFRTELSFSMH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 NEEPFALLLFSMVTKFCSGLAPHFPIKKVLLLLWKVVMFTLGGFEHLQTLKVQKRAELGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NEEPFALLLFSMVTKFCSGLAPHFPIKKVLLLLWKVVMFTLGGFEHLQTLKVQKRAELGL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 PPLAEDSIQVVKSMRAASPPSYTLDLGESQLAPPPSKLRGRRGSRRQLLTKQDSLDIYNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PPLAEDSIQVVKSMRAASPPSYTLDLGESQLAPPPSKLRGRRGSRRQLLTKQDSLDIYNE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 RDLFKTEEPATEEEEESAGDGERTLDGELDLLEQDPLVPPPPSQAPLSAERVAFPKGLPW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RDLFKTEEPATEEEEESAGDGERTLDGELDLLEQDPLVPPPPSQAPLSAERVAFPKGLPW
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 APKVRQKDIEHFLEMSRNKFIGFTLGQDTDTLVGLPRPIHESVKTLKQHKYISIADVQIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 APKVRQKDIEHFLEMSRNKFIGFTLGQDTDTLVGLPRPIHESVKTLKQHKYISIADVQIK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 NEEELEKCPMSLGEEVVPETPCEILYQGMLYSLPQYMIALLKILLAAAPTSKAKTDSINI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NEEELEKCPMSLGEEVVPETPCEILYQGMLYSLPQYMIALLKILLAAAPTSKAKTDSINI
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 LADVLPEEMPITVLQSMKLGIDVNRHKEIIVKSISTLLLLLLKHFKLNHIYQFEYVSQHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LADVLPEEMPITVLQSMKLGIDVNRHKEIIVKSISTLLLLLLKHFKLNHIYQFEYVSQHL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 VFANCIPLILKFFNQNILSYITAKNSISVLDYPCCTIQDLPELTTESLEAGDNSQFCWRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VFANCIPLILKFFNQNILSYITAKNSISVLDYPCCTIQDLPELTTESLEAGDNSQFCWRN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 LFSCINLLRLLNKLTKWKHSRTMMLVVFKSAPILKRALKVKQAMLQLYVLKLLKLQTKYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LFSCINLLRLLNKLTKWKHSRTMMLVVFKSAPILKRALKVKQAMLQLYVLKLLKLQTKYL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750        
pF1KA1 GRQWRKSNMKTMSAIYQKVRHRMNDDWAYGNGESSQSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GRQWRKSNMKTMSAIYQKVRHRMNDDWAYGNGESSQSS
              730       740       750        

>>CCDS34752.1 STRIP2 gene_id:57464|Hs108|chr7             (834 aa)
 initn: 4969 init1: 4969 opt: 4969  Z-score: 4737.6  bits: 887.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4969; 100.0% identity (100.0% similar) in 751 aa overlap (1-751:1-751)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MEDPAAPGTGGPPANGNGNGGGKGKQAAPKGREAFRSQRRESEGSVDCPTLEFEYGDADG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MEDPAAPGTGGPPANGNGNGGGKGKQAAPKGREAFRSQRRESEGSVDCPTLEFEYGDADG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 HAAELSELYSYTENLEFTNNRRCFEEDFKTQVQGKEWLELEEDAQKAYIMGLLDRLEVVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HAAELSELYSYTENLEFTNNRRCFEEDFKTQVQGKEWLELEEDAQKAYIMGLLDRLEVVS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 RERRLKVARAVLYLAQGTFGECDSEVDVLHWSRYNCFLLYQMGTFSTFLELLHMEIDNSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RERRLKVARAVLYLAQGTFGECDSEVDVLHWSRYNCFLLYQMGTFSTFLELLHMEIDNSQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 ACSSALRKPAVSIADSTELRVLLSVMYLMVENIRLERETDPCGWRTARETFRTELSFSMH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ACSSALRKPAVSIADSTELRVLLSVMYLMVENIRLERETDPCGWRTARETFRTELSFSMH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 NEEPFALLLFSMVTKFCSGLAPHFPIKKVLLLLWKVVMFTLGGFEHLQTLKVQKRAELGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NEEPFALLLFSMVTKFCSGLAPHFPIKKVLLLLWKVVMFTLGGFEHLQTLKVQKRAELGL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 PPLAEDSIQVVKSMRAASPPSYTLDLGESQLAPPPSKLRGRRGSRRQLLTKQDSLDIYNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PPLAEDSIQVVKSMRAASPPSYTLDLGESQLAPPPSKLRGRRGSRRQLLTKQDSLDIYNE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 RDLFKTEEPATEEEEESAGDGERTLDGELDLLEQDPLVPPPPSQAPLSAERVAFPKGLPW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RDLFKTEEPATEEEEESAGDGERTLDGELDLLEQDPLVPPPPSQAPLSAERVAFPKGLPW
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 APKVRQKDIEHFLEMSRNKFIGFTLGQDTDTLVGLPRPIHESVKTLKQHKYISIADVQIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 APKVRQKDIEHFLEMSRNKFIGFTLGQDTDTLVGLPRPIHESVKTLKQHKYISIADVQIK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 NEEELEKCPMSLGEEVVPETPCEILYQGMLYSLPQYMIALLKILLAAAPTSKAKTDSINI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NEEELEKCPMSLGEEVVPETPCEILYQGMLYSLPQYMIALLKILLAAAPTSKAKTDSINI
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 LADVLPEEMPITVLQSMKLGIDVNRHKEIIVKSISTLLLLLLKHFKLNHIYQFEYVSQHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LADVLPEEMPITVLQSMKLGIDVNRHKEIIVKSISTLLLLLLKHFKLNHIYQFEYVSQHL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 VFANCIPLILKFFNQNILSYITAKNSISVLDYPCCTIQDLPELTTESLEAGDNSQFCWRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VFANCIPLILKFFNQNILSYITAKNSISVLDYPCCTIQDLPELTTESLEAGDNSQFCWRN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 LFSCINLLRLLNKLTKWKHSRTMMLVVFKSAPILKRALKVKQAMLQLYVLKLLKLQTKYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LFSCINLLRLLNKLTKWKHSRTMMLVVFKSAPILKRALKVKQAMLQLYVLKLLKLQTKYL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750                              
pF1KA1 GRQWRKSNMKTMSAIYQKVRHRMNDDWAYGNGESSQSS                      
       :::::::::::::::::::::::::::::::                             
CCDS34 GRQWRKSNMKTMSAIYQKVRHRMNDDWAYGNDIDARPWDFQAEECTLRANIEAFNSRRYD
              730       740       750       760       770       780

CCDS34 RPQDSEFSPVDNCLQSVLGQRLDLPEDFHYSYELWLEREVFSQPICWEELLQNH
              790       800       810       820       830    

>>CCDS59197.1 STRIP1 gene_id:85369|Hs108|chr1             (742 aa)
 initn: 3127 init1: 1947 opt: 2097  Z-score: 2000.3  bits: 380.8 E(32554): 4.3e-105
Smith-Waterman score: 3182; 71.4% identity (88.8% similar) in 672 aa overlap (80-751:2-660)

      50        60        70        80        90       100         
pF1KA1 TLEFEYGDADGHAAELSELYSYTENLEFTNNRRCFEEDFKTQVQGKEWLELEEDAQKAYI
                                     ::.::::::. .:  :.: ::. . .... 
CCDS59                              MNRKCFEEDFRIHVTDKKWTELDTNQHRTHA
                                            10        20        30 

     110       120       130       140       150       160         
pF1KA1 MGLLDRLEVVSRERRLKVARAVLYLAQGTFGECDSEVDVLHWSRYNCFLLYQMGTFSTFL
       : ::: :::..::.:::::::.::.::::::::.::..:  : ::: ::: ..:::....
CCDS59 MRLLDGLEVTAREKRLKVARAILYVAQGTFGECSSEAEVQSWMRYNIFLLLEVGTFNALV
              40        50        60        70        80        90 

     170       180       190       200       210       220         
pF1KA1 ELLHMEIDNSQACSSALRKPAVSIADSTELRVLLSVMYLMVENIRLERETDPCGWRTARE
       :::.:::::: :::::.::::.:.::::.:::::..:::.::... : : :   ::: :.
CCDS59 ELLNMEIDNSAACSSAVRKPAISLADSTDLRVLLNIMYLIVETVHQECEGDKAEWRTMRQ
             100       110       120       130       140       150 

     230       240       250       260       270       280         
pF1KA1 TFRTELSFSMHNEEPFALLLFSMVTKFCSGLAPHFPIKKVLLLLWKVVMFTLGGFEHLQT
       :::.::.  ..:.::::..::.:::::::: :::::.:::::::::.:. ::::::.::.
CCDS59 TFRAELGSPLYNNEPFAIMLFGMVTKFCSGHAPHFPMKKVLLLLWKTVLCTLGGFEELQS
             160       170       180       190       200       210 

     290       300       310       320       330       340         
pF1KA1 LKVQKRAELGLPPLAEDSIQVVKSMRAASPPSYTLDLGESQLAPPPSKLRGRRGSRRQLL
       .:..::. :::::: ::::.:...:::::::. . :: :.:      . ::::  ... :
CCDS59 MKAEKRSILGLPPLPEDSIKVIRNMRAASPPASASDLIEQQ------QKRGRR--EHKAL
             220       230       240       250               260   

     350       360       370       380       390       400         
pF1KA1 TKQDSLDIYNERDLFKTEEPATEEEEESAGDGERTLDGELDLLEQDPLVPPPPSQAPLSA
        :::.:: .:::: .:... . :::::.  : . .:.::   ::.: ..:::  : : ..
CCDS59 IKQDNLDAFNERDPYKADD-SREEEEEN--DDDNSLEGETFPLERDEVMPPP-LQHP-QT
           270       280        290         300       310          

     410       420       430       440       450       460         
pF1KA1 ERVAFPKGLPWAPKVRQKDIEHFLEMSRNKFIGFTLGQDTDTLVGLPRPIHESVKTLKQH
       .:.. :::::::::::.:::: ::: ::.::::.:::.::.:.::::::::::.::::::
CCDS59 DRLTCPKGLPWAPKVREKDIEMFLESSRSKFIGYTLGSDTNTVVGLPRPIHESIKTLKQH
      320       330       340       350       360       370        

     470       480       490       500       510       520         
pF1KA1 KYISIADVQIKNEEELEKCPMSLGEEVVPETPCEILYQGMLYSLPQYMIALLKILLAAAP
       :: :::.:: . :::  . :.: ::: : ..: : ::::.: ::::::::::::::::::
CCDS59 KYTSIAEVQAQMEEEYLRSPLSGGEEEVEQVPAETLYQGLLPSLPQYMIALLKILLAAAP
      380       390       400       410       420       430        

     530       540       550       560       570       580         
pF1KA1 TSKAKTDSINILADVLPEEMPITVLQSMKLGIDVNRHKEIIVKSISTLLLLLLKHFKLNH
       ::::::::::::::::::::: :::::::::.:::::::.:::.::..::::::::::::
CCDS59 TSKAKTDSINILADVLPEEMPTTVLQSMKLGVDVNRHKEVIVKAISAVLLLLLKHFKLNH
      440       450       460       470       480       490        

     590       600       610       620       630       640         
pF1KA1 IYQFEYVSQHLVFANCIPLILKFFNQNILSYITAKNSISVLDYPCCTIQDLPELTTESLE
       .:::::..::::::::::::::::::::.::::::::::::::: :....:::::.::::
CCDS59 VYQFEYMAQHLVFANCIPLILKFFNQNIMSYITAKNSISVLDYPHCVVHELPELTAESLE
      500       510       520       530       540       550        

     650       660       670       680       690       700         
pF1KA1 AGDNSQFCWRNLFSCINLLRLLNKLTKWKHSRTMMLVVFKSAPILKRALKVKQAMLQLYV
       :::..:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS59 AGDSNQFCWRNLFSCINLLRILNKLTKWKHSRTMMLVVFKSAPILKRALKVKQAMMQLYV
      560       570       580       590       600       610        

     710       720       730       740       750                   
pF1KA1 LKLLKLQTKYLGRQWRKSNMKTMSAIYQKVRHRMNDDWAYGNGESSQSS           
       :::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::                  
CCDS59 LKLLKVQTKYLGRQWRKSNMKTMSAIYQKVRHRLNDDWAYGNDLDARPWDFQAEECALRA
      620       630       640       650       660       670        

CCDS59 NIERFNARRYDRAHSNPDFLPVDNCLQSVLGQRVDLPEDFQMNYDLWLEREVFSKPISWE
      680       690       700       710       720       730        

>>CCDS30798.1 STRIP1 gene_id:85369|Hs108|chr1             (837 aa)
 initn: 3311 init1: 1947 opt: 2097  Z-score: 1999.5  bits: 380.8 E(32554): 4.7e-105
Smith-Waterman score: 3381; 69.0% identity (86.6% similar) in 748 aa overlap (4-751:23-755)

                                  10        20        30        40 
pF1KA1                    MEDPAAPGTGGPPANGNGNGGGKGKQAAPKGREAFRSQRRE
                             :  :... :: ..    .. :   . :.::  :.::..
CCDS30 MEPAVGGPGPLIVNNKQPQPPPPPPPAAAQPPPGAPR--AAAGLLPGGKAREFNRNQRKD
               10        20        30          40        50        

              50        60        70        80        90       100 
pF1KA1 SEGSVDCPTLEFEYGDADGHAAELSELYSYTENLEFTNNRRCFEEDFKTQVQGKEWLELE
       :::  . : :::::.:.:  ::::::::::::. ::  ::.::::::. .:  :.: ::.
CCDS30 SEGYSESPDLEFEYADTDKWAAELSELYSYTEGPEFLMNRKCFEEDFRIHVTDKKWTELD
       60        70        80        90       100       110        

             110       120       130       140       150       160 
pF1KA1 EDAQKAYIMGLLDRLEVVSRERRLKVARAVLYLAQGTFGECDSEVDVLHWSRYNCFLLYQ
        . .... : ::: :::..::.:::::::.::.::::::::.::..:  : ::: ::: .
CCDS30 TNQHRTHAMRLLDGLEVTAREKRLKVARAILYVAQGTFGECSSEAEVQSWMRYNIFLLLE
      120       130       140       150       160       170        

             170       180       190       200       210       220 
pF1KA1 MGTFSTFLELLHMEIDNSQACSSALRKPAVSIADSTELRVLLSVMYLMVENIRLERETDP
       .:::....:::.:::::: :::::.::::.:.::::.:::::..:::.::... : : : 
CCDS30 VGTFNALVELLNMEIDNSAACSSAVRKPAISLADSTDLRVLLNIMYLIVETVHQECEGDK
      180       190       200       210       220       230        

             230       240       250       260       270       280 
pF1KA1 CGWRTARETFRTELSFSMHNEEPFALLLFSMVTKFCSGLAPHFPIKKVLLLLWKVVMFTL
         ::: :.:::.::.  ..:.::::..::.:::::::: :::::.:::::::::.:. ::
CCDS30 AEWRTMRQTFRAELGSPLYNNEPFAIMLFGMVTKFCSGHAPHFPMKKVLLLLWKTVLCTL
      240       250       260       270       280       290        

             290       300       310       320       330       340 
pF1KA1 GGFEHLQTLKVQKRAELGLPPLAEDSIQVVKSMRAASPPSYTLDLGESQLAPPPSKLRGR
       ::::.::..:..::. :::::: ::::.:...:::::::. . :: :.:      . :::
CCDS30 GGFEELQSMKAEKRSILGLPPLPEDSIKVIRNMRAASPPASASDLIEQQ------QKRGR
      300       310       320       330       340             350  

             350       360       370       380       390       400 
pF1KA1 RGSRRQLLTKQDSLDIYNERDLFKTEEPATEEEEESAGDGERTLDGELDLLEQDPLVPPP
       :  ... : :::.:: .:::: .:... . :::::.  : . .:.::   ::.: ..:::
CCDS30 R--EHKALIKQDNLDAFNERDPYKADD-SREEEEEN--DDDNSLEGETFPLERDEVMPPP
              360       370        380         390       400       

             410       420       430       440       450       460 
pF1KA1 PSQAPLSAERVAFPKGLPWAPKVRQKDIEHFLEMSRNKFIGFTLGQDTDTLVGLPRPIHE
         : : . .:.. :::::::::::.:::: ::: ::.::::.:::.::.:.:::::::::
CCDS30 -LQHPQT-DRLTCPKGLPWAPKVREKDIEMFLESSRSKFIGYTLGSDTNTVVGLPRPIHE
        410        420       430       440       450       460     

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pF1KA1 SVKTLKQHKYISIADVQIKNEEELEKCPMSLGEEVVPETPCEILYQGMLYSLPQYMIALL
       :.:::::::: :::.:: . :::  . :.: ::: : ..: : ::::.: ::::::::::
CCDS30 SIKTLKQHKYTSIAEVQAQMEEEYLRSPLSGGEEEVEQVPAETLYQGLLPSLPQYMIALL
         470       480       490       500       510       520     

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pF1KA1 KILLAAAPTSKAKTDSINILADVLPEEMPITVLQSMKLGIDVNRHKEIIVKSISTLLLLL
       ::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::.:::::::.:::.::..::::
CCDS30 KILLAAAPTSKAKTDSINILADVLPEEMPTTVLQSMKLGVDVNRHKEVIVKAISAVLLLL
         530       540       550       560       570       580     

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pF1KA1 LKHFKLNHIYQFEYVSQHLVFANCIPLILKFFNQNILSYITAKNSISVLDYPCCTIQDLP
       ::::::::.:::::..::::::::::::::::::::.::::::::::::::: :....::
CCDS30 LKHFKLNHVYQFEYMAQHLVFANCIPLILKFFNQNIMSYITAKNSISVLDYPHCVVHELP
         590       600       610       620       630       640     

             650       660       670       680       690       700 
pF1KA1 ELTTESLEAGDNSQFCWRNLFSCINLLRLLNKLTKWKHSRTMMLVVFKSAPILKRALKVK
       :::.:::::::..:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ELTAESLEAGDSNQFCWRNLFSCINLLRILNKLTKWKHSRTMMLVVFKSAPILKRALKVK
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pF1KA1 QAMLQLYVLKLLKLQTKYLGRQWRKSNMKTMSAIYQKVRHRMNDDWAYGNGESSQSS   
       :::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::          
CCDS30 QAMMQLYVLKLLKVQTKYLGRQWRKSNMKTMSAIYQKVRHRLNDDWAYGNDLDARPWDFQ
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CCDS30 AEECALRANIERFNARRYDRAHSNPDFLPVDNCLQSVLGQRVDLPEDFQMNYDLWLEREV
         770       780       790       800       810       820     




758 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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