FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1170, 758 aa 1>>>pF1KA1170 758 - 758 aa - 758 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8015+/-0.000804; mu= 14.4673+/- 0.049 mean_var=110.0206+/-21.890, 0's: 0 Z-trim(111.1): 12 B-trim: 2 in 1/50 Lambda= 0.122275 statistics sampled from 12090 (12096) to 12090 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.711), E-opt: 0.2 (0.372), width: 16 Scan time: 3.790 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS47709.1 STRIP2 gene_id:57464|Hs108|chr7 ( 758) 5010 894.7 0 CCDS34752.1 STRIP2 gene_id:57464|Hs108|chr7 ( 834) 4969 887.5 0 CCDS59197.1 STRIP1 gene_id:85369|Hs108|chr1 ( 742) 2097 380.8 4.3e-105 CCDS30798.1 STRIP1 gene_id:85369|Hs108|chr1 ( 837) 2097 380.8 4.7e-105 >>CCDS47709.1 STRIP2 gene_id:57464|Hs108|chr7 (758 aa) initn: 5010 init1: 5010 opt: 5010 Z-score: 4777.3 bits: 894.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5010; 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CCDS59 IKQDNLDAFNERDPYKADD-SREEEEEN--DDDNSLEGETFPLERDEVMPPP-LQHP-QT 270 280 290 300 310 410 420 430 440 450 460 pF1KA1 ERVAFPKGLPWAPKVRQKDIEHFLEMSRNKFIGFTLGQDTDTLVGLPRPIHESVKTLKQH .:.. :::::::::::.:::: ::: ::.::::.:::.::.:.::::::::::.:::::: CCDS59 DRLTCPKGLPWAPKVREKDIEMFLESSRSKFIGYTLGSDTNTVVGLPRPIHESIKTLKQH 320 330 340 350 360 370 470 480 490 500 510 520 pF1KA1 KYISIADVQIKNEEELEKCPMSLGEEVVPETPCEILYQGMLYSLPQYMIALLKILLAAAP :: :::.:: . ::: . :.: ::: : ..: : ::::.: :::::::::::::::::: CCDS59 KYTSIAEVQAQMEEEYLRSPLSGGEEEVEQVPAETLYQGLLPSLPQYMIALLKILLAAAP 380 390 400 410 420 430 530 540 550 560 570 580 pF1KA1 TSKAKTDSINILADVLPEEMPITVLQSMKLGIDVNRHKEIIVKSISTLLLLLLKHFKLNH ::::::::::::::::::::: :::::::::.:::::::.:::.::..:::::::::::: CCDS59 TSKAKTDSINILADVLPEEMPTTVLQSMKLGVDVNRHKEVIVKAISAVLLLLLKHFKLNH 440 450 460 470 480 490 590 600 610 620 630 640 pF1KA1 IYQFEYVSQHLVFANCIPLILKFFNQNILSYITAKNSISVLDYPCCTIQDLPELTTESLE .:::::..::::::::::::::::::::.::::::::::::::: :....:::::.:::: CCDS59 VYQFEYMAQHLVFANCIPLILKFFNQNIMSYITAKNSISVLDYPHCVVHELPELTAESLE 500 510 520 530 540 550 650 660 670 680 690 700 pF1KA1 AGDNSQFCWRNLFSCINLLRLLNKLTKWKHSRTMMLVVFKSAPILKRALKVKQAMLQLYV :::..:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: CCDS59 AGDSNQFCWRNLFSCINLLRILNKLTKWKHSRTMMLVVFKSAPILKRALKVKQAMMQLYV 560 570 580 590 600 610 710 720 730 740 750 pF1KA1 LKLLKLQTKYLGRQWRKSNMKTMSAIYQKVRHRMNDDWAYGNGESSQSS :::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::: CCDS59 LKLLKVQTKYLGRQWRKSNMKTMSAIYQKVRHRLNDDWAYGNDLDARPWDFQAEECALRA 620 630 640 650 660 670 CCDS59 NIERFNARRYDRAHSNPDFLPVDNCLQSVLGQRVDLPEDFQMNYDLWLEREVFSKPISWE 680 690 700 710 720 730 >>CCDS30798.1 STRIP1 gene_id:85369|Hs108|chr1 (837 aa) initn: 3311 init1: 1947 opt: 2097 Z-score: 1999.5 bits: 380.8 E(32554): 4.7e-105 Smith-Waterman score: 3381; 69.0% identity (86.6% similar) in 748 aa overlap (4-751:23-755) 10 20 30 40 pF1KA1 MEDPAAPGTGGPPANGNGNGGGKGKQAAPKGREAFRSQRRE : :... :: .. .. : . :.:: :.::.. CCDS30 MEPAVGGPGPLIVNNKQPQPPPPPPPAAAQPPPGAPR--AAAGLLPGGKAREFNRNQRKD 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KA1 SEGSVDCPTLEFEYGDADGHAAELSELYSYTENLEFTNNRRCFEEDFKTQVQGKEWLELE ::: . : :::::.:.: ::::::::::::. :: ::.::::::. .: :.: ::. CCDS30 SEGYSESPDLEFEYADTDKWAAELSELYSYTEGPEFLMNRKCFEEDFRIHVTDKKWTELD 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KA1 EDAQKAYIMGLLDRLEVVSRERRLKVARAVLYLAQGTFGECDSEVDVLHWSRYNCFLLYQ . .... : ::: :::..::.:::::::.::.::::::::.::..: : ::: ::: . CCDS30 TNQHRTHAMRLLDGLEVTAREKRLKVARAILYVAQGTFGECSSEAEVQSWMRYNIFLLLE 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KA1 MGTFSTFLELLHMEIDNSQACSSALRKPAVSIADSTELRVLLSVMYLMVENIRLERETDP .:::....:::.:::::: :::::.::::.:.::::.:::::..:::.::... : : : CCDS30 VGTFNALVELLNMEIDNSAACSSAVRKPAISLADSTDLRVLLNIMYLIVETVHQECEGDK 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KA1 CGWRTARETFRTELSFSMHNEEPFALLLFSMVTKFCSGLAPHFPIKKVLLLLWKVVMFTL ::: :.:::.::. ..:.::::..::.:::::::: :::::.:::::::::.:. :: CCDS30 AEWRTMRQTFRAELGSPLYNNEPFAIMLFGMVTKFCSGHAPHFPMKKVLLLLWKTVLCTL 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KA1 GGFEHLQTLKVQKRAELGLPPLAEDSIQVVKSMRAASPPSYTLDLGESQLAPPPSKLRGR ::::.::..:..::. :::::: ::::.:...:::::::. . :: :.: . ::: CCDS30 GGFEELQSMKAEKRSILGLPPLPEDSIKVIRNMRAASPPASASDLIEQQ------QKRGR 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KA1 RGSRRQLLTKQDSLDIYNERDLFKTEEPATEEEEESAGDGERTLDGELDLLEQDPLVPPP : ... : :::.:: .:::: .:... . :::::. : . .:.:: ::.: ..::: CCDS30 R--EHKALIKQDNLDAFNERDPYKADD-SREEEEEN--DDDNSLEGETFPLERDEVMPPP 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KA1 PSQAPLSAERVAFPKGLPWAPKVRQKDIEHFLEMSRNKFIGFTLGQDTDTLVGLPRPIHE : : . .:.. :::::::::::.:::: ::: ::.::::.:::.::.:.::::::::: CCDS30 -LQHPQT-DRLTCPKGLPWAPKVREKDIEMFLESSRSKFIGYTLGSDTNTVVGLPRPIHE 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KA1 SVKTLKQHKYISIADVQIKNEEELEKCPMSLGEEVVPETPCEILYQGMLYSLPQYMIALL :.:::::::: :::.:: . ::: . :.: ::: : ..: : ::::.: :::::::::: CCDS30 SIKTLKQHKYTSIAEVQAQMEEEYLRSPLSGGEEEVEQVPAETLYQGLLPSLPQYMIALL 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KA1 KILLAAAPTSKAKTDSINILADVLPEEMPITVLQSMKLGIDVNRHKEIIVKSISTLLLLL ::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::.:::::::.:::.::..:::: CCDS30 KILLAAAPTSKAKTDSINILADVLPEEMPTTVLQSMKLGVDVNRHKEVIVKAISAVLLLL 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KA1 LKHFKLNHIYQFEYVSQHLVFANCIPLILKFFNQNILSYITAKNSISVLDYPCCTIQDLP ::::::::.:::::..::::::::::::::::::::.::::::::::::::: :....:: CCDS30 LKHFKLNHVYQFEYMAQHLVFANCIPLILKFFNQNIMSYITAKNSISVLDYPHCVVHELP 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KA1 ELTTESLEAGDNSQFCWRNLFSCINLLRLLNKLTKWKHSRTMMLVVFKSAPILKRALKVK :::.:::::::..:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 ELTAESLEAGDSNQFCWRNLFSCINLLRILNKLTKWKHSRTMMLVVFKSAPILKRALKVK 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 pF1KA1 QAMLQLYVLKLLKLQTKYLGRQWRKSNMKTMSAIYQKVRHRMNDDWAYGNGESSQSS :::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::: CCDS30 QAMMQLYVLKLLKVQTKYLGRQWRKSNMKTMSAIYQKVRHRLNDDWAYGNDLDARPWDFQ 710 720 730 740 750 760 CCDS30 AEECALRANIERFNARRYDRAHSNPDFLPVDNCLQSVLGQRVDLPEDFQMNYDLWLEREV 770 780 790 800 810 820 758 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 01:22:40 2016 done: Fri Nov 4 01:22:41 2016 Total Scan time: 3.790 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]