Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1190
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1190, 747 aa
1>>>pF1KA1190 747 - 747 aa - 747 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4712+/-0.00109; mu= -3.0940+/- 0.066
mean_var=519.8167+/-107.099, 0's: 0 Z-trim(118.0): 831 B-trim: 898 in 1/55
Lambda= 0.056253
statistics sampled from 17898 (18817) to 17898 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.821), E-opt: 0.2 (0.578), width: 16
Scan time: 4.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46805.2 ZBTB47 gene_id:92999|Hs108|chr3 ( 747) 5223 438.7 1.6e-122
CCDS32677.1 ZNF652 gene_id:22834|Hs108|chr17 ( 606) 1916 170.2 8.6e-42
CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19 ( 576) 750 75.5 2.6e-13
CCDS42532.1 ZNF253 gene_id:56242|Hs108|chr19 ( 499) 747 75.2 2.8e-13
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19 ( 536) 733 74.1 6.3e-13
CCDS12412.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 646) 735 74.4 6.4e-13
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 733 74.2 6.8e-13
CCDS33094.1 ZNF468 gene_id:90333|Hs108|chr19 ( 522) 731 73.9 7e-13
CCDS42536.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19 ( 774) 735 74.5 7.2e-13
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 731 74.1 8.7e-13
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 728 73.9 1e-12
CCDS32978.1 ZNF430 gene_id:80264|Hs108|chr19 ( 570) 723 73.3 1.2e-12
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 724 73.5 1.2e-12
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 722 73.4 1.5e-12
CCDS46990.1 ZNF732 gene_id:654254|Hs108|chr4 ( 585) 719 73.0 1.5e-12
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 799) 722 73.4 1.5e-12
CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19 ( 682) 720 73.2 1.5e-12
CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 907) 723 73.6 1.6e-12
CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 913) 723 73.6 1.6e-12
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 718 73.0 1.6e-12
CCDS47357.2 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 867) 721 73.4 1.7e-12
CCDS54955.1 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 900) 721 73.4 1.7e-12
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 713 72.4 1.8e-12
CCDS4441.1 ZNF454 gene_id:285676|Hs108|chr5 ( 522) 714 72.6 1.8e-12
CCDS12099.1 ZNF77 gene_id:58492|Hs108|chr19 ( 545) 714 72.6 1.9e-12
CCDS45984.2 ZNF878 gene_id:729747|Hs108|chr19 ( 531) 713 72.5 1.9e-12
CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 718 73.2 2e-12
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 713 72.6 2.1e-12
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 713 72.6 2.2e-12
CCDS46172.1 ZNF813 gene_id:126017|Hs108|chr19 ( 617) 712 72.5 2.3e-12
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 711 72.4 2.4e-12
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 711 72.4 2.5e-12
CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19 ( 528) 708 72.1 2.6e-12
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 709 72.2 2.7e-12
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 819) 710 72.5 3e-12
CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 825) 710 72.5 3.1e-12
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 705 71.9 3.2e-12
CCDS54239.1 ZNF714 gene_id:148206|Hs108|chr19 ( 555) 703 71.7 3.5e-12
CCDS12409.1 ZNF14 gene_id:7561|Hs108|chr19 ( 642) 702 71.7 4.1e-12
CCDS32902.1 ZNF121 gene_id:7675|Hs108|chr19 ( 390) 695 70.9 4.4e-12
CCDS77228.1 ZNF121 gene_id:7675|Hs108|chr19 ( 390) 695 70.9 4.4e-12
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 702 71.8 4.6e-12
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 696 71.2 5.3e-12
CCDS5528.2 ZNF273 gene_id:10793|Hs108|chr7 ( 569) 696 71.2 5.3e-12
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 702 71.9 5.3e-12
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 696 71.2 5.5e-12
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 696 71.2 5.6e-12
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 702 72.0 5.6e-12
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 702 72.0 5.7e-12
CCDS58659.1 ZNF382 gene_id:84911|Hs108|chr19 ( 549) 694 71.0 5.8e-12
>>CCDS46805.2 ZBTB47 gene_id:92999|Hs108|chr3 (747 aa)
initn: 5223 init1: 5223 opt: 5223 Z-score: 2313.2 bits: 438.7 E(32554): 1.6e-122
Smith-Waterman score: 5223; 100.0% identity (100.0% similar) in 747 aa overlap (1-747:1-747)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MGRLNEQRLFQPDLCDVDLVLVPQRSVFPAHKGVLAAYSQFFHSLFTQNKQLQRVELSLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MGRLNEQRLFQPDLCDVDLVLVPQRSVFPAHKGVLAAYSQFFHSLFTQNKQLQRVELSLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 ALAPGGLQQILNFIYTSKLLVNAANVHEVLSAASLLQMADIAASCQELLDARSLGPPGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ALAPGGLQQILNFIYTSKLLVNAANVHEVLSAASLLQMADIAASCQELLDARSLGPPGPG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 TVALAQPAASCTPAAPPYYCDIKQEADTPGLPKIYAREGPDPYSVRVEDGAGTAGGTVPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TVALAQPAASCTPAAPPYYCDIKQEADTPGLPKIYAREGPDPYSVRVEDGAGTAGGTVPA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 TIGPAQPFFKEEKEGGVEEAGGPPASLCKLEGGEELEEELGGSGTYSRREQSQIIVEVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TIGPAQPFFKEEKEGGVEEAGGPPASLCKLEGGEELEEELGGSGTYSRREQSQIIVEVNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 NNQTLHVSTGPEGKPGAGPSPATVVLGREDGLQRHSDEEEEDDEEEEEEEEEEEGGGSGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NNQTLHVSTGPEGKPGAGPSPATVVLGREDGLQRHSDEEEEDDEEEEEEEEEEEGGGSGR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 EEEEEEEGGSQGEEEEEEEDGHSEQEEEEEEEEEEGPSEQDQESSEEEEGEEGEAGGKQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EEEEEEEGGSQGEEEEEEEDGHSEQEEEEEEEEEEGPSEQDQESSEEEEGEEGEAGGKQG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 PRGSRSSRADPPPHSHMATRSRENARRRGTPEPEEAGRRGGKRPKPPPGVASASARGPPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PRGSRSSRADPPPHSHMATRSRENARRRGTPEPEEAGRRGGKRPKPPPGVASASARGPPA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 TDGLGAKVKLEEKQHHPCQKCPRVFNNRWYLEKHMNVTHSRMQICDQCGKRFLLESELLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TDGLGAKVKLEEKQHHPCQKCPRVFNNRWYLEKHMNVTHSRMQICDQCGKRFLLESELLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 HRQTDCERNIQCVTCGKAFKKLWSLHEHNKIVHGYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HRQTDCERNIQCVTCGKAFKKLWSLHEHNKIVHGYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 AHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCNERFQYKYQLRSHMSIHIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCNERFQYKYQLRSHMSIHIG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 HKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 PCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVSHTLAGDGVPAAPGLPPTQPQAHALPLLPGLPQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVSHTLAGDGVPAAPGLPPTQPQAHALPLLPGLPQTL
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KA1 PPPPHLPPPPPLFPTTASPGGRMNANN
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PPPPHLPPPPPLFPTTASPGGRMNANN
730 740
>>CCDS32677.1 ZNF652 gene_id:22834|Hs108|chr17 (606 aa)
initn: 2054 init1: 1776 opt: 1916 Z-score: 863.8 bits: 170.2 E(32554): 8.6e-42
Smith-Waterman score: 1983; 51.4% identity (64.8% similar) in 673 aa overlap (98-735:1-579)
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 QQILNFIYTSKLLVNAANVHEVLSAASLLQMADIAASCQELLDARSLGPPGPGTVALAQP
:. :.:::::.. .. : .::
CCDS32 MSHTASSCQELVENCAVHVAG-----MAQE
10 20
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 AASCTPAAPPYYCDIKQEADTPGLPKIYAREGPDPYSVRVEDGAGTAGGTVPATIGPAQP
. . .: .:: : :.: ::. .:::: :. : . ::
CCDS32 DSRRGQVPSSFYHGANQELDLS--TKVYKRESGSPYSVLVD----TKMSKPHLHETEEQP
30 40 50 60 70
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 FFKEEKEGGVEEAGGPPASLCKLEGGEELEEELGGSGTYSRREQSQIIVEVNLNNQTLHV
.:.: . .: .. . . . . :: :::. .:.:. :::::::::::::.:
CCDS32 YFRETR--AVSDVHAVKEDRENSDDTEEEEEEV----SYKRE---QIIVEVNLNNQTLNV
80 90 100 110 120 130
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 STGPEGKPGAGPSPATVVLGREDGLQRHSDEEEEDDEEEEEEEEEEEGGGSGREEEEEEE
: : .: .. : : :: . :.::::..::: .. .. :
CCDS32 SKGEKGV--SSQSKETPVL------KTSSEEEEEESEEEATDDSNDYG------------
140 150 160 170
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 GGSQGEEEEEEEDGHSEQEEEEEEEEEEGPSEQDQESSEEEEGEEGEAGGKQGPRGSRSS
:.:.....: :. . .... . . : ..
CCDS32 -------------------ENEKQKKKEKIVEKVSVTQRRTRRAASVA----------AA
180 190 200
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 RADPPPHSHMATRSRENARRRGTPEPEEAGRRGGKRPKPPPGVASASARGPPATDGLGAK
..: :.. ::.: : . :: . .:. :.:: : :
CCDS32 TTSPTPRT---TRGR-----RKSVEPPKRKKRATKEPKAPV-----------------QK
210 220 230
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 VKLEEKQHHPCQKCPRVFNNRWYLEKHMNVTHSRMQICDQCGKRFLLESELLLHRQTDCE
.: :::. :.:::::::.:::::::::::: ::::::.:::.:.::::: ::.:::::
CCDS32 AKCEEKETLTCEKCPRVFNTRWYLEKHMNVTHRRMQICDKCGKKFVLESELSLHQQTDCE
240 250 260 270 280 290
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 RNIQCVTCGKAFKKLWSLHEHNKIVHGYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMP
.:::::.:.:.:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KNIQCVSCNKSFKKLWSLHEHIKIVHGYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMP
300 310 320 330 340 350
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 FTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCNERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCDERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQ
360 370 380 390 400 410
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 WCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQ
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPFICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQ
420 430 440 450 460 470
670 680 690 700
pF1KA1 RFRFSNMLKAHKEKCFRVSH-------------TLAGDGVPAA------PGLP-------
::::::::::::::::::. : . ::.. : :
CCDS32 RFRFSNMLKAHKEKCFRVTSPVNVPPAVQIPLTTSPATPVPSVVNTATTPTPPINMNPVS
480 490 500 510 520 530
710 720 730 740
pF1KA1 --PTQPQAHALPLL-----PGLPQTLP-PP-PHLPPPPPLFPTTASPGGRMNANN
: .: : . : : :. :: :: ::::::: :: .
CCDS32 TLPPRPIPHPFSHLHIHPHPHHPHHLPIPPVPHLPPPPALFKSEPLNHRGQSEDNFLRHL
540 550 560 570 580 590
CCDS32 AEKNSSAQHH
600
>>CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19 (576 aa)
initn: 1047 init1: 589 opt: 750 Z-score: 352.6 bits: 75.5 E(32554): 2.6e-13
Smith-Waterman score: 750; 40.6% identity (65.2% similar) in 256 aa overlap (427-679:195-447)
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 GRRGGKRPKPPPGVASASARGPPATDGLGAKVKLEEKQHHPCQKCPRVFNNRWYLEKH--
:.. :. :.:: . : .: .:
CCDS32 NQCLTTTQSKIFPCDKYVKVFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKR
170 180 190 200 210 220
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 MNVTHSRMQICDQCGKRFLLESELLLHRQTDC-ERNIQCVTCGKAFKKLWSLHEHNKIVH
... .. .: :..::: : : : :.. :. ..: ::::::. .: : ::.:
CCDS32 IHIRENSYQ-CEECGKAFKWFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTH-KIIH
230 240 250 260 270 280
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 GYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGE
.:: . :: : : : .:. : . :: . :. :: :::.:..: .:..:.. :.::
CCDS32 T-GEKPYRCEECGKAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSTHKFIHAGE
290 300 310 320 330 340
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 KPFRCENCNERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYI
::..::.:.. :. : .: :: :.:.. :. ::: :: .. . .: . :::::::
CCDS32 KPYKCEECDKAFNRFSYLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYK
350 360 370 380 390 400
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 CEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVSHTLAGDG
::.:::.:. :. :. ::::::: :. ::. : : .: :::
CCDS32 CEVCGKAFNESSNLTTHKMIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPQLTAHKIIHTGEKPYKCEEC
410 420 430 440 450 460
700 710 720 730 740
pF1KA1 VPAAPGLPPTQPQAHALPLLPGLPQTLPPPPHLPPPPPLFPTTASPGGRMNANN
CCDS32 GKAFSQSSILTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAF
470 480 490 500 510 520
>>CCDS42532.1 ZNF253 gene_id:56242|Hs108|chr19 (499 aa)
initn: 1615 init1: 584 opt: 747 Z-score: 352.0 bits: 75.2 E(32554): 2.8e-13
Smith-Waterman score: 747; 42.0% identity (64.7% similar) in 255 aa overlap (427-679:192-443)
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 GRRGGKRPKPPPGVASASARGPPATDGLGAKVKLEEKQHHPCQKCPRVFNNRWYLEKHMN
:.. :: .. :..: ..::. : :
CCDS42 YKTRHTGINLFKCIICGKAFKRSSTLTTHKKIHTGEKPYR-CEECGKAFNQSANLTTHKR
170 180 190 200 210 220
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 V-THSRMQICDQCGKRFLLESELLLHRQTDC-ERNIQCVTCGKAFKKLWSLHEHNKIVHG
. : . :..::: : :.: :.. :. .: :::::.. .: : ::::
CCDS42 IHTGEKPYRCEECGKAFKQSSNLTTHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRSTDLTTH-KIVHT
230 240 250 260 270
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 YAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEK
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CCDS42 -GEKPYKCEECGKAFKHPSHVTTHKKIHTRGKPYNCEECGKSFKHCSNLTIHKRIHTGEK
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580 590 600 610 620 630
pF1KA1 PFRCENCNERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYIC
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CCDS42 PYKCEECGKAFHLSSHLTTHKILHTGEKPYRCRECGKAFNHSTTLFSHEKIHTGEKPYKC
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pF1KA1 EICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVSHTLAGDGV
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CCDS42 DECGKTFTWPSILSKHKRTHTGEKPYKCEECGKSFTASSTLTTHKRIHTGEKPYKCEECG
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pF1KA1 PAAPGLPPTQPQAHALPLLPGLPQTLPPPPHLPPPPPLFPTTASPGGRMNANN
CCDS42 KAFNWSSDLNKHKKIHIERKPYIVKNVTDLLNVPPLLISIR
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pF1KA1 V-THSRMQICDQCGKRFLLESELLLHRQTDC-ERNIQCVTCGKAFKKLWSLHEHNKIVHG
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CCDS54 IHTGEKPFKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCGKAFSRFSYLTAH-KIIHS
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pF1KA1 YAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEK
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CCDS54 -GEKPYKCEECGKAFKRSSNLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSILTAHKIIHSGEK
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pF1KA1 PFRCENCNERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYIC
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CCDS54 PYKCEECGKAFKHPSVLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFKYFSSLTTHKIIHSGEKPYKC
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pF1KA1 EICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVSHTLAGDGV
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CCDS54 EECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGEAFKYSSSLTTHKIIHTGQQPFKCEECG
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CCDS54 KAFKCFSILTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNSSSHLTAHKRIHTGEKPYKCERCGKAFK
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pF1KA1 -THSRMQICDQCGKRFLLESELLLHRQTDCE-RNIQCVTCGKAFKKLWSLHEHNKIVHGY
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CCDS12 HTGEKPYKCEECGKTFSVFSILTKHKIIHTEEKPYKCEECGKAFKRSSTLTKH-RIIHT-
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pF1KA1 AEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKP
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CCDS12 EEKPYKCEECGKAFNQSSTLSIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSTLTIHKMIHTGEKP
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pF1KA1 FRCENCNERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYICE
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CCDS12 YKCEECGKAFNRSSHLTTHKRIHTGHKPYKCKECGKSFSVFSTLTKHKIIHTDKKPYKCE
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pF1KA1 ICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVSHTLAGDGVP
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CCDS12 ECGKAFNRSSILSIHKKIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSHLAGHKQIHSVQKPYKCEECGK
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CCDS12 AFSIFSTLTKHKIIHTEEKPYKCEKCGKTFYRFSNLNTHKIIHTGEKPCKCEECGKAFNH
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CCDS32 TGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTH-EVIHTGE
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pF1KA1 RMQICDQCGKRFLLESELLLHRQTDC-ERNIQCVTCGKAFKKLWSLHEHNKIVHGYAEKK
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CCDS32 KPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKH-KIIHT-GEKP
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pF1KA1 FSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCE
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CCDS32 YKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCE
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pF1KA1 NCNERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYICEICGK
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CCDS32 ECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGK
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CCDS32 AFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
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pF1KA1 GAGPSPATVVLGREDGLQRHSDEEEEDDEEEEEEEEEEEGGGSGREEEEEEEGGSQGEEE
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CCDS33 VIHTGTLHRQASHHIGEFCFHEIEKDIHGFEFQWKEDETNGHAAPMTEIKELAGSTGQHD
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pF1KA1 EEEEDGHSEQEEEEEEEEEEGPSEQDQESSEEEEGEEGEAGGKQGPRGSRSSRADPPPHS
... .. ... . . : : .:: . :.. : . ... : :.: :..
CCDS33 QRHAGNKRIKDQLGSSFHLHLP-EPHIFQSEGKIGNQVEKSINNASSVSTSQRICCRPKT
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pF1KA1 HMATRSRENARRRGTPEPEEAGRRGGKRPKPPPGVASASARGPPATDGLGAKVKLEEKQH
:.... .:. . . . . : : . : .. . . ..:::::
CCDS33 HISNKYGNNSLHSSLLTQKWEVH---MREKSFECIQSFKSFNCSSLLKKHQIIHLEEKQC
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pF1KA1 HPCQKCPRVFNNRWYLEKHMNV-THSRMQICDQCGKRFLLESELLLHRQTDC-ERNIQCV
. :. : .:::.. :: : : . :..::: : .: :..:. :. .:
CCDS33 K-CDVCGKVFNQKRYLACHRRCHTGEKPYKCNECGKTFGHNSSLFIHKALHTGEKPYECE
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pF1KA1 TCGKAFKKLWSLHEHNKIVHGYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETC
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CCDS33 ECDKVFSRKSHLERHKRIHTG--EKPYKCKVCDEAFAYNSYLAKHTILHTGEKPYTCNEC
310 320 330 340 350 360
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CCDS33 GKVFNRLSTLARHHRLHTGEKPYKCEECDKVFSRKSHLERHRRIHSGEKPYKCEECCKVF
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pF1KA1 NMKQYFDEHMKTHTGEKPYICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSN
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CCDS33 SRKSNLERHRRIHTGEKPYKCKVCDKAFQRDSHLAQHQRVHTGEKPYKCNECGKTFGQTS
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pF1KA1 MLKAHKEKCFRVSHTLAGDGVPAAPGLPPTQPQAHALPLLPGLPQTLPPPPHLPPPPPLF
: :.
CCDS33 SLIIHRRLHTGEKPYKCNECGKTFSQMSSLVYHHRLHSGEKP
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pF1KA1 RRGGKRPKPPPGVASASARGPPATDGLGAKVKLEEKQHHPCQKCPRVFNNRWYLEKHMNV
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CCDS42 KRIHTGEKPYKCEECGKAFSIFSTLTKHKIIHTEEKSHR-CEECGKAYKESSHLTTHKRI
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pF1KA1 -THSRMQICDQCGKRFLLESELLLHRQTDCE-RNIQCVTCGKAFKKLWSLHEHNKIVHGY
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CCDS42 EEKPYKCEECGKAFNQSSTLSIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSTLTIHKMIHTGEKP
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pF1KA1 FRCENCNERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYICE
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CCDS42 YKCEECGKAFNRSSHLTTHKRIHTGHKPYKCKECGKSFSVFSTLTKHKIIHTDKKPYKCE
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pF1KA1 ICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVSHTLAGDGVP
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CCDS42 ECGKAFNRSSILSIHKKIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSHLAGHKQIHSVQKPYKCEECGK
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pF1KA1 AAPGLPPTQPQAHALPLLPGLPQTLPPPPHLPPPPPLFPTTASPGGRMNANN
CCDS42 AFSIFSTLTKHKIIHTEEKPYKCEKCGKTFYRFSNLNTHKIIHTGEKPCKCEECGKAFNH
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pF1KA1 EEGEEGEAGGKQGPRGSRSSRADPPPHSHMATRSRENARRRGTPEPEEAGRRGGKRPKPP
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CCDS33 QGNECEEAFNDSSSLELHKQVHLGKKSPACSTHEKDTSYSSGIPV-QQSVRTGKKRY---
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pF1KA1 PGVASASARGPPATDGLGAKVKLEE-KQHHPCQKCPRVFNNRWYLEKHMNV-THSRMQIC
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CCDS33 --WCHECGKGFSQSSNLQTHQRVHTGEKPYTCHECGKSFNQSSHLYAHLPIHTGEKPYRC
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CCDS33 DSCGKGFSRSTDLNIHCRVHTGEKPYKCEVCGKGFTQRSHLQAHERIHTG--EKPYKCGD
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: :.: .... :. .::.. :. :. ::: :. :..:. :. :.::::..::.:..
CCDS33 CGKRFSCSSNLHTHQRVHTEEKPYKCDECGKCFSLSFNLHSHQRVHTGEKPYKCEECGKG
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pF1KA1 FQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYICEICGKSFTSR
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CCDS33 FSSASSFQSHQRVHTGEKPFRCNVCGKGFSQSSYFQAHQRVHTGEKPYKCEVCGKRFNWS
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pF1KA1 PNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVSHTLAGDGVPAAPGLPPTQ
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CCDS33 LNLHNHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSQASNLQAHQSVHTGEKPFKCDACQKRFSQASHLQ
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747 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]