Result of FASTA (omim) for
pF1KA1190
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1190, 747 aa
1>>>pF1KA1190 747 - 747 aa - 747 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.5149+/-0.000445; mu= -9.5646+/- 0.028
mean_var=588.1299+/-118.650, 0's: 0 Z-trim(125.8): 1621 B-trim: 2496 in 1/59
Lambda= 0.052886
statistics sampled from 48491 (50357) to 48491 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.825), E-opt: 0.2 (0.59), width: 16
Scan time: 10.200
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001138837 (OMIM: 613907) zinc finger protein 65 ( 606) 1916 161.2 1.2e-38
NP_055712 (OMIM: 613907) zinc finger protein 652 [ ( 606) 1916 161.2 1.2e-38
XP_005257223 (OMIM: 613907) PREDICTED: zinc finger ( 426) 1455 125.8 3.6e-28
NP_001318063 (OMIM: 606954) zinc finger protein 25 ( 423) 747 71.8 6.5e-12
NP_001318062 (OMIM: 606954) zinc finger protein 25 ( 435) 747 71.8 6.6e-12
NP_066385 (OMIM: 606954) zinc finger protein 253 i ( 499) 747 71.9 7.3e-12
XP_016881606 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 486) 733 70.8 1.5e-11
XP_016881605 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 504) 733 70.8 1.5e-11
XP_016882723 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 518) 733 70.8 1.6e-11
NP_001243102 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 531) 733 70.9 1.6e-11
XP_011526566 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 536) 733 70.9 1.6e-11
NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 733 70.9 1.6e-11
XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 733 70.9 1.6e-11
XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 733 70.9 1.6e-11
XP_016882933 (OMIM: 616841) PREDICTED: zinc finger ( 469) 731 70.6 1.6e-11
XP_011525900 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 733 70.9 1.6e-11
XP_005259754 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 733 70.9 1.6e-11
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 733 70.9 1.7e-11
NP_001008801 (OMIM: 616841) zinc finger protein 46 ( 522) 731 70.7 1.7e-11
NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625) 733 70.9 1.8e-11
XP_016882932 (OMIM: 616841) PREDICTED: zinc finger ( 541) 731 70.7 1.8e-11
XP_011526565 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 640) 733 70.9 1.8e-11
XP_016881641 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 502) 728 70.4 2e-11
XP_016881642 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 502) 728 70.4 2e-11
XP_005259469 (OMIM: 604749) PREDICTED: zinc finger ( 734) 731 70.9 2.2e-11
NP_004225 (OMIM: 604749) zinc finger protein 235 [ ( 738) 731 70.9 2.2e-11
XP_016881640 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 669) 728 70.6 2.4e-11
XP_016881639 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 688) 728 70.6 2.4e-11
NP_006621 (OMIM: 604750) zinc finger protein 234 [ ( 700) 728 70.6 2.5e-11
XP_006723037 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 700) 728 70.6 2.5e-11
NP_001138296 (OMIM: 604750) zinc finger protein 23 ( 700) 728 70.6 2.5e-11
XP_016881638 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 700) 728 70.6 2.5e-11
XP_016882718 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 720 70.0 3.6e-11
XP_016882719 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 720 70.0 3.6e-11
XP_016882717 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 720 70.0 3.6e-11
XP_011525571 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 720 70.0 3.7e-11
XP_011525569 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 720 70.0 3.7e-11
XP_016882710 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 720 70.0 3.7e-11
XP_016882715 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 720 70.0 3.7e-11
XP_016882708 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 720 70.0 3.7e-11
XP_016882713 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 720 70.0 3.7e-11
XP_011525573 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 720 70.0 3.7e-11
XP_016882716 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 720 70.0 3.7e-11
XP_016882707 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 720 70.0 3.7e-11
XP_016882711 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 720 70.0 3.7e-11
XP_016882706 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 720 70.0 3.7e-11
XP_016882714 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 720 70.0 3.7e-11
XP_016882712 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 720 70.0 3.7e-11
XP_011525575 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 720 70.0 3.7e-11
XP_016882709 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 720 70.0 3.7e-11
>>NP_001138837 (OMIM: 613907) zinc finger protein 652 [H (606 aa)
initn: 2054 init1: 1776 opt: 1916 Z-score: 815.0 bits: 161.2 E(85289): 1.2e-38
Smith-Waterman score: 1983; 51.4% identity (64.8% similar) in 673 aa overlap (98-735:1-579)
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 QQILNFIYTSKLLVNAANVHEVLSAASLLQMADIAASCQELLDARSLGPPGPGTVALAQP
:. :.:::::.. .. : .::
NP_001 MSHTASSCQELVENCAVHVAG-----MAQE
10 20
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 AASCTPAAPPYYCDIKQEADTPGLPKIYAREGPDPYSVRVEDGAGTAGGTVPATIGPAQP
. . .: .:: : :.: ::. .:::: :. : . ::
NP_001 DSRRGQVPSSFYHGANQELDLS--TKVYKRESGSPYSVLVD----TKMSKPHLHETEEQP
30 40 50 60 70
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 FFKEEKEGGVEEAGGPPASLCKLEGGEELEEELGGSGTYSRREQSQIIVEVNLNNQTLHV
.:.: . .: .. . . . . :: :::. .:.:. :::::::::::::.:
NP_001 YFRETR--AVSDVHAVKEDRENSDDTEEEEEEV----SYKRE---QIIVEVNLNNQTLNV
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250 260 270 280 290 300
pF1KA1 STGPEGKPGAGPSPATVVLGREDGLQRHSDEEEEDDEEEEEEEEEEEGGGSGREEEEEEE
: : .: .. : : :: . :.::::..::: .. .. :
NP_001 SKGEKGV--SSQSKETPVL------KTSSEEEEEESEEEATDDSNDYG------------
140 150 160 170
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 GGSQGEEEEEEEDGHSEQEEEEEEEEEEGPSEQDQESSEEEEGEEGEAGGKQGPRGSRSS
:.:.....: :. . .... . . : ..
NP_001 -------------------ENEKQKKKEKIVEKVSVTQRRTRRAASVA----------AA
180 190 200
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 RADPPPHSHMATRSRENARRRGTPEPEEAGRRGGKRPKPPPGVASASARGPPATDGLGAK
..: :.. ::.: : . :: . .:. :.:: : :
NP_001 TTSPTPRT---TRGR-----RKSVEPPKRKKRATKEPKAPV-----------------QK
210 220 230
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 VKLEEKQHHPCQKCPRVFNNRWYLEKHMNVTHSRMQICDQCGKRFLLESELLLHRQTDCE
.: :::. :.:::::::.:::::::::::: ::::::.:::.:.::::: ::.:::::
NP_001 AKCEEKETLTCEKCPRVFNTRWYLEKHMNVTHRRMQICDKCGKKFVLESELSLHQQTDCE
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490 500 510 520 530 540
pF1KA1 RNIQCVTCGKAFKKLWSLHEHNKIVHGYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMP
.:::::.:.:.:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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550 560 570 580 590 600
pF1KA1 FTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCNERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
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pF1KA1 WCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQ
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPFICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQ
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670 680 690 700
pF1KA1 RFRFSNMLKAHKEKCFRVSH-------------TLAGDGVPAA------PGLP-------
::::::::::::::::::. : . ::.. : :
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710 720 730 740
pF1KA1 --PTQPQAHALPLL-----PGLPQTLP-PP-PHLPPPPPLFPTTASPGGRMNANN
: .: : . : : :. :: :: ::::::: :: .
NP_001 TLPPRPIPHPFSHLHIHPHPHHPHHLPIPPVPHLPPPPALFKSEPLNHRGQSEDNFLRHL
540 550 560 570 580 590
NP_001 AEKNSSAQHH
600
>>NP_055712 (OMIM: 613907) zinc finger protein 652 [Homo (606 aa)
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Smith-Waterman score: 1983; 51.4% identity (64.8% similar) in 673 aa overlap (98-735:1-579)
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 QQILNFIYTSKLLVNAANVHEVLSAASLLQMADIAASCQELLDARSLGPPGPGTVALAQP
:. :.:::::.. .. : .::
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pF1KA1 AASCTPAAPPYYCDIKQEADTPGLPKIYAREGPDPYSVRVEDGAGTAGGTVPATIGPAQP
. . .: .:: : :.: ::. .:::: :. : . ::
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pF1KA1 FFKEEKEGGVEEAGGPPASLCKLEGGEELEEELGGSGTYSRREQSQIIVEVNLNNQTLHV
.:.: . .: .. . . . . :: :::. .:.:. :::::::::::::.:
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: : .: .. : : :: . :.::::..::: .. .. :
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pF1KA1 GGSQGEEEEEEEDGHSEQEEEEEEEEEEGPSEQDQESSEEEEGEEGEAGGKQGPRGSRSS
:.:.....: :. . .... . . : ..
NP_055 -------------------ENEKQKKKEKIVEKVSVTQRRTRRAASVA----------AA
180 190 200
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pF1KA1 RADPPPHSHMATRSRENARRRGTPEPEEAGRRGGKRPKPPPGVASASARGPPATDGLGAK
..: :.. ::.: : . :: . .:. :.:: : :
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pF1KA1 VKLEEKQHHPCQKCPRVFNNRWYLEKHMNVTHSRMQICDQCGKRFLLESELLLHRQTDCE
.: :::. :.:::::::.:::::::::::: ::::::.:::.:.::::: ::.:::::
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pF1KA1 RNIQCVTCGKAFKKLWSLHEHNKIVHGYAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMP
.:::::.:.:.:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA1 FTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCNERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
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pF1KA1 WCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQ
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 WCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPFICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQ
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pF1KA1 RFRFSNMLKAHKEKCFRVSH-------------TLAGDGVPAA------PGLP-------
::::::::::::::::::. : . ::.. : :
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pF1KA1 --PTQPQAHALPLL-----PGLPQTLP-PP-PHLPPPPPLFPTTASPGGRMNANN
: .: : . : : :. :: :: ::::::: :: .
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NP_055 AEKNSSAQHH
600
>>XP_005257223 (OMIM: 613907) PREDICTED: zinc finger pro (426 aa)
initn: 1489 init1: 1408 opt: 1455 Z-score: 626.8 bits: 125.8 E(85289): 3.6e-28
Smith-Waterman score: 1464; 58.7% identity (71.1% similar) in 395 aa overlap (376-735:18-399)
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pF1KA1 EEEEGEEGEAGGKQGPRGSRSSRADPPPHSHMATRSRENARRRGTPEPEEAGRRGGKRPK
:.: ..:..:: .: . .:...
XP_005 MSHTASSCQELVENCAVHVAGMAQEDSRRGQVP---SSFYHGANQEL
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410 420 430 440 450 460
pF1KA1 PPPGVASASARGPPATDGLGAKVKLEEKQHHPCQKCPRVFNNRWYLEKHMNVTHSRMQIC
. : : . . . .:. . . : .. : ..: . : : ..: .
XP_005 DLSTKVYKRESGSPYS--VLVDTKMSKPHLHETEEQPYFRETRAVSDVHA-VKEDR-ENS
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pF1KA1 DQCGKRFLLESELLLHRQTDCERNIQCVTCGKAFKKLWSLHEHNKIVHGYAEKKFSCEIC
:. .. : :. .:. . ..::.:.:.:::::::::: ::::::::::::::::
XP_005 DDTEEE---EEEVSYKRE---QIIVECVSCNKSFKKLWSLHEHIKIVHGYAEKKFSCEIC
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pF1KA1 EKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCNERF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
XP_005 EKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCDERF
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pF1KA1 QYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYICEICGKSFTSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
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pF1KA1 NMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVSH-------------TLAGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. : .
XP_005 NMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVTSPVNVPPAVQIPLTTSPAT
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pF1KA1 GVPAA------PGLP---------PTQPQAHALPLL-----PGLPQTLP-PP-PHLPPPP
::.. : : : .: : . : : :. :: :: :::::::
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pF1KA1 PLFPTTASPGGRMNANN
:: .
XP_005 ALFKSEPLNHRGQSEDNFLRHLAEKNSSAQHH
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>>NP_001318063 (OMIM: 606954) zinc finger protein 253 is (423 aa)
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Smith-Waterman score: 747; 42.0% identity (64.7% similar) in 255 aa overlap (427-679:116-367)
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pF1KA1 GRRGGKRPKPPPGVASASARGPPATDGLGAKVKLEEKQHHPCQKCPRVFNNRWYLEKHMN
:.. :: .. :..: ..::. : :
NP_001 YKTRHTGINLFKCIICGKAFKRSSTLTTHKKIHTGEKPYR-CEECGKAFNQSANLTTHKR
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pF1KA1 V-THSRMQICDQCGKRFLLESELLLHRQTDC-ERNIQCVTCGKAFKKLWSLHEHNKIVHG
. : . :..::: : :.: :.. :. .: :::::.. .: : ::::
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pF1KA1 YAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEK
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pF1KA1 PFRCENCNERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYIC
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NP_001 IHTGEKPYRCEECGKAFKQSSNLTTHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRSTDLTTH-KIVHT
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pF1KA1 YAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEK
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pF1KA1 V-THSRMQICDQCGKRFLLESELLLHRQTDC-ERNIQCVTCGKAFKKLWSLHEHNKIVHG
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NP_066 IHTGEKPYRCEECGKAFKQSSNLTTHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRSTDLTTH-KIVHT
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pF1KA1 YAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEK
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NP_066 -GEKPYKCEECGKAFKHPSHVTTHKKIHTRGKPYNCEECGKSFKHCSNLTIHKRIHTGEK
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pF1KA1 PFRCENCNERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYIC
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NP_066 PYKCEECGKAFHLSSHLTTHKILHTGEKPYRCRECGKAFNHSTTLFSHEKIHTGEKPYKC
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pF1KA1 EICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVSHTLAGDGV
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NP_066 DECGKTFTWPSILSKHKRTHTGEKPYKCEECGKSFTASSTLTTHKRIHTGEKPYKCEECG
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NP_066 KAFNWSSDLNKHKKIHIERKPYIVKNVTDLLNVPPLLISIR
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pF1KA1 V-THSRMQICDQCGKRFLLESELLLHRQTDC-ERNIQCVTCGKAFKKLWSLHEHNKIVHG
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XP_016 IHTGEKPFKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCGKAFSRFSYLTAH-KIIHS
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pF1KA1 YAEKKFSCEICEKKFYTMAHVRKHMVAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEK
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XP_016 -GEKPYKCEECGKAFKRSSNLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSILTAHKIIHSGEK
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XP_016 PYKCEECGKAFKHPSVLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFKYFSSLTTHKIIHSGEKPYKC
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pF1KA1 EICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVSHTLAGDGV
: :::.:. .. :.: ::::::: :. ::. :..:. : .::
XP_016 EECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGEAFKYSSSLTTHKIIHTGQQPFKCEECG
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pF1KA1 GHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKP
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XP_016 GEKPYKCEECGKAFNSSSHLTAHKRIHTGEKPYKCERCGKAFKRSFILTRHKRIHTGEKP
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pF1KA1 YPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVSHTLAGDGVPAAPGLPPTQPQAHALPLLPGLPQT
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>>XP_016881605 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger pro (504 aa)
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pF1KA1 GRRGGKRPKPPPGVASASARGPPATDGLGAKVKLEEKQHHPCQKCPRVFNNRWYLEKHMN
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XP_016 NQYLTTTQSKIFQCDKYVKVIHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKCIECGKAFNQSSTLTTHKK
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pF1KA1 V-THSRMQICDQCGKRFLLESELLLHRQTDC-ERNIQCVTCGKAFKKLWSLHEHNKIVHG
. : . :..::: : :.: :.. :. .: :::::... : : ::.:.
XP_016 IHTGEKPFKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCGKAFSRFSYLTAH-KIIHS
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XP_016 -GEKPYKCEECGKAFKRSSNLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSILTAHKIIHSGEK
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pF1KA1 PFRCENCNERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYIC
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XP_016 PYKCEECGKAFKHPSVLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFKYFSSLTTHKIIHSGEKPYKC
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pF1KA1 EICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVSHTLAGDGV
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XP_016 EECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGEAFKYSSSLTTHKIIHTGQQPFKCEECG
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pF1KA1 PAAPGLPPTQPQAHALPLLPGLPQTLPPPPHLPPPPPLFPTTASPGGRMNANN
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pF1KA1 VAHTKDMPFTCETCGKSFKRSMSLKVHSLQHSGEKPFRCENCNERFQYKYQLRSHMSIHI
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pF1KA1 GHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYICEICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKP
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XP_016 GEKPYKCEECGKAFNSSSHLTAHKRIHTGEKPYKCERCGKAFKRSFILTRHKRIHTGEKP
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pF1KA1 YPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVSHTLAGDGVPAAPGLPPTQPQAHALPLLPGLPQT
: :. ::. :. . : .::
XP_016 YKCEECGKGFKCPSTLTTHKVIHTGEKL
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XP_016 KPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKH-KIIHT-GEKP
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pF1KA1 FRCENCNERFQYKYQLRSHMSIHIGHKQFMCQWCGKDFNMKQYFDEHMKTHTGEKPYICE
..::.:.. :. . .: .: .:: :.: . :. ::: :: . . : ::::::: :.
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pF1KA1 ICGKSFTSRPNMKRHRRTHTGEKPYPCDVCGQRFRFSNMLKAHKEKCFRVSHTLAGDGVP
:::.:. .. ::. ::::::: :. ::. :. :. : .::
XP_016 ECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGK
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pF1KA1 AAPGLPPTQPQAHALPLLPGLPQTLPPPPHLPPPPPLFPTTASPGGRMNANN
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>>NP_001243102 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 iso (531 aa)
initn: 1610 init1: 573 opt: 733 Z-score: 327.9 bits: 70.9 E(85289): 1.6e-11
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pF1KA1 RPKPPPGVASASARGPPATDGLGAKVKLEEKQHHPCQKCPRVFNNRWYLEKHMNVTHS--
.. . :.:: ..::. .: : .: :.
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250 260 270 280 290 300
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pF1KA1 RMQICDQCGKRFLLESELLLHRQTDC-ERNIQCVTCGKAFKKLWSLHEHNKIVHGYAEKK
. :..::: : :.: :. :. .: ::::::. .: .: ::.: .::
NP_001 KPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKH-KIIHT-GEKP
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