Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1198
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1198, 529 aa
1>>>pF1KA1198 529 - 529 aa - 529 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5239+/-0.00179; mu= 20.7042+/- 0.108
mean_var=308.2374+/-56.414, 0's: 0 Z-trim(105.0): 952 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.073052
statistics sampled from 7146 (8188) to 7146 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16
Scan time: 2.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12272.1 ZNF490 gene_id:57474|Hs108|chr19 ( 529) 3793 414.8 1.2e-115
CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 ( 641) 2127 239.4 9.3e-63
CCDS42505.1 ZNF564 gene_id:163050|Hs108|chr19 ( 553) 2021 228.1 2e-59
CCDS45986.1 ZNF20 gene_id:7568|Hs108|chr19 ( 532) 1934 218.9 1.2e-56
CCDS42502.1 ZNF627 gene_id:199692|Hs108|chr19 ( 461) 1865 211.5 1.7e-54
CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 742) 1837 209.0 1.6e-53
CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 745) 1826 207.8 3.5e-53
CCDS12268.1 ZNF439 gene_id:90594|Hs108|chr19 ( 499) 1819 206.7 5e-53
CCDS45983.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 ( 673) 1819 207.0 5.6e-53
CCDS32918.1 ZNF443 gene_id:10224|Hs108|chr19 ( 671) 1815 206.6 7.5e-53
CCDS45989.1 ZNF799 gene_id:90576|Hs108|chr19 ( 643) 1793 204.2 3.7e-52
CCDS12270.1 ZNF563 gene_id:147837|Hs108|chr19 ( 476) 1785 203.1 5.9e-52
CCDS45988.1 ZNF44 gene_id:51710|Hs108|chr19 ( 615) 1784 203.2 7e-52
CCDS54223.1 ZNF44 gene_id:51710|Hs108|chr19 ( 663) 1784 203.3 7.2e-52
CCDS45981.1 ZNF823 gene_id:55552|Hs108|chr19 ( 610) 1773 202.1 1.6e-51
CCDS42503.1 ZNF440 gene_id:126070|Hs108|chr19 ( 595) 1764 201.1 3e-51
CCDS77240.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 ( 638) 1664 190.6 4.6e-48
CCDS82297.1 ZNF799 gene_id:90576|Hs108|chr19 ( 611) 1641 188.2 2.4e-47
CCDS12409.1 ZNF14 gene_id:7561|Hs108|chr19 ( 642) 1640 188.1 2.6e-47
CCDS12267.1 ZNF491 gene_id:126069|Hs108|chr19 ( 437) 1598 183.3 4.9e-46
CCDS45984.2 ZNF878 gene_id:729747|Hs108|chr19 ( 531) 1586 182.2 1.3e-45
CCDS12273.1 ZNF791 gene_id:163049|Hs108|chr19 ( 576) 1584 182.1 1.5e-45
CCDS32916.1 ZNF136 gene_id:7695|Hs108|chr19 ( 540) 1573 180.9 3.3e-45
CCDS32971.1 ZNF101 gene_id:94039|Hs108|chr19 ( 436) 1522 175.3 1.3e-43
CCDS12271.1 ZNF442 gene_id:79973|Hs108|chr19 ( 627) 1522 175.6 1.4e-43
CCDS31087.1 ZNF670 gene_id:93474|Hs108|chr1 ( 389) 1508 173.8 3.3e-43
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1502 173.5 6.2e-43
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1502 173.6 6.4e-43
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1502 173.6 6.4e-43
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1502 173.6 6.5e-43
CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19 ( 642) 1498 173.1 8.4e-43
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1483 171.5 2.4e-42
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1483 171.6 2.5e-42
CCDS32440.1 ZNF267 gene_id:10308|Hs108|chr16 ( 743) 1479 171.3 3.6e-42
CCDS59329.1 ZNF555 gene_id:148254|Hs108|chr19 ( 627) 1478 171.0 3.6e-42
CCDS12096.1 ZNF555 gene_id:148254|Hs108|chr19 ( 628) 1478 171.0 3.6e-42
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1475 170.5 4.1e-42
CCDS12099.1 ZNF77 gene_id:58492|Hs108|chr19 ( 545) 1460 169.0 1.3e-41
CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 540) 1459 168.9 1.4e-41
CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 1459 169.1 1.5e-41
CCDS12269.2 ZNF625 gene_id:90589|Hs108|chr19 ( 372) 1452 167.8 2e-41
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1455 168.7 2e-41
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1450 168.0 2.8e-41
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1448 167.7 3.1e-41
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1440 166.7 5.1e-41
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1442 167.7 6.2e-41
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1442 167.7 6.3e-41
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1438 166.8 6.7e-41
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1438 166.8 6.7e-41
CCDS54213.1 ZNF317 gene_id:57693|Hs108|chr19 ( 563) 1433 166.2 9.2e-41
>>CCDS12272.1 ZNF490 gene_id:57474|Hs108|chr19 (529 aa)
initn: 3793 init1: 3793 opt: 3793 Z-score: 2189.7 bits: 414.8 E(32554): 1.2e-115
Smith-Waterman score: 3793; 100.0% identity (100.0% similar) in 529 aa overlap (1-529:1-529)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MRRNSSLSFQMERPLEEQVQSKWSSSQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MRRNSSLSFQMERPLEEQVQSKWSSSQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 DVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRDVMRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRDVMRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 VEALCENKEDCPCGKSTSQIPDLNTNLETPTGLKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VEALCENKEDCPCGKSTSQIPDLNTNLETPTGLKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 QKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFTRSSSIRTHERIHTGEKPYECKECGKAFAFLFSFRNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFTRSSSIRTHERIHTGEKPYECKECGKAFAFLFSFRNH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 IRIHTGETPYECKECGKAFRYLTALRRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTHERTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IRIHTGETPYECKECGKAFRYLTALRRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTHERTH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSHEKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSHEKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 PYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTHFGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTHFGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYEC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 KECGKAFLYSTHFRIHERTHTREKPYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCECKQCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KECGKAFLYSTHFRIHERTHTREKPYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCECKQCG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KA1 KAFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQCRQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KAFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQCRQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP
490 500 510 520
>>CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 (641 aa)
initn: 1896 init1: 1896 opt: 2127 Z-score: 1240.1 bits: 239.4 E(32554): 9.3e-63
Smith-Waterman score: 2198; 60.0% identity (78.5% similar) in 503 aa overlap (55-529:2-503)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 SSQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLEDVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRD
::. .:::::::: :::::: :.:...:::
CCDS42 MDSVVFEDVAVNFTQEEWALLGPSQKKLYRD
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 VMRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPMVEALCENKEDCPCGKSTSQIPDLN
::. :: ::: :::.:....::: ::::::.::: ::: ::: :: :.. :: :. .
CCDS42 VMQETFVNLASIGENWEEKNIED-HKNQGRKLRSHMVERLCERKEGSQFGETISQTPNPK
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190
pF1KA1 TNLETPTGLKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEK------------
: .: : .:: .:::::. .: . :::::::::::.. : :.::::
CCDS42 PNKKTFTRVKPYECSVCGKDYMCHSSLNRHMRSHTEHRSYEYHKYGEKSYECKECGKRFS
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230
pF1KA1 ----------------PHKCKECGKTFTRSSSIRTHERIHTGEKPYECKECGKAFAFLFS
:.:::.:::.:. ::.. ::: :::::::::::::::: . .
CCDS42 FRSSFRIHERTHTGEKPYKCKQCGKAFSWPSSFQIHERTHTGEKPYECKECGKAFIYHTT
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 FRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTALRRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTH
::.:.:.:::: ::.::::::.: . ...: ::..:.:::::.:::::::: ::: : :
CCDS42 FRGHMRMHTGEKPYKCKECGKTFSHPSSFRNHERTHSGEKPYECKQCGKAFRYYQTFQIH
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 ERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSHEKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTH
::::::::::.:::::::.:::: .::::. ::::::. :..::.:: ::.::: . :
CCDS42 ERTHTGEKPYQCKQCGKALSCPTSFRSHERIHTGEKPYKCKKCGKAFSFPSSFRKHERIH
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 TGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTHFGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEK
:: .:: ::.::.:: : : . : : :. ::.::.:::::. : .:.:::.:::::
CCDS42 TGEKPYDCKECGKAFISLPSYRRHMIMHTGNGPYKCKECGKAFDCPSSFQIHERTHTGEK
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 TYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTREKPYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCEC
::::.::::: :. ::.:::::: :::.::::::..: : .: :::.::: :: ::
CCDS42 PYECKQCGKAFSCSSSFRMHERTHTGEKPHECKQCGKAFSCSSSVRIHERTHTGEKPYEC
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KA1 KQCGKAFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQCRQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP
:::::::.: .:...:.::::::.:..:.:::::::.:.:...:::::. .::
CCDS42 KQCGKAFSCSSSFRMHERIHTGEKPYECKQCGKAFSFSSSFRMHERTHTGEKPYECKQCG
460 470 480 490 500 510
CCDS42 KAFSCSSSFRMHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSIRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFS
520 530 540 550 560 570
>--
initn: 1276 init1: 701 opt: 701 Z-score: 427.9 bits: 89.1 E(32554): 1.6e-17
Smith-Waterman score: 701; 66.9% identity (86.0% similar) in 136 aa overlap (390-525:504-639)
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 QPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTHFGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYE
::::::::::. :: ...:::.::::: ::
CCDS42 KPYECKQCGKAFSFSSSFRMHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSFRMHERTHTGEKPYE
480 490 500 510 520 530
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 CKECGKAFLYSTHFRIHERTHTREKPYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCECKQC
::.::::: :. .:::::::: ::::::::::..: : .: :::.:::::: :::::
CCDS42 CKQCGKAFSCSSSIRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSVRMHERTHTGVKPYECKQC
540 550 560 570 580 590
480 490 500 510 520
pF1KA1 GKAFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQCRQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP
:::.: :...:.: ::::.:. :.::::::. :.:...:::.::
CCDS42 DKAFSCSRSFRIHERTHTGEKPYACQQCGKAFKCSRSFRIHERVHSGE
600 610 620 630 640
>>CCDS42505.1 ZNF564 gene_id:163050|Hs108|chr19 (553 aa)
initn: 2021 init1: 2021 opt: 2021 Z-score: 1180.2 bits: 228.1 E(32554): 2e-59
Smith-Waterman score: 2059; 55.7% identity (77.1% similar) in 503 aa overlap (55-529:2-504)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 SSQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLEDVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRD
::.. :::::::::::::::::.:...:::
CCDS42 MDSVASEDVAVNFTLEEWALLDPSQKKLYRD
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 VMRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPMVEALCENKEDCPCGKSTSQIPDLN
::: ::.::::.:.::.::.::: .::::: ::. : :.: :.:: ::.. ::: .::
CCDS42 VMRETFRNLACVGKKWEDQSIEDWYKNQGRILRNHMEEGLSESKEYDQCGEAFSQILNLN
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 TNLETPTGLKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFT
: . :: ..::.::.::.::::. ::.::.::: .:: . .::::::.:::.:::.:.
CCDS42 LNKKIPTIVRPCECSLCGKVFMHHSSLSRHIRSHLGHKPYDYQEYGEKPYKCKQCGKAFS
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 RSSSIRTHERIHTGEKPYECKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTA
.:.: ::: ::::::: : :::::: : : : :. :::. ::.:.:::::: .
CCDS42 SCQSFRRHERTHTGEKPYACPECGKAFISLPSVRRHMIKHTGDGPYKCQECGKAFDRPSL
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 LRRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSH
.. ::..:::::::.:..:.:::: : : :::. ::.:..:::::. :. .: :
CCDS42 FQIHERTHTGEKPYECQECAKAFISLPSFQRHMIRHTGDGPYKCQECGKAFDRPSLFRIH
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 EKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTH
:.::::::: :..::.::.: .....:. ::: :: :: ::.:: : . :::::
CCDS42 ERTHTGEKPHECKQCGKAFISFTNFQSHMIRHTGDGPYKCKVCGRAFIFPSYVRKHERTH
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420
pF1KA1 FGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFL----------------
:::::::..:::.:.::: .. :::.::::: ::::::::::.
CCDS42 TGEKPYECNKCGKTFSSSSNVRTHERTHTGEKPYECKECGKAFISLPSVRRHMIKHTGDG
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470
pF1KA1 -YS-----------THFRIHERTHTREKPYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCEC
:. . :.::::::: ::::::. ::..:: ....:.: ::: : .:
CCDS42 PYKCQVCGRAFDCPSSFQIHERTHTGEKPYECQVCGKAFISLKRIRKHMILHTGDGPYKC
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KA1 KQCGKAFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQCRQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP
. ::::: : .:...:.: ::::.:..:..:::::.:..:...:::::. .::
CCDS42 QVCGKAFDCPSSVRTHERTHTGEKPYECKECGKAFNYASSIRIHERTHTGEKPYECKQCG
460 470 480 490 500 510
CCDS42 KTFSYSSSFQRHERAHNGDKPYVKNVGKLSFITQPSNTCENE
520 530 540 550
>>CCDS45986.1 ZNF20 gene_id:7568|Hs108|chr19 (532 aa)
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30 40 50 60 70 80
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::...:::::.:: ::::::::.:.:.:::
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90 100 110 120 130 140
pF1KA1 VMRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPMVEALCENKEDCPCGKSTSQIPDLN
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CCDS45 VMQETFKNLTSVGKTWKVQNIEDEYKNPRRNL-SLMREKLCESKESHHCGESFNQIADDM
40 50 60 70 80 90
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CCDS45 LNRKTLPGITPCESSVCGEVGTGHSSLNTHIRADTGHKSSEYQEYGENPYRNKECKKAFS
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 RSSSIRTHERIHTGEKPYECKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTA
.:...:.. : ::::. ::: ..: .. : .:.:. ::.:: ::::: .:.
CCDS45 YLDSFQSHDKACTKEKPYDGKECTETFISHSCIQRHRVMHSGDGPYKCKFCGKAFYFLNL
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CCDS45 CLIHERIHTGVKPYKCKQCGKAFTRSTTLPVHERTHTGVNADECKECGNAFSFPSEIRRH
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pF1KA1 EKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTH
...::::::. :..::..:.: ::.. : :::: .:: ::.::.::. .: . : :::
CCDS45 KRSHTGEKPYECKQCGKVFISFSSIQYHKMTHTGEKPYECKQCGKAFRCGSHLQKHGRTH
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pF1KA1 PYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCECKQCGKAFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQC
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CCDS45 PHECKECGKVFKYFSSLRIHERTHTGEKPHECKQCGKAFRYFSSLHIHERTHTGDKPYEC
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510 520
pF1KA1 RQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP
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CCDS45 KVCGKAFTCSSSIRYHERTHTGEKPYECKHCGKAFISNYIRYHERTHTGEKPYQCKQCGK
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30 40 50 60 70 80
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CCDS42 MDSVAFEDVAVNFTLEEWALLDPSQKNLYRD
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90 100 110 120 130 140
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CCDS42 VMRETFRNLASVGKQWEDQNIEDPFKIPRRNI-SHIPERLCESKEGGQGEETFSQIPDGI
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pF1KA1 TNLETPTGLKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFT
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CCDS42 LNKKTP-GVKPCESSVCGEVGMGPSSLNRHIRDHTGREPNEYQEYGKKSYTRNQCGRALS
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CCDS42 FRIHERSHTGEKPYECKQCGKAFSCSSYIRIHERTHTGDKPYECKQCGKAFSCSKYIRIH
210 220 230 240 250 260
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pF1KA1 EKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTH
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CCDS42 ERTHTGEKPYECKQCGKAFRCASSVRSHERTHTGEKLFECKECGKALTCLASVRRHMIKH
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pF1KA1 FGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTREK
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CCDS42 TGNGPYKCKVCGKAFDFPSSFRIHERTHTGEKPYDCKQCGKAFSCSSSFRKHERIHTGEK
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CCDS42 PYKCTKCGKAFSRSSYFRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSRSTYFRVHEKIHTGEKPYEN
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pF1KA1 RQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP
CCDS42 PNPNASVVPVLS
450 460
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20 30 40 50 60 70
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CCDS32 MPCCSHRSCREDPGTSESREMDPVAFEDVAVNFTQEEWTL
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CCDS32 GTYKCKFCGKAFHSFSLYLIHERTHTGEKPYECKQCGKSFTYSATLQIHERTHTGEKPYE
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pF1KA1 GEAFKSSSSCEVHERTHFGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAF
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CCDS32 GEGLSYLISFQTHIRMNSGERPYKCKICGKGFYSAKSFQTHEKTHTGEKRYKCKQCGKAF
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CCDS32 NLSSSFRYHERIHTGEKPYECKQCGKAFRSASQLRVHGGTHTGEKPYECKECGKAFRSTS
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pF1KA1 SLKVHKRIHTGERPFQCRQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP
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CCDS32 HLRVHGRTHTGEKPYECKECGKAFRYVKHLQIHERTEKHIRMPSGERPYKCSICEKGFYS
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CCDS32 KTHTGEKPYECNQCGKAFRCCNSLRYHERTHTGEKPYECKQCGKAFRSASHLRMHERTHT
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pF1KA1 GEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSHEKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQP
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CCDS32 YECKECEKAFCKFSSFQIHERKHRGEKPYECKHCGNGFTSAKILQIHARTHIGEKHYECK
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:::::: : . ..:: ::: :::::::.::..:
CCDS32 ECGKAFNYFSSLHIHARTHMGEKPYECKDCGKAFS
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CCDS74 MPCCSHRSCREDPGTSESREMMFQDPVAFEDVAVNFTQEEWTLLDISQKNLFRE
10 20 30 40 50
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CCDS74 VMLETFRNLTSIGKKWSDQNIEYEYQNPRRSFRSLIEEKVNEIKEDSHCGETFTQVPDDR
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CCDS74 LNFQEKKASPEVKSCDSFVCAEVGIGNSSFNMSIRGDTGHKAYEYQEYGPKPYKCQQPKN
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CCDS74 KKAFRYRPSIRTQERDHTGEKPYACKVCGKTFIFHSSIRRHMVMHSGDGTYKCKFCGKAF
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. .. ::..:::::::.::::::.: : . :::::::::::::..: ::: .
CCDS74 HSFSLYLIHERTHTGEKPYECKQCGKSFTYSATLQIHERTHTGEKPYECSKCDKAFHSSS
240 250 260 270 280 290
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pF1KA1 YLRSHEKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEV
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CCDS74 SYHRHERSHMGEKPYQCKECGKAFAYTSSLRRHERTHSGKKPYECKQYGEGLSYLISFQT
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pF1KA1 HERTHFGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFLYSTHFRIHERT
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CCDS74 HIRMNSGERPYKCKICGKGFYSAKSFQTHEKTHTGEKRYKCKQCGKAFNLSSSFRYHERI
360 370 380 390 400 410
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:: ::::::::::..: :.:: : .::: :: :::.::::: . :.:: : ::::
CCDS74 HTGEKPYECKQCGKAFRSASQLRVHGGTHTGEKPYECKECGKAFRSTSHLRVHGRTHTGE
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pF1KA1 RPFQCRQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP
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CCDS74 KPYECKECGKAFRYVKHLQIHERTEKHIRMPSGERPYKCSICEKGFYSAKSFQTHEKTHT
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CCDS74 HTGEKPYECKECGKAFRYVKHLQIHERTEKHIRMPSGERPYKCSICEKGFYSAKSFQTHE
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pF1KA1 RIHTGETPYECKECGKAFRYLTALRRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTHERTHT
. :::: ::::..:::::: ..:: ::..:::::::.:::::::: . . ::::::
CCDS74 KTHTGEKPYECNQCGKAFRCCNSLRYHERTHTGEKPYECKQCGKAFRSASHLRMHERTHT
540 550 560 570 580 590
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pF1KA1 GEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSHEKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQP
:::::::::::::::: . ::.: .:::::::. :..::.:: : :.:. : .:::: .:
CCDS74 GEKPYECKQCGKAFSCASNLRKHGRTHTGEKPYECKQCGKAFRSASNLQMHERTHTGEKP
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pF1KA1 YTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTHFGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYECK
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CCDS74 YECKECEKAFCKFSSFQIHERKHRGEKPYECKHCGNGFTSAKILQIHARTHIGEKHYECK
660 670 680 690 700 710
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pF1KA1 ECGKAFLYSTHFRIHERTHTREKPYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCECKQCGK
:::::: : . ..:: ::: :::::::.::..:
CCDS74 ECGKAFNYFSSLHIHARTHMGEKPYECKDCGKAFS
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pF1KA1 AFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQCRQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP
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CCDS12 MLSLSPILLYTCEMFQDPVAFKDVAVNFTQEEWALLDISQKNLYRE
10 20 30 40
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pF1KA1 VMRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPMVEALCENKEDCPCGKSTSQIPDLN
:: :: ::. ::.:::::.:: :..: ::.:: : . : ::: ::.. . .::
CCDS12 VMLETFWNLTSIGKKWKDQNIEYEYQNPRRNFRSVTEEKVNEIKEDSHCGETFTPVPDDR
50 60 70 80 90 100
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pF1KA1 TNLETPTG---LKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEKPHKCKECGK
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CCDS12 LNFQKKKASPEVKSCDSFVC-EVGLGNSSSNMNIRGDTGHKACECQEYGPKPWKSQQPKK
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 TFTRSSSIRTHERIHTGEKPYECKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRY
.: :.::.:: :::.::: :::::: . . :.. :. .:.:. ::.:: :::::.
CCDS12 AFRYHPSLRTQERDHTGKKPYACKECGKNIIYHSSIQRHMVVHSGDGPYKCKFCGKAFHC
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pF1KA1 LTALRRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYL
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CCDS12 LSLYLIHERTHTGEKPYECKQCGKSFSYSATHRIHERTHIGEKPYECQECGKAFHSPRSC
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pF1KA1 RSHEKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHE
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CCDS12 HRHERSHMGEKAYQCKECGKAFMCPRYVRRHERTHSRKKLYECKQCGKALSSLTSFQTHI
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pF1KA1 RTHFGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHT
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CCDS12 RMHSGERPYECKTCGKGFYSAKSFQRHEKTHSGEKPYKCKQCGKAFTRSGSFRYHERTHT
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pF1KA1 REKPYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCECKQCGKAFTCLNSLKVHKRIHTGERP
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CCDS12 GEKPYECKQCGKAFRSAPNLQLHGRTHTGEKPYQCKECGKAFRSASQLRIHRRIHTGEKP
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..:..::::: : .... ::::....
CCDS12 YECKKCGKAFRYVQNFRFHERTQTHKNALWRKTL
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..::: :: . ...::: : ..::
CCDS45 KECGKPFSNFSFFQIHERMHREEKPYECKGYGKTFSLPSLFHRHERTHTGGKTYECKQCG
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CCDS32 ERTHTGEKPYKCKQCSKAFPDSSSCLIHERTHTGEKPYTCKQCGKAFSVSGSLQRHETTH
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start: Wed Nov 2 20:45:20 2016 done: Wed Nov 2 20:45:20 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]