Result of FASTA (omim) for
pF1KA1198
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1198, 529 aa
1>>>pF1KA1198 529 - 529 aa - 529 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3001+/-0.000732; mu= 22.8499+/- 0.046
mean_var=358.1330+/-70.334, 0's: 0 Z-trim(111.7): 2026 B-trim: 121 in 1/56
Lambda= 0.067772
statistics sampled from 18103 (20402) to 18103 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.568), E-opt: 0.2 (0.239), width: 16
Scan time: 7.070
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001190179 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 ( 529) 1934 204.6 6.1e-52
NP_066966 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 is ( 532) 1934 204.6 6.1e-52
NP_660338 (OMIM: 612248) zinc finger protein 627 i ( 461) 1865 197.7 6.2e-50
XP_006722936 (OMIM: 194543) PREDICTED: zinc finger ( 569) 1833 194.8 5.9e-49
XP_016881628 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 685) 1817 193.4 1.9e-48
XP_011525925 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 718) 1817 193.4 1.9e-48
NP_005806 (OMIM: 606697) zinc finger protein 443 [ ( 671) 1815 193.2 2.1e-48
XP_016881629 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 673) 1815 193.2 2.1e-48
NP_057348 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 is ( 615) 1784 190.1 1.7e-47
XP_011526366 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1784 190.1 1.7e-47
XP_011526364 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 653) 1784 190.1 1.7e-47
NP_001157748 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 ( 663) 1784 190.1 1.7e-47
XP_011526082 (OMIM: 612248) PREDICTED: zinc finger ( 429) 1685 180.1 1.2e-44
NP_001277012 (OMIM: 612248) zinc finger protein 62 ( 429) 1685 180.1 1.2e-44
XP_011525924 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 639) 1663 178.3 6.2e-44
NP_066358 (OMIM: 194556) zinc finger protein 14 [H ( 642) 1640 176.0 2.9e-43
XP_016882359 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 583) 1621 174.1 1e-42
XP_016882732 (OMIM: 604078) PREDICTED: zinc finger ( 474) 1573 169.2 2.5e-41
XP_011526571 (OMIM: 604078) PREDICTED: zinc finger ( 508) 1573 169.3 2.5e-41
NP_003428 (OMIM: 604078) zinc finger protein 136 [ ( 540) 1573 169.3 2.6e-41
XP_011526368 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger ( 571) 1565 168.6 4.6e-41
NP_149981 (OMIM: 603983) zinc finger protein 101 i ( 436) 1522 164.1 7.6e-40
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1502 162.5 3.3e-39
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1502 162.5 3.4e-39
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1502 162.5 3.4e-39
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1502 162.6 3.4e-39
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1502 162.6 3.4e-39
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1502 162.6 3.5e-39
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1502 162.6 3.5e-39
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1502 162.6 3.5e-39
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1502 162.6 3.5e-39
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1502 162.6 3.5e-39
NP_940937 (OMIM: 609571) zinc finger protein 699 [ ( 642) 1498 162.2 4.5e-39
XP_016878355 (OMIM: 604752) PREDICTED: zinc finger ( 487) 1479 160.0 1.5e-38
XP_016878354 (OMIM: 604752) PREDICTED: zinc finger ( 711) 1479 160.4 1.7e-38
NP_001252517 (OMIM: 604752) zinc finger protein 26 ( 711) 1463 158.8 5e-38
NP_003405 (OMIM: 604752) zinc finger protein 267 i ( 743) 1463 158.9 5e-38
NP_067040 (OMIM: 194551) zinc finger protein 77 [H ( 545) 1460 158.3 5.5e-38
XP_016882571 (OMIM: 194551) PREDICTED: zinc finger ( 365) 1451 157.0 8.8e-38
XP_016882570 (OMIM: 194551) PREDICTED: zinc finger ( 365) 1451 157.0 8.8e-38
NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 1450 157.4 1.1e-37
NP_001177720 (OMIM: 613864) zinc finger protein 31 ( 563) 1433 155.7 3.5e-37
NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 1433 156.3 4.4e-37
XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1433 156.3 4.4e-37
NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 1433 156.3 4.4e-37
XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1433 156.3 4.4e-37
XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1433 156.3 4.4e-37
NP_001277013 (OMIM: 612248) zinc finger protein 62 ( 351) 1427 154.7 4.4e-37
NP_001277014 (OMIM: 612248) zinc finger protein 62 ( 351) 1427 154.7 4.4e-37
NP_003437 (OMIM: 300024) zinc finger protein 157 [ ( 506) 1427 155.0 5e-37
>>NP_001190179 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 iso (529 aa)
initn: 1649 init1: 1649 opt: 1934 Z-score: 1053.5 bits: 204.6 E(85289): 6.1e-52
Smith-Waterman score: 1934; 55.6% identity (77.9% similar) in 475 aa overlap (55-529:2-475)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 SSQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLEDVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRD
::...:::::.:: ::::::::.:.:.:::
NP_001 MDSVAFEDVAVSFTQEEWALLDPSQKNLYRD
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 VMRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPMVEALCENKEDCPCGKSTSQIPDLN
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NP_001 VMQETFKNLTSVGKTWKVQNIEDEYKNPRRNL-SLMREKLCESKESHHCGESFNQIADDM
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150 160 170 180 190 200
pF1KA1 TNLETPTGLKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFT
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NP_001 LNRKTLPGITPCESSVCGEVGTGHSSLNTHIRADTGHKSSEYQEYGENPYRNKECKKAFS
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 RSSSIRTHERIHTGEKPYECKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTA
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NP_001 YLDSFQSHDKACTKEKPYDGKECTETFISHSCIQRHRVMHSGDGPYKCKFCGKAFYFLNL
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pF1KA1 LRRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSH
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NP_001 CLIHERIHTGVKPYKCKQCGKAFTRSTTLPVHERTHTGVNADECKECGNAFSFPSEIRRH
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330 340 350 360 370 380
pF1KA1 EKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTH
...::::::. :..::..:.: ::.. : :::: .:: ::.::.::. .: . : :::
NP_001 KRSHTGEKPYECKQCGKVFISFSSIQYHKMTHTGEKPYECKQCGKAFRCGSHLQKHGRTH
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pF1KA1 FGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTREK
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NP_001 TGEKPYECRQCGKAFRCTSDLQRHEKTHTEDKPYGCKQCGKGFRCASQLQIHERTHSGEK
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pF1KA1 PYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCECKQCGKAFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQC
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NP_001 PHECKECGKVFKYFSSLRIHERTHTGEKPHECKQCGKAFRYFSSLHIHERTHTGDKPYEC
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510 520
pF1KA1 RQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP
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NP_001 KVCGKAFTCSSSIRYHERTHTGEKPYECKHCGKAFISNYIRYHERTHTGEKPYQCKQCGK
460 470 480 490 500 510
>>NP_066966 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 isofor (532 aa)
initn: 1649 init1: 1649 opt: 1934 Z-score: 1053.5 bits: 204.6 E(85289): 6.1e-52
Smith-Waterman score: 1934; 55.6% identity (77.9% similar) in 475 aa overlap (55-529:5-478)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 SSQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLEDVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRD
::...:::::.:: ::::::::.:.:.:::
NP_066 MMFQDSVAFEDVAVSFTQEEWALLDPSQKNLYRD
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90 100 110 120 130 140
pF1KA1 VMRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPMVEALCENKEDCPCGKSTSQIPDLN
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NP_066 VMQETFKNLTSVGKTWKVQNIEDEYKNPRRNL-SLMREKLCESKESHHCGESFNQIADDM
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pF1KA1 TNLETPTGLKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFT
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NP_066 LNRKTLPGITPCESSVCGEVGTGHSSLNTHIRADTGHKSSEYQEYGENPYRNKECKKAFS
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pF1KA1 RSSSIRTHERIHTGEKPYECKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTA
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NP_066 YLDSFQSHDKACTKEKPYDGKECTETFISHSCIQRHRVMHSGDGPYKCKFCGKAFYFLNL
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pF1KA1 LRRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSH
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NP_066 CLIHERIHTGVKPYKCKQCGKAFTRSTTLPVHERTHTGVNADECKECGNAFSFPSEIRRH
220 230 240 250 260 270
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pF1KA1 EKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTH
...::::::. :..::..:.: ::.. : :::: .:: ::.::.::. .: . : :::
NP_066 KRSHTGEKPYECKQCGKVFISFSSIQYHKMTHTGEKPYECKQCGKAFRCGSHLQKHGRTH
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pF1KA1 FGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTREK
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NP_066 TGEKPYECRQCGKAFRCTSDLQRHEKTHTEDKPYGCKQCGKGFRCASQLQIHERTHSGEK
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pF1KA1 PYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCECKQCGKAFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQC
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NP_066 PHECKECGKVFKYFSSLRIHERTHTGEKPHECKQCGKAFRYFSSLHIHERTHTGDKPYEC
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510 520
pF1KA1 RQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP
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NP_066 KVCGKAFTCSSSIRYHERTHTGEKPYECKHCGKAFISNYIRYHERTHTGEKPYQCKQCGK
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>>NP_660338 (OMIM: 612248) zinc finger protein 627 isofo (461 aa)
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Smith-Waterman score: 1865; 57.0% identity (77.7% similar) in 449 aa overlap (55-503:2-448)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 SSQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLEDVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRD
::...:::::::::::::::::.:.:.:::
NP_660 MDSVAFEDVAVNFTLEEWALLDPSQKNLYRD
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pF1KA1 VMRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPMVEALCENKEDCPCGKSTSQIPDLN
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NP_660 VMRETFRNLASVGKQWEDQNIEDPFKIPRRNI-SHIPERLCESKEGGQGEETFSQIPDGI
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pF1KA1 TNLETPTGLKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFT
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NP_660 LNKKTP-GVKPCESSVCGEVGMGPSSLNRHIRDHTGREPNEYQEYGKKSYTRNQCGRALS
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pF1KA1 RSSSIRTHERIHTGEKPYECKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTA
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pF1KA1 LRRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSH
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NP_660 FRIHERSHTGEKPYECKQCGKAFSCSSYIRIHERTHTGDKPYECKQCGKAFSCSKYIRIH
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pF1KA1 EKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTH
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NP_660 ERTHTGEKPYECKQCGKAFRCASSVRSHERTHTGEKLFECKECGKALTCLASVRRHMIKH
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pF1KA1 FGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTREK
:. ::.:: :::::. : ...:::.::::: :.::.::::: :. :: ::: :: ::
NP_660 TGNGPYKCKVCGKAFDFPSSFRIHERTHTGEKPYDCKQCGKAFSCSSSFRKHERIHTGEK
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pF1KA1 PYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCECKQCGKAFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQC
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NP_660 PYKCTKCGKAFSRSSYFRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSRSTYFRVHEKIHTGEKPYEN
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pF1KA1 RQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP
NP_660 PNPNASVVPVLS
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>>XP_006722936 (OMIM: 194543) PREDICTED: zinc finger pro (569 aa)
initn: 2400 init1: 1387 opt: 1833 Z-score: 999.9 bits: 194.8 E(85289): 5.9e-49
Smith-Waterman score: 1845; 50.4% identity (72.6% similar) in 508 aa overlap (55-525:25-532)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 SSQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLEDVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRD
: ....::::::: ::::::: .::..:..
XP_006 MPCCSHRRCREDPGTSESQEMMFQDPVAFDDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYKE
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pF1KA1 VMRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPMVEALCENKEDCPCGKSTSQIPDLN
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XP_006 VMLETFRNLTSVGKSWKDQNIEYEYQNPRRNFRSLIEKKVNEIKDDSHCGETFTQVPDDR
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pF1KA1 TNLETPTG---LKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYG-----------
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XP_006 LNFQEKKASPEIKSCDSFVCGEVGLGNSSFNMNIRGDIGHKAYEYQEYGPKPCKCQQPKK
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230
pF1KA1 -----------------EKPHKCKECGKTFTRSSSIRTHERIHTGEKPYECKECGKAFAF
:::. :::::::: :::. : .:.:. ::.:: :::::
XP_006 AFRYHPSFRTPQRDHTGEKPYACKECGKTFISHSSIQRHVVMHSGDGPYKCKFCGKAFHC
180 190 200 210 220 230
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pF1KA1 LFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTALRRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPF
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pF1KA1 LTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSHEKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHV
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360 370 380 390 400 410
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XP_006 GEKPYECKQCGKAFRSSSHLQLHGRTHTGEKPYECQECGKAFRSMKNLQSHERTQTHVRI
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pF1KA1 HTGVKPCECKQCGKAFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQCRQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQ
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XP_006 HSGERPYKCKLCGKGFYCPKSLQRHEKTHTGEKLYECKQCGEAFSSSSSFRYHERTHTGE
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pF1KA1 KP
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pF1KA1 FSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTHFGEKPYECKQCGKAFNSSS
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XP_016 ASLSSLHRHKKTH
680
>>XP_011525925 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger pro (718 aa)
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pF1KA1 QCGKAFSC-PTYLRSHEKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCG
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pF1KA1 LKVHKRIHTGERPFQCRQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP
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pF1KA1 FNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTREKPYECKQCGRVFIYF
>>XP_016881629 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger pro (673 aa)
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pF1KA1 SQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLEDVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRDV
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. .: :. ::. :. :: : . ::: ..: . .::.: :: :::: :. ::.:.
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160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 RRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSC-PTYLRSH
. ::..:::::::.::::.::: .:. .: ::::::::::::::::.::: .::: :
XP_016 HMHERTHTGEKPYECKQCSKAFSFYSSYLRHERTHTGEKPYECKQCSKAFPFYSSYLR-H
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 EKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTH
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XP_016 ERTHTGEKPYKCKQCSKAFPDSSSCLIHERTHTGEKPYTCKQCGKAFSVSGSLQRHETTH
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 FGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTREK
.:::: :.::::::. . .: : :::. ..:: :::.: . .. :::::: ::
XP_016 SAEKPYACQQCGKAFHHLGSFQRHMIRHTGNGPHKCKICGKGFDCPSSLQSHERTHTGEK
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pF1KA1 PYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCECKQCGKAFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQC
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XP_016 PYECKQCGKALSHRSSFRSHMIMHTGDGPHKCKVCGKAFVYPSVFQRHERTHTAEKPYKC
400 410 420 430 440 450
510 520
pF1KA1 RQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP
.:::::. :.::. :: ::. .::
XP_016 KQCGKAYRISSSLRRHETTHTGEKPYKCKLGKACIDFCSFQNHKTTHTGEKPYECKECGK
460 470 480 490 500 510
>--
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170 180 190 200 210 220
pF1KA1 VFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFTRSSSIRTHERIHTGEKPYE
.::: ::. :...:. ::::::::
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pF1KA1 CKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTALRRHEKNHTGEKPYKCKQC
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pF1KA1 GKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSHEKTHTGEKPFVCRECGRAF
:::: . :: ::: : :: ::: ::::::. .:..::::::::.:. :.:::.::
XP_016 GKAFSWLTCFLRHERIHMREKSYECPQCGKAFTHSRFLQGHEKTHTGENPYECKECGKAF
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pF1KA1 FNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTREKPYECKQCGRVFIYF
>>NP_057348 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 isofor (615 aa)
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pF1KA1 SSQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLEDVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRD
::...:::::::: :::::: :.:.:.:::
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::: :..:: ::: ::..:.:.:.:.: :: : .:: . ..:. ::.. ::: .
NP_057 VMRETIRNLNCIGMKWENQNIDDQHQNLRRNPRCDVVERFGKSKDGSQCGETLSQIRNSI
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.: .::. . : :: :::.: . ::: ..: : .: :::::.:: . :.::: ..
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:..: :: :::.:::.::::::.: ::..
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pF1KA1 FRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTALRRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTH
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NP_057 LRMHERTHTGEKPYECKQCSKAFPVYSSYLRHEKIHTGEKPYECKQCSKAFPDYSSYLRH
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pF1KA1 ERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSHEKTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTH
::::::::::.::::::::: :: ::. ::::::..:..::.:: .:...:. :
NP_057 ERTHTGEKPYKCKQCGKAFSVSGSLRVHERIHTGEKPYTCKQCGKAFCHLGSFQRHMIMH
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pF1KA1 TGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTHFGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEK
.: :. :: ::..: .: ..:: :: ::::::::::: .. : .. : .:::.
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pF1KA1 TYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTREKPYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSHTGVKPCEC
..: ::::: . :. :::::: ::::::::::..: : ::.:: .::: .: .:
NP_057 PHKCTVCGKAFDSPSVFQRHERTHTGEKPYECKQCGKAFRTSSSLRKHETTHTGEQPYKC
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pF1KA1 KQCGKAFTCLNSLKVHKRIHTGERPFQCRQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP
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NP_057 K-CGKAFSDLFSFQSHETTHSEEEPYECKECGKAFSSFKYFCRHERTHSEEKSYECQICG
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>--
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220 230 240 250 260 270
pF1KA1 KPYECKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLTALRRHEKNHTGEKPYK
:::. ::::: .. :. ::..::.::::.
NP_057 EPYECKECGKAFSSFKYFCRHERTHSEEKSYECQICGKAFSRFSYLKTHERTHTAEKPYE
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pF1KA1 CKQCGKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSHEKTHTGEKPFVCREC
:::: :::.. . .: ::::::::.:::::.:::::: .. : ::.:::::::. :.::
NP_057 CKQCRKAFFWPSFLLRHERTHTGERPYECKHCGKAFSRSSFCREHERTHTGEKPYECKEC
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pF1KA1 GRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHERTHFGEKPYECKQCGKAF
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NP_057 GKAFSSLSSFNRHKRTHWKDIL
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>>XP_011526366 (OMIM: 194542) PREDICTED: zinc finger pro (616 aa)
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Smith-Waterman score: 1787; 51.4% identity (71.3% similar) in 502 aa overlap (55-528:3-503)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 SSQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLEDVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRD
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XP_011 VMRETIRNLNCIGMKWENQNIDDQHQNLRRNPRCDVVERFGKSKDGSQCGETLSQIRNSI
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 TNLETPTGLKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECHEYGEKPHKCKECGKTFT
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XP_011 VNKNTPARVDACGSSVNGEVIMGHSSLNCYIRVDTGHKHRECHEYAEKSYTHKQCGKGLS
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210 220 230
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240 250 260 270 280 290
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XP_011 SGDGPHKCKICGKGFDFPGSARIHEGTHTLEKPYECKQCGKLLSHRSSFRRHMMAHTGDG
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initn: 1371 init1: 511 opt: 511 Z-score: 301.1 bits: 65.6 E(85289): 4.9e-10
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pF1KA1 CKQCGKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRSHEKTHTGEKPFVCREC
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XP_011 GKAFSSLSSFNRHKRTHWKDIL
600 610
529 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 20:45:20 2016 done: Wed Nov 2 20:45:22 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]