FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1204, 1444 aa 1>>>pF1KA1204 1444 - 1444 aa - 1444 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8341+/-0.00102; mu= -5.6649+/- 0.061 mean_var=349.9365+/-71.558, 0's: 0 Z-trim(114.1): 124 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.068561 statistics sampled from 14603 (14724) to 14603 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.752), E-opt: 0.2 (0.452), width: 16 Scan time: 5.890 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS43135.1 ARHGAP31 gene_id:57514|Hs108|chr3 (1444) 9692 973.7 0 CCDS31718.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs108|chr11 (1738) 1158 129.6 7.9e-29 CCDS44769.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs108|chr11 (2087) 1158 129.7 9.2e-29 CCDS12477.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs108|chr19 (1126) 1059 119.7 4.9e-26 CCDS54254.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs108|chr19 (1123) 1054 119.2 6.9e-26 CCDS1215.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs108|chr1 ( 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::.:::::::.:: :.. ::::.: :.:::: :::::::::::::::::::.:::::..: CCDS31 GVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDIHSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 VSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEYLIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNL :: .: .: .:..:::.::: ::::::.:.:::. .:.. : :::::.:::.:::::: CCDS31 VSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEFLMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 LRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFILNHVDQIFNNGAPGSLENDE---NRPIMKS ::::.::.. .: :::. ::.:.::.:::::::: .:.. .... .:: :: CCDS31 LRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFILNHVDVLFSGRISMAMQEGAASLSRP--KS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 LTLPALSLPMKLVSLEEAQARSLA-TNHPARKERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNK : . . : ::..:::::::. : .: : : . . : . :::..:.: .. CCDS31 LLVSSPS--TKLLTLEEAQARTQAQVNSPIVTENKYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLER 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KA1 RKLSSKSKK-----WKSIFNLGRSGSDSKSKLSRNGSVFVRGQRLSVE----KATIRPAK .. ..: :: :.:.::::.:.: :: ::.:: : . . .... ..:.: :: CCDS31 KRPQNKMKKSPVGSWRSFFNLGKSSSVSKRKLQRNESEPSEMKAMALKGGRAEGTLRSAK 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KA1 SMDSLCSVPVEGKETKGNFNRTVTTGGFFIPATKMHSTGTGSSC---DLTKQEGEWGQEG : .:: :. . ..: : ... . :. ... :. : : ...: .:: CCDS31 SEESLTSLHAVDGDSKLFRPRRPRSSSDALSAS-FNGEMLGNRCNSYDNLPHDNESEEEG 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 pF1KA1 ----MPP--GAEGGFDVSSDRSHLQGAQARPPPEQLKVFRPVEDPESEQTAPKMLGMFYT .: . ... ::. . . :. : ... : . : ... ..: CCDS31 GLLHIPALMSPHSAEDVDLSPPDIGVASLDFDPMSFQCSPPKAESECLESGASFLDSPGY 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KA1 SNDSPS---KSVFTSSLFQMEPSPRNQRKALNISEPFAVSVPL--RVSAVISTNSTPCRT :.:.:: :.. :.: . :. . ::: . :: ..: .. . .: : CCDS31 SKDKPSANKKDAETGSSQCQTPGSTAS------SEPVS---PLQEKLSPFFTLDLSP--T 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KA1 PPKELQSLSSLEEFSFHGSESGGWPEEEKPLGAETSAASVPKKAGLEDAKAVPEAPGTVE : . : :. . : . : ..: . :. . .. : :. ::: CCDS31 EDKSSKPSSFTEKVVYAFSPKIGRKLSKSP------SMSISEPISVTLPPRVSEVIGTV- 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KA1 CSKGLSQEPGAHLEEKKTPESSLSSQHLNELEKRPNPEKVVEEGREAGEMESSTLQESPR :. .:. .. .: . : . ... ... : . : :..:. : : .: . CCDS31 -SNTTAQNASSSTWDKCVEERDATNRSPTQIVKMKTNETVAQEAYE------SEVQPLDQ 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 pF1KA1 ARAEAVLLHEMDEDDLANALIWPEIQQELKIIESEEELSSLPPPALKTSPIQPILESSLG . :: : : ........ . : . : . .. :. .: : . : CCDS31 VAAEEVELPGKEDQSVSSS--------QSKAVASGQTQTG----AVTHDPPQDSVPVSSV 640 650 660 670 700 710 720 730 740 pF1KA1 PFIPSEPPGSLPCGSFPAPVSTPLEVWTRDPANQ-STQ-----GASTAASREKPE----- .:: :: : :. : . . :.: ::: :.: :. . . CCDS31 SLIPPPPP--------PKNVARMLALALAESAQQASTQSLKRPGTSQAGYTNYGDIAVAT 680 690 700 710 720 730 750 760 770 780 790 pF1KA1 PEQGLHPDLASLAPLEIVPFEKASP--QATVEVGGPGNLSPPLPPAPPPPTPLEESTP-- :..: . ...: :. . :. : : .. ..::: . ::: . : . .: CCDS31 TEDNLSSSYSAVA-LDKAYFQTDRPAEQFHLQNNAPGNCDHPLPETTATGDPTHSNTTES 740 750 760 770 780 800 810 820 830 pF1KA1 ------VLLSKGSPERE----DSSRKLRTDLYIDQLKSQDS-------------PEISSL : :. ..:.. : . :.. .:. ::.: : .: : CCDS31 GEQHHQVDLTGNQPHQAYLSGDPEKARITSVPLDSEKSDDHVSFPEDQSGKNSMPTVSFL 790 800 810 820 830 840 840 850 860 870 880 890 pF1KA1 CQGEEATPRH--SDKQNSKNAASEGKGCGFPSPTREVEIVSQEEEDVTHSVQEPSDCDED : ... :: .:. : .:: : . : . .. . . .. :: :. CCDS31 DQ-DQSPPRFYSGDQPPSYLGASVDK---LHHPLEFADKSPTPPNLPSDKIYPPSGSPEE 850 860 870 880 890 900 900 910 920 930 940 pF1KA1 DTVTDIAQHGLEMVEPW------EEPQWVTSPLHSPTLKDAHKAQVQGLQGHQLEKRLSH .: : : . : .: .: .. ..:: : : .: . :. .. : CCDS31 NTST--ATMTYMTTTPATAQMSTKEASWDVA--EQPTTADFAAATLQ--RTHRTNRPLPP 910 920 930 940 950 950 960 970 980 990 1000 pF1KA1 RPSLRQSHSLDSKPTVKSQWTLEVPSSSSCANLETERNSDPLQPQAPRREITGWDEKALR :: :... .: : .: ... .. . : . .. :. . : : . :. : CCDS31 PPSQRSAE----QPPVVGQ--VQAATNIGLNNSHKVQGVVPVPERPP--EPRAMDDPA-S 960 970 980 990 1000 1010 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA1 SFREFSGLKGAEAPPNQKGPSGVQPNPAETSPISLAEGKELGT-HLGHSSPQIRQGGVPG .: :: .:. : ..:::. : .. .: .. :: : . : :. CCDS31 AFISDSGAAAAQCPM----ATAVQPG----LPEKVRDGARVPLLHLRAESVPAHPCGFPA 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KA1 P-------ESSKESS--PSVQDSTSPGEHPAKLQLKSTECGPPKGKNRPSSLNLDPAIPI : ::. .. : :.:: ... . . .:: ..: : .: CCDS31 PLPPTRMMESKMIAAIHSSSADATSSSNYHSFVTASSTSVD--------DALPLPLPVPQ 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KA1 ADLFWFENV-ASFSSPGMQVSEPGDPK--VTWMTSSYCKADPWRVYSQDPQDLDIVAHAL ..: .::. : . ..:: : . . . :. : : :. . : . CCDS31 PKHASQKTVYSSFARPDV-TTEPFGPDNCLHFNMTPNCQYRPQSV---PPHHNKLEQHQV 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KA1 TGRRNSAPVSVSAVRTSFMV----------KMC-QARAVPVIPPKIQYTQIPQPLPSQSS : :. :.:.. ..... : : ... : . ... : :. .: . CCDS31 YGARSEPPASMGLRYNTYVAPGRNASGHHSKPCSRVEYVSSLSSSVRNTCYPEDIPPYPT 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KA1 GENGVQPLER--SQEGPSSTSGTTQKPAKDDSPSSLESSKEEKPKQDPGAIKSSPVDATA . :: :. :. : . :. : :. . . :: :. : .. : CCDS31 IRR-VQSLHAPPSSMIRSVPISRTEVPPDDEPAYCPRPLYQYKPYQSSQARSDYHVTQLQ 1240 1250 1260 1270 1280 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KA1 PCMCEGPT---LSPEPGSSN-------LLSTQDAVVQCRKRMSETEPSGD-NLLSSKLER : . .: . :: .::. : :: . : . :. : . . .:. CCDS31 PYFENGRVHYRYSPYSSSSSSYYSPDGALCDVDAYGTVQLRPLHRLPNRDFAFYNPRLQG 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KA1 PSGGSKPFHRSRPGRPQSLILFSPPFPIMDHLPPSSTVTDSKVLLSPIRSPTQTVSPGLL : : :: : . ::: . .::.. : CCDS31 KSLYSYAGLAPRP-RANVTGYFSPNDHNVVSMPPAADVKHTYTSWDLEDMEKYRMQSIRR 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KA1 CGELAENTWVTPEGVTLRNKMTIPKNGQRLETSTSCFYQPQRRSVILDGRSGRQIE CCDS31 ESRARQKVKGPVMSQYDNMTPAVQDDLGGIYVIHLRSKSDPGKTGLLSVAEGKESRHAAK 1410 1420 1430 1440 1450 1460 >>CCDS44769.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs108|chr11 (2087 aa) initn: 1168 init1: 964 opt: 1158 Z-score: 629.9 bits: 129.7 E(32554): 9.2e-29 Smith-Waterman score: 1341; 28.8% identity (52.8% similar) in 1478 aa overlap (1-1366:350-1735) 10 20 pF1KA1 MKNKGAKQKLKRKGAAS--AFGCDLTEYLE ::.. .:::::..: . .::::: :.: CCDS44 NQKVPQSVTNSVPKPVSKKHGKLITFLRTFMKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLL 320 330 340 350 360 370 30 40 50 60 70 80 pF1KA1 SSGQDVPYVLKSCAEFIETHGIVDGIYRLSGVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDI .:: .:: ::.::. ::: .::::::::::::.:::::::.:: :.. ::::.: :.::: CCDS44 NSGFEVPQVLQSCTAFIERYGIVDGIYRLSGVASNIQRLRHEFDSEHVPDLTKEPYVQDI 380 390 400 410 420 430 90 100 110 120 130 140 pF1KA1 HCVGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEAVSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEY : :::::::::::::::::::.:::::..::: .: .: .:..:::.::: ::::::. CCDS44 HSVGSLCKLYFRELPNPLLTYQLYEKFSDAVSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEF 440 450 460 470 480 490 150 160 170 180 190 200 pF1KA1 LIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNLLRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFI :.:::. .:.. : :::::.:::.::::::::::.::.. .: :::. ::.:.::.::: CCDS44 LMRHLSLLADYCSITNMHAKNLAIVWAPNLLRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFI 500 510 520 530 540 550 210 220 230 240 250 260 pF1KA1 LNHVDQIFNNGAPGSLENDE---NRPIMKSLTLPALSLPMKLVSLEEAQARSLA-TNHPA ::::: .:.. .... .:: ::: . . : ::..:::::::. : .: : CCDS44 LNHVDVLFSGRISMAMQEGAASLSRP--KSLLVSSPS--TKLLTLEEAQARTQAQVNSPI 560 570 580 590 600 610 270 280 290 300 310 pF1KA1 RKERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNKRKLSSKSKK-----WKSIFNLGRSGSDSKS : . . : . :::..:.: .... ..: :: :.:.::::.:.: :: CCDS44 VTENKYIEVGEGPAALQGKFHTIIEFPLERKRPQNKMKKSPVGSWRSFFNLGKSSSVSKR 620 630 640 650 660 670 320 330 340 350 360 370 pF1KA1 KLSRNGSVFVRGQRLSVE----KATIRPAKSMDSLCSVPVEGKETKGNFNRTVTTGGFFI ::.:: : . . .... ..:.: ::: .:: :. . ..: : ... . CCDS44 KLQRNESEPSEMKAMALKGGRAEGTLRSAKSEESLTSLHAVDGDSKLFRPRRPRSSSDAL 680 690 700 710 720 730 380 390 400 410 420 pF1KA1 PATKMHSTGTGSSC---DLTKQEGEWGQEG----MPP--GAEGGFDVSSDRSHLQGAQAR :. ... :. : : ...: .:: .: . ... ::. . . :. CCDS44 SAS-FNGEMLGNRCNSYDNLPHDNESEEEGGLLHIPALMSPHSAEDVDLSPPDIGVASLD 740 750 760 770 780 790 430 440 450 460 470 480 pF1KA1 PPPEQLKVFRPVEDPESEQTAPKMLGMFYTSNDSPS---KSVFTSSLFQMEPSPRNQRKA : ... : . : ... ..: :.:.:: :.. :.: . :. . CCDS44 FDPMSFQCSPPKAESECLESGASFLDSPGYSKDKPSANKKDAETGSSQCQTPGSTAS--- 800 810 820 830 840 850 490 500 510 520 530 540 pF1KA1 LNISEPFAVSVPL--RVSAVISTNSTPCRTPPKELQSLSSLEEFSFHGSESGGWPEEEKP ::: . :: ..: .. . .: : : . : :. . : . : ..: CCDS44 ---SEPVS---PLQEKLSPFFTLDLSP--TEDKSSKPSSFTEKVVYAFSPKIGRKLSKSP 860 870 880 890 900 550 560 570 580 590 600 pF1KA1 LGAETSAASVPKKAGLEDAKAVPEAPGTVECSKGLSQEPGAHLEEKKTPESSLSSQHLNE . :. . .. : :. ::: :. .:. .. .: . : . ... .. CCDS44 ------SMSISEPISVTLPPRVSEVIGTV--SNTTAQNASSSTWDKCVEERDATNRSPTQ 910 920 930 940 950 610 620 630 640 650 660 pF1KA1 LEKRPNPEKVVEEGREAGEMESSTLQESPRARAEAVLLHEMDEDDLANALIWPEIQQELK . : . : :..:. : : .: .. :: : : ........ . : CCDS44 IVKMKTNETVAQEAYE------SEVQPLDQVAAEEVELPGKEDQSVSSS--------QSK 960 970 980 990 1000 670 680 690 700 710 720 pF1KA1 IIESEEELSSLPPPALKTSPIQPILESSLGPFIPSEPPGSLPCGSFPAPVSTPLEVWTRD . : . .. :. .: : . : .:: :: : :. : . . CCDS44 AVASGQTQTG----AVTHDPPQDSVPVSSVSLIPPPPP--------PKNVARMLALALAE 1010 1020 1030 1040 730 740 750 760 pF1KA1 PANQ-STQ-----GASTAASREKPE-----PEQGLHPDLASLAPLEIVPFEKASP--QAT :.: ::: :.: :. . . :..: . ...: :. . :. : : CCDS44 SAQQASTQSLKRPGTSQAGYTNYGDIAVATTEDNLSSSYSAVA-LDKAYFQTDRPAEQFH 1050 1060 1070 1080 1090 1100 770 780 790 800 810 pF1KA1 VEVGGPGNLSPPLPPAPPPPTPLEESTP--------VLLSKGSPERE----DSSRKLRTD .. ..::: . ::: . : . .: : :. ..:.. : . :. CCDS44 LQNNAPGNCDHPLPETTATGDPTHSNTTESGEQHHQVDLTGNQPHQAYLSGDPEKARITS 1110 1120 1130 1140 1150 1160 820 830 840 850 860 pF1KA1 LYIDQLKSQDS-------------PEISSLCQGEEATPRH--SDKQNSKNAASEGKGCGF . .:. ::.: : .: : : ... :: .:. : .:: : . CCDS44 VPLDSEKSDDHVSFPEDQSGKNSMPTVSFLDQ-DQSPPRFYSGDQPPSYLGASVDK---L 1170 1180 1190 1200 1210 1220 870 880 890 900 910 pF1KA1 PSPTREVEIVSQEEEDVTHSVQEPSDCDEDDTVTDIAQHGLEMVEPW------EEPQWVT : . .. . . .. :: :..: : : . : .: .: . CCDS44 HHPLEFADKSPTPPNLPSDKIYPPSGSPEENTST--ATMTYMTTTPATAQMSTKEASWDV 1230 1240 1250 1260 1270 1280 920 930 940 950 960 970 pF1KA1 SPLHSPTLKDAHKAQVQGLQGHQLEKRLSHRPSLRQSHSLDSKPTVKSQWTLEVPSSSSC . ..:: : : .: . :. .. : :: :... .: : .: ... .. . CCDS44 A--EQPTTADFAAATLQ--RTHRTNRPLPPPPSQRSAE----QPPVVGQ--VQAATNIGL 1290 1300 1310 1320 1330 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KA1 ANLETERNSDPLQPQAPRREITGWDEKALRSFREFSGLKGAEAPPNQKGPSGVQPNPAET : . .. :. . : : . :. : .: :: .:. : ..:::. CCDS44 NNSHKVQGVVPVPERPP--EPRAMDDPA-SAFISDSGAAAAQCPM----ATAVQPG---- 1340 1350 1360 1370 1380 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KA1 SPISLAEGKELGT-HLGHSSPQIRQGGVPGP-------ESSKESS--PSVQDSTSPGEHP : .. .: .. :: : . : :.: ::. .. : :.:: ... CCDS44 LPEKVRDGARVPLLHLRAESVPAHPCGFPAPLPPTRMMESKMIAAIHSSSADATSSSNYH 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA1 AKLQLKSTECGPPKGKNRPSSLNLDPAIPIADLFWFENV-ASFSSPGMQVSEPGDPK--V . . .:: ..: : .: ..: .::. : . ..:: : . CCDS44 SFVTASSTSVD--------DALPLPLPVPQPKHASQKTVYSSFARPDV-TTEPFGPDNCL 1450 1460 1470 1480 1490 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KA1 TWMTSSYCKADPWRVYSQDPQDLDIVAHALTGRRNSAPVSVSAVRTSFMV---------- . . :. : : :. . : . : :. :.:.. ..... CCDS44 HFNMTPNCQYRPQSV---PPHHNKLEQHQVYGARSEPPASMGLRYNTYVAPGRNASGHHS 1500 1510 1520 1530 1540 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KA1 KMC-QARAVPVIPPKIQYTQIPQPLPSQSSGENGVQPLER--SQEGPSSTSGTTQKPAKD : : ... : . ... : :. .: . . :: :. :. : . :. : : CCDS44 KPCSRVEYVSSLSSSVRNTCYPEDIPPYPTIRR-VQSLHAPPSSMIRSVPISRTEVPPDD 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KA1 DSPSSLESSKEEKPKQDPGAIKSSPVDATAPCMCEGPT---LSPEPGSSN-------LLS . . . :: :. : .. : : . .: . :: .::. : CCDS44 EPAYCPRPLYQYKPYQSSQARSDYHVTQLQPYFENGRVHYRYSPYSSSSSSYYSPDGALC 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KA1 TQDAVVQCRKRMSETEPSGD-NLLSSKLERPSGGSKPFHRSRPGRPQSLILFSPPFPIMD :: . : . :. : . . .:. : : :: : . ::: . CCDS44 DVDAYGTVQLRPLHRLPNRDFAFYNPRLQGKSLYSYAGLAPRP-RANVTGYFSPNDHNVV 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KA1 HLPPSSTVTDSKVLLSPIRSPTQTVSPGLLCGELAENTWVTPEGVTLRNKMTIPKNGQRL .::.. : CCDS44 SMPPAADVKHTYTSWDLEDMEKYRMQSIRRESRARQKVKGPVMSQYDNMTPAVQDDLGGI 1730 1740 1750 1760 1770 1780 >>CCDS12477.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs108|chr19 (1126 aa) initn: 957 init1: 923 opt: 1059 Z-score: 580.9 bits: 119.7 E(32554): 4.9e-26 Smith-Waterman score: 1115; 32.8% identity (53.9% similar) in 908 aa overlap (1-864:293-1108) 10 20 pF1KA1 MKNKGAKQKLKRKGA--ASAFGCDLTEYLE :... ..:.:...: .::::: :.: CCDS12 CGIPAPQGISSLTSAVPRPRGKLAGLLRTFMRSRPSRQRLRQRGILRQRVFGCDLGEHLS 270 280 290 300 310 320 30 40 50 60 70 80 pF1KA1 SSGQDVPYVLKSCAEFIETHGIVDGIYRLSGVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDI .:::::: ::. :.::::.::.::::::::::.:::::::.:: :.. :.:. ..:::: CCDS12 NSGQDVPQVLRCCSEFIEAHGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRHEFDSERIPELSGPAFLQDI 330 340 350 360 370 380 90 100 110 120 130 140 pF1KA1 HCVGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEAVSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEY : :.:::::::::::::::::.:: ::.::.: :: .:.:...:::.::: ::::::: CCDS12 HSVSSLCKLYFRELPNPLLTYQLYGKFSEAMSVPGEEERLVRVHDVIQQLPPPHYRTLEY 390 400 410 420 430 440 150 160 170 180 190 200 pF1KA1 LIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNLLRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFI :.::::..: :..:.:::::::.::::::::: :.:..: .: ::: ::::.::.::. 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CCDS12 PNSLAHPGAWVPGPPPYLP-----RQQSDGSLLRSQRPMGT-SRRGLRGPAQVSAQLRAG 800 810 820 830 840 620 630 640 650 660 670 pF1KA1 EEGREAGEMESSTLQESPRARAEAVLLHEMDEDDLANALIWPEIQQELKIIESEEELSSL ::.: : ... : .. .. : : :. : : CCDS12 GGGRDAPEAAAQSPCSVPSQVPTPGFFSPAPRECLPPFLGVPK-----------PGLYPL 850 860 870 880 890 680 690 700 710 720 pF1KA1 PPPALKTSPIQPILESSLGPFIPSEPPGSL--PCG-SFPAPVSTPLEVWT--------RD ::... : :. .::::: : . .: : : .: : : . :. : CCDS12 GPPSFQPSSPAPVWRSSLGPPAPLDRGENLYYEIGASEGSPYSGPTRSWSPFRSMPPDRL 900 910 920 930 940 950 730 740 750 760 770 pF1KA1 PANQSTQGASTAASREK------PEPEQGLHPD-LASLAPLEIVPFEKASPQATVEVG-- :. . : : : : . . :: :. :: . : .. .: . :. CCDS12 NASYGMLGQSPPLHRSPDFLLSYPPAPSCFPPDHLGYSAPQH--PARRPTPPEPLYVNLA 960 970 980 990 1000 1010 780 790 800 810 820 830 pF1KA1 -GPGNLSPPLPPAPPPPT-PLEESTPVLLSKGSPEREDSSRKLRTDLYIDQLKSQDSPEI :: . :: . ::. : .: : :... . :: . :: CCDS12 LGPRGPSPASSSSSSPPAHPRSRSDPGPPVPRLPQKQRAPWGPRTPHRVPG--PWGPPEP 1020 1030 1040 1050 1060 1070 840 850 860 870 880 pF1KA1 SSLCQGEE-ATPRHSDKQNS---KNAASEGKGCGFPSPTREVEIVSQEEEDVTHSVQEPS : .. : : .. . . .:....:.: : : : CCDS12 LLLYRAAPPAYGRGGELHRGSLYRNGGQRGEGAGPPPPYPTPSWSLHSEGQTRSYC 1080 1090 1100 1110 1120 890 900 910 920 930 940 pF1KA1 DCDEDDTVTDIAQHGLEMVEPWEEPQWVTSPLHSPTLKDAHKAQVQGLQGHQLEKRLSHR >>CCDS54254.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs108|chr19 (1123 aa) initn: 1021 init1: 923 opt: 1054 Z-score: 578.2 bits: 119.2 E(32554): 6.9e-26 Smith-Waterman score: 1186; 32.8% identity (57.0% similar) in 905 aa overlap (1-845:157-1034) 10 20 pF1KA1 MKNKGAKQKLKRKGA--ASAFGCDLTEYLE :... ..:.:...: .::::: :.: CCDS54 CGIPAPQGISSLTSAVPRPRGKLAGLLRTFMRSRPSRQRLRQRGILRQRVFGCDLGEHLS 130 140 150 160 170 180 30 40 50 60 70 80 pF1KA1 SSGQDVPYVLKSCAEFIETHGIVDGIYRLSGVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDI .:::::: ::. :.::::.::.::::::::::.:::::::.:: :.. :.:. ..:::: CCDS54 NSGQDVPQVLRCCSEFIEAHGVVDGIYRLSGVSSNIQRLRHEFDSERIPELSGPAFLQDI 190 200 210 220 230 240 90 100 110 120 130 140 pF1KA1 HCVGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEAVSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEY : :.:::::::::::::::::.:: ::.::.: :: .:.:...:::.::: ::::::: CCDS54 HSVSSLCKLYFRELPNPLLTYQLYGKFSEAMSVPGEEERLVRVHDVIQQLPPPHYRTLEY 250 260 270 280 290 300 150 160 170 180 190 200 pF1KA1 LIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNLLRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFI :.::::..: :..:.:::::::.::::::::: :.:..: .: ::: ::::.::.::. CCDS54 LLRHLARMARHSANTSMHARNLAIVWAPNLLRSMELESVGMGGAAAFREVRVQSVVVEFL 310 320 330 340 350 360 210 220 230 240 250 260 pF1KA1 LNHVDQIFNNGAPGSLENDENRPIMKSLTLPALSLP-MKLVSLEEAQARSLAT-NHPARK :.::: .:.. .. . .: .. : : : .:..:::::::. . . :. CCDS54 LTHVDVLFSDTFTSAGLDPAGRCLLPRPKSLAGSCPSTRLLTLEEAQARTQGRLGTPT-- 370 380 390 400 410 420 270 280 290 300 310 320 pF1KA1 ERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNKRKLSSKSKKWKSIFNLGRSGSDSKSK-LSRNG : . :. : . . : ...:: ...: ::..: :::. : ..: : : CCDS54 ---EPTTPKA--PASPAERRKGERGEKQRKPGGSS--WKTFFALGRGPSVPRKKPLPWLG 430 440 450 460 470 330 340 350 360 370 pF1KA1 SVFVRGQRLSV--EKATIRPAKSMDSLCS-VPVEGKETKGNFNRTVTTGGFF----IPAT .. . : . . .:.: ::: .:: : . : . . : ... : :: CCDS54 GTRAPPQPSGSRPDTVTLRSAKSEESLSSQASGAGLQRLHRLRRPHSSSDAFPVGPAPAG 480 490 500 510 520 530 380 390 400 410 420 430 pF1KA1 KMHSTGTGSSCDLTKQEGEWGQEGMPPGAEGGFDVSSDRSHLQGAQARP-------PPEQ . .: ...:: . ...:. .. . .: : .:.. :: .: ::. CCDS54 SCESLSSSSSSESSSSES--SSSSSESSAAGLGALSGSPSHRTSAWLDDGDELDFSPPRC 540 550 560 570 580 590 440 450 460 470 480 pF1KA1 LKVFRPVE-DPESEQ-TAPKMLGMFYTSNDSPSK--SVFTSSLFQMEPSPRNQRK----- :. .: .. :: . . ..: .. .: :.: . . :::. . CCDS54 LEGLRGLDFDPLTFRCSSPTPGDPAPPASPAPPAPASAFPPRVTPQAISPRGPTSPASPA 600 610 620 630 640 650 490 500 510 520 530 pF1KA1 ALNISEPFAVSVPLRVSAVISTNSTPCR-TPPKELQSLSSLEE----FSFHGSESGGWPE ::.::::.::::: : .......: :: :. ::. . ..:.:. CCDS54 ALDISEPLAVSVPPAVLELLGAGGAPASATPTPALSPGRSLRPHLIPLLLRGAEAPLTDA 660 670 680 690 700 710 540 550 560 570 580 590 pF1KA1 EEKPLGAETSAASVPKKAGLEDAKAVPEAPGTVECSKGLSQEPGAHLEEKKTPESSLSSQ .. . .. .:. : .:. .: : . : . :: :.: . : . CCDS54 CQQEMCSKLRGAQGPLGPDMESP--LPPPPLS------LLRPGGAPPPPPKNP-ARLMAL 720 730 740 750 760 600 610 620 630 640 650 pF1KA1 HLNELEKRPNPEKVVEEGREAGEMESSTLQESPRARAEAVLLHEMDE----DDLANALIW : : .. .. .: . .: ...: .. . : ..::. : CCDS54 ALAERAQQVAEQQSQQECGGTPPASQSPFHRSLSLEVGGEPLGTSGSGPPPNSLAHPGAW 770 780 790 800 810 820 660 670 680 690 pF1KA1 --------PEIQQELKIIESEEELSS----LPPPALKTSP--IQPILESSLGPFIPSEPP :. :.. ....:.. ... : :: .: ..: . : ::. : CCDS54 VPGPPPYLPRQQSDGSLLRSQRPMGTSRRGLRGPAQVPTPGFFSPAPRECLPPFLGVPKP 830 840 850 860 870 880 700 710 720 730 740 750 pF1KA1 GSLPCGSFPAPVSTPLEVWTRDPANQSTQGASTAASR-EKPEPEQGLHPDLASLAPLEI- : : : :.: :: .:. : . .: :. : : .: . CCDS54 GLYPLGPPSFQPSSPAPVW------RSSLGPPAPLDRGENLYYEIGASEGSPYSGPTRSW 890 900 910 920 930 940 760 770 780 790 800 810 pF1KA1 VPFEKASPQATVEVGGPGNLSPPLPPAPP-----PPTPLEESTPVLLSKGSPEREDSSRK ::.. :. : . :::: .: ::.: : :. ..:.. CCDS54 SPFRSMPPDRLNASYGMLGQSPPLHRSPDFLLSYPPAP-SCFPPDHLGYSAPQHPARRPT 950 960 970 980 990 820 830 840 850 860 870 pF1KA1 LRTDLYIDQLKSQDSPE-ISSLCQGEEATPR-HSDKQNSKNAASEGKGCGFPSPTREVEI ::.. . .: :: .. : :: .:: CCDS54 PPEPLYVNLALGPRGPSPASSSSSSPPAHPRSRSDPGPPVPRLPQKQRAPWGPRTPHRVP 1000 1010 1020 1030 1040 1050 880 890 900 910 920 930 pF1KA1 VSQEEEDVTHSVQEPSDCDEDDTVTDIAQHGLEMVEPWEEPQWVTSPLHSPTLKDAHKAQ CCDS54 GPWGPPEPLLLYRAAPPAYGRGGELHRGSLYRNGGQRGEGAGPPPPYPTPSWSLHSEGQT 1060 1070 1080 1090 1100 1110 >>CCDS1215.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs108|chr1 (890 aa) initn: 1262 init1: 970 opt: 1000 Z-score: 550.8 bits: 113.8 E(32554): 2.3e-24 Smith-Waterman score: 1225; 33.5% identity (56.6% similar) in 956 aa overlap (6-939:3-890) 10 20 30 40 50 pF1KA1 MKNKGAKQKLKRKGAAS--AFGCDLTEYLESSGQDVPYVLKSCAEFIETHGIVDGIYRLS ..:: :.::.:. .::::: :.:. :::.:: ::::::::.: .:.:::::::: CCDS12 MKSRQKGKKKGSAKERVFGCDLQEHLQHSGQEVPQVLKSCAEFVEEYGVVDGIYRLS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KA1 GVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDIHCVGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEA ::.::::.::::: :.. ::: :.:::::::::.:::: ::::::.:::::.::.::.:: CCDS12 GVSSNIQKLRQEFESERKPDLRRDVYLQDIHCVSSLCKAYFRELPDPLLTYRLYDKFAEA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 VSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEYLIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNL :. : .:..: .:..::: .:::::.:.:::.:.::::..:::::::::.:::::: CCDS12 VGVQLEPERLVKILEVLRELPVPNYRTLEFLMRHLVHMASFSAQTNMHARNLAIVWAPNL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 LRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFILNHVDQIFNNGAPGSLENDENRPIMKSLTL ::::.:::.: :: :::. ::::..:.::::.::::.:...: : . : . .:: CCDS12 LRSKDIEASGFNGTAAFMEVRVQSIVVEFILTHVDQLFGGAA---LSGGEVESGWRSL-- 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 PALSLPMKLVSLEEAQARSLATNHPARKERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNKRKLS :. : :. . : : . :. . .. ::. .::..:. ..::: : CCDS12 PGTRASG---SPEDLMPRPLPYHLPSILQAGDG------PPQMRPYHTIIEIAEHKRKGS 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 SKSKKWKSIFNLGRSGSDSKSKLSRNGSVFVRGQRLSVEKATIRPAKSMDSLCSVPVEGK : .::.::::::::: ..: :: :.. . .. . .:.:.::::::::: .. . CCDS12 LKVRKWRSIFNLGRSGHETKRKLPRGA----EDREDKSNKGTLRPAKSMDSLSAAAGASD 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KA1 ETKGNFNRTVTTGGFFIPATKMHSTGTGSSCDLTKQEGEWGQEGMPPGA-EGGFDV---- : .: . . . ..: . ... .. . . : . ::. ..: .. CCDS12 EPEGLVGPSSPRPSPLLPESLENDSIEAAEGEQEPEAEALGGTNSEPGTPRAGRSAIRAG 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KA1 -SSDRSHLQGAQARPPPEQLKVFRPVEDPESEQTAPKMLGMFYTSNDSPSKSV--FTSSL :: . :.. : .: :.. .. :... :: : .. . . CCDS12 GSSRAERCAGVHISDP---YNVNLPLHITSILSVPPNII-----SNVSLARLTRGLECPA 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 pF1KA1 FQMEPSPRNQRKALNISEPFAVSVPLRVSAVIS--TNSTPCRTPPKELQSLSS--LEEFS .: .::: . : . :..: . : ..: : : .:::. . :: CCDS12 LQHRPSPASGPGPGPGLGPGPPDEKLEASPASSPLADSGPDDLAPALEDSLSQEVQDSFS 460 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 580 pF1KA1 FHGSESGGWPEEEKPLGAETSAASVPKKAGLEDAKAVPEAPGTVECSKGLSQE---PGAH : . :.. :: .::: . .. . :: . .:: . . : .: : . CCDS12 FLEDSSSSEPEW---VGAEDGEVAQAEAAG------AAFSPGEDDPGMGYLEELLGVGPQ 520 530 540 550 560 590 600 610 620 630 640 pF1KA1 LEEKKTPESSLSSQHLNELEKRPNPEKVVEEGREAGEMESSTLQESPRARAEAVLLHEMD .:: .. : :.. :.: . : .. :: : . .: :.: . CCDS12 VEEFSV-EPPLDDLSLDEAQFVLAPSCCSLDS--AGPRP-----EVEEENGEEVFLSAY- 570 580 590 600 610 650 660 670 680 690 700 pF1KA1 EDDLANAL-IWPEIQQELKIIESEEELSSLPPPAL-KTSPIQPILESSLGPFIPSEPPGS :::. : : : . .:.: .. :: . . : : .: .:: : CCDS12 -DDLSPLLGPKPPIWKGSGSLEGEA--AGCGRQALGQGGEEQACWE--VGEDKQAEPGGR 620 630 640 650 660 710 720 730 740 750 760 pF1KA1 LPCGSFPAPVSTPLEVWTRDPANQ-STQGASTAASREKPEPEQGLHPDLASLAPLEIVPF : . : . .: .: : .: : . : :... .. :: CCDS12 LDIREEAEGTPQPPQPEEMEPEGQPSPDGCLCPCSLGLGGVGMRLASTLVQVQQVRSVPV 670 680 690 700 710 720 770 780 790 800 810 pF1KA1 EKASPQATVEVGGPGNLSPPLPPAPPPPTPLEESTPVLLSKGSP-EREDSSRKLRTDLYI .:: . :. . . :: : : : :. :.: :: .:: :.. CCDS12 VPPKPQFAKM---PSAMCSKIHVAPANPCP----RPGRLD-GTPGERAWGSRASRSSWRN 730 740 750 760 770 780 820 830 840 850 860 870 pF1KA1 DQLKSQDSPEISSLCQGEEATPRHSDKQNSKNAASEGKGCGFPSPTREVEIVSQEEEDVT : :. .: . .. : .. .. ... . : : .: : ..: . CCDS12 GGSLSFDA--AVALARDRQRTEAQGVRR-TQTCTEGGDYCLIPR-TSPCSMISAHSPRPL 790 800 810 820 830 880 890 900 910 920 930 pF1KA1 HSVQEPSDCDEDDTVTDIAQHGLEMVEPWEEPQWVTSPLHSPTLKD-AHKAQVQGLQGHQ .. ::. : . . .. : .::: : .:: : .. : ..:.. .:. CCDS12 SCLELPSEGAEGSGSRS------RLSLPPREPQ-VPDPLLSSQRRSYAFETQANPGKGEG 840 850 860 870 880 940 950 960 970 980 990 pF1KA1 LEKRLSHRPSLRQSHSLDSKPTVKSQWTLEVPSSSSCANLETERNSDPLQPQAPRREITG : CCDS12 L 890 >>CCDS30918.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs108|chr1 (1101 aa) initn: 1262 init1: 970 opt: 1000 Z-score: 549.5 bits: 113.9 E(32554): 2.8e-24 Smith-Waterman score: 1228; 30.5% identity (55.6% similar) in 1142 aa overlap (6-1116:3-1004) 10 20 30 40 50 pF1KA1 MKNKGAKQKLKRKGAAS--AFGCDLTEYLESSGQDVPYVLKSCAEFIETHGIVDGIYRLS ..:: :.::.:. .::::: :.:. :::.:: ::::::::.: .:.:::::::: CCDS30 MKSRQKGKKKGSAKERVFGCDLQEHLQHSGQEVPQVLKSCAEFVEEYGVVDGIYRLS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KA1 GVTSNIQRLRQEFGSDQCPDLTREVYLQDIHCVGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEA ::.::::.::::: :.. ::: :.:::::::::.:::: ::::::.:::::.::.::.:: CCDS30 GVSSNIQKLRQEFESERKPDLRRDVYLQDIHCVSSLCKAYFRELPDPLLTYRLYDKFAEA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 VSHCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEYLIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNL :. : .:..: .:..::: .:::::.:.:::.:.::::..:::::::::.:::::: CCDS30 VGVQLEPERLVKILEVLRELPVPNYRTLEFLMRHLVHMASFSAQTNMHARNLAIVWAPNL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 LRSKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFILNHVDQIFNNGAPGSLENDENRPIMKSLTL ::::.:::.: :: :::. ::::..:.::::.::::.:...: : . : . .: : CCDS30 LRSKDIEASGFNGTAAFMEVRVQSIVVEFILTHVDQLFGGAA---LSGGEVESGWRS--L 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 PALSLPMKLVSLEEAQARSLATNHPARKERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNKRKLS :. : :. . : : . :. . .. ::. .::..:. ..::: : CCDS30 PGTRASG---SPEDLMPRPLPYHLPSILQAGDG------PPQMRPYHTIIEIAEHKRKGS 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 SKSKKWKSIFNLGRSGSDSKSKLSRNGSVFVRGQRLSVEKATIRPAKSMDSLCSVPVEGK : .::.::::::::: ..: :: :. .. .. . .:.:.::::::::: .. . CCDS30 LKVRKWRSIFNLGRSGHETKRKLPRG----AEDREDKSNKGTLRPAKSMDSLSAAAGASD 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KA1 ETKGNFNRTVTTGGFFIPATKMHSTGTGSSCDLTKQEGEWGQEGMPPGAEGGFDVSSDRS : .: . . . ..: . ... . ::: :: : ::. CCDS30 EPEGLVGPSSPRPSPLLPESLENDS-------IEAAEGE--QE---PEAEA--------- 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 pF1KA1 HLQGAQARPPPEQLKVFRPVEDPESEQTAPKMLGMFYTSNDSPSKSVFTSSLFQMEPSPR : :....: :.. ..: . : : : CCDS30 -LGGTNSEPGT-----------PRAGRSAIRAGG-----------------------SSR 380 390 400 480 490 500 510 520 530 pF1KA1 NQRKA-LNISEPFAVSVPLRVSAVISTNSTPCRTPPKELQSLSSLEEFSFHGSESGGWPE .: : ..::.:. :..::......:. ::. ....: : ... .: : . CCDS30 AERCAGVHISDPYNVNLPLHITSILSV-------PPNIISNVS-LARLT-RGLECPAL-- 410 420 430 440 450 540 550 560 570 580 590 pF1KA1 EEKPLGAETSAASVPKKAGLEDAKAVPEAPGTVECSKGLSQEPGAHLEEKKTPESSLSSQ ...: : . . : : : . .:.. . . .. . ::.. . : . : . CCDS30 QHRPSPASGPGPGPGLGPGPPDEK-LEASPASSPLADSGPDDLAPALEDSLSQEVQDSFS 460 470 480 490 500 510 600 610 620 630 640 650 pF1KA1 HLNELEKRPNPEKVVEEGREAGEMESSTLQESPRARAEAVLLHEMDEDDLANALIWPEIQ : : . .:: : : :... :.. :: ::: . . . . CCDS30 FL-EDSSSSEPEWVGAEDGEVAQAEAAGAAFSP------------GEDDPGMGYL----E 520 530 540 550 660 670 680 690 700 pF1KA1 QELKIIESEEELSSLPP-PALKTSPIQPILE------SSLGPFIPSEPPGS----LPCGS . : . . ::.: :: :. . : .: .: :: : .. : . CCDS30 ELLGVGPQVEEFSVEPPLDDLSLDEAQFVLAPSCCSLDSAGPRPEVEEENGEEVFLSAYD 560 570 580 590 600 610 710 720 730 740 750 760 pF1KA1 FPAPVSTPLE-VWTRDPANQSTQGASTAASREKPEPEQGLHPDLASLAPLEIVPFEKASP .:. : .: .. : .: ... .: :.: : :. ..: : CCDS30 DLSPLLGPKPPIWK---GSGSLEGEAAGCGR------QALGQGGEEQACWEVGEDKQAEP 620 630 640 650 660 770 780 790 800 810 820 pF1KA1 QATVEVGGPGNLSPPLPPAPPPPTPLEESTPVLLSKGSPEREDSSRKLRTDLYIDQLKSQ . ... .. :: : : .:.: .: ... . .: . . . . . CCDS30 GGRLDIREEAEGSPE--------------TKVEAGKASEDRGEAGGSQETKVRLREGSRE 670 680 690 700 710 830 840 850 860 870 880 pF1KA1 DSPEISSLCQGEEATPRHSDKQNSKNAASEGKGCGFPSPTREVEIVSQEEEDVTHS-VQE .. .:. ...:....:.. : : . . .: :: .:.:. .. :. CCDS30 ETEAKEEKSKGQ----KKADSMEAKGVEEPG-GDEY-TDEKEKEIEREEDEQREEAQVEA 720 730 740 750 760 890 900 910 920 930 940 pF1KA1 PSDCDEDDTVTDIAQHGLEMVEPWEEPQWVTSPLHSPTLKDAHKAQVQGLQGHQLEKRLS : .. ..:.. :.:. : . .. : :.:. . :: ..: : CCDS30 GRDLEQGAQEDQVAEEKWEVVQKQEAEGVREDEDKGQREKGYHEARKD--QGDGEDSR-S 770 780 790 800 810 820 950 960 970 980 990 1000 pF1KA1 HRPSLRQSHSLDSKPTVKSQWTLEVPSSSSCANLETERNSDPLQPQAPRREITGWDEKAL . . . . . :: ... : . .. :: . :. . :. : CCDS30 PEAATEGGAGEVSKERESGDGEAEGDQRAGGYYLEEDTLSE--GSGVASLEVDCAKEGNP 830 840 850 860 870 880 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA1 RSFREFSGLKGAEAPPNQKGPSGVQPNP-AETSPISLAEGKELGTHLGHSSPQIRQ-GGV .: :. . :.. : : ::.: . : ::. : .: .:. . :..: .: CCDS30 HS-SEMEEVAPQPPQPEEMEPEG-QPSPDGCLCPCSLGLGG-VGMRLASTLVQVQQVRSV 890 900 910 920 930 1070 1080 1090 1100 pF1KA1 P--GPESSKESSPSVQDS------TSPGEHPAKLQLKSTECGPPKGKNRPS-----SLNL : :. . . ::.. : ..: .:..:. : . . .: : ::.. CCDS30 PVVPPKPQFAKMPSAMCSKIHVAPANPCPRPGRLDGTPGERAWGSRASRSSWRNGGSLSF 940 950 960 970 980 990 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KA1 DPAIPIADLFWFENVASFSSPGMQVSEPGDPKVTWMTSSYCKADPWRVYSQDPQDLDIVA : :. .: CCDS30 DAAVALARDRQRTEAQGVRRTQTCTEGGDYCLIPRTSPCSMISAHSPRPLSCLELPSEGA 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1444 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Wed Nov 2 20:46:03 2016 done: Wed Nov 2 20:46:04 2016 Total Scan time: 5.890 Total Display time: 0.460 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]