FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1207, 2061 aa 1>>>pF1KA1207 2061 - 2061 aa - 2061 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3591+/-0.000442; mu= 19.6916+/- 0.028 mean_var=99.9794+/-20.892, 0's: 0 Z-trim(112.4): 183 B-trim: 364 in 1/55 Lambda= 0.128268 statistics sampled from 21159 (21381) to 21159 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16 Scan time: 20.350 The best scores are: opt bits E(85289) NP_038479 (OMIM: 604603) myoferlin isoform a [Homo (2061) 13984 2600.0 0 NP_579899 (OMIM: 604603) myoferlin isoform b [Homo (2048) 10765 2004.3 0 XP_016871559 (OMIM: 604603) PREDICTED: myoferlin i (1786) 9722 1811.3 0 XP_005269750 (OMIM: 604603) PREDICTED: myoferlin i (2080) 9722 1811.3 0 XP_011537934 (OMIM: 604603) PREDICTED: myoferlin i (2062) 9539 1777.4 0 XP_016871557 (OMIM: 604603) 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_038 GDVLVTAELILRGKDGSNLPILPPQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNFQ 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KA1 MASITSPSLVVECGGERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_038 MASITSPSLVVECGGERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDH 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KA1 RQFGRKPVVGQCTIERLDRFRCDPYAGKEDIVPQLKASLLSAPPCRDIVIEMEDTKPLLA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_038 RQFGRKPVVGQCTIERLDRFRCDPYAGKEDIVPQLKASLLSAPPCRDIVIEMEDTKPLLA 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KA1 SKLTEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKIYNCELENVAEFEGLTDFSDT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_038 SKLTEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKIYNCELENVAEFEGLTDFSDT 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KA1 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