FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1207, 2061 aa
1>>>pF1KA1207 2061 - 2061 aa - 2061 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3591+/-0.000442; mu= 19.6916+/- 0.028
mean_var=99.9794+/-20.892, 0's: 0 Z-trim(112.4): 183 B-trim: 364 in 1/55
Lambda= 0.128268
statistics sampled from 21159 (21381) to 21159 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16
Scan time: 20.350
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_038479 (OMIM: 604603) myoferlin isoform a [Homo (2061) 13984 2600.0 0
NP_579899 (OMIM: 604603) myoferlin isoform b [Homo (2048) 10765 2004.3 0
XP_016871559 (OMIM: 604603) PREDICTED: myoferlin i (1786) 9722 1811.3 0
XP_005269750 (OMIM: 604603) PREDICTED: myoferlin i (2080) 9722 1811.3 0
XP_011537934 (OMIM: 604603) PREDICTED: myoferlin i (2062) 9539 1777.4 0
XP_016871557 (OMIM: 604603) PREDICTED: myoferlin i (1938) 8798 1640.3 0
XP_016871558 (OMIM: 604603) PREDICTED: myoferlin i (1938) 8798 1640.3 0
NP_003485 (OMIM: 253601,254130,603009,606768) dysf (2080) 7010 1309.4 0
NP_001123927 (OMIM: 253601,254130,603009,606768) d (2081) 7010 1309.4 0
NP_001124451 (OMIM: 253601,254130,603009,606768) d (2111) 7010 1309.4 0
NP_001124454 (OMIM: 253601,254130,603009,606768) d (2112) 7010 1309.4 0
XP_005269751 (OMIM: 604603) PREDICTED: myoferlin i (2067) 6503 1215.6 0
NP_001124458 (OMIM: 253601,254130,603009,606768) d (2067) 5958 1114.8 0
NP_001124448 (OMIM: 253601,254130,603009,606768) d (2066) 5941 1111.6 0
NP_001124452 (OMIM: 253601,254130,603009,606768) d (2097) 5758 1077.8 0
NP_001124457 (OMIM: 253601,254130,603009,606768) d (2098) 5758 1077.8 0
NP_001124450 (OMIM: 253601,254130,603009,606768) d (2101) 4229 794.8 0
NP_001124455 (OMIM: 253601,254130,603009,606768) d (2102) 4229 794.8 0
XP_005264642 (OMIM: 253601,254130,603009,606768) P (2132) 4229 794.8 0
XP_005264641 (OMIM: 253601,254130,603009,606768) P (2133) 4229 794.8 0
NP_001124456 (OMIM: 253601,254130,603009,606768) d (2088) 3177 600.1 8e-170
NP_001124449 (OMIM: 253601,254130,603009,606768) d (2087) 3160 597.0 7.1e-169
NP_001124453 (OMIM: 253601,254130,603009,606768) d (2118) 2977 563.1 1.1e-158
NP_001124459 (OMIM: 253601,254130,603009,606768) d (2119) 2977 563.1 1.1e-158
NP_004793 (OMIM: 601071,603681) otoferlin isoform (1230) 1586 305.6 2.2e-81
NP_919303 (OMIM: 601071,603681) otoferlin isoform (1307) 1586 305.6 2.3e-81
XP_016860827 (OMIM: 601071,603681) PREDICTED: otof (1977) 1586 305.7 3.3e-81
NP_919224 (OMIM: 601071,603681) otoferlin isoform (1997) 1586 305.7 3.3e-81
NP_919304 (OMIM: 601071,603681) otoferlin isoform (1230) 1558 300.4 8.1e-80
NP_001274418 (OMIM: 601071,603681) otoferlin isofo (1997) 1558 300.5 1.2e-79
XP_006723404 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 383) 181 45.3 0.0016
NP_003171 (OMIM: 600782) synaptotagmin-5 isoform 1 ( 386) 181 45.3 0.0016
XP_016882664 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 181 45.3 0.0016
XP_016882665 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 181 45.3 0.0016
XP_006723402 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 181 45.3 0.0016
NP_001171725 (OMIM: 616670) extended synaptotagmin (1114) 181 45.6 0.0038
XP_016867496 (OMIM: 604918,608027) PREDICTED: prot (2561) 182 46.0 0.0066
>>NP_038479 (OMIM: 604603) myoferlin isoform a [Homo sap (2061 aa)
initn: 13984 init1: 13984 opt: 13984 Z-score: 13978.0 bits: 2600.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 13984; 100.0% identity (100.0% similar) in 2061 aa overlap (1-2061:1-2061)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLRVIVESASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 MLRVIVESASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 FSSSLGIIVKDFETIGQNKLIGTATVALKDLTGDQSRSLPYKLISLLNEKGQDTGATIDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 FSSSLGIIVKDFETIGQNKLIGTATVALKDLTGDQSRSLPYKLISLLNEKGQDTGATIDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 VIGYDPPSAPHPNDLSGPSVPGMGGDGEEDEGDEDRLDNAVRGPGPKGPVGTVSEAQLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 VIGYDPPSAPHPNDLSGPSVPGMGGDGEEDEGDEDRLDNAVRGPGPKGPVGTVSEAQLAR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 RLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVHVCGQTHRTRIKRGNNPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 RLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVHVCGQTHRTRIKRGNNPF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 FDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVMRKWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 FDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVMRKWL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 LLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 LLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 WNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVEDFSSSGTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 WNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVEDFSSSGTG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 AASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPDPYDELNTGKGEGVAYRGRILVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 AASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPDPYDELNTGKGEGVAYRGRILVE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEAIQFEVSIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 LATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEAIQFEVSIG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 NYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 NYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LAMAERLQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGKANVTVLDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 LAMAERLQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGKANVTVLDT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 QIRKLRSRSLSQIHEAAVRMRSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 QIRKLRSRSLSQIHEAAVRMRSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 RGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQTIFLKYPQEKNNGPKVPVELRVNIWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 RGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQTIFLKYPQEKNNGPKVPVELRVNIWL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 GLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALMFGKWGTSGLVGRHKFSDVTGKIKLKREFFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 GLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALMFGKWGTSGLVGRHKFSDVTGKIKLKREFFL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 PPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDTYTDANGDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 PPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDTYTDANGDK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 AASPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAEKMYHTHRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 AASPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAEKMYHTHRR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 RRLVRKRKKDLTQTASSTARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 RRLVRKRKKDLTQTASSTARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKM
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 APSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKSLEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 APSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKSLEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYH
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 LRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNPTWDQTIIFDEVEIYGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 LRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNPTWDQTIIFDEVEIYGE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 PQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGKDEFLGRSIFSPVVKLNSEMDITPKLLWHPVMNGDKAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 PQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGKDEFLGRSIFSPVVKLNSEMDITPKLLWHPVMNGDKAC
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 GDVLVTAELILRGKDGSNLPILPPQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 GDVLVTAELILRGKDGSNLPILPPQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNFQ
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 MASITSPSLVVECGGERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 MASITSPSLVVECGGERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDH
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 RQFGRKPVVGQCTIERLDRFRCDPYAGKEDIVPQLKASLLSAPPCRDIVIEMEDTKPLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 RQFGRKPVVGQCTIERLDRFRCDPYAGKEDIVPQLKASLLSAPPCRDIVIEMEDTKPLLA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 SKLTEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKIYNCELENVAEFEGLTDFSDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 SKLTEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKIYNCELENVAEFEGLTDFSDT
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 FKLYRGKSDENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDPSVPAPPRQFRELPDSVPQECTVRIYIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 FKLYRGKSDENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDPSVPAPPRQFRELPDSVPQECTVRIYIV
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 RGLELQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHYIPNTLNPVFGRMYELSCYLPQEKDLKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 RGLELQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHYIPNTLNPVFGRMYELSCYLPQEKDLKI
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA1 SVYDYDTFTRDEKVGETIIDLENRFLSRFGSHCGIPEEYCVSGVNTWRDQLRPTQLLQNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 SVYDYDTFTRDEKVGETIIDLENRFLSRFGSHCGIPEEYCVSGVNTWRDQLRPTQLLQNV
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA1 ARFKGFPQPILSEDGSRIRYGGRDYSLDEFEANKILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 ARFKGFPQPILSEDGSRIRYGGRDYSLDEFEANKILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVPE
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA1 HVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGPPFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 HVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGPPFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDV
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA1 ILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLDGEGNFNWRFVFPFDYLPAEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 ILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLDGEGNFNWRFVFPFDYLPAEQL
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA1 CIVAKKEHFWSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGFLELDLRHTIIPAKSPEKCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 CIVAKKEHFWSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGFLELDLRHTIIPAKSPEKCR
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA1 LDMIPDLKAMNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCYAEKDGARVMAGKVEMTLEILNEKEADE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 LDMIPDLKAMNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCYAEKDGARVMAGKVEMTLEILNEKEADE
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA1 RPAGKGRDEPNMNPKLDLPNRPETSFLWFTNPCKTMKFIVWRRFKWVIIGLLFLLILLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 RPAGKGRDEPNMNPKLDLPNRPETSFLWFTNPCKTMKFIVWRRFKWVIIGLLFLLILLLF
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060
pF1KA1 VAVLLYSLPNYLSMKIVKPNV
:::::::::::::::::::::
NP_038 VAVLLYSLPNYLSMKIVKPNV
2050 2060
>>NP_579899 (OMIM: 604603) myoferlin isoform b [Homo sap (2048 aa)
initn: 13890 init1: 10759 opt: 10765 Z-score: 10758.7 bits: 2004.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 13868; 99.4% identity (99.4% similar) in 2061 aa overlap (1-2061:1-2048)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLRVIVESASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 MLRVIVESASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 FSSSLGIIVKDFETIGQNKLIGTATVALKDLTGDQSRSLPYKLISLLNEKGQDTGATIDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 FSSSLGIIVKDFETIGQNKLIGTATVALKDLTGDQSRSLPYKLISLLNEKGQDTGATIDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 VIGYDPPSAPHPNDLSGPSVPGMGGDGEEDEGDEDRLDNAVRGPGPKGPVGTVSEAQLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 VIGYDPPSAPHPNDLSGPSVPGMGGDGEEDEGDEDRLDNAVRGPGPKGPVGTVSEAQLAR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 RLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVHVCGQTHRTRIKRGNNPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 RLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVHVCGQTHRTRIKRGNNPF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 FDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVMRKWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 FDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVMRKWL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 LLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 LLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 WNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVEDFSSSGTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 WNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVE--------
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 AASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPDPYDELNTGKGEGVAYRGRILVE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 -----VNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPDPYDELNTGKGEGVAYRGRILVE
480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEAIQFEVSIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 LATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEAIQFEVSIG
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 NYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 NYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTL
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LAMAERLQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGKANVTVLDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 LAMAERLQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGKANVTVLDT
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 QIRKLRSRSLSQIHEAAVRMRSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 QIRKLRSRSLSQIHEAAVRMRSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMI
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 RGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQTIFLKYPQEKNNGPKVPVELRVNIWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 RGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQTIFLKYPQEKNNGPKVPVELRVNIWL
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 GLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALMFGKWGTSGLVGRHKFSDVTGKIKLKREFFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 GLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALMFGKWGTSGLVGRHKFSDVTGKIKLKREFFL
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 PPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDTYTDANGDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 PPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDTYTDANGDK
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 AASPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAEKMYHTHRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 AASPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAEKMYHTHRR
950 960 970 980 990 1000
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 RRLVRKRKKDLTQTASSTARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 RRLVRKRKKDLTQTASSTARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKM
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 APSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKSLEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 APSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKSLEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYH
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 LRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNPTWDQTIIFDEVEIYGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 LRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNPTWDQTIIFDEVEIYGE
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 PQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGKDEFLGRSIFSPVVKLNSEMDITPKLLWHPVMNGDKAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 PQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGKDEFLGRSIFSPVVKLNSEMDITPKLLWHPVMNGDKAC
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 GDVLVTAELILRGKDGSNLPILPPQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 GDVLVTAELILRGKDGSNLPILPPQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNFQ
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 MASITSPSLVVECGGERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 MASITSPSLVVECGGERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDH
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 RQFGRKPVVGQCTIERLDRFRCDPYAGKEDIVPQLKASLLSAPPCRDIVIEMEDTKPLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 RQFGRKPVVGQCTIERLDRFRCDPYAGKEDIVPQLKASLLSAPPCRDIVIEMEDTKPLLA
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 SKLTEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKIYNCELENVAEFEGLTDFSDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 SKLTEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKIYNCELENVAEFEGLTDFSDT
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 FKLYRGKSDENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDPSVPAPPRQFRELPDSVPQECTVRIYIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 FKLYRGKSDENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDPSVPAPPRQFRELPDSVPQECTVRIYIV
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 RGLELQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHYIPNTLNPVFGRMYELSCYLPQEKDLKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 RGLELQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHYIPNTLNPVFGRMYELSCYLPQEKDLKI
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA1 SVYDYDTFTRDEKVGETIIDLENRFLSRFGSHCGIPEEYCVSGVNTWRDQLRPTQLLQNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 SVYDYDTFTRDEKVGETIIDLENRFLSRFGSHCGIPEEYCVSGVNTWRDQLRPTQLLQNV
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA1 ARFKGFPQPILSEDGSRIRYGGRDYSLDEFEANKILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 ARFKGFPQPILSEDGSRIRYGGRDYSLDEFEANKILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVPE
1670 1680 1690 1700 1710 1720
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA1 HVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGPPFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 HVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGPPFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDV
1730 1740 1750 1760 1770 1780
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA1 ILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLDGEGNFNWRFVFPFDYLPAEQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 ILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLDGEGNFNWRFVFPFDYLPAEQL
1790 1800 1810 1820 1830 1840
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA1 CIVAKKEHFWSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGFLELDLRHTIIPAKSPEKCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 CIVAKKEHFWSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGFLELDLRHTIIPAKSPEKCR
1850 1860 1870 1880 1890 1900
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA1 LDMIPDLKAMNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCYAEKDGARVMAGKVEMTLEILNEKEADE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 LDMIPDLKAMNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCYAEKDGARVMAGKVEMTLEILNEKEADE
1910 1920 1930 1940 1950 1960
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA1 RPAGKGRDEPNMNPKLDLPNRPETSFLWFTNPCKTMKFIVWRRFKWVIIGLLFLLILLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_579 RPAGKGRDEPNMNPKLDLPNRPETSFLWFTNPCKTMKFIVWRRFKWVIIGLLFLLILLLF
1970 1980 1990 2000 2010 2020
2050 2060
pF1KA1 VAVLLYSLPNYLSMKIVKPNV
:::::::::::::::::::::
NP_579 VAVLLYSLPNYLSMKIVKPNV
2030 2040
>>XP_016871559 (OMIM: 604603) PREDICTED: myoferlin isofo (1786 aa)
initn: 11853 init1: 9698 opt: 9722 Z-score: 9716.5 bits: 1811.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 11819; 98.9% identity (98.9% similar) in 1776 aa overlap (1-1757:1-1776)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLRVIVESASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MLRVIVESASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 FSSSLGIIVKDFETIGQNKLIGTATVALKDLTGDQSRSLPYKLISLLNEKGQDTGATIDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSSSLGIIVKDFETIGQNKLIGTATVALKDLTGDQSRSLPYKLISLLNEKGQDTGATIDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 VIGYDPPSAPHPNDLSGPSVPGMGGDGEEDEGDEDRLDNAVRGPGPKGPVGTVSEAQLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VIGYDPPSAPHPNDLSGPSVPGMGGDGEEDEGDEDRLDNAVRGPGPKGPVGTVSEAQLAR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 RLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVHVCGQTHRTRIKRGNNPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVHVCGQTHRTRIKRGNNPF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 FDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVMRKWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVMRKWL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 WNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVEDFSSSGTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVEDFSSSGTG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 AASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPDPYDELNTGKGEGVAYRGRILVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPDPYDELNTGKGEGVAYRGRILVE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEAIQFEVSIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEAIQFEVSIG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 NYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LAMAERLQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGKANVTVLDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LAMAERLQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGKANVTVLDT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 QIRKLRSRSLSQIHEAAVRMRSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QIRKLRSRSLSQIHEAAVRMRSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 RGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQTIFLKYPQEKNNGPKVPVELRVNIWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQTIFLKYPQEKNNGPKVPVELRVNIWL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 GLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALMFGKWGTSGLVGRHKFSDVTGKIKLKREFFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALMFGKWGTSGLVGRHKFSDVTGKIKLKREFFL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 PPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDTYTDANGDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDTYTDANGDK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 AASPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAEKMYHTHRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AASPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAEKMYHTHRR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 RRLVRKRKKDLTQTASSTARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RRLVRKRKKDLTQTASSTARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKM
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 APSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKSLEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKSLEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYH
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 LRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNPTWDQTIIFDEVEIYGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNPTWDQTIIFDEVEIYGE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 PQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGKDEFLGRSIFSPVVKLNSEMDITPKLLWHPVMNGDKAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGKDEFLGRSIFSPVVKLNSEMDITPKLLWHPVMNGDKAC
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 GDVLVTAELILRGKDGSNLPILPPQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GDVLVTAELILRGKDGSNLPILPPQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNFQ
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 MASITSPSLVVECGGERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MASITSPSLVVECGGERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDH
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 RQFGRKPVVGQCTIERLDRFRCDPYAGKEDIVPQLKASLLSAPPCRDIVIEMEDTKPLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RQFGRKPVVGQCTIERLDRFRCDPYAGKEDIVPQLKASLLSAPPCRDIVIEMEDTKPLLA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480
pF1KA1 SK-------------------LTEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKIY
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SKCLSSMSTALSKMASPATVHLTEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKIY
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KA1 NCELENVAEFEGLTDFSDTFKLYRGKSDENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDPSVPAPPRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NCELENVAEFEGLTDFSDTFKLYRGKSDENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDPSVPAPPRQ
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1550 1560 1570 1580 1590 1600
pF1KA1 FRELPDSVPQECTVRIYIVRGLELQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHYIPNTLNPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FRELPDSVPQECTVRIYIVRGLELQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHYIPNTLNPV
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1610 1620 1630 1640 1650 1660
pF1KA1 FGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTFTRDEKVGETIIDLENRFLSRFGSHCGIPEEYCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTFTRDEKVGETIIDLENRFLSRFGSHCGIPEEYCV
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1670 1680 1690 1700 1710 1720
pF1KA1 SGVNTWRDQLRPTQLLQNVARFKGFPQPILSEDGSRIRYGGRDYSLDEFEANKILHQHLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SGVNTWRDQLRPTQLLQNVARFKGFPQPILSEDGSRIRYGGRDYSLDEFEANKILHQHLG
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1730 1740 1750 1760 1770 1780
pF1KA1 APEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGPPFNIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQPYEEFQEMTE
1750 1760 1770 1780
1790 1800 1810 1820 1830 1840
pF1KA1 PRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLDGE
>>XP_005269750 (OMIM: 604603) PREDICTED: myoferlin isofo (2080 aa)
initn: 13970 init1: 9698 opt: 9722 Z-score: 9715.5 bits: 1811.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 13936; 99.1% identity (99.1% similar) in 2080 aa overlap (1-2061:1-2080)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLRVIVESASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MLRVIVESASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 FSSSLGIIVKDFETIGQNKLIGTATVALKDLTGDQSRSLPYKLISLLNEKGQDTGATIDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FSSSLGIIVKDFETIGQNKLIGTATVALKDLTGDQSRSLPYKLISLLNEKGQDTGATIDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 VIGYDPPSAPHPNDLSGPSVPGMGGDGEEDEGDEDRLDNAVRGPGPKGPVGTVSEAQLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VIGYDPPSAPHPNDLSGPSVPGMGGDGEEDEGDEDRLDNAVRGPGPKGPVGTVSEAQLAR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 RLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVHVCGQTHRTRIKRGNNPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVHVCGQTHRTRIKRGNNPF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 FDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVMRKWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVMRKWL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 WNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVEDFSSSGTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVEDFSSSGTG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 AASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPDPYDELNTGKGEGVAYRGRILVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPDPYDELNTGKGEGVAYRGRILVE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEAIQFEVSIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEAIQFEVSIG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 NYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LAMAERLQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGKANVTVLDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LAMAERLQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGKANVTVLDT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 QIRKLRSRSLSQIHEAAVRMRSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QIRKLRSRSLSQIHEAAVRMRSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 RGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQTIFLKYPQEKNNGPKVPVELRVNIWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQTIFLKYPQEKNNGPKVPVELRVNIWL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 GLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALMFGKWGTSGLVGRHKFSDVTGKIKLKREFFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALMFGKWGTSGLVGRHKFSDVTGKIKLKREFFL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 PPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDTYTDANGDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDTYTDANGDK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 AASPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAEKMYHTHRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AASPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAEKMYHTHRR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 RRLVRKRKKDLTQTASSTARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RRLVRKRKKDLTQTASSTARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKM
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 APSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKSLEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 APSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKSLEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYH
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 LRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNPTWDQTIIFDEVEIYGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNPTWDQTIIFDEVEIYGE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 PQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGKDEFLGRSIFSPVVKLNSEMDITPKLLWHPVMNGDKAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGKDEFLGRSIFSPVVKLNSEMDITPKLLWHPVMNGDKAC
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 GDVLVTAELILRGKDGSNLPILPPQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GDVLVTAELILRGKDGSNLPILPPQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNFQ
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 MASITSPSLVVECGGERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MASITSPSLVVECGGERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDH
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 RQFGRKPVVGQCTIERLDRFRCDPYAGKEDIVPQLKASLLSAPPCRDIVIEMEDTKPLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RQFGRKPVVGQCTIERLDRFRCDPYAGKEDIVPQLKASLLSAPPCRDIVIEMEDTKPLLA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480
pF1KA1 SK-------------------LTEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKIY
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SKCLSSMSTALSKMASPATVHLTEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKIY
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KA1 NCELENVAEFEGLTDFSDTFKLYRGKSDENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDPSVPAPPRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NCELENVAEFEGLTDFSDTFKLYRGKSDENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDPSVPAPPRQ
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1550 1560 1570 1580 1590 1600
pF1KA1 FRELPDSVPQECTVRIYIVRGLELQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHYIPNTLNPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FRELPDSVPQECTVRIYIVRGLELQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHYIPNTLNPV
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1610 1620 1630 1640 1650 1660
pF1KA1 FGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTFTRDEKVGETIIDLENRFLSRFGSHCGIPEEYCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTFTRDEKVGETIIDLENRFLSRFGSHCGIPEEYCV
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1670 1680 1690 1700 1710 1720
pF1KA1 SGVNTWRDQLRPTQLLQNVARFKGFPQPILSEDGSRIRYGGRDYSLDEFEANKILHQHLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SGVNTWRDQLRPTQLLQNVARFKGFPQPILSEDGSRIRYGGRDYSLDEFEANKILHQHLG
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1730 1740 1750 1760 1770 1780
pF1KA1 APEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGPPFNIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 APEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGPPFNIT
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1790 1800 1810 1820 1830 1840
pF1KA1 PRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLDGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLDGE
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1850 1860 1870 1880 1890 1900
pF1KA1 GNFNWRFVFPFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GNFNWRFVFPFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGF
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1910 1920 1930 1940 1950 1960
pF1KA1 LELDLRHTIIPAKSPEKCRLDMIPDLKAMNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCYAEKDGARV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LELDLRHTIIPAKSPEKCRLDMIPDLKAMNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCYAEKDGARV
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1970 1980 1990 2000 2010 2020
pF1KA1 MAGKVEMTLEILNEKEADERPAGKGRDEPNMNPKLDLPNRPETSFLWFTNPCKTMKFIVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MAGKVEMTLEILNEKEADERPAGKGRDEPNMNPKLDLPNRPETSFLWFTNPCKTMKFIVW
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2030 2040 2050 2060
pF1KA1 RRFKWVIIGLLFLLILLLFVAVLLYSLPNYLSMKIVKPNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RRFKWVIIGLLFLLILLLFVAVLLYSLPNYLSMKIVKPNV
2050 2060 2070 2080
>>XP_011537934 (OMIM: 604603) PREDICTED: myoferlin isofo (2062 aa)
initn: 13787 init1: 9515 opt: 9539 Z-score: 9532.5 bits: 1777.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 13753; 99.1% identity (99.1% similar) in 2051 aa overlap (30-2061:12-2062)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLRVIVESASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLD
:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MILPNSPPNRTDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLD
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 FSSSLGIIVKDFETIGQNKLIGTATVALKDLTGDQSRSLPYKLISLLNEKGQDTGATIDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FSSSLGIIVKDFETIGQNKLIGTATVALKDLTGDQSRSLPYKLISLLNEKGQDTGATIDL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 VIGYDPPSAPHPNDLSGPSVPGMGGDGEEDEGDEDRLDNAVRGPGPKGPVGTVSEAQLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VIGYDPPSAPHPNDLSGPSVPGMGGDGEEDEGDEDRLDNAVRGPGPKGPVGTVSEAQLAR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 RLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVHVCGQTHRTRIKRGNNPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVHVCGQTHRTRIKRGNNPF
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 FDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVMRKWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVMRKWL
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTF
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPE
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 WNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVEDFSSSGTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVEDFSSSGTG
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 AASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPDPYDELNTGKGEGVAYRGRILVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPDPYDELNTGKGEGVAYRGRILVE
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEAIQFEVSIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEAIQFEVSIG
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 NYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTL
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LAMAERLQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGKANVTVLDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LAMAERLQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGKANVTVLDT
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 QIRKLRSRSLSQIHEAAVRMRSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QIRKLRSRSLSQIHEAAVRMRSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMI
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 RGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQTIFLKYPQEKNNGPKVPVELRVNIWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQTIFLKYPQEKNNGPKVPVELRVNIWL
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 GLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALMFGKWGTSGLVGRHKFSDVTGKIKLKREFFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALMFGKWGTSGLVGRHKFSDVTGKIKLKREFFL
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 PPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDTYTDANGDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDTYTDANGDK
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 AASPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAEKMYHTHRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AASPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAEKMYHTHRR
950 960 970 980 990 1000
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 RRLVRKRKKDLTQTASSTARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RRLVRKRKKDLTQTASSTARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKM
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 APSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKSLEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKSLEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYH
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 LRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNPTWDQTIIFDEVEIYGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNPTWDQTIIFDEVEIYGE
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 PQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGKDEFLGRSIFSPVVKLNSEMDITPKLLWHPVMNGDKAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGKDEFLGRSIFSPVVKLNSEMDITPKLLWHPVMNGDKAC
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 GDVLVTAELILRGKDGSNLPILPPQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GDVLVTAELILRGKDGSNLPILPPQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNFQ
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 MASITSPSLVVECGGERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MASITSPSLVVECGGERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDH
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 RQFGRKPVVGQCTIERLDRFRCDPYAGKEDIVPQLKASLLSAPPCRDIVIEMEDTKPLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RQFGRKPVVGQCTIERLDRFRCDPYAGKEDIVPQLKASLLSAPPCRDIVIEMEDTKPLLA
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1450 1460 1470 1480
pF1KA1 SK-------------------LTEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKIY
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SKCLSSMSTALSKMASPATVHLTEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKIY
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KA1 NCELENVAEFEGLTDFSDTFKLYRGKSDENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDPSVPAPPRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NCELENVAEFEGLTDFSDTFKLYRGKSDENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDPSVPAPPRQ
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1550 1560 1570 1580 1590 1600
pF1KA1 FRELPDSVPQECTVRIYIVRGLELQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHYIPNTLNPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FRELPDSVPQECTVRIYIVRGLELQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHYIPNTLNPV
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1610 1620 1630 1640 1650 1660
pF1KA1 FGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTFTRDEKVGETIIDLENRFLSRFGSHCGIPEEYCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTFTRDEKVGETIIDLENRFLSRFGSHCGIPEEYCV
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1670 1680 1690 1700 1710 1720
pF1KA1 SGVNTWRDQLRPTQLLQNVARFKGFPQPILSEDGSRIRYGGRDYSLDEFEANKILHQHLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SGVNTWRDQLRPTQLLQNVARFKGFPQPILSEDGSRIRYGGRDYSLDEFEANKILHQHLG
1670 1680 1690 1700 1710 1720
1730 1740 1750 1760 1770 1780
pF1KA1 APEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGPPFNIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGPPFNIT
1730 1740 1750 1760 1770 1780
1790 1800 1810 1820 1830 1840
pF1KA1 PRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLDGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLDGE
1790 1800 1810 1820 1830 1840
1850 1860 1870 1880 1890 1900
pF1KA1 GNFNWRFVFPFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GNFNWRFVFPFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGF
1850 1860 1870 1880 1890 1900
1910 1920 1930 1940 1950 1960
pF1KA1 LELDLRHTIIPAKSPEKCRLDMIPDLKAMNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCYAEKDGARV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LELDLRHTIIPAKSPEKCRLDMIPDLKAMNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCYAEKDGARV
1910 1920 1930 1940 1950 1960
1970 1980 1990 2000 2010 2020
pF1KA1 MAGKVEMTLEILNEKEADERPAGKGRDEPNMNPKLDLPNRPETSFLWFTNPCKTMKFIVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MAGKVEMTLEILNEKEADERPAGKGRDEPNMNPKLDLPNRPETSFLWFTNPCKTMKFIVW
1970 1980 1990 2000 2010 2020
2030 2040 2050 2060
pF1KA1 RRFKWVIIGLLFLLILLLFVAVLLYSLPNYLSMKIVKPNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RRFKWVIIGLLFLLILLLFVAVLLYSLPNYLSMKIVKPNV
2030 2040 2050 2060
>>XP_016871557 (OMIM: 604603) PREDICTED: myoferlin isofo (1938 aa)
initn: 13046 init1: 8774 opt: 8798 Z-score: 8791.9 bits: 1640.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 13012; 99.0% identity (99.0% similar) in 1938 aa overlap (143-2061:1-1938)
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 DTGATIDLVIGYDPPSAPHPNDLSGPSVPGMGGDGEEDEGDEDRLDNAVRGPGPKGPVGT
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MGGDGEEDEGDEDRLDNAVRGPGPKGPVGT
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 VSEAQLARRLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVHVCGQTHRTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VSEAQLARRLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVHVCGQTHRTR
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 IKRGNNPFFDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IKRGNNPFFDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPG
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 HAVMRKWLLLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HAVMRKWLLLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAG
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 IALRWVTFLLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IALRWVTFLLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNI
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 IEKNANPEWNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IEKNANPEWNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVE
280 290 300 310 320 330
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 DFSSSGTGAASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPDPYDELNTGKGEGVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DFSSSGTGAASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPDPYDELNTGKGEGVA
340 350 360 370 380 390
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 YRGRILVELATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YRGRILVELATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEA
400 410 420 430 440 450
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 IQFEVSIGNYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IQFEVSIGNYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISH
460 470 480 490 500 510
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 RLDAVNTLLAMAERLQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RLDAVNTLLAMAERLQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGK
520 530 540 550 560 570
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 ANVTVLDTQIRKLRSRSLSQIHEAAVRMRSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ANVTVLDTQIRKLRSRSLSQIHEAAVRMRSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSM
580 590 600 610 620 630
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 PDIIIWMIRGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQTIFLKYPQEKNNGPKVPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PDIIIWMIRGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQTIFLKYPQEKNNGPKVPV
640 650 660 670 680 690
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 ELRVNIWLGLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALMFGKWGTSGLVGRHKFSDVTGKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ELRVNIWLGLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALMFGKWGTSGLVGRHKFSDVTGKI
700 710 720 730 740 750
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 KLKREFFLPPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLKREFFLPPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDT
760 770 780 790 800 810
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 YTDANGDKAASPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YTDANGDKAASPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAE
820 830 840 850 860 870
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 KMYHTHRRRRLVRKRKKDLTQTASSTARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KMYHTHRRRRLVRKRKKDLTQTASSTARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFR
880 890 900 910 920 930
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA1 RRRWRRKMAPSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKSLEKQKHSATTVFGANTPIVSCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RRRWRRKMAPSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKSLEKQKHSATTVFGANTPIVSCN
940 950 960 970 980 990
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA1 FDRVYIYHLRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNPTWDQTIIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FDRVYIYHLRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNPTWDQTIIF
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA1 DEVEIYGEPQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGKDEFLGRSIFSPVVKLNSEMDITPKLLWHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DEVEIYGEPQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGKDEFLGRSIFSPVVKLNSEMDITPKLLWHP
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA1 VMNGDKACGDVLVTAELILRGKDGSNLPILPPQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VMNGDKACGDVLVTAELILRGKDGSNLPILPPQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWG
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA1 LRNMKNFQMASITSPSLVVECGGERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LRNMKNFQMASITSPSLVVECGGERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPP
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA1 LVIKVIDHRQFGRKPVVGQCTIERLDRFRCDPYAGKEDIVPQLKASLLSAPPCRDIVIEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LVIKVIDHRQFGRKPVVGQCTIERLDRFRCDPYAGKEDIVPQLKASLLSAPPCRDIVIEM
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1440 1450 1460 1470
pF1KA1 EDTKPLLASK-------------------LTEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQK
:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EDTKPLLASKCLSSMSTALSKMASPATVHLTEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQK
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KA1 GYSKLKIYNCELENVAEFEGLTDFSDTFKLYRGKSDENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GYSKLKIYNCELENVAEFEGLTDFSDTFKLYRGKSDENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDP
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KA1 SVPAPPRQFRELPDSVPQECTVRIYIVRGLELQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SVPAPPRQFRELPDSVPQECTVRIYIVRGLELQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHY
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KA1 IPNTLNPVFGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTFTRDEKVGETIIDLENRFLSRFGSHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IPNTLNPVFGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTFTRDEKVGETIIDLENRFLSRFGSHC
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KA1 GIPEEYCVSGVNTWRDQLRPTQLLQNVARFKGFPQPILSEDGSRIRYGGRDYSLDEFEAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GIPEEYCVSGVNTWRDQLRPTQLLQNVARFKGFPQPILSEDGSRIRYGGRDYSLDEFEAN
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1720 1730 1740 1750 1760 1770
pF1KA1 KILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGP
1600 1610 1620 1630 1640 1650
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KA1 PGPPFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGPPFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDV
1660 1670 1680 1690 1700 1710
1840 1850 1860 1870 1880 1890
pF1KA1 HYRSLDGEGNFNWRFVFPFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HYRSLDGEGNFNWRFVFPFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKF
1720 1730 1740 1750 1760 1770
1900 1910 1920 1930 1940 1950
pF1KA1 SLDDYLGFLELDLRHTIIPAKSPEKCRLDMIPDLKAMNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLDDYLGFLELDLRHTIIPAKSPEKCRLDMIPDLKAMNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCY
1780 1790 1800 1810 1820 1830
1960 1970 1980 1990 2000 2010
pF1KA1 AEKDGARVMAGKVEMTLEILNEKEADERPAGKGRDEPNMNPKLDLPNRPETSFLWFTNPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AEKDGARVMAGKVEMTLEILNEKEADERPAGKGRDEPNMNPKLDLPNRPETSFLWFTNPC
1840 1850 1860 1870 1880 1890
2020 2030 2040 2050 2060
pF1KA1 KTMKFIVWRRFKWVIIGLLFLLILLLFVAVLLYSLPNYLSMKIVKPNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KTMKFIVWRRFKWVIIGLLFLLILLLFVAVLLYSLPNYLSMKIVKPNV
1900 1910 1920 1930
>>XP_016871558 (OMIM: 604603) PREDICTED: myoferlin isofo (1938 aa)
initn: 13046 init1: 8774 opt: 8798 Z-score: 8791.9 bits: 1640.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 13012; 99.0% identity (99.0% similar) in 1938 aa overlap (143-2061:1-1938)
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 DTGATIDLVIGYDPPSAPHPNDLSGPSVPGMGGDGEEDEGDEDRLDNAVRGPGPKGPVGT
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MGGDGEEDEGDEDRLDNAVRGPGPKGPVGT
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 VSEAQLARRLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVHVCGQTHRTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VSEAQLARRLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVHVCGQTHRTR
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 IKRGNNPFFDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IKRGNNPFFDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPG
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 HAVMRKWLLLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HAVMRKWLLLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAG
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 IALRWVTFLLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IALRWVTFLLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNI
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 IEKNANPEWNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IEKNANPEWNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVE
280 290 300 310 320 330
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 DFSSSGTGAASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPDPYDELNTGKGEGVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DFSSSGTGAASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPDPYDELNTGKGEGVA
340 350 360 370 380 390
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 YRGRILVELATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YRGRILVELATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEA
400 410 420 430 440 450
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 IQFEVSIGNYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IQFEVSIGNYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISH
460 470 480 490 500 510
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 RLDAVNTLLAMAERLQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RLDAVNTLLAMAERLQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGK
520 530 540 550 560 570
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 ANVTVLDTQIRKLRSRSLSQIHEAAVRMRSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ANVTVLDTQIRKLRSRSLSQIHEAAVRMRSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSM
580 590 600 610 620 630
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 PDIIIWMIRGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQTIFLKYPQEKNNGPKVPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PDIIIWMIRGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQTIFLKYPQEKNNGPKVPV
640 650 660 670 680 690
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 ELRVNIWLGLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALMFGKWGTSGLVGRHKFSDVTGKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ELRVNIWLGLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALMFGKWGTSGLVGRHKFSDVTGKI
700 710 720 730 740 750
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 KLKREFFLPPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLKREFFLPPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDT
760 770 780 790 800 810
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 YTDANGDKAASPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YTDANGDKAASPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAE
820 830 840 850 860 870
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 KMYHTHRRRRLVRKRKKDLTQTASSTARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KMYHTHRRRRLVRKRKKDLTQTASSTARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFR
880 890 900 910 920 930
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA1 RRRWRRKMAPSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKSLEKQKHSATTVFGANTPIVSCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RRRWRRKMAPSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKSLEKQKHSATTVFGANTPIVSCN
940 950 960 970 980 990
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA1 FDRVYIYHLRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNPTWDQTIIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FDRVYIYHLRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNPTWDQTIIF
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA1 DEVEIYGEPQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGKDEFLGRSIFSPVVKLNSEMDITPKLLWHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DEVEIYGEPQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGKDEFLGRSIFSPVVKLNSEMDITPKLLWHP
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KA1 VMNGDKACGDVLVTAELILRGKDGSNLPILPPQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VMNGDKACGDVLVTAELILRGKDGSNLPILPPQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWG
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KA1 LRNMKNFQMASITSPSLVVECGGERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LRNMKNFQMASITSPSLVVECGGERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPP
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KA1 LVIKVIDHRQFGRKPVVGQCTIERLDRFRCDPYAGKEDIVPQLKASLLSAPPCRDIVIEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LVIKVIDHRQFGRKPVVGQCTIERLDRFRCDPYAGKEDIVPQLKASLLSAPPCRDIVIEM
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1440 1450 1460 1470
pF1KA1 EDTKPLLASK-------------------LTEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQK
:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EDTKPLLASKCLSSMSTALSKMASPATVHLTEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQK
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KA1 GYSKLKIYNCELENVAEFEGLTDFSDTFKLYRGKSDENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GYSKLKIYNCELENVAEFEGLTDFSDTFKLYRGKSDENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDP
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KA1 SVPAPPRQFRELPDSVPQECTVRIYIVRGLELQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SVPAPPRQFRELPDSVPQECTVRIYIVRGLELQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHY
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KA1 IPNTLNPVFGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTFTRDEKVGETIIDLENRFLSRFGSHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IPNTLNPVFGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTFTRDEKVGETIIDLENRFLSRFGSHC
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KA1 GIPEEYCVSGVNTWRDQLRPTQLLQNVARFKGFPQPILSEDGSRIRYGGRDYSLDEFEAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GIPEEYCVSGVNTWRDQLRPTQLLQNVARFKGFPQPILSEDGSRIRYGGRDYSLDEFEAN
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1720 1730 1740 1750 1760 1770
pF1KA1 KILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGP
1600 1610 1620 1630 1640 1650
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KA1 PGPPFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGPPFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDV
1660 1670 1680 1690 1700 1710
1840 1850 1860 1870 1880 1890
pF1KA1 HYRSLDGEGNFNWRFVFPFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HYRSLDGEGNFNWRFVFPFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKF
1720 1730 1740 1750 1760 1770
1900 1910 1920 1930 1940 1950
pF1KA1 SLDDYLGFLELDLRHTIIPAKSPEKCRLDMIPDLKAMNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLDDYLGFLELDLRHTIIPAKSPEKCRLDMIPDLKAMNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCY
1780 1790 1800 1810 1820 1830
1960 1970 1980 1990 2000 2010
pF1KA1 AEKDGARVMAGKVEMTLEILNEKEADERPAGKGRDEPNMNPKLDLPNRPETSFLWFTNPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AEKDGARVMAGKVEMTLEILNEKEADERPAGKGRDEPNMNPKLDLPNRPETSFLWFTNPC
1840 1850 1860 1870 1880 1890
2020 2030 2040 2050 2060
pF1KA1 KTMKFIVWRRFKWVIIGLLFLLILLLFVAVLLYSLPNYLSMKIVKPNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KTMKFIVWRRFKWVIIGLLFLLILLLFVAVLLYSLPNYLSMKIVKPNV
1900 1910 1920 1930
>>NP_003485 (OMIM: 253601,254130,603009,606768) dysferli (2080 aa)
initn: 5938 init1: 1288 opt: 7010 Z-score: 7003.2 bits: 1309.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8106; 56.2% identity (78.5% similar) in 2109 aa overlap (1-2059:1-2078)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLRVIVESASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLD
::::.. : :. : :..: ::.:: . : .:::::: .:.::.:::::
NP_003 MLRVFILYAENVHTPDTDISDAYCSAVFAGVKKRTKVIKNSVNPVWNEGFEWDLKGIPLD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 FSSSLGIIVKDFETIGQNKLIGTATVALKDLTGDQSRSLPYKLISLLNEKGQDTGATIDL
.: : ..::: ::.:.:...: : : :... . : : .. ::. : : :::.. :
NP_003 QGSELHVVVKDHETMGRNRFLGEAKVPLREVLATPSLSASFN-APLLDTKKQPTGASLVL
70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KA1 VIGYDP-PSA----PHPNDLS-GPSVPGMG--GD--GEEDE------GDEDR--LDNAVR
..: : :.: : :. : .:..: . .: :::: ::: . ::..
NP_003 QVSYTPLPGAVPLFPPPTPLEPSPTLPDLDVVADTGGEEDTEDQGLTGDEAEPFLDQS-G
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KA1 GPG-PKGPVGTVSEAQL----ARRLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIR
::: : : :. .: .. .::..::.:::::::::.::::::: : ::.
NP_003 GPGAPTTPRKLPSRPPPHYPGIKRKRSAPTSRKLLSDKPQDFQIRVQVIEGRQLPGVNIK
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 PVVKVHVCGQTHRTRIKRGNNPFFDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLM
::::: . :::.::::..::.:.:.: .:.:. .:.::.:: : : : .:.:::.: :.
NP_003 PVVKVTAAGQTKRTRIHKGNSPLFNETLFFNLFDSPGELFDEPIFITVVDSRSLRTDALL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 GEFKIDVGFVYDEPGHAVMRKWLLLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRD
:::..::: .: :: :: .::::::.::.: :.:..::.:.:. ::: ::: : ::.: .
NP_003 GEFRMDVGTIYREPRHAYLRKWLLLSDPDDFSAGARGYLKTSLCVLGPGDEAPLERKDPS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 NDSDDVESNLLLPAGIALRWVTFLLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDP
.:..:.::::: :.:.::: . : ::..::::.:::::: ..::.::: ...:::::::
NP_003 EDKEDIESNLLRPTGVALRGAHFCLKVFRAEDLPQMDDAVMDNVKQIFGFESNKKNLVDP
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 FVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPEWNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTT
::::::::: .:..:.::.:::.::: ..: :::.:::... : ::::::.::.:.::
NP_003 FVEVSFAGKMLCSKILEKTANPQWNQNITLPAMFPSMCEKMRIRIIDWDRLTHNDIVATT
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 YLHLSKIAASGGEVEDFSSSGTGAASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFP
:: .:::.: :::.:. .:. : . . . .::.:::::::.::::::::.::::
NP_003 YLSMSKISAPGGEIEE-EPAGAVKPSKASDL-DDYLGFLPTFGPCYINLYGSPREFTGFP
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 DPYDELNTGKGEGVAYRGRILVELATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLS
::: :::::::::::::::.:. : : : . ..:.: . ::.: :::: :::::::
NP_003 DPYTELNTGKGEGVAYRGRLLLSLETKLVEHS-EQKVEDLPADDILRVEKYLRRRKYSLF
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 AVFHSATMLQDVGEAIQFEVSIGNYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHT
:.:.:::::::: .:::::::::::::::: :: ::::::::::::::: .::::::...
NP_003 AAFYSATMLQDVDDAIQFEVSIGNYGNKFDMTCLPLASTTQYSRAVFDGCHYYYLPWGNV
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 KPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTLLAMAERLQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDE
::::.:.:::::::::... : ::..:.::....: .. ..... .... : .: ::
NP_003 KPVVVLSSYWEDISHRIETQNQLLGIADRLEAGLEQVHLALKAQCSTEDVDSLVAQLTDE
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 VIEDTRYTLPLTEGKANVTVLDTQIRKLRSRSLSQIHEAAVRMRSEATDVKSTLAEIEDW
.: : . ..: :: . .::.. :::: :::. .. ... ..: . :::
NP_003 LIAGCSQPLGDIHETPSATHLDQYLYQLRTHHLSQITEAALALKLGHSELPAALEQAEDW
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 LDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMIRGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQTIF
: .: :.::::::.:::.:::..:.::.:: :.::::::.: : : :: ::: ::::
NP_003 LLRLRALAEEPQNSLPDIVIWMLQGDKRVAYQRVPAHQVLFSRRGANYCGKNCGKLQTIF
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 LKYPQEKNNGPKVPVELRVNIWLGLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQA--LMFGKWG
::::.:: : ..::..::..:.:::. ::.::.:::: ..:::: :::.. . :.::
NP_003 LKYPMEKVPGARMPVQIRVKLWFGLSVDEKEFNQFAEGKLSVFAETYENETKLALVGNWG
840 850 860 870 880 890
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 TSGLVGRHKFSDVTGKIKLKREFFLPPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVY
:.::. ::::::::::: .. : : :: : :.:.: ::..:: . :::: :..::.
NP_003 TTGLT-YPKFSDVTGKIKLPKDSFRPSAGWTWAGDWFVCPEKTLLHDMDAGHLSFVEEVF
900 910 920 930 940 950
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 QNESRYPGGDWKPAEDTYTDANGDKAASPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEY
.:..: :::.: :.:::.::.:. ... :: ::.:::. :: :.::::::.::::
NP_003 ENQTRLPGGQWIYMSDNYTDVNGEKVLPKDDIECPLGWKWEDEEWSTDLNRAVDEQGWEY
960 970 980 990 1000 1010
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 GITIPPDHKPKSWVAAEKMYHTHRRRRLVRKRKKDLTQTASSTARAMEELQDQEGWEYAS
.:::::..::: :: :::::.:::::: :: :..::.: . : . . :::::::
NP_003 SITIPPERKPKHWVPAEKMYYTHRRRRWVRLRRRDLSQMEA-LKRHRQAEAEGEGWEYAS
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 LIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKMAPSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKSLEKQK
:.::::: . :..:.::::::::.: : : : ::.: ::::::. . .: .: :.
NP_003 LFGWKFHLEYRKTDAFRRRRWRRRMEPLEKTGPAAVFALEGALGG-VMDDKSEDSMS---
1080 1090 1100 1110 1120
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 HSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYHLRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTT
.: ::.: : .:: :: ::::::.::::.: :.:::::::::: . :::.:. :
NP_003 -VSTLSFGVNRPTISCIFDYGNRYHLRCYMYQARDLAAMDKDSFSDPYAIVSFLHQSQKT
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 EIIHSTLNPTWDQTIIFDEVEIYGEPQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGKDEFLGRSIFSPV
....:::::::::.:: :.::.::: :: ..::....::.:.: : :::.:: : .:
NP_003 VVVKNTLNPTWDQTLIFYEIEIFGEPATVAEQPPSIVVELYDHDTYGADEFMGRCICQP-
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1240 1250 1260 1270
pF1KA1 VKLNSEMDITPKLLWHPVMNGDKACGDVLVTAELILRGK---------------------
.. :.: : :. :.. :..:.. ::: : :
NP_003 -----SLERMPRLAWFPLTRGSQPSGELLASFELIQREKPAIHHIPGFEVQETSRILDES
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KA1 DGSNLPILPPQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNFQMASITSPSLVVECG
. ..:: :::: :.:::::.:.:..: ::::::::::::::..:.:.:.:::::::::
NP_003 EDTDLPYPPPQREANIYMVPQNIKPALQRTAIEILAWGLRNMKSYQLANISSPSLVVECG
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KA1 GERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDHRQFGRKPVVGQCTI
:. :.: ::.::.:.::: .:::.:.::.:::: ::...::::.:::::.::::::::
NP_003 GQTVQSCVIRNLRKNPNFDICTLFMEVMLPREELYCPPITVKVIDNRQFGRRPVVGQCTI
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KA1 ERLDRFRCDPYAGKEDIVPQL---KASLLSAPPCRDIVIEMEDTKPLLASKLTEKEEEIV
. :. : ::::.. :. :: .:::: : .:..:...: .::. . :::..
NP_003 RSLESFLCDPYSA-ESPSPQGGPDDVSLLS--PGEDVLIDIDDKEPLIPIQ----EEEFI
1430 1440 1450 1460 1470
1460 1470 1480 1490 1500 1510
pF1KA1 DWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKIYNCELENVAEFEGLTDFSDTFKLYRGKS-DE
::::::.:: ::.::::.:..: .. ::.:. .:::: ::::.:: .::::::::. .:
NP_003 DWWSKFFASIGEREKCGSYLEKDFDTLKVYDTQLENVEAFEGLSDFCNTFKLYRGKTQEE
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1520 1530 1540 1550 1560 1570
pF1KA1 NEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDPSVPAPPRQFRELPDSVPQECTVRIYIVRGLELQPQDN
.:::::.::::: :.:::::.::..: :::::..: . :::: :::::::.. :::.:
NP_003 TEDPSVIGEFKGLFKIYPLPEDPAIPMPPRQFHQLAAQGPQECLVRIYIVRAFGLQPKDP
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1580 1590 1600 1610 1620 1630
pF1KA1 NGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHYIPNTLNPVFGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTFTR
:: :::::::..::: . :.:.::: ::.::::.:.::.: :: ::::::..:::: ...
NP_003 NGKCDPYIKISIGKKSVSDQDNYIPCTLEPVFGKMFELTCTLPLEKDLKITLYDYDLLSK
1600 1610 1620 1630 1640 1650
1640 1650 1660 1670 1680 1690
pF1KA1 DEKVGETIIDLENRFLSRFGSHCGIPEEYCVSGVNTWRDQLRPTQLLQNVARFKGFPQPI
:::.:::..:::::.::.::..::.:. ::::: : :::::::.:::. . . :.
NP_003 DEKIGETVVDLENRLLSKFGARCGLPQTYCVSGPNQWRDQLRPSQLLHLFCQQHRVKAPV
1660 1670 1680 1690 1700 1710
1700 1710 1720 1730 1740 1750
pF1KA1 LSEDGSRIRYGGRDYSLDEFEANKILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHST
: :. . ..::..:.::..: . ::: :::::::.:. :::::::::.: :.:
NP_003 YRTD--RVMFQDKEYSIEEIEAGRIPNPHLGPVEERLALHVLQQQGLVPEHVESRPLYSP
1720 1730 1740 1750 1760 1770
1760 1770 1780 1790 1800 1810
pF1KA1 FQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGPPFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGE
.::.: :::::::::.:::.:: ::::::::::.:....:: :::::.:::::. :.:::
NP_003 LQPDIEQGKLQMWVDLFPKALGRPGPPFNITPRRARRFFLRCIIWNTRDVILDDLSLTGE
1780 1790 1800 1810 1820 1830
1820 1830 1840 1850 1860 1870
pF1KA1 EMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLDGEGNFNWRFVFPFDYLPAEQLCIVAKKEHFW
.:::::::::. : ::.::::::::::: :::::::::.::::::::::.: .:::. ::
NP_003 KMSDIYVKGWMIGFEEHKQKTDVHYRSLGGEGNFNWRFIFPFDYLPAEQVCTIAKKDAFW
1840 1850 1860 1870 1880 1890
1880 1890 1900 1910 1920 1930
pF1KA1 SIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGFLELDLRHTIIPAKSPEKCRLDMIPDLKAM
.:.:: .:: :...:::::::::.::.:: :.::: . :::. .:: ::.. : :.
NP_003 RLDKTESKIPARVVFQIWDNDKFSFDDFLGSLQLDLNRMPKPAKTAKKCSLDQLDD--AF
1900 1910 1920 1930 1940 1950
1940 1950 1960 1970 1980 1990
pF1KA1 NPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCYAEKDGARVMAGKVEMTLEILNEKEADERPAGKGRDEP
.: .::::::..:::::: ::. ...:::.::::::. :.: .:::::.:::::
NP_003 HP--EWFVSLFEQKTVKGWWPCVAEEGEKKILAGKLEMTLEIVAESEHEERPAGQGRDEP
1960 1970 1980 1990 2000
2000 2010 2020 2030 2040 2050
pF1KA1 NMNPKLDLPNRPETSFLWFTNPCKTMKFIVWRRFKWVIIGLLFLLILLLFVAVLLYSLPN
::::::. : ::.:::::::.: ::::::.::::.:.:: ...:.:::::.:...:..::
NP_003 NMNPKLEDPRRPDTSFLWFTSPYKTMKFILWRRFRWAIILFIILFILLLFLAIFIYAFPN
2010 2020 2030 2040 2050 2060
2060
pF1KA1 YLSMKIVKPNV
: .::.:::
NP_003 YAAMKLVKPFS
2070 2080
>>NP_001123927 (OMIM: 253601,254130,603009,606768) dysfe (2081 aa)
initn: 5929 init1: 1288 opt: 7010 Z-score: 7003.2 bits: 1309.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8123; 56.3% identity (78.8% similar) in 2110 aa overlap (1-2059:1-2079)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MLRVIVESASNIPKTKFGK-PDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPL
:: .. :::.:..: . ::..:. :. ::.:: . : .:::::: .:.::.::::
NP_001 MLCCLLVRASNLPSAKKDRRSDPVASLTFRGVKKRTKVIKNSVNPVWNEGFEWDLKGIPL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 DFSSSLGIIVKDFETIGQNKLIGTATVALKDLTGDQSRSLPYKLISLLNEKGQDTGATID
: .: : ..::: ::.:.:...: : : :... . : : .. ::. : : :::..
NP_001 DQGSELHVVVKDHETMGRNRFLGEAKVPLREVLATPSLSASFN-APLLDTKKQPTGASLV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KA1 LVIGYDP-PSA----PHPNDLS-GPSVPGMG--GD--GEEDE------GDEDR--LDNAV
: ..: : :.: : :. : .:..: . .: :::: ::: . ::..
NP_001 LQVSYTPLPGAVPLFPPPTPLEPSPTLPDLDVVADTGGEEDTEDQGLTGDEAEPFLDQS-
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KA1 RGPG-PKGPVGTVSEAQL----ARRLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNI
::: : : :. .: .. .::..::.:::::::::.::::::: : ::
NP_001 GGPGAPTTPRKLPSRPPPHYPGIKRKRSAPTSRKLLSDKPQDFQIRVQVIEGRQLPGVNI
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 RPVVKVHVCGQTHRTRIKRGNNPFFDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCL
.::::: . :::.::::..::.:.:.: .:.:. .:.::.:: : : : .:.:::.: :
NP_001 KPVVKVTAAGQTKRTRIHKGNSPLFNETLFFNLFDSPGELFDEPIFITVVDSRSLRTDAL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 MGEFKIDVGFVYDEPGHAVMRKWLLLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDR
.:::..::: .: :: :: .::::::.::.: :.:..::.:.:. ::: ::: : ::.:
NP_001 LGEFRMDVGTIYREPRHAYLRKWLLLSDPDDFSAGARGYLKTSLCVLGPGDEAPLERKDP
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 DNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTFLLKIYRAEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVD
..:..:.::::: :.:.::: . : ::..::::.:::::: ..::.::: ...::::::
NP_001 SEDKEDIESNLLRPTGVALRGAHFCLKVFRAEDLPQMDDAVMDNVKQIFGFESNKKNLVD
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 PFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPEWNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGT
:::::::::: .:..:.::.:::.::: ..: :::.:::... : ::::::.::.:.:
NP_001 PFVEVSFAGKMLCSKILEKTANPQWNQNITLPAMFPSMCEKMRIRIIDWDRLTHNDIVAT
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 TYLHLSKIAASGGEVEDFSSSGTGAASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGF
::: .:::.: :::.:. .:. : . . . .::.:::::::.::::::::.:::
NP_001 TYLSMSKISAPGGEIEE-EPAGAVKPSKASDL-DDYLGFLPTFGPCYINLYGSPREFTGF
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 PDPYDELNTGKGEGVAYRGRILVELATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSL
:::: :::::::::::::::.:. : : : . ..:.: . ::.: :::: :::::::
NP_001 PDPYTELNTGKGEGVAYRGRLLLSLETKLVEHS-EQKVEDLPADDILRVEKYLRRRKYSL
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 SAVFHSATMLQDVGEAIQFEVSIGNYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAH
:.:.:::::::: .:::::::::::::::: :: ::::::::::::::: .::::::..
NP_001 FAAFYSATMLQDVDDAIQFEVSIGNYGNKFDMTCLPLASTTQYSRAVFDGCHYYYLPWGN
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 TKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTLLAMAERLQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLID
.::::.:.:::::::::... : ::..:.::....: .. ..... .... : .: :
NP_001 VKPVVVLSSYWEDISHRIETQNQLLGIADRLEAGLEQVHLALKAQCSTEDVDSLVAQLTD
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 EVIEDTRYTLPLTEGKANVTVLDTQIRKLRSRSLSQIHEAAVRMRSEATDVKSTLAEIED
:.: : . ..: :: . .::.. :::: :::. .. ... ..: . ::
NP_001 ELIAGCSQPLGDIHETPSATHLDQYLYQLRTHHLSQITEAALALKLGHSELPAALEQAED
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 WLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMIRGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQTI
:: .: :.::::::.:::.:::..:.::.:: :.::::::.: : : :: ::: :::
NP_001 WLLRLRALAEEPQNSLPDIVIWMLQGDKRVAYQRVPAHQVLFSRRGANYCGKNCGKLQTI
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 FLKYPQEKNNGPKVPVELRVNIWLGLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQA--LMFGKW
:::::.:: : ..::..::..:.:::. ::.::.:::: ..:::: :::.. . :.:
NP_001 FLKYPMEKVPGARMPVQIRVKLWFGLSVDEKEFNQFAEGKLSVFAETYENETKLALVGNW
840 850 860 870 880 890
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 GTSGLVGRHKFSDVTGKIKLKREFFLPPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEV
::.::. ::::::::::: .. : : :: : :.:.: ::..:: . :::: :..::
NP_001 GTTGLT-YPKFSDVTGKIKLPKDSFRPSAGWTWAGDWFVCPEKTLLHDMDAGHLSFVEEV
900 910 920 930 940 950
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 YQNESRYPGGDWKPAEDTYTDANGDKAASPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWE
..:..: :::.: :.:::.::.:. ... :: ::.:::. :: :.::::::.:::
NP_001 FENQTRLPGGQWIYMSDNYTDVNGEKVLPKDDIECPLGWKWEDEEWSTDLNRAVDEQGWE
960 970 980 990 1000 1010
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 YGITIPPDHKPKSWVAAEKMYHTHRRRRLVRKRKKDLTQTASSTARAMEELQDQEGWEYA
:.:::::..::: :: :::::.:::::: :: :..::.: . : . . ::::::
NP_001 YSITIPPERKPKHWVPAEKMYYTHRRRRWVRLRRRDLSQMEA-LKRHRQAEAEGEGWEYA
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KA1 SLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKMAPSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKSLEKQ
::.::::: . :..:.::::::::.: : : : ::.: ::::::. . .: .: :.
NP_001 SLFGWKFHLEYRKTDAFRRRRWRRRMEPLEKTGPAAVFALEGALGG-VMDDKSEDSMS--
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KA1 KHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYHLRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKT
.: ::.: : .:: :: ::::::.::::.: :.:::::::::: . :::.:.
NP_001 --VSTLSFGVNRPTISCIFDYGNRYHLRCYMYQARDLAAMDKDSFSDPYAIVSFLHQSQK
1140 1150 1160 1170 1180
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 TEIIHSTLNPTWDQTIIFDEVEIYGEPQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGKDEFLGRSIFSP
: ....:::::::::.:: :.::.::: :: ..::....::.:.: : :::.:: : .:
NP_001 TVVVKNTLNPTWDQTLIFYEIEIFGEPATVAEQPPSIVVELYDHDTYGADEFMGRCICQP
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1240 1250 1260 1270
pF1KA1 VVKLNSEMDITPKLLWHPVMNGDKACGDVLVTAELILRGK--------------------
.. :.: : :. :.. :..:.. ::: : :
NP_001 ------SLERMPRLAWFPLTRGSQPSGELLASFELIQREKPAIHHIPGFEVQETSRILDE
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KA1 -DGSNLPILPPQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNFQMASITSPSLVVEC
. ..:: :::: :.:::::.:.:..: ::::::::::::::..:.:.:.::::::::
NP_001 SEDTDLPYPPPQREANIYMVPQNIKPALQRTAIEILAWGLRNMKSYQLANISSPSLVVEC
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KA1 GGERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDHRQFGRKPVVGQCT
::. :.: ::.::.:.::: .:::.:.::.:::: ::...::::.:::::.:::::::
NP_001 GGQTVQSCVIRNLRKNPNFDICTLFMEVMLPREELYCPPITVKVIDNRQFGRRPVVGQCT
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KA1 IERLDRFRCDPYAGKEDIVPQL---KASLLSAPPCRDIVIEMEDTKPLLASKLTEKEEEI
:. :. : ::::.. :. :: .:::: : .:..:...: .::. . :::.
NP_001 IRSLESFLCDPYSA-ESPSPQGGPDDVSLLS--PGEDVLIDIDDKEPLIPIQ----EEEF
1430 1440 1450 1460 1470
1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 VDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKIYNCELENVAEFEGLTDFSDTFKLYRGKS-D
.::::::.:: ::.::::.:..: .. ::.:. .:::: ::::.:: .::::::::. .
NP_001 IDWWSKFFASIGEREKCGSYLEKDFDTLKVYDTQLENVEAFEGLSDFCNTFKLYRGKTQE
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 ENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDPSVPAPPRQFRELPDSVPQECTVRIYIVRGLELQPQD
:.:::::.::::: :.:::::.::..: :::::..: . :::: :::::::.. :::.:
NP_001 ETEDPSVIGEFKGLFKIYPLPEDPAIPMPPRQFHQLAAQGPQECLVRIYIVRAFGLQPKD
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 NNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHYIPNTLNPVFGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTFT
:: :::::::..::: . :.:.::: ::.::::.:.::.: :: ::::::..:::: ..
NP_001 PNGKCDPYIKISIGKKSVSDQDNYIPCTLEPVFGKMFELTCTLPLEKDLKITLYDYDLLS
1600 1610 1620 1630 1640 1650
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA1 RDEKVGETIIDLENRFLSRFGSHCGIPEEYCVSGVNTWRDQLRPTQLLQNVARFKGFPQP
.:::.:::..:::::.::.::..::.:. ::::: : :::::::.:::. . . :
NP_001 KDEKIGETVVDLENRLLSKFGARCGLPQTYCVSGPNQWRDQLRPSQLLHLFCQQHRVKAP
1660 1670 1680 1690 1700 1710
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA1 ILSEDGSRIRYGGRDYSLDEFEANKILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHS
. : :. . ..::..:.::..: . ::: :::::::.:. :::::::::.: :.:
NP_001 VYRTD--RVMFQDKEYSIEEIEAGRIPNPHLGPVEERLALHVLQQQGLVPEHVESRPLYS
1720 1730 1740 1750 1760 1770
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA1 TFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGPPFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITG
.::.: :::::::::.:::.:: ::::::::::.:....:: :::::.:::::. :.::
NP_001 PLQPDIEQGKLQMWVDLFPKALGRPGPPFNITPRRARRFFLRCIIWNTRDVILDDLSLTG
1780 1790 1800 1810 1820 1830
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA1 EEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLDGEGNFNWRFVFPFDYLPAEQLCIVAKKEHF
:.:::::::::. : ::.::::::::::: :::::::::.::::::::::.: .:::. :
NP_001 EKMSDIYVKGWMIGFEEHKQKTDVHYRSLGGEGNFNWRFIFPFDYLPAEQVCTIAKKDAF
1840 1850 1860 1870 1880 1890
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA1 WSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGFLELDLRHTIIPAKSPEKCRLDMIPDLKA
: .:.:: .:: :...:::::::::.::.:: :.::: . :::. .:: ::.. : :
NP_001 WRLDKTESKIPARVVFQIWDNDKFSFDDFLGSLQLDLNRMPKPAKTAKKCSLDQLDD--A
1900 1910 1920 1930 1940 1950
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA1 MNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCYAEKDGARVMAGKVEMTLEILNEKEADERPAGKGRDE
..: .::::::..:::::: ::. ...:::.::::::. :.: .:::::.::::
NP_001 FHP--EWFVSLFEQKTVKGWWPCVAEEGEKKILAGKLEMTLEIVAESEHEERPAGQGRDE
1960 1970 1980 1990 2000
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA1 PNMNPKLDLPNRPETSFLWFTNPCKTMKFIVWRRFKWVIIGLLFLLILLLFVAVLLYSLP
:::::::. : ::.:::::::.: ::::::.::::.:.:: ...:.:::::.:...:..:
NP_001 PNMNPKLEDPRRPDTSFLWFTSPYKTMKFILWRRFRWAIILFIILFILLLFLAIFIYAFP
2010 2020 2030 2040 2050 2060
2050 2060
pF1KA1 NYLSMKIVKPNV
:: .::.:::
NP_001 NYAAMKLVKPFS
2070 2080
>>NP_001124451 (OMIM: 253601,254130,603009,606768) dysfe (2111 aa)
initn: 5938 init1: 1288 opt: 7010 Z-score: 7003.1 bits: 1309.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8027; 55.7% identity (77.7% similar) in 2120 aa overlap (21-2059:21-2109)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MLRVIVESASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLD
: :..: ::.:: . : .:::::: .:.::.:::::
NP_001 MLRVFILYAENVHTPDTDISDAYCSAVFAGVKKRTKVIKNSVNPVWNEGFEWDLKGIPLD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 FSSSLGIIVKDFETIGQNKLIGTATVALKDLTGDQSRSLPYKLISLLNEKGQDTGATIDL
.: : ..::: ::.:.:...: : : :... . : : .. ::. : : :::.. :
NP_001 QGSELHVVVKDHETMGRNRFLGEAKVPLREVLATPSLSASFN-APLLDTKKQPTGASLVL
70 80 90 100 110
130 140
pF1KA1 VIGYDP-PSA----PHPNDLS-GPSVPGM-----GGD-----------------------
..: : :.: : :. : .:..: . ::.
NP_001 QVSYTPLPGAVPLFPPPTPLEPSPTLPDLDVVAGGGQSRAETWSLLSDSTMDTRYSGKKW
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180
pF1KA1 -------GEEDE------GDEDR--LDNAVRGPG-PKGPVGTVSEAQL----ARRLTKVK
:::: ::: . ::.. ::: : : :. .: ..
NP_001 PAPTDTGGEEDTEDQGLTGDEAEPFLDQS-GGPGAPTTPRKLPSRPPPHYPGIKRKRSAP
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 NSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKVHVCGQTHRTRIKRGNNPFFDELFF
.::..::.:::::::::.::::::: : ::.::::: . :::.::::..::.:.:.: .:
NP_001 TSRKLLSDKPQDFQIRVQVIEGRQLPGVNIKPVVKVTAAGQTKRTRIHKGNSPLFNETLF
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 YNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVMRKWLLLNDPE
.:. .:.::.:: : : : .:.:::.: :.:::..::: .: :: :: .::::::.::.
NP_001 FNLFDSPGELFDEPIFITVVDSRSLRTDALLGEFRMDVGTIYREPRHAYLRKWLLLSDPD
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTFLLKIYR
: :.:..::.:.:. ::: ::: : ::.: ..:..:.::::: :.:.::: . : ::..:
NP_001 DFSAGARGYLKTSLCVLGPGDEAPLERKDPSEDKEDIESNLLRPTGVALRGAHFCLKVFR
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 AEDIPQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPEWNQVVN
:::.:::::: ..::.::: ...:::::::::::::::: .:..:.::.:::.::: ..
NP_001 AEDLPQMDDAVMDNVKQIFGFESNKKNLVDPFVEVSFAGKMLCSKILEKTANPQWNQNIT
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LQIKFPSVCEKIKLTIYDWDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVEDFSSSGTGAASYTV
: :::.:::... : ::::::.::.:.:::: .:::.: :::.:. .:. : .
NP_001 LPAMFPSMCEKMRIRIIDWDRLTHNDIVATTYLSMSKISAPGGEIEE-EPAGAVKPSKAS
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 NTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPDPYDELNTGKGEGVAYRGRILVELATFLE
. . .::.:::::::.::::::::.::::::: :::::::::::::::.:. : : :
NP_001 DL-DDYLGFLPTFGPCYINLYGSPREFTGFPDPYTELNTGKGEGVAYRGRLLLSLETKLV
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 KTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEAIQFEVSIGNYGNKF
. ..:.: . ::.: :::: ::::::: :.:.:::::::: .:::::::::::::::
NP_001 EHS-EQKVEDLPADDILRVEKYLRRRKYSLFAAFYSATMLQDVDDAIQFEVSIGNYGNKF
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 DTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTLLAMAER
: :: ::::::::::::::: .::::::...::::.:.:::::::::... : ::..:.:
NP_001 DMTCLPLASTTQYSRAVFDGCHYYYLPWGNVKPVVVLSSYWEDISHRIETQNQLLGIADR
660 670 680 690 700 710
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGKANVTVLDTQIRKLR
:....: .. ..... .... : .: ::.: : . ..: :: . .::
NP_001 LEAGLEQVHLALKAQCSTEDVDSLVAQLTDELIAGCSQPLGDIHETPSATHLDQYLYQLR
720 730 740 750 760 770
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 SRSLSQIHEAAVRMRSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMIRGEKRL
.. :::: :::. .. ... ..: . :::: .: :.::::::.:::.:::..:.::.
NP_001 THHLSQITEAALALKLGHSELPAALEQAEDWLLRLRALAEEPQNSLPDIVIWMLQGDKRV
780 790 800 810 820 830
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 AYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQTIFLKYPQEKNNGPKVPVELRVNIWLGLSAVE
:: :.::::::.: : : :: ::: ::::::::.:: : ..::..::..:.:::. :
NP_001 AYQRVPAHQVLFSRRGANYCGKNCGKLQTIFLKYPMEKVPGARMPVQIRVKLWFGLSVDE
840 850 860 870 880 890
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 KKFNSFAEGTFTVFAEMYENQA--LMFGKWGTSGLVGRHKFSDVTGKIKLKREFFLPPKG
:.::.:::: ..:::: :::.. . :.:::.::. ::::::::::: .. : : :
NP_001 KEFNQFAEGKLSVFAETYENETKLALVGNWGTTGLT-YPKFSDVTGKIKLPKDSFRPSAG
900 910 920 930 940 950
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 WEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDTYTDANGDKAASP
: : :.:.: ::..:: . :::: :..::..:..: :::.: :.:::.::.:.
NP_001 WTWAGDWFVCPEKTLLHDMDAGHLSFVEEVFENQTRLPGGQWIYMSDNYTDVNGEKVLPK
960 970 980 990 1000 1010
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 SELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAEKMYHTHRRRRLV
... :: ::.:::. :: :.::::::.::::.:::::..::: :: :::::.:::::: :
NP_001 DDIECPLGWKWEDEEWSTDLNRAVDEQGWEYSITIPPERKPKHWVPAEKMYYTHRRRRWV
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 RKRKKDLTQTASSTARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKMAPSE
: :..::.: . : . . ::::::::.::::: . :..:.::::::::.: : :
NP_001 RLRRRDLSQMEA-LKRHRQAEAEGEGWEYASLFGWKFHLEYRKTDAFRRRRWRRRMEPLE
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 THGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKSLEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYHLRCY
: ::.: ::::::. . .: .: :. .: ::.: : .:: :: ::::::
NP_001 KTGPAAVFALEGALGG-VMDDKSEDSMS----VSTLSFGVNRPTISCIFDYGNRYHLRCY
1140 1150 1160 1170 1180
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 VYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNPTWDQTIIFDEVEIYGEPQTV
.::::.: :.:::::::::: . :::.:. : ....:::::::::.:: :.::.::: ::
NP_001 MYQARDLAAMDKDSFSDPYAIVSFLHQSQKTVVVKNTLNPTWDQTLIFYEIEIFGEPATV
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 LQNPPKVIMELFDNDQVGKDEFLGRSIFSPVVKLNSEMDITPKLLWHPVMNGDKACGDVL
..::....::.:.: : :::.:: : .: .. :.: : :. :.. :..:
NP_001 AEQPPSIVVELYDHDTYGADEFMGRCICQP------SLERMPRLAWFPLTRGSQPSGELL
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1270 1280 1290 1300
pF1KA1 VTAELILRGK---------------------DGSNLPILPPQRAPNLYMVPQGIRPVVQL
.. ::: : : . ..:: :::: :.:::::.:.:..:
NP_001 ASFELIQREKPAIHHIPGFEVQETSRILDESEDTDLPYPPPQREANIYMVPQNIKPALQR
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KA1 TAIEILAWGLRNMKNFQMASITSPSLVVECGGERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFL
::::::::::::::..:.:.:.::::::::::. :.: ::.::.:.::: .:::.:.:
NP_001 TAIEILAWGLRNMKSYQLANISSPSLVVECGGQTVQSCVIRNLRKNPNFDICTLFMEVML
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KA1 PKEELYMPPLVIKVIDHRQFGRKPVVGQCTIERLDRFRCDPYAGKEDIVPQL---KASLL
:.:::: ::...::::.:::::.::::::::. :. : ::::.. :. :: .:::
NP_001 PREELYCPPITVKVIDNRQFGRRPVVGQCTIRSLESFLCDPYSA-ESPSPQGGPDDVSLL
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KA1 SAPPCRDIVIEMEDTKPLLASKLTEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKI
: : .:..:...: .::. .:::..::::::.:: ::.::::.:..: .. ::.
NP_001 S--PGEDVLIDIDDKEPLIPI----QEEEFIDWWSKFFASIGEREKCGSYLEKDFDTLKV
1490 1500 1510 1520 1530
1490 1500 1510 1520 1530
pF1KA1 YNCELENVAEFEGLTDFSDTFKLYRGKS-DENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDPSVPAPP
:. .:::: ::::.:: .::::::::. .:.:::::.::::: :.:::::.::..: ::
NP_001 YDTQLENVEAFEGLSDFCNTFKLYRGKTQEETEDPSVIGEFKGLFKIYPLPEDPAIPMPP
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KA1 RQFRELPDSVPQECTVRIYIVRGLELQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHYIPNTLN
:::..: . :::: :::::::.. :::.: :: :::::::..::: . :.:.::: ::.
NP_001 RQFHQLAAQGPQECLVRIYIVRAFGLQPKDPNGKCDPYIKISIGKKSVSDQDNYIPCTLE
1600 1610 1620 1630 1640 1650
1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KA1 PVFGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTFTRDEKVGETIIDLENRFLSRFGSHCGIPEEY
::::.:.::.: :: ::::::..:::: ...:::.:::..:::::.::.::..::.:. :
NP_001 PVFGKMFELTCTLPLEKDLKITLYDYDLLSKDEKIGETVVDLENRLLSKFGARCGLPQTY
1660 1670 1680 1690 1700 1710
1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KA1 CVSGVNTWRDQLRPTQLLQNVARFKGFPQPILSEDGSRIRYGGRDYSLDEFEANKILHQH
:::: : :::::::.:::. . . :. : :. . ..::..:.::..: . :
NP_001 CVSGPNQWRDQLRPSQLLHLFCQQHRVKAPVYRTD--RVMFQDKEYSIEEIEAGRIPNPH
1720 1730 1740 1750 1760 1770
1720 1730 1740 1750 1760 1770
pF1KA1 LGAPEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGPPFN
:: :::::::.:. :::::::::.: :.: .::.: :::::::::.:::.:: ::::::
NP_001 LGPVEERLALHVLQQQGLVPEHVESRPLYSPLQPDIEQGKLQMWVDLFPKALGRPGPPFN
1780 1790 1800 1810 1820 1830
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KA1 ITPRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLD
::::.:....:: :::::.:::::. :.:::.:::::::::. : ::.:::::::::::
NP_001 ITPRRARRFFLRCIIWNTRDVILDDLSLTGEKMSDIYVKGWMIGFEEHKQKTDVHYRSLG
1840 1850 1860 1870 1880 1890
1840 1850 1860 1870 1880 1890
pF1KA1 GEGNFNWRFVFPFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKFSLDDYL
:::::::::.::::::::::.: .:::. :: .:.:: .:: :...:::::::::.::.:
NP_001 GEGNFNWRFIFPFDYLPAEQVCTIAKKDAFWRLDKTESKIPARVVFQIWDNDKFSFDDFL
1900 1910 1920 1930 1940 1950
1900 1910 1920 1930 1940 1950
pF1KA1 GFLELDLRHTIIPAKSPEKCRLDMIPDLKAMNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCYAEKDGA
: :.::: . :::. .:: ::.. : :..: .::::::..:::::: ::.
NP_001 GSLQLDLNRMPKPAKTAKKCSLDQLDD--AFHP--EWFVSLFEQKTVKGWWPCVAEEGEK
1960 1970 1980 1990 2000
1960 1970 1980 1990 2000 2010
pF1KA1 RVMAGKVEMTLEILNEKEADERPAGKGRDEPNMNPKLDLPNRPETSFLWFTNPCKTMKFI
...:::.::::::. :.: .:::::.:::::::::::. : ::.:::::::.: ::::::
NP_001 KILAGKLEMTLEIVAESEHEERPAGQGRDEPNMNPKLEDPRRPDTSFLWFTSPYKTMKFI
2010 2020 2030 2040 2050 2060
2020 2030 2040 2050 2060
pF1KA1 VWRRFKWVIIGLLFLLILLLFVAVLLYSLPNYLSMKIVKPNV
.::::.:.:: ...:.:::::.:...:..::: .::.:::
NP_001 LWRRFRWAIILFIILFILLLFLAIFIYAFPNYAAMKLVKPFS
2070 2080 2090 2100 2110
2061 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 19:54:54 2016 done: Thu Nov 3 19:54:57 2016
Total Scan time: 20.350 Total Display time: 1.800
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]