Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1209
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1209, 1444 aa
1>>>pF1KA1209 1444 - 1444 aa - 1444 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4676+/-0.00109; mu= 13.0088+/- 0.065
mean_var=120.7627+/-23.700, 0's: 0 Z-trim(106.5): 107 B-trim: 52 in 1/50
Lambda= 0.116710
statistics sampled from 8908 (9018) to 8908 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.277), width: 16
Scan time: 5.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34552.1 PLEKHG1 gene_id:57480|Hs108|chr6 (1385) 9170 1556.3 0
CCDS76690.1 PLEKHG3 gene_id:26030|Hs108|chr14 (1219) 1579 278.2 1e-73
CCDS33022.2 PLEKHG2 gene_id:64857|Hs108|chr19 (1386) 1119 200.7 2.4e-50
CCDS55514.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX ( 821) 460 89.7 3.9e-17
CCDS55515.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX ( 860) 460 89.7 4e-17
CCDS14667.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX ( 925) 460 89.7 4.3e-17
CCDS48175.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX ( 985) 460 89.7 4.5e-17
CCDS3883.1 TRIO gene_id:7204|Hs108|chr5 (3097) 464 90.6 7.7e-17
CCDS55429.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 414) 445 87.0 1.2e-16
CCDS55430.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 463) 445 87.1 1.4e-16
CCDS83477.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 495) 445 87.1 1.4e-16
CCDS66517.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 ( 574) 446 87.3 1.5e-16
CCDS35315.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 516) 445 87.1 1.5e-16
CCDS66518.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 ( 596) 446 87.3 1.5e-16
CCDS9305.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 ( 652) 446 87.3 1.6e-16
CCDS55516.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX ( 941) 447 87.5 2e-16
CCDS55517.1 MCF2 gene_id:4168|Hs108|chrX (1001) 447 87.5 2.1e-16
CCDS53857.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 (1277) 446 87.4 2.9e-16
CCDS9521.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13 ( 646) 440 86.3 3.2e-16
CCDS2165.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2 ( 690) 434 85.3 6.9e-16
CCDS42754.1 ARHGEF4 gene_id:50649|Hs108|chr2 ( 670) 431 84.8 9.6e-16
CCDS45069.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13 ( 753) 428 84.3 1.5e-15
CCDS32009.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13 ( 782) 428 84.3 1.6e-15
CCDS45068.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13 ( 803) 428 84.3 1.6e-15
CCDS81781.1 ARHGEF7 gene_id:8874|Hs108|chr13 ( 547) 417 82.4 4.1e-15
CCDS81782.1 MCF2L gene_id:23263|Hs108|chr13 ( 984) 418 82.6 6.1e-15
CCDS9527.3 MCF2L gene_id:23263|Hs108|chr13 (1123) 418 82.7 6.8e-15
CCDS45070.2 MCF2L gene_id:23263|Hs108|chr13 (1125) 418 82.7 6.9e-15
CCDS78509.1 ARHGEF6 gene_id:9459|Hs108|chrX ( 622) 413 81.7 7.3e-15
CCDS14660.1 ARHGEF6 gene_id:9459|Hs108|chrX ( 776) 413 81.8 8.9e-15
CCDS3028.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3 (1289) 410 81.4 2e-14
CCDS8947.1 ARHGEF25 gene_id:115557|Hs108|chr12 ( 580) 398 79.2 4e-14
CCDS44931.1 ARHGEF25 gene_id:115557|Hs108|chr12 ( 619) 398 79.2 4.2e-14
CCDS82829.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3 (1654) 393 78.5 1.8e-13
CCDS3027.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3 (1663) 393 78.5 1.8e-13
CCDS73553.1 SPATA13 gene_id:221178|Hs108|chr13 ( 512) 381 76.3 2.6e-13
CCDS45512.1 PLEKHG4 gene_id:25894|Hs108|chr16 (1110) 374 75.3 1.2e-12
CCDS32466.1 PLEKHG4 gene_id:25894|Hs108|chr16 (1191) 374 75.3 1.2e-12
CCDS3243.1 MCF2L2 gene_id:23101|Hs108|chr3 (1114) 369 74.4 2.1e-12
CCDS34124.1 PLEKHG4B gene_id:153478|Hs108|chr5 (1271) 368 74.3 2.6e-12
CCDS6201.1 PREX2 gene_id:80243|Hs108|chr8 (1606) 363 73.5 5.7e-12
CCDS59341.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19 ( 823) 356 72.2 7.2e-12
CCDS12174.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19 ( 845) 356 72.2 7.4e-12
CCDS13410.1 PREX1 gene_id:57580|Hs108|chr20 (1659) 356 72.3 1.3e-11
CCDS785.1 VAV3 gene_id:10451|Hs108|chr1 ( 847) 341 69.7 4.3e-11
CCDS6979.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9 ( 839) 337 69.0 6.8e-11
CCDS48053.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9 ( 878) 337 69.0 7e-11
>>CCDS34552.1 PLEKHG1 gene_id:57480|Hs108|chr6 (1385 aa)
initn: 9170 init1: 9170 opt: 9170 Z-score: 8343.6 bits: 1556.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9170; 100.0% identity (100.0% similar) in 1385 aa overlap (60-1444:1-1385)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 QLRLEVPSAVTKVPHPKTTARRSCPQELKTMELSDSDRPVSFGSTSSSASSRDSHGSFGS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MELSDSDRPVSFGSTSSSASSRDSHGSFGS
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 RMTLVSNSHMGLFNQDKEVGAIKLELIPARPFSSSELQRDNPATGQQNADEGSERPPRAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RMTLVSNSHMGLFNQDKEVGAIKLELIPARPFSSSELQRDNPATGQQNADEGSERPPRAQ
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 WRVDSNGAPKTIADSATSPKLLYVDRVVQEILETERTYVQDLKSIVEDYLDCIRDQTKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 WRVDSNGAPKTIADSATSPKLLYVDRVVQEILETERTYVQDLKSIVEDYLDCIRDQTKLP
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 LGTEERSALFGNIQDIYHFNSELLQDLENCENDPVAIAECFVSKSEEFHIYTQYCTNYPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LGTEERSALFGNIQDIYHFNSELLQDLENCENDPVAIAECFVSKSEEFHIYTQYCTNYPR
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 SVAVLTECMRNKILAKFFRERQETLKHSLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLHEIENHLDKDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SVAVLTECMRNKILAKFFRERQETLKHSLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLHEIENHLDKDT
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 EGYDVVLDAIDTMQRVAWHINDMKRKHEHAVRLQEIQSLLTNWKGPDLTSYGELVLEGTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EGYDVVLDAIDTMQRVAWHINDMKRKHEHAVRLQEIQSLLTNWKGPDLTSYGELVLEGTF
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 RIQRAKNERTLFLFDKLLLITKKRDDTFTYKAHILCGNLMLVEVIPKEPLSFSVFHYKNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RIQRAKNERTLFLFDKLLLITKKRDDTFTYKAHILCGNLMLVEVIPKEPLSFSVFHYKNP
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 KLQHTVQAKSQQDKRLWVLHLKRLILENHAAKIPAKAKQAILEMDAIHHPGFCYSPEGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KLQHTVQAKSQQDKRLWVLHLKRLILENHAAKIPAKAKQAILEMDAIHHPGFCYSPEGGT
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 KALFGSKEGSAPYRLRRKSEPSSRSHKVLKTSETAQDIQKVSREEGSPQLSSARPSPAQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KALFGSKEGSAPYRLRRKSEPSSRSHKVLKTSETAQDIQKVSREEGSPQLSSARPSPAQR
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 NSQPSSSTMISVLRAGGALRNIWTDHQIRQALFPSRRSPQENEDDEDDYQMFVPSFSSSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NSQPSSSTMISVLRAGGALRNIWTDHQIRQALFPSRRSPQENEDDEDDYQMFVPSFSSSD
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 LNSTRLCEDSTSSRPCSWHMGQMESTETSSSGHRIVRRASSAGESNTCPPEIGTSDRTRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LNSTRLCEDSTSSRPCSWHMGQMESTETSSSGHRIVRRASSAGESNTCPPEIGTSDRTRE
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 LQNSPKTEGQEEMTPFGSSIELTIDDIDHVYDNISYEDLKLMVAKREEAESTPSKSARDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LQNSPKTEGQEEMTPFGSSIELTIDDIDHVYDNISYEDLKLMVAKREEAESTPSKSARDS
640 650 660 670 680 690
750 760 770 780 790 800
pF1KA1 VRPKSTPELAFTKRQAGHSKGSLYAQTDGTLSGGEASSQSTHELQAVEENIYDTIGLPDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VRPKSTPELAFTKRQAGHSKGSLYAQTDGTLSGGEASSQSTHELQAVEENIYDTIGLPDP
700 710 720 730 740 750
810 820 830 840 850 860
pF1KA1 PSLGFKCSSLKRAKRSTFLGLEADFVCCDSLRPFVSQDSLQLSEDEAPYHQATPDHGYLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PSLGFKCSSLKRAKRSTFLGLEADFVCCDSLRPFVSQDSLQLSEDEAPYHQATPDHGYLS
760 770 780 790 800 810
870 880 890 900 910 920
pF1KA1 LLYDSPSGNLSMPHKPVSDKLSEEVDEIWNDLENYIKKNEDKARDRLLAAFPVSKDDVPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLYDSPSGNLSMPHKPVSDKLSEEVDEIWNDLENYIKKNEDKARDRLLAAFPVSKDDVPD
820 830 840 850 860 870
930 940 950 960 970 980
pF1KA1 RLHAESTPELSRDVGRSVSTLSLPESQALLTPVKSRAGRASRANCPFEEDLISKEGSFMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RLHAESTPELSRDVGRSVSTLSLPESQALLTPVKSRAGRASRANCPFEEDLISKEGSFMS
880 890 900 910 920 930
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA1 LNRLSLASEMPLMDNPYDLANSGLSQTDPENPDLGMEATDKTKSRVFMMARQYSQKIKKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LNRLSLASEMPLMDNPYDLANSGLSQTDPENPDLGMEATDKTKSRVFMMARQYSQKIKKA
940 950 960 970 980 990
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KA1 NQLLKVKSLELEQPPASQHQKSMHKDLAAILEEKKQGGPAIGARIAEYSQLYDQIVFRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NQLLKVKSLELEQPPASQHQKSMHKDLAAILEEKKQGGPAIGARIAEYSQLYDQIVFRES
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KA1 PLKIQKDGWASPQESSLLRSVSPSQVHHGSGDWLLHSTYSNGELADFCLPPEQDLRSRYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PLKIQKDGWASPQESSLLRSVSPSQVHHGSGDWLLHSTYSNGELADFCLPPEQDLRSRYP
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KA1 TFEINTKSTPRQLSAACSVPSLQTSDPLPGSVQRCSVVVSQPNKENWCQDHLYNSLGRKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TFEINTKSTPRQLSAACSVPSLQTSDPLPGSVQRCSVVVSQPNKENWCQDHLYNSLGRKG
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KA1 ISAKSQPYHRSQSSSSVLINKSMDSINYPSDVGKQQLLSLHRSSRCESHQDLLPDIADSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ISAKSQPYHRSQSSSSVLINKSMDSINYPSDVGKQQLLSLHRSSRCESHQDLLPDIADSH
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KA1 QQGTEKLSDLTLQDSQKVVVVNRNLPLNAQIATQNYFSNFKETDGDEDDYVEIKSEEDES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QQGTEKLSDLTLQDSQKVVVVNRNLPLNAQIATQNYFSNFKETDGDEDDYVEIKSEEDES
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KA1 ELELSHNRRRKSDSKFVDADFSDNVCSGNTLHSLNSPRTPKKPVNSKLGLSPYLTPYNDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ELELSHNRRRKSDSKFVDADFSDNVCSGNTLHSLNSPRTPKKPVNSKLGLSPYLTPYNDS
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1410 1420 1430 1440
pF1KA1 DKLNDYLWRGPSPNQQNIVQSLREKFQCLSSSSFA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DKLNDYLWRGPSPNQQNIVQSLREKFQCLSSSSFA
1360 1370 1380
>>CCDS76690.1 PLEKHG3 gene_id:26030|Hs108|chr14 (1219 aa)
initn: 1783 init1: 1114 opt: 1579 Z-score: 1436.7 bits: 278.2 E(32554): 1e-73
Smith-Waterman score: 1664; 34.6% identity (58.0% similar) in 1194 aa overlap (54-1204:2-1098)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 SITDGHQLRLEVPSAVTKVPHPKTTARRSCPQELKTMELSDSDRPVSFGST-SSSASSRD
: . . ....::::. :: :::.:: :
CCDS76 MPVSTSLHQDGSQERPVSLTSTTSSSGSSCD
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 SHGSFGSRMTLVSNSHMGLFNQDKEVGAIKLELIPARPFSSSELQRDNPATGQQNADEGS
:. : : :.:. ::. ..: .: : ....... .
CCDS76 SR----SAMEEPSSSEA-----------------PAKNGAGSLRSRHLPNSNNNSSSWLN
40 50 60 70
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 ERPPRAQWRVDSNGAPKTIADSATSPKLLYVDRVVQEILETERTYVQDLKSIVEDYLDCI
. : . . . ..: . :: :. :::.::.:::: :::::.::::::: :
CCDS76 VKGPLSPFNSRAAAGP-------AHHKLSYLGRVVREIVETERMYVQDLRSIVEDYLLKI
80 90 100 110 120
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 RDQTKLPLGTEERSALFGNIQDIYHFNSELLQDLENCENDPVAIAECFVSKSEEFHIYTQ
: : : :. :::::::..:: .::.::.::..:..::::.: ::: .:.:: ::::
CCDS76 IDTPGL-LKPEQVSALFGNIENIYALNSQLLRDLDSCNSDPVAVASCFVERSQEFDIYTQ
130 140 150 160 170 180
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 YCTNYPRSVAVLTECMRNKILAKFFRERQETLKHSLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLHEIE
::.::: :::.::::::.: :::::.::: :.:::::::::::::::::::::::.::
CCDS76 YCNNYPNSVAALTECMRDKQQAKFFRDRQELLQHSLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLQEIA
190 200 210 220 230 240
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 NHLDKDTEGYDVVLDAIDTMQRVAWHINDMKRKHEHAVRLQEIQSLLTNWKGPDLTSYGE
.:.:.. .:..:: :::::: :::.::::::.:::::::::::::: ::::::::.:::
CCDS76 KHFDEEEDGFEVVEDAIDTMTCVAWYINDMKRRHEHAVRLQEIQSLLINWKGPDLTTYGE
250 260 270 280 290 300
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 LVLEGTFRIQRAKNERTLFLFDKLLLITKKRDDTFTYKAHILCGNLMLVEVIPKEPLSFS
::::::::..:..::::.::::: ::::::: : :.::..: :..:::.: .. : :.
CCDS76 LVLEGTFRVHRVRNERTFFLFDKTLLITKKRGDHFVYKGNIPCSSLMLIEST-RDSLCFT
310 320 330 340 350 360
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 VFHYKNPKLQHTVQAKSQQDKRLWVLHLKRLILENHAAKIPAKAKQAILEMDAIHHPGFC
: :::. : :...:::. ..:: :. :.:::::::: : :: :::.::::::. . .
CCDS76 VTHYKHSKQQYSIQAKTVEEKRNWTHHIKRLILENHHATIPQKAKEAILEMDSYYPNRYR
370 380 390 400 410 420
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 YSPEGGTKALFGSKEGSAPYRL-RRKSEPSSRSHKVLKTSETAQDIQKVSREEGSPQLSS
::: :: .. : :. : ::.:::... . :. . : .. .:.:. . ::
CCDS76 CSPERLKKAWSSQDEVSTNVRQGRRQSEPTKHLLRQLNEKARAAGMKGKGRRESESSRSS
430 440 450 460 470 480
570 580 590 600 610
pF1KA1 ARPSPAQRNSQPSSSTMISVLRAGGALRNIWTDHQI--RQALF-----PS-RRSPQENED
::: . .:.:. ... ..: .. : . .: .: :: ...:...:.
CCDS76 RRPS----GRSPTSTEKRMSFESISSLPEVEPDPEAGSEQEVFSAVEGPSAEETPSDTES
490 500 510 520 530
620 630 640 650 660
pF1KA1 DE------DDYQMFV---PSFSSSDLNSTRLCEDSTS-SRPCSWHMGQMESTETSSSGHR
: : .: .. : . :. ... :: . : .:: . :
CCDS76 PEVLETQLDAHQGLLGMDPPGDMVDFVAAESTEDLKALSSEEEEEMGGAAQEPESLLPPS
540 550 560 570 580 590
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 IVRRASSAGESNTCPPEIGTSDRTRELQNSPKTEGQEEMTPFGSSIELTIDDIDHVYDNI
.. .:: .: . . : :. :.. :. : ::: .: ... . .
CCDS76 VLDQASVIAERFVS----SFSRRSSVAQEDSKSSG------FGSP-RL----VSRSSSVL
600 610 620 630 640
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 SYEDLKLMVAKREEAESTPSKSARDSVRPKSTPELAFT---KRQAGHSKGSLYAQTDGTL
: : . .:.. :: ::. . .::. .. . . : ... . :
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CCDS14 NLVTSGTPFFSSKQGKKTWRQNQSNLK--IEVVPDCQEK-RSSG-PSSSLDNGNSLDVLK
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CCDS14 -NHVLNELIQTERVYVRELYTVLLGYRAEM-DNPEMFDLMPPLLRNKKDILFGNMAEIYE
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pF1KA1 FNSEL-LQDLENCENDPVAIAECFVSKSEEFHIYTQYCTNYPRSVAV---LTECMRNKIL
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CCDS14 FHNDIFLSSLENCAHAPERVGPCFLERKDDFQMYAKYCQNKPRSETIWRKYSECA-----
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CCDS14 DLLKSVND--SMHQIAI---------NGYIG-NLNELGKMIMQGGFSVWIGHKKGATKMK
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CCDS14 DLARFKPMQRHLFLYEKAIVFCKRRVESGEGSDRYPSYSFKHCWKMDEVGITEYVKGDNR
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pF1KA1 SFSVFHYKNPKLQHTVQAKSQQDKRLWVLHLKRLILENHAAKIPAKAKQAILEMDAIHHP
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CCDS14 KFEIWYGEKEEV-YIVQASNVDVKMTWLKEIRNILLKQQELLTVKKRKQQDQLTERDKFQ
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CCDS14 ISLQQNDEKQQGAFISTEETELEHTSTVVEVCEAIASVQAEANTVWTEASQSAEISEEPA
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pF1KA1 LSDSDRPVSFGSTSSSASSRDSHGSFGSRMTLVSNSHMGLFN-QDKEVGAIKLELIPA--
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CCDS48 ETLQYEFDVILSPELKVQMKTIQLKLENIRSIFENQQAGFRNLADKHVRPIQF-VVPTPE
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CCDS48 NLVTSGTPFFSSKQGKKTWRQNQSNLK--IEVVPDCQEK-RSSG-PSSSLDNGNSLDVLK
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180 190 200 210 220
pF1KA1 VDRVVQEILETERTYVQDLKSIVEDYLDCIRDQTKL-----PLGTEERSALFGNIQDIYH
..:..:...:::.::..: ... : . :. .. :: .... ::::. .::.
CCDS48 -NHVLNELIQTERVYVRELYTVLLGYRAEM-DNPEMFDLMPPLLRNKKDILFGNMAEIYE
560 570 580 590 600 610
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 FNSEL-LQDLENCENDPVAIAECFVSKSEEFHIYTQYCTNYPRSVAV---LTECMRNKIL
:.... :..:::: . : .. ::. ....:..:..:: : ::: .. .::
CCDS48 FHNDIFLSSLENCAHAPERVGPCFLERKDDFQMYAKYCQNKPRSETIWRKYSECA-----
620 630 640 650 660
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 AKFFRERQETLKHSLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLHEIENHLDKDTEGYDVVLDAIDTMQ
::.: :. ::: : : :::::::::: ::.:::.:. .. .:: :: .. :.:.:
CCDS48 --FFQECQRKLKHRLRLDSYLLKPVQRITKYQLLLKELLKY-SKDCEGSALLKKALDAML
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350 360 370 380 390
pF1KA1 RVAWHINDMKRKHEHAVRLQEIQSLLTNWKGPDLTSYGELVLEGTFRIQ--------RAK
. .:: :. :. ... : .:. :.....: : . . :
CCDS48 DLLKSVND--SMHQIAI---------NGYIG-NLNELGKMIMQGGFSVWIGHKKGATKMK
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400 410 420 430
pF1KA1 N-------ERTLFLFDKLLLITKKR------DDTFTYKAHILCGNL---MLVEVIPKEPL
. .: :::..: ... :.: .: . . : .. ..: . .
CCDS48 DLARFKPMQRHLFLYEKAIVFCKRRVESGEGSDRYPSYSFKHCWKMDEVGITEYVKGDNR
780 790 800 810 820 830
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pF1KA1 SFSVFHYKNPKLQHTVQAKSQQDKRLWVLHLKRLILENHAAKIPAKAKQAILEMDAIHHP
.: ... .. .. . :::.. . : :. ... ..:... : ::
CCDS48 KFEIWYGEKEEV-YIVQASNVDVKMTWLKEIRNILLKQQELLTVKKRKQQDQLTERDKFQ
840 850 860 870 880 890
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 GFCYSPEGGTKALFGSKEGSAPYRLRRKSEPSSRSHKVLKTSETAQDIQKVSREEGSPQL
CCDS48 ISLQQNDEKQQGAFISTEETELEHTSTVVEVCEAIASVQAEANTVWTEASQSAEISEEPA
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20 30 40 50 60 70
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... .:: .: . : .:. : .. .
CCDS38 DDSAATPQDETVEERGRNEGLSSGTLSKSSSSGMQSCGEE-EGEEGADAVPLPPPMAIQQ
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: . ::. . .: :: . . . :.::. ::. .:. .: :..
CCDS38 HSLLQPDSQDDKASSRLLVRPTSSETPSAAELVSAIE-ELV-----KSKMALEDRPSSLL
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pF1KA1 QNADEGSERPPR---AQWRVDSNGAPKTIADSATSPKLLYVDRVVQEILETERTYVQDLK
.:.:. : .. . :...: . : .: :.::..:::: ::.::
CCDS38 --VDQGDSSSPSFNPSDNSLLSSSSPIDEMEERKSSSLKRRHYVLQELVETERDYVRDLG
1940 1950 1960 1970 1980
200 210 220 230 240 250
pF1KA1 SIVEDYLDCIRDQTKLPLGTEERSAL-FGNIQDIYHFNSEL-LQDLENCENDPVAIAECF
.:: :. .... .: . .. . ::::..:: .. .. : .::.: .:: .. :
CCDS38 YVVEGYMALMKEDG-VPDDMKGKDKIVFGNIHQIYDWHRDFFLGELEKCLEDPEKLGSLF
1990 2000 2010 2020 2030 2040
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:.. ...:.: :: : :.: ...: . ::.. .. : : : : . :.:::::
CCDS38 VKHERRLHMYIAYCQNKPKSEHIVSE-----YIDTFFEDLKQRLGHRLQLTDLLIKPVQR
2050 2060 2070 2080 2090 2100
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pF1KA1 ILKYHLLLHEIENHLDKDTEGYDVVLDAIDTMQRVAWHINDMKRKHEHAVRLQEIQSLLT
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CCDS38 IMKYQLLLKDFLKYSKKASLDTSELERAVEVMCIVPRRCNDMM----NVGRLQ-------
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pF1KA1 NWKGPDLTSYGELVLEGTFRI--QRAK-----NERTLFLFDKLLLITKKRDDT-------
.. : ... :.:.:. :: . : : :: .:::........ :
CCDS38 GFDGK-IVAQGKLLLQDTFLVTDQDAGLLPRCRERRIFLFEQIVIFSEPLDKKKGFSMPG
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pF1KA1 FTYKAHILCGNLMLVEVIPKEPLSFSVFHYKNPKLQHTV-QAKSQQDKRLWVLHLKRLIL
: .: : . : : : . ..: .:.. . .. . ...: . .. :. : ::
CCDS38 FLFKNSIKVSCLCLEENVENDPCKFALTSRTGDVVETFILHSSSPSVRQTWI-HEINQIL
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pF1KA1 ENHAAKIPAKAKQAILEMDAIHHPGFCYSPEGGTKALFGSKEGSAPYRLRRKSE-PSSRS
::. . .: . .:.. : : . ::. . :: :.:: .: ::: .
CCDS38 ENQRNFL--NALTSPIEYQRNHSGGGGGGGSGGSGGGGGSGGGGAPSGGSGHSGGPSSCG
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pF1KA1 HKVLKTSETAQDIQKVSREEGSPQLSSARPSPAQRNSQPSSSTMISVLRAGGALRNIWTD
. . : . :.. .::: : :. ... ..:: : :: . .
CCDS38 GAPSTSRSRPSRIPQPVRHHPPVLVSSAASSQAEADKMSGTSTPGPSLPPPGAAPEAGPS
2330 2340 2350 2360 2370 2380
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pF1KA1 HQIRQALFPSRRSPQENEDDEDDYQMFVPSFSSSDLNSTRL-CEDSTSSRPCSWHMGQME
:::: : . . . .:... :.: : ....: :
CCDS38 A-------PSRRPPGADAEGSEREAEPIPKMKV--LESPRKGAANASGSSPDAPAKDARA
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pF1KA1 STETSSSGHRIVRRASSAGESNTCPPEIGTSDRTRELQNSPKTEGQEEMTPFGSSIELTI
CCDS38 SLGTLPLGKPRAGAASPLNSPLSSAVPSLGKEPFPPSSPLQKGGSFWSSIPASPASRPGS
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>--
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.. :...::..::.::. .. :: .
CCDS38 ASIPGSEVKLRDAAHELNEEKRKSARRKEFIMAELIQTEKAYVRDLRECMDTYLWEMTSG
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..: : .. .:::.:.::.: :. .:..::. :. : ...:::. ...:..:.
CCDS38 VEEIPPGIVNKELIIFGNMQEIYEFHNNIFLKELEKYEQLPEDVGHCFVTWADKFQMYVT
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:: : : :. .. : ...: : :. .:.: ..:::.:::::: ::.:::.:
CCDS38 YCKNKPDSTQLILEHA-----GSYFDEIQQ--RHGLANSISSYLIKPVQRITKYQLLLKE
1390 1400 1410 1420 1430
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. : :: . :....: : . :: :..:. .... : . :
CCDS38 L---LTCCEEGKGEIKDGLEVMLSVPKRAND-------AMHLSMLEGFDEN-----IESQ
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pF1KA1 GELVLEGTFRIQRAKN------ERTLFLFDKLLLITKKRDDT-----FTYKAHILCGNLM
:::.:. .:.. :. :: ::::. :...:. :. . ::.... ..:
CCDS38 GELILQESFQVWDPKTLIRKGRERHLFLFEMSLVFSKEVKDSSGRSKYLYKSKLFTSELG
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..: . .: .:... ..: .. . .:.: ..:. :. :....: : . :
CCDS38 VTEHVEGDPCKFALWVGRTPTSDNKIVLKASSIENKQDWIKHIREVIQER-----TIHLK
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pF1KA1 QAILEMDAIHHPGFCYSPEGGTKALFGSKEGSAPYRLRRKSEPSSRSHKVLKTSETAQDI
:. : :: : .: : : ..: : ... ::. . .:.:.:.
CCDS38 GALKE--PIHIPKT--APATRQK---GRRDGED---LDSQGDGSSQPDTISIASRTSQNT
1600 1610 1620 1630 1640
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pF1KA1 QKVSREEGSPQLSSARPSPAQRNSQPSSSTMISVLRAGGALRNIWTDHQIRQALFPSRRS
.. :. .:.
CCDS38 LDSDKLSGGCELTVVIHDFTACNSNELTIRRGQTVEVLERPHDKPDWCLVRTTDRSPAAE
1650 1660 1670 1680 1690 1700
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210 220 230 240 250 260
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. .. :. ...::::.:::.:. ...:::. : :: :. ::. ... : ::.
CCDS55 RDM-FSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYS
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pF1KA1 QYCTNYPRSVAVLTECMRNKILAKFFRERQETLKH--SLPLGSYLLKPVQRILKYHLLLH
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CCDS55 EYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFF-EACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLA
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pF1KA1 EIENHLDKDTEGYDVVLDAIDTMQRVAWHINDMKRKHEHAVRLQEIQSLLTNWKGPD-LT
:. .. .: : : :. .:. :. .::. ::. :. .. . :. . .:.: : :
CCDS55 ELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILD
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pF1KA1 SYGELVLEGT----FRIQRAKNERTLFLFDKLLLITKK---RDDTFTYKAHILCGNLMLV
.::. : .. ...:..::::. ... :: : : . ::..: . .:
CCDS55 RSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVV
220 230 240 250 260 270
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pF1KA1 EVIPKEPLSFSV-------FHYKNPKLQHTVQAKSQQDKRLWVLHLKRLILENHAAKIPA
.. . .:.: .: :. . : ::. ..: :.
CCDS55 DIEDGRDDDFNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIG
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pF1KA1 KAKQAILEMDAIHHPGFCYSPEGGTKALFGSKEGSAPYRLRRKSEPSSRSHKVLKTSETA
CCDS55 FEISENQKRQAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQYLVPDGIAQSQVFEF
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pF1KA1 PRAQWRVDSNGAPKTIADSATSPKLLYVDRVVQEILETERTYVQDLKSIVEDYLDCIRDQ
:..::. ::: :.. ::.: : :: : .
CCDS55 SDVQNGHLDPNSDCLCLGRPLQNRDQMRANVINEIMSTERHYIKHLKDICEGYLKQCRKR
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. .. :. ...::::.:::.:. ...:::. : :: :. ::. ... : ::.
CCDS55 RDM-FSDEQLKVIFGNIEDIYRFQMGFVRDLEKQYNNDDPHLSEIGPCFLEHQDGFWIYS
90 100 110 120 130 140
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.::.:. . :.. :... .:: : . :.. .. . ..:: :::.: :: : :
CCDS55 EYCNNHLDACMELSKLMKDSRYQHFF-EACRLLQQMIDIAIDGFLLTPVQKICKYPLQLA
150 160 170 180 190 200
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pF1KA1 EIENHLDKDTEGYDVVLDAIDTMQRVAWHINDMKRKHEHAVRLQEIQSLLTNWKGPD-LT
:. .. .: : : :. .:. :. .::. ::. :. .. . :. . .:.: : :
CCDS55 ELLKYTAQDHSDYRYVAAALAVMRNVTQQINERKRRLENIDKIAQWQASVLDWEGEDILD
210 220 230 240 250 260
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pF1KA1 SYGELVLEGT----FRIQRAKNERTLFLFDKLLLITKK---RDDTFTYKAHILCGNLMLV
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CCDS55 RSSELIYTGEMAWIYQPYGRNQQRVFFLFDHQMVLCKKDLIRRDILYYKGRIDMDKYEVV
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.. . .:.: .: :. . : ::. ..: :.
CCDS55 DIEDGRDDDFNVSMKNAFKLHNKETEEIHLFFAKKLEEKIRWLRAFREERKMVQEDEKIG
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pF1KA1 KAKQAILEMDAIHHPGFCYSPEGGTKALFGSKEGSAPYRLRRKSEPSSRSHKVLKTSETA
CCDS55 FEISENQKRQAAMTVRKVPKQKGVNSARSVPPSYPPPQDPLNHGQYLVPDGIAQSQVFEF
390 400 410 420 430 440
1444 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 19:55:54 2016 done: Thu Nov 3 19:55:55 2016
Total Scan time: 5.650 Total Display time: 0.360
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]