Result of FASTA (omim) for
pF1KA1250
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1250, 1771 aa
1>>>pF1KA1250 1771 - 1771 aa - 1771 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9505+/-0.000605; mu= 1.2290+/- 0.038
mean_var=262.5578+/-57.822, 0's: 0 Z-trim(114.9): 698 B-trim: 846 in 2/51
Lambda= 0.079152
statistics sampled from 24181 (25003) to 24181 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.293), width: 16
Scan time: 21.360
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_065789 (OMIM: 615759) kinase D-interacting subs (1771) 11694 1350.9 0
XP_016863596 (OMIM: 106410,600919) PREDICTED: anky (1797) 664 91.4 8.5e-17
XP_016863595 (OMIM: 106410,600919) PREDICTED: anky (1806) 664 91.4 8.5e-17
XP_016863591 (OMIM: 106410,600919) PREDICTED: anky (1838) 664 91.4 8.6e-17
XP_016863589 (OMIM: 106410,600919) PREDICTED: anky (1846) 664 91.4 8.6e-17
XP_016863586 (OMIM: 106410,600919) PREDICTED: anky (1858) 664 91.4 8.7e-17
XP_016863580 (OMIM: 106410,600919) PREDICTED: anky (1879) 664 91.4 8.8e-17
NP_065210 (OMIM: 182900,612641) ankyrin-1 isoform (1719) 654 90.2 1.8e-16
XP_011542807 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1751) 654 90.2 1.8e-16
XP_011542806 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1752) 654 90.2 1.8e-16
XP_016868818 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1759) 654 90.2 1.8e-16
XP_011542805 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1791) 654 90.2 1.9e-16
XP_016868817 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1792) 654 90.2 1.9e-16
XP_016868816 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1807) 654 90.2 1.9e-16
NP_065208 (OMIM: 182900,612641) ankyrin-1 isoform (1856) 654 90.2 1.9e-16
NP_000028 (OMIM: 182900,612641) ankyrin-1 isoform (1880) 654 90.2 1.9e-16
NP_065209 (OMIM: 182900,612641) ankyrin-1 isoform (1881) 654 90.2 1.9e-16
XP_011542804 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1889) 654 90.2 1.9e-16
XP_016868815 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1892) 654 90.2 1.9e-16
NP_001135918 (OMIM: 182900,612641) ankyrin-1 isofo (1897) 654 90.2 1.9e-16
XP_016868814 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1908) 654 90.2 2e-16
XP_011542803 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1913) 654 90.3 2e-16
XP_011542802 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1914) 654 90.3 2e-16
XP_005273533 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1921) 654 90.3 2e-16
XP_016868813 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1922) 654 90.3 2e-16
XP_016868812 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1936) 654 90.3 2e-16
XP_016868811 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1937) 654 90.3 2e-16
XP_016868810 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1940) 654 90.3 2e-16
XP_011542798 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1944) 654 90.3 2e-16
XP_016868809 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1946) 654 90.3 2e-16
XP_011542797 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1953) 654 90.3 2e-16
XP_011542796 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1954) 654 90.3 2e-16
XP_016868808 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1961) 654 90.3 2e-16
XP_011542793 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1968) 654 90.3 2e-16
XP_011542792 (OMIM: 182900,612641) PREDICTED: anky (1969) 654 90.3 2e-16
XP_016863506 (OMIM: 615929) PREDICTED: ankyrin rep (1116) 639 88.4 4.2e-16
XP_016863505 (OMIM: 615929) PREDICTED: ankyrin rep (1229) 639 88.4 4.5e-16
XP_016863504 (OMIM: 615929) PREDICTED: ankyrin rep (1367) 639 88.4 4.9e-16
XP_016863503 (OMIM: 615929) PREDICTED: ankyrin rep (1479) 639 88.5 5.3e-16
XP_005265730 (OMIM: 615929) PREDICTED: ankyrin rep (1480) 639 88.5 5.3e-16
XP_005265729 (OMIM: 615929) PREDICTED: ankyrin rep (1543) 639 88.5 5.4e-16
XP_016863502 (OMIM: 615929) PREDICTED: ankyrin rep (2238) 639 88.6 7.3e-16
XP_016863501 (OMIM: 615929) PREDICTED: ankyrin rep (2239) 639 88.6 7.3e-16
XP_005265728 (OMIM: 615929) PREDICTED: ankyrin rep (2351) 639 88.6 7.6e-16
NP_942592 (OMIM: 615929) ankyrin repeat domain-con (2352) 639 88.6 7.6e-16
XP_016863500 (OMIM: 615929) PREDICTED: ankyrin rep (2489) 639 88.6 7.9e-16
NP_001273700 (OMIM: 615929) ankyrin repeat domain- (2490) 639 88.6 7.9e-16
NP_056389 (OMIM: 615929) ankyrin repeat domain-con (2602) 639 88.6 8.2e-16
NP_115593 (OMIM: 615929) ankyrin repeat domain-con (2603) 639 88.6 8.2e-16
NP_060217 (OMIM: 610500) ankyrin repeat and KH dom (2542) 636 88.3 1e-15
>>NP_065789 (OMIM: 615759) kinase D-interacting substrat (1771 aa)
initn: 11694 init1: 11694 opt: 11694 Z-score: 7229.8 bits: 1350.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 11694; 100.0% identity (100.0% similar) in 1771 aa overlap (1-1771:1-1771)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSVLISQSVINYVEEENIPALKALLEKCKDVDERNECGQTPLMIAAEQGNLEIVKELIKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MSVLISQSVINYVEEENIPALKALLEKCKDVDERNECGQTPLMIAAEQGNLEIVKELIKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 GANCNLEDLDNWTALISASKEGHVHIVEELLKCGVNLEHRDMGGWTALMWACYKGRTDVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GANCNLEDLDNWTALISASKEGHVHIVEELLKCGVNLEHRDMGGWTALMWACYKGRTDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 ELLLSHGANPSVTGLYSVYPIIWAAGRGHADIVHLLLQNGAKVNCSDKYGTTPLVWAARK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ELLLSHGANPSVTGLYSVYPIIWAAGRGHADIVHLLLQNGAKVNCSDKYGTTPLVWAARK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 GHLECVKHLLAMGADVDQEGANSMTALIVAVKGGYTQSVKEILKRNPNVNLTDKDGNTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GHLECVKHLLAMGADVDQEGANSMTALIVAVKGGYTQSVKEILKRNPNVNLTDKDGNTAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 MIASKEGHTEIVQDLLDAGTYVNIPDRSGDTVLIGAVRGGHVEIVRALLQKYADIDIRGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MIASKEGHTEIVQDLLDAGTYVNIPDRSGDTVLIGAVRGGHVEIVRALLQKYADIDIRGQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DNKTALYWAVEKGNATMVRDILQCNPDTEICTKDGETPLIKATKMRNIEVVELLLDKGAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DNKTALYWAVEKGNATMVRDILQCNPDTEICTKDGETPLIKATKMRNIEVVELLLDKGAK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 VSAVDKKGDTPLHIAIRGRSRKLAELLLRNPKDGRLLYRPNKAGETPYNIDCSHQKSILT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VSAVDKKGDTPLHIAIRGRSRKLAELLLRNPKDGRLLYRPNKAGETPYNIDCSHQKSILT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 QIFGARHLSPTETDGDMLGYDLYSSALADILSEPTMQPPICVGLYAQWGSGKSFLLKKLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 QIFGARHLSPTETDGDMLGYDLYSSALADILSEPTMQPPICVGLYAQWGSGKSFLLKKLE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 DEMKTFAGQQIEPLFQFSWLIVFLTLLLCGGLGLLFAFTVHPNLGIAVSLSFLALLYIFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DEMKTFAGQQIEPLFQFSWLIVFLTLLLCGGLGLLFAFTVHPNLGIAVSLSFLALLYIFF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 IVIYFGGRREGESWNWAWVLSTRLARHIGYLELLLKLMFVNPPELPEQTTKALPVRFLFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 IVIYFGGRREGESWNWAWVLSTRLARHIGYLELLLKLMFVNPPELPEQTTKALPVRFLFT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 DYNRLSSVGGETSLAEMIATLSDACEREFGFLATRLFRVFKTEDTQGKKKWKKTCCLPSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DYNRLSSVGGETSLAEMIATLSDACEREFGFLATRLFRVFKTEDTQGKKKWKKTCCLPSF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 VIFLFIIGCIISGITLLAIFRVDPKHLTVNAVLISIASVVGLAFVLNCRTWWQVLDSLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VIFLFIIGCIISGITLLAIFRVDPKHLTVNAVLISIASVVGLAFVLNCRTWWQVLDSLLN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 SQRKRLHNAASKLHKLKSEGFMKVLKCEVELMARMAKTIDSFTQNQTRLVVIIDGLDACE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SQRKRLHNAASKLHKLKSEGFMKVLKCEVELMARMAKTIDSFTQNQTRLVVIIDGLDACE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 QDKVLQMLDTVRVLFSKGPFIAIFASDPHIIIKAINQNLNSVLRDSNINGHDYMRNIVHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 QDKVLQMLDTVRVLFSKGPFIAIFASDPHIIIKAINQNLNSVLRDSNINGHDYMRNIVHL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 PVFLNSRGLSNARKFLVTSATNGDVPCSDTTGIQEDADRRVSQNSLGEMTKLGSKTALNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PVFLNSRGLSNARKFLVTSATNGDVPCSDTTGIQEDADRRVSQNSLGEMTKLGSKTALNR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 RDTYRRRQMQRTITRQMSFDLTKLLVTEDWFSDISPQTMRRLLNIVSVTGRLLRANQISF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RDTYRRRQMQRTITRQMSFDLTKLLVTEDWFSDISPQTMRRLLNIVSVTGRLLRANQISF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 NWDRLASWINLTEQWPYRTSWLILYLEETEGIPDQMTLKTIYERISKNIPTTKDVEPLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 NWDRLASWINLTEQWPYRTSWLILYLEETEGIPDQMTLKTIYERISKNIPTTKDVEPLLE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 IDGDIRNFEVFLSSRTPVLVARDVKVFLPCTVNLDPKLREIIADVRAAREQISIGGLAYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 IDGDIRNFEVFLSSRTPVLVARDVKVFLPCTVNLDPKLREIIADVRAAREQISIGGLAYP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 PLPLHEGPPRAPSGYSQPPSVCSSTSFNGPFAGGVVSPQPHSSYYSGMTGPQHPFYNRPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PLPLHEGPPRAPSGYSQPPSVCSSTSFNGPFAGGVVSPQPHSSYYSGMTGPQHPFYNRPF
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 FAPYLYTPRYYPGGSQHLISRPSVKTSLPRDQNNGLEVIKEDAAEGLSSPTDSSRGSGPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 FAPYLYTPRYYPGGSQHLISRPSVKTSLPRDQNNGLEVIKEDAAEGLSSPTDSSRGSGPA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 PGPVVLLNSLNVDAVCEKLKQIEGLDQSMLPQYCTTIKKANINGRVLAQCNIDELKKEMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PGPVVLLNSLNVDAVCEKLKQIEGLDQSMLPQYCTTIKKANINGRVLAQCNIDELKKEMN
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 MNFGDWHLFRSTVLEMRNAESHVVPEDPRFLSESSSGPAPHGEPARRASHNELPHTELSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MNFGDWHLFRSTVLEMRNAESHVVPEDPRFLSESSSGPAPHGEPARRASHNELPHTELSS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 QTPYTLNFSFEELNTLGLDEGAPRHSNLSWQSQTRRTPSLSSLNSQDSSIEISKLTDKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 QTPYTLNFSFEELNTLGLDEGAPRHSNLSWQSQTRRTPSLSSLNSQDSSIEISKLTDKVQ
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 AEYRDAYREYIAQMSQLEGGPGSTTISGRSSPHSTYYMGQSSSGGSIHSNLEQEKGKDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 AEYRDAYREYIAQMSQLEGGPGSTTISGRSSPHSTYYMGQSSSGGSIHSNLEQEKGKDSE
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 PKPDDGRKSFLMKRGDVIDYSSSGVSTNDASPLDPITEEDEKSDQSGSKLLPGKKSSERS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PKPDDGRKSFLMKRGDVIDYSSSGVSTNDASPLDPITEEDEKSDQSGSKLLPGKKSSERS
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 SLFQTDLKLKGSGLRYQKLPSDEDESGTEESDNTPLLKDDKDRKAEGKVERVPKSPEHSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SLFQTDLKLKGSGLRYQKLPSDEDESGTEESDNTPLLKDDKDRKAEGKVERVPKSPEHSA
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 EPIRTFIKAKEYLSDALLDKKDSSDSGVRSSESSPNHSLHNEVADDSQLEKANLIELEDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 EPIRTFIKAKEYLSDALLDKKDSSDSGVRSSESSPNHSLHNEVADDSQLEKANLIELEDD
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA1 SHSGKRGIPHSLSGLQDPIIARMSICSEDKKSPSECSLIASSPEENWPACQKAYNLNRTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SHSGKRGIPHSLSGLQDPIIARMSICSEDKKSPSECSLIASSPEENWPACQKAYNLNRTP
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA1 STVTLNNNSAPANRANQNFDEMEGIRETSQVILRPSSSPNPTTIQNENLKSMTHKRSQRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 STVTLNNNSAPANRANQNFDEMEGIRETSQVILRPSSSPNPTTIQNENLKSMTHKRSQRS
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770
pF1KA1 SYTRLSKDPPELHAAASSESTGFGEERESIL
:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SYTRLSKDPPELHAAASSESTGFGEERESIL
1750 1760 1770
>>XP_016863596 (OMIM: 106410,600919) PREDICTED: ankyrin- (1797 aa)
initn: 651 init1: 651 opt: 664 Z-score: 422.6 bits: 91.4 E(85289): 8.5e-17
Smith-Waterman score: 664; 34.0% identity (63.9% similar) in 391 aa overlap (24-414:297-684)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MSVLISQSVINYVEEENIPALKALLEKCKDVDERNECGQTPLMIAAEQGNLEI
:::. . :.. : .:: .::. ..:
XP_016 RGGQIDAKTRDGLTPLHCAARSGHDQVVELLLERGAPLLARTKNGLSPLHMAAQGDHVEC
270 280 290 300 310 320
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 VKELIKNGANCNLEDLDNWTALISASKEGHVHIVEELLKCGVNLEHRDMGGWTALMWACY
::.:... : . :: ::: :.. :: .... :: .: . : ..:.: : ::
XP_016 VKHLLQHKAPVDDVTLDYLTALHVAAHCGHYRVTKLLLDKRANPNARALNGFTPLHIACK
330 340 350 360 370 380
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 KGRTDVVELLLSHGANPSVTGLYSVYPIIWAAGRGHADIVHLLLQNGAKVNCSDKYGTTP
:.: :.:::...::. .. .. :: :: :: .:: :::::::. . .. : :
XP_016 KNRIKVMELLVKYGASIQAITESGLTPIHVAAFMGHLNIVLLLLQNGASPDVTNIRGETA
390 400 410 420 430 440
180 190 200 210 220 230
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XP_016 HCAARSGHDQVVELLLERGAPLLARTKNGLSPLHMAAQGDHVECVKHLLQHKAPVDDVTL
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:.. ..... : ::
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: :. . : .. ::..:::. . . ..:
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:: . : ::. .:. .: . :: .:... :..
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XP_011 NGHVRISEILLDHGAPIQAKTKNGLSPIHMAAQGDHLDCVRLLLQYDAEIDDITLDHLTP
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XP_011 LHVAAHCGHHRVAKVLLDKGAKPNSRALNGFTPLHIACKKNHVRVMELLLKTGASIDAVT
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XP_011 ESGLTPLHVASFMGHLPIVKNLLQRGASPNVSNVKVETPLHMAARAGHTEVAKYLLQNKA
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.. ...:..: :. :.. :...::. .:. : . .. : :.::: :.. ..:.:
XP_011 KVNAKAKDDQTPLHCAARIGHTNMVKLLLENNANPNLATTAGHTPLHIAAREGHVETVLA
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XP_011 LLEKEASQACMTKKGFTPLHVAAKYGKVRVAELLLE--RDAH----PNAAGKNGLTPLHV
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:.. ..... : ::
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. .: .. . . : .. ::..:::. . .
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]