FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1256, 1670 aa
1>>>pF1KA1256 1670 - 1670 aa - 1670 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.4825+/-0.000708; mu= -25.5424+/- 0.044
mean_var=945.4675+/-197.216, 0's: 0 Z-trim(119.6): 200 B-trim: 0 in 0/58
Lambda= 0.041711
statistics sampled from 33718 (33920) to 33718 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.398), width: 16
Scan time: 12.900
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_062541 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform 3 [ (1670) 11010 680.3 3.9e-194
NP_006268 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform 1 [ (1697) 7225 452.5 1.4e-125
XP_016883922 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1650) 5078 323.3 1.1e-86
XP_016883924 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1613) 5071 322.9 1.5e-86
XP_016883923 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1645) 5015 319.5 1.5e-85
XP_016883925 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1608) 5000 318.6 2.8e-85
NP_671494 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform 2 [ (1249) 4127 266.0 1.5e-69
XP_016883919 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1679) 3835 248.5 3.7e-64
NP_001317939 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1716) 3835 248.5 3.7e-64
XP_016883918 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1684) 3802 246.5 1.5e-63
NP_003015 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform ITS (1721) 3802 246.6 1.5e-63
XP_016883917 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1721) 3802 246.6 1.5e-63
XP_016883926 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1185) 3700 240.2 8e-62
XP_016883921 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1660) 2069 142.3 3.6e-32
XP_016883920 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1665) 2036 140.3 1.4e-31
NP_001317937 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1149) 1640 116.3 1.6e-24
XP_016883929 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1112) 1633 115.8 2.1e-24
NP_001317940 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1144) 1615 114.8 4.6e-24
XP_011527994 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1107) 1608 114.3 6e-24
XP_011527995 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1020) 1386 100.9 6e-20
XP_016883930 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1025) 1386 100.9 6e-20
NP_001317938 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1215) 1386 101.0 6.8e-20
NP_001001132 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1220) 1386 101.0 6.8e-20
NP_001317941 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1178) 1379 100.6 8.9e-20
XP_016883927 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1183) 1379 100.6 8.9e-20
NP_009044 (OMIM: 190370) trichohyalin [Homo sapien (1943) 455 45.2 0.0068
XP_016872911 (OMIM: 604763) PREDICTED: rho guanine (1401) 442 44.3 0.0094
XP_016872910 (OMIM: 604763) PREDICTED: rho guanine (1441) 442 44.3 0.0096
XP_011541022 (OMIM: 604763) PREDICTED: rho guanine (1441) 442 44.3 0.0096
NP_001288013 (OMIM: 604763) rho guanine nucleotide (1441) 442 44.3 0.0096
XP_016872909 (OMIM: 604763) PREDICTED: rho guanine (1485) 442 44.3 0.0098
XP_006718868 (OMIM: 604763) PREDICTED: rho guanine (1519) 442 44.3 0.0099
NP_001185594 (OMIM: 604763) rho guanine nucleotide (1525) 442 44.3 0.01
>>NP_062541 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform 3 [Homo (1670 aa)
initn: 11010 init1: 11010 opt: 11010 Z-score: 3606.4 bits: 680.3 E(85289): 3.9e-194
Smith-Waterman score: 11010; 99.9% identity (100.0% similar) in 1670 aa overlap (1-1670:1-1670)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MMAQFPTAMNGGPNMWAITSEERTKHDRQFDNLKPSGGYITGDQARNFFLQSGLPAPVLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 MMAQFPTAMNGGPNMWAITSEERTKHDRQFDNLKPSGGYITGDQARNFFLQSGLPAPVLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPVVLPPIMKQPPMFSPLISARFGMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 EIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPVVLPPIMKQPPMFSPLISARFGMG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 SMPNLSIPQPLPPAAPITSLSSATSGTNLPPLMMPTPLVPSVSTSSLPNGTASLIQPLPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 SMPNLSIPQPLPPAAPITSLSSATSGTNLPPLMMPTPLVPSVSTSSLPNGTASLIQPLPI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 PYSSSTLPHGSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 PYSSSTLPHGSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PQPTRLKYRQKFNTLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADVDGDGQLKAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 PQPTRLKYRQKFNTLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADVDGDGQLKAE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 EFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQIDSINGTLPSYQKMQEEEPQKKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 EFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQIDSINGTLPSYQKMQEEEPQKKLP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 VTFEDKRKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 VTFEDKRKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 ELEKRLEKQRELERQREEERRKDIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQKNREQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 ELEKRLEKQRELERQREEERRKDIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQKNREQEE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 IVRLNSKKKNLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLKKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 IVRLNSKKKNLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLKKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 QQELQEYQNKLIYLVPEKQLLNERIKNMQFSNTPDSGVSLLHKKSLEKEELCQRLKEQLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 QQELQEYQNKLIYLVPEKQLLNERIKNMQFSNTPDSGVSLLHKKSLEKEELCQRLKEQLD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 ALEKETASKLSEMDSFNNQLKELRETYNTQQLALEQLYKIKRDKLKEIERKRLELMQKKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 ALEKETASKLSEMDSFNNQLKELRETYNTQQLALEQLYKIKRDKLKEIERKRLELMQKKK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEEEKQKRLQEEKTQEKIQEEERKAEEKQRKDKDTLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 LEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEEEKQKRLQEEKTQEKIQEEERKAEEKQRKDKDTLK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 AEEKKRETASVLVNYRALYPFEARNHDEMSFNSGDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 AEEKKRETASVLVNYRALYPFEARNHDEMSFNSGDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGW
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 FPCNYVEKMPSSENEKAVSPKKALLPPTVSLSATSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 FPCNYVEKMPSSENEKAVSPKKALLPPTVSLSATSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 TVNTSWQKKSAFTRTVSPGSVSPIHGQGQVVENLKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 TVNTSWQKKSAFTRTVSPGSVSPIHGQGQVVENLKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 LEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVKREEPEALYAAVNKKPTSAAYSVGEEYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 LEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVKREEPEALYAAVNKKPTSAAYSVGEEYI
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 ALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTGSIGDRSGIFPSNYVKPKDQESFGSASK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 ALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTGSIGDRSGIFPSNYVKPKDQESFGSASK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 SGASNKKPEIAQVTSAYVASGSEQLSLAPGQLILILKKNTSGWWQGELQARGKKRQKGWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 SGASNKKPEIAQVTSAYVASGSEQLSLAPGQLILILKKNTSGWWQGELQARGKKRQKGWF
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 PASHVKLLGPSSERATPAFHPVCQVIAMYDYAANNEDELSFSKGQLINVMNKDDPDWWQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 PASHVKLLGPSSERATPAFHPVCQVIAMYDYAANNEDELSFSKGQLINVMNKDDPDWWQG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 EINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTLDTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 EINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTLDTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMAD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 LQLVVEVFQKRMAESGFLTEGEMALIFVNWKELIMSNTKLLKALRVRKKTGGEKMPVQMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 LQLVVEVFQKRMAESGFLTEGEMALIFVNWKELIMSNTKLLKALRVRKKTGGEKMPVQMI
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 GDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTDEDTDFKEFLKKLASDPRCKGMPLSSFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 GDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTDEDTDFKEFLKKLASDPRCKGMPLSSFL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 LKPMQRITRYPLLIRSILENTPESHADHSSLKLALERAEELCSQVNEGVREKENSDRLEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 LKPMQRITRYPLLIRSILENTPESHADHSSLKLALERAEELCSQVNEGVREKENSDRLEW
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 IQAHVQCEGLAEQLIFNSLTNCLGPRKLLHSGKLYKTKSNKELHGFLFNDFLLLTYMVKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 IQAHVQCEGLAEQLIFNSLTNCLGPRKLLHSGKLYKTKSNKELHGFLFNDFLLLTYMVKQ
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 FAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMYKTPIFLNEVLVKLPTDPSSDEPVFHISHIDRVYTLRTD
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NP_062 FAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMYKTPIFLNEVLVKLPTDPSSDEPVFHISHIDRVYTLRTD
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 NINERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKQREKAYQARSQKTSGIGRLMVHVIEATELKACKPN
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 NINERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKKREKAYQARSQKTSGIGRLMVHVIEATELKACKPN
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 GKSNPYCEISMGSQSYTTRTIQDTLNPKWNFNCQFFIKDLYQDVLCLTLFDRDQFSPDDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 GKSNPYCEISMGSQSYTTRTIQDTLNPKWNFNCQFFIKDLYQDVLCLTLFDRDQFSPDDF
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670
pF1KA1 LGRTEIPVAKIRTEQESKGPMTRRLLLHEVPTGEVWVRFDLQLFEQKTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_062 LGRTEIPVAKIRTEQESKGPMTRRLLLHEVPTGEVWVRFDLQLFEQKTLL
1630 1640 1650 1660 1670
>>NP_006268 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform 1 [Homo (1697 aa)
initn: 6972 init1: 6972 opt: 7225 Z-score: 2375.3 bits: 452.5 E(85289): 1.4e-125
Smith-Waterman score: 10946; 98.4% identity (98.4% similar) in 1697 aa overlap (1-1670:1-1697)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MMAQFPTAMNGGPNMWAITSEERTKHDRQFDNLKPSGGYITGDQARNFFLQSGLPAPVLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MMAQFPTAMNGGPNMWAITSEERTKHDRQFDNLKPSGGYITGDQARNFFLQSGLPAPVLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPVVLPPIMKQPPMFSPLISARFGMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPVVLPPIMKQPPMFSPLISARFGMG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 SMPNLSIPQPLPPAAPITSLSSATSGTNLPPLMMPTPLVPSVSTSSLPNGTASLIQPLPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SMPNLSIPQPLPPAAPITSLSSATSGTNLPPLMMPTPLVPSVSTSSLPNGTASLIQPLPI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 PYSSSTLPHGSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PYSSSTLPHGSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PQPTRLKYRQKFNTLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADVDGDGQLKAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PQPTRLKYRQKFNTLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADVDGDGQLKAE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 EFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQIDSINGTLPSYQKMQEEEPQKKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQIDSINGTLPSYQKMQEEEPQKKLP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 VTFEDKRKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VTFEDKRKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 ELEKRLEKQRELERQREEERRKDIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQKNREQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ELEKRLEKQRELERQREEERRKDIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQKNREQEE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 IVRLNSKKKNLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLKKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IVRLNSKKKNLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLKKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 QQELQEYQNKLIYLVPEKQLLNERIKNMQFSNTPDSGVSLLHKKSLEKEELCQRLKEQLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QQELQEYQNKLIYLVPEKQLLNERIKNMQFSNTPDSGVSLLHKKSLEKEELCQRLKEQLD
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KA1 ALEKETASKLSEMDSFNNQLK---------------------------ELRETYNTQQLA
::::::::::::::::::::: ::::::::::::
NP_006 ALEKETASKLSEMDSFNNQLKCGNMDDSVLQCLLSLLSCLNNLFLLLKELRETYNTQQLA
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 LEQLYKIKRDKLKEIERKRLELMQKKKLEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEEEKQKRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LEQLYKIKRDKLKEIERKRLELMQKKKLEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEEEKQKRLQ
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 EEKTQEKIQEEERKAEEKQRKDKDTLKAEEKKRETASVLVNYRALYPFEARNHDEMSFNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EEKTQEKIQEEERKAEEKQRKDKDTLKAEEKKRETASVLVNYRALYPFEARNHDEMSFNS
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 GDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGWFPCNYVEKMPSSENEKAVSPKKALLPPTVSLSA
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NP_006 EVWVRFDLQLFEQKTLL
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XP_016 EQERKIIELEKQK---EEAQRRA-QERDKQWLEHVQQEDEHQRPRKLHEEEKLKREESVK
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. ::. .: : : : ...: :: : :. .: :::::
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.:::.:::::::::::::...:::::::::::::::: ::.::::.::::: .:::...:
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::::::.:.:. ::: :. .::::::::..:::: . :.::::::::::: ::::::.::
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:::::.:.:::.:: :..:::.:..:::::: :..:. :.:::.: . ::. :.: .:
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.:: :.:..::: .:::: :::.:.: :::::::::: .: ::: .. .. .: : :
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: ::: .:: ..: .:: :.: : ... : :....:.: .. ..:.:: : .:...
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. ::. .: : : : ...: :: : :. .: :::::
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:::.:.:::.... :::..: ::. .:::::: : ..:. :::: ::.::.: .:
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.. . .::: .. : ..:::: ... :: ::. :::. ::.:.:::: : ::::
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.
XP_016 EP
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pF1KA1 MMAQFPTAMNGGPNMWAITSEERTKHDRQFDNLKPSGGYITGDQARNFFLQSGLPAPVLA
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XP_016 QIWALADMNNDGRMDQVEFSIAMKLIKLKLQGYQLPSALPPVMKQQPV------------
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pF1KA1 SMPNLSIPQPLPPAAPITSLSSATSGTNLPPLMMPTPLVPSVSTSSLPNGTASLIQPLP-
..::: . . .::: ::. .:::::
XP_016 ------------------AISSAPAFAAVPPLA---------------NGAPPVIQPLPA
110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 IPYSSSTLPHGSSYSLMMGGFG-GASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEW
. . ..:::..::.: : ....:::::. :..: : ..::
XP_016 FAHPAATLPKSSSFSRSGPGSQLNTKLQKAQSF-DVASVP------------P---VAEW
140 150 160 170
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 AVPQPTRLKYRQKFNTLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADVDGDGQLK
:::: .:::::: ::. ::.:::.:.: :::. :.::.: :.:::.::.:.:.: ::.:
XP_016 AVPQSSRLKYRQLFNSHDKTMSGHLTGPQARTILMQSSLPQAQLASIWNLSDIDQDGKLT
180 190 200 210 220 230
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 AEEFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFR---GGKQIDSINGT-----LPSYQKM
:::::::::: :.: .::::: .:::: .::::: .:. :. :..: :: .
XP_016 AEEFILAMHLIDVAMSGQPLPPVLPPEYIPPSFRRVRSGSGISVISSTSVDQRLPEEPVL
240 250 260 270 280 290
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pF1KA1 QEEEPQ--KKLPVTFEDKRKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQ
..:. : ::::::::::.. :.::::.:::::::::.:::..: :: :: :. : :::.
XP_016 EDEQQQLEKKLPVTFEDKKRENFERGNLELEKRRQALLEQQRKEQERLAQLERAEQERKE
300 310 320 330 340 350
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 RELQEQEWKKQLELEKRLEKQRELERQREEERRKDIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQ
:: :::: :.::::::.:::::::::::::::::.::::::::.::::::.::::: :::
XP_016 RERQEQERKRQLELEKQLEKQRELERQREEERRKEIERREAAKRELERQRQLEWERNRRQ
360 370 380 390 400 410
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pF1KA1 ELLNQKNREQEEIVRLNSKKKNLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLKKQTQKTELEVLDK
:::::.:.:::.:: :..:::.:..:::::: :..:. :.:::.: . ::. :.: .:
XP_016 ELLNQRNKEQEDIVVLKAKKKTLEFELEALNDKKHQLEGKLQDIRCRLTTQRQEIESTNK
420 430 440 450 460 470
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pF1KA1 QCDLEIMEIKQLQQELQEYQNKLIYLVPEKQLLNERIKNMQFSNTP-DSGVSLLHKKSLE
. .:.: :: .:::.::: :. : :.::::.::...:..: .. :: :.: :..::
XP_016 SRELRIAEITHLQQQLQESQQMLGRLIPEKQILNDQLKQVQQNSLHRDSLVTL--KRALE
480 490 500 510 520 530
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pF1KA1 KEELC-QRLKEQLDALEKETASKLSEMDSFNNQLKELRETYNTQQLALEQLYKIKRDKLK
.:: :.:..::: .:::: :::.:.: :::::::::: .: ::: .. .. .: : :
XP_016 AKELARQHLRDQLDEVEKETRSKLQEIDIFNNQLKELREIHNKQQLQKQKSMEAERLKQK
540 550 560 570 580 590
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pF1KA1 EIERKRLELMQKKKLEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEE-EKQKRLQEE---KTQEKIQ
: ::: .:: ..: .:: :.: : ... : :....:.: .. ..:.:: : .:...
XP_016 EQERKIIELEKQK---EEAQRRA-QERDKQWLEHVQQEDEHQRPRKLHEEEKLKREESVK
600 610 620 630 640 650
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pF1KA1 E---EERKAEEKQRK-----------DKDTLKAE----EKKRETASV-----LVNYRALY
. ::. .: : : : ...: :: : :. .: :::::
XP_016 KKDGEEKGKQEAQDKLGRLFHQHQEPAKPAVQAPWSTAEKGPLTISAQENVKVVYYRALY
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pF1KA1 PFEARNHDEMSFNSGDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGWFPCNYVEKMPSSE------
:::.:.:::.... :::..:::. .:::::: : ..:. :::: ::.::.: .:
XP_016 PFESRSHDEITIQPGDIVMVDESQTGEPGWLGGELKGKTGWFPANYAEKIPENEVPAPVK
720 730 740 750 760 770
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pF1KA1 ----NEKAVSPKKAL--LPPTVSLSATSTSSEP-----LSSNQPASV-----TDYQNV--
. .: .:: :: : ...... :. : .::. :.:. :: ..
XP_016 PVTDSTSAPAPKLALRETPAPLAVTSSEPSTTPNNWADFSSTWPTSTNEKPETDNWDAWA
780 790 800 810 820 830
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pF1KA1 SFSNLTVNTSWQ--KKSAFTRTVSPGSV-SPIHGQGQVVENLKAQALCSWTAKKDNHLNF
. .::: .. : ..:::: ... :: ::. :::. ::.:.:::: : :::::::::
XP_016 AQPSLTVPSAGQLRQRSAFTPATATGSSPSPVLGQGEKVEGLQAQALYPWRAKKDNHLNF
840 850 860 870 880 890
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pF1KA1 SKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVKREEPEALYAAVNKKPTSAA
.:.:.:::::::. ::::::.: .:::::::::.: : : .: ::
XP_016 NKNDVITVLEQQDMWWFGEVQGQKGWFPKSYVKLISG-------P-------IRKSTS--
900 910 920 930
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pF1KA1 YSVGEEYIALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTGSIGDRSGIFPSNYVKPKDQ
. :: :..: . ..:
XP_016 ---------MDSGSSESPASL------------------------------KRVASP---
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pF1KA1 ESFGSASKSGASNKKPEIAQVTSAYVASGSEQLSLAPGQLILILKKNTSGWWQGELQARG
:.: .:.. ::::: ..:.:.: :::.::::::::: ::: .:::.:::::::
XP_016 -----AAKPVVSGE--EIAQVIASYTATGPEQLTLAPGQLILIRKKNPGGWWEGELQARG
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pF1KA1 KKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHP-------VCQVIAMYDYAANNEDELSFSKGQ
:::: :::::..::::.:.. . ::. : :::::.::::.:.:.:::.:.:::
XP_016 KKRQIGWFPANYVKLLSPGTSKITPTEPPKSTALAAVCQVIGMYDYTAQNDDELAFNKGQ
1010 1020 1030 1040 1050 1060
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pF1KA1 LINVMNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTLDTMQPIERKRQG
.:::.::.:::::.::.:: .:::::::::.::: :::::::.::. :: . : ::::::
XP_016 IINVLNKEDPDWWKGEVNGQVGLFPSNYVKLTTDMDPSQQWCSDLHLLDMLTPTERKRQG
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pF1KA1 YIHELIQTEERYMADLQLVVEVFQKRMAESGFLTEGEMALIFVNWKELIMSNTKLLKALR
:::::: ::: :. :::::.:.::: . :: .::: :.:.:::::::::: : :::::::
XP_016 YIHELIVTEENYVNDLQLVTEIFQKPLMESELLTEKEVAMIFVNWKELIMCNIKLLKALR
1130 1140 1150 1160 1170 1180
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pF1KA1 VRKKTGGEKMPVQMIGDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTDEDTDFKEFLKKL
:::: .::::::.::::::.:.: ::: :::::: :::::::.:::::: :::::.:.:
XP_016 VRKKMSGEKMPVKMIGDILSAQLPHMQPYIRFCSRQLNGAALIQQKTDEAPDFKEFVKRL
1190 1200 1210 1220 1230 1240
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pF1KA1 ASDPRCKGMPLSSFLLKPMQRITRYPLLIRSILENTPESHADHSSLKLALERAEELCSQV
: ::::::::::::.::::::.:::::.:..:::::::.: ::: :: :::.::::::::
XP_016 AMDPRCKGMPLSSFILKPMQRVTRYPLIIKNILENTPENHPDHSHLKHALEKAEELCSQV
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pF1KA1 NEGVREKENSDRLEWIQAHVQCEGLAEQLIFNSLTNCLGPRKLLHSGKLYKTKSNKELHG
:::::::::::::::::::::::::.:::.:::.::::::::.::::::::.::::::.:
XP_016 NEGVREKENSDRLEWIQAHVQCEGLSEQLVFNSVTNCLGPRKFLHSGKLYKAKSNKELYG
1310 1320 1330 1340 1350 1360
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pF1KA1 FLFNDFLLLTYMVKQFAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMYKTPIFLNEVLVKLPTDPSSDEPV
:::::::::: ..: .. :::..:.:: ::: :.:::::::::::::::::::::.:::.
XP_016 FLFNDFLLLTQITKPLG-SSGTDKVFSPKSNLQYKMYKTPIFLNEVLVKLPTDPSGDEPI
1370 1380 1390 1400 1410 1420
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pF1KA1 FHISHIDRVYTLRTDNINERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKQREKAYQARSQKTSGIGRLM
:::::::::::::...:::::::::::::::: ::.::::.::::: .:::...::::::
XP_016 FHISHIDRVYTLRAESINERTAWVQKIKAASELYIETEKKKREKAYLVRSQRATGIGRLM
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1550 1560 1570 1580 1590 1600
pF1KA1 VHVIEATELKACKPNGKSNPYCEISMGSQSYTTRTIQDTLNPKWNFNCQFFIKDLYQDVL
:.:.:. ::: :. .::::::::..:::: . :.::::::::::: ::::::.:: :.::
XP_016 VNVVEGIELKPCRSHGKSNPYCEVTMGSQCHITKTIQDTLNPKWNSNCQFFIRDLEQEVL
1490 1500 1510 1520 1530 1540
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pF1KA1 CLTLFDRDQFSPDDFLGRTEIPVAKIRTEQESKGPMTRRLLLHEVPTGEVWVRFDLQLFE
:.:.:.::::::::::::::: :: :. .: ::::.:. ::::::::::. ::.:::::.
XP_016 CITVFERDQFSPDDFLGRTEIRVADIKKDQGSKGPVTKCLLLHEVPTGEIVVRLDLQLFD
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1670
pF1KA1 QKTLL
.
XP_016 EP
>>NP_671494 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform 2 [Homo (1249 aa)
initn: 4139 init1: 4055 opt: 4127 Z-score: 1369.5 bits: 266.0 E(85289): 1.5e-69
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pF1KA1 MMAQFPTAMNGGPNMWAITSEERTKHDRQFDNLKPSGGYITGDQARNFFLQSGLPAPVLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 MMAQFPTAMNGGPNMWAITSEERTKHDRQFDNLKPSGGYITGDQARNFFLQSGLPAPVLA
10 20 30 40 50 60
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pF1KA1 EIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPVVLPPIMKQPPMFSPLISARFGMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 EIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPVVLPPIMKQPPMFSPLISARFGMG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 SMPNLSIPQPLPPAAPITSLSSATSGTNLPPLMMPTPLVPSVSTSSLPNGTASLIQPLPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 SMPNLSIPQPLPPAAPITSLSSATSGTNLPPLMMPTPLVPSVSTSSLPNGTASLIQPLPI
130 140 150 160 170 180
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pF1KA1 PYSSSTLPHGSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 PYSSSTLPHGSSYSLMMGGFGGASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEWAV
190 200 210 220 230 240
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pF1KA1 PQPTRLKYRQKFNTLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADVDGDGQLKAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 PQPTRLKYRQKFNTLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADVDGDGQLKAE
250 260 270 280 290 300
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pF1KA1 EFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQIDSINGTLPSYQKMQEEEPQKKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 EFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFRGGKQIDSINGTLPSYQKMQEEEPQKKLP
310 320 330 340 350 360
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pF1KA1 VTFEDKRKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 VTFEDKRKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQRELQEQEWKKQL
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pF1KA1 ELEKRLEKQRELERQREEERRKDIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQKNREQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 ELEKRLEKQRELERQREEERRKDIERREAAKQELERQRRLEWERIRRQELLNQKNREQEE
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pF1KA1 IVRLNSKKKNLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLKKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 IVRLNSKKKNLHLELEALNGKHQQISGRLQDVRLKKQTQKTELEVLDKQCDLEIMEIKQL
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pF1KA1 QQELQEYQNKLIYLVPEKQLLNERIKNMQFSNTPDSGVSLLHKKSLEKEELCQRLKEQLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 QQELQEYQNKLIYLVPEKQLLNERIKNMQFSNTPDSGVSLLHKKSLEKEELCQRLKEQLD
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pF1KA1 ALEKETASKLSEMDSFNNQLK---------------------------ELRETYNTQQLA
::::::::::::::::::::: ::::::::::::
NP_671 ALEKETASKLSEMDSFNNQLKCGNMDDSVLQCLLSLLSCLNNLFLLLKELRETYNTQQLA
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pF1KA1 LEQLYKIKRDKLKEIERKRLELMQKKKLEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEEEKQKRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 LEQLYKIKRDKLKEIERKRLELMQKKKLEDEAARKAKQGKENLWKENLRKEEEEKQKRLQ
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700 710 720 730 740 750
pF1KA1 EEKTQEKIQEEERKAEEKQRKDKDTLKAEEKKRETASVLVNYRALYPFEARNHDEMSFNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 EEKTQEKIQEEERKAEEKQRKDKDTLKAEEKKRETASVLVNYRALYPFEARNHDEMSFNS
730 740 750 760 770 780
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pF1KA1 GDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGWFPCNYVEKMPSSENEKAVSPKKALLPPTVSLSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 GDIIQVDEKTVGEPGWLYGSFQGNFGWFPCNYVEKMPSSENEKAVSPKKALLPPTVSLSA
790 800 810 820 830 840
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pF1KA1 TSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNLTVNTSWQKKSAFTRTVSPGSVSPIHGQGQVVEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 TSTSSEPLSSNQPASVTDYQNVSFSNLTVNTSWQKKSAFTRTVSPGSVSPIHGQGQVVEN
850 860 870 880 890 900
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pF1KA1 LKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 LKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPGSEVK
910 920 930 940 950 960
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pF1KA1 REEPEALYAAVNKKPTSAAYSVGEEYIALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 REEPEALYAAVNKKPTSAAYSVGEEYIALYPYSSVEPGDLTFTEGEEILVTQKDGEWWTG
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pF1KA1 SIGDRSGIFPSNYVKPKDQESFGSASKSGASNKKPEIAQVTSAYVASGSEQLSLAPGQLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 SIGDRSGIFPSNYVKPKDQESFGSASKSGASNKKPEIAQVTSAYVASGSEQLSLAPGQLI
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pF1KA1 LILKKNTSGWWQGELQARGKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHPVCQVIAMYDYAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 LILKKNTSGWWQGELQARGKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHPVCQVIAMYDYAA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KA1 NNEDELSFSKGQLINVMNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 NNEDELSFSKGQLINVMNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCADLQTL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KA1 DTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMADLQLVVEVFQKRMAESGFLTEGEMALIFVNWKEL
:::::::::::::::::::::::::::::::::: . .: :
NP_671 DTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMADLQLVVEVRRLLLASSRGICCLS
1210 1220 1230 1240
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KA1 IMSNTKLLKALRVRKKTGGEKMPVQMIGDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTD
>>XP_016883919 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin-1 i (1679 aa)
initn: 5373 init1: 1864 opt: 3835 Z-score: 1272.9 bits: 248.5 E(85289): 3.7e-64
Smith-Waterman score: 6537; 59.6% identity (78.8% similar) in 1748 aa overlap (2-1666:1-1678)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MMAQFPTAMNGGPNMWAITSEERTKHDRQFDNLKPSGGYITGDQARNFFLQSGLPAPVLA
:::::: ..:. ..:::: :::.:::.:: .::: .:.::::::::::.::::: ::::
XP_016 MAQFPTPFGGSLDIWAITVEERAKHDQQFHSLKPISGFITGDQARNFFFQSGLPQPVLA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EIWALSDLNKDGKMDQQEFSIAMKLIKLKLQGQQLPVVLPPIMKQPPMFSPLISARFGMG
.::::.:.:.::.::: ::::::::::::::: ::: .:::.::: :.
XP_016 QIWALADMNNDGRMDQVEFSIAMKLIKLKLQGYQLPSALPPVMKQQPV------------
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KA1 SMPNLSIPQPLPPAAPITSLSSATSGTNLPPLMMPTPLVPSVSTSSLPNGTASLIQPLP-
..::: . . .::: ::. .:::::
XP_016 ------------------AISSAPAFAAVPPLA---------------NGAPPVIQPLPA
110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 IPYSSSTLPHGSSYSLMMGGFG-GASIQKAQSLIDLGSSSSTSSTASLSGNSPKTGTSEW
. . ..:::..::.: : ....:::::. :..: : ..::
XP_016 FAHPAATLPKSSSFSRSGPGSQLNTKLQKAQSF-DVASVP------------P---VAEW
140 150 160 170
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 AVPQPTRLKYRQKFNTLDKSMSGYLSGFQARNALLQSNLSQTQLATIWTLADVDGDGQLK
:::: .:::::: ::. ::.:::.:.: :::. :.::.: :.:::.::.:.:.: ::.:
XP_016 AVPQSSRLKYRQLFNSHDKTMSGHLTGPQARTILMQSSLPQAQLASIWNLSDIDQDGKLT
180 190 200 210 220 230
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 AEEFILAMHLTDMAKAGQPLPLTLPPELVPPSFR---GGKQIDSINGT-----LPSYQKM
:::::::::: :.: .::::: .:::: .::::: .:. :. :..: :: .
XP_016 AEEFILAMHLIDVAMSGQPLPPVLPPEYIPPSFRRVRSGSGISVISSTSVDQRLPEEPVL
240 250 260 270 280 290
360 370 380 390 400
pF1KA1 QEEEPQ--KKLPVTFEDKRKANYERGNMELEKRRQALMEQQQREAERKAQKEKEEWERKQ
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1670
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