FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1261, 773 aa 1>>>pF1KA1261 773 - 773 aa - 773 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8818+/-0.00112; mu= -8.9074+/- 0.067 mean_var=393.5719+/-83.144, 0's: 0 Z-trim(114.0): 69 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.064649 statistics sampled from 14483 (14551) to 14483 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.763), E-opt: 0.2 (0.447), width: 16 Scan time: 4.280 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS43837.1 TLE4 gene_id:7091|Hs108|chr9 ( 773) 5270 506.2 8.2e-143 CCDS6661.1 TLE1 gene_id:7088|Hs108|chr9 ( 770) 4564 440.3 5.5e-123 CCDS65070.1 TLE4 gene_id:7091|Hs108|chr9 ( 748) 4413 426.2 9.3e-119 CCDS61692.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 764) 4351 420.5 5.2e-117 CCDS61691.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 767) 4336 419.1 1.4e-116 CCDS45294.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 769) 4331 418.6 1.9e-116 CCDS45293.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 772) 4316 417.2 5e-116 CCDS61689.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 762) 4274 413.3 7.5e-115 CCDS58375.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 760) 4002 387.9 3.3e-107 CCDS75851.1 TLE4 gene_id:7091|Hs108|chr9 ( 704) 3226 315.5 1.9e-85 CCDS65069.1 TLE4 gene_id:7091|Hs108|chr9 ( 805) 3219 314.9 3.3e-85 CCDS73747.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 ( 699) 2965 291.2 4e-78 CCDS45911.1 TLE2 gene_id:7089|Hs108|chr19 ( 743) 2237 223.3 1.1e-57 CCDS74255.1 TLE2 gene_id:7089|Hs108|chr19 ( 744) 2237 223.3 1.1e-57 CCDS45912.1 TLE2 gene_id:7089|Hs108|chr19 ( 621) 2233 222.8 1.3e-57 CCDS45913.1 TLE2 gene_id:7089|Hs108|chr19 ( 706) 1859 188.0 4.5e-47 CCDS12102.1 AES gene_id:166|Hs108|chr19 ( 197) 887 96.9 3.3e-20 CCDS12101.1 AES gene_id:166|Hs108|chr19 ( 264) 854 93.9 3.5e-19 CCDS45910.1 TLE6 gene_id:79816|Hs108|chr19 ( 572) 735 83.1 1.4e-15 CCDS12100.1 TLE6 gene_id:79816|Hs108|chr19 ( 449) 720 81.6 3e-15 >>CCDS43837.1 TLE4 gene_id:7091|Hs108|chr9 (773 aa) initn: 5270 init1: 5270 opt: 5270 Z-score: 2677.4 bits: 506.2 E(32554): 8.2e-143 Smith-Waterman score: 5270; 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83.1% identity (93.8% similar) in 770 aa overlap (8-773:1-764) 10 20 30 40 50 pF1KA1 MIRDLSKMYPQTRHPAPHQPAQP-FKFTISESCDRIKEEFQFLQAQYHSLKLECEKLASE :::: ::::::::.:: ::::..:::::::.:::::::::::::.: .:::.: CCDS61 MYPQGRHPAPHQPGQPGFKFTVAESCDRIKDEFQFLQAQYHSLKVEYDKLANE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KA1 KTEMQRHYVMYYEMSYGLNIEMHKQAEIVKRLNAICAQVIPFLSQEHQQQVVQAVERAKQ :::::::::::::::::::::::::.::.::::.: ::..:::::::::::.:::::::: CCDS61 KTEMQRHYVMYYEMSYGLNIEMHKQTEIAKRLNTILAQIMPFLSQEHQQQVAQAVERAKQ 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 VTMAELNAIIGQQ-LQAQHLSHG-HGLPVPLTPHPSGLQPPAIPPI-GSSAGLLALSSAL :::.::::::::: ::::::::. :: :: : :::::::::.:::. :::.:::::. :: CCDS61 VTMTELNAIIGQQQLQAQHLSHATHGPPVQLPPHPSGLQPPGIPPVTGSSSGLLALG-AL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 GGQSHLPIKDEKKHHDNDHQRDRDSIKSSSVSPSASFRGAEKHRNSADYSSESKKQKTEE :.:.:: .::::.::. :: :.:.: ..::::: :.:..::::.::::: :.::.:.:: CCDS61 GSQAHLTVKDEKNHHELDH-RERESSANNSVSPSESLRASEKHRGSADYSMEAKKRKAEE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 KEIAARYDSDGEKSDDNLVVDVSNEDPSSPRGSPAHSPRENGLDKTRLLKKDAPISPASI :. .::::::.:::: ::::::::::..:: :::::: ::::::.: :::::: ::::. CCDS61 KDSLSRYDSDGDKSDD-LVVDVSNEDPATPRVSPAHSPPENGLDKARSLKKDAPTSPASV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 ASSSSTPSSKSKELSLNEKSTTPVSKSNTPTPRTDAPTPGSNSTPGLRPVPGKPPGVDPL ::::::::::.:.:. :.::.:: ::::::::.::::::...::::: .::::::.::. CCDS61 ASSSSTPSSKTKDLGHNDKSSTPGLKSNTPTPRNDAPTPGTSTTPGLRSMPGKPPGMDPI 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KA1 ASSLRTPMAVPCPYPTPFGIVPHAGMNGELTSPGAAYAGLHNISPQMSAAAAAAAAAAAY ::.::::... : .::... : ::: :::::: ::::::: ::::::::::::: : CCDS61 ASALRTPISITSSYAAPFAMMSHHEMNGSLTSPGA-YAGLHNIPPQMSAAAAAAAAA--Y 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KA1 GRSPVVGFDPHHHMRVPAIPPNLTGIPGGKPAYSFHVSADGQMQPVPFPPDALIGPGIPR ::::.:::::: ::. ..: .:..:::::::::::::::::::::::: ::: :::::: CCDS61 GRSPMVGFDPHPPMRATGLPSSLASIPGGKPAYSFHVSADGQMQPVPFPHDALAGPGIPR 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KA1 HARQINTLNHGEVVCAVTISNPTRHVYTGGKGCVKVWDISHPGNKSPVSQLDCLNRDNYI ::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::.::.:::.:::::::::::: CCDS61 HARQINTLSHGEVVCAVTISNPTRHVYTGGKGCVKIWDISQPGSKSPISQLDCLNRDNYI 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KA1 RSCRLLPDGRTLIVGGEASTLSIWDLAAPTPRIKAELTSSAPACYALAISPDSKVCFSCC :::.:::::::::::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::.::::::: CCDS61 RSCKLLPDGRTLIVGGEASTLTIWDLASPTPRIKAELTSSAPACYALAISPDAKVCFSCC 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KA1 SDGNIAVWDLHNQTLVRQFQGHTDGASCIDISNDGTKLWTGGLDNTVRSWDLREGRQLQQ ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 SDGNIAVWDLHNQTLVRQFQGHTDGASCIDISHDGTKLWTGGLDNTVRSWDLREGRQLQQ 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KA1 HDFTSQIFSLGYCPTGEWLAVGMENSNVEVLHVTKPDKYQLHLHESCVLSLKFAHCGKWF ::::::::::::::::::::::::.::::::: :::::::::::::::::::::.::::: CCDS61 HDFTSQIFSLGYCPTGEWLAVGMESSNVEVLHHTKPDKYQLHLHESCVLSLKFAYCGKWF 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KA1 VSTGKDNLLNAWRTPYGASIFQSKESSSVLSCDISVDDKYIVTGSGDKKATVYEVIY :::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::: CCDS61 VSTGKDNLLNAWRTPYGASIFQSKESSSVLSCDISADDKYIVTGSGDKKATVYEVIY 710 720 730 740 750 760 >>CCDS61691.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 (767 aa) initn: 3526 init1: 3424 opt: 4336 Z-score: 2206.6 bits: 419.1 E(32554): 1.4e-116 Smith-Waterman score: 4336; 82.8% identity (93.4% similar) in 773 aa overlap (8-773:1-767) 10 20 30 40 50 pF1KA1 MIRDLSKMYPQTRHPAPHQPAQP-FKFTISESCDRIKEEFQFLQAQYHSLKLECEKLASE :::: ::::::::.:: ::::..:::::::.:::::::::::::.: .:::.: CCDS61 MYPQGRHPAPHQPGQPGFKFTVAESCDRIKDEFQFLQAQYHSLKVEYDKLANE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KA1 KTEMQRHYVMYYEMSYGLNIEMHKQAEIVKRLNAICAQVIPFLSQEHQQQVVQAVERAKQ :::::::::::::::::::::::::.::.::::.: ::..:::::::::::.:::::::: CCDS61 KTEMQRHYVMYYEMSYGLNIEMHKQTEIAKRLNTILAQIMPFLSQEHQQQVAQAVERAKQ 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 VTMAELNAIIGQQ-LQAQHLSHG-HGLPVPLTPHPSGLQPPAIPPI-GSSAGLLALSSAL :::.::::::::: ::::::::. :: :: : :::::::::.:::. :::.:::::. :: CCDS61 VTMTELNAIIGQQQLQAQHLSHATHGPPVQLPPHPSGLQPPGIPPVTGSSSGLLALG-AL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 GGQSHLPIKDEKKHHDNDHQRDRDSIKSSSVSPSASFRGAEKHRNSADYSSESKKQKTEE :.:.:: .::::.::. :: :.:.: ..::::: :.:..::::.::::: :.::.:.:: CCDS61 GSQAHLTVKDEKNHHELDH-RERESSANNSVSPSESLRASEKHRGSADYSMEAKKRKAEE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 KEIAARYDSDGEKSDDNLVVDVSNEDPSSPRGSPAHSPRENGLDKTRLLKKDAPISPASI :. .::::::.:::: ::::::::::..:: :::::: ::::::.: :::::: ::::. 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CCDS45 KDSLSRYDSDGDKSDD-LVVDVSNEDPATPRVSPAHSPPENGLDKARSLKKDAPTSPASV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 ASSSSTPSSKSKELSLNEKSTTPVSKSNTPTPRTDAPTPGSNSTPGLRPVPGKPPGVDPL ::::::::::.:.:. :.::.:: ::::::::.::::::...::::: .::::::.::. CCDS45 ASSSSTPSSKTKDLGHNDKSSTPGLKSNTPTPRNDAPTPGTSTTPGLRSMPGKPPGMDPI 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KA1 ASSLRTPMAVPCPYPTPFGIVPHAGMNGELTSPGAAYAGLHNISPQMSAAAAAAAAAAAY ::.::::... : .::... : ::: :::::: ::::::: ::::::::::::: : CCDS45 ASALRTPISITSSYAAPFAMMSHHEMNGSLTSPGA-YAGLHNIPPQMSAAAAAAAAA--Y 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KA1 GRSPVV-----GFDPHHHMRVPAIPPNLTGIPGGKPAYSFHVSADGQMQPVPFPPDALIG ::::.: ::::: ::. ..: .:..:::::::::::::::::::::::: ::: : CCDS45 GRSPMVSFGAVGFDPHPPMRATGLPSSLASIPGGKPAYSFHVSADGQMQPVPFPHDALAG 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KA1 PGIPRHARQINTLNHGEVVCAVTISNPTRHVYTGGKGCVKVWDISHPGNKSPVSQLDCLN :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::.::.:::.::::::: CCDS45 PGIPRHARQINTLSHGEVVCAVTISNPTRHVYTGGKGCVKIWDISQPGSKSPISQLDCLN 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KA1 RDNYIRSCRLLPDGRTLIVGGEASTLSIWDLAAPTPRIKAELTSSAPACYALAISPDSKV ::::::::.:::::::::::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::.:: CCDS45 RDNYIRSCKLLPDGRTLIVGGEASTLTIWDLASPTPRIKAELTSSAPACYALAISPDAKV 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KA1 CFSCCSDGNIAVWDLHNQTLVRQFQGHTDGASCIDISNDGTKLWTGGLDNTVRSWDLREG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: CCDS45 CFSCCSDGNIAVWDLHNQTLVRQFQGHTDGASCIDISHDGTKLWTGGLDNTVRSWDLREG 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KA1 RQLQQHDFTSQIFSLGYCPTGEWLAVGMENSNVEVLHVTKPDKYQLHLHESCVLSLKFAH :::::::::::::::::::::::::::::.::::::: :::::::::::::::::::::. 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CCDS45 KDSLSRYDSDGDKSDD-LVVDVSNEDPATPRVSPAHSPPENGLDKARSLKKDAPTSPASV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 ASSSSTPSSKSKELSLNEKSTTPVSKSNTPTPRTDAPTPGSNSTPGLRPVPGKPPGVDP- ::::::::::.:.:. :.::.:: ::::::::.::::::...::::: .::::::.:: CCDS45 ASSSSTPSSKTKDLGHNDKSSTPGLKSNTPTPRNDAPTPGTSTTPGLRSMPGKPPGMDPI 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KA1 --LASSLRTPMAVPCPYPTPFGIVPHAGMNGELTSPGAAYAGLHNISPQMSAAAAAAAAA .::.::::... : .::... : ::: :::::: ::::::: ::::::::::::: CCDS45 GIMASALRTPISITSSYAAPFAMMSHHEMNGSLTSPGA-YAGLHNIPPQMSAAAAAAAAA 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KA1 AAYGRSPVV-----GFDPHHHMRVPAIPPNLTGIPGGKPAYSFHVSADGQMQPVPFPPDA :::::.: ::::: ::. ..: .:..:::::::::::::::::::::::: :: CCDS45 --YGRSPMVSFGAVGFDPHPPMRATGLPSSLASIPGGKPAYSFHVSADGQMQPVPFPHDA 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KA1 LIGPGIPRHARQINTLNHGEVVCAVTISNPTRHVYTGGKGCVKVWDISHPGNKSPVSQLD : ::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::.::.:::.:::: CCDS45 LAGPGIPRHARQINTLSHGEVVCAVTISNPTRHVYTGGKGCVKIWDISQPGSKSPISQLD 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KA1 CLNRDNYIRSCRLLPDGRTLIVGGEASTLSIWDLAAPTPRIKAELTSSAPACYALAISPD :::::::::::.:::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::: CCDS45 CLNRDNYIRSCKLLPDGRTLIVGGEASTLTIWDLASPTPRIKAELTSSAPACYALAISPD 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KA1 SKVCFSCCSDGNIAVWDLHNQTLVRQFQGHTDGASCIDISNDGTKLWTGGLDNTVRSWDL .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::: CCDS45 AKVCFSCCSDGNIAVWDLHNQTLVRQFQGHTDGASCIDISHDGTKLWTGGLDNTVRSWDL 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KA1 REGRQLQQHDFTSQIFSLGYCPTGEWLAVGMENSNVEVLHVTKPDKYQLHLHESCVLSLK ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::: ::::::::::::::::::: CCDS45 REGRQLQQHDFTSQIFSLGYCPTGEWLAVGMESSNVEVLHHTKPDKYQLHLHESCVLSLK 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KA1 FAHCGKWFVSTGKDNLLNAWRTPYGASIFQSKESSSVLSCDISVDDKYIVTGSGDKKATV ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: CCDS45 FAYCGKWFVSTGKDNLLNAWRTPYGASIFQSKESSSVLSCDISADDKYIVTGSGDKKATV 710 720 730 740 750 760 770 pF1KA1 YEVIY ::::: CCDS45 YEVIY 770 >>CCDS61689.1 TLE3 gene_id:7090|Hs108|chr15 (762 aa) initn: 2506 init1: 2461 opt: 4274 Z-score: 2175.4 bits: 413.3 E(32554): 7.5e-115 Smith-Waterman score: 4274; 82.5% identity (93.2% similar) in 767 aa overlap (16-773:2-762) 10 20 30 40 50 pF1KA1 MIRDLSKMYPQTRHPAPHQPAQP-FKFTISESCDRIKEEFQFLQAQYHSLKLECEKLASE :::::.:: ::::..:::::::.:::::::::::::.: .:::.: CCDS61 MAPHQPGQPGFKFTVAESCDRIKDEFQFLQAQYHSLKVEYDKLANE 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KA1 KTEMQRHYVMYYEMSYGLNIEMHKQAEIVKRLNAICAQVIPFLSQEHQQQVVQAVERAKQ :::::::::::::::::::::::::.::.::::.: ::..:::::::::::.:::::::: CCDS61 KTEMQRHYVMYYEMSYGLNIEMHKQTEIAKRLNTILAQIMPFLSQEHQQQVAQAVERAKQ 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 VTMAELNAIIGQQ-LQAQHLSHG-HGLPVPLTPHPSGLQPPAIPPI-GSSAGLLALSSAL :::.::::::::: ::::::::. :: :: : :::::::::.:::. :::.:::::. :: CCDS61 VTMTELNAIIGQQQLQAQHLSHATHGPPVQLPPHPSGLQPPGIPPVTGSSSGLLALG-AL 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 GGQSHLPIKDEKKHHDNDHQRDRDSIKSSSVSPSASFRGAEKHRNSADYSSESKKQKTEE :.:.:: .::::.::. :: :.:.: ..::::: :.:..::::.::::: :.::.:.:: CCDS61 GSQAHLTVKDEKNHHELDH-RERESSANNSVSPSESLRASEKHRGSADYSMEAKKRKAEE 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 KEIAARYDSDGEKSDDNLVVDVSNEDPSSPRGSPAHSPRENGLDKTRLLKKDAPISPASI :. .::::::.:::: ::::::::::..:: :::::: ::::::.: :::::: ::::. 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