FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1275, 1177 aa 1>>>pF1KA1275 1177 - 1177 aa - 1177 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.4360+/-0.000684; mu= -25.2980+/- 0.042 mean_var=703.4604+/-145.503, 0's: 0 Z-trim(117.1): 401 B-trim: 33 in 1/57 Lambda= 0.048356 statistics sampled from 28402 (28806) to 28402 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.338), width: 16 Scan time: 14.720 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001287795 (OMIM: 607307) filamin-A-interacting (1177) 7418 534.5 1.5e-150 XP_005248770 (OMIM: 607307) PREDICTED: filamin-A-i (1213) 7337 528.8 7.9e-149 NP_056502 (OMIM: 607307) filamin-A-interacting pro (1213) 7337 528.8 7.9e-149 NP_001276916 (OMIM: 607307) filamin-A-interacting (1216) 7337 528.8 7.9e-149 XP_005248772 (OMIM: 607307) PREDICTED: filamin-A-i (1154) 7210 519.9 3.5e-146 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7337 opt: 7337 Z-score: 2793.0 bits: 528.8 E(85289): 7.9e-149 Smith-Waterman score: 7337; 99.7% identity (99.8% similar) in 1164 aa overlap (1-1164:4-1167) 10 20 30 40 50 pF1KA1 MRSRNQGGESASDGHISCPKPSIIGNAGEKSLSEDAKKKRKSNRKEDDVMASGTVKR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::: NP_001 MVGMRSRNQGGESASDGHISCPKPSIIGNAGEKSLSEDAKKKKKSNRKEDDVMASGTVKR 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KA1 HLKTSGECERKTKKSLELSKEDLIQLLSIMEGELQAREDVIHMLKTEKTKPEVLEAHYGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 HLKTSGECERKTKKSLELSKEDLIQLLSIMEGELQAREDVIHMLKTEKTKPEVLEAHYGS 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 AEPEKVLRVLHRDAILAQEKSIGEDVYEKPISELDRLEEKQKETYRRMLEQLLLAEKCHR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 AEPEKVLRVLHRDAILAQEKSIGEDVYEKPISELDRLEEKQKETYRRMLEQLLLAEKCHR 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 RTVYELENEKHKHTDYMNKSDDFTNLLEQERERLKKLLEQEKAYQARKEKENAKRLNKLR 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NP_001 ELTKLKSFALMVVDEQQRLTAQLTLQRQKIQELTTNAKETHTKLALAEARVQEEEQKATR 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 LEVDFEHKASRFSQEHEEMNAKLANQESHNRQLRLKLVGLTQRIEELEEINKNLQKAEEE :: ... ....: :... . :::.:..:.::::. ::..:...:.:::: :..:.::::: NP_001 LEKELQTQTTKFHQDQDTIMAKLTNEDSQNRQLQQKLAALSRQIDELEETNRSLRKAEEE 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KA1 LQELRDKIAKGECGNSSLMAEVENLRKRVLEMEGKDEEITKTESQCRELRKKLQEEEHHS ::....::.::: ::...:::::.::::::.:::::::. : : :::.: :.:..: .: NP_001 LQDIKEKISKGEYGNAGIMAEVEELRKRVLDMEGKDEELIKMEEQCRDLNKRLERETLQS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KA1 KELRLEVEKLQKRMSELEKLEEAFSKSKSECTQLHLNLEKEKNLTKDLLNELEVVKSRVK :...::::::.::. :::::.::.:::.:: .:. :::::. ::.: .::: .: :.: NP_001 KDFKLEVEKLSKRIMALEKLEDAFNKSKQECYSLKCNLEKERMTTKQLSQELESLKVRIK 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KA1 ELECSESRLEKAELSLKDDLTKLKSFTVMLVDERKNMMEKIKQEERKVDGLNKNFKVEQG ::: ::::::.:..::.::::::..:::.:::::.: ::.:. : :... .....:::. 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NP_001 KVTTVTEKLIEETKRALKSKTDVEEKMYSVTKERDDLKNKLKAEEEKGNDLLSRVNMLKN 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KA1 RLDGIEEVEREITRGR----SRKGSELTCPEDNKIKELTLEIERLKKRLQQLEVVEGDLM ::...: .:... ... : :.. :.::::::. :.:::: .:......: ::: NP_001 RLQSLEAIEKDFLKNKLNQDSGKSTTALHQENNKIKELSQEVERLKLKLKDMKAIEDDLM 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KA1 KTEDEYDQLEQKFRTEQDKANFLSQQLEEIKHQIAKNKAIEKGEVVSQEAELRHRFRLEE ::::::. ::... .:.:::.:::..::..: ..:: : :: :. :.: : .:.. :: NP_001 KTEDEYETLERRYANERDKAQFLSKELEHVKMELAKYKLAEKTET-SHEQWLFKRLQEEE 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KA1 AKSRDLKAEVQALKEKIHELMNKEDQLSQLQVDYSVLQQRFMEEENKNKNMGQEVLNLTK ::: :. ::.:::::::: : :: . .:: :.::::... ..::.:...:.:. :::: NP_001 AKSGHLSREVDALKEKIHEYMATEDLICHLQGDHSVLQKKLNQQENRNRDLGREIENLTK 710 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 830 pF1KA1 ELELSKRYSRALRPSVNGRRMVDVPVTSTGVQTDAVSGEAAEEETPAVFIRKSFQEENHI ::: ...:..::::.::::. : : : :::.::..: . .. . : .. . . 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NP_878 MRSR--GSDTEGSAQKKFPRHTK-GHSFQGPKNMKH--RQQDKDSPSESDVILP-CPKAE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KA1 LKTSGECERKTKKSLELSKEDLIQLLSIMEGELQAREDVIHMLKTEKTKPEVLEAHYGSA ::. ... .::..::. ::::.:::::::..:: .::.:: .:::.:: . NP_878 KPHSGN----GHQAEDLSRDDLLFLLSILEGELQARDEVIGILKAEKMDLALLEAQYGFV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 EPEKVLRVLHRDAILAQEKSIGEDVYEKPISELDRLEEKQKETYRRMLEQLLLAEKCHRR :.:::..:.:::. :. ::.::::..:::.. ::.::.:::.: :::.::: .:. NP_878 TPKKVLEALQRDAFQAKSTPWQEDIYEKPMNELDKVVEKHKESYRRILGQLLVAEKSRRQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 TVYELENEKHKHTDYMNKSDDFTNLLEQERERLKKLLEQEKAYQARKEKENAKRLNKLRD :. :::.::.:: .::.:::.: ::::: ::::::..:: : .::.:. ::.. :.. NP_878 TILELEEEKRKHKEYMEKSDEFICLLEQECERLKKLIDQEIKSQEEKEQEKEKRVTTLKE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 ELVKLKSFALMLVDERQMHIEQLGLQSQKVQDLTQKLREEEEKLKAITSKSKEDRQKLLK ::.::::::::.:::.: :: :: ::.:.:: . .: . :: .. .:..:: . 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NP_878 ELEAIESRLEKTEFTLKEDLTKLKTLTVMFVDERKTMSEKLKKTEDKLQAASSQLQVEQN 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KA1 KVMDVTEKLIEESKKLLKLKSEMEEKVYNLTRERDELIGKLKSEEEKSSELSCSVDLLKK :: ::::::::.:. :: :...:::.:..:.:::.: .:::.::::...: :..::. 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