Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1282
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1282, 1083 aa
1>>>pF1KA1282 1083 - 1083 aa - 1083 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.8098+/-0.00112; mu= -1.1468+/- 0.067
mean_var=353.2750+/-74.090, 0's: 0 Z-trim(114.7): 43 B-trim: 482 in 2/50
Lambda= 0.068237
statistics sampled from 15187 (15225) to 15187 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.766), E-opt: 0.2 (0.468), width: 16
Scan time: 5.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8786.1 KCNH3 gene_id:23416|Hs108|chr12 (1083) 7365 739.8 7.5e-213
CCDS2632.1 KCNH8 gene_id:131096|Hs108|chr3 (1107) 1336 146.3 3.6e-34
CCDS1496.1 KCNH1 gene_id:3756|Hs108|chr1 ( 989) 1268 139.6 3.4e-32
CCDS11420.1 KCNH4 gene_id:23415|Hs108|chr17 (1017) 1168 129.7 3.2e-29
CCDS5911.1 KCNH2 gene_id:3757|Hs108|chr7 ( 819) 986 111.7 6.7e-24
CCDS5910.1 KCNH2 gene_id:3757|Hs108|chr7 (1159) 986 111.9 8.7e-24
CCDS11638.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs108|chr17 ( 994) 927 106.0 4.3e-22
CCDS62290.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs108|chr17 ( 958) 914 104.7 1e-21
CCDS2219.1 KCNH7 gene_id:90134|Hs108|chr2 (1196) 894 102.8 4.7e-21
CCDS11639.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs108|chr17 ( 905) 832 96.6 2.6e-19
CCDS31015.1 KCNH1 gene_id:3756|Hs108|chr1 ( 962) 803 93.8 2e-18
CCDS9756.1 KCNH5 gene_id:27133|Hs108|chr14 ( 988) 778 91.3 1.1e-17
CCDS45122.1 KCNH5 gene_id:27133|Hs108|chr14 ( 611) 654 78.9 3.7e-14
>>CCDS8786.1 KCNH3 gene_id:23416|Hs108|chr12 (1083 aa)
initn: 7365 init1: 7365 opt: 7365 Z-score: 3934.8 bits: 739.8 E(32554): 7.5e-213
Smith-Waterman score: 7365; 100.0% identity (100.0% similar) in 1083 aa overlap (1-1083:1-1083)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MPAMRGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFVLGNAQVAGLFPVVYCSDGFCDLTGFSRAEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 MPAMRGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFVLGNAQVAGLFPVVYCSDGFCDLTGFSRAEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 MQRGCACSFLYGPDTSELVRQQIRKALDEHKEFKAELILYRKSGLPFWCLLDVIPIKNEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 MQRGCACSFLYGPDTSELVRQQIRKALDEHKEFKAELILYRKSGLPFWCLLDVIPIKNEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 GEVALFLVSHKDISETKNRGGPDRWKETGGGRRRYGRARSKGFNANRRRSRAVLYHLSGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 GEVALFLVSHKDISETKNRGGPDRWKETGGGRRRYGRARSKGFNANRRRSRAVLYHLSGH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LQKQPKGKHKLNKGVFGEKPNLPEYKVAAIRKSPFILLHCGALRATWDGFILLATLYVAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 LQKQPKGKHKLNKGVFGEKPNLPEYKVAAIRKSPFILLHCGALRATWDGFILLATLYVAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TVPYSVCVSTAREPSAARGPPSVCDLAVEVLFILDIVLNFRTTFVSKSGQVVFAPKSICL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 TVPYSVCVSTAREPSAARGPPSVCDLAVEVLFILDIVLNFRTTFVSKSGQVVFAPKSICL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 HYVTTWFLLDVIAALPFDLLHAFKVNVYFGAHLLKTVRLLRLLRLLPRLDRYSQYSAVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 HYVTTWFLLDVIAALPFDLLHAFKVNVYFGAHLLKTVRLLRLLRLLPRLDRYSQYSAVVL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 TLLMAVFALLAHWVACVWFYIGQREIESSESELPEIGWLQELARRLETPYYLVGRRPAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 TLLMAVFALLAHWVACVWFYIGQREIESSESELPEIGWLQELARRLETPYYLVGRRPAGG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NSSGQSDNCSSSSEANGTGLELLGGPSLRSAYITSLYFALSSLTSVGFGNVSANTDTEKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 NSSGQSDNCSSSSEANGTGLELLGGPSLRSAYITSLYFALSSLTSVGFGNVSANTDTEKI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 FSICTMLIGALMHAVVFGNVTAIIQRMYARRFLYHSRTRDLRDYIRIHRIPKPLKQRMLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 FSICTMLIGALMHAVVFGNVTAIIQRMYARRFLYHSRTRDLRDYIRIHRIPKPLKQRMLE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 YFQATWAVNNGIDTTELLQSLPDELRADIAMHLHKEVLQLPLFEAASRGCLRALSLALRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 YFQATWAVNNGIDTTELLQSLPDELRADIAMHLHKEVLQLPLFEAASRGCLRALSLALRP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 AFCTPGEYLIHQGDALQALYFVCSGSMEVLKGGTVLAILGKGDLIGCELPRREQVVKANA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 AFCTPGEYLIHQGDALQALYFVCSGSMEVLKGGTVLAILGKGDLIGCELPRREQVVKANA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 DVKGLTYCVLQCLQLAGLHDSLALYPEFAPRFSRGLRGELSYNLGAGGGSAEVDTSSLSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 DVKGLTYCVLQCLQLAGLHDSLALYPEFAPRFSRGLRGELSYNLGAGGGSAEVDTSSLSG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 DNTLMSTLEEKETDGEQGPTVSPAPADEPSSPLLSPGCTSSSSAAKLLSPRRTAPRPRLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 DNTLMSTLEEKETDGEQGPTVSPAPADEPSSPLLSPGCTSSSSAAKLLSPRRTAPRPRLG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 GRGRPGRAGALKAEAGPSAPPRALEGLRLPPMPWNVPPDLSPRVVDGIEDGCGSDQPKFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 GRGRPGRAGALKAEAGPSAPPRALEGLRLPPMPWNVPPDLSPRVVDGIEDGCGSDQPKFS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 FRVGQSGPECSSSPSPGPESGLLTVPHGPSEARNTDTLDKLRQAVTELSEQVLQMREGLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 FRVGQSGPECSSSPSPGPESGLLTVPHGPSEARNTDTLDKLRQAVTELSEQVLQMREGLQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 SLRQAVQLVLAPHREGPCPRASGEGPCPASTSGLLQPLCVDTGASSYCLQPPAGSVLSGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 SLRQAVQLVLAPHREGPCPRASGEGPCPASTSGLLQPLCVDTGASSYCLQPPAGSVLSGT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 WPHPRPGPPPLMAPWPWGPPASQSSPWPRATAFWTSTSDSEPPASGDLCSEPSTPASPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 WPHPRPGPPPLMAPWPWGPPASQSSPWPRATAFWTSTSDSEPPASGDLCSEPSTPASPPP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 SEEGARTGPAEPVSQAEATSTGEPPPGSGGLALPWDPHSLEMVLIGCHGSGTVQWTQEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 SEEGARTGPAEPVSQAEATSTGEPPPGSGGLALPWDPHSLEMVLIGCHGSGTVQWTQEEG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 TGV
:::
CCDS87 TGV
>>CCDS2632.1 KCNH8 gene_id:131096|Hs108|chr3 (1107 aa)
initn: 3170 init1: 1297 opt: 1336 Z-score: 727.0 bits: 146.3 E(32554): 3.6e-34
Smith-Waterman score: 3194; 51.8% identity (73.8% similar) in 1040 aa overlap (1-1013:1-996)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MPAMRGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFVLGNAQVAGLFPVVYCSDGFCDLTGFSRAEV
::.:.::::::::::::::::::::::::.:.::::: ::.::::::::.:.::.:.::
CCDS26 MPVMKGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFILANAQVAKGFPIVYCSDGFCELAGFARTEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 MQRGCACSFLYGPDTSELVRQQIRKALDEHKEFKAELILYRKSGLPFWCLLDVIPIKNEK
::..:.:.::.: .:.: . ::.:.:.:. :::.:...:.:.: :::::::..::::::
CCDS26 MQKSCSCKFLFGVETNEQLMLQIEKSLEEKTEFKGEIMFYKKNGSPFWCLLDIVPIKNEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KA1 GEVALFLVSHKDISETKNRGGPDRWKETG-GGRRRYGRARSKGFNANRRRSRAVLYHLSG
:.:.:::.: :::..:: . :. :: :: : : :.. ::::::::::.::
CCDS26 GDVVLFLASFKDITDTKVKITPEDKKEDKVKGRSRAGT----HFDSARRRSRAVLYHISG
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 HLQKQPKGKHKLNKGVFGEKPNLPEYKVAAIRKSPFILLHCGALRATWDGFILLATLYVA
:::.. :.: :.:..:: .:: .:::::. .:: ::::: ....: :: .:::::.:::
CCDS26 HLQRREKNKLKINNNVFVDKPAFPEYKVSDAKKSKFILLHFSTFKAGWDWLILLATFYVA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 VTVPYSVCVSTAREPSAARGPPSVCDLAVEVLFILDIVLNFRTTFVSKSGQVVFAPKSIC
:::::.:: . :..:. .: :.:::.:::.::.::::::.:::::::.: .:::
CCDS26 VTVPYNVCFIGNDDLSTTRST-TVSDIAVEILFIIDIILNFRTTYVSKSGQVIFEARSIC
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 LHYVTTWFLLDVIAALPFDLLHAFKVNVYFGAHLLKTVRLLRLLRLLPRLDRYSQYSAVV
.:::::::..:.:::::::::.::.:.: .::::::::::::::: .::::::.:..:
CCDS26 IHYVTTWFIIDLIAALPFDLLYAFNVTVVSLVHLLKTVRLLRLLRLLQKLDRYSQHSTIV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 LTLLMAVFALLAHWVACVWFYIGQREIESSESELPEIGWLQELARRLETPYYLVGRRPAG
:::::..:::::::.::.:. ::. : :.. :.:::.::..:::.:::
CCDS26 LTLLMSMFALLAHWMACIWYVIGKMEREDNSLLKWEVGWLHELGKRLESPYY--------
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 GNSSGQSDNCSSSSEANGTGLELLGGPSLRSAYITSLYFALSSLTSVGFGNVSANTDTEK
::.. :::::.:::::..:::.:::::::::::::::::.::
CCDS26 GNNT-------------------LGGPSIRSAYIAALYFTLSSLTSVGFGNVSANTDAEK
410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 IFSICTMLIGALMHAVVFGNVTAIIQRMYARRFLYHSRTRDLRDYIRIHRIPKPLKQRML
:::::::::::::::.:::::::::::::.: :::.::.::.:.::.:..:. ::::::
CCDS26 IFSICTMLIGALMHALVFGNVTAIIQRMYSRWSLYHTRTKDLKDFIRVHHLPQQLKQRML
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 EYFQATWAVNNGIDTTELLQSLPDELRADIAMHLHKEVLQLPLFEAASRGCLRALSLALR
::::.::.::::::..:::...:::::.::.:::.::.::: ::: :::::::.::: ..
CCDS26 EYFQTTWSVNNGIDSNELLKDFPDELRSDITMHLNKEILQLSLFECASRGCLRSLSLHIK
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 PAFCTPGEYLIHQGDALQALYFVCSGSMEVLKGGTVLAILGKGDLIGCELPRREQVVKAN
.::.:::::..:::::::.:::::::::::: . :::::::::::: .: ..::.:.:
CCDS26 TSFCAPGEYLLRQGDALQAIYFVCSGSMEVLKDSMVLAILGKGDLIGANLSIKDQVIKTN
570 580 590 600 610 620
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 ADVKGLTYCVLQCLQLAGLHDSLALYPEFAPRFSRGLRGELSYNLGAGGGSAEVDTSSLS
::::.:::: :::. : :: . : ::::.: .: . .. .:.::: : : :. :
CCDS26 ADVKALTYCDLQCIILKGLFEVLDLYPEYAHKFVEDIQHDLTYNLREGH---ESDVISRL
630 640 650 660 670 680
720 730 740 750 760
pF1KA1 GDNTLMSTLEEKETDG--EQGPTV-----SPAPADEPSSPLLSPGCT--SSSSAAKL---
......: : : . . .. :.. ..: . ::: :: ::: :.
CCDS26 SNKSMVSQSEPKGNGNINKRLPSIVEDEEEEEEGEEEEAVSLSPICTRGSSSRNKKVGSN
690 700 710 720 730 740
770 780 790 800 810
pF1KA1 -----LSPRRTAPRPR-LGGRGRPGRAGALKAEA---GPSAPPRALEGLRLPPMPWNV--
:: .. : . . : .:... :.. :. : ..:.: :
CCDS26 KAYLGLSLKQLASGTVPFHSPIRVSRSNSPKTKQEIDPPNHNKRKEKNLKLQLSTLNNAG
750 760 770 780 790 800
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 PPDLSPRVVDGIEDGCGSDQPK-FSFRVGQSGPECSSSPSPG-PESGLLTVPHGPSEARN
:::::::.::::::: .:.. . :.: . : :: : :: : .. :...
CCDS26 PPDLSPRIVDGIEDGNSSEESQTFDFGSERIRSEPRISPPLGDPEIGAAVLFIKAEETKQ
810 820 830 840 850 860
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 TDTLDKLRQAVTELSEQVLQMREGLQSLRQAVQLVLAPHREGPCPRASGEGPCPASTSGL
..:: . :: :...: :. . .... : .. ::.:.. . . . ::. :
CCDS26 --QINKLNSEVTTLTQEVSQLGKDMRNVIQLLENVLSPQQPSRFCSLHSTSVCPSRES--
870 880 890 900 910 920
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 LQPLCVDTGASSYCLQPPAGSVLSGTWPHPRPGPPPLMAP-WPWGPPASQSSPWPRATAF
:: .. .: . ::. .: .... . . . . : : . ::: :. :
CCDS26 LQTR-TSWSAHQPCLHLQTG---GAAYTQAQLCSSNITSDIWSVDPSSVGSSPQ-RTGAH
930 940 950 960 970
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA1 WTSTSDSEPPASGDLCSEPSTPASPPPSEEGARTGPAEPVSQAEATSTGEPPPGSGGLAL
. .::: : .: ::
CCDS26 EQNPADSELYHSPSLDYSPSHYQVVQEGHLQFLRCISPHSDSTLTPLQSISATLSSSVCS
980 990 1000 1010 1020 1030
>>CCDS1496.1 KCNH1 gene_id:3756|Hs108|chr1 (989 aa)
initn: 1736 init1: 489 opt: 1268 Z-score: 691.5 bits: 139.6 E(32554): 3.4e-32
Smith-Waterman score: 1682; 39.6% identity (69.3% similar) in 735 aa overlap (5-704:8-701)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MPAMRGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFVLGNAQVAGLFPVVYCSDGFCDLTGFSR
:::.:::::::..:. : . : ::::::::.. .:.:: .:::: :.:. :
CCDS14 MTMAGGRRGLVAPQNTFLENIVRRSNDT--NFVLGNAQIVD-WPIVYSNDGFCKLSGYHR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 AEVMQRGCACSFLYGPDTSELVRQQIRKALDEHKEFKAELILYRKSGLPFWCLLDVIPIK
:::::.. .:::.:: :.. . ...:....... . :...:.:. : : .. . ::.
CCDS14 AEVMQKSSTCSFMYGELTDKDTIEKVRQTFENYEMNSFEILMYKKNRTPVWFFVKIAPIR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 NEKGEVALFLVSHKDISETKNRGGPDRWKETGGGR-RRYGRARSKGFNANRRRSRAVLYH
::. .:.::: . .::. :. : : : :. : :: .. ::.:: .
CCDS14 NEQDKVVLFLCTFSDITAFKQPIEDDSCK--GWGKFARLTRALTS--------SRGVLQQ
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 LSGHLQKQPK-GKH-KLNKGVFGEKPNLPEYKVAAIRKSPFILLHCGALRATWDGFILLA
:. .:: . :: .: . . . ::.:: : . : :.:: ....::: .::.
CCDS14 LAPSVQKGENVHKHSRLAEVLQLGSDILPQYKQEAPKTPPHIILHYCVFKTTWDWIILIL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 TLYVAVTVPYSVCVSTAREPSAARGPPSVCDLAVEVLFILDIVLNFRTTFVSKSGQVVFA
:.:.:. :::.: .: :. ..: : : :.:.:..::::::.::::. .:.:.
CCDS14 TFYTAILVPYNVSFKT-RQNNVAW---LVVDSIVDVIFLVDIVLNFHTTFVGPAGEVISD
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KA1 PKSICLHYVTTWFLLDVIAALPFDLLHAFK----VNVYFG--------------------
:: : ..:. :::..:... ::.:...::. :....:
CCDS14 PKLIRMNYLKTWFVIDLLSCLPYDVINAFENVDEVSAFMGDPGKIGFADQIPPPLEGRES
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380
pF1KA1 ---AHL---LKTVRLLRLLRLLPRLDRYSQYSAVVLTLLMAVFALLAHWVACVWFYIGQR
. : ::.:::::: :. .::.: .:.:.::.::. ::.: :::.::.:. ::.
CCDS14 QGISSLFSSLKVVRLLRLGRVARKLDHYIEYGAAVLVLLVCVFGLAAHWMACIWYSIGDY
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 EIESSESE-LPEIGWLQELARRLETPYYLVGRRPAGGNSSGQSDNCSSSSEANGTGLELL
:: . ... . . .:: .:: . ::: . .:..::. .
CCDS14 EIFDEDTKTIRNNSWLYQLAMDIGTPYQF------NGSGSGKWE----------------
410 420 430 440
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 GGPSLRSAYITSLYFALSSLTSVGFGNVSANTDTEKIFSICTMLIGALMHAVVFGNVTAI
:::: :.::.::::...:::::::::.. .:: ::::.. :.::.:..:..:::::.:
CCDS14 GGPSKNSVYISSLYFTMTSLTSVGFGNIAPSTDIEKIFAVAIMMIGSLLYATIFGNVTTI
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 IQRMYARRFLYHSRTRDLRDYIRIHRIPKPLKQRMLEYFQATWAVNNGIDTTELLQSLPD
.:.::: :: ..::.......:: :..:...:. .::... :::: ..:: :
CCDS14 FQQMYANTNRYHEMLNSVRDFLKLYQVPKGLSERVMDYIVSTWSMSRGIDTEKVLQICPK
510 520 530 540 550 560
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 ELRADIAMHLHKEVLQL-PLFEAASRGCLRALSLALRPAFCTPGEYLIHQGDALQALYFV
..:::: .::...:.. : :. :: ::::::.. .. . :.::. . : :.....: ::
CCDS14 DMRADICVHLNRKVFKEHPAFRLASDGCLRALAMEFQTVHCAPGDLIYHAGESVDSLCFV
570 580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
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CCDS14 VSGSLEVIQDDEVVAILGKGDVFGDVFWKEATLAQSCANVRALTYCDLHVIKRDALQKVL
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690 700 710 720 730 740
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CCDS14 EFYTAFSHSFSRNL--ILTYNLRKRIVFRKISDVKREEEERMKRKNEAPLILPPDHPVRR
690 700 710 720 730
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CCDS11 MQKTCSCRFLYGPETSEPALQRLHKALEGHQEHRAEICFYRKDGSAFWCLLDMMPIKNEM
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CCDS11 GEVVLFLFSFKDITQSGSPGLGPQGGRGDSNHENSLGRRGATWKFRSARRRSRTVLHRLT
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CCDS11 GHFGRRGQGGMKANNNVFEPKPSVPEYKVASVGGSRCLLLHYSVSKAIWDGLILLATFYV
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240 250 260 270 280 290
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CCDS11 AVTVPYNVCFSGDDDTPITSRHTLVSDIAVEMLFILDIILNFRTTYVSQSGQVISAPRSI
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CCDS11 GLHYLATWFFIDLIAALPFDLLYIFNITVTSLVHLLKTVRLLRLLRLLQKLERYSQCSAV
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360 370 380 390 400 410
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CCDS11 VLTLLMSVFALLAHWMACIWYVIGRREMEANDPLLWDIGWLHELGKRLEVPY--------
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pF1KA1 GGNSSGQSDNCSSSSEANGTGLELLGGPSLRSAYITSLYFALSSLTSVGFGNVSANTDTE
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CCDS11 ----------------VNGS----VGGPSRRSAYIAALYFTLSSLTSVGFGNVCANTDAE
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CCDS11 KIFSICTMLIGALMHAVVFGNVTAIIQRMYSRRSLYHSRMKDLKDFIRVHRLPRPLKQRM
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CCDS11 LEYFQTTWAVNSGIDANELLRDFPDELRADIAMHLNREILQLPLFGAASRGCLRALSLHI
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CCDS11 KTSFCAPGEYLLRRGDALQAHYYVCSGSLEVLRDNMVLAILGKGDLIGADIPEPGQEPGL
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pF1KA1 ------VVKANADVKGLTYCVLQCLQLAGLHDSLALYPEFAPRFSRGLRGELSYNLGAGG
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CCDS11 GADPNFVLKTSADVKALTYCGLQQLSSRGLAEVLRLYPEYGAAFRAGLPRDLTFNLRQGS
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pF1KA1 GSAEVDTSSLSG------DNTLMSTLEEKE---TDGEQGPTVSPAPADEPSSPLLSPGCT
.. .. : : ...: :. .. :..:.: . :. . .: ::: :. .
CCDS11 DTSGLSRFSRSPRLSQPRSESLGSSSDKTLPSITEAESG--AEPGGGPRPRRPLLLPNLS
700 710 720 730 740 750
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. ..:.: : .: : :. :. :: .. :.: .::: .
CCDS11 PARPRGSLVSLLGEELPPFSALVSSPSLSPSLSPALAGQGHS-ASPHGPPRCSAAWKPPQ
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pF1KA1 LRLPPMPWNVPPDLSPRVVDGIEDGCGSDQPKFSFRVGQSGPECSSSPSPGPESGLLTVP
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CCDS11 LLIPPLGTFGPPDLSPRIVDGIEDS-GSTAEAPSFRFSRR-PELPRPRSQAPPTGTRPSP
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CCDS11 ELASEAEEVKEKVCRLNQEISRLNQEVSQLSRELRHIMGLLQARLGPPGHPAGSAWTPDP
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pF1KA1 PCPRASGEGPCPASTSGLLQPLCVDTG-ASSYCLQPPA--GSVLSGTWPHP-RPG--PPP
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CCDS11 PCPQL--RPPCLSPCASRPPPSLQDTTLAEVHC---PASVGTMETGTALLDLRPSILPPY
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CCDS11 PSEPDPLGPSPVPEASPPTPSLLRHSFQSRSDTFH
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CCDS59 LLLVIYTAVFTPYSAAFLLKETEEGPPATECGYACQPLAVVDLIVDIMFIVDILINFRTT
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.::.:.::.::.::. :::: .:. .:::: . .:...:. :.::: .::.. .:: :
CCDS59 FIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNAVLKGFPECLQADICLHLNRSLLQHCKP
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CCDS59 -FRGATKGCLRALAMKFKTTHAPPGDTLVHAGDLLTALYFISRGSIEILRGDVVVAILGK
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CCDS59 NDIFGEPLNLYARPGKSNGDVRALTYCDLHKIHRDDLLEVLDMYPEFSDHFWSSL--EIT
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pF1KA1 YNL------GAGGGSAEVDTSSLSGDNTLMSTLEEKETDGEQGPTVSPAPADEPSSPLLS
.:: .. ::.:.. . . .: .. . : ::
CCDS59 FNLRDTNMIPGSPGSTELEGGFSRQRKRKLSFRRRTDKDTEQ------------------
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:: .:. :.: :.. : ..::::: . . .:::.: : :. :
CCDS59 PGEVSA------LGPGRAGAGP--SSRGRPGGPWGESPSSGPSSPESSEDEGPGRSSSPL
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CCDS59 RLVPFSSPRPPGEPPGGEPLMEDCEKSSDTCNPLSGAFSGVSNIFSFWGDSRGRQYQELP
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pF1KA1 S-PGPESGLLTVP-HGPSEARNTDT---LDKLRQAVTELSEQV-LQMREGLQSLRQAVQL
:.: .::..: .:.. :. :: :.. ...: .. .: :: :.. :.
CCDS59 RCPAPTPSLLNIPLSSPGRRPRGDVESRLDALQRQLNRLETRLSADMATVLQLLQR--QM
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pF1KA1 VLAPHREGPCPRA-SGEGPCPASTSGLL--QPLCVDTGAS-SYCLQPPAGSVLSGTWPH-
.:.: : : . :: :.::: :: .:: . : : : : : : :.
CCDS59 TLVP----PAYSAVTTPGPGPTSTSPLLPVSPLPTLTLDSLSQVSQFMACEELPPGAPEL
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pF1KA1 PRPGPPPLMA-PWPWGPPASQSSPWPRATAFWTSTSDSEPPASGDLCSEPSTPASPPPSE
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CCDS59 PQEGPTRRLSLPGQLGALTSQPLHRHGSDPGS
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pF1KA1 LLATLYVAVTVPYSVCV---STAREPSA-----ARGPPSVCDLAVEVLFILDIVLNFRTT
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CCDS59 LLLVIYTAVFTPYSAAFLLKETEEGPPATECGYACQPLAVVDLIVDIMFIVDILINFRTT
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pF1KA1 FVSKSGQVVFAPKSICLHYVTTWFLLDVIAALPFDLLHAFKVNVYFGAHLLKTVRLLRLL
.:. . .:: : : .:: :::.:..::.::::: : . ::::.:::::.
CCDS59 YVNANEEVVSHPGRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLL-IFGSGSEELIGLLKTARLLRLV
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pF1KA1 RLLPRLDRYSQYSAVVLTLLMAVFALLAHWVACVWFYIGQREIESSESELPEIGWLQELA
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CCDS59 RVARKLDRYSEYGAAVLFLLMCTFALIAHWLACIWYAIGNMEQPHMDSR---IGWLHNLG
540 550 560 570 580 590
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pF1KA1 RRLETPYYLVGRRPAGGNSSGQSDNCSSSSEANGTGLELLGGPSLRSAYITSLYFALSSL
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CCDS59 DQIGKPY----------NSSG------------------LGGPSIKDKYVTALYFTFSSL
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pF1KA1 TSVGFGNVSANTDTEKIFSICTMLIGALMHAVVFGNVTAIIQRMYARRFLYHSRTRDLRD
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CCDS59 TSVGFGNVSPNTNSEKIFSICVMLIGSLMYASIFGNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVRE
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pF1KA1 YIRIHRIPKPLKQRMLEYFQATWAVNNGIDTTELLQSLPDELRADIAMHLHKEVLQL--P
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CCDS59 FIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNAVLKGFPECLQADICLHLNRSLLQHCKP
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pF1KA1 LFEAASRGCLRALSLALRPAFCTPGEYLIHQGDALQALYFVCSGSMEVLKGGTVLAILGK
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CCDS59 -FRGATKGCLRALAMKFKTTHAPPGDTLVHAGDLLTALYFISRGSIEILRGDVVVAILGK
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CCDS59 NDIFGEPLNLYARPGKSNGDVRALTYCDLHKIHRDDLLEVLDMYPEFSDHFWSSL--EIT
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.:: .. ::.:.. . . .: .. . : ::
CCDS59 FNLRDTNMIPGSPGSTELEGGFSRQRKRKLSFRRRTDKDTEQ------------------
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760 770 780 790 800
pF1KA1 PGCTSSSSAAKLLSPRRTAPRPRLGGRGRPGRAGALKAEAGPSAP-------P-RALEGL
:: .:. :.: :.. : ..::::: . . .:::.: : :. :
CCDS59 PGEVSA------LGPGRAGAGP--SSRGRPGGPWGESPSSGPSSPESSEDEGPGRSSSPL
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:: : : : . :: : . : . : :. . :: : :.: : . . :
CCDS59 RLVPFSSPRPPGEPPGGEPLMEDCEKSSDTCNPLSGAFSGVSNIFSFWGDSRGRQYQELP
960 970 980 990 1000 1010
860 870 880 890 900
pF1KA1 S-PGPESGLLTVP-HGPSEARNTDT---LDKLRQAVTELSEQV-LQMREGLQSLRQAVQL
:.: .::..: .:.. :. :: :.. ...: .. .: :: :.. :.
CCDS59 RCPAPTPSLLNIPLSSPGRRPRGDVESRLDALQRQLNRLETRLSADMATVLQLLQR--QM
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910 920 930 940 950 960
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CCDS59 TLVP----PAYSAVTTPGPGPTSTSPLLPVSPLPTLTLDSLSQVSQFMACEELPPGAPEL
1080 1090 1100 1110 1120
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pF1KA1 PRPGPPPLMA-PWPWGPPASQSSPWPRATAFWTSTSDSEPPASGDLCSEPSTPASPPPSE
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CCDS59 PQEGPTRRLSLPGQLGALTSQPLHRHGSDPGS
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CCDS11 MPVRRGHVAPQNTYLDTIIRKFEGQSRKFLIANAQMENC-AIIYCNDGFCELFGYSRVEV
10 20 30 40 50
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pF1KA1 MQRGCACSFLYGPDTSELVRQQIRKALDEHKEFKAELILYRKSGLPFWCLLDVIPIKNEK
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CCDS11 MQQPCTCDFLTGPNTPSSAVSRLAQALLGAEECKVDILYYRKDASSFRCLVDVVPVKNED
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CCDS11 GAVIMFILNFEDLAQLLAKCSSRSLSQRLLSQSFLGSEGSHGRPGGPGPGTGRGKYRTIS
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KA1 ------LYHLSGHLQKQPKGK---------HKLNKGV--FGEKPN---------LPEYKV
: . .:.:. ... ::. . . :: . :::::.
CCDS11 QIPQFTLNFVEFNLEKHRSSSTTEIEIIAPHKVVERTQNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKL
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 AAIRKSPFILLHCGALRATWDGFILLATLYVAVTVPYSVCVSTAREPSAARG-------P
: : . .:: . ..:.:: .::: ..:.:: .:::. . . . :: :
CCDS11 QAPRIHRWTILHYSPFKAVWDWLILLLVIYTAVFTPYSAAFLLSDQDESRRGACSYTCSP
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270 280 290 300 310 320
pF1KA1 PSVCDLAVEVLFILDIVLNFRTTFVSKSGQVVFAPKSICLHYVTTWFLLDVIAALPFDLL
.: :: :...:..:::.:::::.:. . .:: :. : .:: :::.:..::.:::::
CCDS11 LTVVDLIVDIMFVVDIVINFRTTYVNTNDEVVSHPRRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLL
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330 340 350 360 370
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:... . ::::.:::::.:. .:::::.:.:.:: ::: .:::.:::.::.
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380 390 400 410 420 430
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:. ::. : : . ::::. :. .: :.: : :: :
CCDS11 WYAIGNVERPYLEHK---IGWLDSLGVQL-------GKRYNG------SDPAS-------
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440 450 460 470 480 490
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:::... :.:.:::..:::::::::::: ::..::.::::.::::.::.: .:
CCDS11 -------GPSVQDKYVTALYFTFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKVFSICVMLIGSLMYASIF
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:::.:::::.:. ::.. ....::.:.::.::.::. :::: .:. .:::: . .
CCDS11 GNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVKEFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNAV
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560 570 580 590 600 610
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:...:. :.::: .:::. .:: : : .:..::::::.. .. . ::. :.: ::.:
CCDS11 LKGFPECLQADICLHLHRALLQHCPAFSGAGKGCLRALAVKFKTTHAPPGDTLVHLGDVL
570 580 590 600 610 620
620 630 640 650 660 670
pF1KA1 QALYFVCSGSMEVLKGGTVLAILGKGDLIGCELPRREQVVKANADVKGLTYCVLQCLQLA
..:::. ::.:.:. .:.:::::.:..: . . : :..:::..:::: :. .: :
CCDS11 STLYFISRGSIEILRDDVVVAILGKNDIFGEPVSLHAQPGKSSADVRALTYCDLHKIQRA
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pF1KA1 GLHDSLALYPEFAPRFSRGLRGELSYNL--GAGGGSAEVDTSSLSGDNT-LMSTLEEKET
: . : .:: :: : : :...:: .::: . . : :. .. . ... .
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740 750 760 770 780 790
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: :: :. : ::.:: .: .:. .: . : :. : :
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800 810 820 830
pF1KA1 EAGPSAPPRALE----------GLRLPPMPWN-------VPPDLSPRVVDGIEDGCGSDQ
: : :.. . : :: . . : ::: :... .. . .
CCDS11 EMPPRHSPQSPQEDPDCWPLKLGSRLEQLQAQMNRLESRVSSDLS-RILQLLQKPMPQGH
810 820 830 840 850
840 850 860 870 880
pF1KA1 PKFSFRVGQSG-----PECSSSPSPGPE--SGLLTVPHGPSEARNTDTLDKLRQAVTELS
.. ... :. : : . ::::. .:.: . :: . : : :.. ..
CCDS11 ASYILEAPASNDLALVPIASETTSPGPRLPQGFLPPAQTPSYGDLDDCSPKHRNSSPRMP
860 870 880 890 900 910
890 900 910 920 930 940
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. : :.. .::: : : :: : .: : .:: :. . :.
CCDS11 H-----------LAVATDKTLAPSSEQEQP----EGLWPPLASPL-HPLEVQGLICGPCF
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950 960 970 980 990 1000
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. : . . : : : .: ::
CCDS11 SSLPEHLGSVPKQLDFQRHGSDPGFAG-SWGH
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CCDS62 GAVIMFILNFEDLAQLLAKCSSRSLSQRLLSQSFLGSEGSHGRPGGPGPGTGRGKYRTIS
120 130 140 150 160 170
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CCDS62 QIPQFTLNFVEFNLEKHRSSSTTEIEIIAPHKVVERTQNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKL
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 AAIRKSPFILLHCGALRATWDGFILLATLYVAVTVPYSVCVSTAREPSAARG-------P
: : . .:: . ..:.:: .::: ..:.:: .:::. . . . :: :
CCDS62 QAPRIHRWTILHYSPFKAVWDWLILLLVIYTAVFTPYSAAFLLSDQDESRRGACSYTCSP
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 PSVCDLAVEVLFILDIVLNFRTTFVSKSGQVVFAPKSICLHYVTTWFLLDVIAALPFDLL
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CCDS62 LTVVDLIVDIMFVVDIVINFRTTYVNTNDEVVSHPRRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLL
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330 340 350 360 370
pF1KA1 HAFKVN---VYFGAHLLKTVRLLRLLRLLPRLDRYSQYSAVVLTLLMAVFALLAHWVACV
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CCDS62 -IFRTGSDETTTLIGLLKTARLLRLVRVARKLDRYSEYGAAVLFLLMCTFALIAHWLACI
360 370 380 390 400 410
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pF1KA1 WFYIGQREIESSESELPEIGWLQELARRLETPYYLVGRRPAGGNSSGQSDNCSSSSEANG
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CCDS62 WYAIGNVERPYLEHK---IGWLDSLGVQL-------GKRYNG------SDPAS-------
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CCDS62 STLYFISRGSIEILRDDVVVAILGKNDIFGEPVSLHAQPGKSSADVRALTYCDLHKIQRA
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pF1KA1 GLHDSLALYPEFAPRFSRGLRGELSYNL-GAGGGSAEVDTSSLSGDNTLMSTLEEKETDG
: . : .:: :: : : :...:: :.:: .. .... : ....:.
CCDS62 DLLEVLDMYPAFAESFWSKL--EVTFNLRDAAGGLHSSPRQAPGSQDHQGFFLSDNQSDA
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CCDS62 LQAQMNR-LES--------RVSSDLS-RILQLLQKPMPQGHASYILEAPASNDLALVPIA
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CCDS62 GSDPGFAG-SWGH
950
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CCDS22 LLLVIYTAIFTPYSAAFLLNDREEQKRRECGYSCSPLNVVDLIVDIMFIIDILINFRTTY
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:::::::::::: ::..:::::::.::::.::.: .::::.:::::.:. :: .
CCDS22 SSLTSVGFGNVSPNTNSEKIFSICVMLIGSLMYASIFGNVSAIIQRLYSGTARYHMQMLR
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....::.:.::.::.::. :::: .:. .:::: . .:...:. :.::: .::.. .::
CCDS22 VKEFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWTYTNGIDMNMVLKGFPECLQADICLHLNQTLLQN
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:..::.::::::.. .. . ::. :.: ::.: ::::. ::.:.:: :.:::
CCDS22 CKAFRGASKGCLRALAMKFKTTHAPPGDTLVHCGDVLTALYFLSRGSIEILKDDIVVAIL
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::.:..: . . :.::::..:::: :. .: : . : .::::. .: .: :
CCDS22 GKNDIFGEMVHLYAKPGKSNADVRALTYCDLHKIQREDLLEVLDMYPEFSDHFLTNL--E
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CCDS22 LTFNLRHESAKADLLRSQSMNDSEGDNCKLRRRKLSFESEGEKENSTND-PED--SADTI
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pF1KA1 SPGCTSSSSAAKLLSPRRTAPRPRLGGRGRPGRAGALKAEAGPSAPPRALEGLRLPPMPW
.:. . : : .. . . .: .: . . : . :: .
CCDS22 RHYQSSKRHFEEKKS-RSSSFISSIDDEQKPLFSGIVDSSPGIGKAS----GLDFEE---
920 930 940 950 960
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pF1KA1 NVPPDLSPRV-VDGIEDGCG--SDQPKFSFRVGQSGPECSSSPSPGPESGLLTVPHGPSE
.:: : :. .: .: .:. .. . .. :: .:::: .: . : ::
CCDS22 TVPT--SGRMHIDKRSHSCKDITDMRSWERENAHPQPE-DSSPS-----ALQRAAWGISE
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880 890 900 910 920
pF1KA1 ARNTDTLDKLRQAVTELSEQV----LQMREGLQSLRQAVQLVLAPHREGPCPRASGEGPC
... : ...: . :.::. :: .:.. : .:
CCDS22 TESDLTYGEVEQRLDLLQEQLNRLESQMTTDIQTILQLLQKQTTVVPPAYSMVTAGSEYQ
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CCDS22 RPIIQLMRTSQPEASIKTDRSFSPSSQCPEFLDLEKSKLKSKESLSSGVHLNTASEDNLT
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10 20 30 40 50
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pF1KA1 MQRGCACSFLYGPDTSELVRQQIRKALDEHKEFKAELILYRKSGLPFWCLLDVIPIKNEK
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CCDS11 MQQPCTCDFLTGPNTPSSAVSRLAQALLGAEECKVDILYYRKDASSFRCLVDVVPVKNED
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pF1KA1 GEVALFLVSHKDISET----KNRGGPDRWKETG--GGRRRYGRARSKGFNANRRRSRAV-
: : .:... .:... ..:. .: . :.. .:: . : ...: . :..
CCDS11 GAVIMFILNFEDLAQLLAKCSSRSLSQRLLSQSFLGSEGSHGRPGGPGPGTGRGKYRTIS
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pF1KA1 ------LYHLSGHLQKQPKGK---------HKLNKGV--FGEKPN---------LPEYKV
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CCDS11 QIPQFTLNFVEFNLEKHRSSSTTEIEIIAPHKVVERTQNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKL
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210 220 230 240 250 260
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CCDS11 QAPRIHRWTILHYSPFKAVWDWLILLLVIYTAVFTPYSAAFLLSDQDESRRGACSYTCSP
240 250 260 270 280 290
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pF1KA1 PSVCDLAVEVLFILDIVLNFRTTFVSKSGQVVFAPKSICLHYVTTWFLLDVIAALPFDLL
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CCDS11 LTVVDLIVDIMFVVDIVINFRTTYVNTNDEVVSHPRRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLL
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330 340 350 360 370
pF1KA1 HAFKVN---VYFGAHLLKTVRLLRLLRLLPRLDRYSQYSAVVLTLLMAVFALLAHWVACV
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CCDS11 -IFRTGSDETTTLIGLLKTARLLRLVRVARKLDRYSEYGAAVLFLLMCTFALIAHWLACI
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380 390 400 410 420 430
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::
CCDS11 ---------------------------------------------------CS-------
420
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:::::::::: ::..::.::::.::::.::.: .:
CCDS11 -------------------------LTSVGFGNVSPNTNSEKVFSICVMLIGSLMYASIF
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:::.:::::.:. ::.. ....::.:.::.::.::. :::: .:. .:::: . .
CCDS11 GNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVKEFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNAV
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:...:. :.::: .:::. .:: : : .:..::::::.. .. . ::. :.: ::.:
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..:::. ::.:.:. .:.:::::.:..: . . : :..:::..:::: :. .: :
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: . : .:: :: : : :...:: :.:: .. .... : ....:.
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..: : . : ::. . ::.. :. : . :. . :
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. : ::. : ::: :... .. . . .. ... :. :
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: . ::::. .:.: . :: . : : :.. .. . : :..
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