FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1282, 1083 aa 1>>>pF1KA1282 1083 - 1083 aa - 1083 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2666+/-0.000445; mu= -3.5029+/- 0.028 mean_var=430.5210+/-91.959, 0's: 0 Z-trim(122.2): 93 B-trim: 764 in 2/55 Lambda= 0.061813 statistics sampled from 39850 (39946) to 39850 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.763), E-opt: 0.2 (0.468), width: 16 Scan time: 16.460 The best scores are: opt bits E(85289) NP_036416 (OMIM: 604527) potassium voltage-gated c (1083) 7365 672.2 4.5e-192 NP_001300959 (OMIM: 604527) potassium voltage-gate (1023) 6957 635.8 3.9e-181 XP_011536387 (OMIM: 604527) PREDICTED: potassium v (1094) 5871 538.9 5.8e-152 XP_011536388 (OMIM: 604527) PREDICTED: potassium v (1034) 5463 502.5 5e-141 XP_016874585 (OMIM: 604527) PREDICTED: potassium v (1016) 5166 476.0 4.7e-133 XP_016874586 (OMIM: 604527) PREDICTED: potassium v ( 720) 4936 455.4 5.5e-127 XP_016879892 (OMIM: 604528) PREDICTED: potassium v ( 532) 1649 162.1 7.7e-39 XP_016861190 (OMIM: 608260) PREDICTED: potassium v ( 930) 1336 134.5 2.9e-30 XP_016861188 (OMIM: 608260) PREDICTED: potassium v (1030) 1336 134.5 3.1e-30 NP_653234 (OMIM: 608260) potassium voltage-gated c (1107) 1336 134.5 3.3e-30 XP_016861187 (OMIM: 608260) PREDICTED: potassium v (1108) 1336 134.5 3.3e-30 XP_016861189 (OMIM: 608260) PREDICTED: potassium v ( 986) 1327 133.7 5.2e-30 NP_758872 (OMIM: 135500,603305,611816) potassium v ( 989) 1268 128.4 2e-28 XP_016879891 (OMIM: 604528) PREDICTED: potassium v ( 957) 1168 119.5 9.5e-26 XP_016879890 (OMIM: 604528) PREDICTED: potassium v ( 968) 1168 119.5 9.6e-26 XP_016879889 (OMIM: 604528) PREDICTED: potassium v (1017) 1168 119.5 9.9e-26 NP_036417 (OMIM: 604528) potassium voltage-gated c (1017) 1168 119.5 9.9e-26 NP_742054 (OMIM: 152427,609620,613688) potassium v ( 819) 986 103.2 6.6e-21 XP_011514487 (OMIM: 152427,609620,613688) PREDICTE (1059) 986 103.3 7.8e-21 XP_016867685 (OMIM: 152427,609620,613688) PREDICTE (1100) 986 103.3 8.1e-21 XP_016867684 (OMIM: 152427,609620,613688) PREDICTE (1109) 986 103.3 8.1e-21 NP_000229 (OMIM: 152427,609620,613688) potassium v (1159) 986 103.3 8.3e-21 XP_016880665 (OMIM: 608168) PREDICTED: potassium v ( 983) 951 100.1 6.5e-20 XP_016880669 (OMIM: 608168) PREDICTED: potassium v ( 871) 927 98.0 2.6e-19 XP_011523611 (OMIM: 608168) PREDICTED: potassium v ( 915) 927 98.0 2.7e-19 XP_011523610 (OMIM: 608168) PREDICTED: potassium v ( 918) 927 98.0 2.7e-19 NP_110406 (OMIM: 608168) potassium voltage-gated c ( 994) 927 98.0 2.9e-19 XP_016880664 (OMIM: 608168) PREDICTED: potassium v ( 994) 927 98.0 2.9e-19 XP_016880667 (OMIM: 608168) PREDICTED: potassium v ( 947) 926 97.9 3e-19 NP_001265849 (OMIM: 608168) potassium voltage-gate ( 835) 914 96.8 5.7e-19 NP_001265848 (OMIM: 608168) potassium voltage-gate ( 958) 914 96.8 6.3e-19 XP_016880666 (OMIM: 608168) PREDICTED: potassium v ( 958) 914 96.8 6.3e-19 XP_011523613 (OMIM: 608168) PREDICTED: potassium v ( 726) 897 95.2 1.5e-18 XP_011523614 (OMIM: 608168) PREDICTED: potassium v ( 726) 897 95.2 1.5e-18 XP_011514488 (OMIM: 152427,609620,613688) PREDICTE ( 910) 895 95.1 2e-18 XP_016860709 (OMIM: 608169) PREDICTED: potassium v (1189) 894 95.1 2.5e-18 NP_150375 (OMIM: 608169) potassium voltage-gated c (1196) 894 95.1 2.5e-18 XP_011510411 (OMIM: 608169) PREDICTED: potassium v (1204) 894 95.2 2.5e-18 XP_011523615 (OMIM: 608168) PREDICTED: potassium v ( 711) 888 94.4 2.5e-18 XP_016860708 (OMIM: 608169) PREDICTED: potassium v (1193) 872 93.2 9.8e-18 XP_016860707 (OMIM: 608169) PREDICTED: potassium v (1201) 872 93.2 9.8e-18 XP_016880668 (OMIM: 608168) PREDICTED: potassium v ( 941) 845 90.7 4.4e-17 XP_011523612 (OMIM: 608168) PREDICTED: potassium v ( 905) 832 89.5 9.6e-17 NP_775115 (OMIM: 608168) potassium voltage-gated c ( 905) 832 89.5 9.6e-17 XP_016856735 (OMIM: 135500,603305,611816) PREDICTE ( 597) 803 86.7 4.3e-16 NP_002229 (OMIM: 135500,603305,611816) potassium v ( 962) 803 86.9 6e-16 NP_001191727 (OMIM: 152427,609620,613688) potassiu ( 548) 782 84.8 1.5e-15 NP_742053 (OMIM: 152427,609620,613688) potassium v ( 888) 782 85.0 2.1e-15 NP_647479 (OMIM: 605716) potassium voltage-gated c ( 988) 778 84.7 2.9e-15 NP_758963 (OMIM: 605716) potassium voltage-gated c ( 611) 654 73.5 4.4e-12 >>NP_036416 (OMIM: 604527) potassium voltage-gated chann (1083 aa) initn: 7365 init1: 7365 opt: 7365 Z-score: 3569.2 bits: 672.2 E(85289): 4.5e-192 Smith-Waterman score: 7365; 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61.5% identity (81.5% similar) in 558 aa overlap (1-556:1-530) 10 20 30 40 50 60 pF1KA1 MPAMRGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFVLGNAQVAGLFPVVYCSDGFCDLTGFSRAEV ::.:.::::::::::::::::::::::::.:.::: . ::.::::::::.:::..:.:: XP_016 MPVMKGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFLLANAQGTRGFPIVYCSDGFCELTGYGRTEV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA1 MQRGCACSFLYGPDTSELVRQQIRKALDEHKEFKAELILYRKSGLPFWCLLDVIPIKNEK ::. :.: :::::.::: . :...:::. :.: .::. .:::.: ::::::..::::: XP_016 MQKTCSCRFLYGPETSEPALQRLHKALEGHQEHRAEICFYRKDGSAFWCLLDMMPIKNEM 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 GEVALFLVSHKDISETKNRG-GPDRWKETGGGRRRYGR-ARSKGFNANRRRSRAVLYHLS :::.::: : :::... . : ::. . .. . :: . . : . :::::.::..:. XP_016 GEVVLFLFSFKDITQSGSPGLGPQGGRGDSNHENSLGRRGATWKFRSARRRSRTVLHRLT 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 GHLQKQPKGKHKLNKGVFGEKPNLPEYKVAAIRKSPFILLHCGALRATWDGFILLATLYV ::. .. .: : :..:: ::..::::::.. : .::: .. .: :::.:::::.:: XP_016 GHFGRRGQGGMKANNNVFEPKPSVPEYKVASVGGSRCLLLHYSVSKAIWDGLILLATFYV 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 AVTVPYSVCVSTAREPSAARGPPSVCDLAVEVLFILDIVLNFRTTFVSKSGQVVFAPKSI ::::::.:: : . . : :.:::.::::::.::::::.::.::::. ::.:: XP_016 AVTVPYNVCFSGDDDTPITSRHTLVSDIAVEMLFILDIILNFRTTYVSQSGQVISAPRSI 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 CLHYVTTWFLLDVIAALPFDLLHAFKVNVYFGAHLLKTVRLLRLLRLLPRLDRYSQYSAV :::..:::..:.:::::::::. :...: .::::::::::::::: .:.:::: ::: XP_016 GLHYLATWFFIDLIAALPFDLLYIFNITVTSLVHLLKTVRLLRLLRLLQKLERYSQCSAV 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KA1 VLTLLMAVFALLAHWVACVWFYIGQREIESSESELPEIGWLQELARRLETPYYLVGRRPA ::::::.::::::::.::.:. ::.::.:... : .::::.::..:::.:: XP_016 VLTLLMSVFALLAHWMACIWYVIGRREMEANDPLLWDIGWLHELGKRLEVPY-------- 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KA1 GGNSSGQSDNCSSSSEANGTGLELLGGPSLRSAYITSLYFALSSLTSVGFGNVSANTDTE .::. .:::: :::::..:::.:::::::::::: ::::.: XP_016 ----------------VNGS----VGGPSRRSAYIAALYFTLSSLTSVGFGNVCANTDAE 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KA1 KIFSICTMLIGALMHAVVFGNVTAIIQRMYARRFLYHSRTRDLRDYIRIHRIPKPLKQRM ::::::::::::::::::::::::::::::.:: ::::: .::.:.::.::.:.:::::: XP_016 KIFSICTMLIGALMHAVVFGNVTAIIQRMYSRRSLYHSRMKDLKDFIRVHRLPRPLKQRM 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KA1 LEYFQATWAVNNGIDTTELLQSLPDELRADIAMHLHKEVLQLPLFEAASRGCLRALSLAL :::::.:::::.:::..: XP_016 LEYFQTTWAVNSGIDANETS 520 530 >>XP_016861190 (OMIM: 608260) PREDICTED: potassium volta (930 aa) initn: 2347 init1: 1297 opt: 1336 Z-score: 664.4 bits: 134.5 E(85289): 2.9e-30 Smith-Waterman score: 2352; 49.0% identity (70.9% similar) in 858 aa overlap (184-1013:3-819) 160 170 180 190 200 210 pF1KA1 RYGRARSKGFNANRRRSRAVLYHLSGHLQKQPKGKHKLNKGVFGEKPNLPEYKVAAIRKS . . .: ..:: .:: .:::::. .:: XP_016 MSETRTQHCDLQNVFVDKPAFPEYKVSDAKKS 10 20 30 220 230 240 250 260 270 pF1KA1 PFILLHCGALRATWDGFILLATLYVAVTVPYSVCVSTAREPSAARGPPSVCDLAVEVLFI ::::: ....: :: .:::::.::::::::.:: . :..:. .: :.:::.::: XP_016 KFILLHFSTFKAGWDWLILLATFYVAVTVPYNVCFIGNDDLSTTRST-TVSDIAVEILFI 40 50 60 70 80 90 280 290 300 310 320 330 pF1KA1 LDIVLNFRTTFVSKSGQVVFAPKSICLHYVTTWFLLDVIAALPFDLLHAFKVNVYFGAHL .::.::::::.:::::::.: .:::.:::::::..:.:::::::::.::.:.: .:: XP_016 IDIILNFRTTYVSKSGQVIFEARSICIHYVTTWFIIDLIAALPFDLLYAFNVTVVSLVHL 100 110 120 130 140 150 340 350 360 370 380 390 pF1KA1 LKTVRLLRLLRLLPRLDRYSQYSAVVLTLLMAVFALLAHWVACVWFYIGQREIESSESEL ::::::::::::: .::::::.:..::::::..:::::::.::.:. ::. : :.. XP_016 LKTVRLLRLLRLLQKLDRYSQHSTIVLTLLMSMFALLAHWMACIWYVIGKMEREDNSLLK 160 170 180 190 200 210 400 410 420 430 440 450 pF1KA1 PEIGWLQELARRLETPYYLVGRRPAGGNSSGQSDNCSSSSEANGTGLELLGGPSLRSAYI :.:::.::..:::.::: ::.. :::::.::::: XP_016 WEVGWLHELGKRLESPYY--------GNNT-------------------LGGPSIRSAYI 220 230 240 460 470 480 490 500 510 pF1KA1 TSLYFALSSLTSVGFGNVSANTDTEKIFSICTMLIGALMHAVVFGNVTAIIQRMYARRFL ..:::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::::::.: : XP_016 AALYFTLSSLTSVGFGNVSANTDAEKIFSICTMLIGALMHALVFGNVTAIIQRMYSRWSL 250 260 270 280 290 300 520 530 540 550 560 570 pF1KA1 YHSRTRDLRDYIRIHRIPKPLKQRMLEYFQATWAVNNGIDTTELLQSLPDELRADIAMHL ::.::.::.:.::.:..:. ::::::::::.::.::::::..:::...:::::.::.::: XP_016 YHTRTKDLKDFIRVHHLPQQLKQRMLEYFQTTWSVNNGIDSNELLKDFPDELRSDITMHL 310 320 330 340 350 360 580 590 600 610 620 630 pF1KA1 HKEVLQLPLFEAASRGCLRALSLALRPAFCTPGEYLIHQGDALQALYFVCSGSMEVLKGG .::.::: ::: :::::::.::: .. .::.:::::..:::::::.:::::::::::: . XP_016 NKEILQLSLFECASRGCLRSLSLHIKTSFCAPGEYLLRQGDALQAIYFVCSGSMEVLKDS 370 380 390 400 410 420 640 650 660 670 680 690 pF1KA1 TVLAILGKGDLIGCELPRREQVVKANADVKGLTYCVLQCLQLAGLHDSLALYPEFAPRFS :::::::::::: .: ..::.:.:::::.:::: :::. : :: . : ::::.: .: XP_016 MVLAILGKGDLIGANLSIKDQVIKTNADVKALTYCDLQCIILKGLFEVLDLYPEYAHKFV 430 440 450 460 470 480 700 710 720 730 740 pF1KA1 RGLRGELSYNLGAGGGSAEVDTSSLSGDNTLMSTLEEKETDG--EQGPTV-----SPAPA . .. .:.::: : : :. : ......: : : . . .. :.. . XP_016 EDIQHDLTYNLREG---HESDVISRLSNKSMVSQSEPKGNGNINKRLPSIVEDEEEEEEG 490 500 510 520 530 540 750 760 770 780 790 pF1KA1 DEPSSPLLSPGCT--SSSSAAKL--------LSPRRTAPR--PRLGGRGRPGRAGALKAE .: . ::: :: ::: :. :: .. : : . . : .:... :.. XP_016 EEEEAVSLSPICTRGSSSRNKKVGSNKAYLGLSLKQLASGTVP-FHSPIRVSRSNSPKTK 550 560 570 580 590 600 800 810 820 830 840 pF1KA1 A---GPSAPPRALEGLRLPPMPWNV--PPDLSP-RVVDGIEDGCGSDQPK-FSFRVGQSG :. : ..:.: : :::::: :.::::::: .:.. . :.: . XP_016 QEIDPPNHNKRKEKNLKLQLSTLNNAGPPDLSPSRIVDGIEDGNSSEESQTFDFGSERIR 610 620 630 640 650 660 850 860 870 880 890 900 pF1KA1 PECSSSPSPG-PESGLLTVPHGPSEARNTDTLDKLRQAVTELSEQVLQMREGLQSLRQAV : :: : :: : .. :... ..:: . :: :...: :. . .... : . XP_016 SEPRISPPLGDPEIGAAVLFIKAEETKQ--QINKLNSEVTTLTQEVSQLGKDMRNVIQLL 670 680 690 700 710 910 920 930 940 950 960 pF1KA1 QLVLAPHREGPCPRASGEGPCPASTSGLLQPLCVDTGASSYCLQPPAGSVLSGTWPHPRP . ::.:.. . . . ::. : :: .. .: . ::. .: .... . . XP_016 ENVLSPQQPSRFCSLHSTSVCPSRES--LQTR-TSWSAHQPCLHLQTG---GAAYTQAQL 720 730 740 750 760 770 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KA1 GPPPLMAP-WPWGPPASQSSPWPRATAFWTSTSDSEPPASGDLCSEPSTPASPPPSEEGA . . : : . ::: :. : . .::: : .: :: XP_016 CSSNITSDIWSVDPSSVGSSPQ-RTGAHEQNPADSELYHSPSLDYSPSHYQVVQEGHLQF 780 790 800 810 820 830 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KA1 RTGPAEPVSQAEATSTGEPPPGSGGLALPWDPHSLEMVLIGCHGSGTVQWTQEEGTGV XP_016 LRCISPHSDSTLTPLQSISATLSSSVCSSSETSLHLVLPSRSEEGSFSQGTVSSFSLENL 840 850 860 870 880 890 >>XP_016861188 (OMIM: 608260) PREDICTED: potassium volta (1030 aa) initn: 2668 init1: 1297 opt: 1336 Z-score: 663.8 bits: 134.5 E(85289): 3.1e-30 Smith-Waterman score: 2672; 50.1% identity (71.6% similar) in 936 aa overlap (106-1013:28-919) 80 90 100 110 120 130 pF1KA1 SELVRQQIRKALDEHKEFKAELILYRKSGLPFWCLLDVIPIKNEKGEVALFLVSHKDISE :::::::..:::::::.:.:::.: :::.. XP_016 MPVMKGLLAPQNTFLDTIATRFDGTRSPFWCLLDIVPIKNEKGDVVLFLASFKDITD 10 20 30 40 50 140 150 160 170 180 190 pF1KA1 TKNRGGPDRWKETG-GGRRRYGRARSKGFNANRRRSRAVLYHLSGHLQKQPKGKHKLNKG :: . :. :: :: : : :.. ::::::::::.:::::.. :.: :.:.. XP_016 TKVKITPEDKKEDKVKGRSRAGT----HFDSARRRSRAVLYHISGHLQRREKNKLKINNN 60 70 80 90 100 110 200 210 220 230 240 250 pF1KA1 VFGEKPNLPEYKVAAIRKSPFILLHCGALRATWDGFILLATLYVAVTVPYSVCVSTAREP :: .:: .:::::. .:: ::::: ....: :: .:::::.::::::::.:: . XP_016 VFVDKPAFPEYKVSDAKKSKFILLHFSTFKAGWDWLILLATFYVAVTVPYNVCFIGNDDL 120 130 140 150 160 170 260 270 280 290 300 310 pF1KA1 SAARGPPSVCDLAVEVLFILDIVLNFRTTFVSKSGQVVFAPKSICLHYVTTWFLLDVIAA :..:. .: :.:::.:::.::.::::::.:::::::.: .:::.:::::::..:.::: XP_016 STTRST-TVSDIAVEILFIIDIILNFRTTYVSKSGQVIFEARSICIHYVTTWFIIDLIAA 180 190 200 210 220 230 320 330 340 350 360 370 pF1KA1 LPFDLLHAFKVNVYFGAHLLKTVRLLRLLRLLPRLDRYSQYSAVVLTLLMAVFALLAHWV ::::::.::.:.: .::::::::::::::: .::::::.:..::::::..:::::::. XP_016 LPFDLLYAFNVTVVSLVHLLKTVRLLRLLRLLQKLDRYSQHSTIVLTLLMSMFALLAHWM 240 250 260 270 280 290 380 390 400 410 420 430 pF1KA1 ACVWFYIGQREIESSESELPEIGWLQELARRLETPYYLVGRRPAGGNSSGQSDNCSSSSE ::.:. ::. : :.. :.:::.::..:::.::: ::.. XP_016 ACIWYVIGKMEREDNSLLKWEVGWLHELGKRLESPYY--------GNNT----------- 300 310 320 330 440 450 460 470 480 490 pF1KA1 ANGTGLELLGGPSLRSAYITSLYFALSSLTSVGFGNVSANTDTEKIFSICTMLIGALMHA :::::.:::::..:::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::: XP_016 --------LGGPSIRSAYIAALYFTLSSLTSVGFGNVSANTDAEKIFSICTMLIGALMHA 340 350 360 370 380 500 510 520 530 540 550 pF1KA1 VVFGNVTAIIQRMYARRFLYHSRTRDLRDYIRIHRIPKPLKQRMLEYFQATWAVNNGIDT .:::::::::::::.: :::.::.::.:.::.:..:. ::::::::::.::.::::::. XP_016 LVFGNVTAIIQRMYSRWSLYHTRTKDLKDFIRVHHLPQQLKQRMLEYFQTTWSVNNGIDS 390 400 410 420 430 440 560 570 580 590 600 610 pF1KA1 TELLQSLPDELRADIAMHLHKEVLQLPLFEAASRGCLRALSLALRPAFCTPGEYLIHQGD .:::...:::::.::.:::.::.::: ::: :::::::.::: .. .::.:::::..::: XP_016 NELLKDFPDELRSDITMHLNKEILQLSLFECASRGCLRSLSLHIKTSFCAPGEYLLRQGD 450 460 470 480 490 500 620 630 640 650 660 670 pF1KA1 ALQALYFVCSGSMEVLKGGTVLAILGKGDLIGCELPRREQVVKANADVKGLTYCVLQCLQ ::::.:::::::::::: . :::::::::::: .: ..::.:.:::::.:::: :::. XP_016 ALQAIYFVCSGSMEVLKDSMVLAILGKGDLIGANLSIKDQVIKTNADVKALTYCDLQCII 510 520 530 540 550 560 680 690 700 710 720 730 pF1KA1 LAGLHDSLALYPEFAPRFSRGLRGELSYNLGAGGGSAEVDTSSLSGDNTLMSTLEEKETD : :: . : ::::.: .: . .. .:.::: : : :. : ......: : : . XP_016 LKGLFEVLDLYPEYAHKFVEDIQHDLTYNLREG---HESDVISRLSNKSMVSQSEPKGNG 570 580 590 600 610 620 740 750 760 770 pF1KA1 G--EQGPTV-----SPAPADEPSSPLLSPGCT--SSSSAAKL--------LSPRRTAPRP . .. :.. ..: . ::: :: ::: :. :: .. : XP_016 NINKRLPSIVEDEEEEEEGEEEEAVSLSPICTRGSSSRNKKVGSNKAYLGLSLKQLASGT 630 640 650 660 670 680 780 790 800 810 820 830 pF1KA1 R-LGGRGRPGRAGALKAEA---GPSAPPRALEGLRLPPMPWNV--PPDLSP-RVVDGIED . . : .:... :.. :. : ..:.: : :::::: :.:::::: XP_016 VPFHSPIRVSRSNSPKTKQEIDPPNHNKRKEKNLKLQLSTLNNAGPPDLSPSRIVDGIED 690 700 710 720 730 740 840 850 860 870 880 pF1KA1 GCGSDQPK-FSFRVGQSGPECSSSPSPG-PESGLLTVPHGPSEARNTDTLDKLRQAVTEL : .:.. . :.: . : :: : :: : .. :... ..:: . :: : XP_016 GNSSEESQTFDFGSERIRSEPRISPPLGDPEIGAAVLFIKAEETKQQ--INKLNSEVTTL 750 760 770 780 790 800 890 900 910 920 930 940 pF1KA1 SEQVLQMREGLQSLRQAVQLVLAPHREGPCPRASGEGPCPASTSGLLQPLCVDTGASSYC ...: :. . .... : .. ::.:.. . . . ::. : :: .. .: . : XP_016 TQEVSQLGKDMRNVIQLLENVLSPQQPSRFCSLHSTSVCPSRES--LQTR-TSWSAHQPC 810 820 830 840 850 950 960 970 980 990 1000 pF1KA1 LQPPAGSVLSGTWPHPRPGPPPLMAP-WPWGPPASQSSPWPRATAFWTSTSDSEPPASGD :. .:.. .. . . . . : : . ::: :. : . .::: : . XP_016 LHLQTGGA---AYTQAQLCSSNITSDIWSVDPSSVGSSPQ-RTGAHEQNPADSELYHSPS 860 870 880 890 900 910 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA1 LCSEPSTPASPPPSEEGARTGPAEPVSQAEATSTGEPPPGSGGLALPWDPHSLEMVLIGC : :: XP_016 LDYSPSHYQVVQEGHLQFLRCISPHSDSTLTPLQSISATLSSSVCSSSETSLHLVLPSRS 920 930 940 950 960 970 >>NP_653234 (OMIM: 608260) potassium voltage-gated chann (1107 aa) initn: 3170 init1: 1297 opt: 1336 Z-score: 663.4 bits: 134.5 E(85289): 3.3e-30 Smith-Waterman score: 3194; 51.8% identity (73.8% similar) in 1040 aa overlap (1-1013:1-996) 10 20 30 40 50 60 pF1KA1 MPAMRGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFVLGNAQVAGLFPVVYCSDGFCDLTGFSRAEV ::.:.::::::::::::::::::::::::.:.::::: ::.::::::::.:.::.:.:: NP_653 MPVMKGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFILANAQVAKGFPIVYCSDGFCELAGFARTEV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA1 MQRGCACSFLYGPDTSELVRQQIRKALDEHKEFKAELILYRKSGLPFWCLLDVIPIKNEK ::..:.:.::.: .:.: . ::.:.:.:. :::.:...:.:.: :::::::..:::::: NP_653 MQKSCSCKFLFGVETNEQLMLQIEKSLEEKTEFKGEIMFYKKNGSPFWCLLDIVPIKNEK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 GEVALFLVSHKDISETKNRGGPDRWKETG-GGRRRYGRARSKGFNANRRRSRAVLYHLSG :.:.:::.: :::..:: . :. :: :: : : :.. ::::::::::.:: NP_653 GDVVLFLASFKDITDTKVKITPEDKKEDKVKGRSRAGT----HFDSARRRSRAVLYHISG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 HLQKQPKGKHKLNKGVFGEKPNLPEYKVAAIRKSPFILLHCGALRATWDGFILLATLYVA :::.. :.: :.:..:: .:: .:::::. .:: ::::: ....: :: .:::::.::: NP_653 HLQRREKNKLKINNNVFVDKPAFPEYKVSDAKKSKFILLHFSTFKAGWDWLILLATFYVA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 VTVPYSVCVSTAREPSAARGPPSVCDLAVEVLFILDIVLNFRTTFVSKSGQVVFAPKSIC :::::.:: . :..:. .: :.:::.:::.::.::::::.:::::::.: .::: NP_653 VTVPYNVCFIGNDDLSTTRST-TVSDIAVEILFIIDIILNFRTTYVSKSGQVIFEARSIC 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 LHYVTTWFLLDVIAALPFDLLHAFKVNVYFGAHLLKTVRLLRLLRLLPRLDRYSQYSAVV .:::::::..:.:::::::::.::.:.: .::::::::::::::: .::::::.:..: NP_653 IHYVTTWFIIDLIAALPFDLLYAFNVTVVSLVHLLKTVRLLRLLRLLQKLDRYSQHSTIV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KA1 LTLLMAVFALLAHWVACVWFYIGQREIESSESELPEIGWLQELARRLETPYYLVGRRPAG :::::..:::::::.::.:. ::. : :.. :.:::.::..:::.::: NP_653 LTLLMSMFALLAHWMACIWYVIGKMEREDNSLLKWEVGWLHELGKRLESPYY-------- 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KA1 GNSSGQSDNCSSSSEANGTGLELLGGPSLRSAYITSLYFALSSLTSVGFGNVSANTDTEK ::.. :::::.:::::..:::.:::::::::::::::::.:: NP_653 GNNT-------------------LGGPSIRSAYIAALYFTLSSLTSVGFGNVSANTDAEK 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 pF1KA1 IFSICTMLIGALMHAVVFGNVTAIIQRMYARRFLYHSRTRDLRDYIRIHRIPKPLKQRML :::::::::::::::.:::::::::::::.: :::.::.::.:.::.:..:. :::::: NP_653 IFSICTMLIGALMHALVFGNVTAIIQRMYSRWSLYHTRTKDLKDFIRVHHLPQQLKQRML 450 460 470 480 490 500 540 550 560 570 580 590 pF1KA1 EYFQATWAVNNGIDTTELLQSLPDELRADIAMHLHKEVLQLPLFEAASRGCLRALSLALR ::::.::.::::::..:::...:::::.::.:::.::.::: ::: :::::::.::: .. 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NP_653 SNKSMVSQSEPKGNGNINKRLPSIVEDEEEEEEGEEEEAVSLSPICTRGSSSRNKKVGSN 690 700 710 720 730 740 770 780 790 800 810 pF1KA1 -----LSPRRTAPRPR-LGGRGRPGRAGALKAEA---GPSAPPRALEGLRLPPMPWNV-- :: .. : . . : .:... :.. :. : ..:.: : NP_653 KAYLGLSLKQLASGTVPFHSPIRVSRSNSPKTKQEIDPPNHNKRKEKNLKLQLSTLNNAG 750 760 770 780 790 800 820 830 840 850 860 870 pF1KA1 PPDLSPRVVDGIEDGCGSDQPK-FSFRVGQSGPECSSSPSPG-PESGLLTVPHGPSEARN :::::::.::::::: .:.. . :.: . : :: : :: : .. :... 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