FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1286, 1205 aa 1>>>pF1KA1286 1205 - 1205 aa - 1205 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4959+/-0.000997; mu= -5.6425+/- 0.060 mean_var=281.0679+/-56.479, 0's: 0 Z-trim(114.3): 60 B-trim: 362 in 1/53 Lambda= 0.076501 statistics sampled from 14804 (14858) to 14804 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.757), E-opt: 0.2 (0.456), width: 16 Scan time: 6.800 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS34437.1 BRPF3 gene_id:27154|Hs108|chr6 (1205) 8177 916.5 0 CCDS33692.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1220) 1949 229.2 4.9e-59 CCDS82730.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1213) 1915 225.4 6.6e-58 CCDS2575.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1214) 1915 225.4 6.6e-58 CCDS82729.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1119) 1890 222.6 4.2e-57 CCDS14080.1 BRD1 gene_id:23774|Hs108|chr22 (1058) 1846 217.8 1.2e-55 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::::: CCDS34 TSSYL >>CCDS33692.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1220 aa) initn: 3154 init1: 1515 opt: 1949 Z-score: 1173.3 bits: 229.2 E(32554): 4.9e-59 Smith-Waterman score: 3801; 50.8% identity (71.8% similar) in 1241 aa overlap (1-1202:58-1217) 10 20 pF1KA1 MRKPRRKSRQN-AEGRRSPSPYSLKCSPTR .:: ..:.::. ...:::: .. :: : CCDS33 CRKVYKSYSGIEYHLYHYDHDNPPPPQQTPLRKHKKKGRQSRPANKQSPSPSEVSQSPGR 30 40 50 60 70 80 30 40 50 60 70 80 pF1KA1 ETLTYAQAQRIVEVDIDGRLHRISIYDPLKIITEDELTAQDITECNSNKENSEQPQFPGK :...::::::.::::. ::.:::::.: : ...::: . .. : .:::::.: : : CCDS33 EVMSYAQAQRMVEVDLHGRVHRISIFDNLDVVSEDEEAPEEAPENGSNKENTETPAATPK 90 100 110 120 130 140 90 100 110 120 130 140 pF1KA1 SKKPSSKGKKKESCSKH----ASGTSFHLPQPSFRMVDSGIQPEAPPLPAAYYRYIEKPP : : ..: :.:.: .: ...:. .::. .: ... :.::: :..::::::: CCDS33 SGKHKNKEKRKDSNHHHHHNVSASTTPKLPEVVYRELEQDT-PDAPPRPTSYYRYIEKSA 150 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 pF1KA1 EDLDAEVEYDMDEEDLAWLDMVNEKRRVDGHSLVSADTFELLVDRLEKESYLESRSSGAQ :.:: :::::::::: :::..::.:...: : . . :: :.::::::::.::...: CCDS33 EELDEEVEYDMDEEDYIWLDIMNERRKTEGVSPIPQEIFEYLMDRLEKESYFESHNKGDP 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 260 pF1KA1 QSLIDEDAFCCVCLDDECHNSNVILFCDICNLAVHQECYGVPYIPEGQWLCRCCLQSPSR ..:.:::: ::.: : ::.:::::::::.::::::::::::::::::::::: ::::::: CCDS33 NALVDEDAVCCICNDGECQNSNVILFCDMCNLAVHQECYGVPYIPEGQWLCRRCLQSPSR 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 pF1KA1 PVDCILCPNKGGAFKQTSDGHWAHVVCAIWIPEVCFANTVFLEPIEGIDNIPPARWKLTC ::: ::::::::::::.::.:::::::.::::::::::::::::..:..:::::::::: CCDS33 AVDCALCPNKGGAFKQTDDGRWAHVVCALWIPEVCFANTVFLEPIDSIEHIPPARWKLTC 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 pF1KA1 YICKQKGLGAAIQCHKVNCYTAFHVTCAQRAGLFMKIEPMRETSLNGTIFTVRKTAYCEA :::::.: :: :::::.::::::::::::.:::.::.::.:::. ::: :.:::::::. CCDS33 YICKQRGSGACIQCHKANCYTAFHVTCAQQAGLYMKMEPVRETGANGTSFSVRKTAYCDI 390 400 410 420 430 440 390 400 410 420 430 440 pF1KA1 HSPPGAATARRKGDSPRSISETGDEEGLKEGDGEEEEEEEVEEEEQEAQGGVSGSLKGVP :.::: .::: : .:....:::.: .:::.:..: : ..: . CCDS33 HTPPG--SARRL---P----------ALSHSEGEEDE----DEEEDEGKGWSSEKVKKAK 450 460 470 480 450 460 470 480 490 500 pF1KA1 KKSKMSLKQKIKKEPEEAGQDTPSTLPMLAVPQIPSYRLNKICSGLSFQRKNQFMQRLHN ::....:. : :. .. :...:: :: .::.:: . :..:::.:::::::. CCDS33 AKSRIKMKKARKILAEKR-----AAAPVVSVPCIPPHRLSKITNRLTIQRKSQFMQRLHS 490 500 510 520 530 540 510 520 530 540 550 560 pF1KA1 YWLLKRQARNGVPLIRRLHSHLQSQRNAEQ--REQDEKTSAVKEELKYWQKLRHDLERAR :: ::::.::::::.:::..::::::: .: :....:. :.::.:: ::.::::::::: CCDS33 YWTLKRQSRNGVPLLRRLQTHLQSQRNCDQVGRDSEDKNWALKEQLKSWQRLRHDLERAR 550 560 570 580 590 600 570 580 590 600 610 620 pF1KA1 LLIELIRKREKLKREQVKVQQAAMELELMPFNVLLRTTLDLLQEKDPAHIFAEPVNLSEV ::.:::::::::::: .:::: :::..: :: .::: ::. ::::: ..::.::: :::: CCDS33 LLVELIRKREKLKRETIKVQQIAMEMQLTPFLILLRKTLEQLQEKDTGNIFSEPVPLSEV 610 620 630 640 650 660 630 640 650 660 670 pF1KA1 ------PDYLEFISKPMDFSTMRRKLESHLYRTLEEFEEDFNLIVTNCMKYNAKDTIFHR ::::. :.::::: ::...::.. : ....:::::::::.::.:::::::::.: CCDS33 TELDEVPDYLDHIKKPMDFFTMKQNLEAYRYLNFDDFEEDFNLIVSNCLKYNAKDTIFYR 670 680 690 700 710 720 680 690 700 710 720 730 pF1KA1 AAVRLRDLGGAILRHARRQAENIGYDPERGTHLPESPKLEDFYRFSWEDV---DNILIPE ::::::. :::.::.::::::..: : : : :.:.: .. . . ::. . ... : CCDS33 AAVRLREQGGAVLRQARRQAEKMGIDFETGMHIPHSLAGDEATHHT-EDAAEEERLVLLE 730 740 750 760 770 780 740 750 760 770 780 790 pF1KA1 NRAHLSPEVQLKELLEKLDLVSAMRSSGARTRRVRLLRREINALRQKLAQPPPPQPPSLN :. :: : ::: :::.:: :.: ..: .:.::......:..:::.:::. CCDS33 NQKHLPVEEQLKLLLERLDEVNASKQSVGRSRRAKMIKKEMTALRRKLAH---------- 790 800 810 820 830 800 810 820 830 840 850 pF1KA1 KTVSNGELPAGPQGDAAVLEQALQEEPEDDGDRDDSKLPP-PPTLEPTGPAPSLSEQESP . .: .: :: : . ..: : : . . : . : .:. : CCDS33 ------QRETGRDG------------PERHGPSSRGSLTPHPAACDKDGQTDSAAEESSS 840 850 860 870 860 870 880 890 900 910 pF1KA1 PEPPT-LKPINDSKPPSRFLKPRKVEEDELLEKSPLQLGNEPLQRLLSDNGINRLSLMAP : : : .: : . . .: . .:.: : : .: . :: : :.: CCDS33 QETSKGLGPNMSSTPAHEVGRRTSVL---FSKKNPKTAG--PPKRP-GRPPKNRESQMTP 880 890 900 910 920 920 930 940 950 960 970 pF1KA1 DTPAGTPLSGVGRRTSVLFKKAKNGVKLQRSPDRVLENGEDHGVAGSPASPASIEEERHS . .:.:.. ... : : ::: :.: .. . .. . CCDS33 -SHGGSPVGPPQLPIMSSLRQRKRG----RSP--------------RPSSSSDSDSDKST 930 940 950 960 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KA1 RKRPRSRSCSESEGERSPQQEEETGMTNGFGKHTESGSDSECSLGLSGGLAFEACSGLTP . : . . : .: .. . : . .:.:::: : . :.. : . : :: CCDS33 EDPPMDLPANGFSGGNQPVKKSFLVYRNDCSL-PRSSSDSESSSSSSSSAASDRTS-TTP 970 980 990 1000 1010 1020 1040 1050 1060 1070 pF1KA1 PKRSRGKPALSRVPFLEGVNGDSD------YN-GSGR----SLLLPFEDRG--------- :..::::..:: : : . :.. :. :.:: :.. :: CCDS33 SKQGRGKPSFSRGTFPEDSSEDTSGTENEAYSVGTGRGVGHSMVRKSLGRGAGWLSEDED 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KA1 -DLKPLELVWAKCRGYPSYPALIIDPKMPREGLLHNGVPIPVPPLDVLKLGEQKQAEAGE : :.:::::::::::::::::::::::::..:.:::::::::.::::::: :: : CCDS33 SPLDALDLVWAKCRGYPSYPALIIDPKMPREGMFHHGVPIPVPPLEVLKLGEQMTQEARE 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KA1 KLFLVLFFDNKRTWQWLPRDKVLPLGVEDTVDKLKMLEGRKTSIRKSVQVAYDRAMIHLS .:.:::::::::::::::: :..::::.. .:: :::::::..::::::.:: ::. : : CCDS33 HLYLVLFFDNKRTWQWLPRTKLVPLGVNQDLDKEKMLEGRKSNIRKSVQIAYHRALQHRS 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1200 pF1KA1 RVRGPHSFVTSSYL .:.: .: :: CCDS33 KVQGEQSSETSDSD 1210 1220 >>CCDS82730.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1213 aa) initn: 3231 init1: 1515 opt: 1915 Z-score: 1153.0 bits: 225.4 E(32554): 6.6e-58 Smith-Waterman score: 3826; 51.1% identity (72.3% similar) in 1234 aa overlap (1-1202:58-1210) 10 20 pF1KA1 MRKPRRKSRQN-AEGRRSPSPYSLKCSPTR .:: ..:.::. ...:::: .. :: : CCDS82 CRKVYKSYSGIEYHLYHYDHDNPPPPQQTPLRKHKKKGRQSRPANKQSPSPSEVSQSPGR 30 40 50 60 70 80 30 40 50 60 70 80 pF1KA1 ETLTYAQAQRIVEVDIDGRLHRISIYDPLKIITEDELTAQDITECNSNKENSEQPQFPGK :...::::::.::::. ::.:::::.: : ...::: . .. : .:::::.: : : CCDS82 EVMSYAQAQRMVEVDLHGRVHRISIFDNLDVVSEDEEAPEEAPENGSNKENTETPAATPK 90 100 110 120 130 140 90 100 110 120 130 140 pF1KA1 SKKPSSKGKKKESCSKH----ASGTSFHLPQPSFRMVDSGIQPEAPPLPAAYYRYIEKPP : : ..: :.:.: .: ...:. .::. .: ... :.::: :..::::::: CCDS82 SGKHKNKEKRKDSNHHHHHNVSASTTPKLPEVVYRELEQDT-PDAPPRPTSYYRYIEKSA 150 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 pF1KA1 EDLDAEVEYDMDEEDLAWLDMVNEKRRVDGHSLVSADTFELLVDRLEKESYLESRSSGAQ :.:: :::::::::: :::..::.:...: : . . :: :.::::::::.::...: CCDS82 EELDEEVEYDMDEEDYIWLDIMNERRKTEGVSPIPQEIFEYLMDRLEKESYFESHNKGDP 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 260 pF1KA1 QSLIDEDAFCCVCLDDECHNSNVILFCDICNLAVHQECYGVPYIPEGQWLCRCCLQSPSR ..:.:::: ::.: : ::.:::::::::.::::::::::::::::::::::: ::::::: CCDS82 NALVDEDAVCCICNDGECQNSNVILFCDMCNLAVHQECYGVPYIPEGQWLCRRCLQSPSR 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 pF1KA1 PVDCILCPNKGGAFKQTSDGHWAHVVCAIWIPEVCFANTVFLEPIEGIDNIPPARWKLTC ::: ::::::::::::.::.:::::::.::::::::::::::::..:..:::::::::: CCDS82 AVDCALCPNKGGAFKQTDDGRWAHVVCALWIPEVCFANTVFLEPIDSIEHIPPARWKLTC 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 pF1KA1 YICKQKGLGAAIQCHKVNCYTAFHVTCAQRAGLFMKIEPMRETSLNGTIFTVRKTAYCEA :::::.: :: :::::.::::::::::::.:::.::.::.:::. ::: :.:::::::. 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CCDS82 VGPPQLPIMSSLRQRKRG----RSP--------------RPSSSSDSDSDKSTEDPPMDL 930 940 950 960 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KA1 SCSESEGERSPQQEEETGMTNGFGKHTESGSDSECSLGLSGGLAFEACSGLTPPKRSRGK . : .: .. . : . .:.:::: : . :.. : . : :: :..::: CCDS82 PANGFSGGNQPVKKSFLVYRNDCSL-PRSSSDSESSSSSSSSAASDRTS-TTPSKQGRGK 970 980 990 1000 1010 1020 1040 1050 1060 1070 pF1KA1 PALSRVPFLEGVNGDSD------YN-GSGR----SLLLPFEDRG----------DLKPLE :..:: : : . :.. :. :.:: :.. :: : :. 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CCDS25 FFDNKRTWQWLPRTKLVPLGVNQDLDKEKMLEGRKSNIRKSVQIAYHRALQHRSKVQGEQ 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1200 pF1KA1 SFVTSSYL : :: CCDS25 SSETSDSD 1210 >>CCDS82729.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1119 aa) initn: 3455 init1: 1515 opt: 1890 Z-score: 1138.7 bits: 222.6 E(32554): 4.2e-57 Smith-Waterman score: 3661; 50.0% identity (70.6% similar) in 1214 aa overlap (1-1202:58-1116) 10 20 pF1KA1 MRKPRRKSRQN-AEGRRSPSPYSLKCSPTR .:: ..:.::. ...:::: .. :: : CCDS82 CRKVYKSYSGIEYHLYHYDHDNPPPPQQTPLRKHKKKGRQSRPANKQSPSPSEVSQSPGR 30 40 50 60 70 80 30 40 50 60 70 80 pF1KA1 ETLTYAQAQRIVEVDIDGRLHRISIYDPLKIITEDELTAQDITECNSNKENSEQPQFPGK :...::::::.::::. ::.:::::.: : ...::: . .. : .:::::.: : : CCDS82 EVMSYAQAQRMVEVDLHGRVHRISIFDNLDVVSEDEEAPEEAPENGSNKENTETPAATPK 90 100 110 120 130 140 90 100 110 120 130 140 pF1KA1 SKKPSSKGKKKESCSKH----ASGTSFHLPQPSFRMVDSGIQPEAPPLPAAYYRYIEKPP : : ..: :.:.: .: ...:. .::. .: ... :.::: :..::::::: CCDS82 SGKHKNKEKRKDSNHHHHHNVSASTTPKLPEVVYRELEQDT-PDAPPRPTSYYRYIEKSA 150 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 pF1KA1 EDLDAEVEYDMDEEDLAWLDMVNEKRRVDGHSLVSADTFELLVDRLEKESYLESRSSGAQ :.:: :::::::::: :::..::.:...: : . . :: :.::::::::.::...: CCDS82 EELDEEVEYDMDEEDYIWLDIMNERRKTEGVSPIPQEIFEYLMDRLEKESYFESHNKGDP 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 260 pF1KA1 QSLIDEDAFCCVCLDDECHNSNVILFCDICNLAVHQECYGVPYIPEGQWLCRCCLQSPSR ..:.:::: ::.: : ::.:::::::::.::::::::::::::::::::::: ::::::: CCDS82 NALVDEDAVCCICNDGECQNSNVILFCDMCNLAVHQECYGVPYIPEGQWLCRRCLQSPSR 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 pF1KA1 PVDCILCPNKGGAFKQTSDGHWAHVVCAIWIPEVCFANTVFLEPIEGIDNIPPARWKLTC ::: ::::::::::::.::.:::::::.::::::::::::::::..:..:::::::::: CCDS82 AVDCALCPNKGGAFKQTDDGRWAHVVCALWIPEVCFANTVFLEPIDSIEHIPPARWKLTC 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 pF1KA1 YICKQKGLGAAIQCHKVNCYTAFHVTCAQRAGLFMKIEPMRETSLNGTIFTVRKTAYCEA :::::.: :: :::::.::::::::::::.:::.::.::.:::. ::: :.:::::::. CCDS82 YICKQRGSGACIQCHKANCYTAFHVTCAQQAGLYMKMEPVRETGANGTSFSVRKTAYCDI 390 400 410 420 430 440 390 400 410 420 430 440 pF1KA1 HSPPGAATARRKGDSPRSISETGDEEGLKEGDGEEEEEEEVEEEEQEAQGGVSGSLKGVP :.::: .::: : .:....:::.: .:::.:..: : ..: . CCDS82 HTPPG--SARRL---P----------ALSHSEGEEDE----DEEEDEGKGWSSEKVKKAK 450 460 470 480 450 460 470 480 490 500 pF1KA1 KKSKMSLKQKIKKEPEEAGQDTPSTLPMLAVPQIPSYRLNKICSGLSFQRKNQFMQRLHN ::....:. : :. .. :...:: :: .::.:: . :..:::.:::::::. CCDS82 AKSRIKMKKARKILAEKR-----AAAPVVSVPCIPPHRLSKITNRLTIQRKSQFMQRLHS 490 500 510 520 530 540 510 520 530 540 550 560 pF1KA1 YWLLKRQARNGVPLIRRLHSHLQSQRNAEQ--REQDEKTSAVKEELKYWQKLRHDLERAR :: ::::.::::::.:::..::::::: .: :....:. :.::.:: ::.::::::::: CCDS82 YWTLKRQSRNGVPLLRRLQTHLQSQRNCDQVGRDSEDKNWALKEQLKSWQRLRHDLERAR 550 560 570 580 590 600 570 580 590 600 610 620 pF1KA1 LLIELIRKREKLKREQVKVQQAAMELELMPFNVLLRTTLDLLQEKDPAHIFAEPVNLSEV ::.:::::::::::: .:::: :::..: :: .::: ::. ::::: ..::.::: :::: CCDS82 LLVELIRKREKLKRETIKVQQIAMEMQLTPFLILLRKTLEQLQEKDTGNIFSEPVPLSEV 610 620 630 640 650 660 630 640 650 660 670 680 pF1KA1 PDYLEFISKPMDFSTMRRKLESHLYRTLEEFEEDFNLIVTNCMKYNAKDTIFHRAAVRLR ::::. :.::::: ::...::.. : ....:::::::::.::.:::::::::.::::::: CCDS82 PDYLDHIKKPMDFFTMKQNLEAYRYLNFDDFEEDFNLIVSNCLKYNAKDTIFYRAAVRLR 670 680 690 700 710 720 690 700 710 720 730 740 pF1KA1 DLGGAILRHARRQAENIGYDPERGTHLPESPKLEDFYRFSWEDV---DNILIPENRAHLS . :::.::.::::::..: : : : :.:.: .. . . ::. . ... ::. :: CCDS82 EQGGAVLRQARRQAEKMGIDFETGMHIPHSLAGDEATHHT-EDAAEEERLVLLENQKHLP 730 740 750 760 770 780 750 760 770 780 790 800 pF1KA1 PEVQLKELLEKLDLVSAMRSSGARTRRVRLLRREINALRQKLAQPPPPQPPSLNKTVSNG : ::: :::.:: :.: ..: .:.::......:..:::.:::. CCDS82 VEEQLKLLLERLDEVNASKQSVGRSRRAKMIKKEMTALRRKLAH---------------- 790 800 810 820 810 820 830 840 850 pF1KA1 ELPAGPQGDAAVLEQALQEEPEDDGDRDDSKLPP-PPTLEPTGPAPSLSEQESPPEPPTL . .: .: :: : . ..: : : . . : . : .:. : : CCDS82 QRETGRDG------------PERHGPSSRGSLTPHPAACDKDGQTDSAAEESSSQETSKD 830 840 850 860 870 860 870 880 890 900 910 pF1KA1 KPINDSKPPSRFLKPRKVEEDELLEKSPLQLGNEPLQRLLSDNGINRLSLMAPDTPAGTP : : .. ::.:... CCDS82 LPANG-----------------------FSGGNQPVKKS--------------------- 880 920 930 940 950 960 970 pF1KA1 LSGVGRRTSVLFKKAKNGVKLQRSPDRVLENGEDHGVAGSPASPASIEEERHSRKRPRSR : .: .: :: ...... ..: .: :: . :. :.. CCDS82 -----------FLVYRNDCSLPRS------SSDSESSSSSSSSAASDRTSTTPSKQGRGK 890 900 910 920 930 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KA1 SCSESEGERSPQQEEETGMTNGFGKHTESGSDSEC-SLGLSGGLAFEACSGLTPPKRSRG : :.: .. :.: ::...: :.: . :. : . ..: : CCDS82 P-SFSRGTFPEDSSEDT-----------SGTENEAYSVGTGRGV------GHSMVRKSLG 940 950 960 970 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KA1 KPALSRVPFLEGVNGDSDYNGSGRSLLLPFEDRGDLKPLELVWAKCRGYPSYPALIIDPK . :.: : .. . : :.:::::::::::::::::::: CCDS82 R-------------------GAG---WLSEDEDSPLDALDLVWAKCRGYPSYPALIIDPK 980 990 1000 1010 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KA1 MPREGLLHNGVPIPVPPLDVLKLGEQKQAEAGEKLFLVLFFDNKRTWQWLPRDKVLPLGV :::::..:.:::::::::.::::::: :: :.:.:::::::::::::::: :..:::: CCDS82 MPREGMFHHGVPIPVPPLEVLKLGEQMTQEAREHLYLVLFFDNKRTWQWLPRTKLVPLGV 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KA1 EDTVDKLKMLEGRKTSIRKSVQVAYDRAMIHLSRVRGPHSFVTSSYL .. .:: :::::::..::::::.:: ::. : :.:.: .: :: CCDS82 NQDLDKEKMLEGRKSNIRKSVQIAYHRALQHRSKVQGEQSSETSDSD 1080 1090 1100 1110 >>CCDS14080.1 BRD1 gene_id:23774|Hs108|chr22 (1058 aa) initn: 3907 init1: 1453 opt: 1846 Z-score: 1112.8 bits: 217.8 E(32554): 1.2e-55 Smith-Waterman score: 3696; 51.4% identity (69.9% similar) in 1219 aa overlap (1-1198:1-1052) 10 20 30 40 50 60 pF1KA1 MRKPRRKSRQNAEGRRSPSPYSLKCSPTRETLTYAQAQRIVEVDIDGRLHRISIYDPLKI ::. : : .: .:. :: :.: ::::::::::::::.::..:.::::::::.:::.: CCDS14 MRRKGRCHRGSA-ARHPSSPCSVKHSPTRETLTYAQAQRMVEIEIEGRLHRISIFDPLEI 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KA1 ITEDELTAQDITECNSNKENSEQPQFPGKSKK-PSSKGKKKESCSKHASGT---SFHLPQ : ::.::::...::::::::::.: ..:. ... :::. : :: . ::. CCDS14 ILEDDLTAQEMSECNSNKENSERPPVCLRTKRHKNNRVKKKNEALPSAHGTPASASALPE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 PSFRMVDSGIQPEAPPLPAAYYRYIEKPPEDLDAEVEYDMDEEDLAWLDMVNEKRRVDGH :. :.:. . : :: : .::..::: :.:: :::::::::: :::..:::::. : CCDS14 PKVRIVEYS-PPSAPRRPPVYYKFIEKSAEELDNEVEYDMDEEDYAWLEIVNEKRKGDCV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 SLVSADTFELLVDRLEKESYLESRSSGAQQSLIDEDAFCCVCLDDECHNSNVILFCDICN :: . ::.:.::.::::. :....: ::::::::: ::.:.: ::.:::::::::.:: CCDS14 PAVSQSMFEFLMDRFEKESHCENQKQGEQQSLIDEDAVCCICMDGECQNSNVILFCDMCN 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 LAVHQECYGVPYIPEGQWLCRCCLQSPSRPVDCILCPNKGGAFKQTSDGHWAHVVCAIWI ::::::::::::::::::::: :::: .::.::.::::::::::.:.: .:.:::::.:: CCDS14 LAVHQECYGVPYIPEGQWLCRHCLQSRARPADCVLCPNKGGAFKKTDDDRWGHVVCALWI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 PEVCFANTVFLEPIEGIDNIPPARWKLTCYICKQKGLGAAIQCHKVNCYTAFHVTCAQRA ::: ::::::.:::.:. ::::::::::::.:::::.:: :::::.::::::::::::.: CCDS14 PEVGFANTVFIEPIDGVRNIPPARWKLTCYLCKQKGVGACIQCHKANCYTAFHVTCAQKA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KA1 GLFMKIEPMRETSLNGTIFTVRKTAYCEAHSPPGAATARRKGDSPRSISETGDEEGLKEG ::.::.::..: . .:: :.:::::::..:.::: . :: : .: :: : .:.: CCDS14 GLYMKMEPVKELTGGGTTFSVRKTAYCDVHTPPGCT--RR----PLNI--YGDVE-MKNG 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KA1 DGEEEEEEEVEEEEQEAQGGVSGSLKGVPKKSKMSLKQKIKKEPEEAGQDTPSTLPMLAV ..: .:.: : . :: ...: :: ..: . ..:: . . CCDS14 VCRKE-----------------SSVKTVRSTSK--VRKKAKKA-KKALAEPCAVLPTVCA 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 pF1KA1 PQIPSYRLNKICSGLSFQRKNQFMQRLHNYWLLKRQARNGVPLIRRLHSHLQSQRNAEQR : :: :::.: . ...:::.::..: :.:::::: .:::.::.:::.: :::::...:: CCDS14 PYIPPQRLNRIANQVAIQRKKQFVERAHSYWLLKRLSRNGAPLLRRLQSSLQSQRSSQQR 450 460 470 480 490 500 540 550 560 570 580 590 pF1KA1 EQDEKTSAVKEELKYWQKLRHDLERARLLIELIRKREKLKREQVKVQQAAMELELMPFNV :.::. .:.::.:::::.::::::::::::::.:::::::::::::.:.::::.: :..: CCDS14 ENDEEMKAAKEKLKYWQRLRHDLERARLLIELLRKREKLKREQVKVEQVAMELRLTPLTV 510 520 530 540 550 560 600 610 620 630 640 650 pF1KA1 LLRTTLDLLQEKDPAHIFAEPVNLSEVPDYLEFISKPMDFSTMRRKLESHLYRTLEEFEE :::..:: ::.::::.:::.::.:.::::::. :..::::.:::..::.. :..:.:::: CCDS14 LLRSVLDQLQDKDPARIFAQPVSLKEVPDYLDHIKHPMDFATMRKRLEAQGYKNLHEFEE 570 580 590 600 610 620 660 670 680 690 700 710 pF1KA1 DFNLIVTNCMKYNAKDTIFHRAAVRLRDLGGAILRHARRQAENIGYDPERGTHLPESPKL ::.::. :::::::.::.:.:::::::: ::..::.:::....:: . : :::: : CCDS14 DFDLIIDNCMKYNARDTVFYRAAVRLRDQGGVVLRQARREVDSIGLEEASGMHLPERPAA 630 640 650 660 670 680 720 730 740 750 760 770 pF1KA1 EDFYRFSWEDVDNILIPENRAHLSPEVQLKELLEKLDLVSAMRSSGARTRRVRLLRREIN ::::::: .: : :::::. : ::.:::. :::. ::.:::.:..:..::..:: CCDS14 APRRPFSWEDVDRLLDPANRAHLGLEEQLRELLDMLDLTCAMKSSGSRSKRAKLLKKEIA 690 700 710 720 730 740 780 790 800 810 820 830 pF1KA1 ALRQKLAQPPPPQPPSLNKTVSNGELPAGPQGDAAVLEQALQEEPEDDGDRDDSKLPPPP ::.::.: :: ::.:: : : :.:: CCDS14 LLRNKLSQQHS-QP-----------LPTGP-G---------LEGFEEDG----------- 750 760 770 840 850 860 870 880 890 pF1KA1 TLEPTGPAPSLSEQESPPEPPTLKPINDSKPPSRFLKPRKVEEDELLEKSPLQLGNEPLQ :: . .: :. :: :.::: CCDS14 --AALGPEAG---EEVLPRLETL------------LQPRK-------------------- 780 790 900 910 920 930 940 950 pF1KA1 RLLSDNGINRLSLMAPDTPAGTPLSGVGRRTSVLFKKAKNGVKLQRSPDRVLENGEDHGV : : : ... .: :.: .. . .. .:.. .. : : CCDS14 RSRSTCGDSEVEEESP-----------GKRLDAGLTNGFGGARSEQEPG---------GG 800 810 820 830 960 970 980 990 1000 1010 pF1KA1 AGSPASPASIEEERHSRKRPRSRSCSESEGERSPQQEEETGMTNGFGKHTESGSDSECSL : :.: : : ::: : :.:. : CCDS14 LGRKATP-------------RRRCASES-----------------------SISSSNSPL 840 850 860 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA1 GLSGGLAFEAC-SGLTPPKRSRGKPALSRVPFLEGV--------NGDSDYNGS-----GR : :... :: .:::::: : :: ::. . :. CCDS14 ----------CDSSFNAPKCGRGKPALVRRHTLEDRSELISCIENGNYAKAARIAAEVGQ 870 880 890 900 910 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KA1 SLLLPFEDRGD--LKPLELVWAKCRGYPSYPALIIDPKMPREGLLHNGVPIPVPPLDVLK : . : . :.::..::::: :::::::::::::::: :::: ::.::::::: CCDS14 SSMWISTDAAASVLEPLKVVWAKCSGYPSYPALIIDPKMPRVPGHHNGVTIPAPPLDVLK 920 930 940 950 960 970 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KA1 LGEQKQAEAGEKLFLVLFFDNKRTWQWLPRDKVLPLGVEDTVDKLKMLEGRKTSIRKSVQ .::. :... :::::::::::::.:::::..:..:::...:.:::::.:::..::::.:. CCDS14 IGEHMQTKSDEKLFLVLFFDNKRSWQWLPKSKMVPLGIDETIDKLKMMEGRNSSIRKAVR 980 990 1000 1010 1020 1030 1190 1200 pF1KA1 VAYDRAMIHLSRVRG-PHSFVTSSYL .:.:::: :::::.: : : CCDS14 IAFDRAMNHLSRVHGEPTSDLSDID 1040 1050 >>CCDS77686.1 BRD1 gene_id:23774|Hs108|chr22 (1189 aa) initn: 3997 init1: 1453 opt: 1846 Z-score: 1112.0 bits: 217.8 E(32554): 1.3e-55 Smith-Waterman score: 4043; 53.0% identity (74.0% similar) in 1246 aa overlap (1-1198:1-1183) 10 20 30 40 50 60 pF1KA1 MRKPRRKSRQNAEGRRSPSPYSLKCSPTRETLTYAQAQRIVEVDIDGRLHRISIYDPLKI ::. : : .: .:. :: :.: ::::::::::::::.::..:.::::::::.:::.: CCDS77 MRRKGRCHRGSA-ARHPSSPCSVKHSPTRETLTYAQAQRMVEIEIEGRLHRISIFDPLEI 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KA1 ITEDELTAQDITECNSNKENSEQPQFPGKSKK-PSSKGKKKESCSKHASGT---SFHLPQ : ::.::::...::::::::::.: ..:. ... :::. : :: . ::. CCDS77 ILEDDLTAQEMSECNSNKENSERPPVCLRTKRHKNNRVKKKNEALPSAHGTPASASALPE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 PSFRMVDSGIQPEAPPLPAAYYRYIEKPPEDLDAEVEYDMDEEDLAWLDMVNEKRRVDGH :. :.:. . : :: : .::..::: :.:: :::::::::: :::..:::::. : CCDS77 PKVRIVEYS-PPSAPRRPPVYYKFIEKSAEELDNEVEYDMDEEDYAWLEIVNEKRKGDCV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 SLVSADTFELLVDRLEKESYLESRSSGAQQSLIDEDAFCCVCLDDECHNSNVILFCDICN :: . ::.:.::.::::. :....: ::::::::: ::.:.: ::.:::::::::.:: CCDS77 PAVSQSMFEFLMDRFEKESHCENQKQGEQQSLIDEDAVCCICMDGECQNSNVILFCDMCN 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 LAVHQECYGVPYIPEGQWLCRCCLQSPSRPVDCILCPNKGGAFKQTSDGHWAHVVCAIWI ::::::::::::::::::::: :::: .::.::.::::::::::.:.: .:.:::::.:: CCDS77 LAVHQECYGVPYIPEGQWLCRHCLQSRARPADCVLCPNKGGAFKKTDDDRWGHVVCALWI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 PEVCFANTVFLEPIEGIDNIPPARWKLTCYICKQKGLGAAIQCHKVNCYTAFHVTCAQRA ::: ::::::.:::.:. ::::::::::::.:::::.:: :::::.::::::::::::.: CCDS77 PEVGFANTVFIEPIDGVRNIPPARWKLTCYLCKQKGVGACIQCHKANCYTAFHVTCAQKA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KA1 GLFMKIEPMRETSLNGTIFTVRKTAYCEAHSPPGAATARRKGDSPRSISETGDEEGLKEG ::.::.::..: . .:: :.:::::::..:.::: . :: : .: :: : .:.: CCDS77 GLYMKMEPVKELTGGGTTFSVRKTAYCDVHTPPGCT--RR----PLNI--YGDVE-MKNG 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KA1 DGEEEEEEEVEEEEQEAQGGVSGSLKGVPKKSKMSLKQKIKKEPEEAGQDTPSTLPMLAV ..: .:.: : . :: ...: :: ..: . ..:: . . CCDS77 VCRKE-----------------SSVKTVRSTSK--VRKKAKKA-KKALAEPCAVLPTVCA 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 pF1KA1 PQIPSYRLNKICSGLSFQRKNQFMQRLHNYWLLKRQARNGVPLIRRLHSHLQSQRNAEQR : :: :::.: . ...:::.::..: :.:::::: .:::.::.:::.: :::::...:: CCDS77 PYIPPQRLNRIANQVAIQRKKQFVERAHSYWLLKRLSRNGAPLLRRLQSSLQSQRSSQQR 450 460 470 480 490 500 540 550 560 570 580 590 pF1KA1 EQDEKTSAVKEELKYWQKLRHDLERARLLIELIRKREKLKREQVKVQQAAMELELMPFNV :.::. .:.::.:::::.::::::::::::::.:::::::::::::.:.::::.: :..: CCDS77 ENDEEMKAAKEKLKYWQRLRHDLERARLLIELLRKREKLKREQVKVEQVAMELRLTPLTV 510 520 530 540 550 560 600 610 620 630 640 650 pF1KA1 LLRTTLDLLQEKDPAHIFAEPVNLSEVPDYLEFISKPMDFSTMRRKLESHLYRTLEEFEE :::..:: ::.::::.:::.::.:.::::::. :..::::.:::..::.. :..:.:::: CCDS77 LLRSVLDQLQDKDPARIFAQPVSLKEVPDYLDHIKHPMDFATMRKRLEAQGYKNLHEFEE 570 580 590 600 610 620 660 670 680 690 700 710 pF1KA1 DFNLIVTNCMKYNAKDTIFHRAAVRLRDLGGAILRHARRQAENIGYDPERGTHLPESPKL ::.::. :::::::.::.:.:::::::: ::..::.:::....:: . : :::: : CCDS77 DFDLIIDNCMKYNARDTVFYRAAVRLRDQGGVVLRQARREVDSIGLEEASGMHLPERPAA 630 640 650 660 670 680 720 730 740 750 760 770 pF1KA1 EDFYRFSWEDVDNILIPENRAHLSPEVQLKELLEKLDLVSAMRSSGARTRRVRLLRREIN ::::::: .: : :::::. : ::.:::. :::. ::.:::.:..:..::..:: CCDS77 APRRPFSWEDVDRLLDPANRAHLGLEEQLRELLDMLDLTCAMKSSGSRSKRAKLLKKEIA 690 700 710 720 730 740 780 790 800 810 820 830 pF1KA1 ALRQKLAQPPPPQPPSLNKTVSNGELPAGPQGDAAVLEQ--ALQEEPEDDGDRDDSKLPP ::.::.: :: ::.:: : . :. :: : ..::.. CCDS77 LLRNKLSQQHS-QP-----------LPTGP-GLEGFEEDGAALGPEAGEEGDKS------ 750 760 770 780 790 840 850 860 870 880 890 pF1KA1 PPTLEPTGPAPSLSEQESPPEPPTLKPINDSKPPSRFLKPRKVEEDE---LLEKSPLQLG :: :::. : :..:. :::::::.. . :...: : . ..: .: : : CCDS77 PPKLEPSDALPLPSNSETNSEPPTLKPVELNPEQSKLFK-RVTFDNESHSACTQSALVSG 800 810 820 830 840 900 910 920 930 940 950 pF1KA1 NEPLQRLLSDNGINRLSLMAPDTPAGTPLSGVGRRTSVLFKKAKNGVKLQRSPDRVLENG : :.. . : . .. : : :.::::::: :.:. :: . .: CCDS77 RPPEPTRASSGDVP----AAAASAVAEPASDVNRRTSVLFCKSKS-----VSPPKSAKNT 850 860 870 880 890 900 960 970 980 990 1000 pF1KA1 EDHGVA---GSPASPASIEEERHSRKRPRSRS---CSESE-GERSPQQEEETGMTNGFG- : . .. :. . . . . .. .::.:: :..:: :.:: .. ..:.::::: CCDS77 ETQPTSPQLGTKTFLSVVLPRLETLLQPRKRSRSTCGDSEVEEESPGKRLDAGLTNGFGG 910 920 930 940 950 960 1010 1020 1030 1040 pF1KA1 --KHTESGSD------------SECSLGLSGGLAFEAC-SGLTPPKRSRGKPALSRVPFL .. : :. :: :.. :.. : :... :: .:::::: : : CCDS77 ARSEQEPGGGLGRKATPRRRCASESSISSSNS---PLCDSSFNAPKCGRGKPALVRRHTL 970 980 990 1000 1010 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KA1 EGV--------NGDSDYNGS-----GRSLLLPFEDRGD--LKPLELVWAKCRGYPSYPAL : ::. . :.: . : . :.::..::::: :::::::: CCDS77 EDRSELISCIENGNYAKAARIAAEVGQSSMWISTDAAASVLEPLKVVWAKCSGYPSYPAL 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KA1 IIDPKMPREGLLHNGVPIPVPPLDVLKLGEQKQAEAGEKLFLVLFFDNKRTWQWLPRDKV :::::::: :::: ::.:::::::.::. :... :::::::::::::.:::::..:. 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CCDS34 KLHDSYQLNPDEYYVLADPWRQEWEKGVQVPVSPGTIPQPVARVVSEEK--------SLM 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 LPQPSFRMVDSGIQPEAPPLPAAYYRYIEKPPEDLDAEVEYDMDEEDLAWLDMVNEKRRV . .:. .:.:: .: : : . : . :. .::... : :::...::. . CCDS34 FIRPKKYIVSSGSEP--PELGYVDIRTLA------DSVCRYDLNDMDAAWLELTNEEFKE 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 pF1KA1 DGHSLVSADTFELLVDRLEKESYLE-SRSSGAQQSL---IDEDAFCCVCLDDECHNSNVI : .. :.: .....:.. : . ... ....: :::. : :: . . ...: . CCDS34 MGMPELDEYTMERVLEEFEQRCYDNMNHAIETEEGLGIEYDEDVVCDVCQSPDGEDGNEM 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KA1 LFCDICNLAVHQECYGVPYIPEGQWLCRCCLQSPSRPVDCILCPNKGGAFKQTSDG-HWA .::: ::. ::: :::. .:::.:::: : . .: :.:::.::::.: : .: .:. CCDS34 VFCDKCNICVHQACYGILKVPEGSWLCRTCALG-VQP-KCLLCPKKGGAMKPTRSGTKWV 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KA1 HVVCAIWIPEVCFANTVFLEPIEGIDNIPPARWKLTCYICKQKGLGAAIQCHKVNCYTAF :: ::.::::: ... .::: ...:: .:: :.: .:..: .::.::: :: ::: CCDS34 HVSCALWIPEVSIGSPEKMEPITKVSHIPSSRWALVCSLCNEK-FGASIQCSVKNCRTAF 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KA1 HVTCAQRAGLFMKIEPMRETSLNGTIFTVRKTAYCEAHSPPGAATARRKGDSPRSISETG ::::: :: :: . :.. :. .:: :: ..:: : CCDS34 HVTCAFDRGLEMKT-ILAEND------EVKFKSYCPKHS------SHRK---P------- 340 350 360 370 410 420 430 440 450 460 pF1KA1 DEEGLKEGDGEEEEEEEVEEEEQEAQGGVSGSLKGVPKKSKMSL-KQKIKKEPEEAGQDT ::.: : : .:. : .. .. .. . ..:. :::... .: CCDS34 -EESL--GKGAAQENGAPECSPRNPLEPFASLEQNREEAHRVSVRKQKLQQLEDE----F 380 390 400 410 420 470 480 490 500 510 520 pF1KA1 PSTLPMLAVPQIPSYRLNKICSGLSFQRKNQFMQRLHNYWLLKRQARNGVPLIRRLHSHL . . .: : . . :: . . .. :..:: :::.. . ::: . CCDS34 YTFVNLLDVAR--ALRLPE-----------EVVDFLYQYWKLKRKVNFNKPLIT---PKK 430 440 450 460 470 530 540 550 560 570 580 pF1KA1 QSQRNAEQREQDEKTSAVKEELKYWQKLRHDLERARLLIELIRKREKLKREQVKVQQAAM . . : .:::: .. ..:. . .::.::::.: : .. .:::.:: :::. . CCDS34 DEEDNLAKREQD----VLFRRLQLFTHLRQDLERVRNLTYMVTRREKIKRSVCKVQEQIF 480 490 500 510 520 590 600 610 620 630 640 pF1KA1 ELELMPFNVLLRTTLDLLQEKDPAHIFAEPVNLSEVPDYLEFISKPMDFSTMRRKLESHL .: CCDS34 NLYTKLLEQERVSGVPSSCSSSSLENMLLFNSPSVGPDAPKIEDLKWHSAFFRKQMGTSL 530 540 550 560 570 580 1205 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 19:56:46 2016 done: Thu Nov 3 19:56:47 2016 Total Scan time: 6.800 Total Display time: 0.530 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]