Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1292
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1292, 702 aa
1>>>pF1KA1292 702 - 702 aa - 702 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.5868+/-0.00096; mu= -7.7286+/- 0.057
mean_var=375.2522+/-77.929, 0's: 0 Z-trim(116.8): 52 B-trim: 174 in 1/51
Lambda= 0.066208
statistics sampled from 17357 (17408) to 17357 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.817), E-opt: 0.2 (0.535), width: 16
Scan time: 4.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13776.1 ZDHHC8 gene_id:29801|Hs108|chr22 ( 765) 4880 480.3 4.6e-135
CCDS54502.1 ZDHHC8 gene_id:29801|Hs108|chr22 ( 778) 4512 445.1 1.8e-124
CCDS7965.1 ZDHHC5 gene_id:25921|Hs108|chr11 ( 715) 1684 175.0 3.4e-43
CCDS35395.1 ZDHHC9 gene_id:51114|Hs108|chrX ( 364) 564 67.8 3.3e-11
>>CCDS13776.1 ZDHHC8 gene_id:29801|Hs108|chr22 (765 aa)
initn: 4880 init1: 4880 opt: 4880 Z-score: 2538.3 bits: 480.3 E(32554): 4.6e-135
Smith-Waterman score: 4880; 100.0% identity (100.0% similar) in 702 aa overlap (1-702:64-765)
10 20 30
pF1KA1 MATFMDPGVFPRADEDEDKEDDFRAPLYKN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FTCPWLTRAVSPAVPVYNGIIFLFVLANFSMATFMDPGVFPRADEDEDKEDDFRAPLYKN
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 VDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFL
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 LSLSAHMVGVVAFGLVYVLNHAEGLGAAHTTITMAVMCVAGLFFIPVIGLTGFHVVLVTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LSLSAHMVGVVAFGLVYVLNHAEGLGAAHTTITMAVMCVAGLFFIPVIGLTGFHVVLVTR
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 GRTTNEQVTGKFRGGVNPFTRGCCGNVEHVLCSPLAPRYVVEPPRLPLAVSLKPPFLRPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GRTTNEQVTGKFRGGVNPFTRGCCGNVEHVLCSPLAPRYVVEPPRLPLAVSLKPPFLRPE
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 LLDRAAPLKVKLSDNGLKAGLGRSKSKGSLDRLDEKPLDLGPPLPPKIEAGTFSSDLQTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LLDRAAPLKVKLSDNGLKAGLGRSKSKGSLDRLDEKPLDLGPPLPPKIEAGTFSSDLQTP
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 RPGSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRPAFPTGPKVPFCGPGEQVPGPDSLTLGDDSIRSLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RPGSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRPAFPTGPKVPFCGPGEQVPGPDSLTLGDDSIRSLD
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 FVSEPSLDLPDYGPGGLHAAYPPSPPLSASDAFSGALRSLSLKASSRRGGDHVALQPLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FVSEPSLDLPDYGPGGLHAAYPPSPPLSASDAFSGALRSLSLKASSRRGGDHVALQPLRS
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 EGGPPTPHRSIFAPHALPNRNGSLSYDSLLNPGSPGGHACPAHPAVGVAGYHSPYLHPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EGGPPTPHRSIFAPHALPNRNGSLSYDSLLNPGSPGGHACPAHPAVGVAGYHSPYLHPGA
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 TGDPPRPLPRSFSPVLGPRPREPSPVRYDNLSRTIMASIQERKDREERERLLRSQADSLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TGDPPRPLPRSFSPVLGPRPREPSPVRYDNLSRTIMASIQERKDREERERLLRSQADSLF
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 GDSGVYDAPSSYSLQQASVLSEGPRGPALRYGSRDDLVAGPGFGGARNPALQTSLSSLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GDSGVYDAPSSYSLQQASVLSEGPRGPALRYGSRDDLVAGPGFGGARNPALQTSLSSLSS
580 590 600 610 620 630
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 SVSRAPRTSSSSLQADQASSNAPGPRPSSGSHRSPARQGLPSPPGTPHSPSYAGPKAVAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SVSRAPRTSSSSLQADQASSNAPGPRPSSGSHRSPARQGLPSPPGTPHSPSYAGPKAVAF
640 650 660 670 680 690
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 IHTDLPEPPPSLTVQRDHPQLKTPPSKLNGQSPGLARLGPATGPPGPSASPTRHTLVKKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IHTDLPEPPPSLTVQRDHPQLKTPPSKLNGQSPGLARLGPATGPPGPSASPTRHTLVKKV
700 710 720 730 740 750
700
pF1KA1 SGVGGTTYEISV
::::::::::::
CCDS13 SGVGGTTYEISV
760
>>CCDS54502.1 ZDHHC8 gene_id:29801|Hs108|chr22 (778 aa)
initn: 4500 init1: 4500 opt: 4512 Z-score: 2348.3 bits: 445.1 E(32554): 1.8e-124
Smith-Waterman score: 4512; 96.5% identity (96.8% similar) in 681 aa overlap (1-675:64-744)
10 20 30
pF1KA1 MATFMDPGVFPRADEDEDKEDDFRAPLYKN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FTCPWLTRAVSPAVPVYNGIIFLFVLANFSMATFMDPGVFPRADEDEDKEDDFRAPLYKN
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 VDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFL
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 LSLSAHMVGVVAFGLVYVLNHAEGLGAAHTTITMAVMCVAGLFFIPVIGLTGFHVVLVTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSLSAHMVGVVAFGLVYVLNHAEGLGAAHTTITMAVMCVAGLFFIPVIGLTGFHVVLVTR
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 GRTTNEQVTGKFRGGVNPFTRGCCGNVEHVLCSPLAPRYVVEPPRLPLAVSLKPPFLRPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GRTTNEQVTGKFRGGVNPFTRGCCGNVEHVLCSPLAPRYVVEPPRLPLAVSLKPPFLRPE
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 LLDRAAPLKVKLSDNGLKAGLGRSKSKGSLDRLDEKPLDLGPPLPPKIEAGTFSSDLQTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LLDRAAPLKVKLSDNGLKAGLGRSKSKGSLDRLDEKPLDLGPPLPPKIEAGTFSSDLQTP
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 RPGSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRPAFPTGPKVPFCGPGEQVPGPDSLTLGDDSIRSLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RPGSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRPAFPTGPKVPFCGPGEQVPGPDSLTLGDDSIRSLD
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 FVSEPSLDLPDYGPGGLHAAYPPSPPLSASDAFSGALRSLSLKASSRRGGDHVALQPLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FVSEPSLDLPDYGPGGLHAAYPPSPPLSASDAFSGALRSLSLKASSRRGGDHVALQPLRS
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 EGGPPTPHRSIFAPHALPNRNGSLSYDSLLNPGSPGGHACPAHPAVGVAGYHSPYLHPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EGGPPTPHRSIFAPHALPNRNGSLSYDSLLNPGSPGGHACPAHPAVGVAGYHSPYLHPGA
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 TGDPPRPLPRSFSPVLGPRPREPSPVRYDNLSRTIMASIQERKDREERERLLRSQADSLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TGDPPRPLPRSFSPVLGPRPREPSPVRYDNLSRTIMASIQERKDREERERLLRSQADSLF
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 GDSGVYDAPSSYSLQQASVLSEGPRGPALRYGSRDDLVAGPGFGGARNPALQTSLSSLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GDSGVYDAPSSYSLQQASVLSEGPRGPALRYGSRDDLVAGPGFGGARNPALQTSLSSLSS
580 590 600 610 620 630
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 SVSRAPRTSSSSLQADQASSNAPGPRPSSGSHRSPARQGLPSPPGTPHSPSYAGPKAVAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SVSRAPRTSSSSLQADQASSNAPGPRPSSGSHRSPARQGLPSPPGTPHSPSYAGPKAVAF
640 650 660 670 680 690
640 650 660 670 680
pF1KA1 IHTDLPEPPPSLTVQRDHPQLKTPPSKLNGQS---PGL--ARLG-PATGPPGPSASPTRH
:::::::::::::::: . : :: ::: .:: : ::
CCDS54 IHTDLPEPPPSLTVQRGRIGTCTRGWGRRGQPWVPPGLHLCHLGRPEDRPPLRAPWSQAA
700 710 720 730 740 750
690 700
pF1KA1 TLVKKVSGVGGTTYEISV
CCDS54 GAPPRGAMCRLHLAASSLFPSLSGP
760 770
>>CCDS7965.1 ZDHHC5 gene_id:25921|Hs108|chr11 (715 aa)
initn: 1716 init1: 1186 opt: 1684 Z-score: 888.9 bits: 175.0 E(32554): 3.4e-43
Smith-Waterman score: 1884; 48.8% identity (67.4% similar) in 717 aa overlap (1-702:64-715)
10 20 30
pF1KA1 MATFMDPGVFPRADEDEDKEDDFRAPLYKN
::::::::.::::.:::::::::::::::.
CCDS79 FTCPGLSLYVSPAVPIYNAIMFLFVLANFSMATFMDPGIFPRAEEDEDKEDDFRAPLYKT
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 VDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFL
:...::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS79 VEIKGIQVRMKWCATCRFYRPPRCSHCSVCDNCVEEFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFL
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 LSLSAHMVGVVAFGLVYVLNHAEGLGAAHTTITMAVMCVAGLFFIPVIGLTGFHVVLVTR
:::.::..:: .:::.::: : : :....:..::::::::::::::: ::::::::::.:
CCDS79 LSLTAHIMGVFGFGLLYVLYHIEELSGVRTAVTMAVMCVAGLFFIPVAGLTGFHVVLVAR
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 GRTTNEQVTGKFRGGVNPFTRGCCGNVEHVLCSPLAPRYVVEPPRLPLAVSLKPPFLRPE
:::::::::::::::::::: :::.:: .:::: ::::. .: . : ..:::::::
CCDS79 GRTTNEQVTGKFRGGVNPFTNGCCNNVSRVLCSSPAPRYLGRPKKEKTIV-IRPPFLRPE
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 LLDRAAPLKVKLSDNGLKAGLGRSKSKGSLDRLDEKPLDLGPPLPPKIEAGTFSSDLQTP
. : . . ::. :::... : :.::::::. . . : :: ::: . . ... :.:
CCDS79 VSD--GQITVKIMDNGIQGELRRTKSKGSLEITESQSADAEPPPPPKPDLSRYTG-LRTH
280 290 300 310 320
280 290 300 310 320
pF1KA1 RP-GSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRPAFP---TGPKVPFCGPGEQVPGPDSL---TLGD
.. :.. . . :::::.:::.::.. :. .: . .. : ::: :
CCDS79 LGLATNEDSSLLAKDSPPTPTMYKYRPGYSSSSTSAAMPHSSSAKLSRG-DSLKEPTSIA
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 DSIRSLDFVSEPSLDLPDYGPGGLHAAYPPSPPLSAS---DAFSGALRSLSLKASSRRGG
.: : .. :::::. : ... :: .. : : .:.. :: :::... :
CCDS79 ESSRHPSYRSEPSLE-----PESFR-----SPTFGKSFHFDPLSSGSRSSSLKSAQGTGF
390 400 410 420 430
390 400 410 420 430
pF1KA1 DHVALQPLRSEGGPPTPHRSIFAPHALPNRNGSLSYDSLLNPG-SPGGHACPAHPAVGVA
. :: .:::: : ..:. : .:::::::::::.:. :: .. : :
CCDS79 ELGQLQSIRSEGTTSTSYKSL----ANQTRNGSLSYDSLLTPSDSPDFESVQAGPEPDPP
440 450 460 470 480 490
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 -GYHSPYLHPG-ATGDPPRPLPRSFSPVLGPRPREPSPVRYDNLSRTIMASIQER-KDRE
:: ::.: : . :: . :. :: ::::::::::::: :.::.::: : .
CCDS79 LGYTSPFLSARLAQQREAERHPR-LVPT-GPTHREPSPVRYDNLSRHIVASLQEREKLLR
500 510 520 530 540 550
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 ERERLLRSQADSLFGDSGVYDAPSSYSLQQASVLSEGPRGPALRYGSRDDLVAGPGFGGA
. : . . .::::. ..:.: ...:: . : :: .
CCDS79 QSPPLPGREEEPGLGDSGIQSTPGS---------GHAPRTSS----SSDD--------SK
560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 RNPALQTSLSSLSSSVSRAPRTSSSSLQADQASSNAPGPR-PSSGSHRSPARQGLPSPPG
:.: .: :. .: : . .. :.. ..: ::: : : :: . .. . ::
CCDS79 RSPLGKTPLG--RPAVPRFGKPDG--LRGRGVGSPEPGPTAPYLG--RSMSYSSQKAQPG
600 610 620 630 640
620 630 640 650 660 670
pF1KA1 TPHSPSYAGPKAVAFIHTDLPEPPPSLTVQRDHPQLKTPPSKLNGQSPGLARLGPATGPP
. .. . ::. .: : . .:. :::: :: ::: .:. .:. : :
CCDS79 VSET------EEVAL------QP---LLTPKDEVQLKTTYSKSNGQPKSLGSASPGPGQP
650 660 670 680 690
680 690 700
pF1KA1 GPSASPTRHTLVKKVSGVGGTTYEISV
: .:::: ::::::::::::::::
CCDS79 -PLSSPTRGG-VKKVSGVGGTTYEISV
700 710
>>CCDS35395.1 ZDHHC9 gene_id:51114|Hs108|chrX (364 aa)
initn: 599 init1: 417 opt: 564 Z-score: 314.7 bits: 67.8 E(32554): 3.3e-11
Smith-Waterman score: 594; 38.5% identity (59.7% similar) in 288 aa overlap (3-257:87-354)
10 20
pF1KA1 MATFMDPGVFPRADEDEDK--EDDFRA-----
.: ::::.::: :: : ...:
CCDS35 CRYLAVQLSPAIPVFAAMLFLFSMATLLRTSFSDPGVIPRALPDEAAFIEMEIEATNGAV
60 70 80 90 100 110
30 40 50 60 70
pF1KA1 -------PLYKNVDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDHHCPWVNNCI
: :: .. . :..:.: ::...:::: ::::.:::::: ::::::::.::.
CCDS35 PQGQRPPPRIKNFQINNQIVKLKYCYTCKIFRPPRASHCSICDNCVERFDHHCPWVGNCV
120 130 140 150 160 170
80 90 100 110 120 130
pF1KA1 GRRNYRYFFLFLLSLSAHMVGVVAFGLVYV------LNHAEGLGAAHTTITMAVMCVAGL
:.::::::.::.:::: . : ::..::: .. : : . :. ...: :
CCDS35 GKRNYRYFYLFILSLSLLTIYVFAFNIVYVALKSLKIGFLETLKETPGTVLEVLICFFTL
180 190 200 210 220 230
140 150 160 170 180
pF1KA1 FFIPVIGLTGFHVVLVTRGRTTNEQVTGKFRGGV---NPFTRG-----CCGNVEHVLCSP
. :.::::::. ::. ..::::.. :.. : ::...: :: .:::.:
CCDS35 W--SVVGLTGFHTFLVALNQTTNEDIKGSWTGKNRVQNPYSHGNIVKNCC----EVLCGP
240 250 260 270 280 290
190 200 210 220 230
pF1KA1 LAPRYVVEPPRLPLAVS-LKPPFLRPE---LLDRA-APLKVKLSDNGLKAGLGRSKSKGS
: : . . ::: : .:: . :: .. :: . .:..:
CCDS35 LPPSVLDRRGILPLEESGSRPPSTQETSSSLLPQSPAPTE-HLNSN-------------E
300 310 320 330
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 LDRLDEKPLDLGPPLPPKIEAGTFSSDLQTPRPGSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRPAFP
. . . : .. :: ::.
CCDS35 MPEDSSTPEEMPPPEPPEPPQEAAEAEK
340 350 360
702 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 23:44:21 2016 done: Fri Nov 4 23:44:22 2016
Total Scan time: 4.330 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]