Result of FASTA (omim) for
pF1KA1292
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1292, 702 aa
1>>>pF1KA1292 702 - 702 aa - 702 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.8808+/-0.000392; mu= -15.2674+/- 0.024
mean_var=458.1268+/-95.446, 0's: 0 Z-trim(124.4): 121 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.059921
statistics sampled from 46004 (46130) to 46004 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.82), E-opt: 0.2 (0.541), width: 16
Scan time: 12.920
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_037505 (OMIM: 608784) probable palmitoyltransfe ( 765) 4880 436.5 1.8e-121
XP_006724302 (OMIM: 608784) PREDICTED: probable pa ( 778) 4512 404.7 6.8e-112
NP_001171953 (OMIM: 608784) probable palmitoyltran ( 778) 4512 404.7 6.8e-112
XP_011543201 (OMIM: 614586) PREDICTED: palmitoyltr ( 715) 1684 160.2 2.5e-38
XP_011543203 (OMIM: 614586) PREDICTED: palmitoyltr ( 715) 1684 160.2 2.5e-38
XP_011543202 (OMIM: 614586) PREDICTED: palmitoyltr ( 715) 1684 160.2 2.5e-38
NP_056272 (OMIM: 614586) palmitoyltransferase ZDHH ( 715) 1684 160.2 2.5e-38
XP_016872987 (OMIM: 614586) PREDICTED: palmitoyltr ( 613) 1439 139.0 5.2e-32
NP_001008223 (OMIM: 300646,300799) palmitoyltransf ( 364) 564 63.2 2.1e-09
NP_057116 (OMIM: 300646,300799) palmitoyltransfera ( 364) 564 63.2 2.1e-09
XP_016884785 (OMIM: 300576,300577) PREDICTED: palm ( 328) 358 45.3 0.00044
NP_001139728 (OMIM: 300576,300577) palmitoyltransf ( 328) 358 45.3 0.00044
XP_006724687 (OMIM: 300576,300577) PREDICTED: palm ( 337) 358 45.4 0.00045
NP_659406 (OMIM: 300576,300577) palmitoyltransfera ( 337) 358 45.4 0.00045
XP_011536691 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2078) 337 44.1 0.0064
XP_006719477 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 337 44.1 0.0064
XP_006719475 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 337 44.1 0.0064
XP_006719476 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 337 44.1 0.0064
>>NP_037505 (OMIM: 608784) probable palmitoyltransferase (765 aa)
initn: 4880 init1: 4880 opt: 4880 Z-score: 2301.9 bits: 436.5 E(85289): 1.8e-121
Smith-Waterman score: 4880; 100.0% identity (100.0% similar) in 702 aa overlap (1-702:64-765)
10 20 30
pF1KA1 MATFMDPGVFPRADEDEDKEDDFRAPLYKN
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 FTCPWLTRAVSPAVPVYNGIIFLFVLANFSMATFMDPGVFPRADEDEDKEDDFRAPLYKN
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 VDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 VDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFL
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 LSLSAHMVGVVAFGLVYVLNHAEGLGAAHTTITMAVMCVAGLFFIPVIGLTGFHVVLVTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 LSLSAHMVGVVAFGLVYVLNHAEGLGAAHTTITMAVMCVAGLFFIPVIGLTGFHVVLVTR
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 GRTTNEQVTGKFRGGVNPFTRGCCGNVEHVLCSPLAPRYVVEPPRLPLAVSLKPPFLRPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 GRTTNEQVTGKFRGGVNPFTRGCCGNVEHVLCSPLAPRYVVEPPRLPLAVSLKPPFLRPE
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 LLDRAAPLKVKLSDNGLKAGLGRSKSKGSLDRLDEKPLDLGPPLPPKIEAGTFSSDLQTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 LLDRAAPLKVKLSDNGLKAGLGRSKSKGSLDRLDEKPLDLGPPLPPKIEAGTFSSDLQTP
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 RPGSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRPAFPTGPKVPFCGPGEQVPGPDSLTLGDDSIRSLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 RPGSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRPAFPTGPKVPFCGPGEQVPGPDSLTLGDDSIRSLD
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 FVSEPSLDLPDYGPGGLHAAYPPSPPLSASDAFSGALRSLSLKASSRRGGDHVALQPLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 FVSEPSLDLPDYGPGGLHAAYPPSPPLSASDAFSGALRSLSLKASSRRGGDHVALQPLRS
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 EGGPPTPHRSIFAPHALPNRNGSLSYDSLLNPGSPGGHACPAHPAVGVAGYHSPYLHPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 EGGPPTPHRSIFAPHALPNRNGSLSYDSLLNPGSPGGHACPAHPAVGVAGYHSPYLHPGA
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 TGDPPRPLPRSFSPVLGPRPREPSPVRYDNLSRTIMASIQERKDREERERLLRSQADSLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 TGDPPRPLPRSFSPVLGPRPREPSPVRYDNLSRTIMASIQERKDREERERLLRSQADSLF
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 GDSGVYDAPSSYSLQQASVLSEGPRGPALRYGSRDDLVAGPGFGGARNPALQTSLSSLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 GDSGVYDAPSSYSLQQASVLSEGPRGPALRYGSRDDLVAGPGFGGARNPALQTSLSSLSS
580 590 600 610 620 630
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 SVSRAPRTSSSSLQADQASSNAPGPRPSSGSHRSPARQGLPSPPGTPHSPSYAGPKAVAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 SVSRAPRTSSSSLQADQASSNAPGPRPSSGSHRSPARQGLPSPPGTPHSPSYAGPKAVAF
640 650 660 670 680 690
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 IHTDLPEPPPSLTVQRDHPQLKTPPSKLNGQSPGLARLGPATGPPGPSASPTRHTLVKKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 IHTDLPEPPPSLTVQRDHPQLKTPPSKLNGQSPGLARLGPATGPPGPSASPTRHTLVKKV
700 710 720 730 740 750
700
pF1KA1 SGVGGTTYEISV
::::::::::::
NP_037 SGVGGTTYEISV
760
>>XP_006724302 (OMIM: 608784) PREDICTED: probable palmit (778 aa)
initn: 4500 init1: 4500 opt: 4512 Z-score: 2129.9 bits: 404.7 E(85289): 6.8e-112
Smith-Waterman score: 4512; 96.5% identity (96.8% similar) in 681 aa overlap (1-675:64-744)
10 20 30
pF1KA1 MATFMDPGVFPRADEDEDKEDDFRAPLYKN
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FTCPWLTRAVSPAVPVYNGIIFLFVLANFSMATFMDPGVFPRADEDEDKEDDFRAPLYKN
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 VDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFL
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 LSLSAHMVGVVAFGLVYVLNHAEGLGAAHTTITMAVMCVAGLFFIPVIGLTGFHVVLVTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LSLSAHMVGVVAFGLVYVLNHAEGLGAAHTTITMAVMCVAGLFFIPVIGLTGFHVVLVTR
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 GRTTNEQVTGKFRGGVNPFTRGCCGNVEHVLCSPLAPRYVVEPPRLPLAVSLKPPFLRPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GRTTNEQVTGKFRGGVNPFTRGCCGNVEHVLCSPLAPRYVVEPPRLPLAVSLKPPFLRPE
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 LLDRAAPLKVKLSDNGLKAGLGRSKSKGSLDRLDEKPLDLGPPLPPKIEAGTFSSDLQTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LLDRAAPLKVKLSDNGLKAGLGRSKSKGSLDRLDEKPLDLGPPLPPKIEAGTFSSDLQTP
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 RPGSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRPAFPTGPKVPFCGPGEQVPGPDSLTLGDDSIRSLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RPGSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRPAFPTGPKVPFCGPGEQVPGPDSLTLGDDSIRSLD
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 FVSEPSLDLPDYGPGGLHAAYPPSPPLSASDAFSGALRSLSLKASSRRGGDHVALQPLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FVSEPSLDLPDYGPGGLHAAYPPSPPLSASDAFSGALRSLSLKASSRRGGDHVALQPLRS
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 EGGPPTPHRSIFAPHALPNRNGSLSYDSLLNPGSPGGHACPAHPAVGVAGYHSPYLHPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EGGPPTPHRSIFAPHALPNRNGSLSYDSLLNPGSPGGHACPAHPAVGVAGYHSPYLHPGA
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 TGDPPRPLPRSFSPVLGPRPREPSPVRYDNLSRTIMASIQERKDREERERLLRSQADSLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TGDPPRPLPRSFSPVLGPRPREPSPVRYDNLSRTIMASIQERKDREERERLLRSQADSLF
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 GDSGVYDAPSSYSLQQASVLSEGPRGPALRYGSRDDLVAGPGFGGARNPALQTSLSSLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GDSGVYDAPSSYSLQQASVLSEGPRGPALRYGSRDDLVAGPGFGGARNPALQTSLSSLSS
580 590 600 610 620 630
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 SVSRAPRTSSSSLQADQASSNAPGPRPSSGSHRSPARQGLPSPPGTPHSPSYAGPKAVAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SVSRAPRTSSSSLQADQASSNAPGPRPSSGSHRSPARQGLPSPPGTPHSPSYAGPKAVAF
640 650 660 670 680 690
640 650 660 670 680
pF1KA1 IHTDLPEPPPSLTVQRDHPQLKTPPSKLNGQS---PGL--ARLG-PATGPPGPSASPTRH
:::::::::::::::: . : :: ::: .:: : ::
XP_006 IHTDLPEPPPSLTVQRGRIGTCTRGWGRRGQPWVPPGLHLCHLGRPEDRPPLRAPWSQAA
700 710 720 730 740 750
690 700
pF1KA1 TLVKKVSGVGGTTYEISV
XP_006 GAPPRGAMCRLHLAASSLFPSLSGP
760 770
>>NP_001171953 (OMIM: 608784) probable palmitoyltransfer (778 aa)
initn: 4500 init1: 4500 opt: 4512 Z-score: 2129.9 bits: 404.7 E(85289): 6.8e-112
Smith-Waterman score: 4512; 96.5% identity (96.8% similar) in 681 aa overlap (1-675:64-744)
10 20 30
pF1KA1 MATFMDPGVFPRADEDEDKEDDFRAPLYKN
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FTCPWLTRAVSPAVPVYNGIIFLFVLANFSMATFMDPGVFPRADEDEDKEDDFRAPLYKN
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 VDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFL
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 LSLSAHMVGVVAFGLVYVLNHAEGLGAAHTTITMAVMCVAGLFFIPVIGLTGFHVVLVTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSLSAHMVGVVAFGLVYVLNHAEGLGAAHTTITMAVMCVAGLFFIPVIGLTGFHVVLVTR
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 GRTTNEQVTGKFRGGVNPFTRGCCGNVEHVLCSPLAPRYVVEPPRLPLAVSLKPPFLRPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GRTTNEQVTGKFRGGVNPFTRGCCGNVEHVLCSPLAPRYVVEPPRLPLAVSLKPPFLRPE
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 LLDRAAPLKVKLSDNGLKAGLGRSKSKGSLDRLDEKPLDLGPPLPPKIEAGTFSSDLQTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLDRAAPLKVKLSDNGLKAGLGRSKSKGSLDRLDEKPLDLGPPLPPKIEAGTFSSDLQTP
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 RPGSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRPAFPTGPKVPFCGPGEQVPGPDSLTLGDDSIRSLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RPGSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRPAFPTGPKVPFCGPGEQVPGPDSLTLGDDSIRSLD
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 FVSEPSLDLPDYGPGGLHAAYPPSPPLSASDAFSGALRSLSLKASSRRGGDHVALQPLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FVSEPSLDLPDYGPGGLHAAYPPSPPLSASDAFSGALRSLSLKASSRRGGDHVALQPLRS
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 EGGPPTPHRSIFAPHALPNRNGSLSYDSLLNPGSPGGHACPAHPAVGVAGYHSPYLHPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGGPPTPHRSIFAPHALPNRNGSLSYDSLLNPGSPGGHACPAHPAVGVAGYHSPYLHPGA
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 TGDPPRPLPRSFSPVLGPRPREPSPVRYDNLSRTIMASIQERKDREERERLLRSQADSLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TGDPPRPLPRSFSPVLGPRPREPSPVRYDNLSRTIMASIQERKDREERERLLRSQADSLF
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 GDSGVYDAPSSYSLQQASVLSEGPRGPALRYGSRDDLVAGPGFGGARNPALQTSLSSLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GDSGVYDAPSSYSLQQASVLSEGPRGPALRYGSRDDLVAGPGFGGARNPALQTSLSSLSS
580 590 600 610 620 630
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 SVSRAPRTSSSSLQADQASSNAPGPRPSSGSHRSPARQGLPSPPGTPHSPSYAGPKAVAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVSRAPRTSSSSLQADQASSNAPGPRPSSGSHRSPARQGLPSPPGTPHSPSYAGPKAVAF
640 650 660 670 680 690
640 650 660 670 680
pF1KA1 IHTDLPEPPPSLTVQRDHPQLKTPPSKLNGQS---PGL--ARLG-PATGPPGPSASPTRH
:::::::::::::::: . : :: ::: .:: : ::
NP_001 IHTDLPEPPPSLTVQRGRIGTCTRGWGRRGQPWVPPGLHLCHLGRPEDRPPLRAPWSQAA
700 710 720 730 740 750
690 700
pF1KA1 TLVKKVSGVGGTTYEISV
NP_001 GAPPRGAMCRLHLAASSLFPSLSGP
760 770
>>XP_011543201 (OMIM: 614586) PREDICTED: palmitoyltransf (715 aa)
initn: 1716 init1: 1186 opt: 1684 Z-score: 809.1 bits: 160.2 E(85289): 2.5e-38
Smith-Waterman score: 1884; 48.8% identity (67.4% similar) in 717 aa overlap (1-702:64-715)
10 20 30
pF1KA1 MATFMDPGVFPRADEDEDKEDDFRAPLYKN
::::::::.::::.:::::::::::::::.
XP_011 FTCPGLSLYVSPAVPIYNAIMFLFVLANFSMATFMDPGIFPRAEEDEDKEDDFRAPLYKT
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 VDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFL
:...::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
XP_011 VEIKGIQVRMKWCATCRFYRPPRCSHCSVCDNCVEEFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFL
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 LSLSAHMVGVVAFGLVYVLNHAEGLGAAHTTITMAVMCVAGLFFIPVIGLTGFHVVLVTR
:::.::..:: .:::.::: : : :....:..::::::::::::::: ::::::::::.:
XP_011 LSLTAHIMGVFGFGLLYVLYHIEELSGVRTAVTMAVMCVAGLFFIPVAGLTGFHVVLVAR
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 GRTTNEQVTGKFRGGVNPFTRGCCGNVEHVLCSPLAPRYVVEPPRLPLAVSLKPPFLRPE
:::::::::::::::::::: :::.:: .:::: ::::. .: . : ..:::::::
XP_011 GRTTNEQVTGKFRGGVNPFTNGCCNNVSRVLCSSPAPRYLGRPKKEKTIV-IRPPFLRPE
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 LLDRAAPLKVKLSDNGLKAGLGRSKSKGSLDRLDEKPLDLGPPLPPKIEAGTFSSDLQTP
. : . . ::. :::... : :.::::::. . . : :: ::: . . ... :.:
XP_011 VSD--GQITVKIMDNGIQGELRRTKSKGSLEITESQSADAEPPPPPKPDLSRYTG-LRTH
280 290 300 310 320
280 290 300 310 320
pF1KA1 RP-GSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRPAFP---TGPKVPFCGPGEQVPGPDSL---TLGD
.. :.. . . :::::.:::.::.. :. .: . .. : ::: :
XP_011 LGLATNEDSSLLAKDSPPTPTMYKYRPGYSSSSTSAAMPHSSSAKLSRG-DSLKEPTSIA
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 DSIRSLDFVSEPSLDLPDYGPGGLHAAYPPSPPLSAS---DAFSGALRSLSLKASSRRGG
.: : .. :::::. : ... :: .. : : .:.. :: :::... :
XP_011 ESSRHPSYRSEPSLE-----PESFR-----SPTFGKSFHFDPLSSGSRSSSLKSAQGTGF
390 400 410 420 430
390 400 410 420 430
pF1KA1 DHVALQPLRSEGGPPTPHRSIFAPHALPNRNGSLSYDSLLNPG-SPGGHACPAHPAVGVA
. :: .:::: : ..:. : .:::::::::::.:. :: .. : :
XP_011 ELGQLQSIRSEGTTSTSYKSL----ANQTRNGSLSYDSLLTPSDSPDFESVQAGPEPDPP
440 450 460 470 480 490
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 -GYHSPYLHPG-ATGDPPRPLPRSFSPVLGPRPREPSPVRYDNLSRTIMASIQER-KDRE
:: ::.: : . :: . :. :: ::::::::::::: :.::.::: : .
XP_011 LGYTSPFLSARLAQQREAERHPR-LVPT-GPTHREPSPVRYDNLSRHIVASLQEREKLLR
500 510 520 530 540 550
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 ERERLLRSQADSLFGDSGVYDAPSSYSLQQASVLSEGPRGPALRYGSRDDLVAGPGFGGA
. : . . .::::. ..:.: ...:: . : :: .
XP_011 QSPPLPGREEEPGLGDSGIQSTPGS---------GHAPRTSS----SSDD--------SK
560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 RNPALQTSLSSLSSSVSRAPRTSSSSLQADQASSNAPGPR-PSSGSHRSPARQGLPSPPG
:.: .: :. .: : . .. :.. ..: ::: : : :: . .. . ::
XP_011 RSPLGKTPLG--RPAVPRFGKPDG--LRGRGVGSPEPGPTAPYLG--RSMSYSSQKAQPG
600 610 620 630 640
620 630 640 650 660 670
pF1KA1 TPHSPSYAGPKAVAFIHTDLPEPPPSLTVQRDHPQLKTPPSKLNGQSPGLARLGPATGPP
. .. . ::. .: : . .:. :::: :: ::: .:. .:. : :
XP_011 VSET------EEVAL------QP---LLTPKDEVQLKTTYSKSNGQPKSLGSASPGPGQP
650 660 670 680 690
680 690 700
pF1KA1 GPSASPTRHTLVKKVSGVGGTTYEISV
: .:::: ::::::::::::::::
XP_011 -PLSSPTRGG-VKKVSGVGGTTYEISV
700 710
>>XP_011543203 (OMIM: 614586) PREDICTED: palmitoyltransf (715 aa)
initn: 1716 init1: 1186 opt: 1684 Z-score: 809.1 bits: 160.2 E(85289): 2.5e-38
Smith-Waterman score: 1884; 48.8% identity (67.4% similar) in 717 aa overlap (1-702:64-715)
10 20 30
pF1KA1 MATFMDPGVFPRADEDEDKEDDFRAPLYKN
::::::::.::::.:::::::::::::::.
XP_011 FTCPGLSLYVSPAVPIYNAIMFLFVLANFSMATFMDPGIFPRAEEDEDKEDDFRAPLYKT
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40 50 60 70 80 90
pF1KA1 VDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFL
:...::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
XP_011 VEIKGIQVRMKWCATCRFYRPPRCSHCSVCDNCVEEFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFL
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100 110 120 130 140 150
pF1KA1 LSLSAHMVGVVAFGLVYVLNHAEGLGAAHTTITMAVMCVAGLFFIPVIGLTGFHVVLVTR
:::.::..:: .:::.::: : : :....:..::::::::::::::: ::::::::::.:
XP_011 LSLTAHIMGVFGFGLLYVLYHIEELSGVRTAVTMAVMCVAGLFFIPVAGLTGFHVVLVAR
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160 170 180 190 200 210
pF1KA1 GRTTNEQVTGKFRGGVNPFTRGCCGNVEHVLCSPLAPRYVVEPPRLPLAVSLKPPFLRPE
:::::::::::::::::::: :::.:: .:::: ::::. .: . : ..:::::::
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pF1KA1 LLDRAAPLKVKLSDNGLKAGLGRSKSKGSLDRLDEKPLDLGPPLPPKIEAGTFSSDLQTP
. : . . ::. :::... : :.::::::. . . : :: ::: . . ... :.:
XP_011 VSD--GQITVKIMDNGIQGELRRTKSKGSLEITESQSADAEPPPPPKPDLSRYTG-LRTH
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pF1KA1 RP-GSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRPAFP---TGPKVPFCGPGEQVPGPDSL---TLGD
.. :.. . . :::::.:::.::.. :. .: . .. : ::: :
XP_011 LGLATNEDSSLLAKDSPPTPTMYKYRPGYSSSSTSAAMPHSSSAKLSRG-DSLKEPTSIA
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pF1KA1 DSIRSLDFVSEPSLDLPDYGPGGLHAAYPPSPPLSAS---DAFSGALRSLSLKASSRRGG
.: : .. :::::. : ... :: .. : : .:.. :: :::... :
XP_011 ESSRHPSYRSEPSLE-----PESFR-----SPTFGKSFHFDPLSSGSRSSSLKSAQGTGF
390 400 410 420 430
390 400 410 420 430
pF1KA1 DHVALQPLRSEGGPPTPHRSIFAPHALPNRNGSLSYDSLLNPG-SPGGHACPAHPAVGVA
. :: .:::: : ..:. : .:::::::::::.:. :: .. : :
XP_011 ELGQLQSIRSEGTTSTSYKSL----ANQTRNGSLSYDSLLTPSDSPDFESVQAGPEPDPP
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440 450 460 470 480 490
pF1KA1 -GYHSPYLHPG-ATGDPPRPLPRSFSPVLGPRPREPSPVRYDNLSRTIMASIQER-KDRE
:: ::.: : . :: . :. :: ::::::::::::: :.::.::: : .
XP_011 LGYTSPFLSARLAQQREAERHPR-LVPT-GPTHREPSPVRYDNLSRHIVASLQEREKLLR
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pF1KA1 ERERLLRSQADSLFGDSGVYDAPSSYSLQQASVLSEGPRGPALRYGSRDDLVAGPGFGGA
. : . . .::::. ..:.: ...:: . : :: .
XP_011 QSPPLPGREEEPGLGDSGIQSTPGS---------GHAPRTSS----SSDD--------SK
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560 570 580 590 600 610
pF1KA1 RNPALQTSLSSLSSSVSRAPRTSSSSLQADQASSNAPGPR-PSSGSHRSPARQGLPSPPG
:.: .: :. .: : . .. :.. ..: ::: : : :: . .. . ::
XP_011 RSPLGKTPLG--RPAVPRFGKPDG--LRGRGVGSPEPGPTAPYLG--RSMSYSSQKAQPG
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pF1KA1 TPHSPSYAGPKAVAFIHTDLPEPPPSLTVQRDHPQLKTPPSKLNGQSPGLARLGPATGPP
. .. . ::. .: : . .:. :::: :: ::: .:. .:. : :
XP_011 VSET------EEVAL------QP---LLTPKDEVQLKTTYSKSNGQPKSLGSASPGPGQP
650 660 670 680 690
680 690 700
pF1KA1 GPSASPTRHTLVKKVSGVGGTTYEISV
: .:::: ::::::::::::::::
XP_011 -PLSSPTRGG-VKKVSGVGGTTYEISV
700 710
>>XP_011543202 (OMIM: 614586) PREDICTED: palmitoyltransf (715 aa)
initn: 1716 init1: 1186 opt: 1684 Z-score: 809.1 bits: 160.2 E(85289): 2.5e-38
Smith-Waterman score: 1884; 48.8% identity (67.4% similar) in 717 aa overlap (1-702:64-715)
10 20 30
pF1KA1 MATFMDPGVFPRADEDEDKEDDFRAPLYKN
::::::::.::::.:::::::::::::::.
XP_011 FTCPGLSLYVSPAVPIYNAIMFLFVLANFSMATFMDPGIFPRAEEDEDKEDDFRAPLYKT
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40 50 60 70 80 90
pF1KA1 VDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFL
:...::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
XP_011 VEIKGIQVRMKWCATCRFYRPPRCSHCSVCDNCVEEFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFL
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pF1KA1 LSLSAHMVGVVAFGLVYVLNHAEGLGAAHTTITMAVMCVAGLFFIPVIGLTGFHVVLVTR
:::.::..:: .:::.::: : : :....:..::::::::::::::: ::::::::::.:
XP_011 LSLTAHIMGVFGFGLLYVLYHIEELSGVRTAVTMAVMCVAGLFFIPVAGLTGFHVVLVAR
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 GRTTNEQVTGKFRGGVNPFTRGCCGNVEHVLCSPLAPRYVVEPPRLPLAVSLKPPFLRPE
:::::::::::::::::::: :::.:: .:::: ::::. .: . : ..:::::::
XP_011 GRTTNEQVTGKFRGGVNPFTNGCCNNVSRVLCSSPAPRYLGRPKKEKTIV-IRPPFLRPE
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pF1KA1 LLDRAAPLKVKLSDNGLKAGLGRSKSKGSLDRLDEKPLDLGPPLPPKIEAGTFSSDLQTP
. : . . ::. :::... : :.::::::. . . : :: ::: . . ... :.:
XP_011 VSD--GQITVKIMDNGIQGELRRTKSKGSLEITESQSADAEPPPPPKPDLSRYTG-LRTH
280 290 300 310 320
280 290 300 310 320
pF1KA1 RP-GSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRPAFP---TGPKVPFCGPGEQVPGPDSL---TLGD
.. :.. . . :::::.:::.::.. :. .: . .. : ::: :
XP_011 LGLATNEDSSLLAKDSPPTPTMYKYRPGYSSSSTSAAMPHSSSAKLSRG-DSLKEPTSIA
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330 340 350 360 370 380
pF1KA1 DSIRSLDFVSEPSLDLPDYGPGGLHAAYPPSPPLSAS---DAFSGALRSLSLKASSRRGG
.: : .. :::::. : ... :: .. : : .:.. :: :::... :
XP_011 ESSRHPSYRSEPSLE-----PESFR-----SPTFGKSFHFDPLSSGSRSSSLKSAQGTGF
390 400 410 420 430
390 400 410 420 430
pF1KA1 DHVALQPLRSEGGPPTPHRSIFAPHALPNRNGSLSYDSLLNPG-SPGGHACPAHPAVGVA
. :: .:::: : ..:. : .:::::::::::.:. :: .. : :
XP_011 ELGQLQSIRSEGTTSTSYKSL----ANQTRNGSLSYDSLLTPSDSPDFESVQAGPEPDPP
440 450 460 470 480 490
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 -GYHSPYLHPG-ATGDPPRPLPRSFSPVLGPRPREPSPVRYDNLSRTIMASIQER-KDRE
:: ::.: : . :: . :. :: ::::::::::::: :.::.::: : .
XP_011 LGYTSPFLSARLAQQREAERHPR-LVPT-GPTHREPSPVRYDNLSRHIVASLQEREKLLR
500 510 520 530 540 550
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 ERERLLRSQADSLFGDSGVYDAPSSYSLQQASVLSEGPRGPALRYGSRDDLVAGPGFGGA
. : . . .::::. ..:.: ...:: . : :: .
XP_011 QSPPLPGREEEPGLGDSGIQSTPGS---------GHAPRTSS----SSDD--------SK
560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 RNPALQTSLSSLSSSVSRAPRTSSSSLQADQASSNAPGPR-PSSGSHRSPARQGLPSPPG
:.: .: :. .: : . .. :.. ..: ::: : : :: . .. . ::
XP_011 RSPLGKTPLG--RPAVPRFGKPDG--LRGRGVGSPEPGPTAPYLG--RSMSYSSQKAQPG
600 610 620 630 640
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pF1KA1 TPHSPSYAGPKAVAFIHTDLPEPPPSLTVQRDHPQLKTPPSKLNGQSPGLARLGPATGPP
. .. . ::. .: : . .:. :::: :: ::: .:. .:. : :
XP_011 VSET------EEVAL------QP---LLTPKDEVQLKTTYSKSNGQPKSLGSASPGPGQP
650 660 670 680 690
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pF1KA1 GPSASPTRHTLVKKVSGVGGTTYEISV
: .:::: ::::::::::::::::
XP_011 -PLSSPTRGG-VKKVSGVGGTTYEISV
700 710
>>NP_056272 (OMIM: 614586) palmitoyltransferase ZDHHC5 [ (715 aa)
initn: 1716 init1: 1186 opt: 1684 Z-score: 809.1 bits: 160.2 E(85289): 2.5e-38
Smith-Waterman score: 1884; 48.8% identity (67.4% similar) in 717 aa overlap (1-702:64-715)
10 20 30
pF1KA1 MATFMDPGVFPRADEDEDKEDDFRAPLYKN
::::::::.::::.:::::::::::::::.
NP_056 FTCPGLSLYVSPAVPIYNAIMFLFVLANFSMATFMDPGIFPRAEEDEDKEDDFRAPLYKT
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40 50 60 70 80 90
pF1KA1 VDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFL
:...::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
NP_056 VEIKGIQVRMKWCATCRFYRPPRCSHCSVCDNCVEEFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFL
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 LSLSAHMVGVVAFGLVYVLNHAEGLGAAHTTITMAVMCVAGLFFIPVIGLTGFHVVLVTR
:::.::..:: .:::.::: : : :....:..::::::::::::::: ::::::::::.:
NP_056 LSLTAHIMGVFGFGLLYVLYHIEELSGVRTAVTMAVMCVAGLFFIPVAGLTGFHVVLVAR
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160 170 180 190 200 210
pF1KA1 GRTTNEQVTGKFRGGVNPFTRGCCGNVEHVLCSPLAPRYVVEPPRLPLAVSLKPPFLRPE
:::::::::::::::::::: :::.:: .:::: ::::. .: . : ..:::::::
NP_056 GRTTNEQVTGKFRGGVNPFTNGCCNNVSRVLCSSPAPRYLGRPKKEKTIV-IRPPFLRPE
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220 230 240 250 260 270
pF1KA1 LLDRAAPLKVKLSDNGLKAGLGRSKSKGSLDRLDEKPLDLGPPLPPKIEAGTFSSDLQTP
. : . . ::. :::... : :.::::::. . . : :: ::: . . ... :.:
NP_056 VSD--GQITVKIMDNGIQGELRRTKSKGSLEITESQSADAEPPPPPKPDLSRYTG-LRTH
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280 290 300 310 320
pF1KA1 RP-GSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRPAFP---TGPKVPFCGPGEQVPGPDSL---TLGD
.. :.. . . :::::.:::.::.. :. .: . .. : ::: :
NP_056 LGLATNEDSSLLAKDSPPTPTMYKYRPGYSSSSTSAAMPHSSSAKLSRG-DSLKEPTSIA
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330 340 350 360 370 380
pF1KA1 DSIRSLDFVSEPSLDLPDYGPGGLHAAYPPSPPLSAS---DAFSGALRSLSLKASSRRGG
.: : .. :::::. : ... :: .. : : .:.. :: :::... :
NP_056 ESSRHPSYRSEPSLE-----PESFR-----SPTFGKSFHFDPLSSGSRSSSLKSAQGTGF
390 400 410 420 430
390 400 410 420 430
pF1KA1 DHVALQPLRSEGGPPTPHRSIFAPHALPNRNGSLSYDSLLNPG-SPGGHACPAHPAVGVA
. :: .:::: : ..:. : .:::::::::::.:. :: .. : :
NP_056 ELGQLQSIRSEGTTSTSYKSL----ANQTRNGSLSYDSLLTPSDSPDFESVQAGPEPDPP
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440 450 460 470 480 490
pF1KA1 -GYHSPYLHPG-ATGDPPRPLPRSFSPVLGPRPREPSPVRYDNLSRTIMASIQER-KDRE
:: ::.: : . :: . :. :: ::::::::::::: :.::.::: : .
NP_056 LGYTSPFLSARLAQQREAERHPR-LVPT-GPTHREPSPVRYDNLSRHIVASLQEREKLLR
500 510 520 530 540 550
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 ERERLLRSQADSLFGDSGVYDAPSSYSLQQASVLSEGPRGPALRYGSRDDLVAGPGFGGA
. : . . .::::. ..:.: ...:: . : :: .
NP_056 QSPPLPGREEEPGLGDSGIQSTPGS---------GHAPRTSS----SSDD--------SK
560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 RNPALQTSLSSLSSSVSRAPRTSSSSLQADQASSNAPGPR-PSSGSHRSPARQGLPSPPG
:.: .: :. .: : . .. :.. ..: ::: : : :: . .. . ::
NP_056 RSPLGKTPLG--RPAVPRFGKPDG--LRGRGVGSPEPGPTAPYLG--RSMSYSSQKAQPG
600 610 620 630 640
620 630 640 650 660 670
pF1KA1 TPHSPSYAGPKAVAFIHTDLPEPPPSLTVQRDHPQLKTPPSKLNGQSPGLARLGPATGPP
. .. . ::. .: : . .:. :::: :: ::: .:. .:. : :
NP_056 VSET------EEVAL------QP---LLTPKDEVQLKTTYSKSNGQPKSLGSASPGPGQP
650 660 670 680 690
680 690 700
pF1KA1 GPSASPTRHTLVKKVSGVGGTTYEISV
: .:::: ::::::::::::::::
NP_056 -PLSSPTRGG-VKKVSGVGGTTYEISV
700 710
>>XP_016872987 (OMIM: 614586) PREDICTED: palmitoyltransf (613 aa)
initn: 1471 init1: 941 opt: 1439 Z-score: 695.6 bits: 139.0 E(85289): 5.2e-32
Smith-Waterman score: 1639; 46.9% identity (65.3% similar) in 678 aa overlap (40-702:1-613)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 FPRADEDEDKEDDFRAPLYKNVDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDH
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XP_016 MKWCATCRFYRPPRCSHCSVCDNCVEEFDH
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pF1KA1 HCPWVNNCIGRRNYRYFFLFLLSLSAHMVGVVAFGLVYVLNHAEGLGAAHTTITMAVMCV
::::::::::::::::::::::::.::..:: .:::.::: : : :....:..:::::::
XP_016 HCPWVNNCIGRRNYRYFFLFLLSLTAHIMGVFGFGLLYVLYHIEELSGVRTAVTMAVMCV
40 50 60 70 80 90
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pF1KA1 AGLFFIPVIGLTGFHVVLVTRGRTTNEQVTGKFRGGVNPFTRGCCGNVEHVLCSPLAPRY
:::::::: ::::::::::.::::::::::::::::::::: :::.:: .:::: ::::
XP_016 AGLFFIPVAGLTGFHVVLVARGRTTNEQVTGKFRGGVNPFTNGCCNNVSRVLCSSPAPRY
100 110 120 130 140 150
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pF1KA1 VVEPPRLPLAVSLKPPFLRPELLDRAAPLKVKLSDNGLKAGLGRSKSKGSLDRLDEKPLD
. .: . : ..:::::::. : . . ::. :::... : :.::::::. . . :
XP_016 LGRPKKEKTIV-IRPPFLRPEVSD--GQITVKIMDNGIQGELRRTKSKGSLEITESQSAD
160 170 180 190 200
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pF1KA1 LGPPLPPKIEAGTFSSDLQTPRP-GSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRPAFP---TGPKVP
:: ::: . . ... :.: .. :.. . . :::::.:::.::.. :. .:
XP_016 AEPPPPPKPDLSRYTG-LRTHLGLATNEDSSLLAKDSPPTPTMYKYRPGYSSSSTSAAMP
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 FCGPGEQVPGPDSL---TLGDDSIRSLDFVSEPSLDLPDYGPGGLHAAYPPSPPLSAS--
. .. : ::: : .: : .. :::::. : ... :: .. :
XP_016 HSSSAKLSRG-DSLKEPTSIAESSRHPSYRSEPSLE-----PESFR-----SPTFGKSFH
270 280 290 300 310
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pF1KA1 -DAFSGALRSLSLKASSRRGGDHVALQPLRSEGGPPTPHRSIFAPHALPNRNGSLSYDSL
: .:.. :: :::... : . :: .:::: : ..:. : .::::::::::
XP_016 FDPLSSGSRSSSLKSAQGTGFELGQLQSIRSEGTTSTSYKSL----ANQTRNGSLSYDSL
320 330 340 350 360 370
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pF1KA1 LNPG-SPGGHACPAHPAVGVA-GYHSPYLHPG-ATGDPPRPLPRSFSPVLGPRPREPSPV
:.:. :: .. : : :: ::.: : . :: . :. :: ::::::
XP_016 LTPSDSPDFESVQAGPEPDPPLGYTSPFLSARLAQQREAERHPR-LVPT-GPTHREPSPV
380 390 400 410 420
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pF1KA1 RYDNLSRTIMASIQER-KDREERERLLRSQADSLFGDSGVYDAPSSYSLQQASVLSEGPR
::::::: :.::.::: : .. : . . .::::. ..:.: ...::
XP_016 RYDNLSRHIVASLQEREKLLRQSPPLPGREEEPGLGDSGIQSTPGS---------GHAPR
430 440 450 460 470 480
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 GPALRYGSRDDLVAGPGFGGARNPALQTSLSSLSSSVSRAPRTSSSSLQADQASSNAPGP
. : :: . :.: .: :. .: : . .. :.. ..: :::
XP_016 TSS----SSDD--------SKRSPLGKTPLG--RPAVPRFGKPDG--LRGRGVGSPEPGP
490 500 510 520
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 R-PSSGSHRSPARQGLPSPPGTPHSPSYAGPKAVAFIHTDLPEPPPSLTVQRDHPQLKTP
: : :: . .. . ::. .. . ::. : :: .:. ::::
XP_016 TAPYLG--RSMSYSSQKAQPGVSET------EEVAL--------QPLLT-PKDEVQLKTT
530 540 550 560
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pF1KA1 PSKLNGQSPGLARLGPATGPPGPSASPTRHTLVKKVSGVGGTTYEISV
:: ::: .:. .:. : : : .:::: ::::::::::::::::
XP_016 YSKSNGQPKSLGSASPGPGQP-PLSSPTRGG-VKKVSGVGGTTYEISV
570 580 590 600 610
>>NP_001008223 (OMIM: 300646,300799) palmitoyltransferas (364 aa)
initn: 599 init1: 417 opt: 564 Z-score: 289.9 bits: 63.2 E(85289): 2.1e-09
Smith-Waterman score: 594; 38.5% identity (59.7% similar) in 288 aa overlap (3-257:87-354)
10 20
pF1KA1 MATFMDPGVFPRADEDEDK--EDDFRA-----
.: ::::.::: :: : ...:
NP_001 CRYLAVQLSPAIPVFAAMLFLFSMATLLRTSFSDPGVIPRALPDEAAFIEMEIEATNGAV
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pF1KA1 -------PLYKNVDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDHHCPWVNNCI
: :: .. . :..:.: ::...:::: ::::.:::::: ::::::::.::.
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pF1KA1 GRRNYRYFFLFLLSLSAHMVGVVAFGLVYV------LNHAEGLGAAHTTITMAVMCVAGL
:.::::::.::.:::: . : ::..::: .. : : . :. ...: :
NP_001 GKRNYRYFYLFILSLSLLTIYVFAFNIVYVALKSLKIGFLETLKETPGTVLEVLICFFTL
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140 150 160 170 180
pF1KA1 FFIPVIGLTGFHVVLVTRGRTTNEQVTGKFRGGV---NPFTRG-----CCGNVEHVLCSP
. :.::::::. ::. ..::::.. :.. : ::...: :: .:::.:
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190 200 210 220 230
pF1KA1 LAPRYVVEPPRLPLAVS-LKPPFLRPE---LLDRA-APLKVKLSDNGLKAGLGRSKSKGS
: : . . ::: : .:: . :: .. :: . .:..:
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. . . : .. :: ::.
NP_001 MPEDSSTPEEMPPPEPPEPPQEAAEAEK
340 350 360
>>NP_057116 (OMIM: 300646,300799) palmitoyltransferase Z (364 aa)
initn: 599 init1: 417 opt: 564 Z-score: 289.9 bits: 63.2 E(85289): 2.1e-09
Smith-Waterman score: 594; 38.5% identity (59.7% similar) in 288 aa overlap (3-257:87-354)
10 20
pF1KA1 MATFMDPGVFPRADEDEDK--EDDFRA-----
.: ::::.::: :: : ...:
NP_057 CRYLAVQLSPAIPVFAAMLFLFSMATLLRTSFSDPGVIPRALPDEAAFIEMEIEATNGAV
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30 40 50 60 70
pF1KA1 -------PLYKNVDVRGIQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDHHCPWVNNCI
: :: .. . :..:.: ::...:::: ::::.:::::: ::::::::.::.
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pF1KA1 GRRNYRYFFLFLLSLSAHMVGVVAFGLVYV------LNHAEGLGAAHTTITMAVMCVAGL
:.::::::.::.:::: . : ::..::: .. : : . :. ...: :
NP_057 GKRNYRYFYLFILSLSLLTIYVFAFNIVYVALKSLKIGFLETLKETPGTVLEVLICFFTL
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140 150 160 170 180
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. :.::::::. ::. ..::::.. :.. : ::...: :: .:::.:
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702 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 23:44:22 2016 done: Fri Nov 4 23:44:24 2016
Total Scan time: 12.920 Total Display time: 0.140
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]