Result of FASTA (omim) for
pF1KA1319
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1319, 1203 aa
1>>>pF1KA1319 1203 - 1203 aa - 1203 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.1171+/-0.000613; mu= -22.3140+/- 0.038
mean_var=779.3150+/-161.659, 0's: 0 Z-trim(118.3): 484 B-trim: 0 in 0/61
Lambda= 0.045943
statistics sampled from 30590 (31092) to 30590 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.671), E-opt: 0.2 (0.365), width: 16
Scan time: 15.820
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_005245422 (OMIM: 609473) PREDICTED: cingulin is (1203) 7606 521.3 1.5e-146
NP_065821 (OMIM: 609473) cingulin [Homo sapiens] (1203) 7606 521.3 1.5e-146
NP_001239264 (OMIM: 607856) cingulin-like protein (1302) 1588 122.4 1.9e-26
XP_016878175 (OMIM: 607856) PREDICTED: cingulin-li (1302) 1588 122.4 1.9e-26
NP_116255 (OMIM: 607856) cingulin-like protein 1 [ (1302) 1588 122.4 1.9e-26
XP_016878174 (OMIM: 607856) PREDICTED: cingulin-li (1303) 1586 122.3 2.1e-26
XP_011520423 (OMIM: 607856) PREDICTED: cingulin-li (1303) 1586 122.3 2.1e-26
XP_005254784 (OMIM: 607856) PREDICTED: cingulin-li (1303) 1586 122.3 2.1e-26
XP_011520422 (OMIM: 607856) PREDICTED: cingulin-li (1303) 1586 122.3 2.1e-26
XP_005254783 (OMIM: 607856) PREDICTED: cingulin-li (1303) 1586 122.3 2.1e-26
XP_016880170 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (1976) 851 73.8 1.3e-11
NP_005955 (OMIM: 160776) myosin-10 isoform 2 [Homo (1976) 851 73.8 1.3e-11
XP_016880171 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (1976) 851 73.8 1.3e-11
XP_016880169 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (1985) 851 73.8 1.3e-11
NP_001243024 (OMIM: 160776) myosin-10 isoform 3 [H (1985) 851 73.8 1.3e-11
XP_016880167 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (1986) 851 73.8 1.3e-11
XP_016880168 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (1986) 851 73.8 1.3e-11
XP_016880166 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (1986) 851 73.8 1.3e-11
XP_011522182 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (2006) 851 73.8 1.3e-11
NP_001242941 (OMIM: 160776) myosin-10 isoform 1 [H (2007) 851 73.8 1.3e-11
XP_011522181 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (2015) 851 73.8 1.3e-11
XP_011522180 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (2016) 851 73.8 1.3e-11
XP_011522177 (OMIM: 160776) PREDICTED: myosin-10 i (2037) 851 73.8 1.3e-11
XP_016884293 (OMIM: 153640,153650,155100,160775,60 (1960) 824 72.0 4.4e-11
XP_011528499 (OMIM: 153640,153650,155100,160775,60 (1960) 824 72.0 4.4e-11
NP_002464 (OMIM: 153640,153650,155100,160775,60020 (1960) 824 72.0 4.4e-11
XP_016884292 (OMIM: 153640,153650,155100,160775,60 (1960) 824 72.0 4.4e-11
XP_016884294 (OMIM: 153640,153650,155100,160775,60 (1960) 824 72.0 4.4e-11
XP_016884295 (OMIM: 153640,153650,155100,160775,60 (1960) 824 72.0 4.4e-11
NP_002465 (OMIM: 132900,160745) myosin-11 isoform (1972) 804 70.6 1.1e-10
NP_001035203 (OMIM: 132900,160745) myosin-11 isofo (1979) 804 70.6 1.1e-10
XP_011520804 (OMIM: 132900,160745) PREDICTED: myos (1929) 798 70.2 1.4e-10
NP_074035 (OMIM: 132900,160745) myosin-11 isoform (1938) 798 70.2 1.4e-10
XP_016878739 (OMIM: 132900,160745) PREDICTED: myos (1945) 798 70.2 1.4e-10
NP_001035202 (OMIM: 132900,160745) myosin-11 isofo (1945) 798 70.2 1.4e-10
NP_079005 (OMIM: 600652,608568,614369) myosin-14 i (1995) 753 67.3 1.2e-09
XP_006723449 (OMIM: 600652,608568,614369) PREDICTE (2003) 753 67.3 1.2e-09
NP_001070654 (OMIM: 600652,608568,614369) myosin-1 (2003) 753 67.3 1.2e-09
XP_011525625 (OMIM: 600652,608568,614369) PREDICTE (2003) 753 67.3 1.2e-09
XP_011525623 (OMIM: 600652,608568,614369) PREDICTE (2035) 753 67.3 1.2e-09
NP_001139281 (OMIM: 600652,608568,614369) myosin-1 (2036) 753 67.3 1.2e-09
XP_011525622 (OMIM: 600652,608568,614369) PREDICTE (2043) 753 67.3 1.2e-09
NP_009044 (OMIM: 190370) trichohyalin [Homo sapien (1943) 606 57.5 9.8e-07
NP_000248 (OMIM: 160500,160760,181430,192600,25516 (1935) 605 57.4 1e-06
XP_016876829 (OMIM: 160500,160760,181430,192600,25 (1935) 605 57.4 1e-06
NP_002462 (OMIM: 160710,192600,613251,613252,61408 (1939) 599 57.0 1.3e-06
NP_002463 (OMIM: 158300,160741,608837) myosin-8 [H (1937) 597 56.9 1.5e-06
XP_011527250 (OMIM: 609928) PREDICTED: myosin-7B i (1738) 547 53.5 1.4e-05
XP_011527249 (OMIM: 609928) PREDICTED: myosin-7B i (1738) 547 53.5 1.4e-05
XP_016883476 (OMIM: 609928) PREDICTED: myosin-7B i (1807) 547 53.6 1.4e-05
>>XP_005245422 (OMIM: 609473) PREDICTED: cingulin isofor (1203 aa)
initn: 7606 init1: 7606 opt: 7606 Z-score: 2752.0 bits: 521.3 E(85289): 1.5e-146
Smith-Waterman score: 7606; 100.0% identity (100.0% similar) in 1203 aa overlap (1-1203:1-1203)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MEQAPNMAEPRGPVDHGVQIRFITEPVSGAEMGTLRRGGRRPAKDARASTYGVAVRVQGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MEQAPNMAEPRGPVDHGVQIRFITEPVSGAEMGTLRRGGRRPAKDARASTYGVAVRVQGI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 AGQPFVVLNSGEKGGDSFGVQIKGANDQGASGALSSDLELPENPYSQVKGFPAPSQSSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AGQPFVVLNSGEKGGDSFGVQIKGANDQGASGALSSDLELPENPYSQVKGFPAPSQSSTS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 DEEPGAYWNGKLLRSHSQASLAGPGPVDPSNRSNSMLELAPKVASPGSTIDTAPLSSVDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DEEPGAYWNGKLLRSHSQASLAGPGPVDPSNRSNSMLELAPKVASPGSTIDTAPLSSVDS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LINKFDSQLGGQARGRTGRRTRMLPPEQRKRSKSLDSRLPRDTFEERERQSTNHWTSSTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LINKFDSQLGGQARGRTGRRTRMLPPEQRKRSKSLDSRLPRDTFEERERQSTNHWTSSTK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 YDNHVGTSKQPAQSQNLSPLSGFSRSRQTQDWVLQSFEEPRRSAQDPTMLQFKSTPDLLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YDNHVGTSKQPAQSQNLSPLSGFSRSRQTQDWVLQSFEEPRRSAQDPTMLQFKSTPDLLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DQQEAAPPGSVDHMKATIYGILREGSSESETSVRRKVSLVLEKMQPLVMVSSGSTKAVAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DQQEAAPPGSVDHMKATIYGILREGSSESETSVRRKVSLVLEKMQPLVMVSSGSTKAVAG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 QGELTRKVEELQRKLDEEVKKRQKLEPSQVGLERQLEEKTEECSRLQELLERRKGEAQQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QGELTRKVEELQRKLDEEVKKRQKLEPSQVGLERQLEEKTEECSRLQELLERRKGEAQQS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NKELQNMKRLLDQGEDLRHGLETQVMELQNKLKHVQGPEPAKEVLLKDLLETRELLEEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NKELQNMKRLLDQGEDLRHGLETQVMELQNKLKHVQGPEPAKEVLLKDLLETRELLEEVL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 EGKQRVEEQLRLRERELTALKGALKEEVASRDQEVEHVRQQYQRDTEQLRRSMQDATQDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EGKQRVEEQLRLRERELTALKGALKEEVASRDQEVEHVRQQYQRDTEQLRRSMQDATQDH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 AVLEAERQKMSALVRGLQRELEETSEETGHWQSMFQKNKEDLRATKQELLQLRMEKEEME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AVLEAERQKMSALVRGLQRELEETSEETGHWQSMFQKNKEDLRATKQELLQLRMEKEEME
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 EELGEKIEVLQRELEQARASAGDTRQVEVLKKELLRTQEELKELQAERQSQEVAGRHRDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EELGEKIEVLQRELEQARASAGDTRQVEVLKKELLRTQEELKELQAERQSQEVAGRHRDR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 ELEKQLAVLRVEADRGRELEEQNLQLQKTLQQLRQDCEEASKAKMVAEAEATVLGQRRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ELEKQLAVLRVEADRGRELEEQNLQLQKTLQQLRQDCEEASKAKMVAEAEATVLGQRRAA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 VETTLRETQEENDEFRRRILGLEQQLKETRGLVDGGEAVEARLRDKLQRLEAEKQQLEEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VETTLRETQEENDEFRRRILGLEQQLKETRGLVDGGEAVEARLRDKLQRLEAEKQQLEEA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 LNASQEEEGSLAAAKRALEARLEEAQRGLARLGQEQQTLNRALEEEGKQREVLRRGKAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LNASQEEEGSLAAAKRALEARLEEAQRGLARLGQEQQTLNRALEEEGKQREVLRRGKAEL
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850 860 870 880 890 900
pF1KA1 EEQKRLLDRTVDRLNKELEKIGEDSKQALQQLQAQLEDYKEKARREVADAQRQAKDWASE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EEQKRLLDRTVDRLNKELEKIGEDSKQALQQLQAQLEDYKEKARREVADAQRQAKDWASE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 AEKTSGGLSRLQDEIQRLRQALQASQAERDTARLDKELLAQRLQGLEQEAENKKRSQDDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AEKTSGGLSRLQDEIQRLRQALQASQAERDTARLDKELLAQRLQGLEQEAENKKRSQDDR
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 ARQLKGLEEKVSRLETELDEEKNTVELLTDRVNRGRDQVDQLRTELMQERSARQDLECDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ARQLKGLEEKVSRLETELDEEKNTVELLTDRVNRGRDQVDQLRTELMQERSARQDLECDK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 ISLERQNKDLKTRLASSEGFQKPSASLSQLESQNQLLQERLQAEEREKTVLQSTNRKLER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ISLERQNKDLKTRLASSEGFQKPSASLSQLESQNQLLQERLQAEEREKTVLQSTNRKLER
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 KVKELSIQIEDERQHVNDQKDQLSLRVKALKRQVDEAEEEIERLDGLRKKAQREVEEQHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KVKELSIQIEDERQHVNDQKDQLSLRVKALKRQVDEAEEEIERLDGLRKKAQREVEEQHE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 VNEQLQARIKSLEKDSWRKASRSAAESALKNEGLSSDEEFDSVYDPSSIASLLTESNLQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VNEQLQARIKSLEKDSWRKASRSAAESALKNEGLSSDEEFDSVYDPSSIASLLTESNLQT
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 SSC
:::
XP_005 SSC
>>NP_065821 (OMIM: 609473) cingulin [Homo sapiens] (1203 aa)
initn: 7606 init1: 7606 opt: 7606 Z-score: 2752.0 bits: 521.3 E(85289): 1.5e-146
Smith-Waterman score: 7606; 100.0% identity (100.0% similar) in 1203 aa overlap (1-1203:1-1203)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MEQAPNMAEPRGPVDHGVQIRFITEPVSGAEMGTLRRGGRRPAKDARASTYGVAVRVQGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MEQAPNMAEPRGPVDHGVQIRFITEPVSGAEMGTLRRGGRRPAKDARASTYGVAVRVQGI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 AGQPFVVLNSGEKGGDSFGVQIKGANDQGASGALSSDLELPENPYSQVKGFPAPSQSSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 AGQPFVVLNSGEKGGDSFGVQIKGANDQGASGALSSDLELPENPYSQVKGFPAPSQSSTS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 DEEPGAYWNGKLLRSHSQASLAGPGPVDPSNRSNSMLELAPKVASPGSTIDTAPLSSVDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DEEPGAYWNGKLLRSHSQASLAGPGPVDPSNRSNSMLELAPKVASPGSTIDTAPLSSVDS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LINKFDSQLGGQARGRTGRRTRMLPPEQRKRSKSLDSRLPRDTFEERERQSTNHWTSSTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LINKFDSQLGGQARGRTGRRTRMLPPEQRKRSKSLDSRLPRDTFEERERQSTNHWTSSTK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 YDNHVGTSKQPAQSQNLSPLSGFSRSRQTQDWVLQSFEEPRRSAQDPTMLQFKSTPDLLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 YDNHVGTSKQPAQSQNLSPLSGFSRSRQTQDWVLQSFEEPRRSAQDPTMLQFKSTPDLLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DQQEAAPPGSVDHMKATIYGILREGSSESETSVRRKVSLVLEKMQPLVMVSSGSTKAVAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DQQEAAPPGSVDHMKATIYGILREGSSESETSVRRKVSLVLEKMQPLVMVSSGSTKAVAG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 QGELTRKVEELQRKLDEEVKKRQKLEPSQVGLERQLEEKTEECSRLQELLERRKGEAQQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 QGELTRKVEELQRKLDEEVKKRQKLEPSQVGLERQLEEKTEECSRLQELLERRKGEAQQS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NKELQNMKRLLDQGEDLRHGLETQVMELQNKLKHVQGPEPAKEVLLKDLLETRELLEEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 NKELQNMKRLLDQGEDLRHGLETQVMELQNKLKHVQGPEPAKEVLLKDLLETRELLEEVL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 EGKQRVEEQLRLRERELTALKGALKEEVASRDQEVEHVRQQYQRDTEQLRRSMQDATQDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 EGKQRVEEQLRLRERELTALKGALKEEVASRDQEVEHVRQQYQRDTEQLRRSMQDATQDH
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550 560 570 580 590 600
pF1KA1 AVLEAERQKMSALVRGLQRELEETSEETGHWQSMFQKNKEDLRATKQELLQLRMEKEEME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 AVLEAERQKMSALVRGLQRELEETSEETGHWQSMFQKNKEDLRATKQELLQLRMEKEEME
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 EELGEKIEVLQRELEQARASAGDTRQVEVLKKELLRTQEELKELQAERQSQEVAGRHRDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 EELGEKIEVLQRELEQARASAGDTRQVEVLKKELLRTQEELKELQAERQSQEVAGRHRDR
610 620 630 640 650 660
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pF1KA1 ELEKQLAVLRVEADRGRELEEQNLQLQKTLQQLRQDCEEASKAKMVAEAEATVLGQRRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ELEKQLAVLRVEADRGRELEEQNLQLQKTLQQLRQDCEEASKAKMVAEAEATVLGQRRAA
670 680 690 700 710 720
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pF1KA1 VETTLRETQEENDEFRRRILGLEQQLKETRGLVDGGEAVEARLRDKLQRLEAEKQQLEEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VETTLRETQEENDEFRRRILGLEQQLKETRGLVDGGEAVEARLRDKLQRLEAEKQQLEEA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 LNASQEEEGSLAAAKRALEARLEEAQRGLARLGQEQQTLNRALEEEGKQREVLRRGKAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LNASQEEEGSLAAAKRALEARLEEAQRGLARLGQEQQTLNRALEEEGKQREVLRRGKAEL
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pF1KA1 EEQKRLLDRTVDRLNKELEKIGEDSKQALQQLQAQLEDYKEKARREVADAQRQAKDWASE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 EEQKRLLDRTVDRLNKELEKIGEDSKQALQQLQAQLEDYKEKARREVADAQRQAKDWASE
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pF1KA1 AEKTSGGLSRLQDEIQRLRQALQASQAERDTARLDKELLAQRLQGLEQEAENKKRSQDDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 AEKTSGGLSRLQDEIQRLRQALQASQAERDTARLDKELLAQRLQGLEQEAENKKRSQDDR
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pF1KA1 ARQLKGLEEKVSRLETELDEEKNTVELLTDRVNRGRDQVDQLRTELMQERSARQDLECDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ARQLKGLEEKVSRLETELDEEKNTVELLTDRVNRGRDQVDQLRTELMQERSARQDLECDK
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pF1KA1 ISLERQNKDLKTRLASSEGFQKPSASLSQLESQNQLLQERLQAEEREKTVLQSTNRKLER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ISLERQNKDLKTRLASSEGFQKPSASLSQLESQNQLLQERLQAEEREKTVLQSTNRKLER
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pF1KA1 KVKELSIQIEDERQHVNDQKDQLSLRVKALKRQVDEAEEEIERLDGLRKKAQREVEEQHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KVKELSIQIEDERQHVNDQKDQLSLRVKALKRQVDEAEEEIERLDGLRKKAQREVEEQHE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VNEQLQARIKSLEKDSWRKASRSAAESALKNEGLSSDEEFDSVYDPSSIASLLTESNLQT
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pF1KA1 SSC
:::
NP_065 SSC
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: :: .. . : . . : :::. . .
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pF1KA1 VDSLINKFDSQLGGQARGRTGRRTRMLPPEQRKRSKSLDSRLPRDTFEERERQSTNHWTS
::.::.:::.. : : :::.:.:.:. ..::::.:.:: .: :.....
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... ..: :.. :.: ::: :..:. : ..: . . .:. . .
NP_001 -IEFSRNLGKSSEHLLRPSQVCPQRPLSQERRGKQS---VGRTFAKLQGAAHGASCAH--
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pF1KA1 STPDLLRDQQEAAPPGSVDHMKATIYGILREGSSESETSVRRKVSLVLEKMQPLVMVSSG
: : : ..: : . : . .:..: : ::
NP_001 SRP----------PQPNID-------GKVLETEGSQESTVIRAPSL--------------
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: ..: ::.. . . . : . ... :: .
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pF1KA1 KGEAQQSNKELQNMKRLLDQGEDLRHGLETQVMELQNKLKHVQGPEPAKEVLLKDLLETR
...: . :.....: .: .. :: . : : :: .: .. :.
NP_001 -SNTQATPDLLKGQQELTQQTNE-----ETAKQILYNYLK--EGSTDNDDA-------TK
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pF1KA1 ELLEEVLEGKQRVEEQLRLRERELTALKGALKEEVASRDQEVEHVRQQYQR---DTEQLR
. .. :.: : :. : . .: .... . .::. . .: .. .. .:.
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pF1KA1 RSMQDATQDHAVLEAERQKMSALVRGLQRELEETSEETGHWQSMFQKNKEDLRATKQELL
:..: .... .. ::..: : .. :. . .: ::.. :. ..... .:: . .::.
NP_001 RQLQLEVKNQQNIKEERERMRANLEELRSQHNEKVEENSTLQQRLEESEGELRKNLEELF
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pF1KA1 QLRMEKEEMEEE---LGEKIEVLQRELEQARASAGDTRQVEVLKKELLRTQEELKELQAE
:..::.:. . : : ... .. ::..:. : . :. .: .:::.....:..:
NP_001 QVKMEREQHQTEIRDLQDQLSEMHDELDSAKRS--EDREKGALIEELLQAKQDLQDLLIA
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pF1KA1 RQSQEVAGRHRDRELEKQLAVLRVE-ADRGRELEEQNLQLQKTLQQLRQDCEEASKAKMV
.. :: :.:.::: ..:. : ... .:... . : . :: ::.. :::.: :
NP_001 KEEQEDLLRKRERELTALKGALKEEVSSHDQEMDKLKEQYDAELQALRESVEEATKNVEV
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pF1KA1 AEAEATVLGQRRAAVETTLRETQEENDEFRRRILGLEQQLKETRGLVDGGEAVEARLRDK
..... : .:..: .. ::::.... : ::... . . .. .. ::. ..
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pF1KA1 LQRLEAEKQQLEEALNASQEEEGSLAAAKRALEARLEEAQRGLARLGQEQQTLNRALEEE
:.. :.: .:::::: ...:: ..:.:::: .:: :: .:.. :::. :.. :.::
NP_001 LKKYEGEIRQLEEALVHARKEEKEAVSARRALENELEAAQGNLSQTTQEQKQLSEKLKEE
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pF1KA1 GKQREVLRRGKAELEEQKRLLDRTVDRLNKELEKIGEDSKQALQQLQAQLEDYKEKARRE
..:.: ::: : :.:... : .:...:.::. : : :. . .:: ::..:::: :::
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pF1KA1 VADAQRQAKDWASEAEKTSGGLSRLQDEIQRLRQALQASQAERDTARLDKELLAQRLQGL
.:. ::: :. . ::::. ..:::.. ... :. : .: : ..:: : :. :
NP_001 LAEMQRQLKEKTLEAEKSRLTAMKMQDEMRLMEEELRDYQRAQDEALTKRQLLEQTLKDL
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pF1KA1 EQEAENKKRSQDDRARQLKGLEEKVSRLETELDEEKNTVELLTDRVNRGRDQVDQLRTEL
: : : :.. .:::.: .: .:.:::.:: ::.::.:. .::..:..:.:.:..:::.::
NP_001 EYELEAKSHLKDDRSRLVKQMEDKVSQLEMELEEERNNSDLLSERISRSREQMEQLRNEL
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pF1KA1 MQERSARQDLECDKISLERQNKDLKTRLASSEGFQKPSAS--LSQLESQNQLLQERLQAE
.:::.::::::::::::::::::::.:. :: . : . :.:.. :..::..:
NP_001 LQERAARQDLECDKISLERQNKDLKSRIIHLEGSYRSSKEGLVVQMEARIAELEDRLESE
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pF1KA1 EREKTVLQSTNRKLERKVKELSIQIEDERQHVNDQKDQLSLRVKALKRQVDEAEEEIERL
::... :: .::.:::::::: .:..::. ..:::::::::.::.::::.::::::.::
NP_001 ERDRANLQLSNRRLERKVKELVMQVDDEHLSLTDQKDQLSLRLKAMKRQVEEAEEEIDRL
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1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA1 DGLRKKAQREVEEQHEVNEQLQARIKSLEKD-SWRKASRSAAESALKNEGLSSDEEFDSV
.. .:: :::.::: ..::.::....:..:: .: .. .. .. ::.:
NP_001 ESSKKKLQRELEEQMDMNEHLQGQLNSMKKDLRLKKLPSKVLDDMDDDDDLSTDGGSLYE
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pF1KA1 YDPSSIASLLTESNLQTSSC
NP_001 APVSYTFSKDSTVASQI
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120 130 140 150 160 170
pF1KA1 STSDEEPGAYWNGKLLRSHSQASLAGPGPVDPSNRSNSMLELAPKVASPGSTIDTAPLSS
: :: .. . : . . : :::. . .
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pF1KA1 VDSLINKFDSQLGGQARGRTGRRTRMLPPEQRKRSKSLDSRLPRDTFEERERQSTNHWTS
::.::.:::.. : : :::.:.:.:. ..::::.:.:: .: :.....
XP_016 VDQLIEKFDQKPGLQRRGRSGKRNRI-NTDDRKRSRSVDSAFPFGL------QGNSEYL-
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pF1KA1 STKYDNHVGTSKQ----PAQSQNLSPLSGFSRSRQTQDWVLQSFEEPRRSAQDPTMLQFK
... ..: :.. :.: ::: :..:. : ..: . . .:. . .
XP_016 -IEFSRNLGKSSEHLLRPSQVCPQRPLSQERRGKQS---VGRTFAKLQGAAHGASCAH--
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pF1KA1 STPDLLRDQQEAAPPGSVDHMKATIYGILREGSSESETSVRRKVSLVLEKMQPLVMVSSG
: : : ..: : . : . .:..: : ::
XP_016 SRP----------PQPNID-------GKVLETEGSQESTVIRAPSL--------------
460 470 480
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 STKAVAGQGELTRKVEELQRKLDEEVKKRQKLEPSQVGLERQLEEKTEECSRLQELLERR
: ..: ::.. . . . : . ... :: .
XP_016 --------GAQSKKEEEVKTATATLMLQNRATATSPDSGAKKISVKTFPSA---------
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pF1KA1 KGEAQQSNKELQNMKRLLDQGEDLRHGLETQVMELQNKLKHVQGPEPAKEVLLKDLLETR
...: . :.....: .: .. :: . : : :: .: .. :.
XP_016 -SNTQATPDLLKGQQELTQQTNE-----ETAKQILYNYLK--EGSTDNDDA-------TK
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pF1KA1 ELLEEVLEGKQRVEEQLRLRERELTALKGALKEEVASRDQEVEHVRQQYQR---DTEQLR
. .. :.: : :. : . .: .... . .::. . .: .. .. .:.
XP_016 RKVNLVFEKIQT------LKSRAAGSAQG--NNQACNSTSEVKDLLEQKSKLTIEVAELQ
580 590 600 610 620
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 RSMQDATQDHAVLEAERQKMSALVRGLQRELEETSEETGHWQSMFQKNKEDLRATKQELL
:..: .... .. ::..: : .. :. . .: ::.. :. ..... .:: . .::.
XP_016 RQLQLEVKNQQNIKEERERMRANLEELRSQHNEKVEENSTLQQRLEESEGELRKNLEELF
630 640 650 660 670 680
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pF1KA1 QLRMEKEEMEEE---LGEKIEVLQRELEQARASAGDTRQVEVLKKELLRTQEELKELQAE
:..::.:. . : : ... .. ::..:. : . :. .: .:::.....:..:
XP_016 QVKMEREQHQTEIRDLQDQLSEMHDELDSAKRS--EDREKGALIEELLQAKQDLQDLLIA
690 700 710 720 730 740
650 660 670 680 690 700
pF1KA1 RQSQEVAGRHRDRELEKQLAVLRVE-ADRGRELEEQNLQLQKTLQQLRQDCEEASKAKMV
.. :: :.:.::: ..:. : ... .:... . : . :: ::.. :::.: :
XP_016 KEEQEDLLRKRERELTALKGALKEEVSSHDQEMDKLKEQYDAELQALRESVEEATKNVEV
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pF1KA1 AEAEATVLGQRRAAVETTLRETQEENDEFRRRILGLEQQLKETRGLVDGGEAVEARLRDK
..... : .:..: .. ::::.... : ::... . . .. .. ::. ..
XP_016 LASRSNTSEQDQAGTEMRVKLLQEENEKLQGRSEELERRVAQLQRQIEDLKGDEAKAKET
810 820 830 840 850 860
770 780 790 800 810 820
pF1KA1 LQRLEAEKQQLEEALNASQEEEGSLAAAKRALEARLEEAQRGLARLGQEQQTLNRALEEE
:.. :.: .:::::: ...:: ..:.:::: .:: :: .:.. :::. :.. :.::
XP_016 LKKYEGEIRQLEEALVHARKEEKEAVSARRALENELEAAQGNLSQTTQEQKQLSEKLKEE
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830 840 850 860 870 880
pF1KA1 GKQREVLRRGKAELEEQKRLLDRTVDRLNKELEKIGEDSKQALQQLQAQLEDYKEKARRE
..:.: ::: : :.:... : .:...:.::. : : :. . .:: ::..:::: :::
XP_016 SEQKEQLRRLKNEMENERWHLGKTIEKLQKEMADIVEASRTSTLELQNQLDEYKEKNRRE
930 940 950 960 970 980
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pF1KA1 VADAQRQAKDWASEAEKTSGGLSRLQDEIQRLRQALQASQAERDTARLDKELLAQRLQGL
.:. ::: :. . ::::. ..:::.. ... :. : .: : ..:: : :. :
XP_016 LAEMQRQLKEKTLEAEKSRLTAMKMQDEMRLMEEELRDYQRAQDEALTKRQLLEQTLKDL
990 1000 1010 1020 1030 1040
950 960 970 980 990 1000
pF1KA1 EQEAENKKRSQDDRARQLKGLEEKVSRLETELDEEKNTVELLTDRVNRGRDQVDQLRTEL
: : : :.. .:::.: .: .:.:::.:: ::.::.:. .::..:..:.:.:..:::.::
XP_016 EYELEAKSHLKDDRSRLVKQMEDKVSQLEMELEEERNNSDLLSERISRSREQMEQLRNEL
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA1 MQERSARQDLECDKISLERQNKDLKTRLASSEGFQKPSAS--LSQLESQNQLLQERLQAE
.:::.::::::::::::::::::::.:. :: . : . :.:.. :..::..:
XP_016 LQERAARQDLECDKISLERQNKDLKSRIIHLEGSYRSSKEGLVVQMEARIAELEDRLESE
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA1 EREKTVLQSTNRKLERKVKELSIQIEDERQHVNDQKDQLSLRVKALKRQVDEAEEEIERL
::... :: .::.:::::::: .:..::. ..:::::::::.::.::::.::::::.::
XP_016 ERDRANLQLSNRRLERKVKELVMQVDDEHLSLTDQKDQLSLRLKAMKRQVEEAEEEIDRL
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA1 DGLRKKAQREVEEQHEVNEQLQARIKSLEKD-SWRKASRSAAESALKNEGLSSDEEFDSV
.. .:: :::.::: ..::.::....:..:: .: .. .. .. ::.:
XP_016 ESSKKKLQRELEEQMDMNEHLQGQLNSMKKDLRLKKLPSKVLDDMDDDDDLSTDGGSLYE
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1190 1200
pF1KA1 YDPSSIASLLTESNLQTSSC
XP_016 APVSYTFSKDSTVASQI
1290 1300
>>NP_116255 (OMIM: 607856) cingulin-like protein 1 [Homo (1302 aa)
initn: 2160 init1: 938 opt: 1588 Z-score: 595.9 bits: 122.4 E(85289): 1.9e-26
Smith-Waterman score: 1665; 33.2% identity (64.1% similar) in 1044 aa overlap (148-1177:324-1279)
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 STSDEEPGAYWNGKLLRSHSQASLAGPGPVDPSNRSNSMLELAPKVASPGSTIDTAPLSS
: :: .. . : . . : :::. . .
NP_116 RRSSSSSTTPTSANSLYRFLLDDQECAIHADNVNRHENR-RYIPFLPGTGRDIDTGSIPG
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pF1KA1 VDSLINKFDSQLGGQARGRTGRRTRMLPPEQRKRSKSLDSRLPRDTFEERERQSTNHWTS
::.::.:::.. : : :::.:.:.:. ..::::.:.:: .: :.....
NP_116 VDQLIEKFDQKPGLQRRGRSGKRNRI-NTDDRKRSRSVDSAFPFGL------QGNSEYL-
360 370 380 390 400
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pF1KA1 STKYDNHVGTSKQ----PAQSQNLSPLSGFSRSRQTQDWVLQSFEEPRRSAQDPTMLQFK
... ..: :.. :.: ::: :..:. : ..: . . .:. . .
NP_116 -IEFSRNLGKSSEHLLRPSQVCPQRPLSQERRGKQS---VGRTFAKLQGAAHGASCAH--
410 420 430 440 450
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 STPDLLRDQQEAAPPGSVDHMKATIYGILREGSSESETSVRRKVSLVLEKMQPLVMVSSG
: : : ..: : . : . .:..: : ::
NP_116 SRP----------PQPNID-------GKVLETEGSQESTVIRAPSL--------------
460 470 480
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 STKAVAGQGELTRKVEELQRKLDEEVKKRQKLEPSQVGLERQLEEKTEECSRLQELLERR
: ..: ::.. . . . : . ... :: .
NP_116 --------GAQSKKEEEVKTATATLMLQNRATATSPDSGAKKISVKTFPSA---------
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pF1KA1 KGEAQQSNKELQNMKRLLDQGEDLRHGLETQVMELQNKLKHVQGPEPAKEVLLKDLLETR
...: . :.....: .: .. :: . : : :: .: .. :.
NP_116 -SNTQATPDLLKGQQELTQQTNE-----ETAKQILYNYLK--EGSTDNDDA-------TK
540 550 560 570
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pF1KA1 ELLEEVLEGKQRVEEQLRLRERELTALKGALKEEVASRDQEVEHVRQQYQR---DTEQLR
. .. :.: : :. : . .: .... . .::. . .: .. .. .:.
NP_116 RKVNLVFEKIQT------LKSRAAGSAQG--NNQACNSTSEVKDLLEQKSKLTIEVAELQ
580 590 600 610 620
540 550 560 570 580 590
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