FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1331, 589 aa 1>>>pF1KA1331 589 - 589 aa - 589 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7111+/-0.000402; mu= 17.8400+/- 0.025 mean_var=93.0693+/-18.678, 0's: 0 Z-trim(113.6): 66 B-trim: 45 in 1/52 Lambda= 0.132945 statistics sampled from 22926 (22992) to 22926 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.638), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16 Scan time: 7.370 The best scores are: opt bits E(85289) NP_067640 (OMIM: 608261) sentrin-specific protease ( 589) 3987 775.4 0 XP_005247748 (OMIM: 608261) PREDICTED: sentrin-spe ( 474) 3206 625.6 1.2e-178 XP_005247747 (OMIM: 608261) PREDICTED: sentrin-spe ( 545) 2496 489.4 1.3e-137 XP_016862462 (OMIM: 608261) PREDICTED: sentrin-spe ( 430) 1715 339.5 1.3e-92 XP_016874729 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 432) 1005 203.4 1.3e-51 XP_016874725 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 631) 1005 203.5 1.7e-51 XP_016874726 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 631) 1005 203.5 1.7e-51 XP_011536546 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 663) 1005 203.5 1.8e-51 XP_016874719 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 694) 1005 203.5 1.9e-51 XP_006719425 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 445) 1001 202.6 2.3e-51 XP_016874727 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 445) 1001 202.6 2.3e-51 XP_016874728 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 445) 1001 202.6 2.3e-51 XP_016874724 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 637) 1001 202.7 3e-51 XP_016874722 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 637) 1001 202.7 3e-51 XP_016874723 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 637) 1001 202.7 3e-51 NP_001254524 (OMIM: 612157) sentrin-specific prote ( 644) 1001 202.7 3e-51 NP_001254523 (OMIM: 612157) sentrin-specific prote ( 644) 1001 202.7 3e-51 XP_011536547 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 660) 1001 202.7 3.1e-51 XP_016874721 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 675) 1001 202.8 3.1e-51 XP_016874720 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 675) 1001 202.8 3.1e-51 XP_006719424 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 676) 1001 202.8 3.1e-51 XP_016874718 (OMIM: 612157) PREDICTED: sentrin-spe ( 707) 1001 202.8 3.2e-51 NP_056485 (OMIM: 612844) sentrin-specific protease ( 574) 494 105.5 5.2e-22 NP_689912 (OMIM: 612845) sentrin-specific protease ( 755) 488 104.4 1.4e-21 XP_011510846 (OMIM: 612845) PREDICTED: sentrin-spe ( 755) 488 104.4 1.4e-21 XP_005269367 (OMIM: 612845) PREDICTED: sentrin-spe ( 727) 341 76.2 4.2e-13 XP_011510847 (OMIM: 612845) PREDICTED: sentrin-spe ( 643) 209 50.8 1.6e-05 >>NP_067640 (OMIM: 608261) sentrin-specific protease 2 [ (589 aa) initn: 3987 init1: 3987 opt: 3987 Z-score: 4136.8 bits: 775.4 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 3987; 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