Result of FASTA (omim) for
pF1KA1339
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1339, 642 aa
1>>>pF1KA1339 642 - 642 aa - 642 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8322+/-0.000391; mu= 16.0937+/- 0.025
mean_var=291.6737+/-57.342, 0's: 0 Z-trim(122.1): 1881 B-trim: 116 in 1/61
Lambda= 0.075098
statistics sampled from 37416 (39657) to 37416 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.783), E-opt: 0.2 (0.465), width: 16
Scan time: 13.410
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003566 (OMIM: 603397) zinc finger protein 282 i ( 671) 1497 176.3 3.2e-43
NP_036388 (OMIM: 602386) zinc finger protein 212 [ ( 495) 961 118.0 8.2e-26
XP_016868136 (OMIM: 602386) PREDICTED: zinc finger ( 492) 949 116.7 2e-25
XP_005250112 (OMIM: 602386) PREDICTED: zinc finger ( 535) 949 116.8 2.1e-25
XP_016868135 (OMIM: 602386) PREDICTED: zinc finger ( 494) 937 115.4 5e-25
XP_005250013 (OMIM: 613914) PREDICTED: zinc finger ( 659) 908 112.5 5.1e-24
XP_005250012 (OMIM: 613914) PREDICTED: zinc finger ( 660) 908 112.5 5.1e-24
NP_942152 (OMIM: 601856) zinc finger protein 211 i ( 564) 890 110.4 1.8e-23
NP_006376 (OMIM: 601856) zinc finger protein 211 i ( 577) 890 110.4 1.8e-23
NP_001290410 (OMIM: 603397) zinc finger protein 28 ( 463) 885 109.7 2.4e-23
XP_006716214 (OMIM: 603397) PREDICTED: zinc finger ( 672) 885 110.0 2.9e-23
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 884 109.8 3e-23
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 884 109.8 3e-23
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 884 109.8 3e-23
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 884 109.9 3.1e-23
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 884 109.9 3.1e-23
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 884 109.9 3.1e-23
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 884 109.9 3.1e-23
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 884 109.9 3.1e-23
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 884 109.9 3.1e-23
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 884 109.9 3.1e-23
XP_005250014 (OMIM: 613914) PREDICTED: zinc finger ( 647) 878 109.2 4.8e-23
NP_001166303 (OMIM: 612429) zinc finger protein 30 ( 568) 873 108.6 6.5e-23
NP_443092 (OMIM: 612429) zinc finger protein 300 i ( 604) 873 108.6 6.7e-23
XP_011536004 (OMIM: 612429) PREDICTED: zinc finger ( 609) 873 108.6 6.7e-23
NP_001166302 (OMIM: 612429) zinc finger protein 30 ( 620) 873 108.6 6.8e-23
NP_001311176 (OMIM: 616085) zinc finger protein 37 ( 561) 868 108.0 9.4e-23
NP_001171572 (OMIM: 616085) zinc finger protein 37 ( 561) 868 108.0 9.4e-23
NP_001311175 (OMIM: 616085) zinc finger protein 37 ( 561) 868 108.0 9.4e-23
NP_003412 (OMIM: 616085) zinc finger protein 37A i ( 561) 868 108.0 9.4e-23
NP_001311177 (OMIM: 616085) zinc finger protein 37 ( 561) 868 108.0 9.4e-23
XP_011517959 (OMIM: 616085) PREDICTED: zinc finger ( 561) 868 108.0 9.4e-23
NP_001007095 (OMIM: 616085) zinc finger protein 37 ( 561) 868 108.0 9.4e-23
NP_001311180 (OMIM: 616085) zinc finger protein 37 ( 561) 868 108.0 9.4e-23
XP_011517958 (OMIM: 616085) PREDICTED: zinc finger ( 561) 868 108.0 9.4e-23
NP_001311174 (OMIM: 616085) zinc finger protein 37 ( 561) 868 108.0 9.4e-23
NP_001311178 (OMIM: 616085) zinc finger protein 37 ( 561) 868 108.0 9.4e-23
XP_011517960 (OMIM: 616085) PREDICTED: zinc finger ( 561) 868 108.0 9.4e-23
NP_001311179 (OMIM: 616085) zinc finger protein 37 ( 561) 868 108.0 9.4e-23
NP_067039 (OMIM: 194545) endothelial zinc finger p ( 489) 858 106.8 1.9e-22
XP_016882569 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 489) 858 106.8 1.9e-22
NP_001317411 (OMIM: 613904) zinc finger protein 56 ( 527) 858 106.9 1.9e-22
XP_016881871 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 858 106.9 1.9e-22
XP_016881869 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 858 106.9 1.9e-22
XP_016881868 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 858 106.9 1.9e-22
XP_016882567 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 858 106.9 2e-22
XP_011525495 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 858 106.9 2e-22
XP_016882568 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 858 106.9 2e-22
XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 858 107.0 2.2e-22
XP_016881865 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 858 107.1 2.2e-22
>>NP_003566 (OMIM: 603397) zinc finger protein 282 isofo (671 aa)
initn: 1599 init1: 750 opt: 1497 Z-score: 897.1 bits: 176.3 E(85289): 3.2e-43
Smith-Waterman score: 1564; 43.4% identity (65.3% similar) in 643 aa overlap (1-607:47-668)
10 20
pF1KA1 MAEAAPA-PTSEWDSECLTSLQPLPLPTPP
:::. : ..::: . . .:.:. ::
NP_003 GLGLDSGSWSWAQALPPEEVCHQEPALRGEMAEGMPPMQAQEWD---MDARRPMPFQFPP
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70
pF1KA1 AANEA-----------HLQTAAISLWTVVAAVQAIERKVEIHSRRLLHLEGRTGTAEKKL
..: .: :: :::::::::.::.::::. .. .::.::::::::::::
NP_003 FPDRAPVFPDRMMREPQLPTAEISLWTVVAAIQAVERKVDAQASQLLNLEGRTGTAEKKL
80 90 100 110 120 130
80 90 100 110 120 130
pF1KA1 ASCEKTVTELGNQLEGKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENLENLLRNRNFWILRLPPGIKGDI
:.::::..:.::..:.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: ::.
NP_003 ADCEKTAVEFGNHMESKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENLENLLRNRNFWVLRLPPGSKGEA
140 150 160 170 180 190
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 PKVPVAFDDVSIYFSTPEWEKLEEWQKELYKNIMKGNYESLISMDY--AINQPDVLSQIQ
:::::.: :...::: ::..:.:::::::.:..: ::..:.:.: .. .::. : .
NP_003 PKVPVTFVDIAVYFSEDEWKNLDEWQKELYNNLVKENYKTLMSLDAEGSVPKPDAPVQAE
200 210 220 230 240 250
200 210 220 230 240 250
pF1KA1 PEGEHNTEDQAGPEESEIPTDP--SEEPGISTSDILSWIKQEE----EPQVGAPPESKES
:. : . .: ::: ::: :: . :: . ..: : .:.:. . : : .. .
NP_003 PREEPCVWEQRHPEEREIPMDPEAGAEPLVPAQDASSQVKREDTLCVRGQRGLEERAIPT
260 270 280 290 300 310
260 270 280 290 300
pF1KA1 D-VYKSTYADEELV--IKAEGLA----RSSLCP-EVPV-PFSSPPAAAKDAFSDVAFKSQ
. . : . ..:. :: : ...: ..:. : : .:.: .: . .
NP_003 ESITDSPISAQDLLSRIKQEEHQCVWDQQDLADRDIPTDPNSESLISAHDILSWI----K
320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 QSTSMTPFG-RPATDLPEASEGQVTFTQLGSYPLPPPVGEQVFSCHHCGKNLSQDMLLTH
: . :.: : . : : . . .: :::. : . . : .: .
NP_003 QEEQPYPWGPRDSMD-GELGLDSGPSDSLLMVKNPPPAPPQ----PQPQPQPPQPQLQS-
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410
pF1KA1 QCSHATEHPLPCAQCPKHFTPQADLSSTSQ----DHAS-ETPPTCPHCARTFTHPSRLTY
: . . :. :. : .. :.. : ...: :.:: . . .
NP_003 QPQPQSLPPIAVAENPGGPPSRGLLDDGFQVLPGERGSGEAPPGGDRSTGGGGGDGG-GG
430 440 450 460 470 480
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 HLRVHNSTERPFPCPDC-PKRFADQARLTSHRRAHASERPFRCAQCGRSFSLKISLLLHQ
.. .: : .: : . . : : : .:. : .::.::... ::..:.
NP_003 GGGAEAGTGAGGGCGSCCPGGL--RRSLLLH---GARSKPYSCPECGKSFGVRKSLIIHH
490 500 510 520 530
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 RGHAQERPFSCPQCGIDFNGHSALIRHQMIHTGERPYPCTDCSKSFMRKEHLLNHRRLHT
:.:..:::. : .: .:: ::.:::::: : ::::: :..: :.. ::::: ::.::::
NP_003 RSHTKERPYECAECEKSFNCHSGLIRHQMTHRGERPYKCSECEKTYSRKEHLQNHQRLHT
540 550 560 570 580 590
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 GERPFSCPHCGKSFIRKHHLMKHQRIHTGERPYPCSYCGRSFRYKQTLKDHLRSGHNGGC
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NP_003 GERPFQCALCGKSFIRKQNLLKHQRIHTGERPYTCGECGKSFRYKESLKDHLRV-HSGG-
600 610 620 630 640 650
600 610 620 630 640
pF1KA1 GGDSDPSGQPPNPPGPLITGLETSGLGVNTEGLETNQWYGEGSGGGVL
: . : :: :
NP_003 PGPGAPRQLPPPPERD
660 670
>>NP_036388 (OMIM: 602386) zinc finger protein 212 [Homo (495 aa)
initn: 1044 init1: 739 opt: 961 Z-score: 584.4 bits: 118.0 E(85289): 8.2e-26
Smith-Waterman score: 1068; 39.2% identity (58.2% similar) in 572 aa overlap (1-565:1-481)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAEAAPAPTSEWDSECLTSLQPLPLPTPPAANEAHLQTAAISLWTVVAAVQAIERKVEIH
:::.::: . : : ::. . . ...::. :::::::::.::.:.:.: .
NP_036 MAESAPARHRRKRRS--TPLTSSTLPSQATEKSSYFQTTEISLWTVVAAIQAVEKKMESQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 SRRLLHLEGRTGTAEKKLASCEKTVTELGNQLEGKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENLENLL
. :: :::::::::::::.::: ..:.:::::::::::::::::::::::::::.::::
NP_036 AARLQSLEGRTGTAEKKLADCEKMAVEFGNQLEGKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENVENLL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 RNRNFWILRLPPGIKGDIPKVPVAFDDVSIYFSTPEWEKLEEWQKELYKNIMKGNYESLI
::::::::::::: ::. ::: .... .. :. :::.::.::::::.:.:..:::.:.
NP_036 RNRNFWILRLPPGSKGEAPKVSRSLENDGVCFTEQEWENLEDWQKELYRNVMESNYETLV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SMDYAINQPDVLSQIQPEGEHNTEDQAGPEESEIPTDPSEEPGISTSDILSWIKQEEEPQ
:. ::.: . :.: .:: . :: : ::
NP_036 SLK-------VLGQTEGEAELGTEMLGDLEE--------EGPG-----------------
180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 VGAPPESKESDVYKSTYADEELVIKAEGLARSSLCPEVPVPFSSPPAAAKDAFSDVAFKS
:: : . ... .:: :: : ..: :: :.. :: :
NP_036 -GAHPAG-------GVMIKQELQYTQEGPA------DLPGEFS---CIAEEQ----AFLS
210 220 230 240
310 320 330 340 350
pF1KA1 QQSTSMTPFGRPATDLPEASEGQVTFTQLGSYPLPPPVGEQVFSCHH---CGKNLSQDML
..: . :. .. : :.. :. : : ::: .: : . : :. :. ..
NP_036 PEQTELWG-GQGSSVLLETGPGDST--------LEEPVGSRVPSSSRTVGCPKQKSHRQV
250 260 270 280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 LTHQCSHATEHPLPCAQCPKHFTPQADLSSTSQDHASETPPTCPHCARTFTHPSRLTYHL
: .: . . . : : : : .: :: . ..:. ::
NP_036 QLDQ------------ECGQGLKLKKDTSR---------PYECSECEITFRYKQQLATHL
300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 RVHNSTERPFPC-PDCPKR-FADQARLTSHRRAHASERPFRCAQCGRSFSLKISLLLHQR
: :.. : :. :.. . . :: . . . . .: : :::: :.::. :::
NP_036 RSHSGWG---SCTPEEPEESLRPRPRLKPQTK---KAKLHQCDVCLRSFSCKVSLVTHQR
340 350 360 370 380
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 GHAQERPFSCPQCGIDFNGHS--ALIRHQMIHTGERPYPCTDCSKSFMRKEHLLNHRRLH
: :: : . . :. .: :: : . .. : :.::: . :. :.:.:
NP_036 CHLQEGPSAGQHVQERFSPNSLVALPGHIPWRKSRSSLICGYCGKSFSHPSDLVRHQRIH
390 400 410 420 430 440
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 TGERPFSCPHCGKSFIRKHHLMKHQRIHTGERPYPCSYCGRSFRYKQTLKDHLRSGHNGG
:::::.:: .: :::..:.::..::.:: ::
NP_036 TGERPYSCTECEKSFVQKQHLLQHQKIHQRERGGLALEPGRPNGLL
450 460 470 480 490
600 610 620 630 640
pF1KA1 CGGDSDPSGQPPNPPGPLITGLETSGLGVNTEGLETNQWYGEGSGGGVL
>>XP_016868136 (OMIM: 602386) PREDICTED: zinc finger pro (492 aa)
initn: 1036 init1: 731 opt: 949 Z-score: 577.4 bits: 116.7 E(85289): 2e-25
Smith-Waterman score: 1056; 39.3% identity (58.6% similar) in 555 aa overlap (18-565:13-478)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAEAAPAPTSEWDSECLTSLQPLPLPTPPAANEAHLQTAAISLWTVVAAVQAIERKVEIH
: : ::. . . ...::. :::::::::.::.:.:.: .
XP_016 MWKQDKMRKRRSTPLTSSTLPSQATEKSSYFQTTEISLWTVVAAIQAVEKKMESQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 SRRLLHLEGRTGTAEKKLASCEKTVTELGNQLEGKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENLENLL
. :: :::::::::::::.::: ..:.:::::::::::::::::::::::::::.::::
XP_016 AARLQSLEGRTGTAEKKLADCEKMAVEFGNQLEGKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENVENLL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 RNRNFWILRLPPGIKGDIPKVPVAFDDVSIYFSTPEWEKLEEWQKELYKNIMKGNYESLI
::::::::::::: ::. ::: .... .. :. :::.::.::::::.:.:..:::.:.
XP_016 RNRNFWILRLPPGSKGEAPKVSRSLENDGVCFTEQEWENLEDWQKELYRNVMESNYETLV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SMDYAINQPDVLSQIQPEGEHNTEDQAGPEESEIPTDPSEEPGISTSDILSWIKQEEEPQ
:. ::.: . :.: .:: . :: : ::
XP_016 SLK-------VLGQTEGEAELGTEMLGDLEE--------EGPG-----------------
180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 VGAPPESKESDVYKSTYADEELVIKAEGLARSSLCPEVPVPFSSPPAAAKDAFSDVAFKS
:: : . ... .:: :: : ..: :: :.. :: :
XP_016 -GAHPAG-------GVMIKQELQYTQEGPA------DLPGEFS---CIAEEQ----AFLS
210 220 230 240
310 320 330 340 350
pF1KA1 QQSTSMTPFGRPATDLPEASEGQVTFTQLGSYPLPPPVGEQVFSCHH---CGKNLSQDML
..: . :. .. : :.. :. : : ::: .: : . : :. :. ..
XP_016 PEQTELWG-GQGSSVLLETGPGDST--------LEEPVGSRVPSSSRTVGCPKQKSHRQV
250 260 270 280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 LTHQCSHATEHPLPCAQCPKHFTPQADLSSTSQDHASETPPTCPHCARTFTHPSRLTYHL
: .: . . . : : : : .: :: . ..:. ::
XP_016 QLDQ------------ECGQGLKLKKDTSR---------PYECSECEITFRYKQQLATHL
300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 RVHNSTERPFPC-PDCPKR-FADQARLTSHRRAHASERPFRCAQCGRSFSLKISLLLHQR
: :.. : :. :.. . . :: . . . . .: : :::: :.::. :::
XP_016 RSHSGWGS---CTPEEPEESLRPRPRLKPQTK---KAKLHQCDVCLRSFSCKVSLVTHQR
340 350 360 370 380
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 GHAQERPFSCPQCGIDFNGHS--ALIRHQMIHTGERPYPCTDCSKSFMRKEHLLNHRRLH
: :: : . . :. .: :: : . .. : :.::: . :. :.:.:
XP_016 CHLQEGPSAGQHVQERFSPNSLVALPGHIPWRKSRSSLICGYCGKSFSHPSDLVRHQRIH
390 400 410 420 430 440
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 TGERPFSCPHCGKSFIRKHHLMKHQRIHTGERPYPCSYCGRSFRYKQTLKDHLRSGHNGG
:::::.:: .: :::..:.::..::.:: ::
XP_016 TGERPYSCTECEKSFVQKQHLLQHQKIHQRERGGLALEPGRPNGLL
450 460 470 480 490
600 610 620 630 640
pF1KA1 CGGDSDPSGQPPNPPGPLITGLETSGLGVNTEGLETNQWYGEGSGGGVL
>>XP_005250112 (OMIM: 602386) PREDICTED: zinc finger pro (535 aa)
initn: 1036 init1: 731 opt: 949 Z-score: 577.1 bits: 116.8 E(85289): 2.1e-25
Smith-Waterman score: 1056; 39.3% identity (58.6% similar) in 555 aa overlap (18-565:56-521)
10 20 30 40
pF1KA1 MAEAAPAPTSEWDSECLTSLQPLPLPTPPAANEAHLQTAAISLWTVV
: : ::. . . ...::. :::::::
XP_005 STGAPRRGLGVEGRLEPWRSRRLLGRKRRSTPLTSSTLPSQATEKSSYFQTTEISLWTVV
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 AAVQAIERKVEIHSRRLLHLEGRTGTAEKKLASCEKTVTELGNQLEGKWAVLGTLLQEYG
::.::.:.:.: .. :: :::::::::::::.::: ..:.:::::::::::::::::::
XP_005 AAIQAVEKKMESQAARLQSLEGRTGTAEKKLADCEKMAVEFGNQLEGKWAVLGTLLQEYG
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 LLQRRLENLENLLRNRNFWILRLPPGIKGDIPKVPVAFDDVSIYFSTPEWEKLEEWQKEL
::::::::.::::::::::::::::: ::. ::: .... .. :. :::.::.:::::
XP_005 LLQRRLENVENLLRNRNFWILRLPPGSKGEAPKVSRSLENDGVCFTEQEWENLEDWQKEL
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 YKNIMKGNYESLISMDYAINQPDVLSQIQPEGEHNTEDQAGPEESEIPTDPSEEPGISTS
:.:.:..:::.:.:. ::.: . :.: .:: . :: : ::
XP_005 YRNVMESNYETLVSLK-------VLGQTEGEAELGTEMLGDLEE--------EGPG----
210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 DILSWIKQEEEPQVGAPPESKESDVYKSTYADEELVIKAEGLARSSLCPEVPVPFSSPPA
:: : . ... .:: :: : ..: ::
XP_005 --------------GAHPAG-------GVMIKQELQYTQEGPA------DLPGEFS---C
250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 AAKDAFSDVAFKSQQSTSMTPFGRPATDLPEASEGQVTFTQLGSYPLPPPVGEQVFSCHH
:.. :: : ..: . :. .. : :.. :. : : ::: .: : .
XP_005 IAEEQ----AFLSPEQTELWG-GQGSSVLLETGPGDST--------LEEPVGSRVPSSSR
280 290 300 310 320
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pF1KA1 ---CGKNLSQDMLLTHQCSHATEHPLPCAQCPKHFTPQADLSSTSQDHASETPPTCPHCA
: :. :. .. : .: . . . : : : : .:
XP_005 TVGCPKQKSHRQVQLDQ------------ECGQGLKLKKDTSR---------PYECSECE
330 340 350 360
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pF1KA1 RTFTHPSRLTYHLRVHNSTERPFPC-PDCPKR-FADQARLTSHRRAHASERPFRCAQCGR
:: . ..:. ::: :.. : :. :.. . . :: . . . . .: : :
XP_005 ITFRYKQQLATHLRSHSGWGS---CTPEEPEESLRPRPRLKPQTK---KAKLHQCDVCLR
370 380 390 400 410
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pF1KA1 SFSLKISLLLHQRGHAQERPFSCPQCGIDFNGHS--ALIRHQMIHTGERPYPCTDCSKSF
::: :.::. ::: : :: : . . :. .: :: : . .. : :.:::
XP_005 SFSCKVSLVTHQRCHLQEGPSAGQHVQERFSPNSLVALPGHIPWRKSRSSLICGYCGKSF
420 430 440 450 460 470
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 MRKEHLLNHRRLHTGERPFSCPHCGKSFIRKHHLMKHQRIHTGERPYPCSYCGRSFRYKQ
. :. :.:.::::::.:: .: :::..:.::..::.:: ::
XP_005 SHPSDLVRHQRIHTGERPYSCTECEKSFVQKQHLLQHQKIHQRERGGLALEPGRPNGLL
480 490 500 510 520 530
590 600 610 620 630 640
pF1KA1 TLKDHLRSGHNGGCGGDSDPSGQPPNPPGPLITGLETSGLGVNTEGLETNQWYGEGSGGG
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Smith-Waterman score: 1065; 39.2% identity (58.0% similar) in 572 aa overlap (1-565:1-480)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAEAAPAPTSEWDSECLTSLQPLPLPTPPAANEAHLQTAAISLWTVVAAVQAIERKVEIH
:::.::: . : : ::. . . ...::. :::::::::.::.:.:.: .
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pF1KA1 SRRLLHLEGRTGTAEKKLASCEKTVTELGNQLEGKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENLENLL
. :: :::::::::::::.::: ..:.:::::::::::::::::::::::::::.::::
XP_016 AARLQSLEGRTGTAEKKLADCEKMAVEFGNQLEGKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENVENLL
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pF1KA1 RNRNFWILRLPPGIKGDIPKVPVAFDDVSIYFSTPEWEKLEEWQKELYKNIMKGNYESLI
::::::::::::: ::. ::: .... .. :. :::.::.::::::.:.:..:::.:.
XP_016 RNRNFWILRLPPGSKGEAPKVSRSLENDGVCFTEQEWENLEDWQKELYRNVMESNYETLV
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pF1KA1 SMDYAINQPDVLSQIQPEGEHNTEDQAGPEESEIPTDPSEEPGISTSDILSWIKQEEEPQ
:. ::.: . :.: .:: . :: : ::
XP_016 SLK-------VLGQTEGEAELGTEMLGDLEE--------EGPG-----------------
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pF1KA1 VGAPPESKESDVYKSTYADEELVIKAEGLARSSLCPEVPVPFSSPPAAAKDAFSDVAFKS
:: : ... .:: :: : ..: :: :.. :: :
XP_016 -GAHP--------GGVMIKQELQYTQEGPA------DLPGEFS---CIAEEQ----AFLS
210 220 230 240
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pF1KA1 QQSTSMTPFGRPATDLPEASEGQVTFTQLGSYPLPPPVGEQVFSCHH---CGKNLSQDML
..: . :. .. : :.. :. : : ::: .: : . : :. :. ..
XP_016 PEQTELWG-GQGSSVLLETGPGDST--------LEEPVGSRVPSSSRTVGCPKQKSHRQV
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pF1KA1 LTHQCSHATEHPLPCAQCPKHFTPQADLSSTSQDHASETPPTCPHCARTFTHPSRLTYHL
: .: . . . : : : : .: :: . ..:. ::
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pF1KA1 RVHNSTERPFPC-PDCPKR-FADQARLTSHRRAHASERPFRCAQCGRSFSLKISLLLHQR
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XP_016 RSHSGWG---SCTPEEPEESLRPRPRLKPQTK---KAKLHQCDVCLRSFSCKVSLVTHQR
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pF1KA1 GHAQERPFSCPQCGIDFNGHS--ALIRHQMIHTGERPYPCTDCSKSFMRKEHLLNHRRLH
: :: : . . :. .: :: : . .. : :.::: . :. :.:.:
XP_016 CHLQEGPSAGQHVQERFSPNSLVALPGHIPWRKSRSSLICGYCGKSFSHPSDLVRHQRIH
390 400 410 420 430 440
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pF1KA1 TGERPFSCPHCGKSFIRKHHLMKHQRIHTGERPYPCSYCGRSFRYKQTLKDHLRSGHNGG
:::::.:: .: :::..:.::..::.:: ::
XP_016 TGERPYSCTECEKSFVQKQHLLQHQKIHQRERGGLALEPGRPNGLL
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pF1KA1 CGGDSDPSGQPPNPPGPLITGLETSGLGVNTEGLETNQWYGEGSGGGVL
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10 20 30 40 50 60
pF1KA1 TSEWDSECLTSLQPLPLPTPPAANEAHLQTAAISLWTVVAAVQAIERKVEIHSRRLLHLE
: :: ::..:..::.:::.: .. ::: ::
XP_005 MAEAVAAPISPWTMAATIQAMERKIESQAARLLSLE
10 20 30
70 80 90 100 110 120
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:::: ::::::.::::..:.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
XP_005 GRTGMAEKKLADCEKTAVEFGNQLEGKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENVENLLRNRNFWIL
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 RLPPGIKGDIPKVPVAFDDVSIYFSTPEWEKLEEWQKELYKNIMKGNYESLISMDYAINQ
::::: ::. :::::.::::..::: :: :::.:::::::..:.::::.:.:.::::..
XP_005 RLPPGSKGESPKVPVTFDDVAVYFSEQEWGKLEDWQKELYKHVMRGNYETLVSLDYAISK
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190 200 210 220 230 240
pF1KA1 PDVLSQIQPEGEHNTEDQAGPEESEIPTDPSEE--PGISTSDILSWIKQEEEPQV-----
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XP_005 PEVLSQIEQGKEPCNWRRPGPKIPDVPVDPSPGSGPPVPAPDLLMQIKQEGELQLQEQQA
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280
pF1KA1 --------GAPPESKES-DVYKSTYADEELVIKAEGLARSSLCPEVPVPFS----SPPAA
: : ..: . . . .. : . ..:.. .: : : ::
XP_005 LGVEAWAAGQPDIGEEPWGLSQLDSGAGDISTDATSGVHSNFSTTIP-PTSWQTDLPPHH
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 AKDAFSDVAFKSQQSTSMTPFGRPATDLPEASEGQVTFTQLGSYPLPPPVGEQVFSCHHC
..: :: ..: . ..: . :. . . .: .. . :. : : .
XP_005 PSSACSDGTLKLNTAAS-------TEDVKIVIKTEVQEEEVVATPVHPTDLEAHGTLFGP
280 290 300 310 320
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pF1KA1 GKNL------SQDMLLTHQ-CSHATEHPLPCAQCPKHFTPQADLSSTSQDHASE-TPP--
:. .:. : : .. :. . : . :. :.. : :.: :::
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330 340 350 360 370 380
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pF1KA1 ------------TC--PHCARTFTHPSRLTYH-------LRVHNSTERPF--PC--PDCP
: : : : : : . ... ::: :: :
XP_005 WLFGGVRWGWNFRCKPPVGLNPRTGPEGLPYSSPDNGEAILDPSQAPRPFNEPCKYPGRT
390 400 410 420 430 440
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pF1KA1 KRFADQARLTSHRRAHASERPFRCAQCGRSFSLKISLLLHQRGHAQERPFSCPQCGIDFN
: :. . : .: : . ::: :: ::.::.:..:: :::. . : : : .
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: .. . ... : .:.. : : ::. :: :::::::: : .: : : ..
XP_005 GSGGGGGGSGGGSARDGSALRCGECGRCFTRPAHLIRHRMLHTGERPFPCTECEKRFTER
510 520 530 540 550 560
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.:. : : ::: ::. :. ::.:: :. :. : : : . :. . ::: :.::.:
XP_005 SKLIDHYRTHTGVRPFTCTVCGKSFIRKDHLRKHQR---NHAAGAKTPARGQPLPTPPAP
570 580 590 600 610 620
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pF1KA1 LITGLETSGLGVNTEGLETNQWYGEGSGGGVL
XP_005 PDPFKSPASKGPLASTDLVTDWTCGLSVLGPTDGGDM
630 640 650
>>XP_005250012 (OMIM: 613914) PREDICTED: zinc finger pro (660 aa)
initn: 1674 init1: 873 opt: 908 Z-score: 552.2 bits: 112.5 E(85289): 5.1e-24
Smith-Waterman score: 1304; 40.2% identity (59.6% similar) in 627 aa overlap (39-610:7-623)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 TSEWDSECLTSLQPLPLPTPPAANEAHLQTAAISLWTVVAAVQAIERKVEIHSRRLLHLE
: :: ::..:..::.:::.: .. ::: ::
XP_005 MAEAVAAPISPWTMAATIQAMERKIESQAARLLSLE
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:::: ::::::.::::..:.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
XP_005 GRTGMAEKKLADCEKTAVEFGNQLEGKWAVLGTLLQEYGLLQRRLENVENLLRNRNFWIL
40 50 60 70 80 90
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pF1KA1 RLPPGIKGDIPKVPVAFDDVSIYFSTPEWEKLEEWQKELYKNIMKGNYESLISMDYAINQ
::::: ::. :::::.::::..::: :: :::.:::::::..:.::::.:.:.::::..
XP_005 RLPPGSKGESPKVPVTFDDVAVYFSEQEWGKLEDWQKELYKHVMRGNYETLVSLDYAISK
100 110 120 130 140 150
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pF1KA1 PDVLSQIQPEGEHNTEDQAGPEESEIPTDPSEE--PGISTSDILSWIKQEEEPQV-----
:.:::::. : . . ::. ..:.::: : . . :.: :::: : :.
XP_005 PEVLSQIEQGKEPCNWRRPGPKIPDVPVDPSPGSGPPVPAPDLLMQIKQEGELQLQEQQA
160 170 180 190 200 210
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pF1KA1 --------GAPPESKES-DVYKSTYADEELVIKAEGLARSSLCPEVPVPFS----SPPAA
: : ..: . . . .. : . ..:.. .: : : ::
XP_005 LGVEAWAAGQPDIGEEPWGLSQLDSGAGDISTDATSGVHSNFSTTIP-PTSWQTDLPPHH
220 230 240 250 260 270
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..: :: ..: . ..: : . :..: .:. : . .: . .:. .
XP_005 PSSACSDGTLKLNTAAS-TEADVKIVIKTEVQEEEVVATPV--HPTDLEAHGTLFGPGQA
280 290 300 310 320 330
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pF1KA1 GKNL---SQDMLLTHQ-CSHATEHPLPCAQCPKHFTPQADLSSTSQDHASE-TPP-----
. . .:. : : .. :. . : . :. :.. : :.: :::
XP_005 TRFFPSPAQEGAWESQGSSFPSQDPVLGLREPAR--PERDMGELSPAVAQEETPPGDWLF
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pF1KA1 ---------TC--PHCARTFTHPSRLTYH-------LRVHNSTERPF--PC--PDCPKRF
: : : : : : . ... ::: :: : : :
XP_005 GGVRWGWNFRCKPPVGLNPRTGPEGLPYSSPDNGEAILDPSQAPRPFNEPCKYPGRTKGF
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pF1KA1 ADQARLTSHRRAHASERPFRCAQCGRSFSLKISLLLHQRGHAQERPFSCPQCGIDFNGHS
. . : .: : . ::: :: ::.::.:..:: :::. . : : : .: .
XP_005 GHKPGLKKHPAAPPGGRPFTCATCGKSFQLQVSLSAHQRSCGAPDG-SGPGTGGGGSGSG
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pF1KA1 ALIRHQMIHTGE--RPYPCTDCSKSFMRKEHLLNHRRLHTGERPFSCPHCGKSFIRKHHL
. . ... : .:.. : : ::. :: :::::::: : .: : : .. .:
XP_005 GGGGGSGGGSARDGSALRCGECGRCFTRPAHLIRHRMLHTGERPFPCTECEKRFTERSKL
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pF1KA1 MKHQRIHTGERPYPCSYCGRSFRYKQTLKDHLRSGHNGGCGGDSDPSGQP-PNPPGPLIT
. : : ::: ::. :. ::.:: :. :. : : : . :. . ::: :.::.:
XP_005 IDHYRTHTGVRPFTCTVCGKSFIRKDHLRKHQR---NHAAGAKTPARGQPLPTPPAPPDP
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pF1KA1 GLETSGLGVNTEGLETNQWYGEGSGGGVL
XP_005 FKSPASKGPLASTDLVTDWTCGLSVLGPTDGGDM
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>>NP_942152 (OMIM: 601856) zinc finger protein 211 isofo (564 aa)
initn: 2993 init1: 689 opt: 890 Z-score: 542.3 bits: 110.4 E(85289): 1.8e-23
Smith-Waterman score: 919; 33.2% identity (61.0% similar) in 479 aa overlap (143-592:33-505)
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pF1KA1 LENLENLLRNRNFWILRLPPGIKGDIPKVPVAFDDVSIYFSTPEWEKLEEWQKELYKNIM
:.:.::..::: ::. :.: ::.:: ..:
NP_942 GFPPGRPQLPVQLRPQTRMATALRDPASGSVTFEDVAVYFSWEEWDLLDEAQKHLYFDVM
10 20 30 40 50 60
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pF1KA1 KGNYESLISMDY--AINQPDVLSQIQPEGEHNTEDQAGPE-ESEIPTDPSEEPGISTSDI
:. :. .... .. :. . ::. . ... : : .: : . ::
NP_942 LENFALTSSLGCWCGVEHEETPSEQRISGERVPQFRTSKEGSSSQNADSCEICCLVLRDI
70 80 90 100 110 120
230 240 250 260 270
pF1KA1 LSWIKQEEEPQVGAPPESKESDVYKS-----------TYADEELVIKAEGLARSSLCPEV
: . ... . : .. .. : : : : . . . ....: .
NP_942 LH-LAEHQGTNCGQKLHTCGKQFYISANLQQHQRQHITEAPFRSYVDTASFTQSCIVHVS
130 140 150 160 170 180
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pF1KA1 PVPFSSPPAAAKDAFSDVAFKSQQSTSMTPFGRPATDLPEA----------SEGQVT--F
::. :: .... : :..:. .: .. : . :. . :
NP_942 EKPFTCREIR-KDFLANMRFLHQDATQTGE--KPNNSNKCAVAFYSGKSHHNWGKCSKAF
190 200 210 220 230
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pF1KA1 TQLGSYPLPPPV--GEQVFSCHHCGKNLSQDM-LLTHQCSHATEHPLPCAQCPKHFTPQA
... . . : .: : .::: .. :. :: :. :.: : .: : :: .
NP_942 SHIDTLVQDQRILTREGLFECSKCGKACTRRCNLIQHQKVHSEERPYECNECGKFFTYYS
240 250 260 270 280 290
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pF1KA1 DLSSTSQDHASETPPTCPHCARTFTHPSRLTYHLRVHNSTERPFPCPDCPKRFADQARLT
.. .. :..: : .::.:...:.. :. : .:: . :::. : .: : :.... :
NP_942 SFIIHQRVHTGERPYACPECGKSFSQIYSLNSHRKVH-TGERPYECGECGKSFSQRSNLM
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pF1KA1 SHRRAHASERPFRCAQCGRSFSLKISLLLHQRGHAQERPFSCPQCGIDFNGHSALIRHQM
.:::.:..:::..:..::.::: ..::. ::: :. ::: : .:: .:. :.::.:.
NP_942 QHRRVHTGERPYECSECGKSFSQNFSLIYHQRVHTGERPHECNECGKSFSRSSSLIHHRR
360 370 380 390 400 410
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pF1KA1 IHTGERPYPCTDCSKSFMRKEHLLNHRRLHTGERPFSCPHCGKSFIRKHHLMKHQRIHTG
.::::::: :. :.::: .. . .::..::::::. : .::::: .. .: .:::.:::
NP_942 LHTGERPYECSKCGKSFKQSSSFSSHRKVHTGERPYVCGECGKSFSHSSNLKNHQRVHTG
420 430 440 450 460 470
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pF1KA1 ERPYPCSYCGRSFRYKQTLKDHLRSGHNGGCGGDSDPSGQPPNPPGPLITGLETSGLGVN
::: :: :..:: :..: ::: :.:
NP_942 ERPVECSECSKSFSCKSNLIKHLRV-HTGERPYECSECGKSFSQSSSLIQHRRVHTGKRP
480 490 500 510 520 530
>>NP_006376 (OMIM: 601856) zinc finger protein 211 isofo (577 aa)
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10 20
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]