FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1364, 948 aa 1>>>pF1KA1364 948 - 948 aa - 948 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7457+/-0.0012; mu= 14.7119+/- 0.072 mean_var=112.1411+/-22.877, 0's: 0 Z-trim(104.4): 96 B-trim: 2 in 1/48 Lambda= 0.121113 statistics sampled from 7789 (7883) to 7789 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16 Scan time: 4.500 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS46660.1 MICAL3 gene_id:57553|Hs108|chr22 ( 966) 6170 1090.1 0 CCDS46659.1 MICAL3 gene_id:57553|Hs108|chr22 (2002) 6168 1089.9 0 CCDS46661.1 MICAL3 gene_id:57553|Hs108|chr22 (1073) 4917 871.2 0 CCDS60726.1 MICAL2 gene_id:9645|Hs108|chr11 (1103) 3330 593.9 5.6e-169 CCDS7809.1 MICAL2 gene_id:9645|Hs108|chr11 (1124) 3330 593.9 5.7e-169 CCDS60727.1 MICAL2 gene_id:9645|Hs108|chr11 ( 934) 3325 593.0 9e-169 CCDS60728.1 MICAL2 gene_id:9645|Hs108|chr11 ( 976) 3325 593.0 9.4e-169 CCDS5076.1 MICAL1 gene_id:64780|Hs108|chr6 (1067) 2255 406.1 1.9e-112 CCDS69170.1 MICAL1 gene_id:64780|Hs108|chr6 (1086) 2255 406.1 1.9e-112 CCDS55047.1 MICAL1 gene_id:64780|Hs108|chr6 ( 981) 1291 237.6 9.1e-62 CCDS13961.1 MICALL1 gene_id:85377|Hs108|chr22 ( 863) 402 82.2 4.7e-15 CCDS5324.1 MICALL2 gene_id:79778|Hs108|chr7 ( 904) 364 75.6 4.9e-13 CCDS32100.1 SPTB gene_id:6710|Hs108|chr14 (2137) 343 72.2 1.3e-11 CCDS32099.1 SPTB gene_id:6710|Hs108|chr14 (2328) 343 72.2 1.3e-11 CCDS44649.1 EHBP1L1 gene_id:254102|Hs108|chr11 (1523) 332 70.1 3.6e-11 CCDS8150.1 SPTBN2 gene_id:6712|Hs108|chr11 (2390) 333 70.4 4.6e-11 CCDS46300.1 EHBP1 gene_id:23301|Hs108|chr2 (1160) 324 68.7 7.6e-11 CCDS33199.1 SPTBN1 gene_id:6711|Hs108|chr2 (2155) 328 69.5 7.8e-11 CCDS46299.1 EHBP1 gene_id:23301|Hs108|chr2 (1196) 324 68.7 7.8e-11 CCDS1872.1 EHBP1 gene_id:23301|Hs108|chr2 (1231) 324 68.7 8e-11 CCDS33198.1 SPTBN1 gene_id:6711|Hs108|chr2 (2364) 328 69.6 8.4e-11 >>CCDS46660.1 MICAL3 gene_id:57553|Hs108|chr22 (966 aa) initn: 6170 init1: 6170 opt: 6170 Z-score: 5829.8 bits: 1090.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6170; 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CCDS60 KAKALWYKLDKRGSHKEYKRGKSCTNTKCLIVGGGPCGLRTAIELAYLGAKVVVVEKRDS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KA1 FSRNNVLHLWPFTIHDLRGLGAKKFYGKFCAGAIDHISIRQLQLILLKVALILGIEIHVN ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::::.::.::::: CCDS60 FSRNNVLHLWPFTIHDLRGLGAKKFYGKFCAGSIDHISIRQLQLILFKVALMLGVEIHVN 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KA1 VEFQGLIQPPEDQENERIGWRALVHPKTHPVSEYEFEVIIGGDGRRNTLEGFRRKEFRGK ::: ...:::::::..::::: : : .::.::.::::.:::::::::::::::::: CCDS60 VEFVKVLEPPEDQENQKIGWRAEFLPTDHSLSEFEFDVIIGADGRRNTLEGFRRKEFRGK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KA1 LAIAITANFINRNTTAEAKVEEISGVAFIFNQKFFQELREATGIDLENIVYYKDDTHYFV :::::::::::::.::::::::::::::::::::::.:.: ::::::::::::: ::::: CCDS60 LAIAITANFINRNSTAEAKVEEISGVAFIFNQKFFQDLKEETGIDLENIVYYKDCTHYFV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KA1 MTAKKQSLLDKGVILHDYADTELLLSRENVDQEALLSYAREAADFSTQQQLPSLDFAINH ::::::::::::::..:: :::.:: :::.:. :::::::::::.:. ::::::::.:: CCDS60 MTAKKQSLLDKGVIINDYIDTEMLLCAENVNQDNLLSYAREAADFATNYQLPSLDFAMNH 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KA1 YGQPDVAMFDFTCMYASENAALVREQNGHQLLVALVGDSLLEPFWPMGTGIARGFLAAMD :::::::::::::::::::::::::...:::::::::::::::::::::: :::::::.: CCDS60 YGQPDVAMFDFTCMYASENAALVRERQAHQLLVALVGDSLLEPFWPMGTGCARGFLAAFD 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KA1 SAWMVRSWSLGTSPLEVLAERESIYRLLPQTTPENVSKNFSQYSIDPVTRYPNINVNFLR .::::.::. :: :::.::::::.:::::::::::..::: ::..:: :::::.: . .: CCDS60 TAWMVKSWNQGTPPLELLAERESLYRLLPQTTPENINKNFEQYTLDPGTRYPNLNSHCVR 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KA1 PSQVRHLYDTGETKDIHLEMESLVNSRTTPKLTRNESVARSSKLLGWCQRQTDGYAGVNV : ::.::: : : . : .: : . : . .:.:.:: : :::: :::.::.:: ::: CCDS60 PHQVKHLYITKELE--HYPLERLGSVRRSVNLSRKESDIRPSKLLTWCQQQTEGYQHVNV 490 500 510 520 530 550 560 570 580 590 600 pF1KA1 TDLTMSWKSGLALCAIIHRYRPDLIDFDSLDEQNVEKNNQLAFDIAEKELGISPIMTGKE :::: ::.:::::::::::.::.::.::::.:... .:::::::.::.:.:: :. :::: CCDS60 TDLTTSWRSGLALCAIIHRFRPELINFDSLNEDDAVENNQLAFDVAEREFGIPPVTTGKE 540 550 560 570 580 590 610 620 630 640 650 pF1KA1 MASVGEPDKLSMVMYLTQFYEMFKDS-LPSSDTLDLNAEEKAVLIASTRSPISFLSKLGQ :::. :::::::::::..:::.:. . : :. : :.: : . ..: :: . :. CCDS60 MASAQEPDKLSMVMYLSKFYELFRGTPLRPVDSWRKNYGENADL-SLAKSSISN-NYLNL 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KA1 TISRKRSPK-DKKEKDLDGAGKRRKTSQSEEEEAPRGHRGERPTLVSTLTDRRMDVAVGN :. :::.:. : . . : .::: . .: . . :. ... . . :: CCDS60 TFPRKRTPRVDGQTGENDMNKRRRKGFTNLDEPSNFSSRS-----LGSNQECGSSKEGGN 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KA1 QNKVKYMATQLLAKFEENA--PAQSIGIRRQGSMKKEFPQNLGGSDTCYFCQKRVYVMER ::::: ::.::::::::.. :. :: ... : . .: . : : CCDS60 QNKVKSMANQLLAKFEESTRNPSLMKQERRVSGIGKPVLCSSSGPPVHSCCPKPEEATPS 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KA1 LSAEGKFFHRSCFKCEYCATTLRLSAYAYDIEDGKFYCKPHYCYRLSGYAQRKRPAVAPL CCDS60 PSPPLKRQFPSVVVTGHVLRELKQVSAGSECLSRPWRARAKSDLQLGGTENFATLPSTRP 780 790 800 810 820 830 >-- initn: 460 init1: 440 opt: 449 Z-score: 426.5 bits: 90.5 E(32554): 1.9e-17 Smith-Waterman score: 449; 39.1% identity (62.9% similar) in 197 aa overlap (677-870:893-1088) 650 660 670 680 690 700 pF1KA1 TRSPISFLSKLGQTISRKRSPKDKKEKDLDGAGKRRKTSQSEEEEAPRGHRGERPTLVST : .. . : . .: . :. :.. CCDS60 FHTKNIKEKAAHLASMFGHGDFPQNKLLSKGLSHTHPPSPPSRLPSPDPAASSSPSTVDS 870 880 890 900 910 920 710 720 730 740 750 760 pF1KA1 LTDRRMDVAVGNQNKVKYMATQLLAKFEENA--PAQSIGIRRQGSMKKEFPQNLGGSDTC . : ..::. .. :...:... : : . ::.: :: :::::::: CCDS60 ASPAR-KLTVGKVSSGIGAAAEVLVNLYMNDHRPKAQATSPDLESMRKSFPLNLGGSDTC 930 940 950 960 970 980 770 780 790 800 810 820 pF1KA1 YFCQKRVYVMERLSAEGKFFHRSCFKCEYCATTLRLSAYAYDIEDGKFYCKPHYCYRLSG :::.:::::::::::::.:::: ::.: :::::::.::..: ..::::::::. . .. CCDS60 YFCKKRVYVMERLSAEGHFFHRECFRCSICATTLRLAAYTFDCDEGKFYCKPHFIHCKTN 990 1000 1010 1020 1030 1040 830 840 850 860 870 880 pF1KA1 YAQRKRPA-VAPLSGKEAKGPLQDGATTDANGRANAVASSTERTPGSGVNGLEEPSIAKR :::: : . .:: :.. :. ... .... :: CCDS60 SKQRKRRAELKQQREEEATWQEQEAPRRDTPTESSCAVAAIGTLEGSPPVHFSLPVLHPL 1050 1060 1070 1080 1090 1100 890 900 910 920 930 940 pF1KA1 LRGTPERIELENYRLSLRQAEALQEVPEETQAEHNLSSVLDTGAEEDVASRSARRAAGRP CCDS60 LG >>CCDS7809.1 MICAL2 gene_id:9645|Hs108|chr11 (1124 aa) initn: 3702 init1: 2632 opt: 3330 Z-score: 3147.0 bits: 593.9 E(32554): 5.7e-169 Smith-Waterman score: 3330; 66.9% identity (82.8% similar) in 773 aa overlap (1-769:1-764) 10 20 30 40 50 60 pF1KA1 MEERKHETMNPAHVLFDRFVQATTCKGTLKAFQELCDHLELKPKDYRSFYHKLKSKLNYW : : . : . : .:. ::::.::::::.::. : ::.: : :.:.:: :::::.. : CCDS78 MGENEDEKQAQAGQVFENFVQASTCKGTLQAFNILTRHLDLDPLDHRNFYSKLKSKVTTW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA1 KAKALWAKLDKRGSHKDYKKGKACTNTKCLIIGAGPCGLRTAIDLSLLGAKVVVIEKRDA :::::: :::::::::.::.::.::::::::.:.:::::::::.:. :::::::.::::. 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CCDS60 HCKTNSKQRKRRAELKQQREEEATWQEQEAPRRDTPTESSCAVAAIGTLEGSP-PGIST- 840 850 860 870 880 880 890 900 910 920 930 pF1KA1 SIAKRLRGTPERI--ELENYRLSLRQAEALQEVPEETQAEHNLSSVLDTGAEEDVASRSA :. ... : : :. .: :. .: :: .:. CCDS60 SFFRKVLGWPLRLPRDLCNWMQGLLQAAGLHIRDNAYNYCYMYELLSLGLPLLWAFSEVL 890 900 910 920 930 940 940 pF1KA1 RRAAGRPPATRP CCDS60 AAMYRESEGSLESICNWVLRCFPVKLR 950 960 970 >>CCDS5076.1 MICAL1 gene_id:64780|Hs108|chr6 (1067 aa) initn: 2393 init1: 1106 opt: 2255 Z-score: 2132.2 bits: 406.1 E(32554): 1.9e-112 Smith-Waterman score: 2447; 45.6% identity (69.5% similar) in 896 aa overlap (8-899:6-822) 10 20 30 40 50 60 pF1KA1 MEERKHETMNPAHVLFDRFVQATTCKGTLKAFQELCDHLELKPKDYRSFYHKLKSKLNYW . ::::. :. :.:: :. .:..::::: : :.: :::.:..:::: CCDS50 MASPTSTNPAHAHFESFLQAQLCQDVLSSFQELCGALGLEPGGGLPQYHKIKDQLNYW 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KA1 KAKALWAKLDKRGSHKDYKKGKACTNTKCLIIGAGPCGLRTAIDLSLLGAKVVVIEKRDA .::.::.:::::... :..:.:::.::::..::::::::.:..:.::::.::..::: CCDS50 SAKSLWTKLDKRAGQPVYQQGRACTSTKCLVVGAGPCGLRVAVELALLGARVVLVEKRTK 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KA1 FSRNNVLHLWPFTIHDLRGLGAKKFYGKFCAGAIDHISIRQLQLILLKVALILGIEIHVN :::.::::::::::::::.::::::::.::.:..::::::::::.::::::.::.::: . CCDS50 FSRHNVLHLWPFTIHDLRALGAKKFYGRFCTGTLDHISIRQLQLLLLKVALLLGVEIHWG 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KA1 VEFQGLIQPPEDQENERIGWRALVHPKTHP-VSEYEFEVIIGGDGRRNTLEGFRRKEFRG : : :: ::: . . :::: ..:. ...:::.:.:.. : . . :::. .:.:: CCDS50 VTFTGL-QPPPRKGS---GWRAQLQPNPPAQLANYEFDVLISAAGGKFVPEGFKVREMRG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 KLAIAITANFINRNTTAEAKVEEISGVAFIFNQKFFQELREATGIDLENIVYYKDDTHYF ::::.:::::.: :. :..: :::::: :.::.::: : .::::::::::::::::::: CCDS50 KLAIGITANFVNGRTVEETQVPEISGVARIYNQSFFQSLLKATGIDLENIVYYKDDTHYF 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 VMTAKKQSLLDKGVILHDYADTELLLSRENVDQEALLSYAREAADFSTQQQLPSLDFAIN ::::::: :: ::. .:. ::. ::. :: ::: ..: ::::.:. .: .:.:: . CCDS50 VMTAKKQCLLRLGVLRQDWPDTNRLLGSANVVPEALQRFTRAAADFATHGKLGKLEFAQD 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KA1 HYGQPDVAMFDFTCMYASENAALVREQNGHQLLVALVGDSLLEPFWPMGTGIARGFLAAM .:::::. :::: :. .:..: :.:..: .::..:::: :.:::::.:::.:::::::. CCDS50 AHGQPDVSAFDFTSMMRAESSARVQEKHGARLLLGLVGDCLVEPFWPLGTGVARGFLAAF 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KA1 DSAWMVRSWSLGTSPLEVLAERESIYRLLPQTTPENVSKNFSQYSIDPVTRYPNINVNFL :.::::. :. :. :::::::::.:.:: ::.:::. .: .::..::.:::::.:. . CCDS50 DAAWMVKRWAEGAESLEVLAERESLYQLLSQTSPENMHRNVAQYGLDPATRYPNLNLRAV 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KA1 RPSQVRHLYDTGETKDIHLEMESLVNSRTTPKLTRNESVARSSKLLGWCQRQTDGYAGVN :.::: :::. . .. . :..: . . :.. . .:: :::.:: :: ::. CCDS50 TPNQVRDLYDVLAKEPVQRN-----NDKTDTGMPATGSAGTQEELLRWCQEQTAGYPGVH 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KA1 VTDLTMSWKSGLALCAIIHRYRPDLIDFDSLDEQNVEKNNQLAFDIAEKELGISPIMTGK :.::. :: .::::::...: .: :.. . :. .. . . :. .::.::::.:..... CCDS50 VSDLSSSWADGLALCALVYRLQPGLLEPSELQGLGALEATAWALKVAENELGITPVVSAQ 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KA1 EMASVGEPDKLSMVMYLTQFYEMFKDSLPSSDTLDLNAEEKAVLIASTRSPISFLSKLGQ : :. : :... ::..:. ::. : .. . .: : . ::::: . CCDS50 --AVVAGSDPLGLIAYLSHFHSAFKSMAHSPGPVSQASP-------GTSSAVLFLSKLQR 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KA1 TISRKRSPKDKKEKDLDGAGKRRKTSQSEEEEAPRGHRGERPTLVSTLTDRRMDVAVGNQ :..:.:. ::. :..::. . . : :.: . : :: CCDS50 TLQRSRA----KENAEDAGGKKLRLEM--EAETPSTEVPPDPEPGVPLTP---------- 650 660 670 680 720 730 740 750 760 770 pF1KA1 NKVKYMATQLLAKFEENAPAQSIGIRRQGSMKKEFPQNLGGSDTCYFCQKRVYVMERLSA :.: :. :..: : .: ...::.::: . CCDS50 ------------------PSQH--------------QEAGAGDLCALCGEHLYVLERLCV 690 700 710 780 790 800 810 820 830 pF1KA1 EGKFFHRSCFKCEYCATTLRLSAYAYDIEDGKFYCKPHYCYRLSGYAQRKRPAVAPLSGK .:.:::::::.:. : .:: ..: ::.::: : : . : . : CCDS50 NGHFFHRSCFRCHTCEATLWPGGYEQHPGDGHFYCLQHL-------PQTDHKAEGSDRGP 720 730 740 750 760 840 850 860 870 880 890 pF1KA1 EAKGPLQDGATTDANGRANAVASSTERTPGSGVNGLEEPSIAKR--LR-GTPERIELENY :. : . : . :. .... : :.: . .:: : .: ..::: .: . CCDS50 ES--P--ELPTPSENSMPPGLSTPTASQEGAG--PVPDPSQPTRRQIRLSSPERQRLSSL 770 780 790 800 810 900 910 920 930 940 pF1KA1 RLSLRQAEALQEVPEETQAEHNLSSVLDTGAEEDVASRSARRAAGRPPATRP :. CCDS50 NLTPDPEMEPPPKPPRSCSALARHALESSFVGWGLPVQSPQALVAMEKEEKESPFSSEEE 820 830 840 850 860 870 >>CCDS69170.1 MICAL1 gene_id:64780|Hs108|chr6 (1086 aa) initn: 2393 init1: 1106 opt: 2255 Z-score: 2132.1 bits: 406.1 E(32554): 1.9e-112 Smith-Waterman score: 2447; 45.6% identity (69.5% similar) in 896 aa overlap (8-899:25-841) 10 20 30 40 pF1KA1 MEERKHETMNPAHVLFDRFVQATTCKGTLKAFQELCDHLELKP . ::::. :. :.:: :. .:..::::: : :.: CCDS69 MSCLSHSSLPSCCPPQEASMASPTSTNPAHAHFESFLQAQLCQDVLSSFQELCGALGLEP 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KA1 KDYRSFYHKLKSKLNYWKAKALWAKLDKRGSHKDYKKGKACTNTKCLIIGAGPCGLRTAI :::.:..::::.::.::.:::::... :..:.:::.::::..::::::::.:. CCDS69 GGGLPQYHKIKDQLNYWSAKSLWTKLDKRAGQPVYQQGRACTSTKCLVVGAGPCGLRVAV 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KA1 DLSLLGAKVVVIEKRDAFSRNNVLHLWPFTIHDLRGLGAKKFYGKFCAGAIDHISIRQLQ .:.::::.::..::: :::.::::::::::::::.::::::::.::.:..::::::::: CCDS69 ELALLGARVVLVEKRTKFSRHNVLHLWPFTIHDLRALGAKKFYGRFCTGTLDHISIRQLQ 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KA1 LILLKVALILGIEIHVNVEFQGLIQPPEDQENERIGWRALVHPKTHP-VSEYEFEVIIGG :.::::::.::.::: .: : :: ::: . . :::: ..:. ...:::.:.:.. CCDS69 LLLLKVALLLGVEIHWGVTFTGL-QPPPRKGS---GWRAQLQPNPPAQLANYEFDVLISA 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KA1 DGRRNTLEGFRRKEFRGKLAIAITANFINRNTTAEAKVEEISGVAFIFNQKFFQELREAT : . . :::. .:.::::::.:::::.: :. :..: :::::: :.::.::: : .:: CCDS69 AGGKFVPEGFKVREMRGKLAIGITANFVNGRTVEETQVPEISGVARIYNQSFFQSLLKAT 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KA1 GIDLENIVYYKDDTHYFVMTAKKQSLLDKGVILHDYADTELLLSRENVDQEALLSYAREA :::::::::::::::::::::::: :: ::. .:. ::. ::. :: ::: ..: : CCDS69 GIDLENIVYYKDDTHYFVMTAKKQCLLRLGVLRQDWPDTNRLLGSANVVPEALQRFTRAA 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KA1 ADFSTQQQLPSLDFAINHYGQPDVAMFDFTCMYASENAALVREQNGHQLLVALVGDSLLE :::.:. .: .:.:: . .:::::. :::: :. .:..: :.:..: .::..:::: :.: CCDS69 ADFATHGKLGKLEFAQDAHGQPDVSAFDFTSMMRAESSARVQEKHGARLLLGLVGDCLVE 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KA1 PFWPMGTGIARGFLAAMDSAWMVRSWSLGTSPLEVLAERESIYRLLPQTTPENVSKNFSQ ::::.:::.:::::::.:.::::. :. :. :::::::::.:.:: ::.:::. .: .: CCDS69 PFWPLGTGVARGFLAAFDAAWMVKRWAEGAESLEVLAERESLYQLLSQTSPENMHRNVAQ 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KA1 YSIDPVTRYPNINVNFLRPSQVRHLYDTGETKDIHLEMESLVNSRTTPKLTRNESVARSS :..::.:::::.:. . :.::: :::. . .. . :..: . . :.. . CCDS69 YGLDPATRYPNLNLRAVTPNQVRDLYDVLAKEPVQRN-----NDKTDTGMPATGSAGTQE 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KA1 KLLGWCQRQTDGYAGVNVTDLTMSWKSGLALCAIIHRYRPDLIDFDSLDEQNVEKNNQLA .:: :::.:: :: ::.:.::. :: .::::::...: .: :.. . :. .. . . : CCDS69 ELLRWCQEQTAGYPGVHVSDLSSSWADGLALCALVYRLQPGLLEPSELQGLGALEATAWA 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KA1 FDIAEKELGISPIMTGKEMASVGEPDKLSMVMYLTQFYEMFKDSLPSSDTLDLNAEEKAV . .::.::::.:..... : :. : :... ::..:. ::. : .. . CCDS69 LKVAENELGITPVVSAQ--AVVAGSDPLGLIAYLSHFHSAFKSMAHSPGPVSQASP---- 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KA1 LIASTRSPISFLSKLGQTISRKRSPKDKKEKDLDGAGKRRKTSQSEEEEAPRGHRGERPT .: : . ::::: .:..:.:. ::. :..::. . . : :.: . : CCDS69 ---GTSSAVLFLSKLQRTLQRSRA----KENAEDAGGKKLRLEM--EAETPSTEVPPDPE 650 660 670 680 690 710 720 730 740 750 760 pF1KA1 LVSTLTDRRMDVAVGNQNKVKYMATQLLAKFEENAPAQSIGIRRQGSMKKEFPQNLGGSD :: :.: :. :..: CCDS69 PGVPLTP----------------------------PSQH--------------QEAGAGD 700 710 770 780 790 800 810 820 pF1KA1 TCYFCQKRVYVMERLSAEGKFFHRSCFKCEYCATTLRLSAYAYDIEDGKFYCKPHYCYRL : .: ...::.::: ..:.:::::::.:. : .:: ..: ::.::: : CCDS69 LCALCGEHLYVLERLCVNGHFFHRSCFRCHTCEATLWPGGYEQHPGDGHFYCLQHL---- 720 730 740 750 760 770 830 840 850 860 870 880 pF1KA1 SGYAQRKRPAVAPLSGKEAKGPLQDGATTDANGRANAVASSTERTPGSGVNGLEEPSIAK : . : . : :. : . : . :. .... : :.: . .:: CCDS69 ---PQTDHKAEGSDRGPES--P--ELPTPSENSMPPGLSTPTASQEGAG--PVPDPSQPT 780 790 800 810 820 890 900 910 920 930 pF1KA1 R--LR-GTPERIELENYRLSLRQAEALQEVPEETQAEHNLSSVLDTGAEEDVASRSARRA : .: ..::: .: . :. CCDS69 RRQIRLSSPERQRLSSLNLTPDPEMEPPPKPPRSCSALARHALESSFVGWGLPVQSPQAL 830 840 850 860 870 880 >>CCDS55047.1 MICAL1 gene_id:64780|Hs108|chr6 (981 aa) initn: 1712 init1: 858 opt: 1291 Z-score: 1222.4 bits: 237.6 E(32554): 9.1e-62 Smith-Waterman score: 2005; 41.0% identity (62.1% similar) in 896 aa overlap (8-899:6-736) 10 20 30 40 50 60 pF1KA1 MEERKHETMNPAHVLFDRFVQATTCKGTLKAFQELCDHLELKPKDYRSFYHKLKSKLNYW . ::::. :. :.:: :. .:..::::: : :.: :::.:..:::: CCDS55 MASPTSTNPAHAHFESFLQAQLCQDVLSSFQELCGALGLEPGGGLPQYHKIKDQLNYW 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KA1 KAKALWAKLDKRGSHKDYKKGKACTNTKCLIIGAGPCGLRTAIDLSLLGAKVVVIEKRDA .::.::.:::::... :..:.:::.::::..::::::::.:..:.::::.::..::: CCDS55 SAKSLWTKLDKRAGQPVYQQGRACTSTKCLVVGAGPCGLRVAVELALLGARVVLVEKRTK 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KA1 FSRNNVLHLWPFTIHDLRGLGAKKFYGKFCAGAIDHISIRQLQLILLKVALILGIEIHVN :::.::::::::::::::.::::::::.::.:..::::::::::.::::::.::.::: . CCDS55 FSRHNVLHLWPFTIHDLRALGAKKFYGRFCTGTLDHISIRQLQLLLLKVALLLGVEIHWG 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KA1 VEFQGLIQPPEDQENERIGWRALVHPKTHP-VSEYEFEVIIGGDGRRNTLEGFRRKEFRG : : :: ::: . . :::: ..:. ...:::.:.:.. : . . :::. .:.:: CCDS55 VTFTGL-QPPPRKGS---GWRAQLQPNPPAQLANYEFDVLISAAGGKFVPEGFKVREMRG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 KLAIAITANFINRNTTAEAKVEEISGVAFIFNQKFFQELREATGIDLENIVYYKDDTHYF ::::.:::::.: :. :..: :::::: :.::.::: : .::::::::::::::::::: CCDS55 KLAIGITANFVNGRTVEETQVPEISGVARIYNQSFFQSLLKATGIDLENIVYYKDDTHYF 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 VMTAKKQSLLDKGVILHDYADTELLLSRENVDQEALLSYAREAADFSTQQQLPSLDFAIN ::::::: :: :: CCDS55 VMTAKKQCLLRLGV---------------------------------------------- 300 360 370 380 390 400 410 pF1KA1 HYGQPDVAMFDFTCMYASENAALVREQNGHQLLVALVGDSLLEPFWPMGTGIARGFLAAM : .::::.:::.:::::::. CCDS55 ----------------------------------------LRQPFWPLGTGVARGFLAAF 310 320 420 430 440 450 460 470 pF1KA1 DSAWMVRSWSLGTSPLEVLAERESIYRLLPQTTPENVSKNFSQYSIDPVTRYPNINVNFL :.::::. :. :. :::::::::.:.:: ::.:::. .: .::..::.:::::.:. . CCDS55 DAAWMVKRWAEGAESLEVLAERESLYQLLSQTSPENMHRNVAQYGLDPATRYPNLNLRAV 330 340 350 360 370 380 480 490 500 510 520 530 pF1KA1 RPSQVRHLYDTGETKDIHLEMESLVNSRTTPKLTRNESVARSSKLLGWCQRQTDGYAGVN :.::: :::. . .. . :..: . . :.. . .:: :::.:: :: ::. CCDS55 TPNQVRDLYDVLAKEPVQRN-----NDKTDTGMPATGSAGTQEELLRWCQEQTAGYPGVH 390 400 410 420 430 440 540 550 560 570 580 590 pF1KA1 VTDLTMSWKSGLALCAIIHRYRPDLIDFDSLDEQNVEKNNQLAFDIAEKELGISPIMTGK :.::. :: .::::::...: .: :.. . :. .. . . :. .::.::::.:..... CCDS55 VSDLSSSWADGLALCALVYRLQPGLLEPSELQGLGALEATAWALKVAENELGITPVVSAQ 450 460 470 480 490 500 600 610 620 630 640 650 pF1KA1 EMASVGEPDKLSMVMYLTQFYEMFKDSLPSSDTLDLNAEEKAVLIASTRSPISFLSKLGQ : :. : :... ::..:. ::. : .. . .: : . ::::: . CCDS55 --AVVAGSDPLGLIAYLSHFHSAFKSMAHSPGPVSQASP-------GTSSAVLFLSKLQR 510 520 530 540 550 660 670 680 690 700 710 pF1KA1 TISRKRSPKDKKEKDLDGAGKRRKTSQSEEEEAPRGHRGERPTLVSTLTDRRMDVAVGNQ :..:.:. ::. :..::. . . : :.: . : :: CCDS55 TLQRSRA----KENAEDAGGKKLRLEM--EAETPSTEVPPDPEPGVPLTP---------- 560 570 580 590 720 730 740 750 760 770 pF1KA1 NKVKYMATQLLAKFEENAPAQSIGIRRQGSMKKEFPQNLGGSDTCYFCQKRVYVMERLSA :.: :. :..: : .: ...::.::: . CCDS55 ------------------PSQH--------------QEAGAGDLCALCGEHLYVLERLCV 600 610 620 780 790 800 810 820 830 pF1KA1 EGKFFHRSCFKCEYCATTLRLSAYAYDIEDGKFYCKPHYCYRLSGYAQRKRPAVAPLSGK .:.:::::::.:. : .:: ..: ::.::: : : . : . : CCDS55 NGHFFHRSCFRCHTCEATLWPGGYEQHPGDGHFYCLQHL-------PQTDHKAEGSDRGP 630 640 650 660 670 840 850 860 870 880 890 pF1KA1 EAKGPLQDGATTDANGRANAVASSTERTPGSGVNGLEEPSIAKR--LR-GTPERIELENY :. : . : . :. .... : :.: . .:: : .: ..::: .: . CCDS55 ES--P--ELPTPSENSMPPGLSTPTASQEGAG--PVPDPSQPTRRQIRLSSPERQRLSSL 680 690 700 710 720 730 900 910 920 930 940 pF1KA1 RLSLRQAEALQEVPEETQAEHNLSSVLDTGAEEDVASRSARRAAGRPPATRP :. CCDS55 NLTPDPEMEPPPKPPRSCSALARHALESSFVGWGLPVQSPQALVAMEKEEKESPFSSEEE 740 750 760 770 780 790 948 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 01:30:07 2016 done: Fri Nov 4 01:30:08 2016 Total Scan time: 4.500 Total Display time: 0.420 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]