Result of FASTA (ccds) for pF1KA1378
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1378, 620 aa
  1>>>pF1KA1378 620 - 620 aa - 620 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7835+/-0.00101; mu= 16.0826+/- 0.061
 mean_var=76.2083+/-15.777, 0's: 0 Z-trim(103.6): 153  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.146917
 statistics sampled from 7331 (7500) to 7331 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.596), E-opt: 0.2 (0.23), width:  16
 Scan time:  2.880

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4          ( 620) 4223 905.3       0
CCDS77937.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4         ( 544) 3259 701.0 1.1e-201
CCDS75163.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4         ( 437) 2517 543.6  2e-154
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1         ( 609) 1567 342.3 1.1e-93
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1         ( 568) 1400 306.9 4.6e-83
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX         ( 718) 1383 303.4 6.8e-82
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX         ( 720) 1363 299.1 1.3e-80
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1       ( 642) 1354 297.2 4.4e-80
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3        ( 574) 1317 289.3 9.2e-78
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5         ( 555) 1313 288.5 1.6e-77
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5          ( 587) 1313 288.5 1.7e-77
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 597) 1288 283.2 6.7e-76
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 593) 1287 283.0 7.7e-76
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5         ( 505) 1223 269.4 8.2e-72
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14        ( 571) 1213 267.3   4e-71
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14       ( 585) 1213 267.3   4e-71
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 505) 1176 259.4 8.2e-69
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 496) 1101 243.5 4.9e-64
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19         ( 624) 1047 232.1 1.7e-60
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17      ( 608) 1002 222.6 1.2e-57
CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 427)  946 210.6 3.4e-54
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1            ( 582)  860 192.5 1.3e-48
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1            ( 584)  860 192.5 1.3e-48
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7         ( 586)  823 184.6 3.1e-46
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7          ( 538)  782 175.9 1.2e-43
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3          ( 621)  741 167.3 5.5e-41
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5            ( 589)  737 166.4 9.5e-41
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15       ( 589)  728 164.5 3.6e-40
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2       ( 875)  725 164.0 7.8e-40
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3         ( 600)  715 161.8 2.5e-39
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 613)  713 161.3 3.4e-39
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 639)  713 161.3 3.5e-39
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 655)  713 161.3 3.6e-39
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 658)  713 161.4 3.6e-39
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8       ( 581)  695 157.5 4.5e-38
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16       ( 616)  654 148.8   2e-35
CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5           ( 516)  647 147.3 4.7e-35
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22       ( 634)  648 147.6 4.8e-35
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1         ( 597)  625 142.7 1.4e-33
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13        ( 687)  621 141.9 2.7e-33
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13         ( 748)  621 141.9 2.9e-33
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2       ( 578)  614 140.3 6.6e-33
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19       ( 615)  610 139.5 1.3e-32
CCDS1368.1 IVNS1ABP gene_id:10625|Hs108|chr1       ( 642)  567 130.4 7.2e-30
CCDS53882.1 KLHL33 gene_id:123103|Hs108|chr14      ( 533)  563 129.5 1.1e-29
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 568)  557 128.3 2.8e-29
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4          ( 694)  557 128.3 3.4e-29
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 709)  557 128.3 3.4e-29
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 755)  557 128.3 3.6e-29
CCDS2906.2 KBTBD8 gene_id:84541|Hs108|chr3         ( 601)  551 127.0 7.2e-29


>>CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4               (620 aa)
 initn: 4223 init1: 4223 opt: 4223  Z-score: 4837.9  bits: 905.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4223; 100.0% identity (100.0% similar) in 620 aa overlap (1-620:1-620)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MASDSMSSKQARNHITKGKRQQQHQQIKNRSSISDGDGEDSFIFEANEAWKDFHGSLLRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MASDSMSSKQARNHITKGKRQQQHQQIKNRSSISDGDGEDSFIFEANEAWKDFHGSLLRF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 YENGELCDVTLKVGSKLISCHKLVLACVIPYFRAMFLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 YENGELCDVTLKVGSKLISCHKLVLACVIPYFRAMFLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIED
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 LVKFVYSSRLTLTVDNVQPLLYAACILQVELVARACCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 LVKFVYSSRLTLTVDNVQPLLYAACILQVELVARACCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 RIDLMDMADQYACDHFTEVVECEDFVSVSPQHLHKLLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 RIDLMDMADQYACDHFTEVVECEDFVSVSPQHLHKLLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 NPQHHSKWLDETLAQVRLPLLPVDFLMGVVAKEQIVKQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 NPQHHSKWLDETLAQVRLPLLPVDFLMGVVAKEQIVKQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 VPDFEYSIRTTPRKHTAGVLFCVGGRGGSGDPFRSIECYSINKNSWFFGPEMNSRRRHVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 VPDFEYSIRTTPRKHTAGVLFCVGGRGGSGDPFRSIECYSINKNSWFFGPEMNSRRRHVG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 VISVEGKVYAVGGHDGNEHLGSMEMFDPLTNKWMMKASMNTKRRGIALASLGGPIYAIGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 VISVEGKVYAVGGHDGNEHLGSMEMFDPLTNKWMMKASMNTKRRGIALASLGGPIYAIGG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 LDDNTCFNDVERYDIESDQWSTVAPMNTPRGGVGSVALVNHVYAVGGNDGMASLSSVERY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 LDDNTCFNDVERYDIESDQWSTVAPMNTPRGGVGSVALVNHVYAVGGNDGMASLSSVERY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 DPHLDKWIEVKEMGQRRAGNGVSKLHGCLYVVGGFDDNSPLSSVERYDPRSNKWDYVAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 DPHLDKWIEVKEMGQRRAGNGVSKLHGCLYVVGGFDDNSPLSSVERYDPRSNKWDYVAAL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 TTPRGGVGIATVMGKIFAVGGHNGNAYLNTVEAFDPVLNRWELVGSVSHCRAGAGVAVCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 TTPRGGVGIATVMGKIFAVGGHNGNAYLNTVEAFDPVLNRWELVGSVSHCRAGAGVAVCS
              550       560       570       580       590       600

              610       620
pF1KA1 CLTSQIRDVGHGSNNVVDCM
       ::::::::::::::::::::
CCDS36 CLTSQIRDVGHGSNNVVDCM
              610       620

>>CCDS77937.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4              (544 aa)
 initn: 3259 init1: 3259 opt: 3259  Z-score: 3734.5  bits: 701.0 E(32554): 1.1e-201
Smith-Waterman score: 3574; 87.7% identity (87.7% similar) in 620 aa overlap (1-620:1-544)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MASDSMSSKQARNHITKGKRQQQHQQIKNRSSISDGDGEDSFIFEANEAWKDFHGSLLRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MASDSMSSKQARNHITKGKRQQQHQQIKNRSSISDGDGEDSFIFEANEAWKDFHGSLLRF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 YENGELCDVTLKVGSKLISCHKLVLACVIPYFRAMFLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIED
       :::::::::::::                                               
CCDS77 YENGELCDVTLKV-----------------------------------------------
               70                                                  

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 LVKFVYSSRLTLTVDNVQPLLYAACILQVELVARACCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHN
                                    :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 -----------------------------ELVARACCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHN
                                         80        90       100    

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 RIDLMDMADQYACDHFTEVVECEDFVSVSPQHLHKLLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RIDLMDMADQYACDHFTEVVECEDFVSVSPQHLHKLLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLA
          110       120       130       140       150       160    

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 NPQHHSKWLDETLAQVRLPLLPVDFLMGVVAKEQIVKQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 NPQHHSKWLDETLAQVRLPLLPVDFLMGVVAKEQIVKQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRA
          170       180       190       200       210       220    

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 VPDFEYSIRTTPRKHTAGVLFCVGGRGGSGDPFRSIECYSINKNSWFFGPEMNSRRRHVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VPDFEYSIRTTPRKHTAGVLFCVGGRGGSGDPFRSIECYSINKNSWFFGPEMNSRRRHVG
          230       240       250       260       270       280    

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 VISVEGKVYAVGGHDGNEHLGSMEMFDPLTNKWMMKASMNTKRRGIALASLGGPIYAIGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VISVEGKVYAVGGHDGNEHLGSMEMFDPLTNKWMMKASMNTKRRGIALASLGGPIYAIGG
          290       300       310       320       330       340    

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 LDDNTCFNDVERYDIESDQWSTVAPMNTPRGGVGSVALVNHVYAVGGNDGMASLSSVERY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LDDNTCFNDVERYDIESDQWSTVAPMNTPRGGVGSVALVNHVYAVGGNDGMASLSSVERY
          350       360       370       380       390       400    

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 DPHLDKWIEVKEMGQRRAGNGVSKLHGCLYVVGGFDDNSPLSSVERYDPRSNKWDYVAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DPHLDKWIEVKEMGQRRAGNGVSKLHGCLYVVGGFDDNSPLSSVERYDPRSNKWDYVAAL
          410       420       430       440       450       460    

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 TTPRGGVGIATVMGKIFAVGGHNGNAYLNTVEAFDPVLNRWELVGSVSHCRAGAGVAVCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TTPRGGVGIATVMGKIFAVGGHNGNAYLNTVEAFDPVLNRWELVGSVSHCRAGAGVAVCS
          470       480       490       500       510       520    

              610       620
pF1KA1 CLTSQIRDVGHGSNNVVDCM
       ::::::::::::::::::::
CCDS77 CLTSQIRDVGHGSNNVVDCM
          530       540    

>>CCDS75163.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4              (437 aa)
 initn: 2514 init1: 2514 opt: 2517  Z-score: 2886.0  bits: 543.6 E(32554): 2e-154
Smith-Waterman score: 2620; 70.5% identity (70.5% similar) in 620 aa overlap (1-620:1-437)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MASDSMSSKQARNHITKGKRQQQHQQIKNRSSISDGDGEDSFIFEANEAWKDFHGSLLRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MASDSMSSKQARNHITKGKRQQQHQQIKNRSSISDGDGEDSFIFEANEAWKDFHGSLLRF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 YENGELCDVTLKVGSKLISCHKLVLACVIPYFRAMFLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIED
       :::::::::::::                                               
CCDS75 YENGELCDVTLKV-----------------------------------------------
               70                                                  

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 LVKFVYSSRLTLTVDNVQPLLYAACILQVELVARACCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHN
                                                                   
CCDS75 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 RIDLMDMADQYACDHFTEVVECEDFVSVSPQHLHKLLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLA
                                                                   
CCDS75 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 NPQHHSKWLDETLAQVRLPLLPVDFLMGVVAKEQIVKQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRA
                       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ----------------RLPLLPVDFLMGVVAKEQIVKQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRA
                            80        90       100       110       

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 VPDFEYSIRTTPRKHTAGVLFCVGGRGGSGDPFRSIECYSINKNSWFFGPEMNSRRRHVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VPDFEYSIRTTPRKHTAGVLFCVGGRGGSGDPFRSIECYSINKNSWFFGPEMNSRRRHVG
       120       130       140       150       160       170       

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 VISVEGKVYAVGGHDGNEHLGSMEMFDPLTNKWMMKASMNTKRRGIALASLGGPIYAIGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VISVEGKVYAVGGHDGNEHLGSMEMFDPLTNKWMMKASMNTKRRGIALASLGGPIYAIGG
       180       190       200       210       220       230       

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 LDDNTCFNDVERYDIESDQWSTVAPMNTPRGGVGSVALVNHVYAVGGNDGMASLSSVERY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LDDNTCFNDVERYDIESDQWSTVAPMNTPRGGVGSVALVNHVYAVGGNDGMASLSSVERY
       240       250       260       270       280       290       

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 DPHLDKWIEVKEMGQRRAGNGVSKLHGCLYVVGGFDDNSPLSSVERYDPRSNKWDYVAAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DPHLDKWIEVKEMGQRRAGNGVSKLHGCLYVVGGFDDNSPLSSVERYDPRSNKWDYVAAL
       300       310       320       330       340       350       

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 TTPRGGVGIATVMGKIFAVGGHNGNAYLNTVEAFDPVLNRWELVGSVSHCRAGAGVAVCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TTPRGGVGIATVMGKIFAVGGHNGNAYLNTVEAFDPVLNRWELVGSVSHCRAGAGVAVCS
       360       370       380       390       400       410       

              610       620
pF1KA1 CLTSQIRDVGHGSNNVVDCM
       ::::::::::::::::::::
CCDS75 CLTSQIRDVGHGSNNVVDCM
       420       430       

>>CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1              (609 aa)
 initn: 2110 init1: 718 opt: 1567  Z-score: 1795.6  bits: 342.3 E(32554): 1.1e-93
Smith-Waterman score: 1567; 44.7% identity (74.2% similar) in 546 aa overlap (56-598:59-598)

          30        40        50        60        70        80     
pF1KA1 QIKNRSSISDGDGEDSFIFEANEAWKDFHGSLLRFYENGELCDVTLKVGSKLISCHKLVL
                                     .:::  .. :::::.: ::.: :  :...:
CCDS13 DPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLR--KHRELCDVVLVVGAKKIYAHRVIL
       30        40        50        60          70        80      

          90       100       110       120       130       140     
pF1KA1 ACVIPYFRAMFLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIEDLVKFVYSSRLTLTVDNVQPLLYAAC
       .   ::::::: .:.::..:: . :::.:  :.: :. :.:.:..:.   ::: :: :::
CCDS13 SACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAAC
         90       100       110       120       130       140      

         150       160       170       180       190       200     
pF1KA1 ILQVELVARACCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHNRIDLMDMADQYACDHFTEVVECEDF
       .::.  . .::::..: .. :::::..::::..:.  .:. .::...  .: ::.: :.:
CCDS13 LLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQEVMESEEF
        150       160       170       180       190       200      

         210       220       230       240       250       260     
pF1KA1 VSVSPQHLHKLLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLANPQHHSKWLDETLAQVRLPLLPVDF
       . .  ..:  ..::..::...:.::.::.. :.  . :..   : ..: .::::::   :
CCDS13 MLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVRLPLLSPKF
        210       220       230       240       250       260      

         270       280       290       300       310         320   
pF1KA1 LMGVVAKEQIVKQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRAVPDFEYSIRTTPRK--HTAGVLFCV
       :.:.:... ..:.. .::::.:::.:: :  . :  : .. . :: :::  . . ::: :
CCDS13 LVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQER--PLMQ-GPRTRPRKPIRCGEVLFAV
        270       280       290       300          310       320   

           330       340       350       360       370       380   
pF1KA1 GGRGGSGDPFRSIECYSINKNSWFFGPEMNSRRRHVGVISVEGKVYAVGGHDGNEHLGSM
       ::   ::: . :.: :. . : : .   :..::  :::  ..  .::::::::. .:.:.
CCDS13 GGWC-SGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHDGSSYLNSV
            330       340       350       360       370       380  

           390        400       410       420       430       440  
pF1KA1 EMFDPLTNKWMMK-ASMNTKRRGIALASLGGPIYAIGGLDDNTCFNDVERYDIESDQWST
       : .:: ::.:    :  .: : ....: ::: .::.:: :  .:.: ::::: . ..:. 
CCDS13 ERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVERYDPKENKWTR
            390       400       410       420       430       440  

            450       460       470       480       490       500  
pF1KA1 VAPMNTPRGGVGSVALVNHVYAVGGNDGMASLSSVERYDPHLDKWIEVKEMGQRRAGNGV
       :: :.: : ::. ..: . .:::::.:: . :..::::.:. ..:  .  :: ::   : 
CCDS13 VASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYNPQENRWHTIAPMGTRRKHLGC
            450       460       470       480       490       500  

            510       520       530       540       550       560  
pF1KA1 SKLHGCLYVVGGFDDNSPLSSVERYDPRSNKWDYVAALTTPRGGVGIATVMGKIFAVGGH
       .  .  .:.::: ::.. :::.:::.::.:.:. :.:.:. :.:::.:.: :...:::: 
CCDS13 AVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVAMTSRRSGVGLAVVNGQLMAVGGF
            510       520       530       540       550       560  

            570       580       590       600       610       620
pF1KA1 NGNAYLNTVEAFDPVLNRWELVGSVSHCRAGAGVAVCSCLTSQIRDVGHGSNNVVDCM
       .:..::.:.:.:::  : :.: :.... : :.::.:                      
CCDS13 DGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKMTHCESHIW           
            570       580       590       600                    

>>CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1              (568 aa)
 initn: 1660 init1: 1155 opt: 1400  Z-score: 1604.7  bits: 306.9 E(32554): 4.6e-83
Smith-Waterman score: 1400; 38.5% identity (71.0% similar) in 559 aa overlap (47-598:13-564)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KA1 KGKRQQQHQQIKNRSSISDGDGEDSFIFEANEAWKDFHGSLLRFYENGELCDVTLKVGSK
                                     :   :.. .:.  . ... ::::::.: .:
CCDS14                   MGGIMAPKDIMTNTHAKSILNSMNSLRKSNTLCDVTLRVEQK
                                 10        20        30        40  

         80        90       100       110       120       130      
pF1KA1 LISCHKLVLACVIPYFRAMFLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIEDLVKFVYSSRLTLTVDN
        .  :..:::    :: ::: ::..:  .  ..:. . ....: :. :::.  . .::.:
CCDS14 DFPAHRIVLAACSDYFCAMFTSELSEKGKPYVDIQGLTASTMEILLDFVYTETVHVTVEN
             50        60        70        80        90       100  

        140       150       160       170       180       190      
pF1KA1 VQPLLYAACILQVELVARACCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHNRIDLMDMADQYACDHF
       :: :: :::.::.. : .::::... .. :::::..: :::.:: .:::. :. ..  ::
CCDS14 VQELLPAACLLQLKGVKQACCEFLESQLDPSNCLGIRDFAETHNCVDLMQAAEVFSQKHF
            110       120       130       140       150       160  

        200       210       220       230       240       250      
pF1KA1 TEVVECEDFVSVSPQHLHKLLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLANPQHHSKWLDETLAQV
        :::. :.:. .:  ...::.. .......:. :..:.:.:.    ... . : . :  :
CCDS14 PEVVQHEEFILLSQGEVEKLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKEREESLPNLLQYV
            170       180       190       200       210       220  

        260       270       280       290       300          310   
pF1KA1 RLPLLPVDFLMGVVAKEQIVKQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRAVPDFEYSI---RTTPR
       :.:::   ..  :.  : ... .:.::::.:::...::.      :... ..   ::  :
CCDS14 RMPLLTPRYITDVIDAEPFIRCSLQCRDLVDEAKKFHLR------PELRSQMQGPRTRAR
            230       240       250       260             270      

           320       330       340       350       360       370   
pF1KA1 KHTAGVLFCVGGRGGSGDPFRSIECYSINKNSWFFGPEMNSRRRHVGVISVEGKVYAVGG
         .  ::. ::: :.. .:.  .: :. . . : : : .. .::.:. .:.. ..:..::
CCDS14 LGANEVLLVVGGFGSQQSPIDVVEKYDPKTQEWSFLPSITRKRRYVASVSLHDRIYVIGG
        280       290       300       310       320       330      

           380       390          400       410        420         
pF1KA1 HDGNEHLGSMEMFDPLTNK---WMMKASMNTKRRGIALAS-LGGPIYAIGGLDDNTCFND
       .::  .:.:.: .:  ...   :.  : ::. :::.: :. ::  ::. ::.: .   ..
CCDS14 YDGRSRLSSVECLDYTADEDGVWYSVAPMNV-RRGLAGATTLGDMIYVSGGFDGSRRHTS
        340       350       360        370       380       390     

     430       440       450       460       470       480         
pF1KA1 VERYDIESDQWSTVAPMNTPRGGVGSVALVNHVYAVGGNDGMASLSSVERYDPHLDKWIE
       .:::: . :::: .. :.: : :.: :.  . .: .:: ::.  :.:::.::::  .: .
CCDS14 MERYDPNIDQWSMLGDMQTAREGAGLVVASGVIYCLGGYDGLNILNSVEKYDPHTGHWTN
         400       410       420       430       440       450     

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pF1KA1 VKEMGQRRAGNGVSKLHGCLYVVGGFDDNSPLSSVERYDPRSNKWDYVAALTTPRGGVGI
       :  :. .:.: ::. :.  .::::::: .. ::::: :. :...:  :...::::  :: 
CCDS14 VTPMATKRSGAGVALLNDHIYVVGGFDGTAHLSSVEAYNIRTDSWTTVTSMTTPRCYVGA
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pF1KA1 ATVMGKIFAVGGHNGNAYLNTVEAFDPVLNRWELVGSVSHCRAGAGVAVCSCLTSQIRDV
       ... :...:..:..::. :...: .::... ::.: :..  :  ::: :           
CCDS14 TVLRGRLYAIAGYDGNSLLSSIECYDPIIDSWEVVTSMGTQRCDAGVCVLREK       
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     610       620
pF1KA1 GHGSNNVVDCM

>>CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX              (718 aa)
 initn: 2013 init1: 580 opt: 1383  Z-score: 1583.7  bits: 303.4 E(32554): 6.8e-82
Smith-Waterman score: 1383; 38.7% identity (69.1% similar) in 599 aa overlap (19-598:122-714)

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pF1KA1             MASDSMSSKQARNHITKGKRQQQHQQIKNRSSISDG----DGEDSFIF
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CCDS14 QQHNLIVHFQANEDTPKSVPEKNLFKEACEKRAQDLEMMAD-DNIEDSTARLDTQHSEDM
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pF1KA1 EANEAWKDFH-----GSLLRFYEN----GELCDVTLKVGSKLISCHKLVLACVIPYFRAM
       .:... ..::      . :: .::     .:::: : .:   :  :.:::. :  :: ::
CCDS14 NATRSEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQLCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVSDYFAAM
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pF1KA1 FLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIEDLVKFVYSSRLTLTVDNVQPLLYAACILQVELVARA
       : ... ::::  ....  : .:...::...:.. : :  :... :: :::.::.  :  .
CCDS14 FTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYAYTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQVIDV
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pF1KA1 CCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHNRIDLMDMADQYACDHFTEVVECEDFVSVSPQHLHK
       : ...  ..::::::..:.:.....  .:...: .:. .:: ::.. ..:. .  ... :
CCDS14 CSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELLNVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPANEISK
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pF1KA1 LLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLANPQHHSKWLDETLAQVRLPLLPVDFLMGVVAKEQI
       :: :.:.:. .:. ...: ..:.  . :...  :   :. .:::::: . :.. .   ..
CCDS14 LLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNRQGELGMLLSYIRLPLLPPQ-LLADLETSSM
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pF1KA1 VKQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRAVPDFEYSIRTTPRKHTAGVLFCVGGRGGSGDPFRS
          .:.:. :: :: .:::    :.. .   : :: ::: :.:.:. :::  .      .
CCDS14 FTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSMMQ---SPRTKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGT-TT
     390       400       410          420       430       440      

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pF1KA1 IECYSINKNSWFFGPEMNSRRRHVGVISVEGKVYAVGGHDGNEHLGSMEMFDPLTNKWMM
       :: :..  :::.    ::.:: . ::  ...:.:.:::.:: . :...: :.:. . : .
CCDS14 IEKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYVVGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTV
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pF1KA1 KASMNTKRRGIALASLGGPIYAIGGLDDNTCFNDVERYDIESDQWSTVAPMNTPRGGVGS
          :.:.:.:...:.: ::.::.:: :  . .: :::.: :. ::. :: :.:::. :: 
CCDS14 MPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGV
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pF1KA1 VALVNHVYAVGGNDGMASLSSVERYDPHLDKWIEVKEMGQRRAGNGVSKLHGCLYVVGGF
       ::: :..::.:: :: . :.:.: .::: .::     :..::.: ::.  .: :::::: 
CCDS14 VALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLCAPMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGH
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pF1KA1 D---DN--SPLSS-VERYDPRSNKWDYVAALTTPRGGVGIATVMGKIFAVGGHNGNAYLN
       :   .:  : ::. ::::::....:. :: :..:: .:..  .  :...:::..:..:::
CCDS14 DAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPRDAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLN
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pF1KA1 TVEAFDPVLNRWELVGSVSHCRAGAGVAVCSCLTSQIRDVGHGSNNVVDCM
       :::..:   :.:.    :.  :::: :.:                      
CCDS14 TVESYDAQRNEWKEEVPVNIGRAGACVVVVKLP                  
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>>CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX              (720 aa)
 initn: 1977 init1: 580 opt: 1363  Z-score: 1560.8  bits: 299.1 E(32554): 1.3e-80
Smith-Waterman score: 1363; 38.6% identity (69.1% similar) in 583 aa overlap (19-582:122-698)

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pF1KA1             MASDSMSSKQARNHITKGKRQQQHQQIKNRSSISDG----DGEDSFIF
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CCDS14 QQHNLIVHFQANEDTPKSVPEKNLFKEACEKRAQDLEMMAD-DNIEDSTARLDTQHSEDM
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pF1KA1 EANEAWKDFH-----GSLLRFYEN----GELCDVTLKVGSKLISCHKLVLACVIPYFRAM
       .:... ..::      . :: .::     .:::: : .:   :  :.:::. :  :: ::
CCDS14 NATRSEEQFHVINHAEQTLRKMENYLKEKQLCDVLLIAGHLRIPAHRLVLSAVSDYFAAM
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         100       110       120       130       140       150     
pF1KA1 FLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIEDLVKFVYSSRLTLTVDNVQPLLYAACILQVELVARA
       : ... ::::  ....  : .:...::...:.. : :  :... :: :::.::.  :  .
CCDS14 FTNDVLEAKQEEVRMEGVDPNALNSLVQYAYTGVLQLKEDTIESLLAAACLLQLTQVIDV
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         160       170       180       190       200       210     
pF1KA1 CCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHNRIDLMDMADQYACDHFTEVVECEDFVSVSPQHLHK
       : ...  ..::::::..:.:.....  .:...: .:. .:: ::.. ..:. .  ... :
CCDS14 CSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELLNVAHKYTMEHFIEVIKNQEFLLLPANEISK
              280       290       300       310       320       330

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pF1KA1 LLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLANPQHHSKWLDETLAQVRLPLLPVDFLMGVVAKEQI
       :: :.:.:. .:. ...: ..:.  . :...  :   :. .:::::: ..:  .    ..
CCDS14 LLCSDDINVPDEETIFHALMQWVGHDVQNRQGELGMLLSYIRLPLLPPQLLADL-ETSSM
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pF1KA1 VKQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRAVPDFEYSIRTTPRKHTAGVLFCVGGRGGSGDPFRS
          .:.:. :: :: .:::    :..     : :: ::: :.:.:. :::  .      .
CCDS14 FTGDLECQKLLMEAMKYHLLPERRSM---MQSPRTKPRKSTVGALYAVGGMDAMKGT-TT
     390       400       410          420       430       440      

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pF1KA1 IECYSINKNSWFFGPEMNSRRRHVGVISVEGKVYAVGGHDGNEHLGSMEMFDPLTNKWMM
       :: :..  :::.    ::.:: . ::  ...:.:.:::.:: . :...: :.:. . : .
CCDS14 IEKYDLRTNSWLHIGTMNGRRLQFGVAVIDNKLYVVGGRDGLKTLNTVECFNPVGKIWTV
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pF1KA1 KASMNTKRRGIALASLGGPIYAIGGLDDNTCFNDVERYDIESDQWSTVAPMNTPRGGVGS
          :.:.:.:...:.: ::.::.:: :  . .: :::.: :. ::. :: :.:::. :: 
CCDS14 MPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGV
         510       520       530       540       550       560     

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pF1KA1 VALVNHVYAVGGNDGMASLSSVERYDPHLDKWIEVKEMGQRRAGNGVSKLHGCLYVVGGF
       ::: :..::.:: :: . :.:.: .::: .::     :..::.: ::.  .: :::::: 
CCDS14 VALNNKLYAIGGRDGSSCLKSMEYFDPHTNKWSLCAPMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGH
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pF1KA1 D---DN--SPLSS-VERYDPRSNKWDYVAALTTPRGGVGIATVMGKIFAVGGHNGNAYLN
       :   .:  : ::. ::::::....:. :: :..:: .:..  .  :...:::..:..:::
CCDS14 DAPASNHCSRLSDCVERYDPKGDSWSTVAPLSVPRDAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLN
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pF1KA1 TVEAFDPVLNRWELVGSVSHCRAGAGVAVCSCLTSQIRDVGHGSNNVVDCM
       :::..:   :.:.                                      
CCDS14 TVESYDAQRNEWKESMQELLQNFYTTQKLKETLGH                
         690       700       710       720                

>>CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1            (642 aa)
 initn: 1326 init1: 704 opt: 1354  Z-score: 1551.2  bits: 297.2 E(32554): 4.4e-80
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pF1KA1 TKGKRQQQHQQIKNRSSISDGDGEDSFIFEANEAWKDFHGSLL---RFYENGELCDVTLK
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CCDS30 EAERTRPRQARPAAPMEGAVQLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLH
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pF1KA1 VGSKLISCHKLVLACVIPYFRAMFLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIEDLVKFVYSSRLTL
       :..: :  ::.:::   :::.::: .::.:..:: . ..:.: .:...::.:.:......
CCDS30 VAAKEIRAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVV
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pF1KA1 TVDNVQPLLYAACILQVELVARACCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHNRIDLMDMADQYA
          ::: :: :: .::.. :  :::...  .. :::::..:.::..:.  ::.  : .:.
CCDS30 GEGNVQTLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYV
       160       170       180       190       200       210       

            200       210       220       230       240       250  
pF1KA1 CDHFTEVVECEDFVSVSPQHLHKLLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLANPQHHSKWLDET
        .::..:.. :.:. .  ... .:.::..::. .:..:: :...:.  . . . . . . 
CCDS30 LQHFVDVAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRL
       220       230       240       250       260       270       

            260       270       280       290       300       310  
pF1KA1 LAQVRLPLLPVDFLMGVVAKEQIVKQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRAVPDFEYSIRTTP
       .  ::::::  :::.: :  :..:...  :.::: :: ..::   .:.:     . :: :
CCDS30 MKCVRLPLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLPEQRGVLG---TSRTRP
       280       290       300       310       320          330    

              320       330       340       350       360       370
pF1KA1 RK-HTAG-VLFCVGGRGGSGDPFRSIECYSINKNSWFFGPEMNSRRRHVGVISVEGKVYA
       :. . :: ::: ::: :.      . : :.   . :     :..:: .::: .: ...::
CCDS30 RRCEGAGPVLFAVGG-GSLFAIHGDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYA
          340        350       360       370       380       390   

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pF1KA1 VGGHDGNEHLGSMEMFDPLTNKWMMKASMNTKRRGIALASLGGPIYAIGGLDDNTCFNDV
       :::.::.  :...: .::.:: :. ..::.:.:  ...:.: : .:. :: :  .:.:..
CCDS30 VGGYDGTSDLATVESYDPVTNTWQPEVSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSA
           400       410       420       430       440       450   

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pF1KA1 ERYDIESDQWSTVAPMNTPRGGVGSVALVNHVYAVGGNDGMASLSSVERYDPHLDKWIEV
       ::::  .  :..:: :.: :  :  ..: ...::::: :. . :..::.:.:... :  :
CCDS30 ERYDPLTGTWTSVAAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSHLATVEKYEPQVNVWSPV
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pF1KA1 KEMGQRRAGNGVSKLHGCLYVVGGFDDNSPLSSVERYDPRSNKWDYVAALTTPRGGVGIA
         : .::.. ::. :.: :::.:: : .: :.:::::.:... :. :: ..  :.   ..
CCDS30 ASMLSRRSSAGVAVLEGALYVAGGNDGTSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLV
           520       530       540       550       560       570   

              560       570       580       590       600       610
pF1KA1 TVMGKIFAVGGHNGNAYLNTVEAFDPVLNRWELVGSVSHCRAGAGVAVCSCLTSQIRDVG
       .. : ..::::..:.. ::..: ..:  :.:  .. .   :...::::            
CCDS30 AMDGWLYAVGGNDGSSSLNSIEKYNPRTNKWVAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSP
           580       590       600       610       620       630   

              620
pF1KA1 HGSNNVVDCM
                 
CCDS30 TLSVSSTSL 
           640   

>>CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3             (574 aa)
 initn: 1511 init1: 658 opt: 1317  Z-score: 1509.6  bits: 289.3 E(32554): 9.2e-78
Smith-Waterman score: 1317; 35.8% identity (69.8% similar) in 576 aa overlap (33-603:2-573)

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pF1KA1 SDSMSSKQARNHITKGKRQQQHQQIKNRSSISDG--DGEDSFIFEANEAWKDFHGSLLRF
                                     . ::  . ::   : ..:  .  .: . ..
CCDS33                              MVEDGAEELEDLVHFSVSELPSRGYGVMEEI
                                            10        20        30 

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pF1KA1 YENGELCDVTLKVGSKLISCHKLVLACVIPYFRAMFLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIED
        ..:.:::::::.:.. .: :..:::  ::::.::: ..: : ::  : .. .: .:.: 
CCDS33 RRQGKLCDVTLKIGDHKFSAHRIVLAASIPYFHAMFTNDMMECKQDEIVMQGMDPSALEA
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pF1KA1 LVKFVYSSRLTLTVDNVQPLLYAACILQVELVARACCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHN
       :..:.:.. :..  .::: ::..: .::.. .  ::: ... ..::.:::.:: :::.  
CCDS33 LINFAYNGNLAIDQQNVQSLLMGASFLQLQSIKDACCTFLRERLHPKNCLGVRQFAETMM
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pF1KA1 RIDLMDMADQYACDHFTEVVECEDFVSVSPQHLHKLLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLA
          :.: :...  .::.::   :.:...  . . .:.: ..::...:.::..::. :.  
CCDS33 CAVLYDAANSFIHQHFVEVSMSEEFLALPLEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALAWVRY
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pF1KA1 NPQHHSKWLDETLAQVRLPLLPVDFLMGVVAKEQIVKQNLKCRDLLDEARNYHLHLSSRA
       . .... .: : :...::::   .::   : ....:.   :::::.:::..:::    : 
CCDS33 DREQRGPYLPELLSNIRLPLCRPQFLSDRVQQDDLVRCCHKCRDLVDEAKDYHLMPERRP
             220       230       240       250       260       270 

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pF1KA1 -VPDFEYSIRTTPRKHT--AGVLFCVGGRGGSGDPFRSIECYSINKNSWFFGPEMNSRRR
        .: :    :: ::  :  ::... ::: ...:: .  .: ..   : :     :.. : 
CCDS33 HLPAF----RTRPRCCTSIAGLIYAVGGLNSAGDSLNVVEVFDPIANCWERCRPMTTARS
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pF1KA1 HVGVISVEGKVYAVGGHDGNEHLGSMEMFDPLTNKWMMKASMNTKRRGIALASLGGPIYA
       .:::  :.: .::.::.::. .:...: ..: :. :   .:::.:: ... . : : ::.
CCDS33 RVGVAVVNGLLYAIGGYDGQLRLSTVEAYNPETDTWTRVGSMNSKRSAMGTVVLDGQIYV
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pF1KA1 IGGLDDNTCFNDVERYDIESDQWSTVAPMNTPRGGVGSVALVNHVYAVGGNDGMASLSSV
        :: : :. ...:: :. :.:.:..:. :.. :...: ... ...:. ::.::.  .:::
CCDS33 CGGYDGNSSLSSVETYSPETDKWTVVTSMSSNRSAAGVTVFEGRIYVSGGHDGLQIFSSV
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pF1KA1 ERYDPHLDKWIEVKEMGQRRAGNGVSKLHGCLYVVGGFDDNSPLSSVERYDPRSNKWDYV
       :.:. :   :  .  : ..:  .:...: . ..: ::.: .. :: .: :.  ...:  .
CCDS33 EHYNHHTATWHPAAGMLNKRCRHGAASLGSKMFVCGGYDGSGFLSIAEMYSSVADQWCLI
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pF1KA1 AALTTPRGGVGIATVMGKIFAVGGHNGNAYLNTVEAFDPVLNRWELVGSVSHCRAGAGVA
       . . : :. :....  :...::::..:.. :..:: .::  . : ... ..  ..:.::.
CCDS33 VPMHTRRSRVSLVASCGRLYAVGGYDGQSNLSSVEMYDPETDCWTFMAPMACHEGGVGVG
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       600       610       620
pF1KA1 VCSCLTSQIRDVGHGSNNVVDCM
           ::                 
CCDS33 CIPLLTI                
       570                    

>>CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5              (555 aa)
 initn: 1148 init1: 777 opt: 1313  Z-score: 1505.2  bits: 288.5 E(32554): 1.6e-77
Smith-Waterman score: 1313; 39.0% identity (71.1% similar) in 539 aa overlap (66-598:17-550)

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pF1KA1 GDGEDSFIFEANEAWKDFHGSLLRFYENGELCDVTLKVGSKLISCHKLVLACVIPYFRAM
                                     :::: . . .  :  :..:::   ::: ::
CCDS58               MGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIEAHRVVLAACSPYFCAM
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pF1KA1 FLSEMAEAKQTLIEIRDFDGDAIEDLVKFVYSSRLTLTVDNVQPLLYAACILQVELVARA
       : ..:.:.:   :::.: ::...  :. ..:.... .: .::: :: :: .::.  : . 
CCDS58 FTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQN
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pF1KA1 CCEYMKLHFHPSNCLAVRAFAESHNRIDLMDMADQYACDHFTEVVECEDFVSVSPQHLHK
       ::.... ..::.:::..::::. :.  ::...:. :: .:: ::.  :.:.:.: ... .
CCDS58 CCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCS
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pF1KA1 LLSSSDLNIENEKQVYNAAIKWLLANPQHHSKWLDETLAQVRLPLLPVDFLMGVVAKEQI
       :.::. :.. .:..:..:.:.:.  . . . . . . . .::::::: :.:. .: .: .
CCDS58 LISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEAL
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pF1KA1 VKQNLKCRDLLDEARNYHL-HLSSRAVPDFEYSIRTTPRKHTA--GVLFCVGGRGGSGDP
       .:.:  :.:.: :: .:::  :..: .     . :: ::  ..   :.. :::.. ..  
CCDS58 IKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIK---NPRTKPRTPVSLPKVMIVVGGQAPKA--
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pF1KA1 FRSIECYSINKNSWFFGPEMNSRRRHVGVISVEGKVYAVGGHDGNEHLGSMEMFDPLTNK
       .::.:::..... :    :. ::: ..::. . :.:::::: .:. .. .....: . ..
CCDS58 IRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQ
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pF1KA1 WMMKASMNTKRRGIALASLGGPIYAIGGLDDNTCFNDVERYDIESDQWSTVAPMNTPRGG
       :   :::. .:  .. : :.  .::.::.: .: . .:: :. ....:  :::::: :..
CCDS58 WTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNEWFFVAPMNTRRSS
             350       360       370       380       390       400 

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pF1KA1 VGSVALVNHVYAVGGNDGMAS--LSSVERYDPHLDKWIEVKEMGQRRAGNGVSKLHGCLY
       ::  .. ...::::: :: .   ::.::.:.:  ..:: : .:. ::.: ::. : : ::
CCDS58 VGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRRSGAGVGVLSGQLY
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CCDS58 ATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLAS
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pF1KA1 VEAFDPVLNRWELVGS-VSHCRAGAGVAVCSCLTSQIRDVGHGSNNVVDCM
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CCDS58 VEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL                 
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620 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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