FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1395, 2047 aa 1>>>pF1KA1395 2047 - 2047 aa - 2047 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1993+/-0.000366; mu= 21.4916+/- 0.023 mean_var=92.6197+/-18.748, 0's: 0 Z-trim(115.3): 104 B-trim: 304 in 1/53 Lambda= 0.133267 statistics sampled from 25587 (25693) to 25587 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.643), E-opt: 0.2 (0.301), width: 16 Scan time: 19.990 The best scores are: opt bits E(85289) NP_065863 (OMIM: 614194,614219) dedicator of cytok (2047) 13538 2614.2 0 XP_011526454 (OMIM: 614194,614219) PREDICTED: dedi (2058) 12423 2399.8 0 XP_005260058 (OMIM: 614194,614219) PREDICTED: dedi (2082) 7493 1452.0 0 XP_011526452 (OMIM: 614194,614219) PREDICTED: dedi (2093) 7493 1452.0 0 XP_011526453 (OMIM: 614194,614219) PREDICTED: dedi (2089) 7491 1451.6 0 XP_005260057 (OMIM: 614194,614219) 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_065 LKNTEPALLQRWATDLTLPQLGRLLDLLYLCLAAFEYKGKKAFERINSLTFKKSLDMKAR 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KA1 LEEAILGTIGARQEMVRRSRERSPFGNPENVRWRKSVTHWKQTSDRVDKTKDEMEHEALV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_065 LEEAILGTIGARQEMVRRSRERSPFGNPENVRWRKSVTHWKQTSDRVDKTKDEMEHEALV 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KA1 EGNLATEASLVVLDTLEIIVQTVMLSEARESVLGAVLKVVLYSLGSAQSALFLQHGLATQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_065 EGNLATEASLVVLDTLEIIVQTVMLSEARESVLGAVLKVVLYSLGSAQSALFLQHGLATQ 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KA1 RALVSKFPELLFEEDTELCADLCLRLLRHCGSRISTIRTHASASLYLLMRQNFEIGHNFA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_065 RALVSKFPELLFEEDTELCADLCLRLLRHCGSRISTIRTHASASLYLLMRQNFEIGHNFA 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KA1 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1640 1650 1660 1670 pF1KA1 CMVHAAALVAEYLALLEDHRHLPVGCVSFQNISSNVLEESAISDDILSPDEEGFCSGKHF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 CMVHAAALVAEYLALLEDHRHLPVGCVSFQNISSNVLEESAISDDILSPDEEGFCSGKHF 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1680 1690 1700 1710 1720 1730 pF1KA1 TELGLVGLLEQAAGYFTMGGLYEAVNEVYKNLIPILEAHRDYKKLAAVHGKLQEAFTKIM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 TELGLVGLLEQAAGYFTMGGLYEAVNEVYKNLIPILEAHRDYKKLAAVHGKLQEAFTKIM 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1740 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KA1 HQSSGWERVFGTYFRVGFYGAHFGDLDEQEFVYKEPSITKLAEISHRLEEFYTERFGDDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 HQSSGWERVFGTYFRVGFYGAHFGDLDEQEFVYKEPSITKLAEISHRLEEFYTERFGDDV 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1800 1810 1820 1830 1840 1850 pF1KA1 VEIIKDSNPVDKSKLDSQKAYIQITYVEPYFDTYELKDRVTYFDRNYGLRTFLFCTPFTP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_005 VEIIKDSNPVDKSKLDSQKAYIQITYVEPYFDTYELKDRVTYFDRNYGLRTFLFCTPFTP 1870 1880 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_006 ESAISDDILSPDEEGFCSGKHFTELGLVGLLEQAAGYFTMGGLYEAVNEVYKNLIPILEA 770 780 790 800 810 820 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KA1 HRDYKKLAAVHGKLQEAFTKIMHQSSGWERVFGTYFRVGFYGAHFGDLDEQEFVYKEPSI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_006 HRDYKKLAAVHGKLQEAFTKIMHQSSGWERVFGTYFRVGFYGAHFGDLDEQEFVYKEPSI 830 840 850 860 870 880 1780 1790 1800 1810 1820 1830 pF1KA1 TKLAEISHRLEEFYTERFGDDVVEIIKDSNPVDKSKLDSQKAYIQITYVEPYFDTYELKD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_006 TKLAEISHRLEEFYTERFGDDVVEIIKDSNPVDKSKLDSQKAYIQITYVEPYFDTYELKD 890 900 910 920 930 940 1840 1850 1860 1870 1880 1890 pF1KA1 RVTYFDRNYGLRTFLFCTPFTPDGRAHGELPEQHKRKTLLSTDHAFPYIKTRIRVCHREE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_006 RVTYFDRNYGLRTFLFCTPFTPDGRAHGELPEQHKRKTLLSTDHAFPYIKTRIRVCHREE 950 960 970 980 990 1000 1900 1910 1920 1930 1940 1950 pF1KA1 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XP_011 MTHLNSLDVQLAQELGDFTDDDLDVVFTPKECRTLQPSLPEE 10 20 30 40 110 120 130 140 150 160 pF1KA1 E-KLDAQVRAAVEMYIEDWVIVHRRYQYLSAAYSPVTTDTQRERQKGLPRQVFEQDASGD .:: .:: :. ::..:.::.:. : . : .... .: ::.:.::... XP_011 GVELDPHVRDCVQTYIREWLIVNRKNQGSPEICGFKKTGSRKDFHKTLPKQTFESETL-- 50 60 70 80 90 100 170 180 190 200 210 220 pF1KA1 ERSGPEDSNDSRRGSGSPEDTPRSSGASSIFDLRNLAADSLLPSLLERAAPEDVDRRNET : : : . :. . . . .. .. ::::.: :. : .::.... :: ...:: XP_011 ECSEPAAQAGPRHLNVLCDVSGKGPVTACDFDLRSLQPDKRLENLLQQVSAEDFEKQNEE 110 120 130 140 150 160 230 240 250 260 270 280 pF1KA1 LRRQHRPPALLTLYPAPDEDEAVERCSRPEPPREHFGQRILVKCLSLKFEIEIEPIFGIL :: .: :..:::. ::..::: :: :.::.:.::::: :.:::::::::.:. . XP_011 ARRTNRQAELFALYPSVDEEDAVEIRPVPECPKEHLGNRILVKLLTLKFEIEIEPLFASI 170 180 190 200 210 220 290 300 310 320 330 340 pF1KA1 ALYDVREKKKISENFYFDLNSDSMKGLLRAHGTHPAISTLARSAIFSVTYPSPDIFLVIK :::::.:.:::::::. :::::..::.:::: : :. ::::.::::::: ::.::.: XP_011 ALYDVKERKKISENFHCDLNSDQFKGFLRAHTPSVAASSQARSAVFSVTYPSSDIYLVVK 230 240 250 260 270 280 350 360 370 380 390 400 pF1KA1 LEKVLQQGDISECCEPYMVLKEVDTAKNKEKLEKLRLAAEQFCTRLGRYRMPFAWTAVHL .:::::::.:..: ::: :.:: : .:.:::.:::.: ::.:: :::.:::::::. . : XP_011 IEKVLQQGEIGDCAEPYTVIKESDGGKSKEKIEKLKLQAESFCQRLGKYRMPFAWAPISL 290 300 310 320 330 340 410 420 430 440 450 pF1KA1 ANI--VSSAGQ--LDRDS----DSEGERRPAWTDRRRRGPQDRASSGDDACSFSGFRPAT ... ::. . : :: .: :::: .:: ..:: : .. :.:. .: XP_011 SSFFNVSTLEREVTDVDSVVGRSSVGERRTLAQSRRL---SERALSLEENGVGSNFKTST 350 360 370 380 390 460 470 480 490 500 510 pF1KA1 LTVTNFFKQEAERLSDEDLFKFLADMRRPSSLLRRLRPVTAQLKIDISPAPENPHFCLSP :.:..:::::..:::::::::::::..: ::: ::.. . . :...:: ::: . ::.: XP_011 LSVSSFFKQEGDRLSDEDLFKFLADYKRSSSLQRRVKSIPGLLRLEISTAPEIINCCLTP 400 410 420 430 440 450 520 530 540 550 560 570 pF1KA1 ELLHIKPYPDPRGRPTKEILEFPAREVYAPHTSYRNLLYVYPHSLNFSSRQGSVRNLAVR :.: .::.:. : :: :::::::.::::.::: :::::::::. ::: .. .:.::.... 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