Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1405
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1405, 1029 aa
1>>>pF1KA1405 1029 - 1029 aa - 1029 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0758+/-0.00102; mu= 9.8572+/- 0.061
mean_var=159.3735+/-31.822, 0's: 0 Z-trim(109.9): 84 B-trim: 2 in 1/50
Lambda= 0.101594
statistics sampled from 11097 (11181) to 11097 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.684), E-opt: 0.2 (0.343), width: 16
Scan time: 5.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS213.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1029) 6683 992.3 0
CCDS44079.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1028) 6666 989.8 0
CCDS72722.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 ( 929) 5991 890.8 0
CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20 ( 747) 1508 233.7 1.1e-60
CCDS75295.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 702) 1489 230.9 7.4e-60
CCDS34235.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 699) 1484 230.1 1.2e-59
CCDS75296.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 726) 1461 226.8 1.3e-58
CCDS14401.1 KIF4A gene_id:24137|Hs108|chrX (1232) 1019 162.1 6.4e-39
CCDS47324.1 KIF4B gene_id:285643|Hs108|chr5 (1234) 1015 161.5 9.7e-39
CCDS11065.1 KIF1C gene_id:10749|Hs108|chr17 (1103) 919 147.4 1.5e-34
CCDS68768.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2580) 914 146.9 5.1e-34
CCDS34042.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2701) 914 146.9 5.3e-34
CCDS112.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1153) 897 144.2 1.5e-33
CCDS111.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1770) 897 144.3 2.1e-33
CCDS55217.1 KIF13B gene_id:23303|Hs108|chr8 (1826) 884 142.4 8e-33
CCDS1719.1 KIF3C gene_id:3797|Hs108|chr2 ( 793) 867 139.7 2.3e-32
CCDS47380.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1749) 864 139.5 5.9e-32
CCDS54967.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1757) 864 139.5 5.9e-32
CCDS54968.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1770) 864 139.5 6e-32
CCDS47381.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1805) 864 139.5 6.1e-32
CCDS8945.1 KIF5A gene_id:3798|Hs108|chr12 (1032) 859 138.6 6.4e-32
CCDS74586.1 KIF5C gene_id:3800|Hs108|chr2 ( 957) 848 137.0 1.8e-31
CCDS7171.1 KIF5B gene_id:3799|Hs108|chr10 ( 963) 833 134.8 8.5e-31
CCDS45709.2 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 ( 852) 775 126.3 2.8e-28
CCDS7422.1 KIF11 gene_id:3832|Hs108|chr10 (1056) 772 125.9 4.5e-28
CCDS7867.1 KIF18A gene_id:81930|Hs108|chr11 ( 898) 762 124.4 1.1e-27
CCDS45494.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 687) 758 123.7 1.3e-27
CCDS4844.1 KIF6 gene_id:221458|Hs108|chr6 ( 814) 759 123.9 1.4e-27
CCDS81988.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 724) 758 123.7 1.4e-27
CCDS45493.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 826) 758 123.8 1.5e-27
CCDS10789.2 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 833) 758 123.8 1.5e-27
CCDS81989.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 848) 758 123.8 1.6e-27
CCDS58555.1 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 ( 833) 755 123.3 2.1e-27
CCDS2751.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 725) 753 123.0 2.3e-27
CCDS2752.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 790) 753 123.0 2.4e-27
CCDS33744.1 KIF15 gene_id:56992|Hs108|chr3 (1388) 743 121.7 1.1e-26
CCDS81987.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 684) 733 120.1 1.7e-26
CCDS32718.2 KIF19 gene_id:124602|Hs108|chr17 ( 998) 728 119.4 3.7e-26
CCDS32325.2 KIF7 gene_id:374654|Hs108|chr15 (1343) 675 111.7 1e-23
CCDS10653.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 ( 665) 661 109.5 2.4e-23
CCDS58444.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 ( 597) 651 108.0 6.1e-23
CCDS58949.1 KIF2A gene_id:3796|Hs108|chr5 ( 686) 620 103.5 1.6e-21
CCDS3980.2 KIF2A gene_id:3796|Hs108|chr5 ( 706) 620 103.5 1.6e-21
CCDS30963.1 KIF14 gene_id:9928|Hs108|chr1 (1648) 623 104.2 2.4e-21
CCDS47216.1 KIF2A gene_id:3796|Hs108|chr5 ( 744) 594 99.7 2.4e-20
CCDS72774.1 KIF2C gene_id:11004|Hs108|chr1 ( 671) 592 99.4 2.7e-20
CCDS512.1 KIF2C gene_id:11004|Hs108|chr1 ( 725) 592 99.4 2.9e-20
CCDS6427.1 KIFC2 gene_id:90990|Hs108|chr8 ( 838) 582 98.0 9e-20
CCDS6801.1 KIF12 gene_id:113220|Hs108|chr9 ( 513) 565 95.4 3.4e-19
CCDS32685.1 KIF2B gene_id:84643|Hs108|chr17 ( 673) 561 94.8 6.3e-19
>>CCDS213.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1029 aa)
initn: 6683 init1: 6683 opt: 6683 Z-score: 5299.9 bits: 992.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6683; 99.7% identity (99.9% similar) in 1029 aa overlap (1-1029:1-1029)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MASEAVKVVVRCRPMNQRERELRCQPVVTVDCARAQCCIQNPGAADEPPKQFTFDGAYHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 MASEAVKVVVRCRPMNQRERELRCQPVVTVDCARAQCCIQNPGAADEPPKQFTFDGAYHV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 DHVTEQIYNEIAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGLPDPPSQRGIIPRAFEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 DHVTEQIYNEIAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGLPDPPSQRGIIPRAFEH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 VFESVQCAENTKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVYVKGLSMHTVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 VFESVQCAENTKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVYVKGLSMHTVH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDHLRAGKLNLVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 SVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDHLRAGKLNLVD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 LAGSERQSKTGATGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGRCKHVPYRDSKLTRLLQDSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 LAGSERQSKTGATGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGRCKHVPYRDSKLTRLLQDSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 GGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYANRAKNIRNKPRINEDPKDALLREYQEEIKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 GGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYANRAKNIRNKPRINEDPKDALLREYQEEIKKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 KAILTQQMSPSSLSALLSRQVPPDPVQVEEKLLPQPVIQHDMEAEKQLIREEYEERLARL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS21 KAILTQQMSPSSLSALLSRQVPPDPVQVEEKLLPQPVIQHDVEAEKQLIREEYEERLARL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 KADYKAEQESRARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRKETEAVLQVGVLYKAEVMSRAEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 KADYKAEQESRARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRKETEAVLQVGVLYKAEVMSRAEF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 ASSAEYPPAFQYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFAELPKVEPSKSEISLGSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 ASSAEYPPAFQYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFAELPKVEPSKSEISLGSSE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SSSLEETSVSEAFPGPEEPSNVEVSMPTEESRSRYFLDECLGQEAAGHLLGEQNYLPQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 SSSLEETSVSEAFPGPEEPSNVEVSMPTEESRSRYFLDECLGQEAAGHLLGEQNYLPQEE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 PQEVPLQGLLGLQDPFAEVEAKLARLSSTVARTDAPQADVPKVPVQVPAPTDLLEPSDAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 PQEVPLQGLLGLQDPFAEVEAKLARLSSTVARTDAPQADVPKVPVQVPAPTDLLEPSDAR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 PEAEAADDFPPRPEVDLASEVALEVVRTAEPGVWLEAQAPVALVAQPEPLPATAGVKRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 PEAEAADDFPPRPEVDLASEVALEVVRTAEPGVWLEAQAPVALVAQPEPLPATAGVKRES
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 VGMEVAVLTDDPLPVVDQQQVLARLQLLEQQVVGGEQAKNKDLKEKHKRRKRYADERRKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 VGMEVAVLTDDPLPVVDQQQVLARLQLLEQQVVGGEQAKNKDLKEKHKRRKRYADERRKQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 LVAALQNSDEDSGDWVLLNVYDSIQEEVRAKSKLLEKMQRKLRAAEVEIKDLQSEFQLEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 LVAALQNSDEDSGDWVLLNVYDSIQEEVRAKSKLLEKMQRKLRAAEVEIKDLQSEFQLEK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 IDYLATIRRQERDSMLLQQLLEQVQPLIRRDCNYSNLEKILRESCWDEDNGFWKIPHPVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 IDYLATIRRQERDSMLLQQLLEQVQPLIRRDCNYSNLEKILRESCWDEDNGFWKIPHPVI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 TKTSLPVAVSTGPQNKPARKTSAADNGEPNMEEDRYRLMLSRSNSENIASNYFRSKWASQ
::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: :::
CCDS21 TKTSLPVAVSTGPQNKPARKTSAADNGEPNMEDDRYRLMLSRSNSENIASNYFRSKRASQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 ILSTDARKSLTHHNSPPGLSCPLSNNSAIPPTQAPEMPQPRPFRLESLDIPFTKAKRKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 ILSTDARKSLTHHNSPPGLSCPLSNNSAIPPTQAPEMPQPRPFRLESLDIPFTKAKRKKS
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 KSNFGSEPL
:::::::::
CCDS21 KSNFGSEPL
>>CCDS44079.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1028 aa)
initn: 6664 init1: 5887 opt: 6666 Z-score: 5286.4 bits: 989.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6666; 99.6% identity (99.8% similar) in 1029 aa overlap (1-1029:1-1028)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MASEAVKVVVRCRPMNQRERELRCQPVVTVDCARAQCCIQNPGAADEPPKQFTFDGAYHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MASEAVKVVVRCRPMNQRERELRCQPVVTVDCARAQCCIQNPGAADEPPKQFTFDGAYHV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 DHVTEQIYNEIAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGLPDPPSQRGIIPRAFEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DHVTEQIYNEIAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGLPDPPSQRGIIPRAFEH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 VFESVQCAENTKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVYVKGLSMHTVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VFESVQCAENTKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVYVKGLSMHTVH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 SVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDHLRAGKLNLVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDHLRAGKLNLVD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 LAGSERQSKTGATGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGRCKHVPYRDSKLTRLLQDSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LAGSERQSKTGATGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGRCKHVPYRDSKLTRLLQDSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 GGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYANRAKNIRNKPRINEDPKDALLREYQEEIKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYANRAKNIRNKPRINEDPKDALLREYQEEIKKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 KAILTQQMSPSSLSALLSRQVPPDPVQVEEKLLPQPVIQHDMEAEKQLIREEYEERLARL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS44 KAILTQQMSPSSLSALLSRQVPPDPVQVEEKLLPQPVIQHDVEAEKQLIREEYEERLARL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 KADYKAEQESRARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRKETEAVLQVGVLYKAEVMSRAEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KADYKAEQESRARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRKETEAVLQVGVLYKAEVMSRAEF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 ASSAEYPPAFQYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFAELPKVEPSKSEISLGSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ASSAEYPPAFQYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFAELPKVEPSKSEISLGSSE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SSSLEETSVSEAFPGPEEPSNVEVSMPTEESRSRYFLDECLGQEAAGHLLGEQNYLPQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SSSLEETSVSEAFPGPEEPSNVEVSMPTEESRSRYFLDECLGQEAAGHLLGEQNYLPQEE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 PQEVPLQGLLGLQDPFAEVEAKLARLSSTVARTDAPQADVPKVPVQVPAPTDLLEPSDAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PQEVPLQGLLGLQDPFAEVEAKLARLSSTVARTDAPQADVPKVPVQVPAPTDLLEPSDAR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 PEAEAADDFPPRPEVDLASEVALEVVRTAEPGVWLEAQAPVALVAQPEPLPATAGVKRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PEAEAADDFPPRPEVDLASEVALEVVRTAEPGVWLEAQAPVALVAQPEPLPATAGVKRES
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 VGMEVAVLTDDPLPVVDQQQVLARLQLLEQQVVGGEQAKNKDLKEKHKRRKRYADERRKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VGMEVAVLTDDPLPVVDQQQVLARLQLLEQQVVGGEQAKNKDLKEKHKRRKRYADERRKQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 LVAALQNSDEDSGDWVLLNVYDSIQEEVRAKSKLLEKMQRKLRAAEVEIKDLQSEFQLEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LVAALQNSDEDSGDWVLLNVYDSIQEEVRAKSKLLEKMQRKLRAAEVEIKDLQSEFQLEK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 IDYLATIRRQERDSMLLQQLLEQVQPLIRRDCNYSNLEKILRESCWDEDNGFWKIPHPVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IDYLATIRRQERDSMLLQQLLEQVQPLIRRDCNYSNLEKILRESCWDEDNGFWKIPHPVI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 TKTSLPVAVSTGPQNKPARKTSAADNGEPNMEEDRYRLMLSRSNSENIASNYFRSKWASQ
::::::: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: :::
CCDS44 TKTSLPV-VSTGPQNKPARKTSAADNGEPNMEDDRYRLMLSRSNSENIASNYFRSKRASQ
910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 ILSTDARKSLTHHNSPPGLSCPLSNNSAIPPTQAPEMPQPRPFRLESLDIPFTKAKRKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ILSTDARKSLTHHNSPPGLSCPLSNNSAIPPTQAPEMPQPRPFRLESLDIPFTKAKRKKS
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 KSNFGSEPL
:::::::::
CCDS44 KSNFGSEPL
1020
>>CCDS72722.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (929 aa)
initn: 5991 init1: 5991 opt: 5991 Z-score: 4752.4 bits: 890.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5991; 99.7% identity (99.9% similar) in 929 aa overlap (101-1029:1-929)
80 90 100 110 120 130
pF1KA1 IAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGLPDPPSQRGIIPRAFEHVFESVQCAEN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MQGLPDPPSQRGIIPRAFEHVFESVQCAEN
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KA1 TKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVYVKGLSMHTVHSVAQCEHIME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVYVKGLSMHTVHSVAQCEHIME
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KA1 TGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDHLRAGKLNLVDLAGSERQSKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDHLRAGKLNLVDLAGSERQSKT
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KA1 GATGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGRCKHVPYRDSKLTRLLQDSLGGNTKTLMVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GATGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGRCKHVPYRDSKLTRLLQDSLGGNTKTLMVA
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KA1 CLSPADNNYDETLSTLRYANRAKNIRNKPRINEDPKDALLREYQEEIKKLKAILTQQMSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 CLSPADNNYDETLSTLRYANRAKNIRNKPRINEDPKDALLREYQEEIKKLKAILTQQMSP
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 SSLSALLSRQVPPDPVQVEEKLLPQPVIQHDMEAEKQLIREEYEERLARLKADYKAEQES
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SSLSALLSRQVPPDPVQVEEKLLPQPVIQHDVEAEKQLIREEYEERLARLKADYKAEQES
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 RARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRKETEAVLQVGVLYKAEVMSRAEFASSAEYPPAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRKETEAVLQVGVLYKAEVMSRAEFASSAEYPPAF
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 QYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFAELPKVEPSKSEISLGSSESSSLEETSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFAELPKVEPSKSEISLGSSESSSLEETSVS
400 410 420 430 440 450
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 EAFPGPEEPSNVEVSMPTEESRSRYFLDECLGQEAAGHLLGEQNYLPQEEPQEVPLQGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EAFPGPEEPSNVEVSMPTEESRSRYFLDECLGQEAAGHLLGEQNYLPQEEPQEVPLQGLL
460 470 480 490 500 510
620 630 640 650 660 670
pF1KA1 GLQDPFAEVEAKLARLSSTVARTDAPQADVPKVPVQVPAPTDLLEPSDARPEAEAADDFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GLQDPFAEVEAKLARLSSTVARTDAPQADVPKVPVQVPAPTDLLEPSDARPEAEAADDFP
520 530 540 550 560 570
680 690 700 710 720 730
pF1KA1 PRPEVDLASEVALEVVRTAEPGVWLEAQAPVALVAQPEPLPATAGVKRESVGMEVAVLTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PRPEVDLASEVALEVVRTAEPGVWLEAQAPVALVAQPEPLPATAGVKRESVGMEVAVLTD
580 590 600 610 620 630
740 750 760 770 780 790
pF1KA1 DPLPVVDQQQVLARLQLLEQQVVGGEQAKNKDLKEKHKRRKRYADERRKQLVAALQNSDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 DPLPVVDQQQVLARLQLLEQQVVGGEQAKNKDLKEKHKRRKRYADERRKQLVAALQNSDE
640 650 660 670 680 690
800 810 820 830 840 850
pF1KA1 DSGDWVLLNVYDSIQEEVRAKSKLLEKMQRKLRAAEVEIKDLQSEFQLEKIDYLATIRRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 DSGDWVLLNVYDSIQEEVRAKSKLLEKMQRKLRAAEVEIKDLQSEFQLEKIDYLATIRRQ
700 710 720 730 740 750
860 870 880 890 900 910
pF1KA1 ERDSMLLQQLLEQVQPLIRRDCNYSNLEKILRESCWDEDNGFWKIPHPVITKTSLPVAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ERDSMLLQQLLEQVQPLIRRDCNYSNLEKILRESCWDEDNGFWKIPHPVITKTSLPVAVS
760 770 780 790 800 810
920 930 940 950 960 970
pF1KA1 TGPQNKPARKTSAADNGEPNMEEDRYRLMLSRSNSENIASNYFRSKWASQILSTDARKSL
::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS72 TGPQNKPARKTSAADNGEPNMEDDRYRLMLSRSNSENIASNYFRSKRASQILSTDARKSL
820 830 840 850 860 870
980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 THHNSPPGLSCPLSNNSAIPPTQAPEMPQPRPFRLESLDIPFTKAKRKKSKSNFGSEPL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 THHNSPPGLSCPLSNNSAIPPTQAPEMPQPRPFRLESLDIPFTKAKRKKSKSNFGSEPL
880 890 900 910 920
>>CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20 (747 aa)
initn: 1648 init1: 1377 opt: 1508 Z-score: 1202.7 bits: 233.7 E(32554): 1.1e-60
Smith-Waterman score: 1517; 40.5% identity (65.8% similar) in 693 aa overlap (2-689:6-687)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MASEAVKVVVRCRPMNQRERELRCQPVVTVDCARAQCCIQNP-GAADEPPKQFTFD
.::.:.::::::::: .:. . :: :: .: ..:: :.: : :: ::::
CCDS13 MSKLKSSESVRVVVRCRPMNGKEKAASYDKVVDVDVKLGQVSVKNPKGTAHEMPKTFTFD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 GAYHVDHVTEQIYNEIAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGLPDPPSQRGIIP
..: . ..:.: :::..: .:.:::::::::::.::..::.:. : .::.::
CCDS13 AVYDWNAKQFELYDETFRPLVDSVLQGFNGTIFAYGQTGTGKTYTMEGIRGDPEKRGVIP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 RAFEHVFESVQCAENTKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVYVKGLS
.:.:.: .. ..: ..::::::::::.:..::::. : ..:::::.:. ::::: ::
CCDS13 NSFDHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKDQTKRLELKERPDTGVYVKDLS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 MHTVHSVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDHLRAGK
...:: . ::.:..: .::::: : ::. :::::.::.:.:: : : :..:.:.::
CCDS13 SFVTKSVKEIEHVMNVGNQNRSVGATNMNEHSSRSHAIFVITIECSEVGLDGENHIRVGK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 LNLVDLAGSERQSKTGATGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGRCKHVPYRDSKLTRL
::::::::::::.:::: :::::::::::::::::::::::::::. :.::::::::::
CCDS13 LNLVDLAGSERQAKTGAQGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGKSTHIPYRDSKLTRL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 LQDSLGGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYANRAKNIRNKPRINEDPKDALLREYQE
::::::::.::.::: ..::. : .:::.:::::::::::.::::.:::::::::::.::
CCDS13 LQDSLGGNAKTVMVANVGPASYNVEETLTTLRYANRAKNIKNKPRVNEDPKDALLREFQE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 EIKKLKAILTQQMSPSSLSALLSRQVPPDPVQVEEKLLPQPVIQHDMEAEKQLIREEYEE
:: .::: : .. :. . ::. ... . . . ::. :
CCDS13 EIARLKAQLEKRSIGRRKRREKRREGGGSGGGGEEEEEEGEEGEEEGDDKDDYWREQQE-
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 RLARLKADYKAEQESRARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRKETEAVLQVGVLYKAEVM
.:. . .: :... . :. . . . .. :.::.: .:. ..:. :: .
CCDS13 ---KLEIEKRAIVEDHSLVAEEKMRLLKEKEKKM----EDLRREKDAAEMLGAKIKA-ME
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 SRAEFASSAEYPPAFQYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFAELPKVEPSKSEIS
:. ... . . . ... : .. . . :. :: : ... . : ..
CCDS13 SKLLVGGKNIVDHTNEQQKILEQKRQEIAEQKRREREIQQQMESRDEETLELKETYSSLQ
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 LGSSESSSLEETSVSEAFPGPEEPSNVEVSMPTEESRSRYFLDECLGQEAAGHLLGEQNY
. ... . :. : ... :... . .: . ::. : :.
CCDS13 QEVDIKTKKLKKLFSKLQAVKAEIHDLQEEHIKERQELEQTQNELTRELKLKHLIIE-NF
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 LPQEEPQEVPLQGLLGLQDPFAEVEAKLARLSSTVARTDAPQADVPKVPVQVPAPTDLLE
.: :: ... .... .. ... ..:: . .: : :.. : ...
CCDS13 IPLEEKSKIMNRAFFDEEEDHWKLHP-ITRLENQQMMKRPVSAVGYKRPLSQHARMSMMI
600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 PSDARPEAEAAD----DFPPRPEVDLASEVALEVVRTAEPGVWLEAQAPVALVAQPEPLP
.:: .:: :.: : : . . :..:
CCDS13 RPEARYRAENIVLLELDMPSRTTRDYEGPAIAPKVQAALDAALQDEDEIQVDASSFESTA
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 ATAGVKRESVGMEVAVLTDDPLPVVDQQQVLARLQLLEQQVVGGEQAKNKDLKEKHKRRK
CCDS13 NKKSKARPKSGRKSGSSSSSSGTPASQLYPQSRGLVPK
710 720 730 740
>>CCDS75295.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 (702 aa)
initn: 1546 init1: 1045 opt: 1489 Z-score: 1188.1 bits: 230.9 E(32554): 7.4e-60
Smith-Waterman score: 1489; 51.7% identity (75.9% similar) in 489 aa overlap (4-485:13-494)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MASEAVKVVVRCRPMNQRERELRCQPVVTVDCARAQCCIQNPGAADEPPKQ
. :::::::::.:.::. . . .:.:: :. ... ...::::
CCDS75 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGTITVHKTDSSNEPPKT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 FTFDGAYHVDHVTEQIYNEIAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGLPDPPSQR
:::: .. . ..:: : :....: ::::::::::::::.::.:::.:. : :
CCDS75 FTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIPELR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 GIIPRAFEHVFESVQCAE-NTKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVY
:::: .: :.: . :: .:.::::.::::::::.:::::: : :.::.::.:. :::
CCDS75 GIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDVGVY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 VKGLSMHTVHSVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDH
.: :: ..:... . ..:: : :::::: : ::. :::::.::::.:: : :. :
CCDS75 IKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDGNMH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 LRAGKLNLVDLAGSERQSKTGATGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGRCKHVPYRDS
.: :::.::::::::::.::::::.:::::::::::::.:::::::::::. :::::.:
CCDS75 VRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRNS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 KLTRLLQDSLGGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYANRAKNIRNKPRINEDPKDALL
:::::::::::::.::.: : ..::: :::::.::::::::::::.:: :::::::::::
CCDS75 KLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARINEDPKDALL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KA1 REYQEEIKKLKAILTQ--QMSPSSLSALLSRQVPPDPVQVEEKLLPQPVIQHDMEAEKQL
:..:.::..:: : . ..: :..:. :.. . .: : . ..:. ..:..
CCDS75 RQFQKEIEELKKKLEEGEEISGSDISG--SEEDDDEEGEVGEDGEKRKK-RRDQAGKKKV
370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 IREEYEERLARLKADYKAEQESRARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRK---ETEAVLQ
... : :.. . :: :.. .::. ::. ..: :..: : : ...:.
CCDS75 SPDKMIEMQAKIDEERKA-LETKLDMEEE---ERNKARAELEKREKDLLKAQQEHQSLLE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 -VGVLYKAEVMSRAEFASSAEYPPAFQYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFAEL
...: : ... ... ..::
CCDS75 KLSALEKKVIVGGVDLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKRAEQLRRELEEKEQERLDIEE
480 490 500 510 520 530
>>CCDS34235.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 (699 aa)
initn: 1546 init1: 1045 opt: 1484 Z-score: 1184.1 bits: 230.1 E(32554): 1.2e-59
Smith-Waterman score: 1484; 51.3% identity (73.3% similar) in 491 aa overlap (4-485:13-503)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MASEAVKVVVRCRPMNQRERELRCQPVVTVDCARAQCCIQNPGAADEPPKQ
. :::::::::.:.::. . . .:.:: :. ... ...::::
CCDS34 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGTITVHKTDSSNEPPKT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 FTFDGAYHVDHVTEQIYNEIAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGLPDPPSQR
:::: .. . ..:: : :....: ::::::::::::::.::.:::.:. : :
CCDS34 FTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIPELR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 GIIPRAFEHVFESVQCAE-NTKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVY
:::: .: :.: . :: .:.::::.::::::::.:::::: : :.::.::.:. :::
CCDS34 GIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDVGVY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 VKGLSMHTVHSVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDH
.: :: ..:... . ..:: : :::::: : ::. :::::.::::.:: : :. :
CCDS34 IKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDGNMH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 LRAGKLNLVDLAGSERQSKTGATGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGRCKHVPYRDS
.: :::.::::::::::.::::::.:::::::::::::.:::::::::::. :::::.:
CCDS34 VRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRNS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 KLTRLLQDSLGGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYANRAKNIRNKPRINEDPKDALL
:::::::::::::.::.: : ..::: :::::.::::::::::::.:: :::::::::::
CCDS34 KLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARINEDPKDALL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KA1 REYQEEIKKLKAILTQ--QMSPSSLSALLSR-----QVPPDPVQVEEKLLPQPVIQHDME
:..:.::..:: : . ..: :..:. .: : . ... . : :
CCDS34 RQFQKEIEELKKKLEEGEEISGSDISGSEEDDDEEGEVGEDGEKRKKRRGKKKVSPDKMI
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 AEKQLIREEYEERLARLKADYKAEQESRARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRKETEAV
. : :: . ..: . . ....::.::. . .. . . : ::. : ...
CCDS34 EMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARAELEKREKDLLKAQQEHQSLLEKLSALEKKVI
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 LQ-VGVLYKAEVMSRAEFASSAEYPPAFQYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFA
. : .: ::: . . :. :
CCDS34 VGGVDLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKRAEQLRRELEEKEQERLDIEEKYTSLQEEAQ
490 500 510 520 530 540
>>CCDS75296.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 (726 aa)
initn: 1546 init1: 1045 opt: 1461 Z-score: 1165.7 bits: 226.8 E(32554): 1.3e-58
Smith-Waterman score: 1461; 51.9% identity (75.3% similar) in 470 aa overlap (4-465:13-479)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MASEAVKVVVRCRPMNQRERELRCQPVVTVDCARAQCCIQNPGAADEPPKQ
. :::::::::.:.::. . . .:.:: :. ... ...::::
CCDS75 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGTITVHKTDSSNEPPKT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 FTFDGAYHVDHVTEQIYNEIAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGLPDPPSQR
:::: .. . ..:: : :....: ::::::::::::::.::.:::.:. : :
CCDS75 FTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIPELR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 GIIPRAFEHVFESVQCAE-NTKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVY
:::: .: :.: . :: .:.::::.::::::::.:::::: : :.::.::.:. :::
CCDS75 GIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDVGVY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 VKGLSMHTVHSVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDH
.: :: ..:... . ..:: : :::::: : ::. :::::.::::.:: : :. :
CCDS75 IKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDGNMH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 LRAGKLNLVDLAGSERQSKTGATGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGRCKHVPYRDS
.: :::.::::::::::.::::::.:::::::::::::.:::::::::::. :::::.:
CCDS75 VRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRNS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 KLTRLLQDSLGGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYANRAKNIRNKPRINEDPKDALL
:::::::::::::.::.: : ..::: :::::.::::::::::::.:: :::::::::::
CCDS75 KLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARINEDPKDALL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KA1 REYQEEIKKLKAILTQ--QMSPSSLSALLSRQVPPDPVQVEE-----KLLPQPVIQHDME
:..:.::..:: : . ..: :..:. :.. . .: : : . . .
CCDS75 RQFQKEIEELKKKLEEGEEISGSDISG--SEEDDDEEGEVGEDGEKRKKRRGSSSSSSSD
370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 AEKQLIREEYEERLARLKADYKAEQESRARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRKETEAV
. ..:.. .. : . :. .. ... : :.. ...:. .::. :....:
CCDS75 STCSVIEKPLDKFLPNQAGKKKVSPDKMIEMQAKIDEERKALETKLD-MEEEERNKARAE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 LQVGVLYKAEVMSRAEFASSAEYPPAFQYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFAE
:.
CCDS75 LEKREKDLLKAQQEHQSLLEKLSALEKKVIVGGVDLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKR
480 490 500 510 520 530
>>CCDS14401.1 KIF4A gene_id:24137|Hs108|chrX (1232 aa)
initn: 688 init1: 362 opt: 1019 Z-score: 812.2 bits: 162.1 E(32554): 6.4e-39
Smith-Waterman score: 1033; 27.2% identity (57.6% similar) in 1072 aa overlap (6-1010:10-1041)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MASEAVKVVVRCRPMNQRERELRCQPVVTVDCARAQCCIQNPGAADEPPKQFTFDG
:.:..::::. .: :: .. .. : . ..: :.::.:
CCDS14 MKEEVKGIPVRVALRCRPLVPKEISEGCQMCLSFVPGEPQVVV----GTD---KSFTYDF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 AYHVDHVTEQIYNEIAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGLPDPPSQR----G
.. . :...: . ::..:: .:::.:..:::::::::...: : .. :
CCDS14 VFDPSTEQEEVFNTAVAPLIKGVFKGYNATVLAYGQTGSGKTYSMGGAYTAEQENEPTVG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 IIPRAFEHVFESVQCAENTKFLVRASYLEIYNEDVRDLL-GADTKQKLELKEHPEKGVYV
.:::... .:. .. . .: ...::::::::.. ::: . : .....: :..:. .
CCDS14 VIPRVIQLLFKEIDKKSDFEFTLKVSYLEIYNEEILDLLCPSREKAQINIREDPKEGIKI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 KGLSMHTVHSVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDHL
::. .:: . . .: : ..:.:. : ::..:::::.:::::.:. ...... .
CCDS14 VGLTEKTVLVALDTVSCLEQGNNSRTVASTAMNSQSSRSHAIFTISLEQRKKSDKNSS-F
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 RAGKLNLVDLAGSERQSKTGATGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGRCK-HVPYRDS
:. ::.::::::::::.:: : :.::::. .:: .: :::::::: : . ::::::
CCDS14 RS-KLHLVDLAGSERQKKTKAEGDRLKEGININRGLLCLGNVISALGDDKKGGFVPYRDS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 KLTRLLQDSLGGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYANRAKNIRNKPRINEDPKDALL
:::::::::::::..:::.::.::::.: .:::.:::::.::..:.::: .: ::. : :
CCDS14 KLTRLLQDSLGGNSHTLMIACVSPADSNLEETLNTLRYADRARKIKNKPIVNIDPQTAEL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KA1 REYQEEIKKLKAILTQQMSPSSLSALLSRQVPPDPVQVEEKLLP--QPVIQHDMEAEKQL
. ......:...: : . . : .. .: . ..:. : ..... . . :
CCDS14 NHLKQQVQQLQVLLLQAHGGT-----LPGSITVEPSENLQSLMEKNQSLVEENEKLSRGL
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 IRE--EYEERLARLKADYKAEQESRARLEEDITAMRNSYDVR--LSTLEEN-LRKETEAV
. . . : :. .:... :.::: . :.. . :::.. :....: .
CCDS14 SEAAGQTAQMLERIILTEQANEKMNAKLEELRQHAACKLDLQKLVETLEDQELKENVEII
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 LQVGVLYKAEVMSRAEFASSAEYPPAFQYETVVK--PKVFSTTDTLPSDD-VSKTQVSSR
.. : ... ... .: : . :. :. :.. ..:.. .. . ..:.:..
CCDS14 CNLQQLI-TQLSDETVACMAAAIDTAVEQEAQVETSPETSRSSDAFTTQHALRQAQMSKE
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 FAELPKVEPSKSEISLGSSESSSLEETSVSEAFPGPEEPSNVEVSMPTEESRSRYFLDEC
..:: :. : .. ....: . .. . . ..:: .:.. . .
CCDS14 LVELNKALALKEALARKMTQNDS-QLQPIQYQYQDNIKELELEVINLQKEKEELVLELQT
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630
pF1KA1 LGQEAAGHLLGEQ--NYLPQEEPQEVPLQGLLGLQDPFAEVEAKLARLSSTVARTDAPQA
..: :.:. . : . : : . :. :. :. . ... . : : . . . .
CCDS14 AKKDANQAKLSERRRKRLQELEGQIADLKKKLNEQSKLLKLKESTERTVSKLNQ-EIRMM
590 600 610 620 630 640
640 650 660 670 680
pF1KA1 DVPKVPV--QVPAPTDLLEPSDARPEAEAADDFPPRPEVDLASEVALE--------VVR-
.: . :. .. .. . . :. . . : . . :: :.:
CCDS14 KNQRVQLMRQMKEDAEKFRQWKQKKDKEVIQ-LKERDRKRQYELLKLERNFQKQSNVLRR
650 660 670 680 690 700
690 700 710 720 730
pF1KA1 -TAEPGVW-------LEAQAPVA---LVAQPEPLPATAGVKRESVGMEVAVLTDDPLPVV
: : .. :. : :: .: . . .::. .. .: :. :...
CCDS14 KTEEAAAANKRLKDALQKQREVADKRKETQSRGMEGTAARVKNWLGNEIEVMVSTEEAKR
710 720 730 740 750 760
740 750 760 770 780 790
pF1KA1 DQQQVLARLQLLEQQVVGGEQAKNKDLKEKHK-RRKRYA-DERRKQLVAALQNSDEDSGD
...: ..: :.:. .. :.. . : ::. .. : : :. . .:::
CCDS14 HLNDLLEDRKILAQDVAQLKEKKESGENPPPKLRRRTFSLTEVRGQV-----SESEDS--
770 780 790 800 810
800 810 820 830 840 850
pF1KA1 WVLLNVYDSIQEEVRAKSKLLEKMQRKLRAAEVEIKDLQSEFQLEKIDYLATIRRQERDS
. . .:.. :.. .: . .:.:: :: : . : . . .::: . .
CCDS14 --ITKQIESLETEMEFRSAQIADLQQKLLDAESEDRPKQ------RWENIATILEAK---
820 830 840 850 860
860 870 880 890 900 910
pF1KA1 MLLQQLLEQVQPLIRRDCNYSNLEKILRES---CWDEDNG-FWKIPHPVITKTSLPVAVS
:. : . :. . :.::. :..: : : .. : . : . .: : . .
CCDS14 CALKYL---IGELVSSKIQVSKLESSLKQSKTSCADMQKMLFEERNHFAEIETELQAELV
870 880 890 900 910 920
920 930 940 950
pF1KA1 TGPQNKPAR------KTSAADNGEPNMEE---DRYRLMLS--RSNSENIASNYFRSKWAS
:.. . . . .. .: ..:: .. . .:: . ..:.. . . .
CCDS14 RMEQQHQEKVLYLLSQLQQSQMAEKQLEESVSEKEQQLLSTLKCQDEELEKMREVCEQNQ
930 940 950 960 970 980
960 970 980 990 1000
pF1KA1 QILSTDA--RKSLT--------HHNSPPGLSCPLSNNSAIPPTQAPEMPQPRPFRLESLD
:.: . ...:: .: : : :. .:: : . . : .:.:
CCDS14 QLLRENEIIKQKLTLLQVASRQKHLPKDTLLSPDSSFEYVPPKPKPSRVKEK-FLEQSMD
990 1000 1010 1020 1030 1040
1010 1020
pF1KA1 IPFTKAKRKKSKSNFGSEPL
:
CCDS14 IEDLKYCSEHSVNEHEDGDGDDDEGDDEEWKPTKLVKVSRKNIQGCSCKGWCGNKQCGCR
1050 1060 1070 1080 1090 1100
>>CCDS47324.1 KIF4B gene_id:285643|Hs108|chr5 (1234 aa)
initn: 734 init1: 366 opt: 1015 Z-score: 809.0 bits: 161.5 E(32554): 9.7e-39
Smith-Waterman score: 1015; 37.2% identity (68.9% similar) in 540 aa overlap (6-524:10-529)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MASEAVKVVVRCRPMNQRERELRCQPVVTVDCARAQCCIQNPGAADEPPKQFTFDG
:.:..::::. .: :: .. ...: . ..: :.::.:
CCDS47 MKEEVKGIPVRVALRCRPLVPKEISEGCQMCLSFVPGETQVVV----GTD---KSFTYDF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KA1 AYHVDHVTEQ--IYNEIAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGL-----PDPPS
.. : ::: ..:. . ::..:. .:::.:..:::::::::...: : . :.
CCDS47 VF--DPCTEQEEVFNKAVAPLIKGIFKGYNATVLAYGQTGSGKTYSMGGAYTAEQENEPT
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 QRGIIPRAFEHVFESVQCAENTKFLVRASYLEIYNEDVRDLL-GADTKQKLELKEHPEKG
:::::... .:. .. . .: ...::::::::.. ::: . : .....: :..:
CCDS47 V-GIIPRVIQLLFKEIDKKSDFEFTLKVSYLEIYNEEILDLLCPSREKAQINIREDPKEG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 VYVKGLSMHTVHSVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGK
. . ::. .:: . . .: : ..:.:. : ::..:::::.:::::::. ....
CCDS47 IKIVGLTEKTVLVALDTVSCLEQGNNSRTVASTAMNSQSSRSHAIFTISIEQRKKSDKNC
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 DHLRAGKLNLVDLAGSERQSKTGATGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGRC-KHVPY
. .:. ::.::::::::::.:: : :.::::. .:: .: :::::::: : . . :::
CCDS47 S-FRS-KLHLVDLAGSERQKKTKAEGDRLKEGININRGLLCLGNVISALGDDKKGSFVPY
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 RDSKLTRLLQDSLGGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYANRAKNIRNKPRINEDPKD
::::::::::::::::..:::.::.::::.: .:::::::::.::..:.::: .: ::.
CCDS47 RDSKLTRLLQDSLGGNSHTLMIACVSPADSNLEETLSTLRYADRARKIKNKPIVNIDPHT
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 ALLREYQEEIKKLKAILTQQMS---PSSLSALLSRQVPPDPVQ-VEEKLLPQPVIQHDME
: : . ......:...: : . :.:..: : . .: . :: : ..... .
CCDS47 AELNHLKQQVQQLQVLLLQAHGGTLPGSINAE-----PSENLQSLMEK--NQSLVEENEK
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KA1 AEKQLIRE--EYEERLARLKADYKAEQESRARLEEDITAMRNSYDVR--LSTLEEN-LRK
. : . . . : :. ..... :.::: . . :.. . :::.. :..
CCDS47 LSRCLSKAAGQTAQMLERIILTEQVNEKLNAKLEELRQHVACKLDLQKLVETLEDQELKE
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 ETEAVLQVGVLYKAEVMSRAEFASSAEYPPAFQYETVVK--PKVFSTTDTLPSDD-VSKT
..: . .. : ... ... ..: : . :. :. :.. ..:.. .. . ..
CCDS47 NVEIICNLQQLI-TQLSDETVACTAAAIDTAVEEEAQVETSPETSRSSDAFTTQHALHQA
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 QVSSRFAELPKVEPSKSEISLGSSESSSLEETSVSEAFPGPEEPSNVEVSMPTEESRSRY
:.:.. .::
CCDS47 QMSKEVVELNNALALKEALVRKMTQNDNQLQPIQFQYQDNIKNLELEVINLQKEKEELVR
530 540 550 560 570 580
>>CCDS11065.1 KIF1C gene_id:10749|Hs108|chr17 (1103 aa)
initn: 1016 init1: 325 opt: 919 Z-score: 733.7 bits: 147.4 E(32554): 1.5e-34
Smith-Waterman score: 1035; 29.7% identity (54.0% similar) in 1064 aa overlap (1-1002:1-1013)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MASEAVKVVVRCRPMNQRERELRCQPVVTVDCARAQCCIQNPGAADEPPKQFTFDGAYHV
::. .:::.:: ::.: :: . ::... .. : :: . . ::.:::: .:
CCDS11 MAGASVKVAVRVRPFNARETSQDAKCVVSMQGNTTS--IINPKQSKDAPKSFTFDYSYWS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KA1 DHVTE--------QIYNEIAYPLVEGVTEGYNGTIFAYGQTGSGKSFTMQGLPDPPSQRG
:: :.: .:. .. . :::: ::::::::.:::.::.: .: .:.:
CCDS11 HTSTEDPQFASQQQVYRDIGEEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGRQEP-GQQG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 IIPRAFEHVFESVQCAENTK--FLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVY
:.:. : .: :. .... . :..::.::: : :::::. .. .:...::: : :
CCDS11 IVPQLCEDLFSRVSENQSAQLSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNPKSRGSLRVREHPILGPY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KA1 VKGLSMHTVHSVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDE-RGKD
:. :: .: : :. .:. : : :.:. : ::. :::::..::: . . :. : :
CCDS11 VQDLSKLAVTSYADIADLMDCGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTIVFTQRCHDQLTGLD
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 HLRAGKLNLVDLAGSERQSKTGATGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGRCKH-----
...:..::::::::: ...:: : ::::...:: ::..::.:::::.: . :.
CCDS11 SEKVSKISLVDLAGSERADSSGARGMRLKEGANINKSLTTLGKVISALADMQSKKRKSDF
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 VPYRDSKLTRLLQDSLGGNTKTLMVACLSPADNNYDETLSTLRYANRAKNIRNKPRINED
.::::: :: ::...::::..: :.: ::::: ::.:::::::::.:.:.:: . ::::
CCDS11 IPYRDSVLTWLLKENLGGNSRTAMIAALSPADINYEETLSTLRYADRTKQIRCNAIINED
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KA1 PKDALLREYQEEIKKLKAILTQQ-MSPSSLSALLSRQ-----------VPPDPVQVEEKL
:. :.:: :::. .:. .: : .: :.: .: ... :: ::.
CCDS11 PNARLIRELQEEVARLRELLMAQGLSASALEGLKTEEGSVRGALPAVSSPPAPVS-----
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 LPQPVIQHDMEAEKQLIREEYEERLARLKADYKAEQESRARLEEDITAMRNSYDVRLSTL
:. :. : : .. . : ... .: .. ::. :. :. . .... .:
CCDS11 -PSSPTTHNGELEPSF-SPNTESQIGPEEA-MERLQET----EKIIAELNETWEEKLRKT
420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 EENLRKETEAVL-QVGVLYKAEVMSRAEFASSAEYPPAFQYETVVKPKVFSTTDTLPSDD
: :: : ::.: ..:: . . . . : : . : . . : . .:
CCDS11 EA-LRMEREALLAEMGVAVREDGGTVGVF-SPKKTPHLVNLNE--DPLMSECLLYHIKDG
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560
pF1KA1 VSKTQVSSRFAELPKVEPSKSEISLGSSESSSLEETSVSEAFPGPEEPSNVE-VSMP-TE
:... . .: ... . : . . : . . : : : : . :. : .
CCDS11 VTRVGQVDMDIKLTGQFIREQHCLFRSIPQPDGEVVVTLEPCEGAETYVNGKLVTEPLVL
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610
pF1KA1 ESRSRYFLDEC----LGQEAAGHLLGEQNYLPQEEPQEVPL------QGLLGLQ--DPFA
.: .: . . ... ..: :.. : : :. . :: : :
CCDS11 KSGNRIVMGKNHVFRFNHPEQARLERERGVPPPPGPPSEPVDWNFAQKELLEQQGIDIKL
590 600 610 620 630 640
620 630 640 650 660 670
pF1KA1 EVEAKLARLSSTVARTDAPQADVPKVPVQVPAPTDLLEPSDARPEAEAADDFPPRPEVDL
:.: .: : . : . .::. .. : .: . :: : :. . :
CCDS11 EMEKRLQDLENQY-RKEKEEADLLLEQQRLYADSDSGDDSDKRSCEESWRLISSLREQLP
650 660 670 680 690 700
680 690 700 710 720 730
pF1KA1 ASEVALEVVRTAEPGVWLEAQAPVALVAQPEPLPATAGVKRESVGMEVAVLTDDPLPVVD
. : : : . :. . .:: . :. .:. : ::
CCDS11 PTTVQTIVKRCGLPSSG-KRRAPRRVYQIPQ--------RRRLQG-------KDP-----
710 720 730
740 750 760 770 780 790
pF1KA1 QQQVLARLQLLEQQVVGGEQAKNKDLKEKHKRRKRYADERRKQLVAALQNSDEDSGDW--
. ..: :.. . . : : :... . . . : . ..: . . : . :
CCDS11 RWATMADLKMQAVKEICYEVALA-DFRHGRAEIEALAALKMRELCRTYGKPDGPGDAWRA
740 750 760 770 780 790
800 810 820 830 840 850
pF1KA1 VLLNVYDSIQEEVRAKSKLLEKMQRKLRAAEVEIKDLQSEFQ-----LEKIDYLATIRRQ
: .:.:.. :: . . .. :.:::: ::..... :... . . .
CCDS11 VARDVWDTVGEEEGGGAGSGGGSEEGARGAEVE--DLRAHIDKLTGILQEVKLQNSSKDR
800 810 820 830 840 850
860 870 880 890 900
pF1KA1 E----RDSMLLQQLLEQVQPLIRRDCNYSNLEKILRESCWDEDNGFWKIPHPVITKTSLP
: :: :: .:.: :: . : . : : : : .: . . . . .:
CCDS11 ELQALRDRMLR---MERVIPLAQ-DHEDENEEG--GEVPWAPPEGS-EAAEEAAPSDRMP
860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 VAVSTGPQNKPARKTSAADNGEPNMEEDRYR------LMLSRSNSENIASNYFRSKWASQ
: .: . ...: . .: ... : : : :. .. . .. .: :
CCDS11 SARPPSPPLSSWERVSRLMEEDPAFRRGRLRWLKQEQLRLQGLQGSGGRGGGLRRPPARF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010
pF1KA1 ILSTDARKSLTHHNSPPGL-SCP-LSNNSAIPPTQAPEMPQPRPFRLESLDIPFTKAKRK
. : . . ...: : : .... : : : :: :.:
CCDS11 VPPHDCKLRFPFKSNPQHRESWPGMGSGEAPTPLQPPEEVTPHPATPARRPPSPRRSHHP
970 980 990 1000 1010 1020
1020
pF1KA1 KSKSNFGSEPL
CCDS11 RRNSLDGGGRSRGAGSAQPEPQHFQPKKHNSYPQPPQPYPAQRPPGPRYPPYTTPPRMRR
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1029 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 01:32:48 2016 done: Fri Nov 4 01:32:49 2016
Total Scan time: 5.350 Total Display time: 0.360
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]