FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1419, 2432 aa 1>>>pF1KA1419 2432 - 2432 aa - 2432 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.5085+/-0.00119; mu= -12.3593+/- 0.072 mean_var=397.1381+/-79.854, 0's: 0 Z-trim(112.1): 36 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.064358 statistics sampled from 12872 (12897) to 12872 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.396), width: 16 Scan time: 9.810 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7851.2 NAV2 gene_id:89797|Hs108|chr11 (2432) 15842 1486.9 0 CCDS7850.1 NAV2 gene_id:89797|Hs108|chr11 (2429) 15808 1483.8 0 CCDS53612.1 NAV2 gene_id:89797|Hs108|chr11 (2365) 15228 1429.9 0 CCDS58126.1 NAV2 gene_id:89797|Hs108|chr11 (2488) 8765 829.9 0 CCDS44552.1 NAV2 gene_id:89797|Hs108|chr11 (1493) 6307 601.5 9.8e-171 CCDS66432.1 NAV3 gene_id:89795|Hs108|chr12 (2385) 5423 519.6 7.5e-146 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KSQVLQGLQEPAGEGLPLRKSGSVENGFDTQIYTDWANHYLAKSGHKRLIRDLQQDVTDG :: :: ::. :.... :..:::::::::::::::::::.:::::..:: CCDS66 KSTC------EFGEKKPLQ--GKAKEKEDSKIYTDWANHYLAKSGHKRLIKDLQQDIADG 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 VLLAQIIQVVANEKIEDINGCPKNRSQMIENIDACLNFLAAKGINIQGLSAEEIRNGNLK ::::.:::..::::.:::::::...::::::.:.::.::::.:.:.:::::::::::::: CCDS66 VLLAEIIQIIANEKVEDINGCPRSQSQMIENVDVCLSFLAARGVNVQGLSAEEIRNGNLK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 AILGLFFSLSRYKQQQQQPQKQHLS-SPLPPAVSQVAGAPSQCQAGTPQQQVPVTPQAPC ::::::::::::::::.. :. . : : :.. :. ::. . . ::.. . : CCDS66 AILGLFFSLSRYKQQQHHQQQYYQSLVELQQRVTH-ASPPSEASQAKTQQDMQSSLAA-- 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 QPHQPAPHQQSKAQAEMQSRLPGPTARVSAAGSEAKTRGGSTTANNRRSQSFNNYDKSKP . . :. .. . .:::::. :: :::: .:..:.:. ::::::::. ::.:: CCDS66 RYATQSNHSGIATSQKKPTRLPGPS-RVPAAGSSSKVQGASNL--NRRSQSFNSIDKNKP 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 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CCDS66 KAGSKNLSNKKSLLQ--PKEKEEKNRDKNK----------VCTEK-PVKEEKDQ------ 450 460 470 480 490 530 540 550 560 570 580 pF1KA1 VPEM-PKKSSKIASFIPKGGKLNSAKKEPMAPSHSGIPKPGMKSMPGKSPSAPAP--SKE : :: :::.:::::.::::.: ..:::: . :: ::::::: : :. .:. ::: CCDS66 VTEMAPKKTSKIASLIPKGSKTTAAKKESLIPSSSGIPKPGSKVPTVKQTISPGSTASKE 500 510 520 530 540 550 590 600 610 620 630 640 pF1KA1 GERSRSGKLSSGLPQQKPQLDGRHSSSSSSLASSEGKGPGGTTLNHSISSQTVSGSVGTT .:. :. : : . .:: . ...:.:: : ::. : .. . : ..::. : : CCDS66 SEKFRTTKGSPSQSLSKP-ITMEKASASSCPAPLEGREAGQASPSGS-CTMTVAQSSG-- 560 570 580 590 600 650 660 670 680 690 700 pF1KA1 QTTGSNTVSVQLPQPQQQYNHPNTATVAPFLYRSQTDTEGNV--TAESSSTGVSVEPSHF :.::.. .::::: :::..::::::::::.::.....::.. .:.: .. .... : . CCDS66 QSTGNG--AVQLPQ-QQQHSHPNTATVAPFIYRAHSENEGTALPSADSCTSPTKMDLS-Y 610 620 630 640 650 660 710 720 730 740 750 760 pF1KA1 TKTGQPALEELTGEDPEARRLRTVKNIADLRQNLEETMSSLRGTQVTHSTLETTFDTNVT .::.. :::..:::::.::.::::::::::::::::::::::::..:::::::::..:: CCDS66 SKTAKQCLEEISGEDPETRRMRTVKNIADLRQNLEETMSSLRGTQISHSTLETTFDSTVT 670 680 690 700 710 720 770 780 790 800 810 820 pF1KA1 TEMSGRSILSLTGRPTPLSWRLGQSSPRLQAGDAPSMGNGYPPRANASRFINTESGRYVY ::..::.: .::.::::..:::::. ::::::::::.: ::: :...::::.:. .:..: CCDS66 TEVNGRTIPNLTSRPTPMTWRLGQACPRLQAGDAPSLGAGYP-RSGTSRFIHTDPSRFMY 730 740 750 760 770 780 830 840 850 860 870 880 pF1KA1 SAPLRRQLASRGSSVCHVDVSDKAGDEMDLEGISMDAPGYMSDGDVLSKNIRTDDITSGY ..:::: .:: ... ..:.:.::....:. . .:. :::::::.:.:..:::::.::: CCDS66 TTPLRRAAVSRLGNMSQIDMSEKASSDLDMSS-EVDVGGYMSDGDILGKSLRTDDINSGY 790 800 810 820 830 840 890 900 910 920 930 940 pF1KA1 MTDGGLGLYTRRLNRLPDGMAVVRETLQRNTSLGLGDADSWDDSSSVSSGISDTIDNLST ::::::.:::: :::.:: :. :. .::.. ::::::::::::::.:::.::.:: CCDS66 MTDGGLNLYTRSLNRIPD-TATSRDIIQRGVHDVTVDADSWDDSSSVSSGLSDTLDNIST 850 860 870 880 890 950 960 970 980 990 1000 pF1KA1 DDINTSSSISSYANTPASSRKNLDVQTDAEKHSQVERNSLW-SGDDVKKSDGGSDSGIKM ::.::.::.:::.: . :::: ...::.::.: .... : : ...:: . :: . CCDS66 DDLNTTSSVSSYSNITVPSRKNTQLRTDSEKRSTTDET--WDSPEELKKPEEDFDS--HG 900 910 920 930 940 950 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA1 EPGSKWRRNPSDVSDESDKSTSGKKNPV-ISQTGSWRRGMTAQVGITMPRTKASAPAGAL . :.::. : . .. .: .:.: . .::::::::::.:: : : .. .: ..:: CCDS66 DAGGKWKTVSSGLPEDPEK--AGQKASLSVSQTGSWRRGMSAQGGA--P-SRQKAGTSAL 960 970 980 990 1000 1010 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KA1 KTPGTGKTDDAKVSEKGRLSPKASQVKRSPSDAGRSSGDESKKPLPSSSRTPTANANSFG ::: :::::::.::::. :.:...:::::::.:::::.::: ::. ::.. ::: CCDS66 KTP--GKTDDAKASEKGKAPLKGSSLQRSPSDAGKSSGDEGKKP-PSGIGRSTATS-SFG 1020 1030 1040 1050 1060 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KA1 FKKQSGSAAGLAMITASGVTVTSRSATLGKIPKSSALVSRS-AGRKSSMDGAQNQDDGYL ::: :: ... ::::.::.:.:: ::::::::::.:. ..: ::::.:.::.::::: : CCDS66 FKKPSGVGSS-AMITSSGATITSGSATLGKIPKSAAIGGKSNAGRKTSLDGSQNQDDVVL 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KA1 ALSSRTNLQYRSLPRPSKSNSRN--G-AGNRSSTSSIDSNISSKSAGLPVPKLREPSKTA .::.:.::::::::::::.. . : .:.::::::::::.:::::: . :::::.: . CCDS66 HVSSKTTLQYRSLPRPSKSSTSGIPGRGGHRSSTSSIDSNVSSKSAGATTSKLREPTKIG 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KA1 LGSSLPGLVNQTDKEKG--ISSDNESVASCNSVKVNPAAQPVSSPAQTSLQPGAKYPDVA : : : :::::::: ::.:::. .: : .:.. . . :: :::.::::.: CCDS66 SGRSSPVTVNQTDKEKEKVAVSDSESVSLSGSPKSSPTSASACG-AQGLRQPGSKYPDIA 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KA1 SPTLRRLFGGKPT-KQVPIATAENMKNSVVISNPHATMTQQGNLDSPS-GSGVLSS---- :::.:::::.: :.. ..:..:.: :. .: .:...::.:.::: :.: ..: CCDS66 SPTFRRLFGAKAGGKSASAPNTEGVKSSSVMPSPSTTLARQGSLESPSSGTGSMGSAGGL 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KA1 -GSSSPLYSKNVDLNQS------PLASSPSSAHSAPSNSLTWGTNASSSSAVSKDGLGFQ ::::::..: ::. . :::::.:.:: :..:.:..: ::::: ::: ..: CCDS66 SGSSSPLFNKPSDLTTDVISLSHSLASSPASVHSFTSGGLVWAANMSSSSAGSKDTPSYQ 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1410 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KA1 SVSSLHTSCESIDISLSSGGVPSHNSSTGLIASSKD-DSLTPFVRTNSVKTTLSESPLSS :..::::: ::::. :: :.: .:: ..... .:: ..::.::..::::: CCDS66 SMTSLHTSSESIDLPLSH-----HGSLSGLTTGTHEVQSL--LMRTGSVRSTLSESM--- 1370 1380 1390 1400 1410 1470 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KA1 PAASPKFCRSTLPRKQDSDPHLDRNTLPKKGLRYTPTSQLRTQEDAKEWLRSHSAGGLQD .:::::::::::::::.:. .::..::::::::.::::: CCDS66 --------------------QLDRNTLPKKGLRYTPSSRQANQEEGKEWLRSHSTGGLQD 1420 1430 1440 1450 1530 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KA1 TAANSPFSSGSSVTSPSGTRFNFSQLASPTTVTQMSLSNPTMLRTHSLSNADGQYDPYTD :. .::. : :...: .. ...::.:.:::...:..: .:.:.:..:. :...: : : CCDS66 TGNQSPLVSPSAMSSSAAGKYHFSNLVSPTNLSQFNLPGPSMMRSNSIPAQDSSFDLYDD 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1590 1600 1610 1620 1630 1640 pF1KA1 SRFRNSSMSLDEKSRTMSRSGSFRDGFEEVHGSSLSLVSSTSSVYSTPEEKCQSE-IRKL :.. .:. ::.:. :..:.::::::..::::::::::::::::.::: ::: .:: :.:: CCDS66 SQLCGSATSLEERPRAISHSGSFRDSMEEVHGSSLSLVSSTSSLYSTAEEKAHSEQIHKL 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1650 1660 1670 1680 1690 1700 pF1KA1 RRELDASQEKVSALTTQLTANAHLVAAFEQSLGNMTIRLQSLTMTAEQKDSELNELRKTI :::: ::::::..::.::.::::::::::.:::::: ::::::::::::.::: :::.:: CCDS66 RRELVASQEKVATLTSQLSANAHLVAAFEKSLGNMTGRLQSLTMTAEQKESELIELRETI 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1710 1720 1730 1740 1750 1760 pF1KA1 ELLKKQNAAAQAAINGVINTPELNCKGNGTAQSADLRIRRQHSSDSVSSINSATSHSSVG :.:: ::.::::::.:..: :. : ::::::::::.:::::::::::::.: CCDS66 EMLKAQNSAAQAAIQGALNGPDHPPK--------DLRIRRQHSSESVSSINSATSHSSIG 1640 1650 1660 1670 1680 1770 1780 1790 1800 1810 pF1KA1 SNIESDSKKKKRKNWVN----ELRSSFKQAFGKKKSPKSASSHSDIEEMTDSSLPSSPKL :. ..::::::.::::: ::::::::::::::: : ::::::::.::::::.:::: CCDS66 SGNDADSKKKKKKNWVNSRGSELRSSFKQAFGKKKSTKPPSSHSDIEELTDSSLPASPKL 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1820 1830 1840 1850 pF1KA1 PHN-GSTGS-----------TPLL-----RNS-----HSNSLISECMDSEAETVMQLRNE ::: :. :: .::. :.. . : : :: ..::: ..::..: CCDS66 PHNAGDCGSASMKPSQSASASPLVWPPKKRQNGPVIYKHRSRICECTEAEAEIILQLKSE 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1860 1870 1880 1890 1900 1910 pF1KA1 LRDKEMKLTDIRLEALSSAHQLDQLREAMNRMQSEIEKLKAENDRLKSESQGSGC-SRAP ::.::.::::::::::::::.:::.::::::::.::: :::::::::.:. ... .: : CCDS66 LREKELKLTDIRLEALSSAHHLDQIREAMNRMQNEIEILKAENDRLKAETGNTAKPTRPP 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1920 1930 1940 1950 1960 1970 pF1KA1 SQVSIS---ASPRQSMGLSQHSLNLTESTSLDMLLDDTGECSARKEGGRHVKIVVSFQEE :. : : .: :::.::: ..::.::..: :.::::.:. ...:.: : :::.::... CCDS66 SESSSSTSSSSSRQSLGLSLNNLNITEAVSSDILLDDAGDATGHKDG-RSVKIIVSISKG 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1980 1990 2000 2010 2020 2030 pF1KA1 MKWKEDSRPHLFLIGCIGVSGKTKWDVLDGVVRRLFKEYIIHVDPVSQLGLNSDSVLGYS . .:.. . .::: :::::::::::::::.:::::::....: ..:::.:: . .: CCDS66 YGRAKDQKSQAYLIGSIGVSGKTKWDVLDGVIRRLFKEYVFRIDTSTSLGLSSDCIASYC 1930 1940 1950 1960 1970 1980 2040 2050 2060 2070 2080 2090 pF1KA1 IGEIKRSNTSETPELLPCGYLVGENTTISVTVKGLAENSLDSLVFESLIPKPILQRYVSL ::.. ::.. :.:::::::::::.:. :.:..::. ::::::.::..:::::: ::: .: CCDS66 IGDLIRSHNLEVPELLPCGYLVGDNNIITVNLKGVEENSLDSFVFDTLIPKPITQRYFNL 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2100 2110 2120 2130 2140 2150 pF1KA1 LIEHRRIILSGPSGTGKTYLANRLSEYIVLREGRELTDGVIATFNVDHKSSKELRQYLSN :.::.:::::::::::::::::.:.::.. . ::. :. .::::::::::::::.:::.: CCDS66 LMEHHRIILSGPSGTGKTYLANKLAEYVITKSGRKKTEDAIATFNVDHKSSKELQQYLAN 2050 2060 2070 2080 2090 2100 2160 2170 2180 2190 2200 2210 pF1KA1 LADQCNSENNAVDMPLVIILDNLHHVSSLGEIFNGLLNCKYHKCPYIIGTMNQATSSTPN ::.::...::.:..:.::::::::::.::..::::.:::::.:::::::::::..::.:: CCDS66 LAEQCSADNNGVELPVVIILDNLHHVGSLSDIFNGFLNCKYNKCPYIIGTMNQGVSSSPN 2110 2120 2130 2140 2150 2160 2220 2230 2240 2250 2260 2270 pF1KA1 LQLHHNFRWVLCANHTEPVKGFLGRFLRRKLMETEISGRVRNMELVKIIDWIPKVWHHLN :.:::::::::::::::::::::::.:::::.: :: .:: .::::::::::.::::: CCDS66 LELHHNFRWVLCANHTEPVKGFLGRYLRRKLIEIEIERNIRNNDLVKIIDWIPKTWHHLN 2170 2180 2190 2200 2210 2220 2280 2290 2300 2310 2320 2330 pF1KA1 RFLEAHSSSDVTIGPRLFLSCPIDVDGSRVWFTDLWNYSIIPYLLEAVREGLQLYGRRAP :::.:::::::::::::: ::.::.:::::: ::::::..::.:::::::::.::.:.: CCDS66 SFLETHSSSDVTIGPRLFLPCPMDVEGSRVWFMDLWNYSLVPYILEAVREGLQMYGKRTP 2230 2240 2250 2260 2270 2280 2340 2350 2360 2370 2380 2390 pF1KA1 WEDPAKWVMDTYPWAASPQQHEWPPLLQLRPEDVGFDGYSMPREGSTSKQMPPSDAEGDP ::::.:::.:::::... .: : ::::::::::... . .:..:::..: .:.:::: CCDS66 WEDPSKWVLDTYPWSSATLPQESPALLQLRPEDVGYESCTSTKEATTSKHIPQTDTEGDP 2290 2300 2310 2320 2330 2340 2400 2410 2420 2430 pF1KA1 LMNMLMRLQEAANYSSPQSYDSDSNSNSHHDDILDSSLESTL ::::::.::::::::: :: ::.:. :::.::::::::::: CCDS66 LMNMLMKLQEAANYSSTQSCDSEST--SHHEDILDSSLESTL 2350 2360 2370 2380 >>CCDS41815.1 NAV3 gene_id:89795|Hs108|chr12 (2363 aa) initn: 5402 init1: 2710 opt: 4425 Z-score: 2231.2 bits: 426.9 E(32554): 5.8e-118 Smith-Waterman score: 8270; 56.0% identity (79.2% similar) in 2481 aa overlap (1-2432:1-2363) 10 20 30 40 50 pF1KA1 MPAILVASKMKSGL--PKPVHSAAPILHVPPARAGPQPCYLKLGSKVEVSKTTYPSQIPL ::.. ::::... ::::.: :: .. . .: : : . .:. .. :. : CCDS41 MPVLGVASKLRQPAVGSKPVHTALPIPNL--GTTGSQHCSSRPLELTETESSMLSCQLAL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KA1 KSQVLQGLQEPAGEGLPLRKSGSVENGFDTQIYTDWANHYLAKSGHKRLIRDLQQDVTDG :: :: ::. :.... :..:::::::::::::::::::.:::::..:: CCDS41 KSTC------EFGEKKPLQ--GKAKEKEDSKIYTDWANHYLAKSGHKRLIKDLQQDIADG 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA1 VLLAQIIQVVANEKIEDINGCPKNRSQMIENIDACLNFLAAKGINIQGLSAEEIRNGNLK ::::.:::..::::.:::::::...::::::.:.::.::::.:.:.:::::::::::::: CCDS41 VLLAEIIQIIANEKVEDINGCPRSQSQMIENVDVCLSFLAARGVNVQGLSAEEIRNGNLK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA1 AILGLFFSLSRYKQQQQQPQKQHLS-SPLPPAVSQVAGAPSQCQAGTPQQQVPVTPQAPC ::::::::::::::::.. :. . : : :.. :. ::. . . ::.. . : CCDS41 AILGLFFSLSRYKQQQHHQQQYYQSLVELQQRVTH-ASPPSEASQAKTQQDMQSSLAA-- 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KA1 QPHQPAPHQQSKAQAEMQSRLPGPTARVSAAGSEAKTRGGSTTANNRRSQSFNNYDKSKP . . :. .. . .:::::. :: :::: .:..:.:. ::::::::. ::.:: CCDS41 RYATQSNHSGIATSQKKPTRLPGPS-RVPAAGSSSKVQGASNL--NRRSQSFNSIDKNKP 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KA1 VTSPPPPPSSHEKEPLASSASSHPGMSDNAPASLESGSSSTPTNCSTSSAIPQPGAATKP : ...::. ... .: :.. :. .:. : .::::.: .:.:: CCDS41 ----PNYANGNEKDS-SKGPQSSSGVNGNVQPPSTAGQP--P-----ASAIPSP-SASKP 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 pF1KA1 WRSKSLSVKHSATVSMLSVKP------PGPEAPR---PTPEAMKPAPNNQKSMLEKLKLF :::::..:::::: .::.:: : : . : :. :..: ::..:::::::.:: CCDS41 WRSKSMNVKHSATSTMLTVKQSSTATSPTPSSDRLKPPVSEGVKTAPSGQKSMLEKFKLV 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KA1 NSKGGSKAGEGPGSRDTSCERLETLPSFEESEELEAASRMLTTVGPASSSPKIALKGIAQ :.. . . . :.: .. . . .: :: :.:. . :.. : ..::::.. : CCDS41 NARTALRPPQPPSSGPSDGGKDDD--AFSESGEMEGFNSGLNSGGSTNSSPKVSPKLAPP 400 410 420 430 440 470 480 490 500 510 520 pF1KA1 RTFSRALTNKKSSLKGNEKEKEKQQREKDKEKSKDLAKRASVTERLDLKEEPKEDPSGAA .. :. :.:::: :. ::::...:.:.: ::. .::: . CCDS41 KAGSKNLSNKKSLLQ--PKEKEEKNRDKNK----------VCTEK-PVKEEKDQ------ 450 460 470 480 490 530 540 550 560 570 580 pF1KA1 VPEM-PKKSSKIASFIPKGGKLNSAKKEPMAPSHSGIPKPGMKSMPGKSPSAPAP--SKE : :: :::.:::::.::::.: ..:::: . :: ::::::: : :. .:. ::: CCDS41 VTEMAPKKTSKIASLIPKGSKTTAAKKESLIPSSSGIPKPGSKVPTVKQTISPGSTASKE 500 510 520 530 540 550 590 600 610 620 630 640 pF1KA1 GERSRSGKLSSGLPQQKPQLDGRHSSSSSSLASSEGKGPGGTTLNHSISSQTVSGSVGTT .:. :. : : . .:: . ...:.:: : ::. : .. . : ..::. : : CCDS41 SEKFRTTKGSPSQSLSKP-ITMEKASASSCPAPLEGREAGQASPSGS-CTMTVAQSSG-- 560 570 580 590 600 650 660 670 680 690 700 pF1KA1 QTTGSNTVSVQLPQPQQQYNHPNTATVAPFLYRSQTDTEGNV--TAESSSTGVSVEPSHF :.::.. .::::: :::..::::::::::.::.....::.. .:.: .. .... : . CCDS41 QSTGNG--AVQLPQ-QQQHSHPNTATVAPFIYRAHSENEGTALPSADSCTSPTKMDLS-Y 610 620 630 640 650 660 710 720 730 740 750 760 pF1KA1 TKTGQPALEELTGEDPEARRLRTVKNIADLRQNLEETMSSLRGTQVTHSTLETTFDTNVT .::.. :::..:::::.::.::::::::::::::::::::::::..:::::::::..:: CCDS41 SKTAKQCLEEISGEDPETRRMRTVKNIADLRQNLEETMSSLRGTQISHSTLETTFDSTVT 670 680 690 700 710 720 770 780 790 800 810 820 pF1KA1 TEMSGRSILSLTGRPTPLSWRLGQSSPRLQAGDAPSMGNGYPPRANASRFINTESGRYVY ::..::.: .::.::::..:::::. ::::::::::.: ::: :...::::.:. .:..: CCDS41 TEVNGRTIPNLTSRPTPMTWRLGQACPRLQAGDAPSLGAGYP-RSGTSRFIHTDPSRFMY 730 740 750 760 770 780 830 840 850 860 870 880 pF1KA1 SAPLRRQLASRGSSVCHVDVSDKAGDEMDLEGISMDAPGYMSDGDVLSKNIRTDDITSGY ..:::: .:: ... ..:.:.::....:. . .:. :::::::.:.:..:::::.::: CCDS41 TTPLRRAAVSRLGNMSQIDMSEKASSDLDMSS-EVDVGGYMSDGDILGKSLRTDDINSGY 790 800 810 820 830 840 890 900 910 920 930 940 pF1KA1 MTDGGLGLYTRRLNRLPDGMAVVRETLQRNTSLGLGDADSWDDSSSVSSGISDTIDNLST ::::::.:::: :::.:: :. :. .::.. ::::::::::::::.:::.::.:: CCDS41 MTDGGLNLYTRSLNRIPD-TATSRDIIQRGVHDVTVDADSWDDSSSVSSGLSDTLDNIST 850 860 870 880 890 950 960 970 980 990 1000 pF1KA1 DDINTSSSISSYANTPASSRKNLDVQTDAEKHSQVERNSLW-SGDDVKKSDGGSDSGIKM ::.::.::.:::.: . :::: ...::.::.: .... : : ...:: . :: . CCDS41 DDLNTTSSVSSYSNITVPSRKNTQLRTDSEKRSTTDET--WDSPEELKKPEEDFDS--HG 900 910 920 930 940 950 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA1 EPGSKWRRNPSDVSDESDKSTSGKKNPV-ISQTGSWRRGMTAQVGITMPRTKASAPAGAL . :.::. : . .. .: .:.: . .::::::::::.:: : : .. .: ..:: CCDS41 DAGGKWKTVSSGLPEDPEK--AGQKASLSVSQTGSWRRGMSAQGGA--P-SRQKAGTSAL 960 970 980 990 1000 1010 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KA1 KTPGTGKTDDAKVSEKGRLSPKASQVKRSPSDAGRSSGDESKKPLPSSSRTPTANANSFG ::: :::::::.::::. :.:...:::::::.:::::.::: ::. ::.. ::: CCDS41 KTP--GKTDDAKASEKGKAPLKGSSLQRSPSDAGKSSGDEGKKP-PSGIGRSTATS-SFG 1020 1030 1040 1050 1060 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KA1 FKKQSGSAAGLAMITASGVTVTSRSATLGKIPKSSALVSRS-AGRKSSMDGAQNQDDGYL ::: :: ... ::::.::.:.:: ::::::::::.:. ..: ::::.:.::.::::: : CCDS41 FKKPSGVGSS-AMITSSGATITSGSATLGKIPKSAAIGGKSNAGRKTSLDGSQNQDDVVL 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KA1 ALSSRTNLQYRSLPRPSKSNSRN--G-AGNRSSTSSIDSNISSKSAGLPVPKLREPSKTA .::.:.::::::::::::.. . : .:.::::::::::.:::::: . :::::.: . CCDS41 HVSSKTTLQYRSLPRPSKSSTSGIPGRGGHRSSTSSIDSNVSSKSAGATTSKLREPTKIG 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KA1 LGSSLPGLVNQTDKEKG--ISSDNESVASCNSVKVNPAAQPVSSPAQTSLQPGAKYPDVA : : : :::::::: ::.:::. .: : .:.. . . :: :::.::::.: CCDS41 SGRSSPVTVNQTDKEKEKVAVSDSESVSLSGSPKSSPTSASACG-AQGLRQPGSKYPDIA 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KA1 SPTLRRLFGGKPT-KQVPIATAENMKNSVVISNPHATMTQQGNLDSPS-GSGVLSS---- :::.:::::.: :.. ..:..:.: :. .: .:...::.:.::: :.: ..: CCDS41 SPTFRRLFGAKAGGKSASAPNTEGVKSSSVMPSPSTTLARQGSLESPSSGTGSMGSAGGL 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KA1 -GSSSPLYSKNVDLNQS------PLASSPSSAHSAPSNSLTWGTNASSSSAVSKDGLGFQ ::::::..: ::. . :::::.:.:: :..:.:..: ::::: ::: ..: CCDS41 SGSSSPLFNKPSDLTTDVISLSHSLASSPASVHSFTSGGLVWAANMSSSSAGSKDTPSYQ 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1410 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KA1 SVSSLHTSCESIDISLSSGGVPSHNSSTGLIASSKD-DSLTPFVRTNSVKTTLSESPLSS :..::::: ::::. :: :.: .:: ..... .:: ..::.::..::::: CCDS41 SMTSLHTSSESIDLPLSH-----HGSLSGLTTGTHEVQSL--LMRTGSVRSTLSESM--- 1370 1380 1390 1400 1410 1470 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KA1 PAASPKFCRSTLPRKQDSDPHLDRNTLPKKGLRYTPTSQLRTQEDAKEWLRSHSAGGLQD .:::::::::::::::.:. .::..::::::::.::::: CCDS41 --------------------QLDRNTLPKKGLRYTPSSRQANQEEGKEWLRSHSTGGLQD 1420 1430 1440 1450 1530 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KA1 TAANSPFSSGSSVTSPSGTRFNFSQLASPTTVTQMSLSNPTMLRTHSLSNADGQYDPYTD :. .::. : :...: .. ...::.:.:::...:..: .:.:.:..:. :...: : : CCDS41 TGNQSPLVSPSAMSSSAAGKYHFSNLVSPTNLSQFNLPGPSMMRSNSIPAQDSSFDLYDD 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1590 1600 1610 1620 1630 1640 pF1KA1 SRFRNSSMSLDEKSRTMSRSGSFRDGFEEVHGSSLSLVSSTSSVYSTPEEKCQSE-IRKL :.. .:. ::.:. :..:.::::::..::::::::::::::::.::: ::: .:: :.:: CCDS41 SQLCGSATSLEERPRAISHSGSFRDSMEEVHGSSLSLVSSTSSLYSTAEEKAHSEQIHKL 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1650 1660 1670 1680 1690 1700 pF1KA1 RRELDASQEKVSALTTQLTANAHLVAAFEQSLGNMTIRLQSLTMTAEQKDSELNELRKTI :::: ::::::..::.::.::::::::::.:::::: ::::::::::::.::: :::.:: CCDS41 RRELVASQEKVATLTSQLSANAHLVAAFEKSLGNMTGRLQSLTMTAEQKESELIELRETI 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1710 1720 1730 1740 1750 1760 pF1KA1 ELLKKQNAAAQAAINGVINTPELNCKGNGTAQSADLRIRRQHSSDSVSSINSATSHSSVG :.:: ::.::::::.:..: :. : ::::::::::.:::::::::::::.: CCDS41 EMLKAQNSAAQAAIQGALNGPDHPPK--------DLRIRRQHSSESVSSINSATSHSSIG 1640 1650 1660 1670 1680 1770 1780 1790 1800 1810 pF1KA1 SNIESDSKKKKRKNWVN----ELRSSFKQAFGKKKSPKSASSHSDIEEMTDSSLPSSPKL :. ..::::::.::::: ::::::::::::::: : ::::::::.::::::.:::: CCDS41 SGNDADSKKKKKKNWVNSRGSELRSSFKQAFGKKKSTKPPSSHSDIEELTDSSLPASPKL 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1820 1830 1840 1850 1860 1870 pF1KA1 PHN-GSTGSTPLLRNSHSNSLISECMDSEAETVMQLRNELRDKEMKLTDIRLEALSSAHQ ::: :. ::. . . :.: : : :: ..::: ..::..:::.::.::::::::::::::. CCDS41 PHNAGDCGSASM-KPSQSASAICECTEAEAEIILQLKSELREKELKLTDIRLEALSSAHH 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1880 1890 1900 1910 1920 1930 pF1KA1 LDQLREAMNRMQSEIEKLKAENDRLKSESQGSGC-SRAPSQVSIS---ASPRQSMGLSQH :::.::::::::.::: :::::::::.:. ... .: ::. : : .: :::.::: . CCDS41 LDQIREAMNRMQNEIEILKAENDRLKAETGNTAKPTRPPSESSSSTSSSSSRQSLGLSLN 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1940 1950 1960 1970 1980 1990 pF1KA1 SLNLTESTSLDMLLDDTGECSARKEGGRHVKIVVSFQEEMKWKEDSRPHLFLIGCIGVSG .::.::..: :.::::.:. ...:.: : :::.::... . .:.. . .::: ::::: CCDS41 NLNITEAVSSDILLDDAGDATGHKDG-RSVKIIVSISKGYGRAKDQKSQAYLIGSIGVSG 1870 1880 1890 1900 1910 1920 2000 2010 2020 2030 2040 2050 pF1KA1 KTKWDVLDGVVRRLFKEYIIHVDPVSQLGLNSDSVLGYSIGEIKRSNTSETPELLPCGYL ::::::::::.:::::::....: ..:::.:: . .: ::.. ::.. :.::::::::: CCDS41 KTKWDVLDGVIRRLFKEYVFRIDTSTSLGLSSDCIASYCIGDLIRSHNLEVPELLPCGYL 1930 1940 1950 1960 1970 1980 2060 2070 2080 2090 2100 2110 pF1KA1 VGENTTISVTVKGLAENSLDSLVFESLIPKPILQRYVSLLIEHRRIILSGPSGTGKTYLA ::.:. :.:..::. ::::::.::..:::::: ::: .::.::.:::::::::::::::: CCDS41 VGDNNIITVNLKGVEENSLDSFVFDTLIPKPITQRYFNLLMEHHRIILSGPSGTGKTYLA 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2120 2130 2140 2150 2160 2170 pF1KA1 NRLSEYIVLREGRELTDGVIATFNVDHKSSKELRQYLSNLADQCNSENNAVDMPLVIILD :.:.::.. . ::. :. .::::::::::::::.:::.:::.::...::.:..:.::::: CCDS41 NKLAEYVITKSGRKKTEDAIATFNVDHKSSKELQQYLANLAEQCSADNNGVELPVVIILD 2050 2060 2070 2080 2090 2100 2180 2190 2200 2210 2220 2230 pF1KA1 NLHHVSSLGEIFNGLLNCKYHKCPYIIGTMNQATSSTPNLQLHHNFRWVLCANHTEPVKG :::::.::..::::.:::::.:::::::::::..::.:::.::::::::::::::::::: CCDS41 NLHHVGSLSDIFNGFLNCKYNKCPYIIGTMNQGVSSSPNLELHHNFRWVLCANHTEPVKG 2110 2120 2130 2140 2150 2160 2240 2250 2260 2270 2280 2290 pF1KA1 FLGRFLRRKLMETEISGRVRNMELVKIIDWIPKVWHHLNRFLEAHSSSDVTIGPRLFLSC ::::.:::::.: :: .:: .::::::::::.::::: :::.:::::::::::::: : CCDS41 FLGRYLRRKLIEIEIERNIRNNDLVKIIDWIPKTWHHLNSFLETHSSSDVTIGPRLFLPC 2170 2180 2190 2200 2210 2220 2300 2310 2320 2330 2340 2350 pF1KA1 PIDVDGSRVWFTDLWNYSIIPYLLEAVREGLQLYGRRAPWEDPAKWVMDTYPWAASPQQH :.::.:::::: ::::::..::.:::::::::.::.:.:::::.:::.:::::... . CCDS41 PMDVEGSRVWFMDLWNYSLVPYILEAVREGLQMYGKRTPWEDPSKWVLDTYPWSSATLPQ 2230 2240 2250 2260 2270 2280 2360 2370 2380 2390 2400 2410 pF1KA1 EWPPLLQLRPEDVGFDGYSMPREGSTSKQMPPSDAEGDPLMNMLMRLQEAANYSSPQSYD : : ::::::::::... . .:..:::..: .:.::::::::::.::::::::: :: : CCDS41 ESPALLQLRPEDVGYESCTSTKEATTSKHIPQTDTEGDPLMNMLMKLQEAANYSSTQSCD 2290 2300 2310 2320 2330 2340 2420 2430 pF1KA1 SDSNSNSHHDDILDSSLESTL :.:. :::.::::::::::: CCDS41 SEST--SHHEDILDSSLESTL 2350 2360 >>CCDS53456.1 NAV1 gene_id:89796|Hs108|chr1 (1483 aa) initn: 2565 init1: 1212 opt: 2465 Z-score: 1250.9 bits: 244.8 E(32554): 2.4e-63 Smith-Waterman score: 3714; 43.2% identity (71.2% similar) in 1548 aa overlap (923-2432:18-1483) 900 910 920 930 940 950 pF1KA1 TRRLNRLPDGMAVVRETLQRNTSLGLGDADSWDDSSSVSSGISDTIDNLSTDDINTSSSI :::.:::.:::.::. ::::....:.:::. CCDS53 MLHLPLPRSGRTVNFPRSWDESSSISSGLSDASDNLSSEEFNASSSL 10 20 30 40 960 970 980 990 1000 pF1KA1 SSYANTPASSRKNLDV--QTDAEKHSQVERNSLWSGDDVKKSDGG--SDSG-IKMEPG-S .: .::..::.: . .::.::.: .: . : ... .:. ::: .::::: : CCDS53 NSLPSTPTASRRNSTIVLRTDSEKRSLAESGLSWFSESEEKAPKKLEYDSGSLKMEPGTS 50 60 70 80 90 100 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA1 KWRRNPSDVSDESDKSTSGKKNPVISQTGSWRRGMTAQVGITMPRTKASAPAGALKTPGT ::::. . :.:.:. :: ... :: ..: : :..: : :... .:::. : CCDS53 KWRRERPESCDDSSKGGELKKPISLGHPGSLKKGKTPPVAVTSPITHTA--QSALKVAG- 110 120 130 140 150 160 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KA1 GKTDDAKVSEKGRLSPKASQVKRSPSDAGRSSGDESKKPLPSSSRTPTANANSFGFKKQS ..:...::.:. : . ..:: :::::. ...::: ::. :.... :::.:: CCDS53 --KPEGKATDKGKLAVKNTGLQRSSSDAGRDRLSDAKKP-PSGIARPSTSG-SFGYKKPP 170 180 190 200 210 220 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KA1 GSAAGLAMITASGVTVTSRSATLGKIPKSSAL-VSRSAGRKSSMDGAQNQDDGYLALSSR :.: : . .: ::::.:: :::.. :. :::.:.: ... . :.:: ..: CCDS53 -PATGTATVMQTG-----GSATLSKIQKSSGIPVKPVNGRKTSLDVSNSAEPGFLAPGAR 230 240 250 260 270 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KA1 TNLQYRSLPRPSKSNSRNGAGNRSS----TSSID-SNISSKSAGLPVPKLREPSKTALGS .:.::::::::.::.: . .:.:.. .:::: : .:.:..:: .:.::.:.: : CCDS53 SNIQYRSLPRPAKSSSMSVTGGRGGPRPVSSSIDPSLLSTKQGGLTPSRLKEPTKVASGR 280 290 300 310 320 330 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KA1 SLPGLVNQTDKEKGISSDNESVASCNSVKVNPAAQPVSSPAQTSLQPGAKYPDVASPTLR . :. :::::.:: .. . . . ...... ..: :.: . . .: : :: CCDS53 TTPAPVNQTDREKEKAKAKAVALDSDNISLKSIGSPESTPKNQASHPTATKLAELPPTPL 340 350 360 370 380 390 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KA1 RLFGGKPTKQVPIATAENMKNSVVISNPHATMTQQGNLDSPSGSGVLSSGSSSPLYSKNV : . . .: .:. ... :: .. : .. : ... :. .. ::.:..:: CCDS53 RATAKSFVKPPSLANLDKV-NSNSLDLPSSSDTTHAS-KVPDLHAT-SSASGGPL----- 400 410 420 430 440 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KA1 DLNQSPLASSPSSAHSAPSNSLTWGTNASSSSAVSKDGLGFQSVSSLHTSCESIDISLSS : .. ::. . : :.. : . :. .: :. . ..:.:: : ::... .: CCDS53 ---PSCFTPSPAPILNINSASFSQGLELMSGFSVPKETRMYPKLSGLHRSMESLQMPMS- 450 460 470 480 490 500 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KA1 GGVPSHNSSTGLIASSKDDSLTPFVRTNSVKTTLSESPLSSPAASPKFCRSTLPRKQDSD .:: :. . . .: .. .. . : : :: .. . ::. CCDS53 --LPSAFPSSTPVPTPPAPPAAP-TEEETEELTWSGSPRAG--------------QLDSN 510 520 530 540 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KA1 PHLDRNTLPKKGLRYTPTSQLRTQEDAKEWLRSHSAGGLQDTAANSPFSSGSSVTSPSGT . :::::::::::: ::..::..:: .::. ::: .. .: . : .. .. CCDS53 QR-DRNTLPKKGLRY----QLQSQEETKERRHSHTIGGLPESDDQSELPSPPALPMSLSA 550 560 570 580 590 600 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KA1 RFNFSQLASPTTVTQMSLSNPTMLRTHSLSNADGQYDPYTDSRFRNSSMSLDEKSRTMSR . ......:::..: .: . :..:. . .. .. :. :.. .:..:: :. . : : CCDS53 KGQLTNIVSPTAAT-----TPRITRSNSIPTHEAAFELYSGSQM-GSTLSLAERPKGMIR 610 620 630 640 650 1610 1620 1630 1640 1650 pF1KA1 SGSFRDGFEEVHGSSLSLVSSTSSVYSTPEEKCQSE-IRKLRRELDASQEKVSALTTQLT :::::: ..:::: :::.::.::.::. ::. ::: ::::::::..:::::..::.::. CCDS53 SGSFRDPTDDVHGSVLSLASSASSTYSSAEERMQSEQIRKLRRELESSQEKVATLTSQLS 660 670 680 690 700 710 1660 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KA1 ANAHLVAAFEQSLGNMTIRLQSLTMTAEQKDSELNELRKTIELLKKQNAAAQAAINGVIN :::.::::::::: ::: ::. :. :::.::.:: .::.::..:::.:. :::.:.:..: CCDS53 ANANLVAAFEQSLVNMTSRLRHLAETAEEKDTELLDLRETIDFLKKKNSEAQAVIQGALN 720 730 740 750 760 770 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KA1 TPELNCKGNGTAQSADLRIRRQHSSDSVSSINSATSHSSVGSNIESDSKKKKRKNWVNEL . : . : .:::.::.::::.::.:: :::::.::. ..:.::::.:.: : CCDS53 ASETTPK--------ELRIKRQNSSDSISSLNSITSHSSIGSSKDADAKKKKKKSW---L 780 790 800 810 820 1780 1790 1800 1810 1820 1830 pF1KA1 RSSFKQAFGKKKSPKSASSHSDIEEMT--DSSLPSSPKLPHNGSTGSTPLLRNSHSNSL- ::::..::. ::.::::::.:::::.. ::: :::::: :... ..: ...: :.:. CCDS53 RSSFNKAFSIKKGPKSASSYSDIEEIATPDSSAPSSPKLQHGSTETASPSIKSSTSSSVG 830 840 850 860 870 880 1840 1850 1860 1870 pF1KA1 ------------------ISECMDSEAETVMQLRNELRDKEMKLTDIRLEALSSAHQLDQ .: . : . : .::.:: .:::::::::::::.::::::: CCDS53 TDVTEGPAHPAPHTRLFHANEEEEPEKKEVSELRSELWEKEMKLTDIRLEALNSAHQLDQ 890 900 910 920 930 940 1880 1890 1900 1910 1920 1930 pF1KA1 LREAMNRMQSEIEKLKAENDRLK---SESQGSGCSRAPSQVSISASPRQSMGLS-QHSLN :::.:. :: :.. ::::::::: . :.:: ...:.. ..: :::.:.::. ::.. CCDS53 LRETMHNMQLEVDLLKAENDRLKVAPGPSSGSTPGQVPGSSALS-SPRRSLGLALTHSFG 950 960 970 980 990 1000 1940 1950 1960 1970 1980 1990 pF1KA1 LTESTSLDMLLDDTGECSARKEGGRHVKIVVSFQEEMKWKEDSRPHLFLIGCIGVSGKTK . . . .: . :. ..: ...:: . . : : . . :..:: ::::. CCDS53 PSLADTDLSPMDGISTCGPKEE--VTLRVVVRMPPQHIIKGDLKQQEFFLGCSKVSGKVD 1010 1020 1030 1040 1050 1060 2000 2010 2020 2030 2040 2050 pF1KA1 WDVLDGVVRRLFKEYIIHVDPVSQLGLNSDSVLGYSIGEIKRSNTSETPELLPCGYLVGE : .:: .: ..::.:: ..::.: :::...:. ::::...:: .: ::. :: : CCDS53 WKMLDEAVFQVFKDYISKMDPASTLGLSTESIHGYSISHVKRVLDAEPPEMPPCRR--GV 1070 1080 1090 1100 1110 2060 2070 2080 2090 2100 2110 pF1KA1 NTTISVTVKGLAENSLDSLVFESLIPKPILQRYVSLLIEHRRIILSGPSGTGKTYLANRL :. :::..::: :. .::::::.:::::..:.:.:::..:::..::::::::::::.::: CCDS53 NN-ISVSLKGLKEKCVDSLVFETLIPKPMMQHYISLLLKHRRLVLSGPSGTGKTYLTNRL 1120 1130 1140 1150 1160 1170 2120 2130 2140 2150 2160 2170 pF1KA1 SEYIVLREGRELTDGVIATFNVDHKSSKELRQYLSNLADQCNSENNAVDMPLVIILDNLH .::.: : :::.:.:...:::. ..: :.:. ::::::.: . :.. :.::::.::.: CCDS53 AEYLVERSGREVTEGIVSTFNMHQQSCKDLQLYLSNLANQIDRETGIGDVPLVILLDDLS 1180 1190 1200 1210 1220 1230 2180 2190 2200 2210 2220 2230 pF1KA1 HVSSLGEIFNGLLNCKYHKCPYIIGTMNQATSSTPNLQLHHNFRWVLCANHTEPVKGFLG ...:..:. :: :.:::::::::::: :: .. ::: :: .:: . .:..::..::: CCDS53 EAGSISELVNGALTCKYHKCPYIIGTTNQPVKMTPNHGLHLSFRMLTFSNNVEPANGFLV 1240 1250 1260 1270 1280 1290 2240 2250 2260 2270 2280 2290 pF1KA1 RFLRRKLMETEISGRVRNMELVKIIDWIPKVWHHLNRFLEAHSSSDVTIGPRLFLSCPID :.:::::.:.. . . . ::....::.::.:.::. ::: ::.:: ::: .:::::: CCDS53 RYLRRKLVESDSDINANKEELLRVLDWVPKLWYHLHTFLEKHSTSDFLIGPCFFLSCPIG 1300 1310 1320 1330 1340 1350 2300 2310 2320 2330 2340 2350 pF1KA1 VDGSRVWFTDLWNYSIIPYLLEAVREGLQLYGRRAPWEDPAKWVMDTYPWAASPQQHEWP .. :.:: :::: :::::: :....:....:..: ::::..:: :: :: .. :.. CCDS53 IEDFRTWFIDLWNNSIIPYLQEGAKDGIKVHGQKAAWEDPVEWVRDTLPWPSA--QQDQS 1360 1370 1380 1390 1400 1410 2360 2370 2380 2390 2400 2410 pF1KA1 PLLQLRPEDVGFDGYSMPREGSTSKQMPPSDAEGDPLMNMLMRLQEAANYSSPQSYDSDS : .: : :: . . : : : :. ::. ..:::: ::..::::::: .: : .. CCDS53 KLYHLPPPTVGPHSIASPPEDRTVKDSTPSSLDSDPLMAMLLKLQEAANYI--ESPDRET 1420 1430 1440 1450 1460 1470 2420 2430 pF1KA1 NSNSHHDDILDSSLESTL ::: .:..:: CCDS53 --------ILDPNLQATL 1480 >>CCDS1414.2 NAV1 gene_id:89796|Hs108|chr1 (1877 aa) initn: 2878 init1: 1212 opt: 2150 Z-score: 1091.2 bits: 215.6 E(32554): 1.8e-54 Smith-Waterman score: 4120; 39.9% identity (67.1% similar) in 1996 aa overlap (518-2432:25-1877) 490 500 510 520 530 540 pF1KA1 EKEKQQREKDKEKSKDLAKRASVTERLDLKEEPKEDPSGAAVPEMPKKSSKIASFIPKGG .::. ::. . : :. :: CCDS14 MLGSSVKSVQPEVELSSGGGDEGADEPRGAGRKAAAADGRGMLPKRAKAPGGGG 10 20 30 40 50 550 560 570 580 590 600 pF1KA1 KLNSAKKEPMAPSHSGIPKPGMKSMPGKSPSAPAPSKEGERSRSGKLSSGLPQQKPQLDG . .:. . .:: :. .. :..: :... ....: : : ... .:. CCDS14 GMAKASAAELKVFKSG-------SVDSRVPGGP-PASNLRKQKSLTNLSFLTDSEKKLQL 60 70 80 90 100 610 620 630 640 650 pF1KA1 RHSSSSSSLASS-EGKGPGGTTLNHS-ISSQTVSGSVGTT-QTTGSNTVSVQLPQ----- . :...:.. .: : :. .. . :.:.: : . :. :: . ... : CCDS14 YEPEWSDDMAKAPKGLGKVGSKGREAPLMSKTLSKSEHSLFQAKGSPAGGAKTPLAPLAP 110 120 130 140 150 160 660 670 680 690 700 pF1KA1 --------PQQQYNHPNTATVAPFLYRSQ---TDTE---GNVTAESSSTGVSV----EPS :. : . . . :: :. .: : ... :..:: : : CCDS14 NLGKPSRIPRGPYAEVKPLSKAPEAAVSEDGKSDDELLSSKAKAQKSSGPVPSAKGQEER 170 180 190 200 210 220 710 720 730 740 750 pF1KA1 HFTKTGQPALEELTGE----------DPEARRLRTVKNIADLRQNLEETMSSLRGTQVTH : :. . . :. :::..: :::.:. :::::::::::::::.:::: CCDS14 AFLKVDPELVVTVLGDLEQLLFSQMLDPESQRKRTVQNVLDLRQNLEETMSSLRGSQVTH 230 240 250 260 270 280 760 770 780 790 800 810 pF1KA1 STLETT-FDTNVTTEMSGRSILSLTGRPTPLSWRLGQSSPRLQAGDAPSMGNGYPPRANA :.:: : .:.. . . ::. ::..: .::::: ::::::::::::::.:.. ... CCDS14 SSLEMTCYDSD---DANPRSVSSLSNRSSPLSWRYGQSSPRLQAGDAPSVGGSCRSEGTP 290 300 310 320 330 340 820 830 840 850 860 pF1KA1 SRFINTESGRYVYSAPLRRQLASRGSSVCHVDVSDKA-GDEMDLEGISMDAPGYMSDGDV . ... : ..: .. :.: :. : . .... .. .::.::.. :::::.:. CCDS14 AWYMHGERAHYSHTMPMRSP--SKLSHISRLELVESLDSDEVDLKS------GYMSDSDL 350 360 370 380 390 870 880 890 900 910 920 pF1KA1 LSKNI-RTDDITSGYMTDGGLGLYTRRLNRLPDGMAVVRETLQRNTSLGLGDADSWDDSS ..:.. . ::::.: ::.:: CCDS14 MGKTMTEDDDITTG-----------------------------------------WDESS 400 410 930 940 950 960 970 980 pF1KA1 SVSSGISDTIDNLSTDDINTSSSISSYANTPASSRKNLDV--QTDAEKHSQVERNSLWSG :.:::.::. ::::....:.:::..: .::..::.: . .::.::.: .: . : . CCDS14 SISSGLSDASDNLSSEEFNASSSLNSLPSTPTASRRNSTIVLRTDSEKRSLAESGLSWFS 420 430 440 450 460 470 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KA1 DDVKKSDGG--SDSG-IKMEPG-SKWRRNPSDVSDESDKSTSGKKNPVISQTGSWRRGMT .. .:. ::: .::::: :::::. . :.:.:. :: ... :: ..: : CCDS14 ESEEKAPKKLEYDSGSLKMEPGTSKWRRERPESCDDSSKGGELKKPISLGHPGSLKKGKT 480 490 500 510 520 530 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KA1 AQVGITMPRTKASAPAGALKTPGTGKTDDAKVSEKGRLSPKASQVKRSPSDAGRSSGDES :..: : :... .:::. : ..:...::.:. : . ..:: :::::. ... CCDS14 PPVAVTSPITHTA--QSALKVAGK---PEGKATDKGKLAVKNTGLQRSSSDAGRDRLSDA 540 550 560 570 580 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KA1 KKPLPSSSRTPTANANSFGFKKQSGSAAGLAMITASGVTVTSRSATLGKIPKSSAL-VSR ::: ::. :.... :::.:: :.: : . .: ::::.:: :::.. :. CCDS14 KKP-PSGIARPSTSG-SFGYKKPP-PATGTATVMQTG-----GSATLSKIQKSSGIPVKP 590 600 610 620 630 640 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KA1 SAGRKSSMDGAQNQDDGYLALSSRTNLQYRSLPRPSKSNSRNGAGNRSS----TSSID-S :::.:.: ... . :.:: ..:.:.::::::::.::.: . .:.:.. .:::: : CCDS14 VNGRKTSLDVSNSAEPGFLAPGARSNIQYRSLPRPAKSSSMSVTGGRGGPRPVSSSIDPS 650 660 670 680 690 700 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KA1 NISSKSAGLPVPKLREPSKTALGSSLPGLVNQTDKEKGISSDNESVASCNSVKVNPAAQP .:.:..:: .:.::.:.: : . :. :::::.:: .. . . . ...... ..: CCDS14 LLSTKQGGLTPSRLKEPTKVASGRTTPAPVNQTDREKEKAKAKAVALDSDNISLKSIGSP 710 720 730 740 750 760 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KA1 VSSPAQTSLQPGAKYPDVASPTLRRLFGGKPTKQVPIATAENMKNSVVISNPHATMTQQG :.: . . .: : :: : . :::... . ..: .... CCDS14 ESTPKNQASHPTATKLAELPPT--------PLR----ATAKSFVKPPSLAN--LDKVNSN 770 780 790 800 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KA1 NLDSPSGSGVLSSGSSSPLYSKNVDLNQSPLAS----SPSSAHSAPSNSLTWGTNASSSS .:: ::.: . . .:. : . . . .:: : ::. . : :.. : . :. CCDS14 SLDLPSSSDT-THASKVPDLHATSSASGGPLPSCFTPSPAPILNINSASFSQGLELMSGF 810 820 830 840 850 860 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KA1 AVSKDGLGFQSVSSLHTSCESIDISLSSGGVPSHNSSTGLIASSKDDSLTPFVRTNSVKT .: :. . ..:.:: : ::... .: .:: :. . . .: .. .. . CCDS14 SVPKETRMYPKLSGLHRSMESLQMPMS---LPSAFPSSTPVPTPPAPPAAP-TEEETEEL 870 880 890 900 910 920 1460 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KA1 TLSESPLSSPAASPKFCRSTLPRKQDSDPHLDRNTLPKKGLRYTPTSQLRTQEDAKEWLR : : :: .. . ::. . :::::::::::: ::..::..:: . CCDS14 TWSGSPRAG--------------QLDSNQR-DRNTLPKKGLRY----QLQSQEETKERRH 930 940 950 960 1520 1530 1540 1550 1560 1570 pF1KA1 SHSAGGLQDTAANSPFSSGSSVTSPSGTRFNFSQLASPTTVTQMSLSNPTMLRTHSLSNA ::. ::: .. .: . : .. ... ......:::..: .: . :..:. . CCDS14 SHTIGGLPESDDQSELPSPPALPMSLSAKGQLTNIVSPTAAT-----TPRITRSNSIPTH 970 980 990 1000 1010 1580 1590 1600 1610 1620 1630 pF1KA1 DGQYDPYTDSRFRNSSMSLDEKSRTMSRSGSFRDGFEEVHGSSLSLVSSTSSVYSTPEEK .. .. :. :.. .:..:: :. . : ::::::: ..:::: :::.::.::.::. ::. CCDS14 EAAFELYSGSQM-GSTLSLAERPKGMIRSGSFRDPTDDVHGSVLSLASSASSTYSSAEER 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1640 1650 1660 1670 1680 1690 pF1KA1 CQSE-IRKLRRELDASQEKVSALTTQLTANAHLVAAFEQSLGNMTIRLQSLTMTAEQKDS ::: ::::::::..:::::..::.::.:::.::::::::: ::: ::. :. :::.::. CCDS14 MQSEQIRKLRRELESSQEKVATLTSQLSANANLVAAFEQSLVNMTSRLRHLAETAEEKDT 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1700 1710 1720 1730 1740 1750 pF1KA1 ELNELRKTIELLKKQNAAAQAAINGVINTPELNCKGNGTAQSADLRIRRQHSSDSVSSIN :: .::.::..:::.:. :::.:.:..:. : . : .:::.::.::::.::.: CCDS14 ELLDLRETIDFLKKKNSEAQAVIQGALNASETTPK--------ELRIKRQNSSDSISSLN 1140 1150 1160 1170 1180 1760 1770 1780 1790 1800 pF1KA1 SATSHSSVGSNIESDSKKKKRKNWVNELRSSFKQAFGKKKSPKSASSHSDIEEMT--DSS : :::::.::. ..:.::::.:.:: ::::::..::. ::.::::::.:::::.. ::: CCDS14 SITSHSSIGSSKDADAKKKKKKSWVYELRSSFNKAFSIKKGPKSASSYSDIEEIATPDSS 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1810 1820 1830 1840 1850 pF1KA1 LPSSPKLPHNGSTGSTPLLRNSHSNSL-------------------ISECMDSEAETVMQ :::::: :... ..: ...: :.:. .: . : . : . CCDS14 APSSPKLQHGSTETASPSIKSSTSSSVGTDVTEGPAHPAPHTRLFHANEEEEPEKKEVSE 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1860 1870 1880 1890 1900 pF1KA1 LRNELRDKEMKLTDIRLEALSSAHQLDQLREAMNRMQSEIEKLKAENDRLK---SESQGS ::.:: .:::::::::::::.::::::::::.:. :: :.. ::::::::: . :.:: CCDS14 LRSELWEKEMKLTDIRLEALNSAHQLDQLRETMHNMQLEVDLLKAENDRLKVAPGPSSGS 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1910 1920 1930 1940 1950 1960 pF1KA1 GCSRAPSQVSISASPRQSMGLS-QHSLNLTESTSLDMLLDDTGECSARKEGGRHVKIVVS ...:.. ..: :::.:.::. ::.. . . . .: . :. ..: ...:: CCDS14 TPGQVPGSSALS-SPRRSLGLALTHSFGPSLADTDLSPMDGISTCGPKEE--VTLRVVVR 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1970 1980 1990 2000 2010 2020 pF1KA1 FQEEMKWKEDSRPHLFLIGCIGVSGKTKWDVLDGVVRRLFKEYIIHVDPVSQLGLNSDSV . . : : . . :..:: ::::. : .:: .: ..::.:: ..::.: :::...:. CCDS14 MPPQHIIKGDLKQQEFFLGCSKVSGKVDWKMLDEAVFQVFKDYISKMDPASTLGLSTESI 1430 1440 1450 1460 1470 1480 2030 2040 2050 2060 2070 2080 pF1KA1 LGYSIGEIKRSNTSETPELLPCGYLVGENTTISVTVKGLAENSLDSLVFESLIPKPILQR ::::...:: .: ::. :: : :. :::..::: :. .::::::.:::::..:. CCDS14 HGYSISHVKRVLDAEPPEMPPCRR--GVNN-ISVSLKGLKEKCVDSLVFETLIPKPMMQH 1490 1500 1510 1520 1530 1540 2090 2100 2110 2120 2130 2140 pF1KA1 YVSLLIEHRRIILSGPSGTGKTYLANRLSEYIVLREGRELTDGVIATFNVDHKSSKELRQ :.:::..:::..::::::::::::.:::.::.: : :::.:.:...:::. ..: :.:. CCDS14 YISLLLKHRRLVLSGPSGTGKTYLTNRLAEYLVERSGREVTEGIVSTFNMHQQSCKDLQL 1550 1560 1570 1580 1590 1600 2150 2160 2170 2180 2190 2200 pF1KA1 YLSNLADQCNSENNAVDMPLVIILDNLHHVSSLGEIFNGLLNCKYHKCPYIIGTMNQATS ::::::.: . :.. :.::::.::.: ...:..:. :: :.:::::::::::: :: .. CCDS14 YLSNLANQIDRETGIGDVPLVILLDDLSEAGSISELVNGALTCKYHKCPYIIGTTNQPVK 1610 1620 1630 1640 1650 1660 2210 2220 2230 2240 2250 2260 pF1KA1 STPNLQLHHNFRWVLCANHTEPVKGFLGRFLRRKLMETEISGRVRNMELVKIIDWIPKVW ::: :: .:: . .:..::..::: :.:::::.:.. . . . ::....::.::.: CCDS14 MTPNHGLHLSFRMLTFSNNVEPANGFLVRYLRRKLVESDSDINANKEELLRVLDWVPKLW 1670 1680 1690 1700 1710 1720 2270 2280 2290 2300 2310 2320 pF1KA1 HHLNRFLEAHSSSDVTIGPRLFLSCPIDVDGSRVWFTDLWNYSIIPYLLEAVREGLQLYG .::. ::: ::.:: ::: .:::::: .. :.:: :::: :::::: :....:....: CCDS14 YHLHTFLEKHSTSDFLIGPCFFLSCPIGIEDFRTWFIDLWNNSIIPYLQEGAKDGIKVHG 1730 1740 1750 1760 1770 1780 2330 2340 2350 2360 2370 2380 pF1KA1 RRAPWEDPAKWVMDTYPWAASPQQHEWPPLLQLRPEDVGFDGYSMPREGSTSKQMPPSDA ..: ::::..:: :: :: .. :.. : .: : :: . . : : : :. ::. CCDS14 QKAAWEDPVEWVRDTLPWPSA--QQDQSKLYHLPPPTVGPHSIASPPEDRTVKDSTPSSL 1790 1800 1810 1820 1830 1840 2390 2400 2410 2420 2430 pF1KA1 EGDPLMNMLMRLQEAANYSSPQSYDSDSNSNSHHDDILDSSLESTL ..:::: ::..::::::: .: : .. ::: .:..:: CCDS14 DSDPLMAMLLKLQEAANYI--ESPDRET--------ILDPNLQATL 1850 1860 1870 2432 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 20:03:16 2016 done: Thu Nov 3 20:03:17 2016 Total Scan time: 9.810 Total Display time: 2.460 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]