FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1450, 1114 aa 1>>>pF1KA1450 1114 - 1114 aa - 1114 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4439+/-0.000394; mu= 12.2281+/- 0.025 mean_var=129.2094+/-26.715, 0's: 0 Z-trim(116.4): 23 B-trim: 841 in 1/49 Lambda= 0.112831 statistics sampled from 27473 (27496) to 27473 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.671), E-opt: 0.2 (0.322), width: 16 Scan time: 16.530 The best scores are: opt bits E(85289) NP_065891 (OMIM: 612768) folliculin-interacting pr (1114) 7440 1223.3 0 NP_001310845 (OMIM: 612768) folliculin-interacting (1137) 7216 1186.8 0 XP_011530456 (OMIM: 612768) PREDICTED: folliculin- (1112) 6013 991.0 0 XP_005263215 (OMIM: 612768) PREDICTED: folliculin- (1144) 6013 991.0 0 XP_005263213 (OMIM: 612768) PREDICTED: folliculin- (1167) 6013 991.0 0 XP_016863976 (OMIM: 612768) PREDICTED: folliculin- (1150) 5263 868.9 0 XP_005263217 (OMIM: 612768) PREDICTED: folliculin- (1061) 5176 854.8 0 NP_001332972 (OMIM: 612768) folliculin-interacting ( 760) 5123 846.1 0 NP_001008738 (OMIM: 610594) folliculin-interacting (1138) 2225 374.4 2.1e-102 NP_001333043 (OMIM: 610594) folliculin-interacting (1121) 1608 274.0 3.6e-72 NP_588613 (OMIM: 610594) folliculin-interacting pr (1166) 1608 274.0 3.7e-72 NP_001333042 (OMIM: 610594) folliculin-interacting ( 508) 1255 216.3 3.7e-55 >>NP_065891 (OMIM: 612768) folliculin-interacting protei (1114 aa) initn: 7440 init1: 7440 opt: 7440 Z-score: 6547.4 bits: 1223.3 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 7440; 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