Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1460
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1460, 1962 aa
1>>>pF1KA1460 1962 - 1962 aa - 1962 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4459+/-0.00117; mu= 3.1816+/- 0.071
mean_var=334.5015+/-67.329, 0's: 0 Z-trim(112.7): 57 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.070125
statistics sampled from 13364 (13406) to 13364 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.715), E-opt: 0.2 (0.412), width: 16
Scan time: 5.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10624.2 TNRC6A gene_id:27327|Hs108|chr16 (1962) 13475 1378.9 0
CCDS81959.1 TNRC6A gene_id:27327|Hs108|chr16 (1913) 8856 911.6 0
CCDS54533.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22 (1833) 2584 277.1 4.7e-73
CCDS45798.1 TNRC6C gene_id:57690|Hs108|chr17 (1690) 2525 271.1 2.7e-71
CCDS46713.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22 (1723) 2015 219.5 9.5e-56
CCDS46712.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22 (1029) 1756 193.1 5e-48
CCDS45799.1 TNRC6C gene_id:57690|Hs108|chr17 (1726) 1691 186.7 7e-46
>>CCDS10624.2 TNRC6A gene_id:27327|Hs108|chr16 (1962 aa)
initn: 13475 init1: 13475 opt: 13475 Z-score: 7379.5 bits: 1378.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 13475; 100.0% identity (100.0% similar) in 1962 aa overlap (1-1962:1-1962)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MRELEAKATKDVERNLSRDLVQEEEQLMEEKKKKKDDKKKKEAAQKKATEQKIKVPEQIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MRELEAKATKDVERNLSRDLVQEEEQLMEEKKKKKDDKKKKEAAQKKATEQKIKVPEQIK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 PSVSQPQPANSNNGTSTATSTNNNAKRATANNQQPQQQQQQQQPQQQQPQQQPQPQPQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PSVSQPQPANSNNGTSTATSTNNNAKRATANNQQPQQQQQQQQPQQQQPQQQPQPQPQQQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 QPQQQPQALPRYPREVPPRFRHQEHKQLLKRGQHFPVIAANLGSAVKVLNSQSESSALTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QPQQQPQALPRYPREVPPRFRHQEHKQLLKRGQHFPVIAANLGSAVKVLNSQSESSALTN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 QQPQNNGEVQNSKNQSDINHSTSGSHYENSQRGPVSSTSDSSTNCKNAVVSDLSEKEAWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QQPQNNGEVQNSKNQSDINHSTSGSHYENSQRGPVSSTSDSSTNCKNAVVSDLSEKEAWP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 SAPGSDPELASECMDADSASSSESERNITIMASGNTGGEKDGLRNSTGLGSQNKFVVGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SAPGSDPELASECMDADSASSSESERNITIMASGNTGGEKDGLRNSTGLGSQNKFVVGSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 SNNVGHGSSTGPWGFSHGAIISTCQVSVDAPESKSESSNNRMNAWGTVSSSSNGGLNPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SNNVGHGSSTGPWGFSHGAIISTCQVSVDAPESKSESSNNRMNAWGTVSSSSNGGLNPST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LNSASNHGAWPVLENNGLALKGPVGSGSSGINIQCSTIGQMPNNQSINSKVSGGSTHGTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LNSASNHGAWPVLENNGLALKGPVGSGSSGINIQCSTIGQMPNNQSINSKVSGGSTHGTW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 GSLQETCESEVSGTQKVSFSGQPQNITTEMTGPNNTTNFMTSSLPNSGSVQNNELPSSNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GSLQETCESEVSGTQKVSFSGQPQNITTEMTGPNNTTNFMTSSLPNSGSVQNNELPSSNT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 GAWRVSTMNHPQMQAPSGMNGTSLSHLSNGESKSGGSYGTTWGAYGSNYSGDKCSGPNGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GAWRVSTMNHPQMQAPSGMNGTSLSHLSNGESKSGGSYGTTWGAYGSNYSGDKCSGPNGQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 ANGDTVNATLMQPGVNGPMGTNFQVNTNKGGGVWESGAANSQSTSWGSGNGANSGGSRRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ANGDTVNATLMQPGVNGPMGTNFQVNTNKGGGVWESGAANSQSTSWGSGNGANSGGSRRG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 WGTPAQNTGTNLPSVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNGWKSTEEEDQGSATSQTNEQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WGTPAQNTGTNLPSVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNGWKSTEEEDQGSATSQTNEQS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 SVWAKTGGTVESDGSTESTGRLEEKGTGESQSRDRRKIDQHTLLQSIVNRTDLDPRVLSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SVWAKTGGTVESDGSTESTGRLEEKGTGESQSRDRRKIDQHTLLQSIVNRTDLDPRVLSN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 SGWGQTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEAWGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SGWGQTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEAWGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 SGWGDPKPALRWGDSKGSNCQGGWEDDSAATGMVKSNQWGNCKEEKAAWNDSQKNKQGWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SGWGDPKPALRWGDSKGSNCQGGWEDDSAATGMVKSNQWGNCKEEKAAWNDSQKNKQGWG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 DGQKSSQGWSVSASDNWGETSRNNHWGEANKKSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGN
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CCDS10 DGQKSSQGWSVSASDNWGETSRNNHWGEANKKSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 NINPNNSSGWDESSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNKQQDIVGSWGIPP
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CCDS10 NINPNNSSGWDESSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNKQQDIVGSWGIPP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 ATGKPPGTGWLGGPIPAPAKEEEPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNYKNVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ATGKPPGTGWLGGPIPAPAKEEEPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNYKNVN
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 MWNKNVPNGNSRSDQQAQVHQLLTPASAISNKEASSGSGWGEPWGEPSTPATTVDNGTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MWNKNVPNGNSRSDQQAQVHQLLTPASAISNKEASSGSGWGEPWGEPSTPATTVDNGTSA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 WGKPIDSGPSWGEPIAAASSTSTWGSSSVGPQALSKSGPKSMQDGWCGDDMPLPGNRPTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WGKPIDSGPSWGEPIAAASSTSTWGSSSVGPQALSKSGPKSMQDGWCGDDMPLPGNRPTG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 WEEEEDVEIGMWNSNSSQELNSSLNWPPYTKKMSSKGLSGKKRRRERGMMKGGNKQEEAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WEEEEDVEIGMWNSNSSQELNSSLNWPPYTKKMSSKGLSGKKRRRERGMMKGGNKQEEAW
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA1 INPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGMLQDKRMEIDKHSLNIGDYNRTVGKGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 INPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGMLQDKRMEIDKHSLNIGDYNRTVGKGPG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA1 SRPQISKESSMERNPYFDKDGIVADESQNMQFMSSQSMKLPPSNSALPNQALGSIAGLGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SRPQISKESSMERNPYFDKDGIVADESQNMQFMSSQSMKLPPSNSALPNQALGSIAGLGM
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA1 QNLNSVRQNGNPSMFGVGNTAAQPRGMQQPPAQPLSSSQPNLRAQVPPPLLSPQVPVSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QNLNSVRQNGNPSMFGVGNTAAQPRGMQQPPAQPLSSSQPNLRAQVPPPLLSPQVPVSLL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA1 KYAPNNGGLNPLFGPQQVAMLNQLSQLNQLSQISQLQRLLAQQQRAQSQRSVPSGNRPQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KYAPNNGGLNPLFGPQQVAMLNQLSQLNQLSQISQLQRLLAQQQRAQSQRSVPSGNRPQQ
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 DQQGRPLSVQQQMMQQSRQLDPNLLVKQQTPPSQQQPLHQPAMKSFLDNVMPHTTPELQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DQQGRPLSVQQQMMQQSRQLDPNLLVKQQTPPSQQQPLHQPAMKSFLDNVMPHTTPELQK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 GPSPINAFSNFPIGLNSNLNVNMDMNSIKEPQSRLRKWTTVDSISVNTSLDQNSSKHGAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GPSPINAFSNFPIGLNSNLNVNMDMNSIKEPQSRLRKWTTVDSISVNTSLDQNSSKHGAI
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA1 SSGFRLEESPFVPYDFMNSSTSPASPPGSIGDGWPRAKSPNGSSSVNWPPEFRPGEPWKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SSGFRLEESPFVPYDFMNSSTSPASPPGSIGDGWPRAKSPNGSSSVNWPPEFRPGEPWKG
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA1 YPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINTVREVDHLRDRNSGSSSSLNTTLPSTSAWSSIRASN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINTVREVDHLRDRNSGSSSSLNTTLPSTSAWSSIRASN
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA1 YNVPLSSTAQSTSARNSDSKLTWSPGSVTNTSLAHELWKVPLPPKNITAPSRPPPGLTGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YNVPLSSTAQSTSARNSDSKLTWSPGSVTNTSLAHELWKVPLPPKNITAPSRPPPGLTGQ
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA1 KPPLSTWDNSPLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLTPQIDGSTLRTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KPPLSTWDNSPLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLTPQIDGSTLRTL
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA1 CMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEFASEEEISRFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEFASEEEISRFF
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA1 AQSQSLTPSPGWQSLGSSQSRLGSLDCSHSFSSRTDLNHWNGAGLSGTNCGDLHGTSLWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AQSQSLTPSPGWQSLGSSQSRLGSLDCSHSFSSRTDLNHWNGAGLSGTNCGDLHGTSLWG
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960
pF1KA1 TPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM
1930 1940 1950 1960
>>CCDS81959.1 TNRC6A gene_id:27327|Hs108|chr16 (1913 aa)
initn: 8829 init1: 8829 opt: 8856 Z-score: 4854.2 bits: 911.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 13052; 97.5% identity (97.5% similar) in 1962 aa overlap (1-1962:1-1913)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MRELEAKATKDVERNLSRDLVQEEEQLMEEKKKKKDDKKKKEAAQKKATEQKIKVPEQIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MRELEAKATKDVERNLSRDLVQEEEQLMEEKKKKKDDKKKKEAAQKKATEQKIKVPEQIK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 PSVSQPQPANSNNGTSTATSTNNNAKRATANNQQPQQQQQQQQPQQQQPQQQPQPQPQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PSVSQPQPANSNNGTSTATSTNNNAKRATANNQQPQQQQQQQQPQQQQPQQQPQPQPQQQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 QPQQQPQALPRYPREVPPRFRHQEHKQLLKRGQHFPVIAANLGSAVKVLNSQSESSALTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QPQQQPQALPRYPREVPPRFRHQEHKQLLKRGQHFPVIAANLGSAVKVLNSQSESSALTN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 QQPQNNGEVQNSKNQSDINHSTSGSHYENSQRGPVSSTSDSSTNCKNAVVSDLSEKEAWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QQPQNNGEVQNSKNQSDINHSTSGSHYENSQRGPVSSTSDSSTNCKNAVVSDLSEKEAWP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 SAPGSDPELASECMDADSASSSESERNITIMASGNTGGEKDGLRNSTGLGSQNKFVVGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SAPGSDPELASECMDADSASSSESERNITIMASGNTGGEKDGLRNSTGLGSQNKFVVGSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 SNNVGHGSSTGPWGFSHGAIISTCQVSVDAPESKSESSNNRMNAWGTVSSSSNGGLNPST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SNNVGHGSSTGPWGFSHGAIISTCQVSVDAPESKSESSNNRMNAWGTVSSSSNGGLNPST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LNSASNHGAWPVLENNGLALKGPVGSGSSGINIQCSTIGQMPNNQSINSKVSGGSTHGTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LNSASNHGAWPVLENNGLALKGPVGSGSSGINIQCSTIGQMPNNQSINSKVSGGSTHGTW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 GSLQETCESEVSGTQKVSFSGQPQNITTEMTGPNNTTNFMTSSLPNSGSVQNNELPSSNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GSLQETCESEVSGTQKVSFSGQPQNITTEMTGPNNTTNFMTSSLPNSGSVQNNELPSSNT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 GAWRVSTMNHPQMQAPSGMNGTSLSHLSNGESKSGGSYGTTWGAYGSNYSGDKCSGPNGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GAWRVSTMNHPQMQAPSGMNGTSLSHLSNGESKSGGSYGTTWGAYGSNYSGDKCSGPNGQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 ANGDTVNATLMQPGVNGPMGTNFQVNTNKGGGVWESGAANSQSTSWGSGNGANSGGSRRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ANGDTVNATLMQPGVNGPMGTNFQVNTNKGGGVWESGAANSQSTSWGSGNGANSGGSRRG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 WGTPAQNTGTNLPSVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNGWKSTEEEDQGSATSQTNEQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 WGTPAQNTGTNLPSVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNGWKSTEEEDQGSATSQTNEQS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 SVWAKTGGTVESDGSTESTGRLEEKGTGESQSRDRRKIDQHTLLQSIVNRTDLDPRVLSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SVWAKTGGTVESDGSTESTGRLEEKGTGESQSRDRRKIDQHTLLQSIVNRTDLDPRVLSN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 SGWGQTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEAWGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SGWGQTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEAWGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 SGWGDPKPALRWGDSKGSNCQGGWEDDSAATGMVKSNQWGNCKEEKAAWNDSQKNKQGWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SGWGDPKPALRWGDSKGSNCQGGWEDDSAATGMVKSNQWGNCKEEKAAWNDSQKNKQGWG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 DGQKSSQGWSVSASDNWGETSRNNHWGEANKKSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DGQKSSQGWSVSASDNWGETSRNNHWGEANKKSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 NINPNNSSGWDESSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNKQQDIVGSWGIPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NINPNNSSGWDESSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNKQQDIVGSWGIPP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 ATGKPPGTGWLGGPIPAPAKEEEPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNYKNVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ATGKPPGTGWLGGPIPAPAKEEEPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNYKNVN
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 MWNKNVPNGNSRSDQQAQVHQLLTPASAISNKEASSGSGWGEPWGEPSTPATTVDNGTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MWNKNVPNGNSRSDQQAQVHQLLTPASAISNKEASSGSGWGEPWGEPSTPATTVDNGTSA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA1 WGKPIDSGPSWGEPIAAASSTSTWGSSSVGPQALSKSGPKSMQDGWCGDDMPLPGNRPTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 WGKPIDSGPSWGEPIAAASSTSTWGSSSVGPQALSKSGPKSMQDGWCGDDMPLPGNRPTG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KA1 WEEEEDVEIGMWNSNSSQELNSSLNWPPYTKKMSSKGLSGKKRRRERGMMKGGNKQEEAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 WEEEEDVEIGMWNSNSSQELNSSLNWPPYTKKMSSKGLSGKKRRRERGMMKGGNKQEEAW
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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pF1KA1 INPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGMLQDKRMEIDKHSLNIGDYNRTVGKGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 INPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGMLQDKRMEIDKHSLNIGDYNRTVGKGPG
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pF1KA1 SRPQISKESSMERNPYFDKDGIVADESQNMQFMSSQSMKLPPSNSALPNQALGSIAGLGM
:::::::::::::::::::
CCDS81 SRPQISKESSMERNPYFDK-----------------------------------------
1270
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 --------NGNPSMFGVGNTAAQPRGMQQPPAQPLSSSQPNLRAQVPPPLLSPQVPVSLL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KYAPNNGGLNPLFGPQQVAMLNQLSQLNQLSQISQLQRLLAQQQRAQSQRSVPSGNRPQQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DQQGRPLSVQQQMMQQSRQLDPNLLVKQQTPPSQQQPLHQPAMKSFLDNVMPHTTPELQK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GPSPINAFSNFPIGLNSNLNVNMDMNSIKEPQSRLRKWTTVDSISVNTSLDQNSSKHGAI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SSGFRLEESPFVPYDFMNSSTSPASPPGSIGDGWPRAKSPNGSSSVNWPPEFRPGEPWKG
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pF1KA1 YPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINTVREVDHLRDRNSGSSSSLNTTLPSTSAWSSIRASN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 YPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINTVREVDHLRDRNSGSSSSLNTTLPSTSAWSSIRASN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 YNVPLSSTAQSTSARNSDSKLTWSPGSVTNTSLAHELWKVPLPPKNITAPSRPPPGLTGQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KPPLSTWDNSPLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLTPQIDGSTLRTL
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pF1KA1 CMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEFASEEEISRFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 CMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEFASEEEISRFF
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pF1KA1 AQSQSLTPSPGWQSLGSSQSRLGSLDCSHSFSSRTDLNHWNGAGLSGTNCGDLHGTSLWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AQSQSLTPSPGWQSLGSSQSRLGSLDCSHSFSSRTDLNHWNGAGLSGTNCGDLHGTSLWG
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pF1KA1 TPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM
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pF1KA1 MRELEAKATKDVERNLSRDLVQE-EEQLMEEKKKKKDDKKKKEAAQKKATEQKIKVPEQI
:. :: ::::::.::.::.:::::::.:: .:::: ::::
CCDS54 MREKEQEREEQLMEDKKRKKEDKKKKEATQK-VTEQKTKVPEVT
10 20 30 40
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pF1KA1 KPSVSQPQPANSNNGTSTATSTN--NNAKRATANNQQPQQQQQQQQPQQQQPQQQPQPQP
:::.::: : : :.: . .: :::::... : ::
CCDS54 KPSLSQPTAA-SPIGSSPSPPVNGGNNAKRVAVPNGQP----------------------
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pF1KA1 QQQQPQQQPQALPRYPREVPPRFR-HQEHKQLLKRGQHFPVIAANLGSAVKVLNSQSESS
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CCDS54 --------PSAARYMPREVPPRFRCQQDHKVLLKRGQPPPPSCMLLGGGAGPPPCTAPGA
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pF1KA1 ALTNQQPQNNGEVQNSKNQSDINHSTSG---SHYENSQRGP-VSSTSDSSTN---CKNAV
.: : .: . .:.. . . . .: :.: :: : .::.. .: : . :
CCDS54 NPNNAQV--TGALLQSESGTAPDSTLGGAAASNYANSTWGSGASSNNGTSPNPIHIWDKV
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. : :. : :: ..: : .:: : .:::. ::.. :.: ..: :
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::: . : . :. . : : . : ::.. .: .:. :: .. : .:
CCDS54 KGSQCQ------SASSGNECNLGVWKSDPKAK------SVQSSNSTTEN-NNGLGNWRNV
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pF1KA1 SSSS--NGGLNPSTLNSASNHGAWPVLENNGLALKGPVGSGSSGINIQCSTIGQMPNNQS
:... . : . :..: :: .:::.: ..: . :: . . .:. . : ::.:: .:.
CCDS54 SGQDRIGPGSGFSNFNPNSNPSAWPALVQEGTSRKGALETDNSNSSAQVSTVGQTSREQQ
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pF1KA1 INSKVSGGSTHGTWGSLQETCESEVSGTQKVSFSGQPQNITTEMTGPNN-TTNFMTSSLP
::. : .:.. : ::. : . ::.: .:: .. : :
CCDS54 --SKM------------------ENAGVNFV-VSGREQAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSP
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pF1KA1 NSGSVQNNELP-SSNTGAWRVSTMNHPQMQAPSGMNGTSLSHLSNGESKSG--GSYGTTW
: ..:. .: . . : :: .::: :.:. :.: ::.:..
CCDS54 NP--MENKGMPFGMGLGNTSRST------DAPSQ---------STGDRKTGSVGSWGAAR
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pF1KA1 GAYGSN-YSGDKCSGPNGQANG----DTVNATLMQPGVNGPMGTNFQVNTNKGGGVWESG
: :.. ::.. :: ::. :: :. ... .: .. : . ... :. . :: :. :
CCDS54 GPSGTDTVSGQSNSGNNGN-NGKEREDSWKGASVQKST-GSKNDSWDNNNRSTGGSWNFG
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pF1KA1 AANSQSTSWGSGNGANSGGSRRGWGTPAQNTGTNLPSV-EWNKLPSNQHSNDSANGNGKT
.:....:: :: .:: :. : : ::.. .. ::. :.. .:. .: : :
CCDS54 PQDSNDNKWGEGNKMTSGVSQGEWKQP---TGSDELKIGEWSG-PNQPNSSTGAWDNQK-
490 500 510 520 530 540
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pF1KA1 FTNGWKSTEEEDQGSATSQTNEQSSVWAKTGGTVESDGSTESTGRLEEKGTGESQSRDRR
: :.::.: :. :....... :. . .::: .. :...:.. ::
CCDS54 ---G--HPLPENQGNA------QAPCWGRSSSSTGSEVGGQSTGSNHKAGSSDSHNSGRR
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pF1KA1 KI-----DQHTLLQSIVNRTDLDPRVLSNSGWGQTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGTE
. : ...::....:::::::::::.::::: :::.:.:: : :: : :.:.:::
CCDS54 SYRPTHPDCQAVLQTLLSRTDLDPRVLSNTGWGQTQIKQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTE
600 610 620 630 640 650
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pF1KA1 AWGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSVSGWGDPKPALRWGDSKGSNCQGGWEDDSAAT
.: :.:::: :::. : .:. .. . ::::. . . .: : :.. :::.: . .
CCDS54 GWESAATQTKNSGGWGD--APSQSNQMK-SGWGELSASTEWKDPKNT---GGWNDYKNNN
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pF1KA1 GMVKSNQWGNCK-EEK--AAWNDSQKNKQGWGDGQKSSQGWSVSASDNWGET---SRNNH
:..::. . .:: ..::.. .. :::: :.. .:::: :....::: ..:..
CCDS54 ----SSNWGGGRPDEKTPSSWNENPSKDQGWGGGRQPNQGWS-SGKNGWGEEVDQTKNSN
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pF1KA1 WGEANKKSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGNNINPNNSS--GWDESSKPTPSQGWG
: :.... ::::.: :.. ::::. : . .: :: :. : .:. :.
CCDS54 WE----------SSASKPVSGWGEGGQNEIGTWGNGGNASLASKGGW-EDCKRSPA--WN
770 780 790 800
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pF1KA1 DPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNK--QQDIVGSWG--IPPATG--KPPGTGWLGGPIPA
. .. .: :. . . . :. : . :::: :: : .: ...: .:: ::
CCDS54 ETGRQPNS--WNKQHQQQQPPQQPPPPQPEASGSWGGPPPPPPGNVRPSNSSWSSGPQPA
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pF1KA1 PAKEEEPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNYKNVNMWNKNVPNGNSRSDQQA
:.:::.:::::::.:: :::.:::::::::::..:::::::.:.:: .: . . .
CCDS54 TPKDEEPSGWEEPSPQSISRKMDIDDGTSAWGDPNSYNYKNVNLWDKNSQGGPAPREPN-
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pF1KA1 QVHQLLTPASAISNKEASSGSGWGEPWGEPSTPATTVDNGTSAWGKPIDSGPSWGEPIAA
: :: ...: :: :.. . :: ::::::::.: .:.:.::: .
CCDS54 ----LPTP---MTSKSASV-------WSKSTPPAP--DNGTSAWGEPNESSPGWGEMDDT
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..::. ::.. .. :.:. : . ::::::: .: :. : : .:::::: :.::...
CCDS54 GASTTGWGNTPANAPNAM-KPNSKSMQDGWGESDGPVTGARHPSWEEEEDG--GVWNTTG
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pF1KA1 SQELNSSLNWPPYTKKMSSKGLSGKKRRRERGMMKGGNKQEEAWINPFVKQFSNISFSRD
:: :: : .: : .:::. . .:::: ...:.::..:::::...
CCDS54 SQGSASSHN-------SASWGQGGKKQMKCS--LKGGN--NDSWMNPLAKQFSNMGLL--
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pF1KA1 SPEENVQSNKMDLSGGMLQDKRMEIDKHSLNIGDYNRTVGKG-PGSRPQISKE-SSMERN
: :. :.::::: : :.::....::...:.::.: . : : :: ::. .. . .
CCDS54 SQTEDNPSSKMDLSVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKDMGTTDSG
1080 1090 1100 1110 1120 1130
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pF1KA1 PYFDK--------DGIVADESQNMQFMSSQSMKLPPSNSALPNQALGSIA-GLGMQNLNS
:::.: :: ..::. : : :.:: ::.:.::: .::.:. ::. ::. .
CCDS54 PYFEKLTLPFSNQDGCLGDEAPCSPFSPSPSYKLSPSGSTLPNVSLGAIGTGLNPQNF-A
1140 1150 1160 1170 1180 1190
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pF1KA1 VRQNGNPSMFGVGNTAAQPRGMQQPPAQPLSSSQPNLRAQVPPPLLSPQVPVSLLKYAPN
.::.:. ..: ::..:: ::.. : .:::.:: :.::::::: ..:::: .:.:: ::
CCDS54 ARQGGSHGLF--GNSTAQSRGLHTP-VQPLNSS-PSLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFPN
1200 1210 1220 1230 1240
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pF1KA1 NG---GL---NPLFGPQQVAMLNQLSQLNQLSQISQLQRLLAQQQRAQ---SQRSVPSGN
.: :: .: ..:::.:::.:: :. :.. :: :: :::. : .::.. ..
CCDS54 SGLSPGLFNVGPQLSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQL--LLQQQQQQQLLQNQRKISQAV
1250 1260 1270 1280 1290 1300
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pF1KA1 RPQQDQQ-GRPLS-VQQQMMQQSRQLDPNLLVKQQTPPSQQQPLHQPAMKSFLDNVMPHT
: ::.:: .: .: .:::..::.:: : ...: : . : :::..:..
CCDS54 RQQQEQQLARMVSALQQQQQQQQRQ-----------PGMKHSPSHPVGPKPHLDNMVPNA
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pF1KA1 T----PELQ-KGPSPINAFSNFPIGLNSNLNVNMDMNSIKEP--QSRLRKWTTV-DSISV
:.:: ::: : .. :..:. .... : . :: .::...::.. ...
CCDS54 LNVGLPDLQTKGPIP-----GYGSGFSSG-GMDYGMVGGKEAGTESRFKQWTSMMEGLPS
1360 1370 1380 1390 1400
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pF1KA1 NTSLDQNSSKHGAI-SSGFRLEESPFVPYDFMNSSTSPASPPGSIGDGWPRAKSPN----
.. . : :.::: . : ::. .:.. ..: .. : ::.: ::::
CCDS54 VATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQFDIIPGDTL-GGHTGPAGDSWLPAKSPPTNKI
1410 1420 1430 1440 1450 1460
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pF1KA1 GSSSVN--WPPEFRPGEPWKGYPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINTVREVDH--LRDRNS
::.: : :::::.:: :::: :::::.:::::::::... . . . ..:: ::: ..
CCDS54 GSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYVTPGSVLGGTATSPIVDTDHQLLRDNTT
1470 1480 1490 1500 1510 1520
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pF1KA1 GSSSSLNTTLPSTSAWSSIRASNYNVPLSSTAQSTSARNSDSKLTWSPGSVTN--TSLAH
::.:::::.::: .:: ::. . ....::::. : : :::: . . : :..
CCDS54 GSNSSLNTSLPSPGAWP-YSASDNSF---TNVHSTSAKFPDYKSTWSPDPIGHNPTHLSN
1530 1540 1550 1560 1570 1580
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pF1KA1 ELWKVPLPPKNITAPSRPPPGLTGQKPPLSTWDNSPLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESS
..:: . .: : :::::::. :: : :... : :::..:.: . .:.:....
CCDS54 KMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKPS-SPWSSTAPRSVRGWGTQDSRLASASTWSDGG
1590 1600 1610 1620 1630 1640
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pF1KA1 SGRITNWLVLKNLTPQIDGSTLRTLCMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKS
: : . ::::.:::::::::::::.:::::::.:::::: .:.::.:::.:.:..::: .
CCDS54 SVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLNLTQGTALIRYSTKQEAAKAQTA
1650 1660 1670 1680 1690 1700
1840 1850 1860 1870 1880
pF1KA1 LHMCVLGNTTILAEFASEEEISRFFAQSQSLTP--SP-----GWQSLGSSQSRLGSLDCS
::::::::::::::::...:.:::.::.: :: .: ::::: ..:.. . .
CCDS54 LHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPA
1710 1720 1730 1740 1750 1760
1890 1900 1910 1920 1930 1940
pF1KA1 HS-FSSRTDLNHWNGAGLSGTNCGDLHGTSLWGTPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPIN
. :.. : :..:.... .:.. .:: :.:::: :.::.:::: :. ::. ..::.:.
CCDS54 LNLFGGSTGLGQWSSSA-GGSSGADLAGASLWGPPNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPAPL-
1770 1780 1790 1800 1810 1820
1950 1960
pF1KA1 AFLSVDHLGGGGESM
: : ::::..:.
CCDS54 --LPGDLLGGGSDSI
1830
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pF1KA1 SAPGSDPELASECMDADSASSSESERNITIMASGNTGGEKDG-LRNSTGLGSQNKFVVGS
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CCDS45 MATGSAQGNFTGHTKKTNGNNGTNGALVQS
10 20 30
300 310 320 330 340
pF1KA1 SSNN----VGHGSSTGP----WGFSHGAIISTCQVSVDAPESKSES--SNNR-MNAWGTV
::. .: ..:.: :: . :. . . ::.. ..: .. ...: .: ::
CCDS45 PSNQSALGAGGANSNGSAARVWGVATGSSSGLAHCSVSGGDGKMDTMIGDGRSQNCWG--
40 50 60 70 80
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 SSSSNGGLNPSTLNSASNHGAWPVLENNGLALKGPVGSGSSGINIQCSTIGQMPNNQSIN
.:.::.:.: . :: .: .::::: ..: . : . :.: :.::: .:: :
CCDS45 ASNSNAGINLN-LNPNANPAAWPVLGHEGTVATG----NPSSICSPVSAIGQNMGNQ--N
90 100 110 120 130 140
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pF1KA1 SKVSGGSTHGTWGSL--QETCESEVSGTQKVSFSGQPQNITTEMTGPNNTTNFMTSSLPN
.. .: : :.::.: ::. : ..: .:.::::.::::..:. ::::: : :.:: ::
CCDS45 GNPTG--TLGAWGNLLPQESTEPQTSTSQNVSFSAQPQNLNTD--GPNNT-NPMNSS-PN
150 160 170 180 190
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pF1KA1 S-GSVQNNELPSSNTG-AWRVSTMNHPQMQAPSGMNGTSLSHLSNGESKSGGSYGTTWG-
...:.: :: : : : .... :..:. : ::.:.:..:.: .. : ...::
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:::.:: :::: :::::.:::::::::... . . . ..:: ::: ..::.:::::.:
CCDS46 PEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYVTPGSVLGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSL
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1670 1680 1690 1700 1710 1720
pF1KA1 PSTSAWSSIRASNYNVPLSSTAQSTSARNSDSKLTWSPGSVTN--TSLAHELWKVPLPPK
:: .:: ::. . ....::::. : : :::: . . : :....:: . .
CCDS46 PSPGAWP-YSASDNSF---TNVHSTSAKFPDYKSTWSPDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSR
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1730 1740 1750 1760 1770 1780
pF1KA1 NITAPSRPPPGLTGQKPPLSTWDNSPLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVL
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CCDS46 NTTPLPRPPPGLTNPKPS-SPWSSTAPRSVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVL
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1790 1800 1810 1820 1830 1840
pF1KA1 KNLTPQIDGSTLRTLCMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTT
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CCDS46 HNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLNLTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTT
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1850 1860 1870 1880 1890
pF1KA1 ILAEFASEEEISRFFAQSQSLTP--SP-----GWQSLGSSQSRLGSLDCSHS-FSSRTDL
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CCDS46 ILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGL
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1900 1910 1920 1930 1940 1950
pF1KA1 NHWNGAGLSGTNCGDLHGTSLWGTPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGG
..:.... .:.. .:: :.:::: :.::.:::: :. ::. ..::.:. : : :::
CCDS46 GQWSSSA-GGSSGADLAGASLWGPPNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPAPL---LPGDLLGG
1670 1680 1690 1700 1710
1960
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:..:.
CCDS46 GSDSI
1720
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CCDS46 GN--NDSWMNPLAKQFSNMGLL--SQTEDNPSSKMDLSVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFN
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CCDS46 ------------------GGSHGLF--GNSTAQSRGLHTP-VQPLNSS-PSLRAQVPPQF
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. : .::.. .. : ::.:: .: .: .:::..::.:: : ...: :
CCDS46 QQQLLQNQRKISQAVRQQQEQQLARMVSALQQQQQQQQRQ-----------PGMKHSPSH
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::...::.. ... .. . : :.::: . : ::. .:.. ..: .. :
CCDS46 SRFKQWTSMMEGLPSVATQEANMHKNGAIVAPGKTRGGSPYNQFDIIPGDTL-GGHTGPA
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pF1KA1 GDGWPRAKSPN----GSSSVN--WPPEFRPGEPWKGYPNIDPETDPYVTPGSVINNLSIN
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CCDS46 GDSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYVTPGSVLGGTATS
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CCDS46 PIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWP-YSASDNSF---TNVHSTSAKFPDYKST
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pF1KA1 WSPGSVTN--TSLAHELWKVPLPPKNITAPSRPPPGLTGQKPPLSTWDNSPLRIGGGWGN
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CCDS46 WSPDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKPS-SPWSSTAPRSVRGWGT
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CCDS46 QDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLNLTQGTAL
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pF1KA1 VRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEFASEEEISRFFAQSQSLTP--SP-----GWQ
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CCDS46 IRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQ
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pF1KA1 SLGSSQSRLGSLDCSHS-FSSRTDLNHWNGAGLSGTNCGDLHGTSLWGTPHYSTSLWGPP
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CCDS46 SLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGLGQWSSSA-GGSSGADLAGASLWGPPNYSSSLWGVP
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pF1KA1 SSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM
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CCDS46 TVEDPHRMGSPAPL---LPGDLLGGGSDSI
1010 1020
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CCDS45 MATGSAQGNFTGHTKKTNGNNGTNGALVQS
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CCDS45 PSNQSALGAGGANSNGSAARVWGVATGSSSGLAHCSVSGGDGKMDTMIGDGRSQNCWG--
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CCDS45 ASNSNAGINLN-LNPNANPAAWPVLGHEGTVATG----NPSSICSPVSAIGQNMGNQ--N
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CCDS45 GNPTG--TLGAWGNLLPQESTEPQTSTSQNVSFSAQPQNLNTD--GPNNT-NPMNSS-PN
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CCDS45 PINAMQTNGLP--NWGMAVGMGAIIPPHLQGLPGANGSSVSQVSGGSAE--GISNSVWGL
200 210 220 230 240 250
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. :. .:.. :: . :.::::::..: . :: .. : . ..::..:.:: :.
CCDS45 SPGNPATGNSNSGFS-QGNGDTVNSAL-SAKQNGS-SSAVQ-KEGSGGNAWDSGPPAGPG
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CCDS45 ILAWGRGSGNNGVGNIHSGAWGHPSRST-SNGVNGEWGK-PPNQHSNSDINGKGST---G
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CCDS45 WESPSVTSQNPTVQPGGEHMNSWAKAASSGTTASEGSSDGSGNHNEGSTGREGTGEGRRR
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pF1KA1 DRRKIDQ-HTLLQSIVNRTDLDPRVLSNSGWGQTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEA
:. ::: : : :.:::::::::.::::::.::::::. : :::.:::.::::::
CCDS45 DKGIIDQGHIQLP----RNDLDPRVLSNTGWGQTPVKQNTAWEFEESPRSERKNDNGTEA
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:: .:::. :::. : . :...::::::: . :: :::: :. . : :
CCDS45 WGCAATQASNSGGKNDGSIMNSTNTSSVSGWVNAPPAAVPANTGWGDSNNKAPSGPGVWG
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CCDS45 DSISSTAVSTAAAAKSGHAWSGAANQEDKSPTWGEPPKPKSQHWGDGQRSNPAWSAGGGD
540 550 560 570 580 590
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pF1KA1 NWGETSRN-NHWGEANKKSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGNNINPNNSSG--WDE
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CCDS45 -WADSSSVLGHLGDGKKNGSGWDADSNRSGSGWNDTTRSGNSGWGNSTNTKANPGTNWGE
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pF1KA1 SSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNKQQDIVGSWGIPPATGKPPGTGWLG
. :: :.:.:.. :..:. .:: . :. : ::::.:
CCDS45 TLKPGPQQNWASKPQDNNVSNWGGA-----------------------ASVKQTGTGWIG
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pF1KA1 ------NGNSRSDQQAQVHQLLTP----ASAISNKEASSG---SGWGE-P---------W
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CCDS45 STTTNTTTTTTTTTSNTTHRVETPPPHQAGTQLNRSPLLGPVSSGWGEMPNVHSKTENSW
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CCDS45 GEPSSPSTLVDNGTAAWGKPPSSGSGWGDHPAEPPVAFGRAGAPVAASALCKPASKSMQE
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CCDS45 GWGSGGDEMNLSTSQ---WEDEEG---DVWNNAASQESTSSCSSWGNAPKKGLQKG----
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CCDS45 --------MKTSGKQDEAWIMSRLIKQLTDMGFPREPAEEALKSNNMNLDQAMSALLEKK
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CCDS45 -QLA----YQRLQIQQQMLQAQRNVSGSMRQQEQQVARTITNLQQQIQQHQRQLAQALLV
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CCDS45 PNMNVNSMDMTGGLSVKDPSQSQSRLPQWTHPNSMDNLPSAASPLEQNPSKHGAIPGGLS
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CCDS45 IGPPGKSSIDDSYGRYDLIQNSESPASPPVAVPHSWSRAKSDSDKISNGSS-INWPPEFH
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CCDS45 PGVPWKGLQNIDPENDPDVTPGSVPTGPTINTTIQDVNRYLLKSGGSSPPSSQNATLPSS
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CCDS45 SAWP-LSASGYSSSFSSIASAPSVAGKLSDIKSTWSSGPTSHTQASLSHELWKVP---RN
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CCDS45 STAPTRPPPGLTNPKPS-STWGASPL----GWTSS---YSSGSAWSTDTSGRTSSWLVLR
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CCDS45 NLTPQIDGSTLRTLCLQHGPLITFHLNLTQGNAVVRYSSKEEAAKAQKSLHMCVLGNTTI
1560 1570 1580 1590 1600 1610
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