Result of FASTA (omim) for
pF1KA1469
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1469, 649 aa
1>>>pF1KA1469 649 - 649 aa - 649 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0756+/-0.000551; mu= 15.7535+/- 0.034
mean_var=122.7028+/-25.121, 0's: 0 Z-trim(110.7): 415 B-trim: 904 in 1/53
Lambda= 0.115784
statistics sampled from 18580 (19089) to 18580 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.224), width: 16
Scan time: 8.230
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_037413 (OMIM: 604808,615271) leucine-rich repea ( 649) 4311 732.6 1.1e-210
XP_011527506 (OMIM: 604808,615271) PREDICTED: leuc ( 649) 4311 732.6 1.1e-210
XP_011527507 (OMIM: 604808,615271) PREDICTED: leuc ( 649) 4311 732.6 1.1e-210
NP_938205 (OMIM: 604808,615271) leucine-rich repea ( 649) 4311 732.6 1.1e-210
XP_005260739 (OMIM: 604808,615271) PREDICTED: leuc ( 649) 4311 732.6 1.1e-210
XP_011543185 (OMIM: 604806) PREDICTED: leucine-ric ( 674) 2479 426.6 1.4e-118
NP_037412 (OMIM: 604806) leucine-rich repeat trans ( 674) 2479 426.6 1.4e-118
XP_005273918 (OMIM: 604806) PREDICTED: leucine-ric ( 674) 2479 426.6 1.4e-118
XP_005267547 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
XP_016876619 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
NP_001333074 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
NP_001333075 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
NP_001333073 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
XP_016876620 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
XP_016876624 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
XP_016876622 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
XP_016876621 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
NP_037363 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat trans ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
XP_016876618 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
XP_011534913 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
NP_001333072 (OMIM: 604807) leucine-rich repeat tr ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
XP_016876623 (OMIM: 604807) PREDICTED: leucine-ric ( 660) 1684 293.8 1.3e-78
NP_001128217 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat tr ( 590) 457 88.8 6.2e-17
NP_001269853 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat tr ( 590) 457 88.8 6.2e-17
NP_001317299 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat tr ( 591) 457 88.8 6.2e-17
NP_079269 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat trans ( 518) 456 88.5 6.3e-17
NP_001269857 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat tr ( 519) 456 88.5 6.3e-17
XP_011538979 (OMIM: 608661) PREDICTED: podocan iso ( 402) 436 85.1 5.4e-16
XP_005270514 (OMIM: 608661) PREDICTED: podocan iso ( 613) 436 85.3 7.2e-16
NP_001186009 (OMIM: 608661) podocan isoform 2 [Hom ( 642) 436 85.3 7.5e-16
NP_001186010 (OMIM: 608661) podocan isoform 2 [Hom ( 642) 436 85.3 7.5e-16
XP_016855783 (OMIM: 608661) PREDICTED: podocan iso ( 652) 436 85.3 7.6e-16
NP_714914 (OMIM: 608661) podocan isoform 1 [Homo s ( 661) 436 85.3 7.6e-16
NP_071426 (OMIM: 610486) leucine-rich repeat-conta ( 653) 421 82.8 4.3e-15
XP_011514763 (OMIM: 610486) PREDICTED: leucine-ric ( 653) 421 82.8 4.3e-15
XP_016867994 (OMIM: 610486) PREDICTED: leucine-ric ( 653) 421 82.8 4.3e-15
NP_002014 (OMIM: 600245) fibromodulin precursor [H ( 376) 400 79.1 3.3e-14
XP_005269337 (OMIM: 603104) PREDICTED: carboxypept ( 545) 401 79.4 3.8e-14
NP_001073982 (OMIM: 603104) carboxypeptidase N sub ( 545) 401 79.4 3.8e-14
NP_001278917 (OMIM: 603104) carboxypeptidase N sub ( 545) 401 79.4 3.8e-14
XP_016873562 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 392 77.9 1.2e-13
XP_011518545 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 392 77.9 1.2e-13
XP_016873559 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 392 77.9 1.2e-13
XP_011518544 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 392 77.9 1.2e-13
XP_016873560 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 392 77.9 1.2e-13
XP_011518543 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 392 77.9 1.2e-13
XP_011518540 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 392 77.9 1.2e-13
XP_016873563 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 392 77.9 1.2e-13
XP_016873561 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 392 77.9 1.2e-13
XP_016873568 (OMIM: 608817) PREDICTED: leucine-ric ( 640) 392 77.9 1.2e-13
>>NP_037413 (OMIM: 604808,615271) leucine-rich repeat tr (649 aa)
initn: 4311 init1: 4311 opt: 4311 Z-score: 3903.7 bits: 732.6 E(85289): 1.1e-210
Smith-Waterman score: 4311; 100.0% identity (100.0% similar) in 649 aa overlap (1-649:1-649)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 YDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 YDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEEL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 RLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 RLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 PVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQL
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310 320 330 340 350 360
pF1KA1 ILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 ILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 VSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 VSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTS
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430 440 450 460 470 480
pF1KA1 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
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490 500 510 520 530 540
pF1KA1 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
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610 620 630 640
pF1KA1 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
610 620 630 640
>>XP_011527506 (OMIM: 604808,615271) PREDICTED: leucine- (649 aa)
initn: 4311 init1: 4311 opt: 4311 Z-score: 3903.7 bits: 732.6 E(85289): 1.1e-210
Smith-Waterman score: 4311; 100.0% identity (100.0% similar) in 649 aa overlap (1-649:1-649)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
70 80 90 100 110 120
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pF1KA1 YDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEEL
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pF1KA1 RLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA
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250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQL
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310 320 330 340 350 360
pF1KA1 ILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGI
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pF1KA1 VSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTS
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430 440 450 460 470 480
pF1KA1 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
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pF1KA1 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
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pF1KA1 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
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610 620 630 640
pF1KA1 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
610 620 630 640
>>XP_011527507 (OMIM: 604808,615271) PREDICTED: leucine- (649 aa)
initn: 4311 init1: 4311 opt: 4311 Z-score: 3903.7 bits: 732.6 E(85289): 1.1e-210
Smith-Waterman score: 4311; 100.0% identity (100.0% similar) in 649 aa overlap (1-649:1-649)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 YDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEEL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 RLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA
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250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQL
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pF1KA1 ILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGI
310 320 330 340 350 360
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pF1KA1 VSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTS
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pF1KA1 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
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pF1KA1 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
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pF1KA1 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KA1 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
610 620 630 640
>>NP_938205 (OMIM: 604808,615271) leucine-rich repeat tr (649 aa)
initn: 4311 init1: 4311 opt: 4311 Z-score: 3903.7 bits: 732.6 E(85289): 1.1e-210
Smith-Waterman score: 4311; 100.0% identity (100.0% similar) in 649 aa overlap (1-649:1-649)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 YDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 YDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEEL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 RLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 PVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 ILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSGI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 VSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTS
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430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
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pF1KA1 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_938 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
610 620 630 640
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initn: 4311 init1: 4311 opt: 4311 Z-score: 3903.7 bits: 732.6 E(85289): 1.1e-210
Smith-Waterman score: 4311; 100.0% identity (100.0% similar) in 649 aa overlap (1-649:1-649)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDA
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pF1KA1 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSLDEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTIT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA1 RLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VSTIQITTAIPNTVYPAQGQWPAPVTKQPDIKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTS
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pF1KA1 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFGSITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMV
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pF1KA1 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALV
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pF1KA1 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPIS
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pF1KA1 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYRDSGIPDSDHSHS
610 620 630 640
>>XP_011543185 (OMIM: 604806) PREDICTED: leucine-rich re (674 aa)
initn: 2568 init1: 1535 opt: 2479 Z-score: 2249.7 bits: 426.6 E(85289): 1.4e-118
Smith-Waterman score: 2479; 58.7% identity (82.2% similar) in 651 aa overlap (6-649:34-674)
10 20 30
pF1KA1 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVC
: .:: :... .: . . .:::::
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40 50 60 70 80 90
pF1KA1 RCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSL
::: :::::::: :::::. ::.::::::::::::::::::.:::. ..:. ::::.:.:
XP_011 RCDNGFIYCNDRGLTSIPADIPDDATTLYLQNNQINNAGIPQDLKTKVNVQVIYLYENDL
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100 110 120 130 140 150
pF1KA1 DEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNY
:::: :::. ..:::::.::.:::. :::..:: ::.:::::::::.::::: :: ::.
XP_011 DEFPINLPRSLRELHLQDNNVRTIARDSLARIPLLEKLHLDDNSVSTVSIEEDAFADSKQ
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160 170 180 190 200 210
pF1KA1 LRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHG
:.::::::::::.:: :::.:.::::::::::::: ...::.::.::::::::: :.
XP_011 LKLLFLSRNHLSSIPSGLPHTLEELRLDDNRISTIPLHAFKGLNSLRRLVLDGNLLANQR
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220 230 240 250 260 270
pF1KA1 LGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYR
..: .: : ::::::::::::.: :.:::...:.::::::: :...: :... .:.: :
XP_011 IADDTFSRLQNLTELSLVRNSLAAPPLNLPSAHLQKLYLQDNAISHIPYNTLAKMRELER
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 LDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQ
::.:::::..::.:.:::: :..::.::::::.:::.. :.:::... . :::::::::
XP_011 LDLSNNNLTTLPRGLFDDLGNLAQLLLRNNPWFCGCNLMWLRDWVKARAAVVNVRGLMCQ
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340 350 360 370 380 390
pF1KA1 APEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSG----IVSTIQITTAIPN-TVYPAQGQWPAPVTKQPD
.:::::::::::...:. .: ..: .... ::: . .. ::. . .:.:
XP_011 GPEKVRGMAIKDITSEMDECFETGPQGGVANAAAKTTASNHASATTPQGSLFTLKAKRPG
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 IKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFG
.. : . :. . . . ::..: ::..:.:.:.:.:: .:: ...:::::.:::::: :
XP_011 LRLPDSNIDYPMATGDGAKTLAIHVKALTADSIRITWKATLPASSFRLSWLRLGHSPAVG
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460 470 480 490 500 510
pF1KA1 SITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMVPMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPT
:::::.: :...:::.::::: : : .::: ::::: :. :::::: ..::: :.::
XP_011 SITETLVQGDKTEYLLTALEPKSTYIICMVTMETSNAYVADETPVCAKAETAD--SYGPT
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560
pF1KA1 TTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALVTIAL-LALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGR
::::.::. :. .::::.::::::::: . : :. .:::::. : :..:. ::..:
XP_011 TTLNQEQNAGPMA--SLPLAGIIGGAVALVFLFLVLGAICWYVHQAGELLTRERAYNRGS
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 RRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPISNEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSE
:.:::: :.:::::::::::: ..::::: : .:::.:.::::: :: .: : .:.
XP_011 RKKDDYMESGTKKDNSILEIRGPGLQMLPI-NPYRAKEEYVVHTIFPSNGSSLCKATHTI
600 610 620 630 640 650
630 640
pF1KA1 S-SSNRSYRDSGIPDSDHSHS
. ...:.:::.:::: :.:..
XP_011 GYGTTRGYRDGGIPDIDYSYT
660 670
>>NP_037412 (OMIM: 604806) leucine-rich repeat transmemb (674 aa)
initn: 2568 init1: 1535 opt: 2479 Z-score: 2249.7 bits: 426.6 E(85289): 1.4e-118
Smith-Waterman score: 2479; 58.7% identity (82.2% similar) in 651 aa overlap (6-649:34-674)
10 20 30
pF1KA1 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVC
: .:: :... .: . . .:::::
NP_037 AHPTATATTTPTATVTATVVMTTATMDLRDW-LFLCYGLIAFLTEV----IDSTTCPSVC
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40 50 60 70 80 90
pF1KA1 RCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSL
::: :::::::: :::::. ::.::::::::::::::::::.:::. ..:. ::::.:.:
NP_037 RCDNGFIYCNDRGLTSIPADIPDDATTLYLQNNQINNAGIPQDLKTKVNVQVIYLYENDL
60 70 80 90 100 110
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pF1KA1 DEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNY
:::: :::. ..:::::.::.:::. :::..:: ::.:::::::::.::::: :: ::.
NP_037 DEFPINLPRSLRELHLQDNNVRTIARDSLARIPLLEKLHLDDNSVSTVSIEEDAFADSKQ
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 LRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHG
:.::::::::::.:: :::.:.::::::::::::: ...::.::.::::::::: :.
NP_037 LKLLFLSRNHLSSIPSGLPHTLEELRLDDNRISTIPLHAFKGLNSLRRLVLDGNLLANQR
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 LGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYR
..: .: : ::::::::::::.: :.:::...:.::::::: :...: :... .:.: :
NP_037 IADDTFSRLQNLTELSLVRNSLAAPPLNLPSAHLQKLYLQDNAISHIPYNTLAKMRELER
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 LDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQ
::.:::::..::.:.:::: :..::.::::::.:::.. :.:::... . :::::::::
NP_037 LDLSNNNLTTLPRGLFDDLGNLAQLLLRNNPWFCGCNLMWLRDWVKARAAVVNVRGLMCQ
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 APEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSG----IVSTIQITTAIPN-TVYPAQGQWPAPVTKQPD
.:::::::::::...:. .: ..: .... ::: . .. ::. . .:.:
NP_037 GPEKVRGMAIKDITSEMDECFETGPQGGVANAAAKTTASNHASATTPQGSLFTLKAKRPG
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 IKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFG
.. : . :. . . . ::..: ::..:.:.:.:.:: .:: ...:::::.:::::: :
NP_037 LRLPDSNIDYPMATGDGAKTLAIHVKALTADSIRITWKATLPASSFRLSWLRLGHSPAVG
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 SITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMVPMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPT
:::::.: :...:::.::::: : : .::: ::::: :. :::::: ..::: :.::
NP_037 SITETLVQGDKTEYLLTALEPKSTYIICMVTMETSNAYVADETPVCAKAETAD--SYGPT
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560
pF1KA1 TTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALVTIAL-LALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGR
::::.::. :. .::::.::::::::: . : :. .:::::. : :..:. ::..:
NP_037 TTLNQEQNAGPMA--SLPLAGIIGGAVALVFLFLVLGAICWYVHQAGELLTRERAYNRGS
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 RRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPISNEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSE
:.:::: :.:::::::::::: ..::::: : .:::.:.::::: :: .: : .:.
NP_037 RKKDDYMESGTKKDNSILEIRGPGLQMLPI-NPYRAKEEYVVHTIFPSNGSSLCKATHTI
600 610 620 630 640 650
630 640
pF1KA1 S-SSNRSYRDSGIPDSDHSHS
. ...:.:::.:::: :.:..
NP_037 GYGTTRGYRDGGIPDIDYSYT
660 670
>>XP_005273918 (OMIM: 604806) PREDICTED: leucine-rich re (674 aa)
initn: 2568 init1: 1535 opt: 2479 Z-score: 2249.7 bits: 426.6 E(85289): 1.4e-118
Smith-Waterman score: 2479; 58.7% identity (82.2% similar) in 651 aa overlap (6-649:34-674)
10 20 30
pF1KA1 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVC
: .:: :... .: . . .:::::
XP_005 AHPTATATTTPTATVTATVVMTTATMDLRDW-LFLCYGLIAFLTEV----IDSTTCPSVC
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 RCDAGFIYCNDRFLTSIPTGIPEDATTLYLQNNQINNAGIPSDLKNLLKVERIYLYHNSL
::: :::::::: :::::. ::.::::::::::::::::::.:::. ..:. ::::.:.:
XP_005 RCDNGFIYCNDRGLTSIPADIPDDATTLYLQNNQINNAGIPQDLKTKVNVQVIYLYENDL
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 DEFPTNLPKYVKELHLQENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNY
:::: :::. ..:::::.::.:::. :::..:: ::.:::::::::.::::: :: ::.
XP_005 DEFPINLPRSLRELHLQDNNVRTIARDSLARIPLLEKLHLDDNSVSTVSIEEDAFADSKQ
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 LRLLFLSRNHLSTIPWGLPRTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHG
:.::::::::::.:: :::.:.::::::::::::: ...::.::.::::::::: :.
XP_005 LKLLFLSRNHLSSIPSGLPHTLEELRLDDNRISTIPLHAFKGLNSLRRLVLDGNLLANQR
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 LGDKVFFNLVNLTELSLVRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYR
..: .: : ::::::::::::.: :.:::...:.::::::: :...: :... .:.: :
XP_005 IADDTFSRLQNLTELSLVRNSLAAPPLNLPSAHLQKLYLQDNAISHIPYNTLAKMRELER
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 LDMSNNNLSNLPQGIFDDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQ
::.:::::..::.:.:::: :..::.::::::.:::.. :.:::... . :::::::::
XP_005 LDLSNNNLTTLPRGLFDDLGNLAQLLLRNNPWFCGCNLMWLRDWVKARAAVVNVRGLMCQ
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 APEKVRGMAIKDLNAELFDCKDSG----IVSTIQITTAIPN-TVYPAQGQWPAPVTKQPD
.:::::::::::...:. .: ..: .... ::: . .. ::. . .:.:
XP_005 GPEKVRGMAIKDITSEMDECFETGPQGGVANAAAKTTASNHASATTPQGSLFTLKAKRPG
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 IKNPKLTKDHQTTGSPSRKTITITVKSVTSDTIHISWKLALPMTALRLSWLKLGHSPAFG
.. : . :. . . . ::..: ::..:.:.:.:.:: .:: ...:::::.:::::: :
XP_005 LRLPDSNIDYPMATGDGAKTLAIHVKALTADSIRITWKATLPASSFRLSWLRLGHSPAVG
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 SITETIVTGERSEYLVTALEPDSPYKVCMVPMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPT
:::::.: :...:::.::::: : : .::: ::::: :. :::::: ..::: :.::
XP_005 SITETLVQGDKTEYLLTALEPKSTYIICMVTMETSNAYVADETPVCAKAETAD--SYGPT
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520 530 540 550 560
pF1KA1 TTLNREQEKEPYKNPNLPLAAIIGGAVALVTIAL-LALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGR
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XP_005 TTLNQEQNAGPMA--SLPLAGIIGGAVALVFLFLVLGAICWYVHQAGELLTRERAYNRGS
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570 580 590 600 610 620
pF1KA1 RRKDDYAEAGTKKDNSILEIRETSFQMLPISNEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSE
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XP_005 RKKDDYMESGTKKDNSILEIRGPGLQMLPI-NPYRAKEEYVVHTIFPSNGSSLCKATHTI
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630 640
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XP_005 GYGTTRGYRDGGIPDIDYSYT
660 670
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pF1KA1 QENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPW
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pF1KA1 EPYK--NPNLPLAAIIGGAVALVTIALLALVCWYVHRNGSLFSRNCAYSKGRRRKDDYAE
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640
pF1KA1 DSGIPDSDHSHS
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10 20 30 40 50
pF1KA1 MISAAWSIFLIGTKIGLFLQVAPLSVMAKSCPSVCRCDAGFIYCNDRFLTS
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XP_016 VPLGIPEGVTVLYLHNNQINNAGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDEFPMNLPKNVRVLHL
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pF1KA1 QENNIRTITYDSLSKIPYLEELHLDDNSVSAVSIEEGAFRDSNYLRLLFLSRNHLSTIPW
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XP_016 QENNIQTISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPV
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pF1KA1 GLPRTIEELRLDDNRISTISSPSLQGLTSLKRLVLDGNLLNNHGLGDKVFFNLVNLTELS
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XP_016 GLPVDLQELRVDENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFS
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pF1KA1 LVRNSLTAAPVNLPGTNLRKLYLQDNHINRVPPNAFSYLRQLYRLDMSNNNLSNLPQGIF
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XP_016 IVRNSLSHPPPDLPGTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFSNLRKLERLDISNNQLRMLTQGVF
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pF1KA1 DDLDNITQLILRNNPWYCGCKMKWVRDWLQSLPVKVNVRGLMCQAPEKVRGMAIKDLNAE
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XP_016 DNLSNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFMCQGPEQVRGMAVRELNMN
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XP_016 LLSCPTTTPGLPLFTPAPSTASPTTQPPTLSIPNPSRSYTPPTPTTSKLPTI--PDWDGR
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XP_016 ERVT-PPISERIQLSIHFVNDTSIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGGIVQERIVSG
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 ERSEYLVTALEPDSPYKVCMVPMETSNLYLFDETPVCIETETAPLRMYNPTTTLNREQEK
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XP_016 EKQHLSLVNLEPRSTYRICLVPLDAFNYRAVEDT-ICSEATTHASYLNNGSNTASSHEQT
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540 550 560 570 580 590
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pF1KA1 AGTKKDNSILEIRETSFQMLPISNEPISKEEFVIHTIFPPNGMNLYKNNHSESSSNRSYR
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XP_016 AGTKKDNSILEMTETSFQIVSLNNDQLLKGDFRLQPIYTPNGGINYTDCHIP--NNMRYC
600 610 620 630 640
640
pF1KA1 DSGIPDSDHSHS
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XP_016 NSSVPDLEHCHT
650 660
649 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 21:13:57 2016 done: Wed Nov 2 21:13:58 2016
Total Scan time: 8.230 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]