Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1477
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1477, 758 aa
1>>>pF1KA1477 758 - 758 aa - 758 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3808+/-0.00126; mu= -4.7016+/- 0.073
mean_var=344.2434+/-78.468, 0's: 0 Z-trim(108.4): 530 B-trim: 240 in 1/52
Lambda= 0.069126
statistics sampled from 9532 (10179) to 9532 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.667), E-opt: 0.2 (0.313), width: 16
Scan time: 3.800
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS65789.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 758) 4991 513.0 7e-145
CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 780) 4242 438.3 2.2e-122
CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 795) 3485 362.8 1.2e-99
CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 796) 3473 361.6 2.7e-99
CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 745) 2243 238.9 2.2e-62
CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 729) 1879 202.6 1.8e-51
CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 744) 1879 202.6 1.8e-51
CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 753) 1878 202.5 2e-51
CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 788) 1730 187.8 5.7e-47
CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 709) 1689 183.7 9e-46
CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 724) 1689 183.7 9.2e-46
CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 719) 1677 182.5 2.1e-45
CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 752) 1573 172.1 2.9e-42
CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 688) 1569 171.7 3.5e-42
CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 713) 1551 169.9 1.3e-41
CCDS45167.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 659) 1068 121.7 3.8e-27
CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1321) 912 106.4 3e-22
CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1261) 886 103.8 1.7e-21
CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 ( 783) 880 103.0 1.9e-21
CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|c ( 783) 880 103.0 1.9e-21
CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11 ( 926) 866 101.7 5.6e-21
CCDS12921.1 BRSK1 gene_id:84446|Hs108|chr19 ( 778) 697 84.8 5.8e-16
CCDS41590.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 668) 670 82.0 3.4e-15
CCDS58106.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 674) 670 82.0 3.4e-15
CCDS58107.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 736) 670 82.1 3.6e-15
CCDS58108.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 766) 670 82.1 3.7e-15
CCDS60696.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 614) 666 81.6 4.2e-15
CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1 ( 672) 654 80.4 1e-14
CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 559) 643 79.2 1.9e-14
CCDS605.1 PRKAA2 gene_id:5563|Hs108|chr1 ( 552) 636 78.5 3.1e-14
CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 ( 661) 636 78.6 3.5e-14
CCDS59126.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 619) 609 75.9 2.2e-13
CCDS6606.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 651) 609 75.9 2.2e-13
CCDS59127.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 580) 607 75.7 2.4e-13
CCDS3943.1 NIM1K gene_id:167359|Hs108|chr5 ( 436) 601 75.0 2.9e-13
CCDS59123.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 610) 590 74.0 8e-13
CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3 ( 765) 587 73.8 1.2e-12
CCDS3933.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 574) 582 73.2 1.3e-12
>>CCDS65789.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 (758 aa)
initn: 4991 init1: 4991 opt: 4991 Z-score: 2714.5 bits: 513.0 E(32554): 7e-145
Smith-Waterman score: 4991; 99.9% identity (99.9% similar) in 758 aa overlap (1-758:1-758)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSARTPLPTVNERDTENHTSVDGYTEPHIQPTKSSSRQNIPRCRNSITSATDEQPHIGNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 MSARTPLPTVNERDTENHTSVDGYTEPHIQPTKSSSRQNIPRCRNSITSATDEQPHIGNY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 RLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 RLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 EVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIVHRDLKAENLLLDGDMNIKIADFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIVHRDLKAENLLLDGDMNIKIADFG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 FSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 FSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 KELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKRGSLEQIMKDRWMNVGHEEEELKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 KELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKRGSLEQIMKDRWMNVGHEEEELKP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 YTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYDEVMATYILLGRKPPEFEGGESLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 YTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYDEVMATYILLGRKPPEFEGGESLS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 SGNLCQRSRPSSDLNNSTLQSPAHLKVQRSISANQKQRRFSDHAGPSIPPAVSYTKRPQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SGNLCQRSRPSSDLNNSTLQSPAHLKVQRSISANQKQRRFSDHAGPSIPPAVSYTKRPQA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEMTASPLVGPERKKSSTIPSNNVYSGGSMARR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 NSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEMTASPLVGPERKKSSTIPSNNVYSGGSMARR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 NTYVCERTTDRYVALQNGKDSSLTEMSVSSISSAGSSVASAVPSARPRHQKSMSTSGHPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 NTYVCERTTDRYVALQNGKDSSLTEMSVSSISSAGSSVASAVPSARPRHQKSMSTSGHPI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 KVTLPTIKDGSEAYRPGTTQRVPAASPSAHSISTATPDRTRFPRGSSSRSTFHGEQLRER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 KVTLPTIKDGSEAYRPGTTQRVPAASPSAHSISTATPDRTRFPRGSSSRSTFHGEQLRER
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 RSVAYNGPPASPSHETGAFAHARRGTSTGIISKITSKFVRRSTSGEPKERDKEEGKDSKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 RSVAYNGPPASPSHETGAFAHARRGTSTGIISKITSKFVRRSTSGEPKERDKEEGKDSKP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 RSLRFTWSMKTTSSMDPNDMMREIRKVLDANNCDYEQKERFLLFCVHGDARQDSLVQWEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 RSLRFTWSMKTTSSMDPNDMMREIRKVLDANNCDYEQKERFLLFCVHGDARQDSLVQWEM
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KA1 EVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSIAFKNIASKIANELML
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS65 EVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSIAFKNIASKIANELKL
730 740 750
>>CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 (780 aa)
initn: 4992 init1: 4221 opt: 4242 Z-score: 2310.7 bits: 438.3 E(32554): 2.2e-122
Smith-Waterman score: 4937; 97.1% identity (97.1% similar) in 780 aa overlap (1-758:1-780)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSARTPLPTVNERDTENHTSVDGYTEPHIQPTKSSSRQNIPRCRNSITSATDEQPHIGNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MSARTPLPTVNERDTENHTSVDGYTEPHIQPTKSSSRQNIPRCRNSITSATDEQPHIGNY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KA1 RLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNI-
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150
pF1KA1 ---------------------GEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIVH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIVH
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 RDLKAENLLLDGDMNIKIADFGFSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RDLKAENLLLDGDMNIKIADFGFSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 WSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 WSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKRG
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 SLEQIMKDRWMNVGHEEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SLEQIMKDRWMNVGHEEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYDE
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 VMATYILLGRKPPEFEGGESLSSGNLCQRSRPSSDLNNSTLQSPAHLKVQRSISANQKQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VMATYILLGRKPPEFEGGESLSSGNLCQRSRPSSDLNNSTLQSPAHLKVQRSISANQKQR
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 RFSDHAGPSIPPAVSYTKRPQANSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEMTASPLVGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RFSDHAGPSIPPAVSYTKRPQANSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEMTASPLVGP
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 ERKKSSTIPSNNVYSGGSMARRNTYVCERTTDRYVALQNGKDSSLTEMSVSSISSAGSSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ERKKSSTIPSNNVYSGGSMARRNTYVCERTTDRYVALQNGKDSSLTEMSVSSISSAGSSV
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 ASAVPSARPRHQKSMSTSGHPIKVTLPTIKDGSEAYRPGTTQRVPAASPSAHSISTATPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ASAVPSARPRHQKSMSTSGHPIKVTLPTIKDGSEAYRPGTTQRVPAASPSAHSISTATPD
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 RTRFPRGSSSRSTFHGEQLRERRSVAYNGPPASPSHETGAFAHARRGTSTGIISKITSKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RTRFPRGSSSRSTFHGEQLRERRSVAYNGPPASPSHETGAFAHARRGTSTGIISKITSKF
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 VRRSTSGEPKERDKEEGKDSKPRSLRFTWSMKTTSSMDPNDMMREIRKVLDANNCDYEQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VRRSTSGEPKERDKEEGKDSKPRSLRFTWSMKTTSSMDPNDMMREIRKVLDANNCDYEQK
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 ERFLLFCVHGDARQDSLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSIAFKNIASKIANELML
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS73 ERFLLFCVHGDARQDSLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSIAFKNIASKIANELKL
730 740 750 760 770 780
>>CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 (795 aa)
initn: 4218 init1: 3452 opt: 3485 Z-score: 1902.6 bits: 362.8 E(32554): 1.2e-99
Smith-Waterman score: 4897; 95.2% identity (95.2% similar) in 795 aa overlap (1-758:1-795)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSARTPLPTVNERDTENHTSVDGYTEPHIQPTKSSSRQNIPRCRNSITSATDEQPHIGNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSARTPLPTVNERDTENHTSVDGYTEPHIQPTKSSSRQNIPRCRNSITSATDEQPHIGNY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KA1 RLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNI-
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150
pF1KA1 ---------------------GEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIVH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIVH
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 RDLKAENLLLDGDMNIKIADFGFSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RDLKAENLLLDGDMNIKIADFGFSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 WSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 WSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKRG
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 SLEQIMKDRWMNVGHEEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SLEQIMKDRWMNVGHEEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYDE
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 VMATYILLGRKPPEFEGGESLSSGNLCQRSRPSSDLNNSTLQSPAHLKVQRSISANQKQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VMATYILLGRKPPEFEGGESLSSGNLCQRSRPSSDLNNSTLQSPAHLKVQRSISANQKQR
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 RFSDHAGPSIPPAVSYTKRPQANSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEMTASPLVGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RFSDHAGPSIPPAVSYTKRPQANSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEMTASPLVGP
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 ERKKSSTIPSNNVYSGGSMARRNTYVCERTTDRYVALQNGKDSSLTEMSVSSISSAGSSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ERKKSSTIPSNNVYSGGSMARRNTYVCERTTDRYVALQNGKDSSLTEMSVSSISSAGSSV
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 ASAVPSARPRHQKSMSTSGHPIKVTLPTIKDGSEAYRPGTTQRVPAASPSAHSISTATPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ASAVPSARPRHQKSMSTSGHPIKVTLPTIKDGSEAYRPGTTQRVPAASPSAHSISTATPD
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 RTRFPRGSSSRSTFHGEQLRERRSVAYNGPPASPSHETGAFAHARRGTSTGIISKITSKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RTRFPRGSSSRSTFHGEQLRERRSVAYNGPPASPSHETGAFAHARRGTSTGIISKITSKF
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680
pF1KA1 VRR---------------STSGEPKERDKEEGKDSKPRSLRFTWSMKTTSSMDPNDMMRE
::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VRRDPSEGEASGRTDTSRSTSGEPKERDKEEGKDSKPRSLRFTWSMKTTSSMDPNDMMRE
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 IRKVLDANNCDYEQKERFLLFCVHGDARQDSLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IRKVLDANNCDYEQKERFLLFCVHGDARQDSLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSI
730 740 750 760 770 780
750
pF1KA1 AFKNIASKIANELML
::::::::::::: :
CCDS31 AFKNIASKIANELKL
790
>>CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 (796 aa)
initn: 3675 init1: 2909 opt: 3473 Z-score: 1896.1 bits: 361.6 E(32554): 2.7e-99
Smith-Waterman score: 4885; 95.1% identity (95.1% similar) in 796 aa overlap (1-758:1-796)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSARTPLPTVNERDTENHTSVDGYTEPHIQPTKSSSRQNIPRCRNSITSATDEQPHIGNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MSARTPLPTVNERDTENHTSVDGYTEPHIQPTKSSSRQNIPRCRNSITSATDEQPHIGNY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KA1 RLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNI-
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150
pF1KA1 ---------------------GEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIVH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIVH
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 RDLKAENLLLDGDMNIKIADFGFSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RDLKAENLLLDGDMNIKIADFGFSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 WSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 WSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKRG
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 SLEQIMKDRWMNVGHEEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SLEQIMKDRWMNVGHEEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYDE
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 VMATYILLGRKPPEFEGGESLSSGNLCQRSRPSSDLNNSTLQSPAHLKVQRSISANQKQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VMATYILLGRKPPEFEGGESLSSGNLCQRSRPSSDLNNSTLQSPAHLKVQRSISANQKQR
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 RFSDHAGPSIPPAVSYTKRPQANSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEMTASPLVGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RFSDHAGPSIPPAVSYTKRPQANSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEMTASPLVGP
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 ERKKSSTIPSNNVYSGGSMARRNTYVCERTTDRYVALQNGKDSSLTEMSVSSISSAGSSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ERKKSSTIPSNNVYSGGSMARRNTYVCERTTDRYVALQNGKDSSLTEMSVSSISSAGSSV
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 ASAVPSARPRHQKSMSTSGHPIKVTLPTIKDGSEAYRPG-TTQRVPAASPSAHSISTATP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS73 ASAVPSARPRHQKSMSTSGHPIKVTLPTIKDGSEAYRPGSTTQRVPAASPSAHSISTATP
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 DRTRFPRGSSSRSTFHGEQLRERRSVAYNGPPASPSHETGAFAHARRGTSTGIISKITSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DRTRFPRGSSSRSTFHGEQLRERRSVAYNGPPASPSHETGAFAHARRGTSTGIISKITSK
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680
pF1KA1 FVRR---------------STSGEPKERDKEEGKDSKPRSLRFTWSMKTTSSMDPNDMMR
:::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FVRRDPSEGEASGRTDTSRSTSGEPKERDKEEGKDSKPRSLRFTWSMKTTSSMDPNDMMR
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 EIRKVLDANNCDYEQKERFLLFCVHGDARQDSLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EIRKVLDANNCDYEQKERFLLFCVHGDARQDSLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTS
730 740 750 760 770 780
750
pF1KA1 IAFKNIASKIANELML
:::::::::::::: :
CCDS73 IAFKNIASKIANELKL
790
>>CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 (745 aa)
initn: 2545 init1: 1421 opt: 2243 Z-score: 1233.5 bits: 238.9 E(32554): 2.2e-62
Smith-Waterman score: 3082; 66.0% identity (81.2% similar) in 767 aa overlap (42-758:3-745)
20 30 40 50 60 70
pF1KA1 ERDTENHTSVDGYTEPHIQPTKSSSRQNIPRCRNSITSATDEQPHIGNYRLQKTIGKGNF
: ::: ::: ::::::::::: ::::::::
CCDS41 MIRGRNSATSA-DEQPHIGNYRLLKTIGKGNF
10 20 30
80 90 100 110
pF1KA1 AKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNI------------
::::::::.:::.::::::::::::: .:::::::::::::.::::::
CCDS41 AKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNIVKLFEVIETEKT
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160
pF1KA1 ----------GEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIVHRDLKAENLLLD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS41 LYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRDLKAENLLLD
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 GDMNIKIADFGFSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLV
.:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLV
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 SGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKRGSLEQIMKDRWM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::: :::.::::::::::
CCDS41 SGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGTLEQIMKDRWM
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 NVGHEEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYDEVMATYILLGRK
:::::..:::::.:: ::..: .: ..::.::..:.::.:.:..:.:.::::::.::: :
CCDS41 NVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYNEVMATYLLLGYK
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 PPEFEGGESLSSGNLCQRSRPSSDLNNSTLQSPAHLKVQRSISANQKQRRFSDHAGPSIP
:.:: .. . :::.::.::. ::.: :::::.::: :::::::.:::.::
CCDS41 SSELEGD------TITLKPRPSADLTNSSAPSPSH-KVQRSVSANPKQRRFSDQAGPAIP
340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 PAVSYTKRPQANSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEMTASPLVGPERKKSSTIPS-
. ::.:. :.:..:... :: :.. .:: .:: ... :::: : ::::.. ::
CCDS41 TSNSYSKKTQSNNAENKRPEE-DRESGRKASST-----AKVPASPLPGLERKKTTPTPST
390 400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 NNVYSGGSMARRNTYVCERTTDRYVALQNGKDSSLTEMSVSSISSAGSSVASAVPSARPR
:.: : .. ::. . ::.. ...:::::: :: : : :.:..: .:: .::::
CCDS41 NSVLSTSTNRSRNSPLLERASLGQASIQNGKDS-LT-MPGSRASTASAS--AAVSAARPR
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 -HQKSMSTSGHPIKVT-LPTIKDGSEAYRPGTT-QRVPAASPSAHSISTA--TPDRTRFP
::::::.: :: :.. :: ... :. ::.:. ::::.::::::.::.. .:::: ::
CCDS41 QHQKSMSASVHPNKASGLPPTESNCEVPRPSTAPQRVPVASPSAHNISSSGGAPDRTNFP
500 510 520 530 540 550
590 600 610 620 630
pF1KA1 RGSSSRSTFHGEQLRERR---SVAYNGPPASPS-HETGAFAHARRGTSTGIISKITSKFV
:: :::::::. :::. : .. :. ::::: : : :::.: .:.::.:::::
CCDS41 RGVSSRSTFHAGQLRQVRDQQNLPYGVTPASPSGHSQG-----RRGASGSIFSKFTSKFV
560 570 580 590 600
640 650 660 670 680
pF1KA1 RRSTSGEPKERD------------------KEEGKDSKPRSLRFTWSMKTTSSMDPNDMM
::. . ::. .: ::: ...:::::::::::::::::.::.::
CCDS41 RRNLN-EPESKDRVETLRPHVVGSGGNDKEKEEFREAKPRSLRFTWSMKTTSSMEPNEMM
610 620 630 640 650 660
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 REIRKVLDANNCDYEQKERFLLFCVHGDARQDSLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGT
::::::::::.:. : .:...:.:.:: ....::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 REIRKVLDANSCQSELHEKYMLLCMHGTPGHEDFVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGT
670 680 690 700 710 720
750
pF1KA1 SIAFKNIASKIANELML
:.::::::::::::: :
CCDS41 SMAFKNIASKIANELKL
730 740
>>CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 (729 aa)
initn: 2543 init1: 1601 opt: 1879 Z-score: 1037.4 bits: 202.6 E(32554): 1.8e-51
Smith-Waterman score: 3228; 67.4% identity (80.7% similar) in 798 aa overlap (1-758:1-729)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MSARTPLPTVNERDTENHTSV-DGYTEPHIQPTKSSSRQNIPRCRNSITSATDEQPHIGN
::.::::::::::::::::: :: : :. .::.. ::::::.: .::::::::
CCDS41 MSTRTPLPTVNERDTENHTSHGDGRQEV----TSRTSRSGA-RCRNSIASCADEQPHIGN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 YRLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNI
::: ::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150
pF1KA1 ----------------------GEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIV
:::::::::::::::::::.::::::::::::::: ::
CCDS41 VKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 HRDLKAENLLLDGDMNIKIADFGFSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVD
::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVD
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 VWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::::
CCDS41 VWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKR
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 GSLEQIMKDRWMNVGHEEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYD
:.:::::::::.:.::::.::::..::. :..: ::::::: ::....::...: ..:::
CCDS41 GTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYD
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 EVMATYILLGRKPPEFEGGESLSSGNLC-QRSRPSSDLNNSTLQSPAHLKVQRSISANQK
:. :::.::::: :.....: ::.:: . :::::::::: ::: : :::::.:..::
CCDS41 EITATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLNNSTGQSPHH-KVQRSVSSSQK
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 QRRFSDHAGPSIPPAVSYTKRPQANSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEMTASPLV
:::.::::::.:: .:.: :: :.....:. :: : .:: ....::.:. :::..
CCDS41 QRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKE--DGISSRKSSGSAVGGKGIAPASPML
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KA1 G----------PERKKSSTIPSNNVYSGGSMARRNTYVC-ERTT-DRYVALQNGKDSSLT
: ::::::::.::.:. ::: :.::::::: :::: ::. ..::::..:
CCDS41 GNASNPNKADIPERKKSSTVPSSNTASGG-MTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENS--
480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 EMSVSSISSAGSSVASAVPSARPRHQKSMSTSGHPIKVTLPTIKDGSEAYRPGTTQRVPA
:: : ::.:.
CCDS41 -----------------------------------------TIPD----------QRTPV
530
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 ASPSAHSISTA-TPDRTRFPRGSSSRSTFHGEQLRERRSVAYNGPPASPS--HETGAFAH
:: .::::.: :::: :::::..::::::: : ::::...::::::::: ::. ...
CCDS41 AS--THSISSAATPDRIRFPRGTASRSTFHG-QPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQ
540 550 560 570 580 590
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 ARRGTSTGIISKITSKFVR-RSTSGEPKERDKEEGKDSKPRSLRFTWSMKTTSSMDPNDM
.: ::...::.:::..: :..:.: .:.:.:..:::::::::::::::::::.::
CCDS41 TRSRGSTNLFSKLTSKLTRSRNVSAE----QKDENKEAKPRSLRFTWSMKTTSSMDPGDM
600 610 620 630 640 650
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 MREIRKVLDANNCDYEQKERFLLFCVHGDARQDSLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISG
:::::::::::::::::.:::::::::::.. ..::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAENLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISG
660 670 680 690 700 710
750
pF1KA1 TSIAFKNIASKIANELML
:::::::::::::::: :
CCDS41 TSIAFKNIASKIANELKL
720
>>CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 (744 aa)
initn: 2611 init1: 1601 opt: 1879 Z-score: 1037.3 bits: 202.6 E(32554): 1.8e-51
Smith-Waterman score: 3212; 66.4% identity (79.7% similar) in 809 aa overlap (1-758:1-744)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MSARTPLPTVNERDTENHTSV-DGYTEPHIQPTKSSSRQNIPRCRNSITSATDEQPHIGN
::.::::::::::::::::: :: : :. .::.. ::::::.: .::::::::
CCDS45 MSTRTPLPTVNERDTENHTSHGDGRQEV----TSRTSRSGA-RCRNSIASCADEQPHIGN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 YRLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNI
::: ::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150
pF1KA1 ----------------------GEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIV
:::::::::::::::::::.::::::::::::::: ::
CCDS45 VKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 HRDLKAENLLLDGDMNIKIADFGFSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVD
::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVD
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 VWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::::
CCDS45 VWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKR
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 GSLEQIMKDRWMNVGHEEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYD
:.:::::::::.:.::::.::::..::. :..: ::::::: ::....::...: ..:::
CCDS45 GTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYD
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 EVMATYILLGRKPPEFEGGESLSSGNLC-QRSRPSSDLNNSTLQSPAHLKVQRSISANQK
:. :::.::::: :.....: ::.:: . :::::::::: ::: : :::::.:..::
CCDS45 EITATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLNNSTGQSPHH-KVQRSVSSSQK
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 QRRFSDHAGPSIPPAVSYTKRPQANSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEMTASPLV
:::.::::::.:: .:.: :: :.....:. :: : .:: ....::.:. :::..
CCDS45 QRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKE--DGISSRKSSGSAVGGKGIAPASPML
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KA1 G----------PERKKSSTIPSNNVYSGGSMARRNTYVC-ERTT-DRYVALQNGKDSSLT
: ::::::::.::.:. ::: :.::::::: :::: ::. ..::::..:
CCDS45 GNASNPNKADIPERKKSSTVPSSNTASGG-MTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENS--
480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 EMSVSSISSAGSSVASAVPSARPRHQKSMSTSGHPIKVTLPTIKDGSEAYRPGTTQRVPA
:: : ::.:.
CCDS45 -----------------------------------------TIPD----------QRTPV
530
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 ASPSAHSISTA-TPDRTRFPRGSSSRSTFHGEQLRERRSVAYNGPPASPS--HETGAFAH
:: .::::.: :::: :::::..::::::: : ::::...::::::::: ::. ...
CCDS45 AS--THSISSAATPDRIRFPRGTASRSTFHG-QPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQ
540 550 560 570 580 590
630 640 650 660
pF1KA1 ARRGTSTGIISKITSKFVRR------------STSGEPKERDKEEGKDSKPRSLRFTWSM
.: ::...::.:::..:: ..: . . ..:.:.:..:::::::::::
CCDS45 TRSRGSTNLFSKLTSKLTRRLPTEYERNGRYEGSSRNVSAEQKDENKEAKPRSLRFTWSM
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 KTTSSMDPNDMMREIRKVLDANNCDYEQKERFLLFCVHGDARQDSLVQWEMEVCKLPRLS
::::::::.:::::::::::::::::::.:::::::::::.. ..:::::::::::::::
CCDS45 KTTSSMDPGDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAENLVQWEMEVCKLPRLS
660 670 680 690 700 710
730 740 750
pF1KA1 LNGVRFKRISGTSIAFKNIASKIANELML
::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS45 LNGVRFKRISGTSIAFKNIASKIANELKL
720 730 740
>>CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 (753 aa)
initn: 2610 init1: 1601 opt: 1878 Z-score: 1036.7 bits: 202.5 E(32554): 2e-51
Smith-Waterman score: 3201; 65.9% identity (78.7% similar) in 818 aa overlap (1-758:1-753)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MSARTPLPTVNERDTENHTSV-DGYTEPHIQPTKSSSRQNIPRCRNSITSATDEQPHIGN
::.::::::::::::::::: :: : :. .::.. ::::::.: .::::::::
CCDS45 MSTRTPLPTVNERDTENHTSHGDGRQEV----TSRTSRSGA-RCRNSIASCADEQPHIGN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 YRLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNI
::: ::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150
pF1KA1 ----------------------GEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIV
:::::::::::::::::::.::::::::::::::: ::
CCDS45 VKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 HRDLKAENLLLDGDMNIKIADFGFSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVD
::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVD
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 VWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::::
CCDS45 VWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKR
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 GSLEQIMKDRWMNVGHEEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYD
:.:::::::::.:.::::.::::..::. :..: ::::::: ::....::...: ..:::
CCDS45 GTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYD
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 EVMATYILLGRKPPEFEGGESLSSGNLC-QRSRPSSDLNNSTLQSPAHLKVQRSISANQK
:. :::.::::: :.....: ::.:: . :::::::::: ::: : :::::.:..::
CCDS45 EITATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLNNSTGQSPHH-KVQRSVSSSQK
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 QRRFSDHAGPSIPPAVSYTKRPQANSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEMTASPLV
:::.::::::.:: .:.: :: :.....:. :: : .:: ....::.:. :::..
CCDS45 QRRYSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKE--DGISSRKSSGSAVGGKGIAPASPML
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KA1 G----------PERKKSSTIPSNNVYSGGSMARRNTYVC-ERTT-DRYVALQNGKDSSLT
: ::::::::.::.:. ::: :.::::::: :::: ::. ..::::..:
CCDS45 GNASNPNKADIPERKKSSTVPSSNTASGG-MTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENS--
480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 EMSVSSISSAGSSVASAVPSARPRHQKSMSTSGHPIKVTLPTIKDGSEAYRPGTTQRVPA
:: : ::.:.
CCDS45 -----------------------------------------TIPD----------QRTPV
530
570 580 590 600 610 620
pF1KA1 ASPSAHSISTA-TPDRTRFPRGSSSRSTFHGEQLRERRSVAYNGPPASPS--HETGAFAH
:: .::::.: :::: :::::..::::::: : ::::...::::::::: ::. ...
CCDS45 AS--THSISSAATPDRIRFPRGTASRSTFHG-QPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQ
540 550 560 570 580 590
630 640 650 660
pF1KA1 ARRGTSTGIISKITSKFVRRSTSGE-----PKERD----------------KEEGKDSKP
.: ::...::.:::..::. : . : : . :.:.:..::
CCDS45 TRSRGSTNLFSKLTSKLTRRNMSFRFIKRLPTEYERNGRYEGSSRNVSAEQKDENKEAKP
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 RSLRFTWSMKTTSSMDPNDMMREIRKVLDANNCDYEQKERFLLFCVHGDARQDSLVQWEM
:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::::::::.. ..::::::
CCDS45 RSLRFTWSMKTTSSMDPGDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAENLVQWEM
660 670 680 690 700 710
730 740 750
pF1KA1 EVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSIAFKNIASKIANELML
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS45 EVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSIAFKNIASKIANELKL
720 730 740 750
>>CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 (788 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KA1 MSARTPLPTVNERDTENHTSVDGYTEPHIQPTKSSSRQNIPRCRNSITSATDEQPHIGN
::::::::.::::::. : :. . .: ::..:. : ::: ::: ::::::::
CCDS53 MSSARTPLPTLNERDTEQPTL--GHLD-----SKPSSKSNMIRGRNSATSA-DEQPHIGN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 YRLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNI
::: ::::::::::::::::.:::.::::::::::::: .:::::::::::::.::::::
CCDS53 YRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150
pF1KA1 ----------------------GEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS53 VKLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 HRDLKAENLLLDGDMNIKIADFGFSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVD
::::::::::::.:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 HRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVD
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 VWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::: ::
CCDS53 VWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKR
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 GSLEQIMKDRWMNVGHEEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYD
:.:::::::::::::::..:::::.:: ::..: .: ..::.::..:.::.:.:..:.:.
CCDS53 GTLEQIMKDRWMNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYN
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 EVMATYILLGRKPPEFEGGESLSSGNLCQRSRPSSDLNNSTLQSPAHLKVQRSISANQKQ
::::::.::: : :.:: .. . :::.::.::. ::.: :::::.::: ::
CCDS53 EVMATYLLLGYKSSELEG------DTITLKPRPSADLTNSSAPSPSH-KVQRSVSANPKQ
360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 RRFSDHA-GPSIPPAVSYTKRPQANSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEMTASPLV
:::::.: ::.:: . ::.:. :.:..:... :: :.. .:: .:: ... ::::
CCDS53 RRFSDQAAGPAIPTSNSYSKKTQSNNAENKRPEE-DRESGRKASST-----AKVPASPLP
410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 GPERKKSSTIPS-NNVYSGGSMARRNTYVCERTTDRYVALQNGKDSSLTEMSVSSISSAG
: ::::.. :: :.: : .. ::. . ::.. ...:::::: :: : : :.:.
CCDS53 GLERKKTTPTPSTNSVLSTSTNRSRNSPLLERASLGQASIQNGKDS-LT-MPGSRASTAS
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 SSVASAVPSARPR-HQKSMSTSGHPIKVT-LPTIKDGSEAYRPGTT-QRVPAASPSAHSI
.: .:: .:::: ::::::.: :: :.. :: ... :. ::.:. ::::.::::::.:
CCDS53 AS--AAVSAARPRQHQKSMSASVHPNKASGLPPTESNCEVPRPSTAPQRVPVASPSAHNI
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620
pF1KA1 STA--TPDRTRFPRGSSSRSTFHGEQLRERR---SVAYNGPPASPS-HETGAFAHARRGT
:.. .:::: :::: :::::::. :::. : .. :. ::::: : : :::.
CCDS53 SSSGGAPDRTNFPRGVSSRSTFHAGQLRQVRDQQNLPYGVTPASPSGHSQG-----RRGA
580 590 600 610 620 630
630 640 650 660
pF1KA1 STGIISKITSKFVRRSTS--------GEPKERD------------------KEEGKDSKP
: .:.::.:::::::. : .::. .: ::: ...::
CCDS53 SGSIFSKFTSKFVRRNLSFRFARRNLNEPESKDRVETLRPHVVGSGGNDKEKEEFREAKP
640 650 660 670 680 690
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 RSLRFTWSMKTTSSMDPNDMMREIRKVLDANNCDYEQKERFLLFCVHGDARQDSLVQWEM
:::::::::::::::.::.::::::::::::.:. : .:...:.:.:: ....:::::
CCDS53 RSLRFTWSMKTTSSMEPNEMMREIRKVLDANSCQSELHEKYMLLCMHGTPGHEDFVQWEM
700 710 720 730 740 750
730 740 750
pF1KA1 EVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSIAFKNIASKIANELML
::::::::::::::::::::::.::::::::::::: :
CCDS53 EVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFKNIASKIANELKL
760 770 780
>>CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 (709 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KA1 MSARTPLPTVNERDTENHTSVDGYTEPHIQPTKSSSRQNIPRCRNSITSATDEQPHIGN
::::::::.::::::. : :. . .: ::..:. : ::: ::: ::::::::
CCDS53 MSSARTPLPTLNERDTEQPTL--GHLD-----SKPSSKSNMIRGRNSATSA-DEQPHIGN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 YRLQKTIGKGNFAKVKLARHVLTGREVAVKIIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNI
::: ::::::::::::::::.:::.::::::::::::: .:::::::::::::.::::::
CCDS53 YRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150
pF1KA1 ----------------------GEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKYIV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS53 VKLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 HRDLKAENLLLDGDMNIKIADFGFSNEFTVGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVD
::::::::::::.:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 HRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVD
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 VWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKLLVLNPIKR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::: ::
CCDS53 VWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKR
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 GSLEQIMKDRWMNVGHEEEELKPYTEPDPDFNDTKRIDIMVTMGFARDEINDALINQKYD
:.:::::::::::::::..:::::.:: ::..: .: ..::.::..:.::.:.:..:.:.
CCDS53 GTLEQIMKDRWMNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYN
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 EVMATYILLGRKPPEFEGGESLSSGNLCQRSRPSSDLNNSTLQSPAHLKVQRSISANQKQ
::::::.::: : :.:: .. . :::.::.::. ::.: :::::.::: ::
CCDS53 EVMATYLLLGYKSSELEG------DTITLKPRPSADLTNSSAPSPSH-KVQRSVSANPKQ
360 370 380 390 400
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pF1KA1 RRFSDHAGPSIPPAVSYTKRPQANSVESEQKEEWDKDVARKLGSTTVGSKSEMTASPLVG
:::::.:::.:: . ::.:. :.:..:... :: :.. .:: .:: ... :::: :
CCDS53 RRFSDQAGPAIPTSNSYSKKTQSNNAENKRPEE-DRESGRKASST-----AKVPASPLPG
410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 PERKKSSTIPS-NNVYSGGSMARRNTYVCERTTDRYVALQNGKDSSLTEMSVSSISSAGS
::::.. :: :.: : .. ::. . ::.. ...::::::
CCDS53 LERKKTTPTPSTNSVLSTSTNRSRNSPLLERASLGQASIQNGKDS---------------
460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 SVASAVPSARPRHQKSMSTSGHPIKVTLPTIKDGSEAYRPGTTQRVPAASPSAHSISTA-
: : ::::.::::::.::..
CCDS53 --------------------------TAP--------------QRVPVASPSAHNISSSG
510 520
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 -TPDRTRFPRGSSSRSTFHGEQLRERR---SVAYNGPPASPS-HETGAFAHARRGTSTGI
.:::: :::: :::::::. :::. : .. :. ::::: : : :::.: .:
CCDS53 GAPDRTNFPRGVSSRSTFHAGQLRQVRDQQNLPYGVTPASPSGHSQG-----RRGASGSI
530 540 550 560 570
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pF1KA1 ISKITSKFVRR----STSGEPKERDKEEGKDSKPRSLRFTWSMKTTSSMDPNDMMREIRK
.::.::::::: ...:. :: ::: ...:::::::::::::::::.::.:::::::
CCDS53 FSKFTSKFVRRPHVVGSGGNDKE--KEEFREAKPRSLRFTWSMKTTSSMEPNEMMREIRK
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720 730 740
pF1KA1 VLDANNCDYEQKERFLLFCVHGDARQDSLVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSIAFK
:::::.:. : .:...:.:.:: ....:::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS53 VLDANSCQSELHEKYMLLCMHGTPGHEDFVQWEMEVCKLPRLSLNGVRFKRISGTSMAFK
640 650 660 670 680 690
750
pF1KA1 NIASKIANELML
:::::::::: :
CCDS53 NIASKIANELKL
700
758 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 21:15:27 2016 done: Wed Nov 2 21:15:28 2016
Total Scan time: 3.800 Total Display time: 0.240
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]