Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1496
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1496, 1028 aa
1>>>pF1KA1496 1028 - 1028 aa - 1028 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1864+/-0.00126; mu= 12.2361+/- 0.074
mean_var=202.8766+/-43.871, 0's: 0 Z-trim(106.4): 262 B-trim: 3 in 1/50
Lambda= 0.090045
statistics sampled from 8675 (8988) to 8675 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.276), width: 16
Scan time: 3.320
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33790.1 CNTN3 gene_id:5067|Hs108|chr3 (1028) 6839 903.1 0
CCDS43041.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3 (1026) 4738 630.1 7e-180
CCDS2557.1 CNTN6 gene_id:27255|Hs108|chr3 (1028) 4348 579.5 1.3e-164
CCDS53697.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 (1026) 3848 514.5 4.5e-145
CCDS53696.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 (1100) 3811 509.7 1.3e-143
CCDS58168.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 ( 911) 3303 443.7 8.5e-124
CCDS1449.1 CNTN2 gene_id:6900|Hs108|chr1 (1040) 3085 415.4 3.1e-115
CCDS2558.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3 ( 698) 3073 413.6 7.1e-115
CCDS8738.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12 (1007) 2576 349.3 2.4e-95
CCDS8737.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12 (1018) 2574 349.0 2.9e-95
CCDS48192.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1248) 1476 206.5 2.9e-52
CCDS14734.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1253) 1473 206.1 3.8e-52
CCDS14733.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1257) 1473 206.1 3.8e-52
CCDS58812.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1208) 1418 198.9 5.3e-50
CCDS55153.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1192) 1350 190.1 2.4e-47
CCDS75652.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1211) 1147 163.7 2.1e-39
CCDS47686.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1304) 1147 163.8 2.2e-39
CCDS2556.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1224) 1134 162.0 6.8e-39
CCDS74887.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1171) 1128 161.2 1.1e-38
CCDS58225.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12 ( 627) 1046 150.3 1.2e-35
CCDS53460.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1240) 978 141.8 8.7e-33
CCDS5751.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1183) 961 139.5 3.9e-32
CCDS42929.1 DSCAM gene_id:1826|Hs108|chr21 (2012) 852 125.7 1e-27
CCDS53461.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 ( 619) 771 114.5 6.9e-25
CCDS53462.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1174) 740 110.8 1.7e-23
CCDS30982.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1169) 737 110.4 2.2e-23
CCDS8384.1 DSCAML1 gene_id:57453|Hs108|chr11 (2113) 735 110.5 3.9e-23
CCDS2971.1 BOC gene_id:91653|Hs108|chr3 (1114) 605 93.3 3.1e-18
CCDS77788.1 BOC gene_id:91653|Hs108|chr3 (1115) 600 92.6 4.9e-18
CCDS53957.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1408) 583 90.5 2.6e-17
CCDS58378.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1450) 583 90.5 2.7e-17
CCDS10247.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1461) 583 90.6 2.7e-17
CCDS42040.1 PRTG gene_id:283659|Hs108|chr15 (1150) 572 89.0 6.2e-17
CCDS10205.1 IGDCC3 gene_id:9543|Hs108|chr15 ( 814) 562 87.5 1.2e-16
CCDS30956.1 HMCN1 gene_id:83872|Hs108|chr1 (5635) 557 87.9 6.7e-16
CCDS43109.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1378) 523 82.7 5.8e-15
CCDS54609.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1394) 523 82.7 5.8e-15
CCDS44755.1 ROBO3 gene_id:64221|Hs108|chr11 (1386) 521 82.5 6.9e-15
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1910) 507 80.8 3e-14
CCDS54424.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (33423) 520 84.0 5.9e-14
CCDS74610.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (34350) 520 84.0 6e-14
CCDS59435.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (35991) 520 84.0 6.2e-14
CCDS11952.1 DCC gene_id:1630|Hs108|chr18 (1447) 493 78.9 8.9e-14
CCDS54611.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1651) 493 78.9 9.6e-14
CCDS42910.1 NCAM2 gene_id:4685|Hs108|chr21 ( 837) 453 73.4 2.3e-12
>>CCDS33790.1 CNTN3 gene_id:5067|Hs108|chr3 (1028 aa)
initn: 6839 init1: 6839 opt: 6839 Z-score: 4817.9 bits: 903.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6839; 100.0% identity (100.0% similar) in 1028 aa overlap (1-1028:1-1028)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MMFPWKQLILLSFIGCLGGELLLQGPVFIKEPSNSIFPVGSEDKKITLHCEARGNPSPHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MMFPWKQLILLSFIGCLGGELLLQGPVFIKEPSNSIFPVGSEDKKITLHCEARGNPSPHY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 RWQLNGSDIDMSMEHRYKLNGGNLVVINPNRNWDTGTYQCFATNSLGTIVSREAKLQFAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RWQLNGSDIDMSMEHRYKLNGGNLVVINPNRNWDTGTYQCFATNSLGTIVSREAKLQFAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LENFKTKMRSTVSVREGQGVVLLCGPPPHSGELSYAWIFNEYPSFVEEDSRRFVSQETGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LENFKTKMRSTVSVREGQGVVLLCGPPPHSGELSYAWIFNEYPSFVEEDSRRFVSQETGH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LYISKVEPSDVGNYTCVVTSMVTNARVLGSPTPLVLRSDGVMGEYEPKIEVQFPETLPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LYISKVEPSDVGNYTCVVTSMVTNARVLGSPTPLVLRSDGVMGEYEPKIEVQFPETLPAA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 KGSTVKLECFALGNPIPQINWRRSDGLPFSSKIKLRKFSGVLEIPNFQQEDAGSYECIAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KGSTVKLECFALGNPIPQINWRRSDGLPFSSKIKLRKFSGVLEIPNFQQEDAGSYECIAE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 NSRGKNVARGRLTYYAKPHWVQLIKDVEIAVEDSLYWECRASGKPKPSYRWLKNGAALVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NSRGKNVARGRLTYYAKPHWVQLIKDVEIAVEDSLYWECRASGKPKPSYRWLKNGAALVL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 EERTQIENGALTISNLSVTDSGMFQCIAENKHGLVYSSAELKVVASAPDFSKNPMKKLVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EERTQIENGALTISNLSVTDSGMFQCIAENKHGLVYSSAELKVVASAPDFSKNPMKKLVQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 VQVGSLVSLDCKPRASPRALSSWKKGDVSVQEHERISLLNDGGLKIANVTKADAGTYTCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VQVGSLVSLDCKPRASPRALSSWKKGDVSVQEHERISLLNDGGLKIANVTKADAGTYTCM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 AENQFGKANGTTHLVVTEPTRITLAPSNMDVSVGESVILPCQVQHDPLLDIIFTWYFNGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AENQFGKANGTTHLVVTEPTRITLAPSNMDVSVGESVILPCQVQHDPLLDIIFTWYFNGA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LADFKKDGSHFEKVGGSSSGDLMIRNIQLKHSGKYVCMVQTGVDSVSSAADLIVRGSPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LADFKKDGSHFEKVGGSSSGDLMIRNIQLKHSGKYVCMVQTGVDSVSSAADLIVRGSPGP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 PENVKVDEITDTTAQLSWKEGKDNHSPVISYSIQARTPFSVGWQTVTTVPEVIDGKTHTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PENVKVDEITDTTAQLSWKEGKDNHSPVISYSIQARTPFSVGWQTVTTVPEVIDGKTHTA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 TVVELNPWVEYEFRVVASNKIGGGEPSLPSEKVRTEEAVPEVPPSEVNGGGGSRSELVIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TVVELNPWVEYEFRVVASNKIGGGEPSLPSEKVRTEEAVPEVPPSEVNGGGGSRSELVIT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 WDPVPEELQNGEGFGYVVAFRPLGVTTWIQTVVTSPDTPRYVFRNESIVPYSPYEVKVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WDPVPEELQNGEGFGYVVAFRPLGVTTWIQTVVTSPDTPRYVFRNESIVPYSPYEVKVGV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 YNNKGEGPFSPVTTVFSAEEEPTVAPSQVSANSLSSSEIEVSWNTIPWKLSNGHLLGYEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YNNKGEGPFSPVTTVFSAEEEPTVAPSQVSANSLSSSEIEVSWNTIPWKLSNGHLLGYEV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 RYWNGGGKEESSSKMKVAGNETSARLRGLKSNLAYYTAVRAYNSAGAGPFSATVNVTTKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RYWNGGGKEESSSKMKVAGNETSARLRGLKSNLAYYTAVRAYNSAGAGPFSATVNVTTKK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 TPPSQPPGNVVWNATDTKVLLNWEQVKAMENESEVTGYKVFYRTSSQNNVQVLNTNKTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TPPSQPPGNVVWNATDTKVLLNWEQVKAMENESEVTGYKVFYRTSSQNNVQVLNTNKTSA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 ELVLPIKEDYIIEVKATTDGGDGTSSEQIRIPRITSMDARGSTSAISNVHPMSSYMPIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ELVLPIKEDYIIEVKATTDGGDGTSSEQIRIPRITSMDARGSTSAISNVHPMSSYMPIVL
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 FLIVYVLW
::::::::
CCDS33 FLIVYVLW
>>CCDS43041.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3 (1026 aa)
initn: 4669 init1: 2371 opt: 4738 Z-score: 3342.9 bits: 630.1 E(32554): 7e-180
Smith-Waterman score: 4738; 64.9% identity (87.4% similar) in 1023 aa overlap (1-1022:1-1020)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MMFPWKQLILLSFIGCLGGELLLQGPVFIKEPSNSIFPVGSEDKKITLHCEARGNPSPHY
: .::. :.: ::: ::. . :.::.::.::: .::. ::.::. :.::..:::.::
CCDS43 MRLPWELLVLQSFILCLADDSTLHGPIFIQEPSPVMFPLDSEEKKVKLNCEVKGNPKPHI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 RWQLNGSDIDMSMEHRYKLNGGNLVVINPNRNWDTGTYQCFATNSLGTIVSREAKLQFAY
::.:::.:.: .:. ::.. :.:.. :::.. :.::::: ::::.::::::::::::::
CCDS43 RWKLNGTDVDTGMDFRYSVVEGSLLINNPNKTQDAGTYQCTATNSFGTIVSREAKLQFAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LENFKTKMRSTVSVREGQGVVLLCGPPPHSGELSYAWIFNEYPSFVEEDSRRFVSQETGH
:.::::. :::::::.:::.::::::::::::::::::::::::. .:.:::::::::.
CCDS43 LDNFKTRTRSTVSVRRGQGMVLLCGPPPHSGELSYAWIFNEYPSY--QDNRRFVSQETGN
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LYISKVEPSDVGNYTCVVTSMVTNARVLGSPTPLVLRSDGVMGEYEPKIEVQFPETLPAA
:::.::: :::::::::::. ::: .::: ::::.::.::::::::::::::::::.:.:
CCDS43 LYIAKVEKSDVGNYTCVVTNTVTNHKVLGPPTPLILRNDGVMGEYEPKIEVQFPETVPTA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 KGSTVKLECFALGNPIPQINWRRSDGLPFSSKIKLRKFSGVLEIPNFQQEDAGSYECIAE
::.::::::::::::.: : :::.:: :.. : . .: .:.:::::::::::: :::.::
CCDS43 KGATVKLECFALGNPVPTIIWRRADGKPIARKARRHKSNGILEIPNFQQEDAGLYECVAE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 NSRGKNVARGRLTYYAKPHWVQLIKDVEIAVEDSLYWECRASGKPKPSYRWLKNGAALVL
::::::::::.::.::.:.:.: :.:...:.:....:::.:.:.:::.:.::::: :.
CCDS43 NSRGKNVARGQLTFYAQPNWIQKINDIHVAMEENVFWECKANGRPKPTYKWLKNGEPLLT
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 EERTQIENGALTISNLSVTDSGMFQCIAENKHGLVYSSAELKVVASAPDFSKNPMKKLVQ
..: :::.:.:.:. ....:.::.::.::::::...:.:::.:.: .::::.. .:...
CCDS43 RDRIQIEQGTLNITIVNLSDAGMYQCLAENKHGVIFSNAELSVIAVGPDFSRTLLKRVTL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 VQVGSLVSLDCKPRASPRALSSWKKGDVSVQEHERISLLNDGGLKIANVTKADAGTYTCM
:.::. : ..:::.:::. . .:::: ..:.:::.. .::.:.: ::::.:::.:::.
CCDS43 VKVGGEVVIECKPKASPKPVYTWKKGRDILKENERITISEDGNLRIINVTKSDAGSYTCI
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 AENQFGKANGTTHLVVTEPTRITLAPSNMDVSVGESVILPCQVQHDPLLDIIFTWYFNGA
: :.:: :..: .::: .:::. . ::.:::.::::..::::: :: :::.::: :::
CCDS43 ATNHFGTASSTGNLVVKDPTRVMVPPSSMDVTVGESIVLPCQVTHDHSLDIVFTWSFNGH
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KA1 LADFKKDGSHFEKVGGS-SSGDLMIRNIQLKHSGKYVCMVQTGVDSVSSAADLIVRGSPG
: :: .::.:::.:::. :.::::::::::::.:::::::::.:: .:.:::::::: ::
CCDS43 LIDFDRDGDHFERVGGQDSAGDLMIRNIQLKHAGKYVCMVQTSVDRLSAAADLIVRGPPG
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 PPENVKVDEITDTTAQLSWKEGKDNHSPVISYSIQARTPFSVGWQTVTTVPEVIDGKTHT
::: : .::::::::::::. : :::::. : ::::::::::::.:.::::.::::: :
CCDS43 PPEAVTIDEITDTTAQLSWRPGPDNHSPITMYVIQARTPFSVGWQAVSTVPELIDGKTFT
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 ATVVELNPWVEYEFRVVASNKIGGGEPSLPSEKVRTEEAVPEVPPSEVNGGGGSRSELVI
:::: ::::::::::.::.: :: :::: :::: :::::.::: :..:.:::::.:::::
CCDS43 ATVVGLNPWVEYEFRTVAANVIGIGEPSRPSEKRRTEEALPEVTPANVSGGGGSKSELVI
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 TWDPVPEELQNGEGFGYVVAFRPLGVTTWIQTVVTSPDTPRYVFRNESIVPYSPYEVKVG
::. ::::::::.:::::::::: : :. ::..: :. ::::::::. :.::.:::::
CCDS43 TWETVPEELQNGRGFGYVVAFRPYGKMIWMLTVLASADASRYVFRNESVHPFSPFEVKVG
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 VYNNKGEGPFSPVTTVFSAEEEPTVAPSQVSANSLSSSEIEVSWNTIPWKLSNGHLLGYE
:.::::::::::.:.:.::::::: :... : :::...::: : . : . . :.. :::
CCDS43 VFNNKGEGPFSPTTVVYSAEEEPTKPPASIFARSLSATDIEVFWAS-PLEKNRGRIQGYE
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 VRYWNGGGKEESSSKMKVAGNETSARLRGLKSNLAYYTAVRAYNSAGAGPFSATVNVTTK
:.:: :::.. :....::.::... .::... :. ::.::::::.:: ::::::::.
CCDS43 VKYWRHEDKEENARKIRTVGNQTSTKITNLKGSVLYHLAVKAYNSAGTGPSSATVNVTTR
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 KTPPSQPPGNVVWNATDTKVLLNWEQVKAMENESEVTGYKVFYRTSSQNNVQVLNTNKTS
: ::::::::..::..:.:..:::.::::..::::: ::::.:: . :....:..:::::
CCDS43 KPPPSQPPGNIIWNSSDSKIILNWDQVKALDNESEVKGYKVLYRWNRQSSTSVIETNKTS
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 AELVLPIKEDYIIEVKATTDGGDGTSSEQIRIPRITSMDARGSTSAISNVHPMSSYMPIV
.:: ::. ::::::.: .:::::.::::::::.:.. :::: .. ::. .:. :.
CCDS43 VELSLPFDEDYIIEIKPFSDGGDGSSSEQIRIPKISNAYARGSGASTSNACTLSAISTIM
960 970 980 990 1000 1010
1020
pF1KA1 LFLIVYVLW
. :
CCDS43 ISLTARSSL
1020
>>CCDS2557.1 CNTN6 gene_id:27255|Hs108|chr3 (1028 aa)
initn: 4334 init1: 4334 opt: 4348 Z-score: 3069.1 bits: 579.5 E(32554): 1.3e-164
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10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MMFPWKQLILLSFIGCLGGELLLQGPVFIKEPSNSIFPVGSEDKKITLHCEARGNPSPHY
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CCDS25 MRLLWKLVILLPLINSSAGDGLLSRPIFTQEPHDVIFPLDLSKSEVILNCAANGYPSPHY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 RWQLNGSDIDMSMEHRYKLNGGNLVVINPNRNWDTGTYQCFATNSLGTIVSREAKLQFAY
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CCDS25 RWKQNGTDIDFTMSYHYRLDGGSLAINSPHTDQDIGMYQCLATNLLGTILSRKAKLQFAY
70 80 90 100 110 120
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CCDS25 IEDFETKTRSTVSVREGQGVVLLCGPPPHFGDLSYAWTFNDNPLYVQEDNRRFVSQETGN
130 140 150 160 170 180
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CCDS25 LYIAKVEPSDVGNYTCFITNKEAQRSVQGPPTPLVQRTDGVMGEYEPKIEVRFPETIQAA
190 200 210 220 230 240
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CCDS25 KDSSVKLECFALGNPVPDISWRRLDGSPLPGKVKYSKSQAILEIPNFQQEDEGFYECIAS
250 260 270 280 290 300
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pF1KA1 NSRGKNVARGRLTYYAKPHWVQLIKDVEIAVEDSLYWECRASGKPKPSYRWLKNGAALVL
: ::.:.:.:.: .:: :.: : :....... :.: :::.:::::.: : ::::: :
CCDS25 NLRGRNLAKGQLIFYAPPEWEQKIQNTHLSIYDNLLWECKASGKPNPWYTWLKNGERLNP
310 320 330 340 350 360
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CCDS25 EERIQIENGTLIITMLNVSDSGVYQCAAENKYQIIYANAELRVLASAPDFSKSPVKKKSF
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pF1KA1 VQVGSLVSLDCKPRASPRALSSWKKGDVSVQEHERISLLNDGGLKIANVTKADAGTYTCM
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CCDS25 VQVGGDIVIGCKPNAFPRAAISWKRGTETLRQSKRIFLLEDGSLKIYNITRSDAGSYTCI
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pF1KA1 AENQFGKANGTTHLVVTEPTRITLAPSNMDVSVGESVILPCQVQHDPLLDIIFTWYFNGA
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CCDS25 ATNQFGTAKNTGSLIVKERTVITVPPSKMDVTVGESIVLPCQVSHDPSIEVVFVWFFNGD
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CCDS25 VIDLKKGVAHFERIGGESVGDLMIRNIQLHHSGKYLCTVQTTLESLSAVADIIVRGPPGP
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CCDS25 PEDVQVEDISSTTSQLSWRAGPDNNSPIQIFTIQTRTPFSVGWQAVATVPEILNGKTYNA
610 620 630 640 650 660
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pF1KA1 TVVELNPWVEYEFRVVASNKIGGGEPSLPSEKVRTEEAVPEVPPSEVNGGGGSRSELVIT
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CCDS25 TVVGLSPWVEYEFRVVAGNSIGIGEPSEPSELLRTKASVPVVAPVNIHGGGGSRSELVIT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 WDPVPEELQNGEGFGYVVAFRPLGVTTWIQTVVTSPDTPRYVFRNESIVPYSPYEVKVGV
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CCDS25 WESIPEELQNGEGFGYIIMFRPVGSTTWSKEKVSSVESSRFVYRNESIIPLSPFEVKVGV
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pF1KA1 YNNKGEGPFSPVTTVFSAEEEPTVAPSQVSANSLSSSEIEVSWNTIPWKLSNGHLLGYEV
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CCDS25 YNNEGEGSLSTVTIVYSGEDEPQLAPRGTSLQSFSASEMEVSWNAIAWNRNTGRVLGYEV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 RYWNGGGKEESSSKMKVAGNETSARLRGLKSNLAYYTAVRAYNSAGAGPFSATVNVTTKK
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CCDS25 LYWTDDSKESMIGKIRVSGNVTTKNITGLKANTIYFASVRAYNTAGTGPSSPPVNVTTKK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 TPPSQPPGNVVWNATDTKVLLNWEQVKAMENESEVTGYKVFYRTSSQNNVQVLNTNKTSA
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CCDS25 SPPSQPPANIAWKLTNSKLCLNWEHVKTMENESEVLGYKILYRQNRQSKTHILETNNTSA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 ELVLPIKEDYIIEVKATTDGGDGTSSEQIRIPRITSMDARGSTSAISNVHPMSSYMPIVL
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CCDS25 ELLVPFEEDYLIEIRTVSDGGDGSSSEEIRIPKMSSLSSRG----IQFLEPSTHFLSIVI
970 980 990 1000 1010
pF1KA1 FLIVYVLW
.
CCDS25 VIFHCFAIQPLI
1020
>>CCDS53697.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 (1026 aa)
initn: 2456 init1: 1953 opt: 3848 Z-score: 2718.0 bits: 514.5 E(32554): 4.5e-145
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10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MMFPWKQLILLSFIGCLGGELLLQGPVFIKEPSNSIFPVGSEDKKITLHCEARGNPSPHY
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CCDS53 MASSWKLMLFLSVTMCLS-ESVDYGPVFVQEPDDIIFPTDSDEKKVALNCEVRGNPVPSY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 RWQLNGSDIDMSMEHRYKLNGGNLVVINPNRNWDTGTYQCFATNSLGTIVSREAKLQFAY
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CCDS53 RWLRNGTEIDLESDYRYSLIDGTFIISNPSEAKDSGHYQCLATNTVGSILSREATLQFAY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LENFKTKMRSTVSVREGQGVVLLCGPPPHSGELSYAWIFNEYPSFVEEDSRRFVSQETGH
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CCDS53 LGNFSGRTRSAVSVREGQGVVLMCSPPPHSPEIIYSWVFNEFPSFVAEDSRRFISQETGN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LYISKVEPSDVGNYTCVVTSMVTNARVLGSPTPLVLRSDGVMGEYEPKIEVQFPETLPAA
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CCDS53 LYISKVQTSDVGSYICLVKNTVTNARVLSPPTPLTLRNDGVMGEYEPKIEVHFPFTVTAA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KA1 KGSTVKLECFALGNPIPQINWRRSDG-LPFSSKIKLRKFSGVLEIPNFQQEDAGSYECIA
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CCDS53 KGTTVKMECFALGNPVPTITWMKVNGYIP--SKARLRKSQAVLEIPNVQLDDAGIYECRA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 ENSRGKNVARGRLTYYAKPHWVQLIKDVEIAVEDSLYWECRASGKPKPSYRWLKNGAALV
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CCDS53 ENSRGKNSFRGQLQVYTYPHWVEKLNDTQLDSGSPLRWECKATGKPRPTYRWLKNGVPLS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 LEERTQIENGALTISNLSVTDSGMFQCIAENKHGLVYSSAELKVVASAPDFSKNPMKKLV
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CCDS53 PQSRVEMVNGVLMIHNVNQSDAGMYQCLAENKYGAIYASAELKILASAPTFALNQLKKTI
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 QVQVGSLVSLDCKPRASPRALSSWKKGDVSVQEHERISLLNDGGLKIANVTKADAGTYTC
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CCDS53 IVTKDQEVVIECKPQGSPKPTISWKKGDRAVRENKRIAILPDGSLRILNASKSDEGKYVC
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 MAENQFGKANGTTHLVVTEPTRITLAPSNMDVSVGESVILPCQVQHDPLLDIIFTWYFNG
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CCDS53 RGENVFGSAEIIASLSVKEPTRIELTPKRTELTVGESIVLNCKAIHDASLDVTFYWTLKG
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 ALADFKKDGSHFEKV-GGSSSGDLMIRNIQLKHSGKYVCMVQTGVDSVSSAADLIVRGSP
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CCDS53 QPIDFEEEGGHFESIRAQASSADLMIRNILLMHAGRYGCRVQTTADSVSDEAELLVRGPP
540 550 560 570 580 590
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pF1KA1 GPPENVKVDEITDTTAQLSWKEGKDNHSPVISYSIQARTPFSVGWQTVTTVPEVIDGKTH
::: : :.:::..:: :::. . :::::. ::..:::.:::.::::: ::::.: : .
CCDS53 GPPGIVIVEEITESTATLSWSPAADNHSPISSYNLQARSPFSLGWQTVKTVPEIITGDME
600 610 620 630 640 650
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pF1KA1 TATVVELNPWVEYEFRVVASNKIGGGEPSLPSEKVRTEEAVPEVPPSEVNGGGGSRSELV
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CCDS53 SAMAVDLNPWVEYEFRVVATNPIGTGDPSTPSRMIRTNEAVPKTAPTNVSGRSGRRHELV
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 ITWDPVPEELQNGEGFGYVVAFRPLGVTTWIQTVVTSPDTPRYVFRNESIVPYSPYEVKV
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CCDS53 IAWEPVSEEFQNGEGFGYIVAFRPNGTRGWKEKMVTSSEASKFIYRDESVPPLTPFEVKV
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 GVYNNKGEGPFSPVTTVFSAEEEPTVAPSQVSANSLSSSEIEVSWNTIPWKLSNGHLLGY
:::::::.:::: .... ::: ::..::..:.:.:.: ::: :.:. : : : :. :.
CCDS53 GVYNNKGDGPFSQIVVICSAEGEPSAAPTDVKATSVSVSEILVAWKHI--KESLGRPQGF
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 EVRYWNGGGKEESSSKMKVAGNETSARLRGLKSNLAYYTAVRAYNSAGAGPFSATVNVTT
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CCDS53 EVGYWKDMEQEDTAETVKTRGNESFVILTGLEGNTLYHFTVRAYNGAGYGPPSSEVSATT
840 850 860 870 880 890
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pF1KA1 KKTPPSQPPGNVVWNATDTKVLLNWEQVKAMENESEVTGYKVFYRTSSQNNVQVLNTNKT
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CCDS53 KKSPPSQAPSNLRWEQQGSQVSLGWEPVIPLANESEVVGYKVFYRQEGHSNSQVIETQKL
900 910 920 930 940 950
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pF1KA1 SAELVLPIKEDYIIEVKATTDGGDGTSSEQIRIPRITSMDARGSTSAISNVHPMSSYMPI
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CCDS53 QAVVPLPDAGVYIIEVRAYSEGGDGTASSQIRVP---SYSGGKITSAQSTLHSLSTSSSS
960 970 980 990 1000 1010
1020
pF1KA1 VLFLIVYVLW
: .:.. ..
CCDS53 VTLLLALMIPSTSW
1020
>>CCDS53696.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 (1100 aa)
initn: 2456 init1: 1953 opt: 3811 Z-score: 2691.7 bits: 509.7 E(32554): 1.3e-143
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10 20 30 40 50
pF1KA1 MMFPWKQLILLSFIGCLGGELLLQGPVFIKEPSNSIFPVGSEDKKITLHCEARG
::::..::.. :::. :..::..:.::.::
CCDS53 SWLGAAQNYYSPINLYHSSDAFKQDESVDYGPVFVQEPDDIIFPTDSDEKKVALNCEVRG
70 80 90 100 110 120
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 NPSPHYRWQLNGSDIDMSMEHRYKLNGGNLVVINPNRNWDTGTYQCFATNSLGTIVSREA
:: : ::: ::..::. ..::.: :.... ::.. :.: :::.:::..:.:.::::
CCDS53 NPVPSYRWLRNGTEIDLESDYRYSLIDGTFIISNPSEAKDSGHYQCLATNTVGSILSREA
130 140 150 160 170 180
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 KLQFAYLENFKTKMRSTVSVREGQGVVLLCGPPPHSGELSYAWIFNEYPSFVEEDSRRFV
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CCDS53 TLQFAYLGNFSGRTRSAVSVREGQGVVLMCSPPPHSPEIIYSWVFNEFPSFVAEDSRRFI
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pF1KA1 SQETGHLYISKVEPSDVGNYTCVVTSMVTNARVLGSPTPLVLRSDGVMGEYEPKIEVQFP
:::::.::::::. ::::.: :.: . :::::::. ::::.::.:::::::::::::.::
CCDS53 SQETGNLYISKVQTSDVGSYICLVKNTVTNARVLSPPTPLTLRNDGVMGEYEPKIEVHFP
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240 250 260 270 280 290
pF1KA1 ETLPAAKGSTVKLECFALGNPIPQINWRRSDG-LPFSSKIKLRKFSGVLEIPNFQQEDAG
:. ::::.:::.::::::::.: :.: . .: .: :: .::: ..:::::: : .:::
CCDS53 FTVTAAKGTTVKMECFALGNPVPTITWMKVNGYIP--SKARLRKSQAVLEIPNVQLDDAG
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 SYECIAENSRGKNVARGRLTYYAKPHWVQLIKDVEIAVEDSLYWECRASGKPKPSYRWLK
::: :::::::: ::.: :. ::::. ..:... . : :::.:.:::.:.:::::
CCDS53 IYECRAENSRGKNSFRGQLQVYTYPHWVEKLNDTQLDSGSPLRWECKATGKPRPTYRWLK
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pF1KA1 NGAALVLEERTQIENGALTISNLSVTDSGMFQCIAENKHGLVYSSAELKVVASAPDFSKN
::. : . :... ::.: : :.. .:.::.::.::::.: .:.:::::..:::: :. :
CCDS53 NGVPLSPQSRVEMVNGVLMIHNVNQSDAGMYQCLAENKYGAIYASAELKILASAPTFALN
430 440 450 460 470 480
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 PMKKLVQVQVGSLVSLDCKPRASPRALSSWKKGDVSVQEHERISLLNDGGLKIANVTKAD
.:: . : . : ..:::..::. :::::: .:.:..::..: ::.:.: :..:.:
CCDS53 QLKKTIIVTKDQEVVIECKPQGSPKPTISWKKGDRAVRENKRIAILPDGSLRILNASKSD
490 500 510 520 530 540
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 AGTYTCMAENQFGKANGTTHLVVTEPTRITLAPSNMDVSVGESVILPCQVQHDPLLDIIF
: :.: .:: ::.:. . : : ::::: :.:. ...::::..: :.. :: ::. :
CCDS53 EGKYVCRGENVFGSAEIIASLSVKEPTRIELTPKRTELTVGESIVLNCKAIHDASLDVTF
550 560 570 580 590 600
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 TWYFNGALADFKKDGSHFEKV-GGSSSGDLMIRNIQLKHSGKYVCMVQTGVDSVSSAADL
: ..: ::...:.:::.. . .::.::::::: : :.:.: : ::: .::::. :.:
CCDS53 YWTLKGQPIDFEEEGGHFESIRAQASSADLMIRNILLMHAGRYGCRVQTTADSVSDEAEL
610 620 630 640 650 660
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 IVRGSPGPPENVKVDEITDTTAQLSWKEGKDNHSPVISYSIQARTPFSVGWQTVTTVPEV
.::: :::: : :.:::..:: :::. . :::::. ::..:::.:::.::::: ::::.
CCDS53 LVRGPPGPPGIVIVEEITESTATLSWSPAADNHSPISSYNLQARSPFSLGWQTVKTVPEI
670 680 690 700 710 720
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 IDGKTHTATVVELNPWVEYEFRVVASNKIGGGEPSLPSEKVRTEEAVPEVPPSEVNGGGG
: : ..: .:.:::::::::::::.: :: :.:: ::. .::.::::.. :..:.: .:
CCDS53 ITGDMESAMAVDLNPWVEYEFRVVATNPIGTGDPSTPSRMIRTNEAVPKTAPTNVSGRSG
730 740 750 760 770 780
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 SRSELVITWDPVPEELQNGEGFGYVVAFRPLGVTTWIQTVVTSPDTPRYVFRNESIVPYS
: ::::.:.:: ::.::::::::.::::: :. : . .::: .. ....:.::. : .
CCDS53 RRHELVIAWEPVSEEFQNGEGFGYIVAFRPNGTRGWKEKMVTSSEASKFIYRDESVPPLT
790 800 810 820 830 840
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pF1KA1 PYEVKVGVYNNKGEGPFSPVTTVFSAEEEPTVAPSQVSANSLSSSEIEVSWNTIPWKLSN
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CCDS53 PFEVKVGVYNNKGDGPFSQIVVICSAEGEPSAAPTDVKATSVSVSEILVAWKHI--KESL
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pF1KA1 GHLLGYEVRYWNGGGKEESSSKMKVAGNETSARLRGLKSNLAYYTAVRAYNSAGAGPFSA
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CCDS53 GRPQGFEVGYWKDMEQEDTAETVKTRGNESFVILTGLEGNTLYHFTVRAYNGAGYGPPSS
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pF1KA1 TVNVTTKKTPPSQPPGNVVWNATDTKVLLNWEQVKAMENESEVTGYKVFYRTSSQNNVQV
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CCDS53 EVSATTKKSPPSQAPSNLRWEQQGSQVSLGWEPVIPLANESEVVGYKVFYRQEGHSNSQV
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pF1KA1 LNTNKTSAELVLPIKEDYIIEVKATTDGGDGTSSEQIRIPRITSMDARGSTSAISNVHPM
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CCDS53 IETQKLQAVVPLPDAGVYIIEVRAYSEGGDGTASSQIRVP---SYSGGKITSAQSTLHSL
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1020
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1090 1100
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10 20 30 40 50
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CCDS58 NPVPSYRWLRNGTEIDLESDYRYSLIDGTFIISNPSEAKDSGHYQCLATNTVGSILSREA
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CCDS58 FTVTAAKGTTVKMECFALGNPVPTITWMKVNGY-IPSKARLRKSQAVLEIPNVQLDDAGI
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CCDS58 YECRAENSRGKNSFRGQLQVYTYPHWVEKLNDTQLDSGSPLRWECKATGKPRPTYRWLKN
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pF1KA1 GAALVLEERTQIENGALTISNLSVTDSGMFQCIAENKHGLVYSSAELKVVASAPDFSKNP
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CCDS58 GVPLSPQSRVEMVNGVLMIHNVNQSDAGMYQCLAENKYGAIYASAELKILASAPTFALNQ
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CCDS58 LKKTIIVTKDQEVVIECKPQGSPKPTISWKKGDRAVRENKRIAILPDGSLRILNASKSDE
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480 490 500 510 520 530
pF1KA1 GTYTCMAENQFGKANGTTHLVVTEPTRITLAPSNMDVSVGESVILPCQVQHDPLLDIIFT
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CCDS58 GKYVCRGENVFGSAEIIASLSVKEPTRIELTPKRTELTVGESIVLNCKAIHDASLDVTFY
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pF1KA1 WYFNGALADFKKDGSHFEKV-GGSSSGDLMIRNIQLKHSGKYVCMVQTGVDSVSSAADLI
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CCDS58 WTLKGQPIDFEEEGGHFESIRAQASSADLMIRNILLMHAGRYGCRVQTTADSVSDEAELL
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pF1KA1 VRGSPGPPENVKVDEITDTTAQLSWKEGKDNHSPVISYSIQARTPFSVGWQTVTTVPEVI
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CCDS58 VRGPPGPPGIVIVEEITESTATLSWSPAADNHSPISSYNLQARSPFSLGWQTVKTVPEII
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pF1KA1 DGKTHTATVVELNPWVEYEFRVVASNKIGGGEPSLPSEKVRTEEAVPEVPPSEVNGGGGS
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CCDS58 TGDMESAMAVDLNPWVEYEFRVVATNPIGTGDPSTPSRMIRTNEAVPKTAPTNVSGRSGR
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pF1KA1 RSELVITWDPVPEELQNGEGFGYVVAFRPLGVTTWIQTVVTSPDTPRYVFRNESIVPYSP
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CCDS58 RHELVIAWEPVSEEFQNGEGFGYIVAFRPNGTRGWKEKMVTSSEASKFIYRDESVPPLTP
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pF1KA1 YEVKVGVYNNKGEGPFSPVTTVFSAEEEPTVAPSQVSANSLSSSEIEVSWNTIPWKLSNG
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CCDS58 FEVKVGVYNNKGDGPFSQIVVICSAEGEPSAAPTDVKATSVSVSEILVAWKHI--KESLG
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pF1KA1 HLLGYEVRYWNGGGKEESSSKMKVAGNETSARLRGLKSNLAYYTAVRAYNSAGAGPFSAT
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CCDS58 RPQGFEV
910
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10 20 30 40
pF1KA1 MMFPWKQLILLSFIGCLGGELLLQGPVFIKEPSNSIFPVGSEDKKITL
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CCDS14 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTTF-GPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLL
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pF1KA1 HCEARGNPSPHYRWQLNGSDIDMSMEHRYKLNGGNLVVINPNRNWDTGTYQCFATNSLGT
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CCDS14 ACRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGT
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CCDS14 VVSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKAHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPT
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pF1KA1 DSRRFVSQETGHLYISKVEPSDVGNYTCVVTSMV--TNARVLGSPTPLVLRSDGVMGEYE
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CCDS14 DGRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTR-LFA
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CCDS14 PSIKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDG---SLSPQWTTAEPTLQIPS
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CCDS14 VSFEDEGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPR
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CCDS14 PTVRWLRNGEPLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQAL
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CCDS14 APDFRLNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLII
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CCDS14 RNISRSDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHD
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CCDS14 PTMDLTFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDS
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CCDS14 ASKEATVLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTPPAGKWKQ
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CCDS14 VRTNPANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPS
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pF1KA1 EVNGGGGSRSELVITWDPVPEELQNGEGFGYVVAFRPLGVTTWIQTVVTSPDTPRYVFRN
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CCDS14 GLSGGGGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVYSN
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pF1KA1 ESIVPYSPYEVKVGVYNNKGEGPFSPVTTVFSAEEEPTVAPSQVSANSLSSSEIEVSWNT
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CCDS14 ESVRPYTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEP
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pF1KA1 IPWKLSNGHLLGYEVRYWNGGGKEESSSKMKVAGNETSARLRGLKSNLAYYTAVRAYNSA
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CCDS14 VQQDM-NGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRA
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pF1KA1 GAGPFSATVNVTTKKTPPSQPPGNVVWNATDTKVLLNWEQVKAMENESEVTGYKVFYRTS
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CCDS14 GTGPASPSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLY---
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pF1KA1 SQNNVQVLNTNKTSAE--LVLPIKEDY---IIEVKATTDGGDGTSSEQIRIPRITSMDAR
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CCDS14 -QNDLHLTPTLHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAE-VHIVRNGGTSMM
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1010 1020
pF1KA1 GSTSAISNV-HPMSSYMPIVLFLIVYVLW
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CCDS14 VENMAVRPAPHPGTVISHSVAMLILIGSLEL
1010 1020 1030 1040
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CCDS25 MEENVFWECKANGRPKPTYKWLKNGEPLLT
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pF1KA1 EERTQIENGALTISNLSVTDSGMFQCIAENKHGLVYSSAELKVVASAPDFSKNPMKKLVQ
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CCDS25 RDRIQIEQGTLNITIVNLSDAGMYQCLAENKHGVIFSNAELSVIAVGPDFSRTLLKRVTL
40 50 60 70 80 90
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pF1KA1 VQVGSLVSLDCKPRASPRALSSWKKGDVSVQEHERISLLNDGGLKIANVTKADAGTYTCM
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CCDS25 VKVGGEVVIECKPKASPKPVYTWKKGRDILKENERITISEDGNLRIINVTKSDAGSYTCI
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pF1KA1 AENQFGKANGTTHLVVTEPTRITLAPSNMDVSVGESVILPCQVQHDPLLDIIFTWYFNGA
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CCDS25 ATNHFGTASSTGNLVVKDPTRVMVPPSSMDVTVGESIVLPCQVTHDHSLDIVFTWSFNGH
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pF1KA1 LADFKKDGSHFEKVGGS-SSGDLMIRNIQLKHSGKYVCMVQTGVDSVSSAADLIVRGSPG
: :: .::.:::.:::. :.::::::::::::.:::::::::.:: .:.:::::::: ::
CCDS25 LIDFDRDGDHFERVGGQDSAGDLMIRNIQLKHAGKYVCMVQTSVDRLSAAADLIVRGPPG
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CCDS25 PPEAVTIDEITDTTAQLSWRPGPDNHSPITMYVIQARTPFSVGWQAVSTVPELIDGKTFT
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:::: ::::::::::.::.: :: :::: :::: :::::.::: :..:.:::::.:::::
CCDS25 ATVVGLNPWVEYEFRTVAANVIGIGEPSRPSEKRRTEEALPEVTPANVSGGGGSKSELVI
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pF1KA1 TWDPVPEELQNGEGFGYVVAFRPLGVTTWIQTVVTSPDTPRYVFRNESIVPYSPYEVKVG
::. ::::::::.:::::::::: : :. ::..: :. ::::::::. :.::.:::::
CCDS25 TWETVPEELQNGRGFGYVVAFRPYGKMIWMLTVLASADASRYVFRNESVHPFSPFEVKVG
400 410 420 430 440 450
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pF1KA1 VYNNKGEGPFSPVTTVFSAEEEPTVAPSQVSANSLSSSEIEVSWNTIPWKLSNGHLLGYE
:.::::::::::.:.:.::::::: :... : :::...::: : . : . . :.. :::
CCDS25 VFNNKGEGPFSPTTVVYSAEEEPTKPPASIFARSLSATDIEVFWAS-PLEKNRGRIQGYE
460 470 480 490 500
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pF1KA1 VRYWNGGGKEESSSKMKVAGNETSARLRGLKSNLAYYTAVRAYNSAGAGPFSATVNVTTK
:.:: :::.. :....::.::... .::... :. ::.::::::.:: ::::::::.
CCDS25 VKYWRHEDKEENARKIRTVGNQTSTKITNLKGSVLYHLAVKAYNSAGTGPSSATVNVTTR
510 520 530 540 550 560
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pF1KA1 KTPPSQPPGNVVWNATDTKVLLNWEQVKAMENESEVTGYKVFYRTSSQNNVQVLNTNKTS
: ::::::::..::..:.:..:::.::::..::::: ::::.:: . :....:..:::::
CCDS25 KPPPSQPPGNIIWNSSDSKIILNWDQVKALDNESEVKGYKVLYRWNRQSSTSVIETNKTS
570 580 590 600 610 620
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 AELVLPIKEDYIIEVKATTDGGDGTSSEQIRIPRITSMDARGSTSAISNVHPMSSYMPIV
.:: ::. ::::::.: .:::::.::::::::.:.. :::: .. ::. .:. :.
CCDS25 VELSLPFDEDYIIEIKPFSDGGDGSSSEQIRIPKISNAYARGSGASTSNACTLSAISTIM
630 640 650 660 670 680
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pF1KA1 LFLIVYVLW
. :
CCDS25 ISLTARSSL
690
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pF1KA1 MMFPWKQLILLSFIGCLG--GELLLQGPVFIKEPSNSIFPVGSEDKKITLHCEARGNP
.:...:. ::. : ::.: ..: :.:.: : . :..:.:.::..:
CCDS87 MKMWLLVSHLVIISITTCLAVSEEDKGFGPIFEEQPINTIYPEESLEGKVSLNCRARASP
10 20 30 40 50 60
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pF1KA1 SPHYRWQLNGSDIDMSMEHRYKLNGGNLVVINPNRNWDTGTYQCFATNSLGTIVSREAKL
: :.:..:..:.:.. . ::.. :::::. ::... :.: : :.:.:. : . : :: :
CCDS87 FPVYKWRMNNGDVDLTSD-RYSMVGGNLVINNPDKQKDAGIYYCLASNNYGMVRSTEATL
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pF1KA1 QFAYLENFKTKMRSTVSVREGQGVVLLCGPPPH-SGELSYAWIFNEYPSFVEEDSRRFVS
.:.::. : . : : :.::.:.:::: :: : .::: :..::.: :. :.:::::
CCDS87 SFGYLDPFPPEERPEVRVKEGKGMVLLCDPPYHFPDDLSYRWLLNEFPVFITMDKRRFVS
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pF1KA1 QETGHLYISKVEPSDVGNYTCVVTSMVTNARVLGSPTPLVLRSDGVMGEYEPKIEVQFPE
: .:.:::..:: :: :::.: :.: . :... ::. . . : : ::: .
CCDS87 QTNGNLYIANVEASDKGNYSCFVSSPSITKSVFSKFIPLIPIPERTTKPYPADIVVQFKD
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pF1KA1 TLPAAKGSTVKLECFALGNPIPQINWRRSDGLPFSSKIKLRKFSGVLEIPNFQQEDAGSY
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CCDS87 VY-ALMGQNVTLECFALGNPVPDIRWRKVLE-PMPSTAEISTSGAVLKIFNIQLEDEGIY
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