FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1508, 1126 aa 1>>>pF1KA1508 1126 - 1126 aa - 1126 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5532+/-0.00101; mu= -1.6186+/- 0.061 mean_var=292.3699+/-58.762, 0's: 0 Z-trim(113.5): 134 B-trim: 65 in 1/53 Lambda= 0.075008 statistics sampled from 13986 (14120) to 13986 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.434), width: 16 Scan time: 3.200 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS56027.1 ARHGAP23 gene_id:57636|Hs108|chr17 (1491) 7623 839.5 0 CCDS7144.2 ARHGAP21 gene_id:57584|Hs108|chr10 (1958) 1339 159.5 6.8e-38 CCDS2184.1 ARHGAP15 gene_id:55843|Hs108|chr2 ( 475) 539 72.5 2.6e-12 >>CCDS56027.1 ARHGAP23 gene_id:57636|Hs108|chr17 (1491 aa) initn: 7623 init1: 7623 opt: 7623 Z-score: 4470.6 bits: 839.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 7623; 100.0% identity (100.0% similar) in 1118 aa overlap (3-1120:21-1138) 10 20 30 40 pF1KA1 MEQLPLGPRDGCSPRRPFPWQGPRTLLLYKSPQDGFGFTLRH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 MNGVAFCLVGIPPRPEPRPPQLPLGPRDGCSPRRPFPWQGPRTLLLYKSPQDGFGFTLRH 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KA1 FIVYPPESAVHCSLKEEENGGRGGGPSPRYRLEPMDTIFVKNVKEDGPAHRAGLRTGDRL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 FIVYPPESAVHCSLKEEENGGRGGGPSPRYRLEPMDTIFVKNVKEDGPAHRAGLRTGDRL 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KA1 VKVNGESVIGKTYSQVIALIQNSDDTLELSIMPKDEDILQLAYSQDAYLKGNEPYSGEAR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 VKVNGESVIGKTYSQVIALIQNSDDTLELSIMPKDEDILQLAYSQDAYLKGNEPYSGEAR 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KA1 SIPEPPPICYPRKTYAPPARASTRATMVPEPTSALPSDPRSPAAWSDPGLRVPPAARAHL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 SIPEPPPICYPRKTYAPPARASTRATMVPEPTSALPSDPRSPAAWSDPGLRVPPAARAHL 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KA1 DNSSLGMSQPRPSPGAFPHLSSEPRTPRAFPEPGSRVPPSRLECQQALSHWLSNQVPRRA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 DNSSLGMSQPRPSPGAFPHLSSEPRTPRAFPEPGSRVPPSRLECQQALSHWLSNQVPRRA 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KA1 GERRCPAMAPRARSASQDRLEEVAAPRPWPCSTSQDALSQLGQEGWHRARSDDYLSRATR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 GERRCPAMAPRARSASQDRLEEVAAPRPWPCSTSQDALSQLGQEGWHRARSDDYLSRATR 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KA1 SAEALGPGALVSPRFERCGWASQRSSARTPACPTRDLPGPQAPPPSGLQGLDDLGYIGYR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 SAEALGPGALVSPRFERCGWASQRSSARTPACPTRDLPGPQAPPPSGLQGLDDLGYIGYR 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KA1 SYSPSFQRRTGLLHALSFRDSPFGGLPTFNLAQSPASFPPEASEPPRVVRPEPSTRALEP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 SYSPSFQRRTGLLHALSFRDSPFGGLPTFNLAQSPASFPPEASEPPRVVRPEPSTRALEP 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KA1 PAEDRGDEVVLRQKPPTGRKVQLTPARQMNLGFGDESPEPEASGRGERLGRKVAPLATTE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 PAEDRGDEVVLRQKPPTGRKVQLTPARQMNLGFGDESPEPEASGRGERLGRKVAPLATTE 490 500 510 520 530 540 530 540 550 560 570 580 pF1KA1 DSLASIPFIDEPTSPSIDLQAKHVPASAVVSSAMNSAPVLGTSPSSPTFTFTLGRHYSQD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 DSLASIPFIDEPTSPSIDLQAKHVPASAVVSSAMNSAPVLGTSPSSPTFTFTLGRHYSQD 550 560 570 580 590 600 590 600 610 620 630 640 pF1KA1 CSSIKAGRRSSYLLAITTERSKSCDDGLNTFRDEGRVLRRLPNRIPSLRMLRSFFTDGSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 CSSIKAGRRSSYLLAITTERSKSCDDGLNTFRDEGRVLRRLPNRIPSLRMLRSFFTDGSL 610 620 630 640 650 660 650 660 670 680 690 700 pF1KA1 DSWGTSEDADAPSKRHSTSDLSDATFSDIRREGWLYYKQILTKKGKKAGSGLRQWKRVYA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 DSWGTSEDADAPSKRHSTSDLSDATFSDIRREGWLYYKQILTKKGKKAGSGLRQWKRVYA 670 680 690 700 710 720 710 720 730 740 750 760 pF1KA1 ALRARSLSLSKERREPGPAAAGAAAAGAGEDEAAPVCIGSCLVDISYSETKRRHVFRLTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 ALRARSLSLSKERREPGPAAAGAAAAGAGEDEAAPVCIGSCLVDISYSETKRRHVFRLTT 730 740 750 760 770 780 770 780 790 800 810 820 pF1KA1 ADFCEYLFQAEDRDDMLGWIRAIRENSRAEGEDPGCANQALISKKLNDYRKVSHSSGPKA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 ADFCEYLFQAEDRDDMLGWIRAIRENSRAEGEDPGCANQALISKKLNDYRKVSHSSGPKA 790 800 810 820 830 840 830 840 850 860 870 880 pF1KA1 DSSPKGSRGLGGLKSEFLKQSAARGLRTQDLPAGSKDDSAAAPKTPWGINIIKKNKKAAP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 DSSPKGSRGLGGLKSEFLKQSAARGLRTQDLPAGSKDDSAAAPKTPWGINIIKKNKKAAP 850 860 870 880 890 900 890 900 910 920 930 940 pF1KA1 RAFGVRLEECQPATENQRVPLIVAACCRIVEARGLESTGIYRVPGNNAVVSSLQEQLNRG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 RAFGVRLEECQPATENQRVPLIVAACCRIVEARGLESTGIYRVPGNNAVVSSLQEQLNRG 910 920 930 940 950 960 950 960 970 980 990 1000 pF1KA1 PGDINLQDERWQDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTDDKYNDFIEANRIEDARERMRTLRKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 PGDINLQDERWQDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTDDKYNDFIEANRIEDARERMRTLRKL 970 980 990 1000 1010 1020 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA1 IRDLPGHYYETLKFLVGHLKTIADHSEKNKMEPRNLALVFGPTLVRTSEDNMTDMVTHMP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 IRDLPGHYYETLKFLVGHLKTIADHSEKNKMEPRNLALVFGPTLVRTSEDNMTDMVTHMP 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KA1 DRYKIVETLIQHSDWFFSDEEDKGERTPVGDKEPQAVPNIEYLLPNIGRTVPPGDPGSAD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS56 DRYKIVETLIQHSDWFFSDEEDKGERTPVGDKEPQAVPNIEYLLPNIGRTVPPGDPGSDS 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA1 LLEI CCDS56 TTCSSAKSKGSWAPKKEPYAREMLAISFISAVNRKRKKRREARGLGSSTDDDSEQEAHKP 1150 1160 1170 1180 1190 1200 >>CCDS7144.2 ARHGAP21 gene_id:57584|Hs108|chr10 (1958 aa) initn: 2253 init1: 1050 opt: 1339 Z-score: 793.8 bits: 159.5 E(32554): 6.8e-38 Smith-Waterman score: 1918; 48.6% identity (71.5% similar) in 681 aa overlap (466-1117:730-1381) 440 450 460 470 480 490 pF1KA1 SPASFPPEASEPPRVVRPEPSTRALEPPAEDRGDEVVLRQKPPTGRKVQLTPARQMN--L : . :.::.:::.::.. : :... : CCDS71 AGTSDLELPVSQRNQDLSLQEAETEQSDTLDNKEAVILREKPPSGRQTP-QPLRHQSYIL 700 710 720 730 740 750 500 510 520 530 540 pF1KA1 GFGDESPEPEAS------GRGE----RLG-RKVAPLATTEDSLASIPFIDEPTSPSIDLQ . .:. ... .: : :. ::.. . :::::::::::::::::: . CCDS71 AVNDQETGSDTTCWLPNDARREVHIKRMEERKASSTSPPGDSLASIPFIDEPTSPSIDHD 760 770 780 790 800 810 550 560 570 580 590 600 pF1KA1 AKHVPASAVVSSAMNSAPVLGTSPSSPTFTFTL-GRHYSQDCSSIKAGRRSSYLLAITTE :.:::::.:.. ...: ..: : : . : :. :.: :. .. . :: CCDS71 IAHIPASAVISASTSQVPSIATVPPCLTTSAPLIRRQLSHDHESVGPPSLDAQPNS-KTE 820 830 840 850 860 870 610 620 630 640 650 660 pF1KA1 RSKSCDDGLNTFRDEGRVLRRLPNRIPSLRMLRSFFTDGSLDSWGTSEDADAPSKRHSTS :::: :.::. .:..... . .. ::. .. :: .:::. :.. :.: CCDS71 RSKSYDEGLDDYREDAKLSFK---HVSSLKGIKI------ADSQKSSEDSG--SRKDSSS 880 890 900 910 920 670 680 690 700 710 720 pF1KA1 DLSDATFSDIRREGWLYYKQILTKKGKKAGSGLRQWKRVYAALRARSLSLSKERREPGPA .. ::: .::::... ..: :::..:...: ::..:..::..:: : :..:: CCDS71 EV----FSDAAKEGWLHFRPLVTDKGKRVGGSIRPWKQMYVVLRGHSLYLYKDKREQTTP 930 940 950 960 970 980 730 740 750 760 770 780 pF1KA1 AAGAAAAGAGEDEAAPVCIGSCLVDISYSETKRRHVFRLTTADFCEYLFQAEDRDDMLGW . .: :. ...::.:::::::::..::::::.: :: :::::::::::.: CCDS71 S----------EEEQPISVNACLIDISYSETKRKNVFRLTTSD-CECLFQAEDRDDMLAW 990 1000 1010 1020 1030 790 800 810 820 830 pF1KA1 IRAIRENSRAEGEDPGCANQALISKKLNDYRKVSHSSGPKADSSPKGS----RGLGGLKS :..:.:.: . :: : .:. :::.....: .. :.. . ..:. : . : : :: CCDS71 IKTIQESSNLNEEDTGVTNRDLISRRIKEYNNL-MSKAEQLPKTPRQSLSIRQTLLGAKS 1040 1050 1060 1070 1080 1090 840 850 860 870 880 890 pF1KA1 EFLKQSAARGLRTQDLPAGSKDD-SAAAPKTPW--GI-NIIKKNKKAAPRA---FGVRLE : :: . .. :::: : : : :: .:..:. . : : :::::. CCDS71 EPKTQSPHSPKEESERKLLSKDDTSPPKDKGTWRKGIPSIMRKTFEKKPTATGTFGVRLD 1100 1110 1120 1130 1140 1150 900 910 920 930 940 950 pF1KA1 ECQPATENQRVPLIVAACCRIVEARGLESTGIYRVPGNNAVVSSLQEQLNRGPGDINLQD .: :: :. .:::: ::..:: :::: :::::::::::..::.::.::.: .::..:: CCDS71 DCPPAHTNRYIPLIVDICCKLVEERGLEYTGIYRVPGNNAAISSMQEELNKGMADIDIQD 1160 1170 1180 1190 1200 1210 960 970 980 990 1000 1010 pF1KA1 ERWQDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTDDKYNDFIEANRIEDARERMRTLRKLIRDLPGHY ..:.::::::::::::::::::::::.::: ::::::: :: .:..::..::.::: :. CCDS71 DKWRDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTNDKYADFIEANRKEDPLDRLKTLKRLIHDLPEHH 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KA1 YETLKFLVGHLKTIADHSEKNKMEPRNLALVFGPTLVRTSEDNMTDMVTHMPDRYKIVET ::::::: .::::.:..::::::::::::.::::::::::::::: :::::::.:::::: CCDS71 YETLKFLSAHLKTVAENSEKNKMEPRNLAIVFGPTLVRTSEDNMTHMVTHMPDQYKIVET 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KA1 LIQHSDWFFSDEEDKGERTPVGDK---EPQAVPNIEYLLPNIGRT-VPPGDPGSADLLEI :::: ::::..: . : : .. . : ::::..:: ::::: : ::: CCDS71 LIQHHDWFFTEEGAEEPLTTVQEESTVDSQPVPNIDHLLTNIGRTGVSPGDVSDSATSDS 1340 1350 1360 1370 1380 1390 CCDS71 TKSKGSWGSGKDQYSRELLVSSIFAAASRKRKKPKEKAQPSSSEDELDNVFFKKENVEQC 1400 1410 1420 1430 1440 1450 >-- initn: 516 init1: 398 opt: 830 Z-score: 496.1 bits: 104.4 E(32554): 2.6e-21 Smith-Waterman score: 830; 62.0% identity (75.1% similar) in 221 aa overlap (13-217:38-253) 10 20 30 40 pF1KA1 MEQLPLGPRDGCSPRRPFPWQGPRTLLLYKSPQDGFGFTLRH : . : : ::.:. : .. : :::::::: CCDS71 GLSEGDGDKLKACEVSKNKDGKEQSETVSLSEDETFSWPGPKTVTLKRTSQ-GFGFTLRH 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KA1 FIVYPPESAVHCSLKEEENGGRGGGPSPRYRLEPMDTIFVKNVKEDGPAHRAGLRTGDRL :::::::::.. : :.::::.::: . : :::::::::::.::: ::: .::: ::::. CCDS71 FIVYPPESAIQFSYKDEENGNRGG--KQRNRLEPMDTIFVKQVKEGGPAFEAGLCTGDRI 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 pF1KA1 VKVNGESVIGKTYSQVIALIQNSDDTLELSIMPKDEDILQ----------LAYSQDAYLK .::::::::::::::::::::::: :::::.::::::::: :::::::::: CCDS71 IKVNGESVIGKTYSQVIALIQNSDTTLELSVMPKDEDILQVLQFTKDVTALAYSQDAYLK 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KA1 GNEPYSGEARSIPEPPPICYPRKTYAPPARASTRATMVPEPTSALPSDPRSPAAWSDPG- ::: :::.::.:::::::::: :: : : . . . : :.: .. : . ..:: CCDS71 GNEAYSGNARNIPEPPPICYPWLPSAPSAMA--QPVEISPPDSSLSKQQTSTPVLTQPGR 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 pF1KA1 -----LRVPPAARAHLDNSSLGMSQPRPSPGAFPHLSSEPRTPRAFPEPGSRVPPSRLEC ..:::. CCDS71 AYRMEIQVPPSPTDVAKSNTAVCVCNESVRTVIVPSEKVVDLLSNRNNHTGPSHRTEEVR 250 260 270 280 290 300 >>CCDS2184.1 ARHGAP15 gene_id:55843|Hs108|chr2 (475 aa) initn: 452 init1: 304 opt: 539 Z-score: 334.6 bits: 72.5 E(32554): 2.6e-12 Smith-Waterman score: 573; 29.5% identity (63.3% similar) in 420 aa overlap (671-1084:80-475) 650 660 670 680 690 pF1KA1 SLDSWGTSEDADAPSKRHSTSDLSDATFSDIRREGWLYYKQILTKKGKKAGSGLRQ-WKR ...::.: .: . ::: ::. :. CCDS21 GKVTEPISRHRRNHSQHILKDVIPPLEQLMVEKEGYLQKAKI-ADGGKK----LRKNWST 50 60 70 80 90 100 700 710 720 730 740 750 pF1KA1 VYAALRARSLSLSKERREPGPAAAGAAAAGAGEDEAAPVCIGSCLVDISYSETKRRHVFR . .: .: . . :: .. : . .: . :.. .: :. .. . ...:..::. CCDS21 SWIVLSSRRIEFYKESKQQ---ALSNMKTGH-KPESVDLC-GAH-IEWAKEKSSRKNVFQ 110 120 130 140 150 760 770 780 790 800 810 pF1KA1 LTTADFCEYLFQAEDRDDMLGWIRAIRENSRAEGEDPGCANQALISKKL---NDYRKVSH .::.. :.:.:.. .: :..::.. .: .: .. : :. .. . .:: CCDS21 ITTVSGNEFLLQSDIDFIILDWFHAIKNAIDRLPKDSSCPSRNLELFKIQRSSSTELLSH 160 170 180 190 200 210 820 830 840 850 860 870 pF1KA1 SSGPKADSSPKGSRGLGGLKSEF-LKQSAARGLRTQDLPAGSKDDSAAAPKTPWGINIIK .. ...:. ..: : :..::. :.: .. . . : ... .. CCDS21 YDSDIKEQKPEHRKSL-----MFRLHHSASD---TSDKNRVKSRLKKFITRRP-SLKTLQ 220 230 240 250 260 880 890 900 910 920 930 pF1KA1 KNKKAAPRAFGVRLEE-CQPATENQRVPLIVAACCRIVEARGLESTGIYRVPGNNAVVSS .. . :: .:.. :. ::. :: .: : . :: :::. ::::: :: :.... CCDS21 EKGLIKDQIFGSHLHKVCE--RENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQK 270 280 290 300 310 320 940 950 960 970 980 990 pF1KA1 LQEQLNRGPGDINLQDERWQDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTDDKYNDFIEANRIEDARE :. .:. .::.: .:.:..:... :: :::.:::::: . ...:.:: . .: CCDS21 LRFIVNQ-EEKLNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNT 330 340 350 360 370 380 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KA1 RMRTLRKLIRDLPGHYYETLKFLVGHLKTIADHSEKNKMEPRNLALVFGPTLVRTSEDNM :......:.. :: .:.: : ::: :. .. :: : ..:..::::::.: .:.. CCDS21 RIEAVKSLVQKLPPPNRDTMKVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLR-AENET 390 400 410 420 430 440 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KA1 TDMVTHMPDRYKIVETLIQHSDWFFSDEEDKGERTPVGDKEPQAVPNIEYLLPNIGRTVP .:. :: . .:.: .... . .:..::: CCDS21 GNMAIHMVYQNQIAELMLSEYSKIFGSEED 450 460 470 1126 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 02:21:52 2016 done: Sat Nov 5 02:21:53 2016 Total Scan time: 3.200 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]