Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1512
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1512, 1983 aa
1>>>pF1KA1512 1983 - 1983 aa - 1983 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.9111+/-0.00201; mu= -25.4366+/- 0.118
mean_var=653.4088+/-140.697, 0's: 0 Z-trim(106.8): 262 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.050174
statistics sampled from 9010 (9206) to 9010 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.582), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16
Scan time: 6.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42869.1 MYH7B gene_id:57644|Hs108|chr20 (1983) 12619 931.1 0
CCDS9600.1 MYH6 gene_id:4624|Hs108|chr14 (1939) 8781 653.3 2.8e-186
CCDS9601.1 MYH7 gene_id:4625|Hs108|chr14 (1935) 8760 651.8 7.9e-186
CCDS11156.1 MYH2 gene_id:4620|Hs108|chr17 (1941) 8629 642.3 5.7e-183
CCDS11155.1 MYH1 gene_id:4619|Hs108|chr17 (1939) 8607 640.7 1.7e-182
CCDS11154.1 MYH4 gene_id:4622|Hs108|chr17 (1939) 8533 635.3 7e-181
CCDS11157.1 MYH3 gene_id:4621|Hs108|chr17 (1940) 8481 631.6 9.5e-180
CCDS11153.1 MYH8 gene_id:4626|Hs108|chr17 (1937) 8461 630.1 2.6e-179
CCDS45613.1 MYH13 gene_id:8735|Hs108|chr17 (1938) 8432 628.0 1.1e-178
CCDS43127.1 MYH15 gene_id:22989|Hs108|chr3 (1946) 6862 514.4 1.8e-144
CCDS10566.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1938) 4667 355.5 1.2e-96
CCDS45424.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1945) 4661 355.0 1.7e-96
CCDS10565.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1972) 4660 355.0 1.8e-96
CCDS45423.1 MYH11 gene_id:4629|Hs108|chr16 (1979) 4654 354.5 2.4e-96
CCDS11144.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1976) 4642 353.7 4.4e-96
CCDS73984.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (1985) 4642 353.7 4.4e-96
CCDS13927.1 MYH9 gene_id:4627|Hs108|chr22 (1960) 4605 351.0 2.8e-95
CCDS46151.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (2003) 4398 336.0 9.1e-91
CCDS59411.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (1995) 4378 334.6 2.5e-90
CCDS58515.1 MYH10 gene_id:4628|Hs108|chr17 (2007) 2646 209.2 1.4e-52
CCDS54295.1 MYH14 gene_id:79784|Hs108|chr19 (2036) 2448 194.9 2.9e-48
CCDS42036.1 MYO5C gene_id:55930|Hs108|chr15 (1742) 1703 140.9 4.3e-32
CCDS45262.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1828) 1641 136.4 1e-30
CCDS42037.1 MYO5A gene_id:4644|Hs108|chr15 (1855) 1629 135.6 1.9e-30
CCDS42436.1 MYO5B gene_id:4645|Hs108|chr18 (1848) 1626 135.3 2.2e-30
CCDS76991.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 961) 1234 106.8 4.5e-22
CCDS32615.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 (1006) 1234 106.8 4.6e-22
CCDS54834.1 MYO10 gene_id:4651|Hs108|chr5 (2058) 1209 105.2 2.9e-21
CCDS46010.1 MYO9B gene_id:4650|Hs108|chr19 (2022) 1124 99.0 2e-19
CCDS11003.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1028) 1112 98.0 2.2e-19
CCDS45562.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1044) 1112 98.0 2.2e-19
CCDS42226.1 MYO1C gene_id:4641|Hs108|chr17 (1063) 1112 98.0 2.2e-19
CCDS8929.1 MYO1A gene_id:4640|Hs108|chr12 (1043) 1098 97.0 4.4e-19
CCDS82546.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1107) 1097 96.9 4.8e-19
CCDS2311.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1078) 1088 96.2 7.4e-19
CCDS46477.1 MYO1B gene_id:4430|Hs108|chr2 (1136) 1088 96.3 7.8e-19
CCDS54112.1 MYO19 gene_id:80179|Hs108|chr17 ( 970) 1041 92.8 7.2e-18
CCDS46405.1 MYO7B gene_id:4648|Hs108|chr2 (2116) 1021 91.6 3.7e-17
CCDS34629.1 MYO1G gene_id:64005|Hs108|chr7 (1018) 993 89.3 8.4e-17
CCDS53685.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (1178) 980 88.4 1.8e-16
CCDS53684.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (2175) 980 88.6 2.9e-16
CCDS53683.1 MYO7A gene_id:4647|Hs108|chr11 (2215) 980 88.6 3e-16
CCDS53826.1 MYO1H gene_id:283446|Hs108|chr12 (1022) 952 86.4 6.6e-16
CCDS32254.1 MYO1E gene_id:4643|Hs108|chr15 (1108) 909 83.3 6.1e-15
CCDS46446.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1314) 869 80.4 5.2e-14
CCDS42773.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1341) 869 80.4 5.2e-14
CCDS42494.1 MYO1F gene_id:4542|Hs108|chr19 (1098) 862 79.9 6.4e-14
CCDS7148.1 MYO3A gene_id:53904|Hs108|chr10 (1616) 842 78.5 2.4e-13
CCDS76992.1 MYO1D gene_id:4642|Hs108|chr17 ( 436) 752 71.7 7.6e-12
CCDS45654.1 MYO19 gene_id:80179|Hs108|chr17 ( 770) 725 69.9 4.6e-11
>>CCDS42869.1 MYH7B gene_id:57644|Hs108|chr20 (1983 aa)
initn: 12619 init1: 12619 opt: 12619 Z-score: 4959.2 bits: 931.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12619; 100.0% identity (100.0% similar) in 1983 aa overlap (1-1983:1-1983)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSGNKRGSRASCPHRGAECLLPWAALNLQGFQLLLLHPSATAMMDVSELGESARYLRQGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSGNKRGSRASCPHRGAECLLPWAALNLQGFQLLLLHPSATAMMDVSELGESARYLRQGY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 QEMTKVHTIPWDGKKRVWVPDEQDAYVEAEVKSEATGGRVTVETKDQKVLMVREAELQPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QEMTKVHTIPWDGKKRVWVPDEQDAYVEAEVKSEATGGRVTVETKDQKVLMVREAELQPM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 NPPRFDLLEDMAMMTHLNEASVLHNLRQRYARWMIYTYSGLFCVTINPYKWLPVYTASVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NPPRFDLLEDMAMMTHLNEASVLHNLRQRYARWMIYTYSGLFCVTINPYKWLPVYTASVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 AAYKGKRRSDSPPHIYAVADNAYNDMLRNRDNQSMLITGESGAGKTVNTKRVIQYFAIVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AAYKGKRRSDSPPHIYAVADNAYNDMLRNRDNQSMLITGESGAGKTVNTKRVIQYFAIVA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 ALGDGPGKKAQFLATKTGGTLEDQIIEANPAMEAFGNAKTLRNDNSSRFGKFIRIHFGPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ALGDGPGKKAQFLATKTGGTLEDQIIEANPAMEAFGNAKTLRNDNSSRFGKFIRIHFGPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 GKLASADIDSYLLEKSRVIFQLPGERSYHVYYQILSGRKPELQDMLLLSMNPYDYHFCSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GKLASADIDSYLLEKSRVIFQLPGERSYHVYYQILSGRKPELQDMLLLSMNPYDYHFCSQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 GVITVDNMNDGEELIATDHAMDILGFSVDEKCACYKIVGALLHFGNMKFKQKQREEQAEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GVITVDNMNDGEELIATDHAMDILGFSVDEKCACYKIVGALLHFGNMKFKQKQREEQAEA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 DGTESADKAAYLMGVSSGDLLKGLLHPRVRVGNEYVTKGQSVEQVVFAVGALAKATYDRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DGTESADKAAYLMGVSSGDLLKGLLHPRVRVGNEYVTKGQSVEQVVFAVGALAKATYDRL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 FRWLVSRINQTLDTKLPRQFFIGVLDIAGFEIFEFNSFEQLCINFTNEKLQQFFNQHMFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FRWLVSRINQTLDTKLPRQFFIGVLDIAGFEIFEFNSFEQLCINFTNEKLQQFFNQHMFV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LEQEEYKREGIDWVFIDFGLDLQPCIDLIEKPLGILSILEEECMFPKASDASFRAKLYDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LEQEEYKREGIDWVFIDFGLDLQPCIDLIEKPLGILSILEEECMFPKASDASFRAKLYDN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 HAGKSPNFQQPRPDKKRKYQAHFEVVHYAGVVPYSIVGWLEKNKDPLNETVVPIFQKSQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HAGKSPNFQQPRPDKKRKYQAHFEVVHYAGVVPYSIVGWLEKNKDPLNETVVPIFQKSQN
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670 680 690 700 710 720
pF1KA1 RLLATLYENYAGSCSTEPPKSGVKEKRKKAASFQTVSQLHKENLNKLMTNLRATQPHFVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RLLATLYENYAGSCSTEPPKSGVKEKRKKAASFQTVSQLHKENLNKLMTNLRATQPHFVR
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pF1KA1 CIVPNENKTPGVMDAFLVLHQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRLLYTDFRQRYRILNPSAIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 CIVPNENKTPGVMDAFLVLHQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRLLYTDFRQRYRILNPSAIP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 DDTFMDSRKATEKLLGSLDLDHTQYQFGHTKVFFKAGLLGVLEELRDQRLAKVLTLLQAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DDTFMDSRKATEKLLGSLDLDHTQYQFGHTKVFFKAGLLGVLEELRDQRLAKVLTLLQAR
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850 860 870 880 890 900
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SRGRLMRLEYQRLLGGRDALFTIQWNIRAFNAVKNWSWMKLFFKMKPLLRSAQAEEELAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LRAELRGLRGALAAAEAKRQELEETHVSITQEKNDLALQLQAEQDNLADAEERCHLLIKS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KVQLEGKVKELSERLEDEEEVNADLAARRRKLEDECTELKKDIDDLELTLAKAEKEKQAT
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1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 ENKVKNLTEEMAALDESVARLTKEKKALQEAHQQALGDLQAEEDRVSALTKAKLRLEQQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ENKVKNLTEEMAALDESVARLTKEKKALQEAHQQALGDLQAEEDRVSALTKAKLRLEQQV
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pF1KA1 EDLECSLEQEKKLRMDTERAKRKLEGDLKLTQESVADAAQDKQQLEEKLKKKDSELSQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EDLECSLEQEKKLRMDTERAKRKLEGDLKLTQESVADAAQDKQQLEEKLKKKDSELSQLS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EAGGASAGQREGCRKREAELGRLRRELEEAALRHEATVAALRRKQAEGAAELGEQVDSLQ
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pF1KA1 RVRQKLEKEKSELRMEVDDLAANVETLTRAKASAEKLCRTYEDQLSEAKIKVEELQRQLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RVRQKLEKEKSELRMEVDDLAANVETLTRAKASAEKLCRTYEDQLSEAKIKVEELQRQLA
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pF1KA1 DASTQRGRLQTESGELSRLLEEKECLISQLSRGKALAAQSLEELRRQLEEESKAKSALAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA1 AVQALRHDCDLLREQHEEEAEAQAELQRLLSKANAEVAQWRSKYEADAIQRTEELEEAKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KLALRLQEAEEGVEAANAKCSSLEKAKLRLQTESEDVTLELERATSAAAALDKKQRHLER
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pF1KA1 ALEERRRQEEEMQRELEAAQRESRGLGTELFRLRHGHEEALEALETLKRENKNLQEEISD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ALEERRRQEEEMQRELEAAQRESRGLGTELFRLRHGHEEALEALETLKRENKNLQEEISD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LTDQVSLSGKSIQELEKTKKALEGEKSEIQAALEEAEGALELEETKTLRIQLELSQVKAE
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pF1KA1 VDRKLAEKDEECANLRRNHQRAVESLQASLDAETRARNEALRLKKKMEGDLNDLELQLGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VDRKLAEKDEECANLRRNHQRAVESLQASLDAETRARNEALRLKKKMEGDLNDLELQLGH
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pF1KA1 ATRQATEAQAATRLMQAQLKEEQAGRDEEQRLAAELHEQAQALERRASLLAAELEELRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ATRQATEAQAATRLMQAQLKEEQAGRDEEQRLAAELHEQAQALERRASLLAAELEELRAA
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pF1KA1 LEQGERSRRLAEQELLEATERLNLLHSQNTGLLNQKKKLEADLAQLSGEVEEAAQERREA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LEQGERSRRLAEQELLEATERLNLLHSQNTGLLNQKKKLEADLAQLSGEVEEAAQERREA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EEKAKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKTLEQTVRELQARLEEAEQAALRGGKKQ
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pF1KA1 VQKLEAKVRELEAELDAEQKKHAEALKGVRKHERRVKELAYQAEEDRKNLARMQDLVDKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VQKLEAKVRELEAELDAEQKKHAEALKGVRKHERRVKELAYQAEEDRKNLARMQDLVDKL
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pF1KA1 QSKVKSYKRQFEEAEQQANTNLAKYRKAQHELDDAEERADMAETQANKLRARTRDALGPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QSKVKSYKRQFEEAEQQANTNLAKYRKAQHELDDAEERADMAETQANKLRARTRDALGPK
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pF1KA1 HKE
:::
CCDS42 HKE
>>CCDS9600.1 MYH6 gene_id:4624|Hs108|chr14 (1939 aa)
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20 30 40 50 60 70
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CCDS96 EKVRKQLEVEKLELQSALEEAEASLEHEEGKILRAQLEFNQIKAEIERKLAEKDEEMEQA
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CCDS96 KRNHQRVVDSLQTSLDAETRSRNEVLRVKKKMEGDLNEMEIQLSHANRMAAEAQKQVKSL
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CCDS96 IETSERVQLLHSQNTSLINQKKKMESDLTQLQSEVEEAVQECRNAEEKAKKAITDAAMMA
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CCDS96 EELKKEQDTSAHLERMKKNMEQTIKDLQHRLDEAEQIALKGGKKQLQKLEARVRELEGEL
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CCDS96 EAEQKRNAESVKGMRKSERRIKELTYQTEEDKKNLLRLQDLVDKLQLKVKAYKRQAEEAE
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CCDS96 EQANTNLSKFRKVQHELDEAEERADIAESQVNKLRAKSRD-IGAKQKMHDEE
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CCDS96 MGDSEMAVFGAAAPYLRKSEKERLEAQTRPFDLK
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CCDS96 KDVFVPDDKQEFVKAKIVSRE-GGKVTAETEYGKTVTVKEDQVMQQNPPKFDKIEDMAML
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CCDS96 IFSISDNAYQYMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFAVIAAIGDR-SKKDQ---
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CCDS96 SPGKGTLEDQIIQANPALEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGATGKLASADIETYLLE
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CCDS96 KSRVIFQLKAERDYHIFYQILSNKKPELLDMLLITNNPYDYAFISQGETTVASIDDAEEL
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CCDS96 MATDNAFDVLGFTSEEKNSMYKLTGAIMHFGNMKFKLKQREEQAEPDGTEEADKSAYLMG
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CCDS96 FIDFGMDLQACIDLIEKPMGIMSILEEECMFPKATDMTFKAKLFDNHLGKSANFQKPR-N
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pF1KA1 KKRKYQAHFEVVHYAGVVPYSIVGWLEKNKDPLNETVVPIFQKSQNRLLATLYENYAGSC
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CCDS96 IKGKPEAHFSLIHYAGIVDYNIIGWLQKNKDPLNETVVGLYQKSSLKLLSTLFANYAGA-
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CCDS96 -DAPIEKG-KGKAKKGSSFQTVSALHRENLNKLMTNLRSTHPHFVRCIIPNETKSPGVMD
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CCDS96 MDLERAKRKLEGDLKLTQESIMDLENDKQQLDERLKKKDFELNALNARIEDEQALGSQLQ
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::.:::::: :::::::::::.:::.::: :.. .:::::.::::::::::.. : : .
CCDS96 KKLKELQARIEELEEELEAERTARAKVEKLRSDLSRELEEISERLEEAGGATSVQIEMNK
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KA1 KREAELGRLRRELEEAALRHEATVAALRRKQAEGAAELGEQVDSLQRVRQKLEKEKSELR
:::::. ..::.::::.:.::::.::::.:.:...::::::.:.::::.:::::::::..
CCDS96 KREAEFQKMRRDLEEATLQHEATAAALRKKHADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSEFK
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KA1 MEVDDLAANVETLTRAKASAEKLCRTYEDQLSEAKIKVEELQRQLADASTQRGRLQTESG
.:.::...:.: . .:::. ::.::: :::..: . :.:: ::.. : ..::..::::.:
CCDS96 LELDDVTSNMEQIIKAKANLEKMCRTLEDQMNEHRSKAEETQRSVNDLTSQRAKLQTENG
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KA1 ELSRLLEEKECLISQLSRGKALAAQSLEELRRQLEEESKAKSALAHAVQALRHDCDLLRE
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CCDS96 ELSRQLDEKEALISQLTRGKLTYTQQLEDLKRQLEEEVKAKNALAHALQSARHDCDLLRE
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KA1 QHEEEAEAQAELQRLLSKANAEVAQWRSKYEADAIQRTEELEEAKKKLALRLQEAEEGVE
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CCDS96 QYEEETEAKAELQRVLSKANSEVAQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQEAEEAVE
1350 1360 1370 1380 1390 1400
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pF1KA1 AANAKCSSLEKAKLRLQTESEDVTLELERATSAAAALDKKQRHLERALEERRRQEEEMQR
:.:::::::::.: :::.: ::. ...::...::::::::::.... : : ... :: :
CCDS96 AVNAKCSSLEKTKHRLQNEIEDLMVDVERSNAAAAALDKKQRNFDKILAEWKQKYEESQS
1410 1420 1430 1440 1450 1460
1520 1530 1540 1550 1560 1570
pF1KA1 ELEAAQRESRGLGTELFRLRHGHEEALEALETLKRENKNLQEEISDLTDQVSLSGKSIQE
:::..:.:.:.:.::::.:....::.:: :::.:::::::::::::::.:.. :::.:.:
CCDS96 ELESSQKEARSLSTELFKLKNAYEESLEHLETFKRENKNLQEEISDLTEQLGSSGKTIHE
1470 1480 1490 1500 1510 1520
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pF1KA1 LEKTKKALEGEKSEIQAALEEAEGALELEETKTLRIQLELSQVKAEVDRKLAEKDEECAN
:::..: ::.:: :.:.::::::..:: :: : :: :::..:.:::..::::::::: .
CCDS96 LEKVRKQLEAEKMELQSALEEAEASLEHEEGKILRAQLEFNQIKAEIERKLAEKDEEMEQ
1530 1540 1550 1560 1570 1580
1640 1650 1660 1670 1680 1690
pF1KA1 LRRNHQRAVESLQASLDAETRARNEALRLKKKMEGDLNDLELQLGHATRQATEAQAATRL
.::: :.:.:::.:::::::.::::::.:::::::::..:.::.::.:.:.::: ..
CCDS96 AKRNHLRVVDSLQTSLDAETRSRNEALRVKKKMEGDLNEMEIQLSHANRMAAEAQKQVKS
1590 1600 1610 1620 1630 1640
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pF1KA1 MQAQLKEEQAGRDEEQRLAAELHEQAQALERRASLLAAELEELRAALEQGERSRRLAEQE
.:. ::. : :. : .:.:. .::: .:: ::::::::..:: ::::.:::::
CCDS96 LQSLLKDTQIQLDDAVRANDDLKENIAIVERRNNLLQAELEELRAVVEQTERSRKLAEQE
1650 1660 1670 1680 1690 1700
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pF1KA1 LLEATERLNLLHSQNTGLLNQKKKLEADLAQLSGEVEEAAQERREAEEKAKKAITDAAMM
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CCDS96 LIETSERVQLLHSQNTSLINQKKKMDADLSQLQTEVEEAVQECRNAEEKAKKAITDAAMM
1710 1720 1730 1740 1750 1760
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pF1KA1 AEELKKEQDTSAHLERMKKTLEQTVRELQARLEEAEQAALRGGKKQVQKLEAKVRELEAE
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CCDS96 AEELKKEQDTSAHLERMKKNMEQTIKDLQHRLDEAEQIALKGGKKQLQKLEARVRELENE
1770 1780 1790 1800 1810 1820
1880 1890 1900 1910 1920 1930
pF1KA1 LDAEQKKHAEALKGVRKHERRVKELAYQAEEDRKNLARMQDLVDKLQSKVKSYKRQFEEA
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CCDS96 LEAEQKRNAESVKGMRKSERRIKELTYQTEEDRKNLLRLQDLVDKLQLKVKAYKRQAEEA
1830 1840 1850 1860 1870 1880
1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA1 EQQANTNLAKYRKAQHELDDAEERADMAETQANKLRARTRDALGPKHKE
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CCDS96 EEQANTNLSKFRKVQHELDEAEERADIAESQVNKLRAKSRD-IGTKGLNEE
1890 1900 1910 1920 1930
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20 30 40 50 60 70
pF1KA1 RGAECLLPWAALNLQGFQLLLLHPSATAMMDVSELGESARYLRQGYQEMTKVHTIPWDGK
... .::.: .::.. .: .... :.:.:
CCDS11 MSSDSELAVFGEAAPFLRKSERERIEAQNRPFDAK
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pF1KA1 KRVWVPDEQDAYVEAEVKSEATGGRVTVETKDQKVLMVREAELQPMNPPRFDLLEDMAMM
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CCDS11 TSVFVAEPKESFVKGTIQSRE-GGKVTVKTEGGATLTVKDDQVFPMNPPKYDKIEDMAMM
40 50 60 70 80 90
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pF1KA1 THLNEASVLHNLRQRYARWMIYTYSGLFCVTINPYKWLPVYTASVVAAYKGKRRSDSPPH
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CCDS11 THLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLPVYKPEVVTAYRGKKRQEAPPH
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CCDS11 IFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFATIAVTGE--KKKEEITS
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pF1KA1 TKTGGTLEDQIIEANPAMEAFGNAKTLRNDNSSRFGKFIRIHFGPSGKLASADIDSYLLE
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CCDS11 GKIQGTLEDQIISANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGTTGKLASADIETYLLE
220 230 240 250 260 270
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pF1KA1 KSRVIFQLPGERSYHVYYQILSGRKPELQDMLLLSMNPYDYHFCSQGVITVDNMNDGEEL
::::.::: .:::::..::: :..:::: .:::.. ::::: : ::: :.: ...: :::
CCDS11 KSRVVFQLKAERSYHIFYQITSNKKPELIEMLLITTNPYDYPFVSQGEISVASIDDQEEL
280 290 300 310 320 330
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pF1KA1 IATDHAMDILGFSVDEKCACYKIVGALLHFGNMKFKQKQREEQAEADGTESADKAAYLMG
.::: :.:::::. .:: . ::..::..:.::.:::::::::::: :::: :::::::..
CCDS11 MATDSAIDILGFTNEEKVSIYKLTGAVMHYGNLKFKQKQREEQAEPDGTEVADKAAYLQS
340 350 360 370 380 390
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pF1KA1 VSSGDLLKGLLHPRVRVGNEYVTKGQSVEQVVFAVGALAKATYDRLFRWLVSRINQTLDT
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CCDS11 LNSADLLKALCYPRVKVGNEYVTKGQTVEQVSNAVGALAKAVYEKMFLWMVARINQQLDT
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pF1KA1 KLPRQFFIGVLDIAGFEIFEFNSFEQLCINFTNEKLQQFFNQHMFVLEQEEYKREGIDWV
: :::.:::::::::::::.:::.:::::::::::::::::.:::::::::::.:::.:.
CCDS11 KQPRQYFIGVLDIAGFEIFDFNSLEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWT
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pF1KA1 FIDFGLDLQPCIDLIEKPLGILSILEEECMFPKASDASFRAKLYDNHAGKSPNFQQPRPD
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CCDS11 FIDFGMDLAACIELIEKPMGIFSILEEECMFPKATDTSFKNKLYDQHLGKSANFQKPKVV
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pF1KA1 KKRKYQAHFEVVHYAGVVPYSIVGWLEKNKDPLNETVVPIFQKSQNRLLATLYENYAGSC
: : .::: ..:::::: :.:.::::::::::::::: ..::: . :: :. . : .
CCDS11 KG-KAEAHFALIHYAGVVDYNITGWLEKNKDPLNETVVGLYQKSAMKTLAQLFSG-AQTA
580 590 600 610 620 630
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pF1KA1 STEPPKSGVKEK-RKKAASFQTVSQLHKENLNKLMTNLRATQPHFVRCIVPNENKTPGVM
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CCDS11 EGEGAGGGAKKGGKKKGSSFQTVSALFRENLNKLMTNLRSTHPHFVRCIIPNETKTPGAM
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pF1KA1 DAFLVLHQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRLLYTDFRQRYRILNPSAIPDDTFMDSRKATEK
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CCDS11 EHELVLHQLRCNGVLEGIRICRKGFPSRILYADFKQRYKVLNASAIPEGQFIDSKKASEK
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CCDS11 LLASIDIDHTQYKFGHTKVFFKAGLLGLLEEMRDDKLAQLITRTQARCRGFLARVEYQRM
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CCDS11 VERREAIFCIQYNIRSFMNVKHWPWMKLFFKIKPLLKSAETEKEMATMKEEFQKIKDELA
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pF1KA1 AAEAKRQELEETHVSITQEKNDLALQLQAEQDNLADAEERCHLLIKSKVQLEGKVKELSE
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CCDS11 KSEAKRKELEEKMVTLLKEKNDLQLQVQAEAEGLADAEERCDQLIKTKIQLEAKIKEVTE
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: :::::.::.:.:..:::::::.:::::::::::::::.::::.::::::::::::::.
CCDS11 RAEDEEEINAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHATENKVKNLTEEMAG
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:::..:.::::::::::::::.: :::::::.:..:::::..:::::.::: ::::::::
CCDS11 LDETIAKLTKEKKALQEAHQQTLDDLQAEEDKVNTLTKAKIKLEQQVDDLEGSLEQEKKL
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::: :::::::::::::.:::. : ..::::.::::::. :.:.:. ..:::: :: :.
CCDS11 RMDLERAKRKLEGDLKLAQESIMDIENEKQQLDEKLKKKEFEISNLQSKIEDEQALGIQL
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CCDS11 QKKIKELQARIEELEEEIEAERASRAKAEKQRSDLSRELEEISERLEEAGGATSAQIEMN
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CCDS11 KMEIDDLASNVETVSKAKGNLEKMCRTLEDQLSELKSKEEEQQRLINDLTAQRGRLQTES
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CCDS11 GEFSRQLDEKEALVSQLSRGKQAFTQQIEELKRQLEEEIKAKNALAHALQSSRHDCDLLR
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CCDS11 EQYEEEQESKAELQRALSKANTEVAQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQAAEEHV
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CCDS11 EAVNAKCASLEKTKQRLQNEVEDLMLDVERTNAACAALDKKQRNFDKILAEWKQKCEETH
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CCDS11 AELEASQKEARSLGTELFKIKNAYEESLDQLETLKRENKNLQQEISDLTEQIAEGGKRIH
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CCDS11 ELEKIKKQVEQEKCELQAALEEAEASLEHEEGKILRIQLELNQVKSEVDRKIAEKDEEID
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CCDS11 QLKRNHIRIVESMQSTLDAEIRSRNDAIRLKKKMEGDLNEMEIQLNHANRMAAEALRNYR
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CCDS11 NTQGILKDTQIHLDDALRSQEDLKEQLAMVERRANLLQAEIEELRATLEQTERSRKIAEQ
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CCDS11 ELLDASERVQLLHTQNTSLINTKKKLETDISQMQGEMEDILQEARNAEEKAKKAITDAAM
1720 1730 1740 1750 1760 1770
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CCDS11 MAEELKKEQDTSAHLERMKKNMEQTVKDLQLRLDEAEQLALKGGKKQIQKLEARVRELEG
1780 1790 1800 1810 1820 1830
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pF1KA1 ELDAEQKKHAEALKGVRKHERRVKELAYQAEEDRKNLARMQDLVDKLQSKVKSYKRQFEE
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CCDS11 EVESEQKRNAEAVKGLRKHERRVKELTYQTEEDRKNILRLQDLVDKLQAKVKSYKRQAEE
1840 1850 1860 1870 1880 1890
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CCDS11 AEEQSNTNLAKFRKLQHELEEAEERADIAESQVNKLRVKSREVHTKVISEE
1900 1910 1920 1930 1940
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Smith-Waterman score: 8607; 67.5% identity (89.1% similar) in 1928 aa overlap (49-1975:10-1930)
20 30 40 50 60 70
pF1KA1 CLLPWAALNLQGFQLLLLHPSATAMMDVSELGESARYLRQGYQEMTKVHTIPWDGKKRVW
.::.: .::.. .: .... :.:.: :.
CCDS11 MSSDSEMAIFGEAAPFLRKSERERIEAQNKPFDAKTSVF
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pF1KA1 VPDEQDAYVEAEVKSEATGGRVTVETKDQKVLMVREAELQPMNPPRFDLLEDMAMMTHLN
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CCDS11 VVDPKESFVKATVQSRE-GGKVTAKTEAGATVTVKDDQVFPMNPPKYDKIEDMAMMTHLH
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pF1KA1 EASVLHNLRQRYARWMIYTYSGLFCVTINPYKWLPVYTASVVAAYKGKRRSDSPPHIYAV
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CCDS11 EPAVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLPVYNAEVVTAYRGKKRQEAPPHIFSI
100 110 120 130 140 150
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pF1KA1 ADNAYNDMLRNRDNQSMLITGESGAGKTVNTKRVIQYFAIVAALGDGPGKKAQFLATKTG
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CCDS11 SDNAYQFMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFATIAVTGE--KKKEEVTSGKMQ
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CCDS11 EEEINAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHATENKVKNLTEEMAGLDET
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CCDS11 IAKLTKEKKALQEAHQQTLDDLQAEEDKVNTLTKAKIKLEQQVDDLEGSLEQEKKIRMDL
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CCDS11 AEFQKMRRDLEEATLQHEATAATLRKKHADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSEMKMEI
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CCDS11 DDLASNMETVSKAKGNLEKMCRALEDQLSEIKTKEEEQQRLINDLTAQRARLQTESGEYS
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CCDS11 RQLDEKDTLVSQLSRGKQAFTQQIEELKRQLEEEIKAKSALAHALQSSRHDCDLLREQYE
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CCDS11 EEQEAKAELQRAMSKANSEVAQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQDAEEHVEAVN
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CCDS11 AKCASLEKTKQRLQNEVEDLMIDVERTNAACAALDKKQRNFDKILAEWKQKCEETHAELE
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CCDS11 ASQKESRSLSTELFKIKNAYEESLDQLETLKRENKNLQQEISDLTEQIAEGGKRIHELEK
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CCDS11 IKKQVEQEKSELQAALEEAEASLEHEEGKILRIQLELNQVKSEVDRKIAEKDEEIDQMKR
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CCDS11 ILKDTQLHLDDALRSQEDLKEQLAMVERRANLLQAEIEELRATLEQTERSRKIAEQELLD
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CCDS11 LKKEQDTSAHLERMKKNLEQTVKDLQHRLDEAEQLALKGGKKQIQKLEARVRELEGEVES
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CCDS11 EQKRNVEAVKGLRKHERKVKELTYQTEEDRKNILRLQDLVDKLQAKVKSYKRQAEEAEEQ
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CCDS11 SNVNLSKFRRIQHELEEAEERADIAESQVNKLRVKSREVHTKIISEE
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CCDS11 GTLEDQIISANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGATGKLASADIETYLLEKSRV
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CCDS11 SAVDILGFTADEKVAIYKLTGAVMHYGNMKFKQKQREEQAEPDGTEVADKAAYLTSLNSA
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CCDS11 AEFQKMRRDLEESTLQHEATAAALRKKHADSVAELGEQIDSLQRVKQKLEKEKSELKMEI
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CCDS11 RQLDEKDAMVSQLSRGKQAFTQQIEELKRQLEEETKAKSTLAHALQSARHDCDLLREQYE
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KA1 EEAEAQAELQRLLSKANAEVAQWRSKYEADAIQRTEELEEAKKKLALRLQEAEEGVEAAN
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CCDS11 EEQEAKAELQRGMSKANSEVAQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQDAEEHVEAVN
1360 1370 1380 1390 1400 1410
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pF1KA1 AKCSSLEKAKLRLQTESEDVTLELERATSAAAALDKKQRHLERALEERRRQEEEMQRELE
.::.::::.: :::.: ::. ...::...: :::::::.....: : ... :: : :::
CCDS11 SKCASLEKTKQRLQNEVEDLMIDVERSNAACIALDKKQRNFDKVLAEWKQKYEETQAELE
1420 1430 1440 1450 1460 1470
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pF1KA1 AAQRESRGLGTELFRLRHGHEEALEALETLKRENKNLQEEISDLTDQVSLSGKSIQELEK
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CCDS11 ASQKESRSLSTELFKVKNAYEESLDHLETLKRENKNLQQEISDLTEQIAEGGKHIHELEK
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1580 1590 1600 1610 1620 1630
pF1KA1 TKKALEGEKSEIQAALEEAEGALELEETKTLRIQLELSQVKAEVDRKLAEKDEECANLRR
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CCDS11 VKKQLDHEKSELQTSLEEAEASLEHEEGKILRIQLELNQVKSEIDRKIAEKDEELDQLKR
1540 1550 1560 1570 1580 1590
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pF1KA1 NHQRAVESLQASLDAETRARNEALRLKKKMEGDLNDLELQLGHATRQATEAQAATRLMQA
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CCDS11 NHLRVVESMQSTLDAEIRSRNDALRIKKKMEGDLNEMEIQLNHANRQAAEALRNLRNTQG
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pF1KA1 QLKEEQAGRDEEQRLAAELHEQAQALERRASLLAAELEELRAALEQGERSRRLAEQELLE
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CCDS11 ILKDTQLHLDDAIRGQDDLKEQLAMVERRANLMQAEVEELRASLERTERGRKMAEQELLD
1660 1670 1680 1690 1700 1710
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pF1KA1 ATERLNLLHSQNTGLLNQKKKLEADLAQLSGEVEEAAQERREAEEKAKKAITDAAMMAEE
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CCDS11 ASERVQLLHTQNTSLINTKKKLETDISQIQGEMEDIVQEARNAEEKAKKAITDAAMMAEE
1720 1730 1740 1750 1760 1770
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pF1KA1 LKKEQDTSAHLERMKKTLEQTVRELQARLEEAEQAALRGGKKQVQKLEAKVRELEAELDA
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CCDS11 LKKEQDTSAHLERMKKNMEQTVKDLQLRLDEAEQLALKGGKKQIQKLEARVRELESEVES
1780 1790 1800 1810 1820 1830
1880 1890 1900 1910 1920 1930
pF1KA1 EQKKHAEALKGVRKHERRVKELAYQAEEDRKNLARMQDLVDKLQSKVKSYKRQFEEAEQQ
:::...::.::.::::::::::.::.::::::. :.::::::::.:::.:::: ::::.:
CCDS11 EQKHNVEAVKGLRKHERRVKELTYQTEEDRKNILRLQDLVDKLQTKVKAYKRQAEEAEEQ
1840 1850 1860 1870 1880 1890
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pF1KA1 ANTNLAKYRKAQHELDDAEERADMAETQANKLRARTRDALGPKHKE
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CCDS11 SNVNLAKFRKLQHELEEAKERADIAESQVNKLRVKSREVHTKVISEE
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>>CCDS11157.1 MYH3 gene_id:4621|Hs108|chr17 (1940 aa)
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CCDS11 MSSDTEMEV--FGIAAPFLRKSEKERIEAQN
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pF1KA1 IPWDGKKRVWVPDEQDAYVEAEVKSEATGGRVTVETKDQKVLMVREAELQPMNPPRFDLL
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CCDS11 QPFDAKTYCFVVDSKEEYAKGKIKS-SQDGKVTVETEDNRTLVVKPEDVYAMNPPKFDRI
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CCDS11 EDMAMLTHLNEPAVLYNLKDRYTSWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLPVYNPEVVEGYRGKKR
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...::::....::::. :: .:.:::.:::::::::::::::::::::: .:: :: :
CCDS11 QEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFATIAATGDLAKK
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CCDS11 KD----SKMKGTLEDQIISANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGTTGKLASADI
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pF1KA1 DSYLLEKSRVIFQLPGERSYHVYYQILSGRKPELQDMLLLSMNPYDYHFCSQGVITVDNM
..:::::::: ::: .:::::..:::::..:::: ..::.. ::::: : ::: : : ..
CCDS11 ETYLLEKSRVTFQLKAERSYHIFYQILSNKKPELIELLLITTNPYDYPFISQGEILVASI
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pF1KA1 NDGEELIATDHAMDILGFSVDEKCACYKIVGALLHFGNMKFKQKQREEQAEADGTESADK
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CCDS11 DDAEELLATDSAIDILGFTPEEKSGLYKLTGAVMHYGNMKFKQKQREEQAEPDGTEVADK
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pF1KA1 AAYLMGVSSGDLLKGLLHPRVRVGNEYVTKGQSVEQVVFAVGALAKATYDRLFRWLVSRI
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CCDS11 TAYLMGLNSSDLLKALCFPRVKVGNEYVTKGQTVDQVHHAVNALSKSVYEKLFLWMVTRI
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pF1KA1 NQTLDTKLPRQFFIGVLDIAGFEIFEFNSFEQLCINFTNEKLQQFFNQHMFVLEQEEYKR
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CCDS11 NQQLDTKLPRQHFIGVLDIAGFEIFEYNSLEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKK
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pF1KA1 EGIDWVFIDFGLDLQPCIDLIEKPLGILSILEEECMFPKASDASFRAKLYDNHAGKSPNF
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CCDS11 EGIEWTFIDFGMDLAACIELIEKPMGIFSILEEECMFPKATDTSFKNKLYDQHLGKSNNF
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CCDS11 QKPKVVKGRA-EAHFSLIHYAGTVDYSVSGWLEKNKDPLNETVVGLYQKSSNRLLAHLYA
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pF1KA1 NYAGSCSTEPPKSGVKE-KRKKAASFQTVSQLHKENLNKLMTNLRATQPHFVRCIVPNEN
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CCDS11 TFA----TADADSGKKKVAKKKGSSFQTVSALFRENLNKLMSNLRTTHPHFVRCIIPNET
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pF1KA1 KTPGVMDAFLVLHQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRLLYTDFRQRYRILNPSAIPDDTFMDS
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CCDS11 KTPGAMEHSLVLHQLRCNGVLEGIRICRKGFPNRILYGDFKQRYRVLNASAIPEGQFIDS
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pF1KA1 RKATEKLLGSLDLDHTQYQFGHTKVFFKAGLLGVLEELRDQRLAKVLTLLQARSRGRLMR
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CCDS11 KKACEKLLASIDIDHTQYKFGHTKVFFKAGLLGTLEEMRDDRLAKLITRTQAVCRGFLMR
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CCDS11 VEFQKMVQRRESIFCIQYNIRSFMNVKHWPWMKLFFKIKPLLKSAETEKEMATMKEEFQK
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pF1KA1 LRGALAAAEAKRQELEETHVSITQEKNDLALQLQAEQDNLADAEERCHLLIKSKVQLEGK
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CCDS11 TKDELAKSEAKRKELEEKLVTLVQEKNDLQLQVQAESENLLDAEERCDQLIKAKFQLEAK
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CCDS11 IKEVTERAEDEEEINAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHATENKVKNL
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CCDS11 TEELSGLDETIAKLTREKKALQEAHQQALDDLQAEEDKVNSLNKTKSKLEQQVEDLESSL
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:::::::.: :: ::::::::::.:::. : .:::::.:.::::: : ::. .:::::
CCDS11 EQEKKLRVDLERNKRKLEGDLKLAQESILDLENDKQQLDERLKKKDFEYCQLQSKVEDEQ
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:: :.:::::::::: ::::::.:::::.::..::::.. ::::::::::::::::...
CCDS11 TLGLQFQKKIKELQARIEELEEEIEAERATRAKTEKQRSDYARELEELSERLEEAGGVTS
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CCDS11 TQIELNKKREAEFLKLRRDLEEATLQHEAMVAALRKKHADSVAELGEQIDNLQRVKQKLE
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pF1KA1 KEKSELRMEVDDLAANVETLTRAKASAEKLCRTYEDQLSEAKIKVEELQRQLADASTQRG
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CCDS11 KEKSEFKLEIDDLSSSMESVSKSKANLEKICRTLEDQLSEARGKNEEIQRSLSELTTQKS
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CCDS11 RLQTEAGELSRQLEEKESIVSQLSRSKQAFTQQTEELKRQLEEENKAKNALAHALQSSRH
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CCDS11 DCDLLREQYEEEQEGKAELQRALSKANSEVAQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQ
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CCDS11 DSEEQVEAVNAKCASLEKTKQRLQGEVEDLMVDVERANSLAAALDKKQRNFDKVLAEWKT
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CCDS11 KCEESQAELEASLKESRSLSTELFKLKNAYEEALDQLETVKRENKNLEQEIADLTEQIAE
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CCDS11 NGKTIHELEKSRKQIELEKADIQLALEEAEAALEHEEAKILRIQLELTQVKSEIDRKIAE
1520 1530 1540 1550 1560 1570
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:::: .:.::.::.::..:..::::.:.::::.:::::::::::..:.::.::.:::.:
CCDS11 KDEEIEQLKRNYQRTVETMQSALDAEVRSRNEAIRLKKKMEGDLNEIEIQLSHANRQAAE
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CCDS11 TLKHLRSVQGQLKDTQLHLDDALRGQEDLKEQLAIVERRANLLQAEVEELRATLEQTERA
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CCDS11 RKLAEQELLDSNERVQLLHTQNTSLIHTKKKLETDLMQLQSEVEDASRDARNAEEKAKKA
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pF1KA1 ITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKTLEQTVRELQARLEEAEQAALRGGKKQVQKLEAK
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CCDS11 ITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNLEQTVKDLQHRLDEAEQLALKGGKKQIQKLETR
1760 1770 1780 1790 1800 1810
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pF1KA1 VRELEAELDAEQKKHAEALKGVRKHERRVKELAYQAEEDRKNLARMQDLVDKLQSKVKSY
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CCDS11 IRELEFELEGEQKKNTESVKGLRKYERRVKELTYQSEEDRKNVLRLQDLVDKLQVKVKSY
1820 1830 1840 1850 1860 1870
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA1 KRQFEEAEQQANTNLAKYRKAQHELDDAEERADMAETQANKLRARTRDALGPKHKE
::: :::..:::..:.:.:::::::..::::::.::.:.:::::.:::
CCDS11 KRQAEEADEQANAHLTKFRKAQHELEEAEERADIAESQVNKLRAKTRDFTSSRMVVHESE
1880 1890 1900 1910 1920 1930
CCDS11 E
1940
>>CCDS11153.1 MYH8 gene_id:4626|Hs108|chr17 (1937 aa)
initn: 8863 init1: 5716 opt: 8461 Z-score: 3332.7 bits: 630.1 E(32554): 2.6e-179
Smith-Waterman score: 8562; 67.4% identity (88.6% similar) in 1937 aa overlap (39-1975:2-1929)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 RASCPHRGAECLLPWAALNLQGFQLLLLHPSATAMMDVSELGESARYLRQGYQEMTKVHT
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CCDS11 MSASSDAEMAVFGEAAPYLRKSEKERIEAQN
10 20 30
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pF1KA1 IPWDGKKRVWVPDEQDAYVEAEVKSEATGGRVTVETKDQKVLMVREAELQPMNPPRFDLL
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CCDS11 KPFDAKTSVFVAEPKESYVKSTIQSKE-GGKVTVKTEGGATLTVREDQVFPMNPPKYDKI
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pF1KA1 EDMAMMTHLNEASVLHNLRQRYARWMIYTYSGLFCVTINPYKWLPVYTASVVAAYKGKRR
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CCDS11 EDMAMMTHLHEPGVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLPVYKPEVVAAYRGKKR
100 110 120 130 140 150
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pF1KA1 SDSPPHIYAVADNAYNDMLRNRDNQSMLITGESGAGKTVNTKRVIQYFAIVAALGDGPGK
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CCDS11 QEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFATIAVTGEK--K
160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 KAQFLATKTGGTLEDQIIEANPAMEAFGNAKTLRNDNSSRFGKFIRIHFGPSGKLASADI
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CCDS11 KDE--SGKMQGTLEDQIISANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGTTGKLASADI
210 220 230 240 250 260
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pF1KA1 DSYLLEKSRVIFQLPGERSYHVYYQILSGRKPELQDMLLLSMNPYDYHFCSQGVITVDNM
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CCDS11 ETYLLEKSRVTFQLKAERSYHIFYQITSNKKPDLIEMLLITTNPYDYAFVSQGEITVPSI
270 280 290 300 310 320
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pF1KA1 NDGEELIATDHAMDILGFSVDEKCACYKIVGALLHFGNMKFKQKQREEQAEADGTESADK
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CCDS11 DDQEELMATDSAIDILGFTPEEKVSIYKLTGAVMHYGNMKFKQKQREEQAEPDGTEVADK
330 340 350 360 370 380
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pF1KA1 AAYLMGVSSGDLLKGLLHPRVRVGNEYVTKGQSVEQVVFAVGALAKATYDRLFRWLVSRI
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::::: .:.:: :::.:.::. :::: :.::.:::::::::::::..:.::::..:: .
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]