FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1512, 1983 aa 1>>>pF1KA1512 1983 - 1983 aa - 1983 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 20.7550+/-0.000775; mu= -53.5206+/- 0.048 mean_var=839.1119+/-174.991, 0's: 0 Z-trim(114.7): 721 B-trim: 0 in 0/55 Lambda= 0.044276 statistics sampled from 23939 (24621) to 23939 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.289), width: 16 Scan time: 22.100 The best scores are: opt bits E(85289) NP_065935 (OMIM: 609928) myosin-7B [Homo sapiens] (1983) 12619 823.9 0 XP_006723903 (OMIM: 609928) PREDICTED: myosin-7B i (1989) 12597 822.5 0 XP_011527243 (OMIM: 609928) PREDICTED: myosin-7B i (1997) 10068 661.0 3.6e-188 XP_016883475 (OMIM: 609928) PREDICTED: myosin-7B i (2003) 8806 580.4 6.6e-164 XP_011527250 (OMIM: 609928) PREDICTED: myosin-7B i (1738) 8784 579.0 1.5e-163 XP_011527249 (OMIM: 609928) PREDICTED: myosin-7B i (1738) 8784 579.0 1.5e-163 XP_016883476 (OMIM: 609928) PREDICTED: myosin-7B i (1807) 8784 579.0 1.6e-163 NP_002462 (OMIM: 160710,192600,613251,613252,61408 (1939) 8781 578.8 1.9e-163 NP_000248 (OMIM: 160500,160760,181430,192600,25516 (1935) 8760 577.4 4.9e-163 XP_016876829 (OMIM: 160500,160760,181430,192600,25 (1935) 8760 577.4 4.9e-163 NP_001093582 (OMIM: 160740,605637) myosin-2 [Homo (1941) 8629 569.1 1.6e-160 NP_060004 (OMIM: 160740,605637) myosin-2 [Homo sap (1941) 8629 569.1 1.6e-160 XP_016880164 (OMIM: 160730) PREDICTED: myosin-1 is (1939) 8607 567.7 4.3e-160 NP_005954 (OMIM: 160730) myosin-1 [Homo sapiens] (1939) 8607 567.7 4.3e-160 XP_016880165 (OMIM: 160742) PREDICTED: myosin-4 is (1939) 8533 562.9 1.1e-158 NP_060003 (OMIM: 160742) myosin-4 [Homo sapiens] (1939) 8533 562.9 1.1e-158 XP_011522172 (OMIM: 160720,178110,193700,601680) P (1940) 8481 559.6 1.1e-157 XP_011522173 (OMIM: 160720,178110,193700,601680) P (1940) 8481 559.6 1.1e-157 NP_002461 (OMIM: 160720,178110,193700,601680) myos (1940) 8481 559.6 1.1e-157 NP_002463 (OMIM: 158300,160741,608837) myosin-8 [H (1937) 8461 558.3 2.7e-157 NP_003793 (OMIM: 603487) myosin-13 [Homo sapiens] (1938) 8432 556.5 9.9e-157 XP_011510861 (OMIM: 609929) PREDICTED: myosin-15 i (1946) 6862 456.2 1.5e-126 NP_055796 (OMIM: 609929) myosin-15 precursor [Homo (1946) 6862 456.2 1.5e-126 XP_016861411 (OMIM: 609929) PREDICTED: myosin-15 i (1599) 6279 418.9 2.1e-115 NP_074035 (OMIM: 132900,160745) myosin-11 isoform (1938) 4667 316.0 2.5e-84 XP_016878739 (OMIM: 132900,160745) PREDICTED: myos (1945) 4661 315.6 3.2e-84 NP_001035202 (OMIM: 132900,160745) myosin-11 isofo (1945) 4661 315.6 3.2e-84 XP_011520804 (OMIM: 132900,160745) PREDICTED: myos (1929) 4660 315.5 3.4e-84 NP_002465 (OMIM: 132900,160745) myosin-11 isoform (1972) 4660 315.5 3.4e-84 NP_001035203 (OMIM: 132900,160745) myosin-11 isofo (1979) 4654 315.2 4.5e-84 NP_005955 (OMIM: 160776) myosin-10 isoform 2 [Homo (1976) 4642 314.4 7.6e-84 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 AQDKQQLEEKLKKKDSELSQLSLRVEDEQLLGAQMQKKIKELQARAEELEEELEAERAAR 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KA1 ARVEKQRAEAARELEELSERLEEAGGASAGQREGCRKREAELGRLRRELEEAALRHEATV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 ARVEKQRAEAARELEELSERLEEAGGASAGQREGCRKREAELGRLRRELEEAALRHEATV 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KA1 AALRRKQAEGAAELGEQVDSLQRVRQKLEKEKSELRMEVDDLAANVETLTRAKASAEKLC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 AALRRKQAEGAAELGEQVDSLQRVRQKLEKEKSELRMEVDDLAANVETLTRAKASAEKLC 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KA1 RTYEDQLSEAKIKVEELQRQLADASTQRGRLQTESGELSRLLEEKECLISQLSRGKALAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 RTYEDQLSEAKIKVEELQRQLADASTQRGRLQTESGELSRLLEEKECLISQLSRGKALAA 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KA1 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