FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1516, 2302 aa 1>>>pF1KA1516 2302 - 2302 aa - 2302 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4127+/-0.00119; mu= 15.3863+/- 0.072 mean_var=114.9178+/-22.765, 0's: 0 Z-trim(105.0): 66 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.119641 statistics sampled from 8143 (8200) to 8143 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.591), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16 Scan time: 8.190 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS41552.1 PLCE1 gene_id:51196|Hs108|chr10 (2302) 15294 2652.4 0 CCDS53555.1 PLCE1 gene_id:51196|Hs108|chr10 (1994) 12583 2184.5 0 CCDS54447.1 PLCB4 gene_id:5332|Hs108|chr20 (1187) 680 129.9 7.2e-29 CCDS13105.1 PLCB4 gene_id:5332|Hs108|chr20 (1175) 670 128.1 2.4e-28 CCDS13104.1 PLCB4 gene_id:5332|Hs108|chr20 (1194) 670 128.1 2.4e-28 CCDS13314.1 PLCG1 gene_id:5335|Hs108|chr20 (1290) 660 126.4 8.5e-28 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CCDS54 CRYLMSDEN-APVFLDRLELYQEMDHPLAHYFISSSHNTYLTGRQFGGKSSVEMYRQVLL 300 310 320 330 340 350 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KA1 QGCRSVELDCWDG--DDGMPIIYHGHTLTTKIPFKEVVEAIDRSAFINSDLPIIISIENH ::: :::::::: .: ::: ::... : : ::.:..:: ..::..:. :.:.:.::: CCDS54 AGCRCVELDCWDGKGEDQEPIITHGKAMCTDILFKDVIQAIKETAFVTSEYPVILSFENH 360 370 380 390 400 410 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KA1 CSLPQQRKMAEIFKTVFGEKLVTKFLFETDFSDDPMLPSPDQLRKKVLLKNKKLKAHQTP :: :: ::.. . .::. :. . : . ::::..:..:.:.:::.:: : CCDS54 CSKYQQYKMSKYCEDLFGDLLLKQALESHPLEPGRALPSPNDLKRKILIKNKRLK----P 420 430 440 450 460 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KA1 VDILKQKAHQLASMQVQAYNGGNANPRPANNEEEEDEEDEYDYDYESLSDDNILEDRPEN .. :.. . : :: ..: : .:.: :: :...::. . : : : .:: CCDS54 -EVEKKQLEALRSM-MEA--GESASP--ANILEDDNEEEIESADQEE-------EAHPEF 470 480 490 500 510 1610 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KA1 KSCND--KLQFEYNEEIPKRIKKADNS---ACNKGKVYDMELGEEFYLDQNKK--ESRQI : :. .. ..: . . .:::... :: . .: :. .. . : . .: CCDS54 KFGNELSADDLGHKEAVANSVKKASDDLEHENNKKGLVTVE-DEQAWMASYKYVGATTNI 520 530 540 550 560 570 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KA1 APELSDLVIYCQAVKFPGLSTLNASGSSRGKERKSRKSIFGNNPGRMSPGETASFNKTSG : :: .. : : ::: :. . ..:: .: : :: :::.. : CCDS54 HPYLSTMINYAQPVKFQGFHV--------AEER----NIHYN----MS-----SFNESVG 580 590 600 610 1730 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KA1 KSSCEGIRQTWEESSSPLNPTTSLSAIIRTPKCYHISSLNENAAKRLCRRYSQKLTQHTA :. . : . : .: : :: CCDS54 -----------------------LGYL----KTHAIEFVNYN--KR-------------- 620 1790 1800 1810 1820 1830 1840 pF1KA1 CQLLRTYPAATRIDSSNPNPLMFWLHGIQLVALNYQTDDLPLHLNAAMFEANGGCGYVLK :. : :: . :.:::: : .:: : :.:.::::: :: ..:: . :: ::.:::.:: CCDS54 -QMSRIYPKGGRVDSSNYMPQIFWNAGCQMVSLNYQTPDLAMQLNQGKFEYNGSCGYLLK 630 640 650 660 670 680 1850 1860 1870 1880 1890 1900 pF1KA1 PPVLWDKNCPMYQKFSPL-ERDLDSMDPAVYSLTIVSGQNVCPSNSMGSPCIEVDVLGMP : . . . :.:. : .:.. :. :. ..::: ....:. .:::. :.: CCDS54 PDFMRRPD----RTFDPFSETPVDGVIAATCSVQVISGQ-FLSDKKIGTY-VEVDMYGLP 690 700 710 720 730 740 1910 1920 1930 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: . : .:.. ::..:.: :::::::::.:. :.::::.: :::: CCDS13 CRYLMSDEN-APVFLDRLELYQEMDHPLAHYFISSSHNTYLTGRQFGGKSSVEMYRQVLL 300 310 320 330 340 350 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KA1 QGCRSVELDCWDG--DDGMPIIYHGHTLTTKIPFKEVVEAIDRSAFINSDLPIIISIENH ::: :::::::: .: ::: ::... : : ::.:..:: ..::..:. :.:.:.::: CCDS13 AGCRCVELDCWDGKGEDQEPIITHGKAMCTDILFKDVIQAIKETAFVTSEYPVILSFENH 360 370 380 390 400 410 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KA1 CSLPQQRKMAEIFKTVFGEKLVTKFLFETDFSDDPMLPSPDQLRKKVLLKNKKLKAHQTP :: :: ::.. . .::. :. . : . ::::..:..:.:.:::.:: : CCDS13 CSKYQQYKMSKYCEDLFGDLLLKQALESHPLEPGRALPSPNDLKRKILIKNKRLK----P 420 430 440 450 460 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KA1 VDILKQKAHQLASMQVQAYNGGNANPRPANNEEEEDEEDEYDYDYESLSDDNILEDRPEN .. :.. . : :: ..: : .:.: :: :...::. . : : : .:: CCDS13 -EVEKKQLEALRSM-MEA--GESASP--ANILEDDNEEEIESADQEE-------EAHPEF 470 480 490 500 510 1610 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KA1 KSCNDKLQFEYNEEIPKRIKKADNSACNKGKVYDMELGEEFYLDQNKK--ESRQIAPELS : :. . .. :.: .. .:: : .: :. .. . : . .: : :: CCDS13 KFGNELSADDLGH------KEAVANSVKKGLV-TVE-DEQAWMASYKYVGATTNIHPYLS 520 530 540 550 560 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KA1 DLVIYCQAVKFPGLSTLNASGSSRGKERKSRKSIFGNNPGRMSPGETASFNKTSGKSSCE .. : : ::: :. . ..:: .: : :: :::.. : CCDS13 TMINYAQPVKFQGFHV--------AEER----NIHYN----MS-----SFNESVG----- 570 580 590 600 1730 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KA1 GIRQTWEESSSPLNPTTSLSAIIRTPKCYHISSLNENAAKRLCRRYSQKLTQHTACQLLR :. . : . : .: : :: :. : CCDS13 ------------------LGYL----KTHAIEFVNYN--KR---------------QMSR 610 620 1790 1800 1810 1820 1830 1840 pF1KA1 TYPAATRIDSSNPNPLMFWLHGIQLVALNYQTDDLPLHLNAAMFEANGGCGYVLKPPVLW :: . :.:::: : .:: : :.:.::::: :: ..:: . :: ::.:::.::: . 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CCDS13 IYPKGGRVDSSNYMPQIFWNAGCQMVSLNYQTPDLAMQLNQGKFEYNGSCGYLLKPDFMR 630 640 650 660 670 680 1850 1860 1870 1880 1890 1900 pF1KA1 DKNCPMYQKFSPL-ERDLDSMDPAVYSLTIVSGQNVCPSNSMGSPCIEVDVLGMPLDSCH . . :.:. : .:.. :. :. ..::: ....:. .:::. :.: :. . CCDS13 RPD----RTFDPFSETPVDGVIAATCSVQVISGQ-FLSDKKIGTY-VEVDMYGLPTDTIR 690 700 710 720 730 1910 1920 1930 1940 1950 1960 pF1KA1 --FRTKPIHRNTLNPMWNEQ-FLFR-VHFEDLVFLRFAVVENNSSAVTAQRIIPLKALKR :::. . : :::..::. :.:: : . ::. ::.:: ..:.. . .:::.:: .:. CCDS13 KEFRTRMVMNNGLNPVYNEESFVFRKVILPDLAVLRIAVYDDNNKLI-GQRILPLDGLQA 740 750 760 770 780 790 1970 1980 1990 2000 2010 2020 pF1KA1 GYRHLQLRNLHNEVLEISSLFINSRRMEENSSGNTMSASSMFNTEERKCLQTHRVTVHGV ::::..::: :. : . ..: : CCDS13 GYRHISLRNEGNKPLSLPTIFCNIVLKTYVPDGFGDIVDALSDPKKFLSITEKRADQMRA 800 810 820 830 840 850 >>CCDS13314.1 PLCG1 gene_id:5335|Hs108|chr20 (1290 aa) initn: 960 init1: 540 opt: 660 Z-score: 612.5 bits: 126.4 E(32554): 8.5e-28 Smith-Waterman score: 690; 24.9% identity (47.5% similar) in 1092 aa overlap (1240-2008:162-1231) 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KA1 DSNMSFVEFVELFKSFSVRSRKDLKDLFDVYAVPCNRSGSESAPLYTNLTIDENTSDLQP :.: :: :: :. . : : CCDS13 MWIKGLTWLMEDTLQAPTPLQIERWLRKQFYSVDRNREDRISAKDLKNMLSQVNYR--VP 140 150 160 170 180 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KA1 DLDLLTRNVSDL---------GLFIK-SKQQLSDNQRQISDAIAAASIVTNGTGIESTSL .. .: . ..:: : : . .. . . :. .. . :: . : : CCDS13 NMRFLRERLTDLEQRSGDITYGQFAQLYRSLMYSAQKTMDLPFLEASTLRAGERPE---- 190 200 210 220 230 240 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KA1 GIFGVGILQLNDFLVNCQGEHCTYDEILSIIQKFEPS-----ISMCHQGLMSFEGFARFL . :.. ....::.. ::: . :.. .:.: : . .. . .. :. :: CCDS13 -LCRVSLPEFQQFLLDYQGELWAVDRLQ--VQEFMLSFLRDPLREIEEPYFFLDEFVTFL 250 260 270 280 290 300 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KA1 MDKENFASKNDESQENIKELQLPLSYYYIESSHNTYLTGHQLKGESSVELYSQVLLQGCR ..::: . ... . .. :::.:.: ::::::::: :...:::.: :.. : .::: CCDS13 FSKENSVWNSQLDAVCPDTMNNPLSHYWISSSHNTYLTGDQFSSESSLEAYARCLRMGCR 310 320 330 340 350 360 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KA1 SVELDCWDGDDGMPIIYHGHTLTTKIPFKEVVEAIDRSAFINSDLPIIISIENHCSLPQQ .::::::: ::::.::::::::::: :..:...: . ::. :. :.:.:::.:::. :: CCDS13 CIELDCWDGPDGMPVIYHGHTLTTKIKFSDVLHTIKEHAFVASEYPVILSIEDHCSIAQQ 370 380 390 400 410 420 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KA1 RKMAEIFKTVFGEKLVTKFLFETDFSDDPMLPSPDQLRKKVLLKNKKLKA----HQTPVD :.::. :: :.:. :.:: ...: : ::::.::..:.:.:.::: ...:.. 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CCDS46 KPPDSMFGDRGEIIDPFVEVEIIGLPVDCCKDQTRVVDDNGFNPVWEETLTFTVHMPEIA 750 760 770 780 790 800 1940 1950 1960 1970 1980 1990 pF1KA1 FLRFAVVENN--SSAVTAQRIIPLKALKRGYRHLQLRNLHNEVLEISSLFINSRRMEENS ..:: : ... . ..:: . ...: ::::. :..: CCDS46 LVRFLVWDHDPIGRDFVGQRTVTFSSLVPGYRHVYLEGLTEASIFVHITINEIYGKWSPL 810 820 830 840 850 860 2000 2010 2020 2030 2040 2050 pF1KA1 SGNTMSASSMFNTEERKCLQTHRVTVHGVPGPEPFTVFTINGGTKAKQLLQQILTNEQDI CCDS46 ILNPSYTILHFLGATKNRQLQGLKGLFNKNPRHSSSENNSHYVRKRSIGDRILRRTASAP 870 880 890 900 910 920 2302 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 11:09:19 2016 done: Thu Nov 3 11:09:20 2016 Total Scan time: 8.190 Total Display time: 1.150 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]