Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1533
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1533, 725 aa
1>>>pF1KA1533 725 - 725 aa - 725 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8629+/-0.000819; mu= 9.9678+/- 0.050
mean_var=149.6761+/-30.155, 0's: 0 Z-trim(113.1): 21 B-trim: 96 in 1/51
Lambda= 0.104833
statistics sampled from 13771 (13792) to 13771 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.747), E-opt: 0.2 (0.424), width: 16
Scan time: 3.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42546.1 GRAMD1A gene_id:57655|Hs108|chr19 ( 724) 4791 736.3 3.7e-212
CCDS46046.1 GRAMD1A gene_id:57655|Hs108|chr19 ( 713) 4732 727.4 1.8e-209
CCDS53720.1 GRAMD1B gene_id:57476|Hs108|chr11 ( 738) 1840 290.0 8.6e-78
CCDS66253.1 GRAMD1B gene_id:57476|Hs108|chr11 ( 745) 1775 280.2 7.9e-75
CCDS81640.1 GRAMD1B gene_id:57476|Hs108|chr11 ( 694) 1766 278.8 1.9e-74
CCDS66254.1 GRAMD1B gene_id:57476|Hs108|chr11 ( 698) 1766 278.8 1.9e-74
CCDS33826.1 GRAMD1C gene_id:54762|Hs108|chr3 ( 662) 747 124.7 4.6e-28
CCDS54625.1 GRAMD1C gene_id:54762|Hs108|chr3 ( 457) 692 116.3 1.1e-25
>>CCDS42546.1 GRAMD1A gene_id:57655|Hs108|chr19 (724 aa)
initn: 4110 init1: 4110 opt: 4791 Z-score: 3922.3 bits: 736.3 E(32554): 3.7e-212
Smith-Waterman score: 4791; 99.2% identity (99.4% similar) in 723 aa overlap (7-725:2-724)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAYVKAWSTTPHSGRSTPSSSPSLRKRLQLLPPSRPPPEPEPGTMVEKGSDSSSEKGGVP
..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MFDTTPHSGRSTPSSSPSLRKRLQLLPPSRPPPEPEPGTMVEKGSDSSSEKGGVP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 GTPSTQSLGSRNFIRNSKKMQSWYSMLSPTYKQRNEDFRKLFSKLPEAERLIVDYSCALQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GTPSTQSLGSRNFIRNSKKMQSWYSMLSPTYKQRNEDFRKLFSKLPEAERLIVDYSCALQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 REILLQGRLYLSENWICFYSNIFRWETTISIQLKEVTCLKKEKTAKLIPNAIQICTESEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 REILLQGRLYLSENWICFYSNIFRWETTISIQLKEVTCLKKEKTAKLIPNAIQICTESEK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 HFFTSFGARDRCFLLIFRLWQNALLEKTLSPRELWHLVHQCYGSELGLTSEDEDYVSPLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HFFTSFGARDRCFLLIFRLWQNALLEKTLSPRELWHLVHQCYGSELGLTSEDEDYVSPLQ
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 LNGLGTPKEVGDVIALSDITSSGAADRSQEPSPVGSRRGHVTPNLSRASSDADHGAEEDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LNGLGTPKEVGDVIALSDITSSGAADRSQEPSPVGSRRGHVTPNLSRASSDADHGAEEDK
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 EEQVDSQPDASSSQTVTPVAEPPSTEPTQPDGPTTLGPLDLLPSEELLTDTSNSSSSTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EEQVDSQPDASSSQTVTPVAEPPSTEPTQPDGPTTLGPLDLLPSEELLTDTSNSSSSTGE
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 EADLAALLPDLSGRLLINSVFHVGAERLQQMLFSDSPFLQGFLQQCKFTDVTLSPWSGDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EADLAALLPDLSGRLLINSVFHVGAERLQQMLFSDSPFLQGFLQQCKFTDVTLSPWSGDS
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 KCHQRRVLTYTIPISNPLGPKSASVVETQTLFRRGPQAGGCVVDSEVLTQGIPYQDYFYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KCHQRRVLTYTIPISNPLGPKSASVVETQTLFRRGPQAGGCVVDSEVLTQGIPYQDYFYT
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 AHRYCILGLARNKARLRVSSEIRYRKQPWSLVKSLIEKNSWSGIEDYFHHLERELAKAEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AHRYCILGLARNKARLRVSSEIRYRKQPWSLVKSLIEKNSWSGIEDYFHHLERELAKAEK
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LSLEEGGKDARGLLSGLRRRKRPLSWRAHGDGPQHPDPDPCARAGIHTSGSLSSRFSEPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSLEEGGKDARGLLSGLRRRKRPLSWRAHGDGPQHPDPDPCARAGIHTSGSLSSRFSEPS
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650
pF1KA1 VDQGPGAGIPSALVLISIV----LIILIALNVLLFYRLWSLERTAHTFESWHSLALAKGK
::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VDQGPGAGIPSALVLISIVICVSLIILIALNVLLFYRLWSLERTAHTFESWHSLALAKGK
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 FPQTATEWAEILALQKQFHSVEVHKWRQILRASVELLDEMKFSLEKLHQGITVSDPPFDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FPQTATEWAEILALQKQFHSVEVHKWRQILRASVELLDEMKFSLEKLHQGITVSDPPFDT
660 670 680 690 700 710
720
pF1KA1 QPRPDDSFS
:::::::::
CCDS42 QPRPDDSFS
720
>>CCDS46046.1 GRAMD1A gene_id:57655|Hs108|chr19 (713 aa)
initn: 4283 init1: 4283 opt: 4732 Z-score: 3874.2 bits: 727.4 E(32554): 1.8e-209
Smith-Waterman score: 4732; 98.7% identity (99.0% similar) in 719 aa overlap (7-725:2-713)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAYVKAWSTTPHSGRSTPSSSPSLRKRLQLLPPSRPPPEPEPGTMVEKGSDSSSEKGGVP
..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MFDTTPHSGRSTPSSSPSLRKRLQLLPPSRPPPEPEPGTMVEKGSDSSSEKGGVP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 GTPSTQSLGSRNFIRNSKKMQSWYSMLSPTYKQRNEDFRKLFSKLPEAERLIVDYSCALQ
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GTPSTQSLGSRNFIRNSK-------MLSPTYKQRNEDFRKLFSKLPEAERLIVDYSCALQ
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 REILLQGRLYLSENWICFYSNIFRWETTISIQLKEVTCLKKEKTAKLIPNAIQICTESEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 REILLQGRLYLSENWICFYSNIFRWETTISIQLKEVTCLKKEKTAKLIPNAIQICTESEK
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 HFFTSFGARDRCFLLIFRLWQNALLEKTLSPRELWHLVHQCYGSELGLTSEDEDYVSPLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HFFTSFGARDRCFLLIFRLWQNALLEKTLSPRELWHLVHQCYGSELGLTSEDEDYVSPLQ
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 LNGLGTPKEVGDVIALSDITSSGAADRSQEPSPVGSRRGHVTPNLSRASSDADHGAEEDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LNGLGTPKEVGDVIALSDITSSGAADRSQEPSPVGSRRGHVTPNLSRASSDADHGAEEDK
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 EEQVDSQPDASSSQTVTPVAEPPSTEPTQPDGPTTLGPLDLLPSEELLTDTSNSSSSTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EEQVDSQPDASSSQTVTPVAEPPSTEPTQPDGPTTLGPLDLLPSEELLTDTSNSSSSTGE
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 EADLAALLPDLSGRLLINSVFHVGAERLQQMLFSDSPFLQGFLQQCKFTDVTLSPWSGDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EADLAALLPDLSGRLLINSVFHVGAERLQQMLFSDSPFLQGFLQQCKFTDVTLSPWSGDS
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 KCHQRRVLTYTIPISNPLGPKSASVVETQTLFRRGPQAGGCVVDSEVLTQGIPYQDYFYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KCHQRRVLTYTIPISNPLGPKSASVVETQTLFRRGPQAGGCVVDSEVLTQGIPYQDYFYT
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 AHRYCILGLARNKARLRVSSEIRYRKQPWSLVKSLIEKNSWSGIEDYFHHLERELAKAEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AHRYCILGLARNKARLRVSSEIRYRKQPWSLVKSLIEKNSWSGIEDYFHHLERELAKAEK
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LSLEEGGKDARGLLSGLRRRKRPLSWRAHGDGPQHPDPDPCARAGIHTSGSLSSRFSEPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LSLEEGGKDARGLLSGLRRRKRPLSWRAHGDGPQHPDPDPCARAGIHTSGSLSSRFSEPS
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 VDQGPGAGIPSALVLISIVLIILIALNVLLFYRLWSLERTAHTFESWHSLALAKGKFPQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VDQGPGAGIPSALVLISIVLIILIALNVLLFYRLWSLERTAHTFESWHSLALAKGKFPQT
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 ATEWAEILALQKQFHSVEVHKWRQILRASVELLDEMKFSLEKLHQGITVSDPPFDTQPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ATEWAEILALQKQFHSVEVHKWRQILRASVELLDEMKFSLEKLHQGITVSDPPFDTQPRP
650 660 670 680 690 700
pF1KA1 DDSFS
:::::
CCDS46 DDSFS
710
>>CCDS53720.1 GRAMD1B gene_id:57476|Hs108|chr11 (738 aa)
initn: 1942 init1: 1620 opt: 1840 Z-score: 1510.1 bits: 290.0 E(32554): 8.6e-78
Smith-Waterman score: 2115; 46.7% identity (72.9% similar) in 749 aa overlap (1-719:1-733)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MAYVKAWSTTPHSGRSTPSSSPSLRKRLQLLPPSRPP-PEPEPG-TMVEKGSDSSSEKGG
: : :. .:.::::. :: :::: :: : :. . : :::::::: ::.:.
CCDS53 MKGFKLSCTASNSNRSTPACSPILRKR------SRSPTPQNQDGDTMVEKGSDHSSDKS-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 VPGTP------STQSLGSRNFIRNSKKMQSWYSMLSPTYKQRNEDFRKLFSKLPEAERLI
:.:: : .: ..:. .:::: ::::..::::::::::::::::..::..::::
CCDS53 -PSTPEQGVQRSCSSQSGRSGGKNSKKSQSWYNVLSPTYKQRNEDFRKLFKQLPDTERLI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 VDYSCALQREILLQGRLYLSENWICFYSNIFRWETTISIQLKEVTCLKKEKTAKLIPNAI
:::::::::.::::::::::::::::::::::::: ....::.. . :::::.::::::
CCDS53 VDYSCALQRDILLQGRLYLSENWICFYSNIFRWETLLTVRLKDICSMTKEKTARLIPNAI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 QICTESEKHFFTSFGARDRCFLLIFRLWQNALLEKTLSPRELWHLVHQCYGSELGLTSED
:.::.:::::::::::::: ....::::::::::: : :.::::.::::::.::::::.:
CCDS53 QVCTDSEKHFFTSFGARDRTYMMMFRLWQNALLEKPLCPKELWHFVHQCYGNELGLTSDD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KA1 EDYVSPLQ-LNGLGTPKEVG-DVIALSDITSSGAADRSQEPSPVGSRRGHVTPNL-SRAS
:::: : . .: .: .:. . ..: .:... . . . :: ... .. .: : .:
CCDS53 EDYVPPDDDFNTMGYCEEIPVEENEVNDSSSKSSIETKPDASPQLPKKSITNSTLTSTGS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 SDADHGAEEDKEEQVDSQPDASSSQTVTPVAEPPSTEPTQPDGPTTLGPLDLLPSEELLT
:.: . . :. . :.: . .. . : . .:.. ::. .:.. :
CCDS53 SEAPVSFDGLPLEEEALEGDGSLEKELA--IDNIMGEKIEMIAPVNSPSLDFNDNEDIPT
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 DTSNSSSSTGEEADLAALLPDLSGRLLINSVFHVGAERLQQMLFSDSPFLQGFLQQCKFT
. :.::. : .:... :. ::::: .: ::. ....: ..::..::: . :..: .:.
CCDS53 ELSDSSD-THDEGEVQAFYEDLSGRQYVNEVFNFSVDKLYDLLFTNSPFQRDFMEQRRFS
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 DVTLSPWSGDSKCHQRRVLTYTIPISNPLGPKSASVVETQTLFRRGPQAGGC-VVDSEVL
:. . ::. . . .: ::. ::: ..:::.::.:.: ::::... . : . : :.:.:::
CCDS53 DIIFHPWKKEENGNQSRVILYTITLTNPLAPKTATVRETQTMYK-ASQESECYVIDAEVL
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 TQGIPYQDYFYTAHRYCILGLARNKARLRVSSEIRYRKQPWSLVKSLIEKNSWSGIEDYF
:. .::.::::: .:: . .::::.:::::.:.:::::::.:::..:::: :::.::::
CCDS53 THDVPYHDYFYTINRYTLTRVARNKSRLRVSTELRYRKQPWGLVKTFIEKNFWSGLEDYF
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570
pF1KA1 HHLERELAKAEKLSLEE----GGKDARGLLSGLRRRKRPLSWRAHGDGPQ---------H
.::: ::::.:. : : . :. . . .:::::: .:: :.
CCDS53 RHLESELAKTESTYLAEMHRQSPKEKASKTTTVRRRKRP---HAHLRVPHLEEVMSPVTT
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 PDPDPCARAGIHTSGSLSSRFSEPSVDQGPG-AGIPSALVLISIV----LIILIALNVLL
: . .. :..:: ..: .. .: .. . :..:: : :..:. ::..:
CCDS53 PTDEDVGHRIKHVAGSTQTRHIPEDTPNGFHLQSVSKLLLVISCVICFSLVLLVILNMML
590 600 610 620 630 640
640 650 660 670 680 690
pF1KA1 FYRLWSLERTAHTFESWHSLALAKGKFPQTATEWAEILALQKQFHSVEVHKWRQILRASV
::.:: :: :..:. .:..: : . ..::. ::::..: :...:..:..:::.:...::
CCDS53 FYKLWMLEYTTQTLTAWQGLRLQE-RLPQSQTEWAQLLESQQKYHDTELQKWREIIKSSV
650 660 670 680 690 700
700 710 720
pF1KA1 ELLDEMKFSLEKLHQGITVSDPPFDTQPRPDDSFS
:::.:: :: .:..:: : ... .
CCDS53 MLLDQMKDSLINLQNGIRSRDYTSESEEKRNRYH
710 720 730
>>CCDS66253.1 GRAMD1B gene_id:57476|Hs108|chr11 (745 aa)
initn: 1878 init1: 1556 opt: 1775 Z-score: 1456.9 bits: 280.2 E(32554): 7.9e-75
Smith-Waterman score: 2098; 46.4% identity (72.2% similar) in 756 aa overlap (1-719:1-740)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MAYVKAWSTTPHSGRSTPSSSPSLRKRLQLLPPSRPP-PEPEPG-TMVEKGSDSSSEKGG
: : :. .:.::::. :: :::: :: : :. . : :::::::: ::.:.
CCDS66 MKGFKLSCTASNSNRSTPACSPILRKR------SRSPTPQNQDGDTMVEKGSDHSSDKS-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KA1 VPGTP--------STQS-----LGSRNFIRNSKKMQSWYSMLSPTYKQRNEDFRKLFSKL
:.:: :.:: .:.. : ::: ::::..::::::::::::::::..:
CCDS66 -PSTPEQGVQRSCSSQSGRSGGKNSKSHKRLSKKSQSWYNVLSPTYKQRNEDFRKLFKQL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 PEAERLIVDYSCALQREILLQGRLYLSENWICFYSNIFRWETTISIQLKEVTCLKKEKTA
:..:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::: ....::.. . :::::
CCDS66 PDTERLIVDYSCALQRDILLQGRLYLSENWICFYSNIFRWETLLTVRLKDICSMTKEKTA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 KLIPNAIQICTESEKHFFTSFGARDRCFLLIFRLWQNALLEKTLSPRELWHLVHQCYGSE
.:::::::.::.:::::::::::::: ....::::::::::: : :.::::.::::::.:
CCDS66 RLIPNAIQVCTDSEKHFFTSFGARDRTYMMMFRLWQNALLEKPLCPKELWHFVHQCYGNE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 LGLTSEDEDYVSPLQ-LNGLGTPKEVG-DVIALSDITSSGAADRSQEPSPVGSRRGHVTP
:::::.::::: : . .: .: .:. . ..: .:... . . . :: ... ..
CCDS66 LGLTSDDEDYVPPDDDFNTMGYCEEIPVEENEVNDSSSKSSIETKPDASPQLPKKSITNS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 NL-SRASSDADHGAEEDKEEQVDSQPDASSSQTVTPVAEPPSTEPTQPDGPTTLGPLDLL
.: : .::.: . . :. . :.: . .. . : . .:.. ::.
CCDS66 TLTSTGSSEAPVSFDGLPLEEEALEGDGSLEKELA--IDNIMGEKIEMIAPVNSPSLDFN
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 PSEELLTDTSNSSSSTGEEADLAALLPDLSGRLLINSVFHVGAERLQQMLFSDSPFLQGF
.:.. :. :.::. : .:... :. ::::: .: ::. ....: ..::..::: . :
CCDS66 DNEDIPTELSDSSD-THDEGEVQAFYEDLSGRQYVNEVFNFSVDKLYDLLFTNSPFQRDF
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 LQQCKFTDVTLSPWSGDSKCHQRRVLTYTIPISNPLGPKSASVVETQTLFRRGPQAGGC-
..: .:.:. . ::. . . .: ::. ::: ..:::.::.:.: ::::... . : . :
CCDS66 MEQRRFSDIIFHPWKKEENGNQSRVILYTITLTNPLAPKTATVRETQTMYK-ASQESECY
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 VVDSEVLTQGIPYQDYFYTAHRYCILGLARNKARLRVSSEIRYRKQPWSLVKSLIEKNSW
:.:.::::. .::.::::: .:: . .::::.:::::.:.:::::::.:::..:::: :
CCDS66 VIDAEVLTHDVPYHDYFYTINRYTLTRVARNKSRLRVSTELRYRKQPWGLVKTFIEKNFW
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570
pF1KA1 SGIEDYFHHLERELAKAEKLSLEE----GGKDARGLLSGLRRRKRPLSWRAHGDGPQ---
::.::::.::: ::::.:. : : . :. . . .:::::: .:: :.
CCDS66 SGLEDYFRHLESELAKTESTYLAEMHRQSPKEKASKTTTVRRRKRP---HAHLRVPHLEE
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620
pF1KA1 ------HPDPDPCARAGIHTSGSLSSRFSEPSVDQGPG-AGIPSALVLISIV----LIIL
: . .. :..:: ..: .. .: .. . :..:: : :..:
CCDS66 VMSPVTTPTDEDVGHRIKHVAGSTQTRHIPEDTPNGFHLQSVSKLLLVISCVICFSLVLL
590 600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KA1 IALNVLLFYRLWSLERTAHTFESWHSLALAKGKFPQTATEWAEILALQKQFHSVEVHKWR
. ::..:::.:: :: :..:. .:..: : . ..::. ::::..: :...:..:..:::
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650 660 670 680 690 700
690 700 710 720
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.:...:: :::.:: :: .:..:: : ... .
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::: ....::::::::::: : :.::::.::::::.::::::.::::: : . .: .:
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.:. . ..: .:... . . . :: ... .. .: : .::.: . . :.
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::. ::: ..:::.::.:.: ::::... . : . : :.:.::::. .::.::::: .::
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. .::::.:::::.:.:::::::.:::..:::: :::.::::.::: ::::.:. :
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pF1KA1 E----GGKDARGLLSGLRRRKRPLSWRAHGDGPQ---------HPDPDPCARAGIHTSGS
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..: .. .: .. . :..:: ::..:. ::..:::.:: :: :..:. .:..:
CCDS81 TQTRHIPEDTPNGFHLQSVSKLLLVISCVLVLLVILNMMLFYKLWMLEYTTQTLTAWQGL
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: . ..::. ::::..: :...:..:..:::.:...:: :::.:: :: .:..::
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720
pF1KA1 DPPFDTQPRPDDSFS
: ... .
CCDS81 DYTSESEEKRNRYH
690
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20 30 40 50 60
pF1KA1 RSTPSSSPSLRKRLQLLPPSRPPPEPEPGTMVEKGSDSSSEKGGVPGTP------STQSL
::::::: ::.:. :.:: : .:
CCDS66 MVEKGSDHSSDKS--PSTPEQGVQRSCSSQ
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CCDS66 SGRSGGKNSKKSQSWYNVLSPTYKQRNEDFRKLFKQLPDTERLIVDYSCALQRDILLQGR
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.:. . ..: .:... . . . :: ... .. .: : .::.: . . :.
CCDS66 EEIPVEENEVNDSSSKSSIETKPDASPQLPKKSITNSTLTSTGSSEAPVSFDGLPLEEEA
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CCDS66 AFYEDLSGRQYVNEVFNFSVDKLYDLLFTNSPFQRDFMEQRRFSDIIFHPWKKEENGNQS
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CCDS66 RVILYTITLTNPLAPKTATVRETQTMYK-ASQESECYVIDAEVLTHDVPYHDYFYTINRY
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. .::::.:::::.:.:::::::.:::..:::: :::.::::.::: ::::.:. :
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pF1KA1 E----GGKDARGLLSGLRRRKRPLSWRAHGDGPQ---------HPDPDPCARAGIHTSGS
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CCDS66 EMHRQSPKEKASKTTTVRRRKRP---HAHLRVPHLEEVMSPVTTPTDEDVGHRIKHVAGS
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CCDS66 TQTRHIPEDTPNGFHLQSVSKLLLVISCVICFSLVLLVILNMMLFYKLWMLEYTTQTLTA
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CCDS66 WQGLRLQE-RLPQSQTEWAQLLESQQKYHDTELQKWREIIKSSVMLLDQMKDSLINLQNG
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CCDS66 IRSRDYTSESEEKRNRYH
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pF1KA1 SSEKGGVPGTPSTQSLGSRNFIRNSKKMQSWYSMLSPTYKQRNEDFRKLFSKLPEAERLI
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CCDS33 ENPSPTVEENNVVVKKQGPNLHNWSGDWSFWIS--SSTYKDRNEEYRRQFTHLPDTERLI
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pF1KA1 VDYSCALQREILLQGRLYLSENWICFYSNIFRWETTISIQLKEVTCLKKEKTAKLIPNAI
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CCDS33 ADYACALQRDILLQGRLYLSENWLCFYSNIFRWETTISIALKNITFMTKEKTARLIPNAI
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pF1KA1 QICTESEKHFFTSFGARDRCFLLIFRLWQNALLEKTLSPRELWHLVHQCYGSELGLTSED
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CCDS33 QIVTESEKFFFTSFGARDRSYLSIFRLWQNVLLDKSLTRQEFWQLLQQNYGTELGLNAEE
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CCDS33 MENLS-LSIEDV-QPRSPGR----SSLDDSGERDEKLSKSI-----SFTSESISRVSETE
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CCDS33 SFDGNSSKGGLGKEESQNEKQTKKSLLPTLEKKLTRVPSKS--------LDLNKNEYLSL
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..:..... .: . .. . .:..:: ...:. ::: :: .: ..:..:..:
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. : : . : . :.. .. ..:: .. ..:. . .:: :. .:...: :: :..
CCDS33 YRLRLQEEKSLNLASDMVSRAETIQK--NKDQAHRLKGVLRDSIVMLEQLKSSLIMLQKT
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pF1KA1 ITVSDPPFDTQPRPDDSFS
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CCDS54 MENLSLSIEDVQPRSPGRSSLDDSGERDEKLSKSISFTSESISRVSET
10 20 30 40
300 310 320 330 340
pF1KA1 A--DHGAEEDKEEQVDSQPDASSSQTVTPVAEPPSTE-PTQPDGPTTLGPLDLLPSEELL
: .. . . .:: . ...... :. : :. :.. ::: .: :
CCDS54 ESFDGNSSKGGLGKEESQNEKQTKKSLLPTLEKKLTRVPSKS--------LDLNKNEYLS
50 60 70 80 90 100
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 TDTSNSSSSTGEEADLAALLP--DLSGRLLINSVFHVGAERLQQMLFSDSPFLQGFLQQC
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CCDS54 LDKSSTSDSVDEEN-----VPEKDLHGRLFINRIFHISADRMFELLFTSSRFMQKFASSR
110 120 130 140 150
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pF1KA1 KFTDVTLSPWSGDSKCHQRRVLTYTIPISNPLGPKSASVVETQTLFRRGPQAGGCVVDSE
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CCDS54 NIIDVVSTPWTAELGGDQLRTMTYTIVLNSPLTGKCTAATEKQTLYKESREARFYLVDSE
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CCDS54 VLTHDVPYHDYFYTVNRYCIIRSSKQKCRLRVSTDLKYRKQPWGLVKSLIEKNSWSSLED
220 230 240 250 260 270
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pF1KA1 YFHHLERELAKAEKLSLEEGGKDARGLLSGLRRRKRPLSWRAHGDGPQHPDPDPCARAGI
::..:: .: :.. :... .: : :.:::::.: .. :. :. . . .:.
CCDS54 YFKQLESDLLIEESV-LNQAIEDP-GKLTGLRRRRRTFN-RTAETVPKLSSQHSSGDVGL
280 290 300 310 320 330
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pF1KA1 HTSGSLSSRFSEPSVDQGPGAGIPSALVLISIVLIILIALNVLLFYRLWSLERTAHTFES
..:..... .: . .. . .:..:: ...:. ::: :: .: ..:..:..:
CCDS54 GAKGDITGKKKEME-----NYNV-TLIVVMSIFVLLLVLLNVTLFLKLSKIEHAAQSF--
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pF1KA1 WHSLALAKGKFPQTATEW-AEILALQKQFHSVEVHKWRQILRASVELLDEMKFSLEKLHQ
. : : . : . :.. .. ..:: .. ..:. . .:: :. .:...: :: :..
CCDS54 -YRLRLQEEKSLNLASDMVSRAETIQK--NKDQAHRLKGVLRDSIVMLEQLKSSLIMLQK
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pF1KA1 GITVSDPPFDTQPRPDDSFS
CCDS54 TFDLLNKNKTGMAVES
450
725 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 21:23:59 2016 done: Wed Nov 2 21:24:00 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]