Result of FASTA (ccds) for pF1KA1549
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1549, 1858 aa
  1>>>pF1KA1549 1858 - 1858 aa - 1858 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6859+/-0.0012; mu= 0.3041+/- 0.072
 mean_var=264.9369+/-56.069, 0's: 0 Z-trim(110.8): 32  B-trim: 280 in 2/49
 Lambda= 0.078796
 statistics sampled from 11864 (11887) to 11864 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.365), width:  16
 Scan time:  6.120

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS47723.2 KIAA1549 gene_id:57670|Hs108|chr7      (1934) 12059 1385.7       0
CCDS56513.1 KIAA1549 gene_id:57670|Hs108|chr7      (1950) 11622 1336.0       0
CCDS44565.2 KIAA1549L gene_id:25758|Hs108|chr11    (1849)  720 96.7 8.8e-19


>>CCDS47723.2 KIAA1549 gene_id:57670|Hs108|chr7           (1934 aa)
 initn: 12059 init1: 12059 opt: 12059  Z-score: 7416.7  bits: 1385.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 12059; 99.8% identity (99.8% similar) in 1858 aa overlap (1-1858:77-1934)

                                             10        20        30
pF1KA1                               MELVLKKSTGHSAAQVALTETAPGSQHSSP
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PGLWLLLLARPASCAPDELSPEQHNLSLYSMELVLKKSTGHSAAQVALTETAPGSQHSSP
         50        60        70        80        90       100      

               40        50        60        70        80        90
pF1KA1 LHVTAPPSATTFDTAFFNQGKQTKSTADPSIFVATYVSVTSKEVAVNDDEMDNFLPDTHW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LHVTAPPSATTFDTAFFNQGKQTKSTADPSIFVATYVSVTSKEVAVNDDEMDNFLPDTHW
        110       120       130       140       150       160      

              100       110       120       130       140       150
pF1KA1 TTPRMVSPIQYITVSPPGLPREALEPMLTPSLPMVSLQDEEVTSGWQNTTRQPAAYAESA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TTPRMVSPIQYITVSPPGLPREALEPMLTPSLPMVSLQDEEVTSGWQNTTRQPAAYAESA
        170       180       190       200       210       220      

              160       170       180       190       200       210
pF1KA1 SHFHTFRSAFRTSEGIVPTPGRNLVLYPTDAYSHLSSRTLPEIVASLTEGVETTLFLSSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SHFHTFRSAFRTSEGIVPTPGRNLVLYPTDAYSHLSSRTLPEIVASLTEGVETTLFLSSR
        230       240       250       260       270       280      

              220       230       240       250       260       270
pF1KA1 SLMPQPLGDGITIPLPSLGEVSQPPEEVWATSADRYTDVTTVLSQSLEETISPRTYPTVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SLMPQPLGDGITIPLPSLGEVSQPPEEVWATSADRYTDVTTVLSQSLEETISPRTYPTVT
        290       300       310       320       330       340      

              280       290       300       310       320       330
pF1KA1 ASHAALAFSRTHSPLLSTPLAFASSASPTDVSSNPFLPSDSSKTSELHSNSALPGPVDNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ASHAALAFSRTHSPLLSTPLAFASSASPTDVSSNPFLPSDSSKTSELHSNSALPGPVDNT
        350       360       370       380       390       400      

              340       350       360       370       380       390
pF1KA1 HILSPVSSFRPYTWCAACTVPSPQQVLATSLMEKDVGSGDGAETLCMTVLEESSISLMSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HILSPVSSFRPYTWCAACTVPSPQQVLATSLMEKDVGSGDGAETLCMTVLEESSISLMSS
        410       420       430       440       450       460      

              400       410       420       430       440       450
pF1KA1 VVADFSEFEEDPQVFNTLFASRPIVPLSSRSMEISETSVGISAEVDMSSVTTTQVPPAHG
       ::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VVADFSEFEEDPQVFNTLFPSRPIVPLSSRSMEISETSVGISAEVDMSSVTTTQVPPAHG
        470       480       490       500       510       520      

              460       470       480       490       500       510
pF1KA1 RLSVPASLDPTAGSLSVAETQVTPSSVTTAFFSVITSILLDSSFSVIANKNTPSLAVRDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RLSVPASLDPTAGSLSVAETQVTPSSVTTAFFSVITSILLDSSFSVIANKNTPSLAVRDP
        530       540       550       560       570       580      

              520       530       540       550       560       570
pF1KA1 SVFTPYSLVPSVESSLFSDQERSSFSEHKPGGALDFASSFFSTPPLELSGSISSPSEAPA
       :::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SVFTPYSLVPSVESSLFSDQERSSFSEHKPRGALDFASSFFSTPPLELSGSISSPSEAPA
        590       600       610       620       630       640      

              580       590       600       610       620       630
pF1KA1 SLSLMLSDLSPFTSQSFSPLVETFTLFDSSDLQSSQLSLPSSTNLEFSQLQPSSELPLNT
       ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SLSLMPSDLSPFTSQSFSPLVETFTLFDSSDLQSSQLSLPSSTNLEFSQLQPSSELPLNT
        650       660       670       680       690       700      

              640       650       660       670       680       690
pF1KA1 IMLLPSRSEVSPWSSFPSDSLEFVEASTVSLTDSEAHFTSAFIETTSYLESSLISHESAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IMLLPSRSEVSPWSSFPSDSLEFVEASTVSLTDSEAHFTSAFIETTSYLESSLISHESAV
        710       720       730       740       750       760      

              700       710       720       730       740       750
pF1KA1 TALVPPGSESFDILTAGIQATSPLTTVHTTPILTESSLFSTLTPPDDQISALDGHVSVLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TALVPPGSESFDILTAGIQATSPLTTVHTTPILTESSLFSTLTPPDDQISALDGHVSVLA
        770       780       790       800       810       820      

              760       770       780       790       800       810
pF1KA1 SFSKAIPTGTVLITDAYLPSGSLFVSEATPFPLPTELTVVGPSLTPTEVPLNTSTEVSTT
       :::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SFSKAIPTGTVLITDAYLPSGSSFVSEATPFPLPTELTVVGPSLTPTEVPLNTSTEVSTT
        830       840       850       860       870       880      

              820       830       840       850       860       870
pF1KA1 STGAATGGPLDSTLMGDAASQSPPESSAAPPLPSLRPVTAFTLEATVDTPTLATAKPPYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 STGAATGGPLDSTLMGDAASQSPPESSAAPPLPSLRPVTAFTLEATVDTPTLATAKPPYV
        890       900       910       920       930       940      

              880       890       900       910       920       930
pF1KA1 CDITVPDAYLITTVLARRAVQEYIITAIKEVLRIHFNRAVELKVYELFTDFTFLVTSGPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CDITVPDAYLITTVLARRAVQEYIITAIKEVLRIHFNRAVELKVYELFTDFTFLVTSGPF
        950       960       970       980       990      1000      

              940       950       960       970       980       990
pF1KA1 VYTAISVINVLINSKLVRDQTPLILSVKPSFLVPESRFQVQTVLQFVPPSVDTGFCNFTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VYTAISVINVLINSKLVRDQTPLILSVKPSFLVPESRFQVQTVLQFVPPSVDTGFCNFTQ
       1010      1020      1030      1040      1050      1060      

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KA1 RIEKGLMTALFEVRKHHQGTYNLTVQILNITISSSRVTPRRGPVNIIFAVKSTQGFLNGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RIEKGLMTALFEVRKHHQGTYNLTVQILNITISSSRVTPRRGPVNIIFAVKSTQGFLNGS
       1070      1080      1090      1100      1110      1120      

             1060      1070      1080      1090      1100      1110
pF1KA1 EVSELLRNLSVVEFSFYLGYPVLQIAEPFQYPQLNLSQLLKSSWVRTVLLGVMEKQLQNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EVSELLRNLSVVEFSFYLGYPVLQIAEPFQYPQLNLSQLLKSSWVRTVLLGVMEKQLQNE
       1130      1140      1150      1160      1170      1180      

             1120      1130      1140      1150      1160      1170
pF1KA1 VFQAEMERKLAQLLSEVSTRRRMWRRATVAAGNSVVQVVNVSRLEGDDNPVQLIYFVEDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VFQAEMERKLAQLLSEVSTRRRMWRRATVAAGNSVVQVVNVSRLEGDDNPVQLIYFVEDQ
       1190      1200      1210      1220      1230      1240      

             1180      1190      1200      1210      1220      1230
pF1KA1 DGERLSAVKSSDLINKMDLQRAAIILGYRIQGVIAQPVDRVKRPSPESQSNNLWVIVGVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DGERLSAVKSSDLINKMDLQRAAIILGYRIQGVIAQPVDRVKRPSPESQSNNLWVIVGVV
       1250      1260      1270      1280      1290      1300      

             1240      1250      1260      1270      1280      1290
pF1KA1 IPVLVVMVIVVILYWKLCRTDKLDFQPDTVANIQQRQKLQIPSVKGFDFAKQHLGQHNKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IPVLVVMVIVVILYWKLCRTDKLDFQPDTVANIQQRQKLQIPSVKGFDFAKQHLGQHNKD
       1310      1320      1330      1340      1350      1360      

             1300      1310      1320      1330      1340      1350
pF1KA1 DILIIHEPAPLPGPLKDHTTPSENGDVPSPKSKIPSKNVRHRGRVSPSDADSTVSEESSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DILIIHEPAPLPGPLKDHTTPSENGDVPSPKSKIPSKNVRHRGRVSPSDADSTVSEESSE
       1370      1380      1390      1400      1410      1420      

             1360      1370      1380      1390      1400      1410
pF1KA1 RDAGDKTPGAVNDGRSHRAPQSGPPLPSSGNEQHSSASIFEHVDRISRPPEASRRVPSKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RDAGDKTPGAVNDGRSHRAPQSGPPLPSSGNEQHSSASIFEHVDRISRPPEASRRVPSKI
       1430      1440      1450      1460      1470      1480      

             1420      1430      1440      1450      1460      1470
pF1KA1 QLIAMQPIPAPPVQRPSPADRVAESNKINKEIQTALRHKSEIEHHRNKIRLRAKRRGHYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QLIAMQPIPAPPVQRPSPADRVAESNKINKEIQTALRHKSEIEHHRNKIRLRAKRRGHYE
       1490      1500      1510      1520      1530      1540      

             1480      1490      1500      1510      1520      1530
pF1KA1 FPVVDDLSSGDTKERHRVYRRAQMQIDKILDPTASVPSVFIEPRKSSRIKRSPKPRRKHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FPVVDDLSSGDTKERHRVYRRAQMQIDKILDPTASVPSVFIEPRKSSRIKRSPKPRRKHQ
       1550      1560      1570      1580      1590      1600      

             1540      1550      1560      1570      1580      1590
pF1KA1 VNGCPADAEKDRLITTDSDGTYRRPPGVHNSAYIGCPSDPDLPADVQTPSSVELGRYPAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VNGCPADAEKDRLITTDSDGTYRRPPGVHNSAYIGCPSDPDLPADVQTPSSVELGRYPAL
       1610      1620      1630      1640      1650      1660      

             1600      1610      1620      1630      1640      1650
pF1KA1 PFPASQYIPPQPSIEEARQTMHSLLDDAFALVAPSSQPASTAGVGPGVPPGLPANSTPSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PFPASQYIPPQPSIEEARQTMHSLLDDAFALVAPSSQPASTAGVGPGVPPGLPANSTPSQ
       1670      1680      1690      1700      1710      1720      

             1660      1670      1680      1690      1700      1710
pF1KA1 EERRATQWGSFYSPAQTANNPCSRYEDYGMTPPTGPLPRPGFGPGLLQSTELVPPDPQQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EERRATQWGSFYSPAQTANNPCSRYEDYGMTPPTGPLPRPGFGPGLLQSTELVPPDPQQP
       1730      1740      1750      1760      1770      1780      

             1720      1730      1740      1750      1760      1770
pF1KA1 QASAEAPFAARGIYSEEMPSVARPRPVGGTTGSQIQHLTQVGIASRIGAQPVEIPPSRGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QASAEAPFAARGIYSEEMPSVARPRPVGGTTGSQIQHLTQVGIASRIGAQPVEIPPSRGS
       1790      1800      1810      1820      1830      1840      

             1780      1790      1800      1810      1820      1830
pF1KA1 QYGGPGWPSYGEDEAGRREAVPRTSGREPSAPSGNLPHRGLQGPGLGYPTSSTEDLQPGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QYGGPGWPSYGEDEAGRREAVPRTSGREPSAPSGNLPHRGLQGPGLGYPTSSTEDLQPGH
       1850      1860      1870      1880      1890      1900      

             1840      1850        
pF1KA1 SSASLIKAIREELLRLSQKQSTVQNFHS
       ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SSASLIKAIREELLRLSQKQSTVQNFHS
       1910      1920      1930    

>>CCDS56513.1 KIAA1549 gene_id:57670|Hs108|chr7           (1950 aa)
 initn: 12045 init1: 11609 opt: 11622  Z-score: 7148.1  bits: 1336.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 12017; 98.9% identity (98.9% similar) in 1874 aa overlap (1-1858:77-1950)

                                             10        20        30
pF1KA1                               MELVLKKSTGHSAAQVALTETAPGSQHSSP
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PGLWLLLLARPASCAPDELSPEQHNLSLYSMELVLKKSTGHSAAQVALTETAPGSQHSSP
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               40        50        60        70        80        90
pF1KA1 LHVTAPPSATTFDTAFFNQGKQTKSTADPSIFVATYVSVTSKEVAVNDDEMDNFLPDTHW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LHVTAPPSATTFDTAFFNQGKQTKSTADPSIFVATYVSVTSKEVAVNDDEMDNFLPDTHW
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              100       110       120       130       140       150
pF1KA1 TTPRMVSPIQYITVSPPGLPREALEPMLTPSLPMVSLQDEEVTSGWQNTTRQPAAYAESA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TTPRMVSPIQYITVSPPGLPREALEPMLTPSLPMVSLQDEEVTSGWQNTTRQPAAYAESA
        170       180       190       200       210       220      

              160       170       180       190       200       210
pF1KA1 SHFHTFRSAFRTSEGIVPTPGRNLVLYPTDAYSHLSSRTLPEIVASLTEGVETTLFLSSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SHFHTFRSAFRTSEGIVPTPGRNLVLYPTDAYSHLSSRTLPEIVASLTEGVETTLFLSSR
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pF1KA1 SLMPQPLGDGITIPLPSLGEVSQPPEEVWATSADRYTDVTTVLSQSLEETISPRTYPTVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SLMPQPLGDGITIPLPSLGEVSQPPEEVWATSADRYTDVTTVLSQSLEETISPRTYPTVT
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pF1KA1 ASHAALAFSRTHSPLLSTPLAFASSASPTDVSSNPFLPSDSSKTSELHSNSALPGPVDNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ASHAALAFSRTHSPLLSTPLAFASSASPTDVSSNPFLPSDSSKTSELHSNSALPGPVDNT
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pF1KA1 HILSPVSSFRPYTWCAACTVPSPQQVLATSLMEKDVGSGDGAETLCMTVLEESSISLMSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 HILSPVSSFRPYTWCAACTVPSPQQVLATSLMEKDVGSGDGAETLCMTVLEESSISLMSS
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pF1KA1 VVADFSEFEEDPQVFNTLFASRPIVPLSSRSMEISETSVGISAEVDMSSVTTTQVPPAHG
       ::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VVADFSEFEEDPQVFNTLFPSRPIVPLSSRSMEISETSVGISAEVDMSSVTTTQVPPAHG
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pF1KA1 RLSVPASLDPTAGSLSVAETQVTPSSVTTAFFSVITSILLDSSFSVIANKNTPSLAVRDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RLSVPASLDPTAGSLSVAETQVTPSSVTTAFFSVITSILLDSSFSVIANKNTPSLAVRDP
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pF1KA1 SVFTPYSLVPSVESSLFSDQERSSFSEHKPGGALDFASSFFSTPPLELSGSISSPSEAPA
       :::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SVFTPYSLVPSVESSLFSDQERSSFSEHKPRGALDFASSFFSTPPLELSGSISSPSEAPA
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pF1KA1 SLSLMLSDLSPFTSQSFSPLVETFTLFDSSDLQSSQLSLPSSTNLEFSQLQPSSELPLNT
       ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SLSLMPSDLSPFTSQSFSPLVETFTLFDSSDLQSSQLSLPSSTNLEFSQLQPSSELPLNT
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pF1KA1 IMLLPSRSEVSPWSSFPSDSLEFVEASTVSLTDSEAHFTSAFIETTSYLESSLISHESAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IMLLPSRSEVSPWSSFPSDSLEFVEASTVSLTDSEAHFTSAFIETTSYLESSLISHESAV
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pF1KA1 TALVPPGSESFDILTAGIQATSPLTTVHTTPILTESSLFSTLTPPDDQISALDGHVSVLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TALVPPGSESFDILTAGIQATSPLTTVHTTPILTESSLFSTLTPPDDQISALDGHVSVLA
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pF1KA1 SFSKAIPTGTVLITDAYLPSGSLFVSEATPFPLPTELTVVGPSLTPTEVPLNTSTEVSTT
       :::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SFSKAIPTGTVLITDAYLPSGSSFVSEATPFPLPTELTVVGPSLTPTEVPLNTSTEVSTT
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pF1KA1 STGAATGGPLDSTLMGDAASQSPPESSAAPPLPSLRPVTAFTLEATVDTPTLATAKPPYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 STGAATGGPLDSTLMGDAASQSPPESSAAPPLPSLRPVTAFTLEATVDTPTLATAKPPYV
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pF1KA1 CDITVPDAYLITTVLARRAVQEYIITAIKEVLRIHFNRAVELKVYELFTDFTFLVTSGPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 CDITVPDAYLITTVLARRAVQEYIITAIKEVLRIHFNRAVELKVYELFTDFTFLVTSGPF
        950       960       970       980       990      1000      

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pF1KA1 VYTAISVINVLINSKLVRDQTPLILSVKPSFLVPESRFQVQTVLQFVPPSVDTGFCNFTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VYTAISVINVLINSKLVRDQTPLILSVKPSFLVPESRFQVQTVLQFVPPSVDTGFCNFTQ
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pF1KA1 RIEKGLMTALFEVRKHHQGTYNLTVQILNITISSSRVTPRRGPVNIIFAVKSTQGFLNGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RIEKGLMTALFEVRKHHQGTYNLTVQILNITISSSRVTPRRGPVNIIFAVKSTQGFLNGS
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pF1KA1 EVSELLRNLSVVEFSFYLGYPVLQIAEPFQYPQLNLSQLLKSSWVRTVLLGVMEKQLQNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EVSELLRNLSVVEFSFYLGYPVLQIAEPFQYPQLNLSQLLKSSWVRTVLLGVMEKQLQNE
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pF1KA1 VFQAEMERKLAQLLSEVSTRRRMWRRATVAAGNSVVQVVNVSRLEGDDNPVQLIYFVEDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VFQAEMERKLAQLLSEVSTRRRMWRRATVAAGNSVVQVVNVSRLEGDDNPVQLIYFVEDQ
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pF1KA1 DGERLSAVKSSDLINKMDLQRAAIILGYRIQGVIAQPVDRVKRPSPESQSNNLWVIVGVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DGERLSAVKSSDLINKMDLQRAAIILGYRIQGVIAQPVDRVKRPSPESQSNNLWVIVGVV
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             1240      1250      1260      1270      1280      1290
pF1KA1 IPVLVVMVIVVILYWKLCRTDKLDFQPDTVANIQQRQKLQIPSVKGFDFAKQHLGQHNKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IPVLVVMVIVVILYWKLCRTDKLDFQPDTVANIQQRQKLQIPSVKGFDFAKQHLGQHNKD
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             1300      1310      1320      1330      1340      1350
pF1KA1 DILIIHEPAPLPGPLKDHTTPSENGDVPSPKSKIPSKNVRHRGRVSPSDADSTVSEESSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DILIIHEPAPLPGPLKDHTTPSENGDVPSPKSKIPSKNVRHRGRVSPSDADSTVSEESSE
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pF1KA1 RDAGDKTPGAVNDGRSHRAPQSGPPLPSSGNEQHSSASIFEHVDRISRPPEASRRVPSKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RDAGDKTPGAVNDGRSHRAPQSGPPLPSSGNEQHSSASIFEHVDRISRPPEASRRVPSKI
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pF1KA1 QLIAMQPIPAPPVQRPSPADRVAESNKINKEIQTALRHKSEIEHHRNKIRLRAKRRGHYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QLIAMQPIPAPPVQRPSPADRVAESNKINKEIQTALRHKSEIEHHRNKIRLRAKRRGHYE
       1490      1500      1510      1520      1530      1540      

             1480      1490      1500      1510      1520      1530
pF1KA1 FPVVDDLSSGDTKERHRVYRRAQMQIDKILDPTASVPSVFIEPRKSSRIKRSPKPRRKHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FPVVDDLSSGDTKERHRVYRRAQMQIDKILDPTASVPSVFIEPRKSSRIKRSPKPRRKHQ
       1550      1560      1570      1580      1590      1600      

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pF1KA1 VNGCPADAEKDRLITTDSDGTYRRPPGVHNSAYIGCPSDPDLPADVQTPSSVELGRYPAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VNGCPADAEKDRLITTDSDGTYRRPPGVHNSAYIGCPSDPDLPADVQTPSSVELGRYPAL
       1610      1620      1630      1640      1650      1660      

             1600      1610      1620      1630      1640      1650
pF1KA1 PFPASQYIPPQPSIEEARQTMHSLLDDAFALVAPSSQPASTAGVGPGVPPGLPANSTPSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PFPASQYIPPQPSIEEARQTMHSLLDDAFALVAPSSQPASTAGVGPGVPPGLPANSTPSQ
       1670      1680      1690      1700      1710      1720      

             1660      1670      1680      1690      1700      1710
pF1KA1 EERRATQWGSFYSPAQTANNPCSRYEDYGMTPPTGPLPRPGFGPGLLQSTELVPPDPQQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EERRATQWGSFYSPAQTANNPCSRYEDYGMTPPTGPLPRPGFGPGLLQSTELVPPDPQQP
       1730      1740      1750      1760      1770      1780      

             1720      1730      1740      1750      1760      1770
pF1KA1 QASAEAPFAARGIYSEEMPSVARPRPVGGTTGSQIQHLTQVGIASRIGAQPVEIPPSRGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QASAEAPFAARGIYSEEMPSVARPRPVGGTTGSQIQHLTQVGIASRIGAQPVEIPPSRGS
       1790      1800      1810      1820      1830      1840      

             1780      1790                      1800      1810    
pF1KA1 QYGGPGWPSYGEDEAGRREA----------------VPRTSGREPSAPSGNLPHRGLQGP
       ::::::::::::::::::::                ::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QYGGPGWPSYGEDEAGRREATHMLGHQEYSSSPLFQVPRTSGREPSAPSGNLPHRGLQGP
       1850      1860      1870      1880      1890      1900      

         1820      1830      1840      1850        
pF1KA1 GLGYPTSSTEDLQPGHSSASLIKAIREELLRLSQKQSTVQNFHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GLGYPTSSTEDLQPGHSSASLIKAIREELLRLSQKQSTVQNFHS
       1910      1920      1930      1940      1950

>>CCDS44565.2 KIAA1549L gene_id:25758|Hs108|chr11         (1849 aa)
 initn: 792 init1: 201 opt: 720  Z-score: 450.6  bits: 96.7 E(32554): 8.8e-19
Smith-Waterman score: 1487; 27.7% identity (54.9% similar) in 1854 aa overlap (134-1857:154-1848)

           110       120       130       140       150             
pF1KA1 VSPPGLPREALEPMLTPSLPMVSLQDEEVTSGWQNTTRQPAAYAESAS------HFHTFR
                                     :.  ...: ::  :: .:      :. :. 
CCDS44 FQTAESGAIEMTSRKLASATANDSANPLHLSAAPENSRGPALSAEHTSSLVPSLHITTLG
           130       140       150       160       170       180   

       160        170             180       190       200       210
pF1KA1 SAFRTSEGIVP-TPGRNLVLYPT------DAYSHLSSRTLPEIVASLTEGVETTLFLSSR
       .      : :: .:. . . .:.       . .: :   .::. .  .:: . .   ..:
CCDS44 QEQAILSGAVPASPSTGTADFPSILTFLQPTENHASPSPVPEMPTLPAEGSDGSPP-ATR
           190       200       210       220       230        240  

              220       230       240       250       260       270
pF1KA1 SLMPQPLGDGITIPLPSLGEVSQPPEEVWATSADRYTDVTTVLSQSLEETISPRTYPTVT
       .:.       ..  .:.:  .:      :.    .  .::..:... : ..   : :   
CCDS44 DLL-------LSSKVPNLLSTS------WTFPRWKKDSVTAILGKNEEANV---TIPL--
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pF1KA1 ASHAALAFSRTHSPLLSTPLAFASSASPTDVSSNPFLPSDSSKTSELHSNSALPG--PVD
             :: : .   : :  .:.:. :  .::: :.. .   .:. : :.  ::.   ..
CCDS44 -----QAFPRKEVLSLHTVNGFVSDFSTGSVSS-PIITAP--RTNPLPSGPPLPSILSIQ
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pF1KA1 NTHILSP---VSSFRPYTWCAACTVPSPQQVLATSLMEKDVGSGDGAETLCMTVLEESSI
        :. . :    :: .: .. ::                    ::  : .  ..    ::.
CCDS44 ATQTVFPSLGFSSTKPEAYAAAVD-----------------HSGLPASASKQVRASPSSM
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pF1KA1 SLMSSV-VADFSEFEEDPQVFNTLFASRPIVPLSSRSMEISETSVGISAEVDMSSVTTTQ
       ....:. ..:...       ...: :      ::..:. ::  .   . ...  ...::.
CCDS44 DVYDSLTIGDMKKPATTDVFWSSLSAETG--SLSTESI-ISGLQQQTNYDLNGHTISTTS
     380       390       400         410        420       430      

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pF1KA1 VPPAHGRLSVPASLDPTAGSLSVAETQVTPS-SVTTAFFSVITSILLDSSFSVIANKNTP
            .  . : .:  .: ...  . . : . :::.  :: : ...: .:.   ....  
CCDS44 WETHLAPTAPPNGLTSAADAIKSQDFKDTAGHSVTAEGFS-IQDLVLGTSIEQPVQQSDM
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pF1KA1 SLAVRDPSVFTPYSLVPSVESSLFSDQERSSFSEHKPGGALDFASSFFSTPPLELSGSIS
       ..      : .  .: :. ...   : . .  . ..:      .    : : :.:     
CCDS44 TM------VGSHIDLWPTSNNNHSRDFQTAEVAYYSPT-----TRHSVSHPQLQL-----
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pF1KA1 SPSEAPASLSLMLSDLSPFTSQSFSPLVETFTLFDSSDLQSSQLSLPSSTNLEFSQLQPS
        :.. ::   :.:.. .: .. :.. .     : :..:  .:..:  :. :   :. . .
CCDS44 -PNQ-PAH-PLLLTSPGPTSTGSLQEM-----LSDGTDT-GSEIS--SDIN---SSPERN
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pF1KA1 SELPLNTIMLLPSRSEVSPWSS-FPSDSLEFVEAS------TVSLTDSEAHFTSAFIETT
       .  :...:.   : .: :  .: ::  : . ..::      :.. ..:... :.:   .:
CCDS44 ASTPFQNILGYHSAAESSISTSVFPRTSSRVLRASQHPKKWTADTVSSKVQPTAA-AAVT
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pF1KA1 SYLESSLISHESAVTALVPPGSESFDILTA-GIQATSPLTTVH--------TTPILTESS
        .:..:  :  .  .:::  :. :  . .: :   .: .::.         . :  : ..
CCDS44 LFLRKS--SPPALSAALVAKGTSSSPLAVASGPAKSSSMTTLAKNVTNKAASGPKRTPGA
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pF1KA1 LFSTLTPPDDQISALDGHV-SVLASFSKAIPTGTVLITDAYLPSGSLFVSEATPFPLPTE
       . ...      . :  ::. :. ....  . :.. :.. .:::      .  : .: ::.
CCDS44 VHTAFPFTPTYMYARTGHTTSTHTAMQGNMDTASGLLSTTYLPRKPQ--AMHTGLPNPTN
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pF1KA1 LTVVGPSLTPTEVPLNTSTEVSTTSTGAATGGPLDSTLMGDAASQSPPESSAAPPLPSLR
       :          :.:             :.:  ::  :    ::  :   :  :  :: ::
CCDS44 L----------EMPR------------ASTPRPLTVT----AALTSITASVKATRLPPLR
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pF1KA1 PVTAFTLEATVDTPTLATAKPPYVCDITVPDAYLITTVL--ARRAVQ-----EY-IITAI
         .. ..  .... ...:.:     .  . .  :. :::  ..: ::     .. :  ..
CCDS44 AENTDAVLPAASAAVVTTGKMASNLECQMSSKLLVKTVLFLTQRRVQISESLKFSIAKGL
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pF1KA1 KEVLRIHFNR---AVELKVYELFTDFT--FLVTSGPFVYTAISVINVL-------INSKL
        ..::  :..   .... . :   . :  . .:.: .::    ::..:       ... :
CCDS44 TQALRKAFHQNDVSAHVDILEYSHNVTVGYYATKGKLVYLPAVVIEMLGVYGVSNVTADL
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pF1KA1 VRDQTPLILSV----KPSFLVPESRFQVQTVLQFVPPSVDTGFCNFTQRIEKGLMTALFE
        ...:: . ::    .:    : . ::..::::::  . .   :.:.: .:. :. :. .
CCDS44 -KQHTPHLQSVAVLASPWNPQPAGYFQLKTVLQFVSQADNIQSCKFAQTMEQRLQKAFQD
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pF1KA1 V-RKHHQGTYNLTVQILNITISSSRVTPRRGPVNIIFAVKSTQGFLNGSEVSELLRNLSV
       . ::  .   :::.::.. . .:. ::       ....: . . ::::. .: :: .::.
CCDS44 AERKVLNTKSNLTIQIVSTSNASQAVT-------LVYVVGNQSTFLNGTVASSLLSQLSA
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pF1KA1 VEFSFYLGYPVLQIAEPFQYPQLNLSQLLKSSWVRTVLLGVMEKQ--LQNEVFQAEMERK
          .::: :: : ::::..::.:..:.  .. :: ::: :: ..   :.:. :   ::..
CCDS44 ELVGFYLTYPPLTIAEPLEYPNLDISETTRDYWVITVLQGVDNSLVGLHNQSFARVMEQR
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pF1KA1 LAQLLSEVSTRRRMWRRATVAAGNSVVQVVNVSRLEGDDNPVQLIYFVEDQDGERLSAVK
       ::::.   . . : ..:::.  :. .::.:...:. :  .:..: :..   .:. : .. 
CCDS44 LAQLFMMSQQQGRRFKRATTL-GSYTVQMVKMQRVPGPKDPAELTYYTL-YNGKPLLGTA
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pF1KA1 SSDLINKMDLQRAAIILGYRIQGVIAQPVDRVKRPSPESQSNNLWVIVGVVIPVLVVMVI
       .. ... .: :: :. : ...  . :.::  :: : :    ::::.:..:. :. :: ::
CCDS44 AAKILSTIDSQRMALTL-HHVVLLQADPV--VKNP-P----NNLWIIAAVLAPIAVVTVI
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pF1KA1 VVILYWKLCRTDKLDFQPDTVANIQQRQKLQIPSVKGFDFAKQHLGQHNKDD--ILIIHE
       ..:.   ::: .: ::.:::. :. :: :   : :.:::.:::::::.. :.  : . .:
CCDS44 IIIITAVLCRKNKNDFKPDTMINLPQRAK---P-VQGFDYAKQHLGQQGADEEVIPVTQE
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pF1KA1 PAPLPGPLKDHTTPSENGDVPSPKSKIPS-KNVRHRGRVSPSDADSTVSEESSERDAGDK
        . :: :..:  .:.:  :: .  : : . :... :   :::.  :..:.::.. ..: .
CCDS44 TVVLPLPIRD--APQER-DVAQDGSTIKTAKSTETRKSRSPSENGSVISNESGKPSSGRR
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pF1KA1 TPGAV-NDGRSHRAPQSGPPLPSSGNEQHSSASIFEHVDRISRPPEASRRVPSKIQLIAM
       .:  :  . .  .       .:.: .:.  .: .:.. ....  :  .    ...::::.
CCDS44 SPQNVMAQQKVTKEEARKRNVPASDEEE--GAVLFDNSSKVAAEPFDTSS--GSVQLIAI
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pF1KA1 QPIPAPPVQRPSPADRVAESNKI-NKEIQTALRHKSEIEHHRNKIRLRAKRRGHYEFPVV
       .:   : :  :  .::  ::. . : :.. ::..::.:::.:::.::.:::.:.:.::.:
CCDS44 KPTALPMV--PPTSDRSQESSAVLNGEVNKALKQKSDIEHYRNKLRLKAKRKGYYDFPAV
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pF1KA1 DDLSSGDTKERHRVYRRAQMQIDKILDPTASVPSVFIEPRKSSRIKRSPKPRRKHQVNGC
       .  :.: : ::...:..:  .....::: . . . : : .. ...: :    :.   .  
CCDS44 ET-SKGLT-ERKKMYEKAPKEMEHVLDPDSELCAPFTESKNRQQMKNSVYRSRQSLNSPS
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pF1KA1 PADAEKDRLITTDSDGTYRRPPGVHNSAYIGCPSDPDLPAD-----VQTPSSVELGRYPA
       :...: : :.: .     ::  :..::.:    ..:..  .     :  : .   .:  .
CCDS44 PGETEMDLLVTRERP---RR--GIRNSGY---DTEPEIIEETNIDRVPEPRGYSRSRQ-V
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pF1KA1 LPFPASQYIPPQPSIEEARQTMHSLLDDAFALV----APSSQPASTAGVGPGVPPGLPAN
            .. .  ::::.:.:: :: ::..::.:.    : .:.   . : .  .: .  ..
CCDS44 KGHSETSTLSSQPSIDEVRQQMHMLLEEAFSLASAGHAGQSRHQEAYGSAQHLPYSEVVT
           1540      1550      1560      1570      1580      1590  

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pF1KA1 STPSQEER-RA-TQWGSFYSPAQ---TANNPCSRYE---DYGMTPPTGPLPRPGFGP---
       :.:.   : :: .::   : : .   .   :  :.    .. :  :  :.: :  ::   
CCDS44 SAPGTMTRPRAGVQWVPTYRPEMYQYSLPRPAYRFSQLPEMVMGSPPPPVP-PRTGPVAV
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pF1KA1 -GLLQST----------ELVPPDPQQPQASAEAPFAARGIYSEEMPSVARPRPVGGTTGS
        .: .::          : . :.: : . ::     .::  :     .   . . . .:.
CCDS44 ASLRRSTSDIGSKTRMAESTGPEPAQLHDSASFTQMSRGPVS----VTQLDQSALNYSGN
            1660      1670      1680      1690          1700       

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pF1KA1 QIQHLTQVGIASRIGAQPVEIPPSRGSQYGGPGWPSY-GEDE-----------AGRREAV
        .  .  .  :.: :     :: .  :.: . .: :: ::.:            :  :: 
CCDS44 TVPAVFAIPAANRPGFTGYFIP-TPPSSYRNQAWMSYAGENELPSQWADSVPLPGYIEAY
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pF1KA1 PRTSGREPSAPSGNLPHRGLQG----PGLGY-PTSSTEDLQ-------PGH------SSA
       ::.  : :..  . ::..  :     :.:   :. ::   :       :.       :.:
CCDS44 PRS--RYPQSSPSRLPRQYSQPANLHPSLEQAPAPSTAASQQSLAENDPSDAPLTNISTA
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pF1KA1 SLIKAIREELLRLSQKQSTVQNFHS
       .:.::::::. .:..::. . .:. 
CCDS44 ALVKAIREEVAKLAKKQTDMFEFQV
         1830      1840         




1858 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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