FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1549, 1858 aa 1>>>pF1KA1549 1858 - 1858 aa - 1858 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6859+/-0.0012; mu= 0.3041+/- 0.072 mean_var=264.9369+/-56.069, 0's: 0 Z-trim(110.8): 32 B-trim: 280 in 2/49 Lambda= 0.078796 statistics sampled from 11864 (11887) to 11864 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.365), width: 16 Scan time: 6.120 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS47723.2 KIAA1549 gene_id:57670|Hs108|chr7 (1934) 12059 1385.7 0 CCDS56513.1 KIAA1549 gene_id:57670|Hs108|chr7 (1950) 11622 1336.0 0 CCDS44565.2 KIAA1549L gene_id:25758|Hs108|chr11 (1849) 720 96.7 8.8e-19 >>CCDS47723.2 KIAA1549 gene_id:57670|Hs108|chr7 (1934 aa) initn: 12059 init1: 12059 opt: 12059 Z-score: 7416.7 bits: 1385.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 12059; 99.8% identity (99.8% similar) in 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CCDS44 FQTAESGAIEMTSRKLASATANDSANPLHLSAAPENSRGPALSAEHTSSLVPSLHITTLG 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KA1 SAFRTSEGIVP-TPGRNLVLYPT------DAYSHLSSRTLPEIVASLTEGVETTLFLSSR . : :: .:. . . .:. . .: : .::. . .:: . . ..: CCDS44 QEQAILSGAVPASPSTGTADFPSILTFLQPTENHASPSPVPEMPTLPAEGSDGSPP-ATR 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KA1 SLMPQPLGDGITIPLPSLGEVSQPPEEVWATSADRYTDVTTVLSQSLEETISPRTYPTVT .:. .. .:.: .: :. . .::..:... : .. : : CCDS44 DLL-------LSSKVPNLLSTS------WTFPRWKKDSVTAILGKNEEANV---TIPL-- 250 260 270 280 280 290 300 310 320 pF1KA1 ASHAALAFSRTHSPLLSTPLAFASSASPTDVSSNPFLPSDSSKTSELHSNSALPG--PVD :: : . : : .:.:. : .::: :.. . .:. : :. ::. .. CCDS44 -----QAFPRKEVLSLHTVNGFVSDFSTGSVSS-PIITAP--RTNPLPSGPPLPSILSIQ 290 300 310 320 330 330 340 350 360 370 380 pF1KA1 NTHILSP---VSSFRPYTWCAACTVPSPQQVLATSLMEKDVGSGDGAETLCMTVLEESSI :. . : :: .: .. :: :: : . .. ::. CCDS44 ATQTVFPSLGFSSTKPEAYAAAVD-----------------HSGLPASASKQVRASPSSM 340 350 360 370 390 400 410 420 430 440 pF1KA1 SLMSSV-VADFSEFEEDPQVFNTLFASRPIVPLSSRSMEISETSVGISAEVDMSSVTTTQ ....:. ..:... ...: : ::..:. :: . . ... ...::. CCDS44 DVYDSLTIGDMKKPATTDVFWSSLSAETG--SLSTESI-ISGLQQQTNYDLNGHTISTTS 380 390 400 410 420 430 450 460 470 480 490 500 pF1KA1 VPPAHGRLSVPASLDPTAGSLSVAETQVTPS-SVTTAFFSVITSILLDSSFSVIANKNTP . . : .: .: ... . . : . :::. :: : ...: .:. .... CCDS44 WETHLAPTAPPNGLTSAADAIKSQDFKDTAGHSVTAEGFS-IQDLVLGTSIEQPVQQSDM 440 450 460 470 480 490 510 520 530 540 550 560 pF1KA1 SLAVRDPSVFTPYSLVPSVESSLFSDQERSSFSEHKPGGALDFASSFFSTPPLELSGSIS .. : . .: :. ... : . . . ..: . : : :.: CCDS44 TM------VGSHIDLWPTSNNNHSRDFQTAEVAYYSPT-----TRHSVSHPQLQL----- 500 510 520 530 570 580 590 600 610 620 pF1KA1 SPSEAPASLSLMLSDLSPFTSQSFSPLVETFTLFDSSDLQSSQLSLPSSTNLEFSQLQPS :.. :: :.:.. .: .. :.. . : :..: .:..: :. : :. . . CCDS44 -PNQ-PAH-PLLLTSPGPTSTGSLQEM-----LSDGTDT-GSEIS--SDIN---SSPERN 540 550 560 570 580 630 640 650 660 670 pF1KA1 SELPLNTIMLLPSRSEVSPWSS-FPSDSLEFVEAS------TVSLTDSEAHFTSAFIETT . :...:. : .: : .: :: : . ..:: :.. ..:... :.: .: CCDS44 ASTPFQNILGYHSAAESSISTSVFPRTSSRVLRASQHPKKWTADTVSSKVQPTAA-AAVT 590 600 610 620 630 640 680 690 700 710 720 pF1KA1 SYLESSLISHESAVTALVPPGSESFDILTA-GIQATSPLTTVH--------TTPILTESS .:..: : . .::: :. : . .: : .: .::. . : : .. CCDS44 LFLRKS--SPPALSAALVAKGTSSSPLAVASGPAKSSSMTTLAKNVTNKAASGPKRTPGA 650 660 670 680 690 700 730 740 750 760 770 780 pF1KA1 LFSTLTPPDDQISALDGHV-SVLASFSKAIPTGTVLITDAYLPSGSLFVSEATPFPLPTE . ... . : ::. :. .... . :.. :.. .::: . : .: ::. CCDS44 VHTAFPFTPTYMYARTGHTTSTHTAMQGNMDTASGLLSTTYLPRKPQ--AMHTGLPNPTN 710 720 730 740 750 760 790 800 810 820 830 840 pF1KA1 LTVVGPSLTPTEVPLNTSTEVSTTSTGAATGGPLDSTLMGDAASQSPPESSAAPPLPSLR : :.: :.: :: : :: : : : :: :: CCDS44 L----------EMPR------------ASTPRPLTVT----AALTSITASVKATRLPPLR 770 780 790 850 860 870 880 890 pF1KA1 PVTAFTLEATVDTPTLATAKPPYVCDITVPDAYLITTVL--ARRAVQ-----EY-IITAI .. .. .... ...:.: . . . :. ::: ..: :: .. : .. CCDS44 AENTDAVLPAASAAVVTTGKMASNLECQMSSKLLVKTVLFLTQRRVQISESLKFSIAKGL 800 810 820 830 840 850 900 910 920 930 940 pF1KA1 KEVLRIHFNR---AVELKVYELFTDFT--FLVTSGPFVYTAISVINVL-------INSKL ..:: :.. .... . : . : . .:.: .:: ::..: ... : CCDS44 TQALRKAFHQNDVSAHVDILEYSHNVTVGYYATKGKLVYLPAVVIEMLGVYGVSNVTADL 860 870 880 890 900 910 950 960 970 980 990 1000 pF1KA1 VRDQTPLILSV----KPSFLVPESRFQVQTVLQFVPPSVDTGFCNFTQRIEKGLMTALFE ...:: . :: .: : . ::..:::::: . . :.:.: .:. :. :. . CCDS44 -KQHTPHLQSVAVLASPWNPQPAGYFQLKTVLQFVSQADNIQSCKFAQTMEQRLQKAFQD 920 930 940 950 960 970 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA1 V-RKHHQGTYNLTVQILNITISSSRVTPRRGPVNIIFAVKSTQGFLNGSEVSELLRNLSV . :: . :::.::.. . .:. :: ....: . . ::::. .: :: .::. CCDS44 AERKVLNTKSNLTIQIVSTSNASQAVT-------LVYVVGNQSTFLNGTVASSLLSQLSA 980 990 1000 1010 1020 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KA1 VEFSFYLGYPVLQIAEPFQYPQLNLSQLLKSSWVRTVLLGVMEKQ--LQNEVFQAEMERK .::: :: : ::::..::.:..:. .. :: ::: :: .. :.:. : ::.. CCDS44 ELVGFYLTYPPLTIAEPLEYPNLDISETTRDYWVITVLQGVDNSLVGLHNQSFARVMEQR 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KA1 LAQLLSEVSTRRRMWRRATVAAGNSVVQVVNVSRLEGDDNPVQLIYFVEDQDGERLSAVK ::::. . . : ..:::. :. .::.:...:. : .:..: :.. .:. : .. CCDS44 LAQLFMMSQQQGRRFKRATTL-GSYTVQMVKMQRVPGPKDPAELTYYTL-YNGKPLLGTA 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KA1 SSDLINKMDLQRAAIILGYRIQGVIAQPVDRVKRPSPESQSNNLWVIVGVVIPVLVVMVI .. ... .: :: :. : ... . :.:: :: : : ::::.:..:. :. :: :: CCDS44 AAKILSTIDSQRMALTL-HHVVLLQADPV--VKNP-P----NNLWIIAAVLAPIAVVTVI 1150 1160 1170 1180 1190 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KA1 VVILYWKLCRTDKLDFQPDTVANIQQRQKLQIPSVKGFDFAKQHLGQHNKDD--ILIIHE ..:. ::: .: ::.:::. :. :: : : :.:::.:::::::.. :. : . .: CCDS44 IIIITAVLCRKNKNDFKPDTMINLPQRAK---P-VQGFDYAKQHLGQQGADEEVIPVTQE 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KA1 PAPLPGPLKDHTTPSENGDVPSPKSKIPS-KNVRHRGRVSPSDADSTVSEESSERDAGDK . :: :..: .:.: :: . : : . :... : :::. :..:.::.. ..: . CCDS44 TVVLPLPIRD--APQER-DVAQDGSTIKTAKSTETRKSRSPSENGSVISNESGKPSSGRR 1260 1270 1280 1290 1300 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KA1 TPGAV-NDGRSHRAPQSGPPLPSSGNEQHSSASIFEHVDRISRPPEASRRVPSKIQLIAM .: : . . . .:.: .:. .: .:.. .... : . ...::::. CCDS44 SPQNVMAQQKVTKEEARKRNVPASDEEE--GAVLFDNSSKVAAEPFDTSS--GSVQLIAI 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KA1 QPIPAPPVQRPSPADRVAESNKI-NKEIQTALRHKSEIEHHRNKIRLRAKRRGHYEFPVV .: : : : .:: ::. . : :.. ::..::.:::.:::.::.:::.:.:.::.: CCDS44 KPTALPMV--PPTSDRSQESSAVLNGEVNKALKQKSDIEHYRNKLRLKAKRKGYYDFPAV 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KA1 DDLSSGDTKERHRVYRRAQMQIDKILDPTASVPSVFIEPRKSSRIKRSPKPRRKHQVNGC . :.: : ::...:..: .....::: . . . : : .. ...: : :. . CCDS44 ET-SKGLT-ERKKMYEKAPKEMEHVLDPDSELCAPFTESKNRQQMKNSVYRSRQSLNSPS 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KA1 PADAEKDRLITTDSDGTYRRPPGVHNSAYIGCPSDPDLPAD-----VQTPSSVELGRYPA :...: : :.: . :: :..::.: ..:.. . : : . .: . CCDS44 PGETEMDLLVTRERP---RR--GIRNSGY---DTEPEIIEETNIDRVPEPRGYSRSRQ-V 1490 1500 1510 1520 1530 1590 1600 1610 1620 1630 1640 pF1KA1 LPFPASQYIPPQPSIEEARQTMHSLLDDAFALV----APSSQPASTAGVGPGVPPGLPAN .. . ::::.:.:: :: ::..::.:. : .:. . : . .: . .. CCDS44 KGHSETSTLSSQPSIDEVRQQMHMLLEEAFSLASAGHAGQSRHQEAYGSAQHLPYSEVVT 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1650 1660 1670 1680 1690 pF1KA1 STPSQEER-RA-TQWGSFYSPAQ---TANNPCSRYE---DYGMTPPTGPLPRPGFGP--- :.:. : :: .:: : : . . : :. .. : : :.: : :: CCDS44 SAPGTMTRPRAGVQWVPTYRPEMYQYSLPRPAYRFSQLPEMVMGSPPPPVP-PRTGPVAV 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1700 1710 1720 1730 1740 pF1KA1 -GLLQST----------ELVPPDPQQPQASAEAPFAARGIYSEEMPSVARPRPVGGTTGS .: .:: : . :.: : . :: .:: : . . . . .:. CCDS44 ASLRRSTSDIGSKTRMAESTGPEPAQLHDSASFTQMSRGPVS----VTQLDQSALNYSGN 1660 1670 1680 1690 1700 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KA1 QIQHLTQVGIASRIGAQPVEIPPSRGSQYGGPGWPSY-GEDE-----------AGRREAV . . . :.: : :: . :.: . .: :: ::.: : :: CCDS44 TVPAVFAIPAANRPGFTGYFIP-TPPSSYRNQAWMSYAGENELPSQWADSVPLPGYIEAY 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1800 1810 1820 1830 pF1KA1 PRTSGREPSAPSGNLPHRGLQG----PGLGY-PTSSTEDLQ-------PGH------SSA ::. : :.. . ::.. : :.: :. :: : :. :.: CCDS44 PRS--RYPQSSPSRLPRQYSQPANLHPSLEQAPAPSTAASQQSLAENDPSDAPLTNISTA 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1840 1850 pF1KA1 SLIKAIREELLRLSQKQSTVQNFHS .:.::::::. .:..::. . .:. CCDS44 ALVKAIREEVAKLAKKQTDMFEFQV 1830 1840 1858 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Wed Nov 2 21:24:48 2016 done: Wed Nov 2 21:24:50 2016 Total Scan time: 6.120 Total Display time: 0.440 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]