Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1558
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1558, 879 aa
1>>>pF1KA1558 879 - 879 aa - 879 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2408+/-0.000986; mu= 12.3241+/- 0.060
mean_var=115.0340+/-22.274, 0's: 0 Z-trim(109.0): 19 B-trim: 393 in 1/51
Lambda= 0.119581
statistics sampled from 10549 (10563) to 10549 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.324), width: 16
Scan time: 3.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53671.1 PPP6R3 gene_id:55291|Hs108|chr11 ( 879) 5775 1007.7 0
CCDS53672.1 PPP6R3 gene_id:55291|Hs108|chr11 ( 873) 5709 996.3 0
CCDS53673.1 PPP6R3 gene_id:55291|Hs108|chr11 ( 867) 5287 923.5 0
CCDS53674.1 PPP6R3 gene_id:55291|Hs108|chr11 ( 844) 3386 595.6 1.3e-169
CCDS53675.1 PPP6R3 gene_id:55291|Hs108|chr11 ( 791) 2138 380.2 7.8e-105
CCDS8182.1 PPP6R3 gene_id:55291|Hs108|chr11 ( 793) 2138 380.2 7.8e-105
CCDS46186.1 PPP6R1 gene_id:22870|Hs108|chr19 ( 881) 2135 379.7 1.2e-104
CCDS56235.1 PPP6R2 gene_id:9701|Hs108|chr22 ( 933) 1867 333.5 1.1e-90
CCDS33681.1 PPP6R2 gene_id:9701|Hs108|chr22 ( 932) 1794 320.9 6.5e-87
CCDS56236.1 PPP6R2 gene_id:9701|Hs108|chr22 ( 927) 1790 320.2 1.1e-86
CCDS74881.1 PPP6R2 gene_id:9701|Hs108|chr22 ( 959) 1685 302.1 3.1e-81
>>CCDS53671.1 PPP6R3 gene_id:55291|Hs108|chr11 (879 aa)
initn: 5775 init1: 5775 opt: 5775 Z-score: 5385.9 bits: 1007.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5775; 100.0% identity (100.0% similar) in 879 aa overlap (1-879:1-879)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MFWKFDLHSSSHIDTLLEREDVTLKELMDEEDVLQECKAQNRKLIEFLLKAECLEDLVSF
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CCDS53 MFWKFDLHSSSHIDTLLEREDVTLKELMDEEDVLQECKAQNRKLIEFLLKAECLEDLVSF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 IIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNDSPLNPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNDSPLNPLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 ASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKHDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKHDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 DVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIVRLSRDQMLQIQNSTEPDPLLA
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CCDS53 DVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIVRLSRDQMLQIQNSTEPDPLLA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRPTFEGHIEICPPGMSHSACS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRPTFEGHIEICPPGMSHSACS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 VNKSVLEAIRGRLGSFHELLLEPPKKSVMKTTWGVLDPPVGNTRLNVIRLISSLLQTNTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VNKSVLEAIRGRLGSFHELLLEPPKKSVMKTTWGVLDPPVGNTRLNVIRLISSLLQTNTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 SINGDLMELNSIGVILNMFFKYTWNNFLHTQVEICIALILASPFENTENATITDQDSTGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SINGDLMELNSIGVILNMFFKYTWNNFLHTQVEICIALILASPFENTENATITDQDSTGD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NLLLKHLFQKCQLIERILEAWEMNEKKQAEGGRRHGYMGHLTRIANCIVHSTDKGPNSAL
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CCDS53 NLLLKHLFQKCQLIERILEAWEMNEKKQAEGGRRHGYMGHLTRIANCIVHSTDKGPNSAL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 VQQLIKDLPDEVRERWETFCTSSLGETNKRNTVDLVTTCHIHSSSDDEIDFKETGFSQDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VQQLIKDLPDEVRERWETFCTSSLGETNKRNTVDLVTTCHIHSSSDDEIDFKETGFSQDS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SLQQAFSDYQMQQMTSNFIDQFGFNDEKFADQDDIGNVSFDRVSDINFTLNTNESGNIAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SLQQAFSDYQMQQMTSNFIDQFGFNDEKFADQDDIGNVSFDRVSDINFTLNTNESGNIAL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 FEACCKERIQQFDDGGSDEEDIWEEKHIAFTPESQRRSSSGSTDSEESTDSEEEDGAKQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FEACCKERIQQFDDGGSDEEDIWEEKHIAFTPESQRRSSSGSTDSEESTDSEEEDGAKQD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LFEPSSANTEDKMEVDLSEPPNWSANFDVPMETTHGAPLDSVGSDVWSTEEPMPTKETGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LFEPSSANTEDKMEVDLSEPPNWSANFDVPMETTHGAPLDSVGSDVWSTEEPMPTKETGW
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 ASFSEFTSSLSTKDSLRSNSPVEMETSTEPMDPLTPSAAALAVQPEAAGSVAMEASSDGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ASFSEFTSSLSTKDSLRSNSPVEMETSTEPMDPLTPSAAALAVQPEAAGSVAMEASSDGE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 EDAESTDKVTETVMNGGMKETLSLTVDAKTETAVFKRVLKSYREEGKLSTSQDAACKDAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EDAESTDKVTETVMNGGMKETLSLTVDAKTETAVFKRVLKSYREEGKLSTSQDAACKDAE
790 800 810 820 830 840
850 860 870
pF1KA1 ECPETAEAKCAAPRPPSSSPEQRTGQPSAPGDTSVNGPV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ECPETAEAKCAAPRPPSSSPEQRTGQPSAPGDTSVNGPV
850 860 870
>>CCDS53672.1 PPP6R3 gene_id:55291|Hs108|chr11 (873 aa)
initn: 5718 init1: 5345 opt: 5709 Z-score: 5324.4 bits: 996.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5709; 99.2% identity (99.2% similar) in 879 aa overlap (1-879:1-873)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MFWKFDLHSSSHIDTLLEREDVTLKELMDEEDVLQECKAQNRKLIEFLLKAECLEDLVSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MFWKFDLHSSSHIDTLLEREDVTLKELMDEEDVLQECKAQNRKLIEFLLKAECLEDLVSF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 IIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNDSPLNPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNDSPLNPLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 ASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKHDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKHDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 DVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIVRLSRDQMLQIQNSTEPDPLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIVRLSRDQMLQIQNSTEPDPLLA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRPTFEGHIEICPPGMSHSACS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRPTFEGHIEICPPGMSHSACS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 VNKSVLEAIRGRLGSFHELLLEPPKKSVMKTTWGVLDPPVGNTRLNVIRLISSLLQTNTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VNKSVLEAIRGRLGSFHELLLEPPKKSVMKTTWGVLDPPVGNTRLNVIRLISSLLQTNTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 SINGDLMELNSIGVILNMFFKYTWNNFLHTQVEICIALILASPFENTENATITDQDSTGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SINGDLMELNSIGVILNMFFKYTWNNFLHTQVEICIALILASPFENTENATITDQDSTGD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NLLLKHLFQKCQLIERILEAWEMNEKKQAEGGRRHGYMGHLTRIANCIVHSTDKGPNSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NLLLKHLFQKCQLIERILEAWEMNEKKQAEGGRRHGYMGHLTRIANCIVHSTDKGPNSAL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 VQQLIKDLPDEVRERWETFCTSSLGETNKRNTVDLVTTCHIHSSSDDEIDFKETGFSQDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VQQLIKDLPDEVRERWETFCTSSLGETNKRNTVDLVTTCHIHSSSDDEIDFKETGFSQDS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SLQQAFSDYQMQQMTSNFIDQFGFNDEKFADQDDIGNVSFDRVSDINFTLNTNESGNIAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SLQQAFSDYQMQQMTSNFIDQFGFNDEKFADQDDIGNVSFDRVSDINFTLNTNESGNIAL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 FEACCKERIQQFDDGGSDEEDIWEEKHIAFTPESQRRSSSGSTDSEESTDSEEEDGAKQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FEACCKERIQQFDDGGSDEEDIWEEKHIAFTPESQRRSSSGSTDSEESTDSEEEDGAKQD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LFEPSSANTEDKMEVDLSEPPNWSANFDVPMETTHGAPLDSVGSDVWSTEEPMPTKETGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LFEPSSANTEDKMEVDLSEPPNWSANFDVPMETTHGAPLDSVGSDVWSTEEPMPTKETGW
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 ASFSEFTSSLSTKDSLRSNSPVEMETSTEPMDPLTPSAAALAVQPEAAGSVAMEASSDGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ASFSEFTSSLSTKDSLRSNSPVEMETSTEPMDPLTPSAAALAVQPEAAGSVAMEASSDGE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 EDAESTDKVTETVMNGGMKETLSLTVDAKTETAVFKRVLKSYREEGKLSTSQDAACKDAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS53 EDAESTDKVTETVMNGGMKETLSLTVDAKTETAVFKS------EEGKLSTSQDAACKDAE
790 800 810 820 830
850 860 870
pF1KA1 ECPETAEAKCAAPRPPSSSPEQRTGQPSAPGDTSVNGPV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ECPETAEAKCAAPRPPSSSPEQRTGQPSAPGDTSVNGPV
840 850 860 870
>>CCDS53673.1 PPP6R3 gene_id:55291|Hs108|chr11 (867 aa)
initn: 3937 init1: 3564 opt: 5287 Z-score: 4931.0 bits: 923.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5646; 98.5% identity (98.5% similar) in 879 aa overlap (1-879:1-867)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MFWKFDLHSSSHIDTLLEREDVTLKELMDEEDVLQECKAQNRKLIEFLLKAECLEDLVSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MFWKFDLHSSSHIDTLLEREDVTLKELMDEEDVLQECKAQNRKLIEFLLKAECLEDLVSF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 IIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNDSPLNPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNDSPLNPLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 ASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKHDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKHDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 DVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIVRLSRDQMLQIQNSTEPDPLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIVRLSRDQMLQIQNSTEPDPLLA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRPTFEGHIEICPPGMSHSACS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRPTFEGHIEICPPGMSHSACS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 VNKSVLEAIRGRLGSFHELLLEPPKKSVMKTTWGVLDPPVGNTRLNVIRLISSLLQTNTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VNKSVLEAIRGRLGSFHELLLEPPKKSVMKTTWGVLDPPVGNTRLNVIRLISSLLQTNTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 SINGDLMELNSIGVILNMFFKYTWNNFLHTQVEICIALILASPFENTENATITDQDSTGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SINGDLMELNSIGVILNMFFKYTWNNFLHTQVEICIALILASPFENTENATITDQDSTGD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 NLLLKHLFQKCQLIERILEAWEMNEKKQAEGGRRHGYMGHLTRIANCIVHSTDKGPNSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NLLLKHLFQKCQLIERILEAWEMNEKKQAEGGRRHGYMGHLTRIANCIVHSTDKGPNSAL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 VQQLIKDLPDEVRERWETFCTSSLGETNKRNTVDLVTTCHIHSSSDDEIDFKETGFSQDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VQQLIKDLPDEVRERWETFCTSSLGETNKRNTVDLVTTCHIHSSSDDEIDFKETGFSQDS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 SLQQAFSDYQMQQMTSNFIDQFGFNDEKFADQDDIGNVSFDRVSDINFTLNTNESGNIAL
::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SLQ------QMQQMTSNFIDQFGFNDEKFADQDDIGNVSFDRVSDINFTLNTNESGNIAL
550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 FEACCKERIQQFDDGGSDEEDIWEEKHIAFTPESQRRSSSGSTDSEESTDSEEEDGAKQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FEACCKERIQQFDDGGSDEEDIWEEKHIAFTPESQRRSSSGSTDSEESTDSEEEDGAKQD
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LFEPSSANTEDKMEVDLSEPPNWSANFDVPMETTHGAPLDSVGSDVWSTEEPMPTKETGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LFEPSSANTEDKMEVDLSEPPNWSANFDVPMETTHGAPLDSVGSDVWSTEEPMPTKETGW
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 ASFSEFTSSLSTKDSLRSNSPVEMETSTEPMDPLTPSAAALAVQPEAAGSVAMEASSDGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ASFSEFTSSLSTKDSLRSNSPVEMETSTEPMDPLTPSAAALAVQPEAAGSVAMEASSDGE
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 EDAESTDKVTETVMNGGMKETLSLTVDAKTETAVFKRVLKSYREEGKLSTSQDAACKDAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS53 EDAESTDKVTETVMNGGMKETLSLTVDAKTETAVFKS------EEGKLSTSQDAACKDAE
780 790 800 810 820
850 860 870
pF1KA1 ECPETAEAKCAAPRPPSSSPEQRTGQPSAPGDTSVNGPV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ECPETAEAKCAAPRPPSSSPEQRTGQPSAPGDTSVNGPV
830 840 850 860
>>CCDS53674.1 PPP6R3 gene_id:55291|Hs108|chr11 (844 aa)
initn: 3772 init1: 3371 opt: 3386 Z-score: 3158.8 bits: 595.6 E(32554): 1.3e-169
Smith-Waterman score: 5448; 95.9% identity (95.9% similar) in 879 aa overlap (1-879:1-844)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MFWKFDLHSSSHIDTLLEREDVTLKELMDEEDVLQECKAQNRKLIEFLLKAECLEDLVSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MFWKFDLHSSSHIDTLLEREDVTLKELMDEEDVLQECKAQNRKLIEFLLKAECLEDLVSF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 IIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNDSPLNPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNDSPLNPLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 ASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKHDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKHDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 DVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIVRLSRDQMLQIQNSTEPDPLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIVRLSRDQMLQIQNSTEPDPLLA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRPTFEGHIEICPPGMSHSACS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRPTFEGHIEICPPGMSHSACS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 VNKSVLEAIRGRLGSFHELLLEPPKKSVMKTTWGVLDPPVGNTRLNVIRLISSLLQTNTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VNKSVLEAIRGRLGSFHELLLEPPKKSVMKTTWGVLDPPVGNTRLNVIRLISSLLQTNTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SINGDLMELNSIGVILNMFFKYTWNNFLHTQVEICIALILASPFENTENATITDQDSTGD
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430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NLLLKHLFQKCQLIERILEAWEMNEKKQAEGGRRHGYMGHLTRIANCIVHSTDKGPNSAL
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FEACCKERIQQFDDGGSDEEDIWEEKHIAFTPESQRRSSSGSTDSEESTDSEEEDGAKQD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRPTFEGHIEICPPGMSHSACS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NLLLKHLFQKCQLIERILEAWEMNEKKQAEGGRRHGYMGHLTRIANCIVHSTDKGPNSAL
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pF1KA1 VQQLIKDLPDEVRERWETFCTSSLGETNKRNTVDLVTTCHIHSSSDDEIDFKETGFSQDS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VQQLIKDLPDEVRERWETFCTSSLGETNKRNTVDL-------------------------
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ----AFSDYQMQQMTSNFIDQFGFNDEKFADQDDIGNVSFDRVSDINFTLNTNESGNIAL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FEACCKERIQQFDDGGSDEEDIWEEKHIAFTPESQRRSSSGSTDSEESTDSEEEDGAKQD
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pF1KA1 LFEPSSANTEDKMEVDLSEPPNWSANFDVPMETTHGAPLDSVGSDVWSTEEPMPTKETGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KA1 ASFSEFTSSLSTKDSLRSNSPVEMETSTEPMDPLTPSAAALAVQPEAAGSVAMEASSDGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ASFSEFTSSLSTKDSLRSNSPVEMETSTEPMDPLTPSAAALAVQPEAAGSVAMEASSDGE
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pF1KA1 EDAESTDKVTETVMNGGMKETLSLTVDAKTETAVFKRVLKSYREEGKLSTSQDAACKDAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS53 EDAESTDKVTETVMNGGMKETLSLTVDAKTETAVFKS------EEGKLSTSQDAACKDAE
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pF1KA1 ECPETAEAKCAAPRPPSSSPEQRTGQ-PSAPGDTSVNGPV
:::::::::::::::::::::: . :. ::. :
CCDS53 ECPETAEAKCAAPRPPSSSPEQSGVEIPALPGQWSQQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNDSPLNPLL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKHDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIVRLSRDQMLQIQNSTEPDPLLA
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CCDS81 TLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRPTFEGHIEICPPGMSHSACS
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CCDS81 VNKSVLEAIRGRLGSFHELLLEPPK-----------------------------------
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CCDS81 ----------------NMFFKYTWNNFLHTQVEICIALILASPFENTENATITDQDSTGD
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pF1KA1 NLLLKHLFQKCQLIERILEAWEMNEKKQAEGGRRHGYMGHLTRIANCIVHSTDKGPNSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NLLLKHLFQKCQLIERILEAWEMNEKKQAEGGRRHGYMGHLTRIANCIVHSTDKGPNSAL
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pF1KA1 VQQLIKDLPDEVRERWETFCTSSLGETNKRNTVDLVTTCHIHSSSDDEIDFKETGFSQDS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VQQLIKDLPDEVRERWETFCTSSLGETNKRNTVDL-------------------------
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ----AFSDYQMQQMTSNFIDQFGFNDEKFADQDDIGNVSFDRVSDINFTLNTNESGNIAL
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CCDS81 FEACCKERIQQFDDGGSDEEDIWEEKHIAFTPESQRRSSSGSTDSEESTDSEEEDGAKQD
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pF1KA1 LFEPSSANTEDKMEVDLSEPPNWSANFDVPMETTHGAPLDSVGSDVWSTEEPMPTKETGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LFEPSSANTEDKMEVDLSEPPNWSANFDVPMETTHGAPLDSVGSDVWSTEEPMPTKETGW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ASFSEFTSSLSTKDSLRSNSPVEMETSTEPMDPLTPSAAALAVQPEAAGSVAMEASSDGE
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pF1KA1 EDAESTDKVTETVMNGGMKETLSLTVDAKTETAVFKRVLKSYREEGKLSTSQDAACKDAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS81 EDAESTDKVTETVMNGGMKETLSLTVDAKTETAVFKS------EEGKLSTSQDAACKDAE
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pF1KA1 ECPETAEAKCAAPRPPSSSPEQRTGQPSAPGDTSVNGPV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ECPETAEAKCAAPRPPSSSPEQRTGQPSAPGDTSVNGPV
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pF1KA1 MFWKFDLHSSSHIDTLLEREDVTLKELMDEEDVLQECKAQNRKLIEFLLKAECLEDLVSF
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CCDS46 MFWKFDLHTSSHLDTLLEREDLSLPELLDEEDVLQECKVVNRKLLDFLLQPPHLQAMVAW
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pF1KA1 IIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNDSPLNPLL
. .:::.. .:..:::::...::.::::: :.:: :: ::::: .::.:: . . :::::
CCDS46 VTQEPPDSGEERLRYKYPSVACEILTSDVPQINDALGADESLLNRLYGFLQSTGSLNPLL
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pF1KA1 ASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKHDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQ
:::::::..:::.:: .:.:.::.:: :::::...:::::::::::::::::.: :: ::
CCDS46 ASFFSKVMGILINRKTDQLVSFLRKKDDFVDLLLQHIGTSAIMDLLLRLLTCVERPQLRQ
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pF1KA1 DVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIVRLSRDQMLQIQNSTEPDPLLA
::.::::::::.:::.: .:::..:..:::::::::.:.::::.::.:.:.: ::: :::
CCDS46 DVVNWLNEEKIVQRLIEQIHPSKDENQHSNASQSLCDIIRLSREQMIQVQDSPEPDQLLA
190 200 210 220 230 240
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pF1KA1 TLEKQEIIEQLLSNIFHKEKNESAIVSAIQILLTLLETRRP------------TFEGHIE
:::::: :::::::.:. :...:.:::.::.:::::: ::: . .:..:
CCDS46 TLEKQETIEQLLSNMFEGEQSQSVIVSGIQVLLTLLEPRRPRSESVTVNSFFSSVDGQLE
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 ICPPGMSHSACSVNKSVLEAIRGRLGSFHELLLEPPKKSVMKTTWGVLDPPVGNTRLNVI
. : .:. : . ..:.:.: ::. ::.::::::: .. :::.: ::.:::::.:.
CCDS46 LLAQGALESTVS-SVGALHALRPRLSCFHQLLLEPPKLEPLQMTWGMLAPPLGNTRLHVV
310 320 330 340 350
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pF1KA1 RLISSLLQTNTSSINGDLMELNSIGVILNMFFKYTWNNFLHTQVEICIALILA--SPFEN
.:..: :..: .... .:. :. ...:..::.:..:::::.::: :.. .:. : ..
CCDS46 KLLASALSANDAALTHELLALDVPNTMLDLFFHYVFNNFLHAQVEGCVSTMLSLGPPPDS
360 370 380 390 400 410
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pF1KA1 TENATITDQDSTGDNLLLKHLFQKCQLIERILEAWEMNEKKQAEGGRRHGYMGHLTRIAN
. .. : .: ..:::.:.:.:.:::: .:: :.. : :: :.::::::::.:.
CCDS46 SPETPI-------QNPVVKHLLQQCRLVERILTSWEENDRVQCAGGPRKGYMGHLTRVAG
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 CIVHSTDKGPNSALVQQLIKDLPDEVRERWETFCTSSLGETNKRNTVDLVTTCHIHSSSD
.:..:.::::. ..::.:.::.: .:.::.: .. :.::::.: ::::.: :.:::::
CCDS46 ALVQNTEKGPNAEQLRQLLKELPSEQQEQWEAFVSGPLAETNKKNMVDLVNTHHLHSSSD
480 490 500 510 520 530
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pF1KA1 DEID-FKETGFSQDSSLQQAFSDYQMQQMTSNFIDQFGFNDEKFADQDDIGNVSFDRVSD
:: : .:: .: ... ::::: :.:::.::: :::.::::::.:..:.. :. ::....
CCDS46 DEDDRLKEFNFPEEAVLQQAFMDFQMQRMTSAFIDHFGFNDEEFGEQEESVNAPFDKTAN
540 550 560 570 580 590
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pF1KA1 INFTLNTN-ESGNIALFEACCKERIQQFDD-------------GGSDEED-IWEEKHIAF
:.:.::.. :. : :.: : :.::::::: : :: :: :. ...:
CCDS46 ITFSLNADDENPNANLLEICYKDRIQQFDDDEEEEDEEEAQGSGESDGEDGAWQGSQLAR
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680
pF1KA1 -----TPESQRRSSSGSTDSE--ESTDSEEEDGAKQDLFEPSSANTEDKMEVDLSEPP--
: . : :.:::::: : : :::. . .. : .. .::
CCDS46 GARLGQPPGVR--SGGSTDSEDEEEEDEEEEEDEEGIGCAARGGATPLSYPSPGPQPPGP
660 670 680 690 700 710
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pF1KA1 NWSANFDVPMETTHGAPLDSVGSDVWSTEEPMPTKETGWASFSEFTSSLSTKDSLRSNSP
.:.:.:: :. : :. : : :: . : . . ..: :. :: : :
CCDS46 SWTATFD-PV------PTDAPTSPRVSGEEELHTGPPAPQGPLSVPQGLPTQ-SLAS-PP
720 730 740 750 760
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pF1KA1 VEMETSTEPMDPLTPSAAALAVQPEAAGSVAMEASSDGEEDAESTDKVTETVMNGGMKET
.. . . .:: ::: :. : ..: . .: . : : .. :
CCDS46 ARDALQLRSQDPTPPSA------PQEA--------TEGSKVTEPSAPCQALVSIGDLQAT
770 780 790 800
810 820 830 840 850
pF1KA1 LSLTVDAKTETAVFKRVLKSYREEGKLSTSQDAACKDAEECPETAEAKCAAPRP---PSS
. .: . . .. :. ::: :. :.. :.:.:.. .:.: :.:
CCDS46 FHGIRSAPSSSD------SATRDP---STSVPAS--GAHQPPQTTEGE-KSPEPLGLPQS
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860 870
pF1KA1 SPEQRTGQPSAPGDTSVNGPV
. : : :. .. .::
CCDS46 QSAQALTPPPIPNGSAPEGPASPGSQ
860 870 880
>>CCDS56235.1 PPP6R2 gene_id:9701|Hs108|chr22 (933 aa)
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pF1KA1 MFWKFDLHSSSHIDTLLEREDVTLKELMDEEDVLQECKAQNRKLIEFLLKAECLEDLVSF
:::::::...::.: ::..: :::.:::::.:.::::::::.::..:: . .:.:.:::.
CCDS56 MFWKFDLNTTSHVDKLLDKEHVTLQELMDEDDILQECKAQNQKLLDFLCRQQCMEELVSL
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pF1KA1 IIEEPPQDMDEKIRYKYPNISCELLTSDVSQMNDRLGEDESLLMKLYSFLLNDSPLNPLL
: ..:: ::.::.:.:::: .::::: :: :..:::: ::::: ::.:: .. ::::::
CCDS56 ITQDPPLDMEEKVRFKYPNTACELLTCDVPQISDRLGGDESLLSLLYDFLDHEPPLNPLL
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pF1KA1 ASFFSKVLSILISRKPEQIVDFLKKKHDFVDLIIKHIGTSAIMDLLLRLLTCIEPPQPRQ
::::::... ::.:: ::.. ::::: :..:..:::::::.:::::::..:.:: ::
CCDS56 ASFFSKTIGNLIARKTEQVITFLKKKDKFISLVLKHIGTSALMDLLLRLVSCVEPAGLRQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 DVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIVRLSRDQMLQIQNSTEPDPLLA
:::.::::::.::::::..::::.:::.:::::.::.::::.::: :.:.. ::::::.
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CCDS33 APAVAVPPEATVAITTALSKAGPAIPTPAVSSALAVAVPLGPIMAVTAAPAMVATLGTVT
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CCDS56 ASFFSKTIGNLIARKTEQVITFLKKKDKFISLVLKHIGTSALMDLLLRLVSCVEPAGLRQ
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pF1KA1 DVLNWLNEEKIIQRLVEIVHPSQEEDRHSNASQSLCEIVRLSRDQMLQIQNSTEPDPLLA
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CCDS56 DVLHWLNEEKVIQRLVELIHPSQDEDRQSNASQTLCDIVRLGRDQGSQLQEALEPDPLLT
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CCDS56 ------------------------AFSDYQIQQMTANFVDQFGFNDEEFADQDDNINAPF
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pF1KA1 DRVSDINFTLNTNE-SGNIALFEACCKERIQQFDDGGSDEEDIWEEKHIAFTPESQRRSS
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CCDS56 DRIAEINFNIDADEDSPSAALFEACCSDRIQPFDD--DEDEDIWEDSDTRCAARVMARPR
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CCDS56 DTECSHAEGSRSQGPEKAFSPASPCAWNVCVT-RKAPLLASDSSSSGGSHSEDGDQKAAS
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pF1KA1 VMN----GGMKETLSLTVDAKTETAVFKRVLKSYREEGKLSTSQDAACKDAEECPETAEA
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CCDS56 AMDAVSRGPGREAPPLPTVARTEEAV-----------GRVGCADSRLLSPACPAPKEVTA
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pF1KA1 KCAAPRPPSSSPEQRTGQPSAPGDTSVNGPV
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CCDS56 APAVAVPPEATVAITTALSKAGPAIPTPAVSSALAVAVPLGPIMAVTAAPAMVATLGTVT
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879 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]