FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1560, 828 aa 1>>>pF1KA1560 828 - 828 aa - 828 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6327+/-0.000435; mu= 18.9882+/- 0.027 mean_var=75.6444+/-14.752, 0's: 0 Z-trim(110.3): 26 B-trim: 33 in 1/54 Lambda= 0.147464 statistics sampled from 18633 (18658) to 18633 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.576), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16 Scan time: 10.260 The best scores are: opt bits E(85289) XP_005270055 (OMIM: 602395) PREDICTED: glycerol-3- ( 828) 5440 1167.7 0 NP_001231878 (OMIM: 602395) glycerol-3-phosphate a ( 828) 5440 1167.7 0 NP_065969 (OMIM: 602395) glycerol-3-phosphate acyl ( 828) 5440 1167.7 0 XP_016858913 (OMIM: 616431) PREDICTED: glycerol-3- ( 801) 1086 241.4 1.3e-62 NP_001308455 (OMIM: 616431) glycerol-3-phosphate a ( 801) 1086 241.4 1.3e-62 NP_001308454 (OMIM: 616431) glycerol-3-phosphate a ( 801) 1086 241.4 1.3e-62 NP_001308456 (OMIM: 616431) glycerol-3-phosphate a ( 801) 1086 241.4 1.3e-62 NP_997211 (OMIM: 616431) glycerol-3-phosphate acyl ( 795) 1048 233.3 3.4e-60 XP_006712374 (OMIM: 616431) PREDICTED: glycerol-3- ( 721) 894 200.5 2.3e-50 XP_006712371 (OMIM: 616431) PREDICTED: glycerol-3- ( 729) 894 200.5 2.3e-50 NP_001308457 (OMIM: 616431) glycerol-3-phosphate a ( 758) 894 200.5 2.4e-50 XP_006712376 (OMIM: 616431) PREDICTED: glycerol-3- ( 677) 864 194.1 1.8e-48 XP_006712375 (OMIM: 616431) PREDICTED: glycerol-3- ( 685) 864 194.1 1.8e-48 NP_001308460 (OMIM: 616431) glycerol-3-phosphate a ( 671) 826 186.0 4.8e-46 XP_005263945 (OMIM: 616431) PREDICTED: glycerol-3- ( 671) 826 186.0 4.8e-46 XP_016858915 (OMIM: 616431) PREDICTED: glycerol-3- ( 651) 793 179.0 6.1e-44 XP_016858914 (OMIM: 616431) PREDICTED: glycerol-3- ( 659) 793 179.0 6.2e-44 NP_001303279 (OMIM: 222765,602744) dihydroxyaceton ( 619) 452 106.4 4.1e-22 XP_005273370 (OMIM: 222765,602744) PREDICTED: dihy ( 679) 452 106.4 4.4e-22 NP_055051 (OMIM: 222765,602744) dihydroxyacetone p ( 680) 452 106.4 4.4e-22 XP_011542605 (OMIM: 222765,602744) PREDICTED: dihy ( 571) 424 100.4 2.4e-20 XP_011542606 (OMIM: 222765,602744) PREDICTED: dihy ( 571) 424 100.4 2.4e-20 NP_001308459 (OMIM: 616431) glycerol-3-phosphate a ( 724) 324 79.2 7.3e-14 NP_001308458 (OMIM: 616431) glycerol-3-phosphate a ( 730) 324 79.2 7.3e-14 >>XP_005270055 (OMIM: 602395) PREDICTED: glycerol-3-phos (828 aa) initn: 5440 init1: 5440 opt: 5440 Z-score: 6251.3 bits: 1167.7 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5440; 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