FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1565, 1275 aa
1>>>pF1KA1565 1275 - 1275 aa - 1275 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.8315+/-0.00179; mu= -10.7471+/- 0.105
mean_var=514.6587+/-111.337, 0's: 0 Z-trim(107.7): 201 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.056535
statistics sampled from 9571 (9733) to 9571 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.299), width: 16
Scan time: 5.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32078.2 NIN gene_id:51199|Hs108|chr14 (1377) 8007 669.7 1.4e-191
CCDS32079.1 NIN gene_id:51199|Hs108|chr14 (2090) 5290 448.3 1e-124
CCDS82605.1 NINL gene_id:22981|Hs108|chr20 (1033) 1248 118.3 1e-25
CCDS33452.1 NINL gene_id:22981|Hs108|chr20 (1382) 1182 113.0 5.4e-24
>>CCDS32078.2 NIN gene_id:51199|Hs108|chr14 (1377 aa)
initn: 5517 init1: 5449 opt: 8007 Z-score: 3552.7 bits: 669.7 E(32554): 1.4e-191
Smith-Waterman score: 8007; 99.9% identity (99.9% similar) in 1246 aa overlap (1-1245:1-1246)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MDEVEQDQHEARLKELFDSFDTTGTGSLGQEELTDLCHMLSLEEVAPVLQQTLLQDNLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDEVEQDQHEARLKELFDSFDTTGTGSLGQEELTDLCHMLSLEEVAPVLQQTLLQDNLLG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RVHFDQFKEALILILSRTLSNEEHFQEPDCSLEAQPKYVRGGKRYGRRSLPEFQESVEEF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PEVTVIEPLDEEARPSHIPAGDCSEHWKTQRSEEYEAEGQLRFWNPDDLNASQSGSSPPQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 DWIEEKLQEVCEDLGITRDGHLNRKKLVSICEQYGLQNVDGEMLEEVFHNLDPDGTMSVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DWIEEKLQEVCEDLGITRDGHLNRKKLVSICEQYGLQNVDGEMLEEVFHNLDPDGTMSVE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 DFFYGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQSFDESGRRTTTSSAMTSTIGFRVFSCLDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DFFYGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQSFDESGRRTTTSSAMTSTIGFRVFSCLDD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GMGHASVERILDTWQEEGIENSQEILKALDFSLDGNINLTELTLALENELLVTKNSIHQA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ALASFKAEIRHLLERVDQVVREKEKLRSDLDKAEKLKSLMASEVDDHHAAIERRNEYNLR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 KLDEEYKERIAALKNELRKEREQILQQAGKQRLELEQEIEKAKTEENYIRDRLALSLKEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KLDEEYKERIAALKNELRKEREQILQQAGKQRLELEQEIEKAKTEENYIRDRLALSLKEN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SRLENELLENAEKLAEYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLDPSSAEFFLQEERLTQMRNEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SRLENELLENAEKLAEYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLDPSSAEFFLQEERLTQMRNEY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 ERQCRVLQDQVDELQSELEEYRAQGRVLRLPLKNSPSEEVEANSGGIEPEHGLGSEECNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ERQCRVLQDQVDELQSELEEYRAQGRVLRLPLKNSPSEEVEANSGGIEPEHGLGSEECNP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 LNMSIEAELVIEQMKEQHHRDICCLRLELEDKVRHYEKQLDETVVSCKKAQENMKQRHEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LNMSIEAELVIEQMKEQHHRDICCLRLELEDKVRHYEKQLDETVVSCKKAQENMKQRHEN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 ETHTLEKQISDLKNEIAELQGQAAVLKEAHHEATCRHEEEKKQLQVKLEEEKTHLQEKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ETHTLEKQISDLKNEIAELQGQAAVLKEAHHEATCRHEEEKKQLQVKLEEEKTHLQEKLR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 LQHEMELKARLTQAQASFEREREGLQSSAWTEEKVRGLTQELEQFHQEQLTSLVEKHTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LQHEMELKARLTQAQASFEREREGLQSSAWTEEKVRGLTQELEQFHQEQLTSLVEKHTLE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 KEELRKELLEKHQRELQEGRYESEKLQQENSILRNEITTLNEEDSISNLKLGTLNGSQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KEELRKELLEKHQRELQEGRYESEKLQQENSILRNEITTLNEEDSISNLKLGTLNGSQEE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KA1 M-QKTETVKQENAAVQKMVENLKKQISELKIKNQQLDLENTELSQKNSQNQEKLQELNQR
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MWQKTETVKQENAAVQKMVENLKKQISELKIKNQQLDLENTELSQKNSQNQEKLQELNQR
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 LTEMLCQKEKEPGNSALEEREQEKFNLKEELERCKVQSSTLVSSLEAELSEVKIQTHIVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTEMLCQKEKEPGNSALEEREQEKFNLKEELERCKVQSSTLVSSLEAELSEVKIQTHIVQ
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 QENHLLKDELEKMKQLHRCPDLSDFQQKISSVLSYNEKLLKEKEALSEELNSCVDKLAKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QENHLLKDELEKMKQLHRCPDLSDFQQKISSVLSYNEKLLKEKEALSEELNSCVDKLAKS
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 SLLEHRIATMKQEQKSWEHQSASLKSQLVASQEKVQNLEDTVQNVNLQMSRMKSDLRVTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SLLEHRIATMKQEQKSWEHQSASLKSQLVASQEKVQNLEDTVQNVNLQMSRMKSDLRVTQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KA1 QEKEALKQEVMSLHKQLQNAGGKSWAPEIATHPSGLHNQQKRLSWDKLDHLMNEEQQLLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QEKEALKQEVMSLHKQLQNAGGKSWAPEIATHPSGLHNQQKRLSWDKLDHLMNEEQQLLW
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KA1 QENERLQTMVQNTKAELTHSREKVRQLESNLLPKHQKHLNPSGTMNPTEQEKLSLKRECD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QENERLQTMVQNTKAELTHSREKVRQLESNLLPKHQKHLNPSGTMNPTEQEKLSLKRECD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KA1 QFQKEQSPANRKVSQMNSLEQELETIHLENEGLKKKQVKLDEQLMENSVVGSSREGCSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QFQKEQSPANRKVSQMNSLEQELETIHLENEGLKKKQVKLDEQLMEMQHLRSTATPSPSP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1260 1270
pF1KA1 PEIVCEDAAPEVHCDA
CCDS32 HAWDLQLLQQQACPMVPREQFLQLQRQLLQAERINQHLQEELENRTSETNTPQGNQEQLV
1270 1280 1290 1300 1310 1320
>>CCDS32079.1 NIN gene_id:51199|Hs108|chr14 (2090 aa)
initn: 7766 init1: 5202 opt: 5290 Z-score: 2352.7 bits: 448.3 E(32554): 1e-124
Smith-Waterman score: 5345; 70.9% identity (84.1% similar) in 1261 aa overlap (1-1244:1-1208)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MDEVEQDQHEARLKELFDSFDTTGTGSLGQEELTDLCHMLSLEEVAPVLQQTLLQDNLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDEVEQDQHEARLKELFDSFDTTGTGSLGQEELTDLCHMLSLEEVAPVLQQTLLQDNLLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 RVHFDQFKEALILILSRTLSNEEHFQEPDCSLEAQPKYVRGGKRYGRRSLPEFQESVEEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RVHFDQFKEALILILSRTLSNEEHFQEPDCSLEAQPKYVRGGKRYGRRSLPEFQESVEEF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 PEVTVIEPLDEEARPSHIPAGDCSEHWKTQRSEEYEAEGQLRFWNPDDLNASQSGSSPPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PEVTVIEPLDEEARPSHIPAGDCSEHWKTQRSEEYEAEGQLRFWNPDDLNASQSGSSPPQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 DWIEEKLQEVCEDLGITRDGHLNRKKLVSICEQYGLQNVDGEMLEEVFHNLDPDGTMSVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DWIEEKLQEVCEDLGITRDGHLNRKKLVSICEQYGLQNVDGEMLEEVFHNLDPDGTMSVE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 DFFYGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQSFDESGRRTTTSSAMTSTIGFRVFSCLDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DFFYGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQSFDESGRRTTTSSAMTSTIGFRVFSCLDD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 GMGHASVERILDTWQEEGIENSQEILKALDFSLDGNINLTELTLALENELLVTKNSIHQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GMGHASVERILDTWQEEGIENSQEILKALDFSLDGNINLTELTLALENELLVTKNSIHQA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 ALASFKAEIRHLLERVDQVVREKEKLRSDLDKAEKLKSLMASEVDDHHAAIERRNEYNLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ALASFKAEIRHLLERVDQVVREKEKLRSDLDKAEKLKSLMASEVDDHHAAIERRNEYNLR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 KLDEEYKERIAALKNELRKEREQILQQAGKQRLELEQEIEKAKTEENYIRDRLALSLKEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KLDEEYKERIAALKNELRKEREQILQQAGKQRLELEQEIEKAKTEENYIRDRLALSLKEN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 SRLENELLENAEKLAEYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLDPSSAEFFLQEERLTQMRNEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SRLENELLENAEKLAEYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLDPSSAEFFLQEERLTQMRNEY
490 500 510 520 530 540
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pF1KA1 ERQCRVLQDQVDELQSELEEYRAQGRVLRLPLKNSPSEEVEANSGGIEPEHGLGSEECNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ERQCRVLQDQVDELQSELEEYRAQGRVLRLPLKNSPSEEVEANSGGIEPEHGLGSEECNP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 LNMSIEAELVIEQMKEQHHRDICCLRLELEDKVRHYEKQLDETVVSCKKAQENMKQRHEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LNMSIEAELVIEQMKEQHHRDICCLRLELEDKVRHYEKQLDETVVSCKKAQENMKQRHEN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 ETHTLEKQISDLKNEIAELQGQAAVLKEAHHEATCRHEEEKKQLQVKLEEEKTHLQEKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ETHTLEKQISDLKNEIAELQGQAAVLKEAHHEATCRHEEEKKQLQVKLEEEKTHLQEKLR
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pF1KA1 LQHEMELKARLTQAQASFEREREGLQSSAWTEEKVRGLTQELEQFHQEQLTSLVEKHTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LQHEMELKARLTQAQASFEREREGLQSSAWTEEKVRGLTQELEQFHQEQLTSLVEKHTLE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 KEELRKELLEKHQRELQEGRYESEKLQQENSILRNEITTLNEEDSISNLKLGTLNGSQEE
:::::::::::::::::::: ::.. : . ..: . . : :.
CCDS32 KEELRKELLEKHQRELQEGR---EKMETECNRRTSQIEAQFQSDC------------QKV
790 800 810 820
850 860 870 880 890
pF1KA1 MQKTETVKQE-NAAVQKMVENLKKQISELKIKNQQLDLENTELSQKNSQNQEKLQELNQR
.. :.. : .. .. ...:..: : : .: ..:. ::.:. .. :: :.: .:
CCDS32 TERCESALQSLEGRYRQELKDLQEQQREEK---SQWEFEKDELTQECAEAQELLKETLKR
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 LTEMLCQKEKEPGNSALEEREQEKFNLKEELERCKVQSSTLVSSLEAELSEVKIQTHIVQ
:: . .:::. . . ::.:. :. . :...:: .: .:. .
CCDS32 --------EKTTSLVLTQEREMLEKTYKEHLNSMVVERQQLLQDLE-DLRNVS------E
890 900 910 920
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 QENHLLKDELEKMKQLHRCPDLSDFQQKISSVLSYNEKLLKEK-EALSEELNSCVDKLAK
.. ::.:.. ..:. :. .: . .... . .:.: ... : : : .. ... .
CCDS32 TQQSLLSDQILELKSSHK-RELRE-REEVLCQAGASEQLASQRLERLEMEHDQERQEMMS
930 940 950 960 970 980
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 SSLLEHRIATMKQEQKSWEHQSASLKSQLVASQEKVQNLEDTVQNVNLQMS--------R
. : . : : .. ... : ..... : :......... ... .: .
CCDS32 KLLAMENI--HKATCETADRERAEMSTEISRLQSKIKEMQQATSPLSMLQSGCQVIGEEE
990 1000 1010 1020 1030 1040
1080 1090 1100 1110 1120
pF1KA1 MKSD--LRVTQQEKEALKQE---VMSLHKQLQNAGGKSWAPEIATHPSGLHNQQKRLSWD
...: : . :: .. :... ..::.. ..: .. ..::. : :... ..:
CCDS32 VEGDGALSLLQQGEQLLEENGDVLLSLQRAHEQAVKENV--KMATEISRLQQRLQKLEPG
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KA1 K-LDHLMNEEQ-QLLWQENERLQTMVQNTKAELTHSREKVRQLESNLLPKHQKHLNPSGT
.. ..: ... . :. . ..:..... ... . :.. :.: . . :. .::
CCDS32 LVMSSCLDEPATEFFGNTAEQTEQFLQQNRTKQVEGVTR-RHVLSDLEDDEVRDLGSTGT
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KA1 MNPTEQEKLSLKRECDQFQKEQSPANRKVSQMNSLEQELETIHLENEGLKKKQVKLDEQL
. .:: . :.: :. : .. ::. :: . :. ::.. .:.:::
CCDS32 SSVQRQE----------VKIEESEAS--VEGFSELENSEET-RTESWELKNQISQLQEQL
1170 1180 1190 1200
1250 1260 1270
pF1KA1 MENSVVGSSREGCSSLPEIVCEDAAPEVHCDA
:
CCDS32 MMLCADCDRASEKKQDLLFDVSVLKKKLKMLERIPEASPKYKLLYEDVSRENDCLQEELR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
>--
initn: 2627 init1: 2578 opt: 2939 Z-score: 1316.4 bits: 256.5 E(32554): 5.3e-67
Smith-Waterman score: 2939; 68.8% identity (80.6% similar) in 763 aa overlap (510-1245:1229-1959)
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 NSRLENELLENAEKLAEYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLD--P-SSAEFFLQEERLTQM
.:: .:. :. : .: .. : : ...
CCDS32 QISQLQEQLMMLCADCDRASEKKQDLLFDVSVLKKKLKMLERIPEASPKYKLLYEDVSRE
1200 1210 1220 1230 1240 1250
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pF1KA1 RNEYERQCRVLQDQVDELQSELEEYRAQGRVLRLPLKNSPSEEVEANSGGIEPEHGLGSE
. ... :... . :: . .: :. :.:: . . ::: . ..: . .
CCDS32 NDCLQEELRMMETRYDEALENNKELTAE--VFRLQDELKKMEEVTETFLSLEKSYDEVKI
1260 1270 1280 1290 1300 1310
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 ECNPLN-MSIEAELVIEQMKEQH-HRDICCLRLELEDKVRHYEKQLDETVVSCKKAQENM
: . :: . .. . ::...:. .: ::: : .... : . : .... ... :.
CCDS32 ENEGLNVLVLRLQGKIEKLQESVVQRCDCCL---WEASLENLEIEPDGNILQLNQTLEEC
1320 1330 1340 1350 1360 1370
660 670 680 690 700
pF1KA1 KQRHENETHTLEKQISDLKNEIAELQGQAAVLKE--AH-----HEATCRHEEEKK-QLQV
: .. :..: . :.: :.:.. .:.. :: : . :.:. . : ::
CCDS32 VPRVRSVHHVIE----ECKQENQYLEGNTQLLEKVKAHEIAWLHGTIQTHQERPRVQNQV
1380 1390 1400 1410 1420
710 720 730 740 750 760
pF1KA1 KLEEEKTHL--QEKLRLQHEMELKARLTQAQASFEREREGLQSSAWTEEKVRGLTQELEQ
:::. : : :.: ..::. . : .: :. :: ::..:
CCDS32 ILEENTTLLGFQDK-HFQHQATI--------AELELEKTKLQE----------LTRKL--
1430 1440 1450 1460
770 780 790 800 810
pF1KA1 FHQEQLTSLVEKHTL----EKEELRKELLEKHQ---RELQEG----RYESEKLQQENSIL
.:..: ::... . :::: : ... : :.:. ::::::::::::::
CCDS32 --KERVTILVKQKDVLSHGEKEEELKAMMHDLQITCSEMQQKVELLRYESEKLQQENSIL
1470 1480 1490 1500 1510 1520
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 RNEITTLNEEDSISNLKLGTLNGSQEEM-QKTETVKQENAAVQKMVENLKKQISELKIKN
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RNEITTLNEEDSISNLKLGTLNGSQEEMWQKTETVKQENAAVQKMVENLKKQISELKIKN
1530 1540 1550 1560 1570 1580
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 QQLDLENTELSQKNSQNQEKLQELNQRLTEMLCQKEKEPGNSALEEREQEKFNLKEELER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QQLDLENTELSQKNSQNQEKLQELNQRLTEMLCQKEKEPGNSALEEREQEKFNLKEELER
1590 1600 1610 1620 1630 1640
940 950 960 970 980 990
pF1KA1 CKVQSSTLVSSLEAELSEVKIQTHIVQQENHLLKDELEKMKQLHRCPDLSDFQQKISSVL
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CCDS33 TARGPEPE---QMGLAPCCTQALCGLALRHHSHLQQIRREAEAELSGELSGLGALPARRD
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CCDS33 VDGPSLEAEMQALPKDGLVAGSGQEGTRGLLPLRPGCGERPLAWLAPGDGRESEEAAGAG
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CCDS33 PRRRQAQDTEATQSPAPAPAPASHGPSERWSRMQPCGVDGDIVPKEPEPFGASAAGLEQP
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CCDS33 GARELPLLGTE--RDASQTQPRMWEPPLR-PAASCRGQAERLQAIQEERARSWSRGTQEQ
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