Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1567
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1567, 861 aa
1>>>pF1KA1567 861 - 861 aa - 861 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9987+/-0.000928; mu= 17.1377+/- 0.056
mean_var=68.1061+/-13.287, 0's: 0 Z-trim(105.5): 18 B-trim: 8 in 1/49
Lambda= 0.155411
statistics sampled from 8443 (8457) to 8443 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16
Scan time: 4.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS397.1 AGO4 gene_id:192670|Hs108|chr1 ( 861) 5868 1325.0 0
CCDS398.1 AGO1 gene_id:26523|Hs108|chr1 ( 857) 3664 830.9 0
CCDS399.1 AGO3 gene_id:192669|Hs108|chr1 ( 860) 3501 794.3 0
CCDS55279.1 AGO2 gene_id:27161|Hs108|chr8 ( 825) 3450 782.9 0
CCDS6380.1 AGO2 gene_id:27161|Hs108|chr8 ( 859) 3450 782.9 0
CCDS81300.1 AGO1 gene_id:26523|Hs108|chr1 ( 782) 3345 759.3 5.8e-219
CCDS400.1 AGO3 gene_id:192669|Hs108|chr1 ( 626) 2443 557.1 3.6e-158
CCDS9268.1 PIWIL1 gene_id:9271|Hs108|chr12 ( 861) 365 91.2 8.6e-18
CCDS6029.1 PIWIL2 gene_id:55124|Hs108|chr8 ( 973) 356 89.2 3.9e-17
CCDS31656.1 PIWIL4 gene_id:143689|Hs108|chr11 ( 852) 337 84.9 6.6e-16
CCDS33623.1 PIWIL3 gene_id:440822|Hs108|chr22 ( 882) 295 75.5 4.7e-13
>>CCDS397.1 AGO4 gene_id:192670|Hs108|chr1 (861 aa)
initn: 5868 init1: 5868 opt: 5868 Z-score: 7101.1 bits: 1325.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5868; 100.0% identity (100.0% similar) in 861 aa overlap (1-861:1-861)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MEALGPGPPASLFQPPRRPGLGTVGKPIRLLANHFQVQIPKIDVYHYDVDIKPEKRPRRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 MEALGPGPPASLFQPPRRPGLGTVGKPIRLLANHFQVQIPKIDVYHYDVDIKPEKRPRRV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 NREVVDTMVRHFKMQIFGDRQPGYDGKRNMYTAHPLPIGRDRVDMEVTLPGEGKDQTFKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 NREVVDTMVRHFKMQIFGDRQPGYDGKRNMYTAHPLPIGRDRVDMEVTLPGEGKDQTFKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 SVQWVSVVSLQLLLEALAGHLNEVPDDSVQALDVITRHLPSMRYTPVGRSFFSPPEGYYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 SVQWVSVVSLQLLLEALAGHLNEVPDDSVQALDVITRHLPSMRYTPVGRSFFSPPEGYYH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 PLGGGREVWFGFHQSVRPAMWNMMLNIDVSATAFYRAQPIIEFMCEVLDIQNINEQTKPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 PLGGGREVWFGFHQSVRPAMWNMMLNIDVSATAFYRAQPIIEFMCEVLDIQNINEQTKPL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TDSQRVKFTKEIRGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLENGQAMECTVAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 TDSQRVKFTKEIRGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLENGQAMECTVAQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 YFKQKYSLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTSTMIKATAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 YFKQKYSLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTSTMIKATAR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 SAPDRQEEISRLVKSNSMVGGPDPYLKEFGIVVHNEMTELTGRVLPAPMLQYGGRNKTVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 SAPDRQEEISRLVKSNSMVGGPDPYLKEFGIVVHNEMTELTGRVLPAPMLQYGGRNKTVA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 TPNQGVWDMRGKQFYAGIEIKVWAVACFAPQKQCREDLLKSFTDQLRKISKDAGMPIQGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 TPNQGVWDMRGKQFYAGIEIKVWAVACFAPQKQCREDLLKSFTDQLRKISKDAGMPIQGQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 PCFCKYAQGADSVEPMFKHLKMTYVGLQLIVVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 PCFCKYAQGADSVEPMFKHLKMTYVGLQLIVVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 VKNVVKTSPQTLSNLCLKINAKLGGINNVLVPHQRPSVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 VKNVVKTSPQTLSNLCLKINAKLGGINNVLVPHQRPSVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 PSIAAVVGSMDGHPSRYCATVRVQTSRQEISQELLYSQEVIQDLTNMVRELLIQFYKSTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 PSIAAVVGSMDGHPSRYCATVRVQTSRQEISQELLYSQEVIQDLTNMVRELLIQFYKSTR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 FKPTRIIYYRGGVSEGQMKQVAWPELIAIRKACISLEEDYRPGITYIVVQKRHHTRLFCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 FKPTRIIYYRGGVSEGQMKQVAWPELIAIRKACISLEEDYRPGITYIVVQKRHHTRLFCA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 DKTERVGKSGNVPAGTTVDSTITHPSEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYQVLWDDNCFTADE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 DKTERVGKSGNVPAGTTVDSTITHPSEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYQVLWDDNCFTADE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 LQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKDHDSAEGSHVSGQSNGRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 LQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKDHDSAEGSHVSGQSNGRD
790 800 810 820 830 840
850 860
pF1KA1 PQALAKAVQIHHDTQHTMYFA
:::::::::::::::::::::
CCDS39 PQALAKAVQIHHDTQHTMYFA
850 860
>>CCDS398.1 AGO1 gene_id:26523|Hs108|chr1 (857 aa)
initn: 3663 init1: 2121 opt: 3664 Z-score: 4430.4 bits: 830.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4925; 83.5% identity (93.6% similar) in 855 aa overlap (8-861:15-857)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MEALGPGPP-ASLFQPPRRPGLGTVGKPIRLLANHFQVQIPKIDVYHYDVDIK
:: ..:: :::::.:::::::.::::.:.:.:::::::::.::::
CCDS39 MEAGPSGAAAGAYLPPLQQVFQAPRRPGIGTVGKPIKLLANYFEVDIPKIDVYHYEVDIK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 PEKRPRRVNREVVDTMVRHFKMQIFGDRQPGYDGKRNMYTAHPLPIGRDRVDMEVTLPGE
:.: :::::::::. ::.::: ::::::.: ::::.:.::. :::: .:::.:::.:::
CCDS39 PDKCPRRVNREVVEYMVQHFKPQIFGDRKPVYDGKKNIYTVTALPIGNERVDFEVTIPGE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 GKDQTFKVSVQWVSVVSLQLLLEALAGHLNEVPDDSVQALDVITRHLPSMRYTPVGRSFF
:::. ::::..:...:: ..: :::.. :: .::::::: ::: ::::::::::::
CCDS39 GKDRIFKVSIKWLAIVSWRMLHEALVSGQIPVPLESVQALDVAMRHLASMRYTPVGRSFF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 SPPEGYYHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWNMMLNIDVSATAFYRAQPIIEFMCEVLDIQN
:::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::.::::::::::.:
CCDS39 SPPEGYYHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIEFMCEVLDIRN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 INEQTKPLTDSQRVKFTKEIRGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLENGQ
:.:: :::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS39 IDEQPKPLTDSQRVRFTKEIKGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLESGQ
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 AMECTVAQYFKQKYSLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTS
..::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 TVECTVAQYFKQKYNLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 TMIKATARSAPDRQEEISRLVKSNSMVGGPDPYLKEFGIVVHNEMTELTGRVLPAPMLQY
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CCDS39 TMIKATARSAPDRQEEISRLMKNASY--NLDPYIQEFGIKVKDDMTEVTGRVLPAPILQY
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 GGRNKTVATPNQGVWDMRGKQFYAGIEIKVWAVACFAPQKQCREDLLKSFTDQLRKISKD
::::...:::::::::::::::: ::::::::.:::::::::::..::.:::::::::::
CCDS39 GGRNRAIATPNQGVWDMRGKQFYNGIEIKVWAIACFAPQKQCREEVLKNFTDQLRKISKD
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 AGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFKHLKMTYVGLQLIVVILPGKTPVYAEVKRVGDTLL
:::::::::::::::::::::::::.::: :: :::::.:::::::::::::::::::::
CCDS39 AGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDTLL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 GMATQCVQVKNVVKTSPQTLSNLCLKINAKLGGINNVLVPHQRPSVFQQPVIFLGADVTH
::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::: .:::::::::::::::
CCDS39 GMATQCVQVKNVVKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRSAVFQQPVIFLGADVTH
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 PPAGDGKKPSIAAVVGSMDGHPSRYCATVRVQTSRQEISQELLYSQEVIQDLTNMVRELL
:::::::::::.:::::::.:::::::::::: :::: :.::. ::::::
CCDS39 PPAGDGKKPSITAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEI----------IEDLSYMVRELL
600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 IQFYKSTRFKPTRIIYYRGGVSEGQMKQVAWPELIAIRKACISLEEDYRPGITYIVVQKR
:::::::::::::::.:: :: :::. :. ::.::: :::.::.::.:::::::::::
CCDS39 IQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVPEGQLPQILHYELLAIRDACIKLEKDYQPGITYIVVQKR
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 HHTRLFCADKTERVGKSGNVPAGTTVDSTITHPSEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYQVLWD
::::::::::.::.:::::.:::::::..:::: ::::::::::::::::::::: ::::
CCDS39 HHTRLFCADKNERIGKSGNIPAGTTVDTNITHPFEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYYVLWD
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 DNCFTADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKDHDSAEGSHV
:: :::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::.
CCDS39 DNRFTADELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKEHDSGEGSHI
770 780 790 800 810 820
840 850 860
pF1KA1 SGQSNGRDPQALAKAVQIHHDTQHTMYFA
:::::::::::::::::.:.:: .:::::
CCDS39 SGQSNGRDPQALAKAVQVHQDTLRTMYFA
830 840 850
>>CCDS399.1 AGO3 gene_id:192669|Hs108|chr1 (860 aa)
initn: 3525 init1: 1523 opt: 3501 Z-score: 4232.9 bits: 794.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4807; 81.3% identity (92.5% similar) in 866 aa overlap (5-861:7-860)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MEALGPGPPASLFQPPRRPGLGTVGKPIRLLANHFQVQIPKIDVYHYDVDIKPEKRPR
::. :.. ::::: ::.::::.:::: :::.::::::: :.:::::.: ::
CCDS39 MEIGSAGPAGAQPLLMVPRRPGYGTMGKPIKLLANCFQVEIPKIDVYLYEVDIKPDKCPR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 RVNREVVDTMVRHFKMQIFGDRQPGYDGKRNMYTAHPLPIGRDRVDMEVTLPGEG-KDQT
::::::::.::.:::. :::::.: :::::..:::.:::.. ::..::::::: ::.
CCDS39 RVNREVVDSMVQHFKVTIFGDRRPVYDGKRSLYTANPLPVATTGVDLDVTLPGEGGKDRP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KA1 FKVSVQWVSVVSLQLLLEALAGH-LNE-------VPDDSVQALDVITRHLPSMRYTPVGR
::::...:: :: .:: :.:.:. : : . . :.:.::. ::::::.::::::
CCDS39 FKVSIKFVSRVSWHLLHEVLTGRTLPEPLELDKPISTNPVHAVDVVLRHLPSMKYTPVGR
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 SFFSPPEGYYHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWNMMLNIDVSATAFYRAQPIIEFMCEVLD
:::: :::: ::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::.:.:::::::
CCDS39 SFFSAPEGYDHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIQFMCEVLD
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 IQNINEQTKPLTDSQRVKFTKEIRGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLE
:.::.:: .:::::.::::::::.:::::::::: :.:::::::::::::::::::::::
CCDS39 IHNIDEQPRPLTDSHRVKFTKEIKGLKVEVTHCGTMRRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLE
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 NGQAMECTVAQYFKQKYSLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDN
:::..: ::::::..::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 NGQTVERTVAQYFREKYTLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDN
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 QTSTMIKATARSAPDRQEEISRLVKSNSMVGGPDPYLKEFGIVVHNEMTELTGRVLPAPM
::::::::::::::::::::::::.: .. ::...:: . :..::...:::::::::
CCDS39 QTSTMIKATARSAPDRQEEISRLVRSANYE--TDPFVQEFQFKVRDEMAHVTGRVLPAPM
370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 LQYGGRNKTVATPNQGVWDMRGKQFYAGIEIKVWAVACFAPQKQCREDLLKSFTDQLRKI
:::::::.:::::..::::::::::..:.:::.::.:::: :.::::..::.::::::::
CCDS39 LQYGGRNRTVATPSHGVWDMRGKQFHTGVEIKMWAIACFATQRQCREEILKGFTDQLRKI
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 SKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFKHLKMTYVGLQLIVVILPGKTPVYAEVKRVGD
::::::::::::::::::::::::::::.::: :: :::::.::::::::::::::::::
CCDS39 SKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGD
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 TLLGMATQCVQVKNVVKTSPQTLSNLCLKINAKLGGINNVLVPHQRPSVFQQPVIFLGAD
:::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::::::
CCDS39 TLLGMATQCVQVKNVIKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRPSVFQQPVIFLGAD
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KA1 VTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDGHPSRYCATVRVQTSRQEISQELLYSQEVIQDLTNMVR
::::::::::::::::::::::.:::::::::::: :::: ::::..:::
CCDS39 VTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEI----------IQDLASMVR
600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KA1 ELLIQFYKSTRFKPTRIIYYRGGVSEGQMKQVAWPELIAIRKACISLEEDYRPGITYIVV
::::::::::::::::::.:: ::::::..:: . ::.:::.::::::.::.::::::::
CCDS39 ELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFRQVLYYELLAIREACISLEKDYQPGITYIVV
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740 750 760
pF1KA1 QKRHHTRLFCADKTERVGKSGNVPAGTTVDSTITHPSEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYQV
::::::::::::.:::::.:::.:::::::. :::: :::::::::::::::::::::.:
CCDS39 QKRHHTRLFCADRTERVGRSGNIPAGTTVDTDITHPYEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYHV
710 720 730 740 750 760
770 780 790 800 810 820
pF1KA1 LWDDNCFTADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKDHDSAEG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::::::
CCDS39 LWDDNCFTADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEG
770 780 790 800 810 820
830 840 850 860
pF1KA1 SHVSGQSNGRDPQALAKAVQIHHDTQHTMYFA
::::::::::::::::::::::.:: .:::::
CCDS39 SHVSGQSNGRDPQALAKAVQIHQDTLRTMYFA
830 840 850 860
>>CCDS55279.1 AGO2 gene_id:27161|Hs108|chr8 (825 aa)
initn: 4046 init1: 2009 opt: 3450 Z-score: 4171.4 bits: 782.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4402; 74.9% identity (88.1% similar) in 860 aa overlap (6-861:12-825)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MEALGPGPPASL----FQPPRRPGLGTVGKPIRLLANHFQVQIPKIDVYHYDVD
:.:: . :.:: :: .:: :. :.: :: :...:::::.:::..:
CCDS55 MYSGAGPALAPPAPPPPIQGYAFKPPPRPDFGTSGRTIKLQANFFEMDIPKIDIYHYELD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 IKPEKRPRRVNREVVDTMVRHFKMQIFGDRQPGYDGKRNMYTAHPLPIGRDRVDMEVTLP
::::: :::::::.:. ::.::: ::::::.: .::..:.::: :::::::.:..:::::
CCDS55 IKPEKCPRRVNREIVEHMVQHFKTQIFGDRKPVFDGRKNLYTAMPLPIGRDKVELEVTLP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 GEGKDQTFKVSVQWVSVVSLQLLLEALAGHLNEVPDDSVQALDVITRHLPSMRYTPVGRS
:::::. ::::..::: :::: : .::.:.: :: ...:::::. ::::::::::::::
CCDS55 GEGKDRIFKVSIKWVSCVSLQALHDALSGRLPSVPFETIQALDVVMRHLPSMRYTPVGRS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 FFSPPEGYYHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWNMMLNIDVSATAFYRAQPIIEFMCEVLDI
::. :: .::::::::::::::::::..:.:::::::::::::.:::.:::.:::::.
CCDS55 FFTASEGCSNPLGGGREVWFGFHQSVRPSLWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIEFVCEVLDF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 QNINEQTKPLTDSQRVKFTKEIRGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLEN
..:.:: :::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::: :.
CCDS55 KSIEEQQKPLTDSQRVKFTKEIKGLKVEITHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQQES
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 GQAMECTVAQYFKQKYSLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQ
::..:::::::::....: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GQTVECTVAQYFKDRHKLVLRYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQ
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 TSTMIKATARSAPDRQEEISRLVKSNSMVGGPDPYLKEFGIVVHNEMTELTGRVLPAPML
:::::.::::::::::::::.:..: :. . :::..::::.:..:::..::::: : .
CCDS55 TSTMIRATARSAPDRQEEISKLMRSASF--NTDPYVREFGIMVKDEMTDVTGRVLQPPSI
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 QYGGRNKTVATPNQGVWDMRGKQFYAGIEIKVWAVACFAPQKQCREDLLKSFTDQLRKIS
::::::..::: :::::::.:::..::::::::.::::::.:: : :::::.::::::
CCDS55 LYGGRNKAIATPVQGVWDMRNKQFHTGIEIKVWAIACFAPQRQCTEVHLKSFTEQLRKIS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 KDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFKHLKMTYVGLQLIVVILPGKTPVYAEVKRVGDT
.::::::::::::::::::::::::::.::: ::.::::.::::::::::::::::::::
CCDS55 RDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYAGLQLVVVILPGKTPVYAEVKRVGDT
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 LLGMATQCVQVKNVVKTSPQTLSNLCLKINAKLGGINNVLVPHQRPSVFQQPVIFLGADV
.:::::::::.::: .:.::::::::::::.::::.::.:.:. :: :::::::::::::
CCDS55 VLGMATQCVQMKNVQRTTPQTLSNLCLKINVKLGGVNNILLPQGRPPVFQQPVIFLGADV
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 THPPAGDGKKPSIAAVVGSMDGHPSRYCATVRVQTSRQEISQELLYSQEVIQDLTNMVRE
:::::::::::::::::::::.::.::::::::: :::: ::::. ::::
CCDS55 THPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPNRYCATVRVQQHRQEI----------IQDLAAMVRE
600 610 620 630 640
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pF1KA1 LLIQFYKSTRFKPTRIIYYRGGVSEGQMKQVAWPELIAIRKACISLEEDYRPGITYIVVQ
:::::::::::::::::.:: ::::::..:: ::.:::.:::.::.::.::::.::::
CCDS55 LLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFQQVLHHELLAIREACIKLEKDYQPGITFIVVQ
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 KRHHTRLFCADKTERVGKSGNVPAGTTVDSTITHPSEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYQVL
:::::::::.::.:: ::::::::.::
CCDS55 KRHHTRLFCTDKNER----------------------------------GTSRPSHYHVL
710 720 730
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 WDDNCFTADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKDHDSAEGS
:::: :..::::.:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::
CCDS55 WDDNRFSSDELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGS
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840 850 860
pF1KA1 HVSGQSNGRDPQALAKAVQIHHDTQHTMYFA
:.:::::::: ::::::::.:.:: .:::::
CCDS55 HTSGQSNGRDHQALAKAVQVHQDTLRTMYFA
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10 20 30 40 50
pF1KA1 MEALGPGPPASL----FQPPRRPGLGTVGKPIRLLANHFQVQIPKIDVYHYDVD
:.:: . :.:: :: .:: :. :.: :: :...:::::.:::..:
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10 20 30 40 50 60
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pF1KA1 IKPEKRPRRVNREVVDTMVRHFKMQIFGDRQPGYDGKRNMYTAHPLPIGRDRVDMEVTLP
::::: :::::::.:. ::.::: ::::::.: .::..:.::: :::::::.:..:::::
CCDS63 IKPEKCPRRVNREIVEHMVQHFKTQIFGDRKPVFDGRKNLYTAMPLPIGRDKVELEVTLP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 GEGKDQTFKVSVQWVSVVSLQLLLEALAGHLNEVPDDSVQALDVITRHLPSMRYTPVGRS
:::::. ::::..::: :::: : .::.:.: :: ...:::::. ::::::::::::::
CCDS63 GEGKDRIFKVSIKWVSCVSLQALHDALSGRLPSVPFETIQALDVVMRHLPSMRYTPVGRS
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pF1KA1 FFSPPEGYYHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWNMMLNIDVSATAFYRAQPIIEFMCEVLDI
::. :: .::::::::::::::::::..:.:::::::::::::.:::.:::.:::::.
CCDS63 FFTASEGCSNPLGGGREVWFGFHQSVRPSLWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIEFVCEVLDF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 QNINEQTKPLTDSQRVKFTKEIRGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLEN
..:.:: :::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::: :.
CCDS63 KSIEEQQKPLTDSQRVKFTKEIKGLKVEITHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQQES
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300 310 320 330 340 350
pF1KA1 GQAMECTVAQYFKQKYSLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQ
::..:::::::::....: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GQTVECTVAQYFKDRHKLVLRYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQ
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360 370 380 390 400 410
pF1KA1 TSTMIKATARSAPDRQEEISRLVKSNSMVGGPDPYLKEFGIVVHNEMTELTGRVLPAPML
:::::.::::::::::::::.:..: :. . :::..::::.:..:::..::::: : .
CCDS63 TSTMIRATARSAPDRQEEISKLMRSASF--NTDPYVREFGIMVKDEMTDVTGRVLQPPSI
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pF1KA1 QYGGRNKTVATPNQGVWDMRGKQFYAGIEIKVWAVACFAPQKQCREDLLKSFTDQLRKIS
::::::..::: :::::::.:::..::::::::.::::::.:: : :::::.::::::
CCDS63 LYGGRNKAIATPVQGVWDMRNKQFHTGIEIKVWAIACFAPQRQCTEVHLKSFTEQLRKIS
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pF1KA1 KDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFKHLKMTYVGLQLIVVILPGKTPVYAEVKRVGDT
.::::::::::::::::::::::::::.::: ::.::::.::::::::::::::::::::
CCDS63 RDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYAGLQLVVVILPGKTPVYAEVKRVGDT
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pF1KA1 LLGMATQCVQVKNVVKTSPQTLSNLCLKINAKLGGINNVLVPHQRPSVFQQPVIFLGADV
.:::::::::.::: .:.::::::::::::.::::.::.:.:. :: :::::::::::::
CCDS63 VLGMATQCVQMKNVQRTTPQTLSNLCLKINVKLGGVNNILLPQGRPPVFQQPVIFLGADV
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pF1KA1 THPPAGDGKKPSIAAVVGSMDGHPSRYCATVRVQTSRQEISQELLYSQEVIQDLTNMVRE
:::::::::::::::::::::.::.::::::::: :::: ::::. ::::
CCDS63 THPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAHPNRYCATVRVQQHRQEI----------IQDLAAMVRE
600 610 620 630 640
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pF1KA1 LLIQFYKSTRFKPTRIIYYRGGVSEGQMKQVAWPELIAIRKACISLEEDYRPGITYIVVQ
:::::::::::::::::.:: ::::::..:: ::.:::.:::.::.::.::::.::::
CCDS63 LLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVSEGQFQQVLHHELLAIREACIKLEKDYQPGITFIVVQ
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pF1KA1 KRHHTRLFCADKTERVGKSGNVPAGTTVDSTITHPSEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYQVL
:::::::::.::.::::::::.:::::::. ::::.:::::::::::::::::::::.::
CCDS63 KRHHTRLFCTDKNERVGKSGNIPAGTTVDTKITHPTEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYHVL
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pF1KA1 WDDNCFTADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKDHDSAEGS
:::: :..::::.:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::
CCDS63 WDDNRFSSDELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGS
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:.:::::::: ::::::::.:.:: .:::::
CCDS63 HTSGQSNGRDHQALAKAVQVHQDTLRTMYFA
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pF1KA1 QIPKIDVYHYDVDIKPEKRPRRVNREVVDTMVRHFKMQIFGDRQPGYDGKRNMYTAHPLP
::.::: ::::::.: ::::.:.::. ::
CCDS81 MVQHFKPQIFGDRKPVYDGKKNIYTVTALP
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pF1KA1 IGRDRVDMEVTLPGEGKDQTFKVSVQWVSVVSLQLLLEALAGHLNEVPDDSVQALDVITR
:: .:::.:::.::::::. ::::..:...:: ..: :::.. :: .::::::: :
CCDS81 IGNERVDFEVTIPGEGKDRIFKVSIKWLAIVSWRMLHEALVSGQIPVPLESVQALDVAMR
40 50 60 70 80 90
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pF1KA1 HLPSMRYTPVGRSFFSPPEGYYHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWNMMLNIDVSATAFYRA
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:
CCDS81 HLASMRYTPVGRSFFSPPEGYYHPLGGGREVWFGFHQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKA
100 110 120 130 140 150
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pF1KA1 QPIIEFMCEVLDIQNINEQTKPLTDSQRVKFTKEIRGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRR
::.::::::::::.::.:: :::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QPVIEFMCEVLDIRNIDEQPKPLTDSQRVRFTKEIKGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRR
160 170 180 190 200 210
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pF1KA1 PASHQTFPLQLENGQAMECTVAQYFKQKYSLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIV
::::::::::::.::..::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PASHQTFPLQLESGQTVECTVAQYFKQKYNLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIV
220 230 240 250 260 270
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pF1KA1 AGQRCIKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLVKSNSMVGGPDPYLKEFGIVVHNEM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:. :. . :::..:::: :...:
CCDS81 AGQRCIKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLMKNASY--NLDPYIQEFGIKVKDDM
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::.::::::::.:::::::...:::::::::::::::: ::::::::.:::::::::::.
CCDS81 TEVTGRVLPAPILQYGGRNRAIATPNQGVWDMRGKQFYNGIEIKVWAIACFAPQKQCREE
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pF1KA1 LLKSFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFKHLKMTYVGLQLIVVILPGK
.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: :: :::::.::::::
CCDS81 VLKNFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVEPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGK
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pF1KA1 TPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVVKTSPQTLSNLCLKINAKLGGINNVLVPHQRPS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::: .
CCDS81 TPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVVKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRSA
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pF1KA1 VFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDGHPSRYCATVRVQTSRQEISQELLYS
::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::: ::::
CCDS81 VFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSITAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEI-------
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pF1KA1 QEVIQDLTNMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIYYRGGVSEGQMKQVAWPELIAIRKACISLE
:.::. :::::::::::::::::::::.:: :: :::. :. ::.::: :::.::
CCDS81 ---IEDLSYMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGVPEGQLPQILHYELLAIRDACIKLE
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pF1KA1 EDYRPGITYIVVQKRHHTRLFCADKTERVGKSGNVPAGTTVDSTITHPSEFDFYLCSHAG
.::.:::::::::::::::::::::.::.:::::.:::::::..:::: :::::::::::
CCDS81 KDYQPGITYIVVQKRHHTRLFCADKNERIGKSGNIPAGTTVDTNITHPFEFDFYLCSHAG
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pF1KA1 IQGTSRPSHYQVLWDDNCFTADELQLLTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARY
:::::::::: :::::: :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IQGTSRPSHYYVLWDDNRFTADELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARY
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pF1KA1 HLVDKDHDSAEGSHVSGQSNGRDPQALAKAVQIHHDTQHTMYFA
:::::.:::.::::.:::::::::::::::::.:.:: .:::::
CCDS81 HLVDKEHDSGEGSHISGQSNGRDPQALAKAVQVHQDTLRTMYFA
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pF1KA1 QSVRPAMWNMMLNIDVSATAFYRAQPIIEFMCEVLDIQNINEQTKPLTDSQRVKFTKEIR
:::::::.::.:: .:::::.::::::::.
CCDS40 MCEVLDIHNIDEQPRPLTDSHRVKFTKEIK
10 20 30
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pF1KA1 GLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLENGQAMECTVAQYFKQKYSLQLKYP
:::::::::: :.::::::::::::::::::::::::::..: ::::::..::.::::::
CCDS40 GLKVEVTHCGTMRRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLENGQTVERTVAQYFREKYTLQLKYP
40 50 60 70 80 90
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pF1KA1 HLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 HLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRCIKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLV
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pF1KA1 KSNSMVGGPDPYLKEFGIVVHNEMTELTGRVLPAPMLQYGGRNKTVATPNQGVWDMRGKQ
.: .. ::...:: . :..::...::::::::::::::::.:::::..:::::::::
CCDS40 RSANYE--TDPFVQEFQFKVRDEMAHVTGRVLPAPMLQYGGRNRTVATPSHGVWDMRGKQ
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pF1KA1 FYAGIEIKVWAVACFAPQKQCREDLLKSFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSV
:..:.:::.::.:::: :.::::..::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 FHTGVEIKMWAIACFATQRQCREEILKGFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSV
210 220 230 240 250 260
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pF1KA1 EPMFKHLKMTYVGLQLIVVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVVKTSPQTLS
::::.::: :: :::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS40 EPMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNVIKTSPQTLS
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pF1KA1 NLCLKINAKLGGINNVLVPHQRPSVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDGH
:::::::.:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS40 NLCLKINVKLGGINNILVPHQRPSVFQQPVIFLGADVTHPPAGDGKKPSIAAVVGSMDAH
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pF1KA1 PSRYCATVRVQTSRQEISQELLYSQEVIQDLTNMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIYYRGGV
::::::::::: :::: ::::..:::::::::::::::::::::.:: ::
CCDS40 PSRYCATVRVQRPRQEI----------IQDLASMVRELLIQFYKSTRFKPTRIIFYRDGV
390 400 410 420 430
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pF1KA1 SEGQMKQVAWPELIAIRKACISLEEDYRPGITYIVVQKRHHTRLFCADKTERVGKSGNVP
::::..:: . ::.:::.::::::.::.::::::::::::::::::::.:::::.:::.:
CCDS40 SEGQFRQVLYYELLAIREACISLEKDYQPGITYIVVQKRHHTRLFCADRTERVGRSGNIP
440 450 460 470 480 490
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pF1KA1 AGTTVDSTITHPSEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYQVLWDDNCFTADELQLLTYQLCHTYV
::::::. :::: :::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS40 AGTTVDTDITHPYEFDFYLCSHAGIQGTSRPSHYHVLWDDNCFTADELQLLTYQLCHTYV
500 510 520 530 540 550
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pF1KA1 RCTRSVSIPAPAYYARLVAFRARYHLVDKDHDSAEGSHVSGQSNGRDPQALAKAVQIHHD
:::::::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS40 RCTRSVSIPAPAYYAHLVAFRARYHLVDKEHDSAEGSHVSGQSNGRDPQALAKAVQIHQD
560 570 580 590 600 610
860
pF1KA1 TQHTMYFA
: .:::::
CCDS40 TLRTMYFA
620
>>CCDS9268.1 PIWIL1 gene_id:9271|Hs108|chr12 (861 aa)
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Smith-Waterman score: 648; 24.8% identity (54.3% similar) in 816 aa overlap (22-813:106-840)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MEALGPGPPASLFQPPRRPGLGTVGKPIRLLANHFQVQI-PKIDVYHYDVD
:. : .:: .:::.. :. .:.: .:
CCDS92 LAERGGRRRDFHDLGVNTRQNLDHVKESKTGSSGIIVRLSTNHFRLTSRPQWALYQYHID
80 90 100 110 120 130
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 IKPEKRPRRVNREVVDTMVRHFKMQIFGDRQPGYDGKRNMYTAHPLPIGRDRVDMEVTLP
.: . ::. .. :. . . . ..:: : :: :....::
CCDS92 YNPLMEARRLRSALL------FQHEDLIGKCHAFDG-----TILFLP---KRLQQKVT--
140 150 160 170
120 130 140 150 160
pF1KA1 GEGKDQTFKVSVQWVSV-VSLQLLLEALAGHLNEVPDDS---VQALDVITRHLPS-MRYT
..:. . . .: ... : ::.: : .: ..: :.: . :
CCDS92 -----EVFSKTRNGEDVRITITLT--------NELPPTSPTCLQFYNIIFRRLLKIMNLQ
180 190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
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CCDS92 QIGRNYYNPNDPIDIP--SHRLVIWPGFTTSILQYENSIMLCTDVSHKVL-RSETVLDFM
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230 240 250 260 270 280
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..... : . .:....:. .. . : : :.: ... :: . .. .
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... ..::.: . .. ::.. .:. . : . :: . . . : . .
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. ..:... : :.. :: .. . . : .: ... :.. .. :..
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CCDS92 VCLLSSNRKDKYDAIKKYLCTDCPTPSQCVVARTLGKQQTVMAIATKIALQMNCKMGG--
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: .. . :...: : : .. :.. :::. :.:.. .:. ::
CCDS92 ----ELWRVDIPLKLVMIVGIDCYHDMTA-GRR-SIAGFVASINEGMTRWF-------SR
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CCDS92 AHKLAFLVGQSIHREPNLSLSNRLYYL
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230 240 250 260 270 280
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CCDS31 LTGRIVPSEKILMQDHICQPVSAAD---WSKDIRTCKILNAQSLNTWLILC----SDRTE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]