Result of FASTA (ccds) for pF1KA1582
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1582, 1690 aa
  1>>>pF1KA1582 1690 - 1690 aa - 1690 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4007+/-0.00106; mu= -3.1140+/- 0.063
 mean_var=340.9493+/-70.665, 0's: 0 Z-trim(113.8): 68  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.069459
 statistics sampled from 14302 (14359) to 14302 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.732), E-opt: 0.2 (0.441), width:  16
 Scan time:  7.090

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS45798.1 TNRC6C gene_id:57690|Hs108|chr17       (1690) 11690 1186.7       0
CCDS45799.1 TNRC6C gene_id:57690|Hs108|chr17       (1726) 9965 1013.9       0
CCDS10624.2 TNRC6A gene_id:27327|Hs108|chr16       (1962) 2525 268.4 1.8e-70
CCDS81959.1 TNRC6A gene_id:27327|Hs108|chr16       (1913) 1352 150.8 4.2e-35
CCDS54533.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22       (1833) 1210 136.6 7.9e-31
CCDS46713.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22       (1723) 1046 120.1 6.6e-26
CCDS46712.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22       (1029)  872 102.5 7.8e-21


>>CCDS45798.1 TNRC6C gene_id:57690|Hs108|chr17            (1690 aa)
 initn: 11690 init1: 11690 opt: 11690  Z-score: 6343.1  bits: 1186.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 11690; 100.0% identity (100.0% similar) in 1690 aa overlap (1-1690:1-1690)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MATGSAQGNFTGHTKKTNGNNGTNGALVQSPSNQSALGAGGANSNGSAARVWGVATGSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MATGSAQGNFTGHTKKTNGNNGTNGALVQSPSNQSALGAGGANSNGSAARVWGVATGSSS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 GLAHCSVSGGDGKMDTMIGDGRSQNCWGASNSNAGINLNLNPNANPAAWPVLGHEGTVAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GLAHCSVSGGDGKMDTMIGDGRSQNCWGASNSNAGINLNLNPNANPAAWPVLGHEGTVAT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 GNPSSICSPVSAIGQNMGNQNGNPTGTLGAWGNLLPQESTEPQTSTSQNVSFSAQPQNLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GNPSSICSPVSAIGQNMGNQNGNPTGTLGAWGNLLPQESTEPQTSTSQNVSFSAQPQNLN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 TDGPNNTNPMNSSPNPINAMQTNGLPNWGMAVGMGAIIPPHLQGLPGANGSSVSQVSGGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TDGPNNTNPMNSSPNPINAMQTNGLPNWGMAVGMGAIIPPHLQGLPGANGSSVSQVSGGS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 AEGISNSVWGLSPGNPATGNSNSGFSQGNGDTVNSALSAKQNGSSSAVQKEGSGGNAWDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AEGISNSVWGLSPGNPATGNSNSGFSQGNGDTVNSALSAKQNGSSSAVQKEGSGGNAWDS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 GPPAGPGILAWGRGSGNNGVGNIHSGAWGHPSRSTSNGVNGEWGKPPNQHSNSDINGKGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GPPAGPGILAWGRGSGNNGVGNIHSGAWGHPSRSTSNGVNGEWGKPPNQHSNSDINGKGS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 TGWESPSVTSQNPTVQPGGEHMNSWAKAASSGTTASEGSSDGSGNHNEGSTGREGTGEGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TGWESPSVTSQNPTVQPGGEHMNSWAKAASSGTTASEGSSDGSGNHNEGSTGREGTGEGR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 RRDKGIIDQGHIQLPRNDLDPRVLSNTGWGQTPVKQNTAWEFEESPRSERKNDNGTEAWG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RRDKGIIDQGHIQLPRNDLDPRVLSNTGWGQTPVKQNTAWEFEESPRSERKNDNGTEAWG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 CAATQASNSGGKNDGSIMNSTNTSSVSGWVNAPPAAVPANTGWGDSNNKAPSGPGVWGDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CAATQASNSGGKNDGSIMNSTNTSSVSGWVNAPPAAVPANTGWGDSNNKAPSGPGVWGDS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 ISSTAVSTAAAAKSGHAWSGAANQEDKSPTWGEPPKPKSQHWGDGQRSNPAWSAGGGDWA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ISSTAVSTAAAAKSGHAWSGAANQEDKSPTWGEPPKPKSQHWGDGQRSNPAWSAGGGDWA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 DSSSVLGHLGDGKKNGSGWDADSNRSGSGWNDTTRSGNSGWGNSTNTKANPGTNWGETLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DSSSVLGHLGDGKKNGSGWDADSNRSGSGWNDTTRSGNSGWGNSTNTKANPGTNWGETLK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 PGPQQNWASKPQDNNVSNWGGAASVKQTGTGWIGGPVPVKQKDSSEATGWEEPSPPSIRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PGPQQNWASKPQDNNVSNWGGAASVKQTGTGWIGGPVPVKQKDSSEATGWEEPSPPSIRR
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 KMEIDDGTSAWGDPSNYNNKTVNMWDRNNPVIQSSTTTNTTTTTTTTTSNTTHRVETPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KMEIDDGTSAWGDPSNYNNKTVNMWDRNNPVIQSSTTTNTTTTTTTTTSNTTHRVETPPP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 HQAGTQLNRSPLLGPGRKVSSGWGEMPNVHSKTENSWGEPSSPSTLVDNGTAAWGKPPSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HQAGTQLNRSPLLGPGRKVSSGWGEMPNVHSKTENSWGEPSSPSTLVDNGTAAWGKPPSS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA1 GSGWGDHPAEPPVAFGRAGAPVAASALCKPASKSMQEGWGSGGDEMNLSTSQWEDEEGDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GSGWGDHPAEPPVAFGRAGAPVAASALCKPASKSMQEGWGSGGDEMNLSTSQWEDEEGDV
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA1 WNNAASQESTSSCSSWGNAPKKGLQKGMKTSGKQDEAWIMSRLIKQLTDMGFPREPAEEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WNNAASQESTSSCSSWGNAPKKGLQKGMKTSGKQDEAWIMSRLIKQLTDMGFPREPAEEA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA1 LKSNNMNLDQAMSALLEKKVDVDKRGLGVTDHNGMAAKPLGCRPPISKESSVDRPTFLDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LKSNNMNLDQAMSALLEKKVDVDKRGLGVTDHNGMAAKPLGCRPPISKESSVDRPTFLDK
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 DGGLVEEPTPSPFLPSPSLKLPLSHSALPSQALGGIASGLGMQNLNSSRQIPSGNLGMFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DGGLVEEPTPSPFLPSPSLKLPLSHSALPSQALGGIASGLGMQNLNSSRQIPSGNLGMFG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA1 NSGAAQARTMQQPPQPPVQPLNSSQPSLRAQVPQFLSPQVQAQLLQFAAKNIGLNPALLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NSGAAQARTMQQPPQPPVQPLNSSQPSLRAQVPQFLSPQVQAQLLQFAAKNIGLNPALLT
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA1 SPINPQHMTMLNQLYQLQLAYQRLQIQQQMLQAQRNVSGSMRQQEQQVARTITNLQQQIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SPINPQHMTMLNQLYQLQLAYQRLQIQQQMLQAQRNVSGSMRQQEQQVARTITNLQQQIQ
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA1 QHQRQLAQALLVKQPPPPPPPPHLSLHPSAGKSAMDSFPSHPQTPGLPDLQTKEQQSSPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QHQRQLAQALLVKQPPPPPPPPHLSLHPSAGKSAMDSFPSHPQTPGLPDLQTKEQQSSPN
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA1 TFAPYPLAGLNPNMNVNSMDMTGGLSVKDPSQSQSRLPQWTHPNSMDNLPSAASPLEQNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TFAPYPLAGLNPNMNVNSMDMTGGLSVKDPSQSQSRLPQWTHPNSMDNLPSAASPLEQNP
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA1 SKHGAIPGGLSIGPPGKSSIDDSYGRYDLIQNSESPASPPVAVPHSWSRAKSDSDKISNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SKHGAIPGGLSIGPPGKSSIDDSYGRYDLIQNSESPASPPVAVPHSWSRAKSDSDKISNG
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA1 SSINWPPEFHPGVPWKGLQNIDPENDPDVTPGSVPTGPTINTTIQDVNRYLLKSGGKLSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SSINWPPEFHPGVPWKGLQNIDPENDPDVTPGSVPTGPTINTTIQDVNRYLLKSGGKLSD
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KA1 IKSTWSSGPTSHTQASLSHELWKVPRNSTAPTRPPPGLTNPKPSSTWGASPLGWTSSYSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IKSTWSSGPTSHTQASLSHELWKVPRNSTAPTRPPPGLTNPKPSSTWGASPLGWTSSYSS
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KA1 GSAWSTDTSGRTSSWLVLRNLTPQIDGSTLRTLCLQHGPLITFHLNLTQGNAVVRYSSKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GSAWSTDTSGRTSSWLVLRNLTPQIDGSTLRTLCLQHGPLITFHLNLTQGNAVVRYSSKE
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KA1 EAAKAQKSLHMCVLGNTTILAEFAGEEEVNRFLAQGQALPPTSSWQSSSASSQPRLSAAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EAAKAQKSLHMCVLGNTTILAEFAGEEEVNRFLAQGQALPPTSSWQSSSASSQPRLSAAG
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KA1 SSHGLVRSDAGHWNAPCLGGKGSSELLWGGVPQYSSSLWGPPSADDSRVIGSPTPLTTLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SSHGLVRSDAGHWNAPCLGGKGSSELLWGGVPQYSSSLWGPPSADDSRVIGSPTPLTTLL
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690
pF1KA1 PGDLLSGESL
       ::::::::::
CCDS45 PGDLLSGESL
             1690

>>CCDS45799.1 TNRC6C gene_id:57690|Hs108|chr17            (1726 aa)
 initn: 7346 init1: 5552 opt: 9965  Z-score: 5408.8  bits: 1013.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 11541; 97.6% identity (97.6% similar) in 1725 aa overlap (1-1686:1-1722)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MATGSAQGNFTGHTKKTNGNNGTNGALVQSPSNQSALGAGGANSNGSAARVWGVATGSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MATGSAQGNFTGHTKKTNGNNGTNGALVQSPSNQSALGAGGANSNGSAARVWGVATGSSS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 GLAHCSVSGGDGKMDTMIGDGRSQNCWGASNSNAGINLNLNPNANPAAWPVLGHEGTVAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GLAHCSVSGGDGKMDTMIGDGRSQNCWGASNSNAGINLNLNPNANPAAWPVLGHEGTVAT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 GNPSSICSPVSAIGQNMGNQNGNPTGTLGAWGNLLPQESTEPQTSTSQNVSFSAQPQNLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GNPSSICSPVSAIGQNMGNQNGNPTGTLGAWGNLLPQESTEPQTSTSQNVSFSAQPQNLN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 TDGPNNTNPMNSSPNPINAMQTNGLPNWGMAVGMGAIIPPHLQGLPGANGSSVSQVSGGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TDGPNNTNPMNSSPNPINAMQTNGLPNWGMAVGMGAIIPPHLQGLPGANGSSVSQVSGGS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 AEGISNSVWGLSPGNPATGNSNSGFSQGNGDTVNSALSAKQNGSSSAVQKEGSGGNAWDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AEGISNSVWGLSPGNPATGNSNSGFSQGNGDTVNSALSAKQNGSSSAVQKEGSGGNAWDS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 GPPAGPGILAWGRGSGNNGVGNIHSGAWGHPSRSTSNGVNGEWGKPPNQHSNSDINGKGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GPPAGPGILAWGRGSGNNGVGNIHSGAWGHPSRSTSNGVNGEWGKPPNQHSNSDINGKGS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 TGWESPSVTSQNPTVQPGGEHMNSWAKAASSGTTASEGSSDGSGNHNEGSTGREGTGEGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TGWESPSVTSQNPTVQPGGEHMNSWAKAASSGTTASEGSSDGSGNHNEGSTGREGTGEGR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 RRDKGIIDQGHIQLPRNDLDPRVLSNTGWGQTPVKQNTAWEFEESPRSERKNDNGTEAWG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RRDKGIIDQGHIQLPRNDLDPRVLSNTGWGQTPVKQNTAWEFEESPRSERKNDNGTEAWG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 CAATQASNSGGKNDGSIMNSTNTSSVSGWVNAPPAAVPANTGWGDSNNKAPSGPGVWGDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CAATQASNSGGKNDGSIMNSTNTSSVSGWVNAPPAAVPANTGWGDSNNKAPSGPGVWGDS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 ISSTAVSTAAAAKSGHAWSGAANQEDKSPTWGEPPKPKSQHWGDGQRSNPAWSAGGGDWA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ISSTAVSTAAAAKSGHAWSGAANQEDKSPTWGEPPKPKSQHWGDGQRSNPAWSAGGGDWA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 DSSSVLGHLGDGKKNGSGWDADSNRSGSGWNDTTRSGNSGWGNSTNTKANPGTNWGETLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DSSSVLGHLGDGKKNGSGWDADSNRSGSGWNDTTRSGNSGWGNSTNTKANPGTNWGETLK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 PGPQQNWASKPQDNNVSNWGGAASVKQTGTGWIGGPVPVKQKDSSEATGWEEPSPPSIRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PGPQQNWASKPQDNNVSNWGGAASVKQTGTGWIGGPVPVKQKDSSEATGWEEPSPPSIRR
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pF1KA1 KMEIDDGTSAWGDPSNYNNKTVNMWDRNNPVIQSSTTTNTTTTTTTTTSNTTHRVETPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KMEIDDGTSAWGDPSNYNNKTVNMWDRNNPVIQSSTTTNTTTTTTTTTSNTTHRVETPPP
              730       740       750       760       770       780

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pF1KA1 HQAGTQLNRSPLLGPGRKVSSGWGEMPNVHSKTENSWGEPSSPSTLVDNGTAAWGKPPSS
       :::::::::::::::   ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HQAGTQLNRSPLLGP---VSSGWGEMPNVHSKTENSWGEPSSPSTLVDNGTAAWGKPPSS
              790          800       810       820       830       

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pF1KA1 GSGWGDHPAEPPVAFGRAGAPVAASALCKPASKSMQEGWGSGGDEMNLSTSQWEDEEGDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GSGWGDHPAEPPVAFGRAGAPVAASALCKPASKSMQEGWGSGGDEMNLSTSQWEDEEGDV
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pF1KA1 WNNAASQESTSSCSSWGNAPKKGLQKGMKTSGKQDEAWIMSRLIKQLTDMGFPREPAEEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WNNAASQESTSSCSSWGNAPKKGLQKGMKTSGKQDEAWIMSRLIKQLTDMGFPREPAEEA
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pF1KA1 LKSNNMNLDQAMSALLEKKVDVDKRGLGVTDHNGMAAKPLGCRPPISKESSVDRPTFLDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LKSNNMNLDQAMSALLEKKVDVDKRGLGVTDHNGMAAKPLGCRPPISKESSVDRPTFLDK
       960       970       980       990      1000      1010       

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA1 DGGLVEEPTPSPFLPSPSLKLPLSHSALPSQALGGIASGLGMQNLNSSRQIPSGNLGMFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DGGLVEEPTPSPFLPSPSLKLPLSHSALPSQALGGIASGLGMQNLNSSRQIPSGNLGMFG
      1020      1030      1040      1050      1060      1070       

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pF1KA1 NSGAAQARTMQQPPQPPVQPLNSSQPSLRAQVPQFLSPQVQAQLLQFAAKNIGLNPALLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NSGAAQARTMQQPPQPPVQPLNSSQPSLRAQVPQFLSPQVQAQLLQFAAKNIGLNPALLT
      1080      1090      1100      1110      1120      1130       

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA1 SPINPQHMTMLNQLYQLQLAYQRLQIQQQMLQAQRNVSGSMRQQEQQVARTITNLQQQIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SPINPQHMTMLNQLYQLQLAYQRLQIQQQMLQAQRNVSGSMRQQEQQVARTITNLQQQIQ
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pF1KA1 QHQRQLAQALLVKQPPPPPPPPHLSLHPSAGKSAMDSFPSHPQTPGLPDLQTKEQQSSPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QHQRQLAQALLVKQPPPPPPPPHLSLHPSAGKSAMDSFPSHPQTPGLPDLQTKEQQSSPN
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             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA1 TFAPYPLAGLNPNMNVNSMDMTGGLSVKDPSQSQSRLPQWTHPNSMDNLPSAASPLEQNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TFAPYPLAGLNPNMNVNSMDMTGGLSVKDPSQSQSRLPQWTHPNSMDNLPSAASPLEQNP
      1260      1270      1280      1290      1300      1310       

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA1 SKHGAIPGGLSIGPPGKSSIDDSYGRYDLIQNSESPASPPVAVPHSWSRAKSDSDKISNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SKHGAIPGGLSIGPPGKSSIDDSYGRYDLIQNSESPASPPVAVPHSWSRAKSDSDKISNG
      1320      1330      1340      1350      1360      1370       

             1390      1400      1410      1420      1430          
pF1KA1 SSINWPPEFHPGVPWKGLQNIDPENDPDVTPGSVPTGPTINTTIQDVNRYLLKSGG----
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::    
CCDS45 SSINWPPEFHPGVPWKGLQNIDPENDPDVTPGSVPTGPTINTTIQDVNRYLLKSGGSSPP
      1380      1390      1400      1410      1420      1430       

                                          1440      1450      1460 
pF1KA1 -----------------------------------KLSDIKSTWSSGPTSHTQASLSHEL
                                          :::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SSQNATLPSSSAWPLSASGYSSSFSSIASAPSVAGKLSDIKSTWSSGPTSHTQASLSHEL
      1440      1450      1460      1470      1480      1490       

            1470      1480      1490      1500      1510      1520 
pF1KA1 WKVPRNSTAPTRPPPGLTNPKPSSTWGASPLGWTSSYSSGSAWSTDTSGRTSSWLVLRNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WKVPRNSTAPTRPPPGLTNPKPSSTWGASPLGWTSSYSSGSAWSTDTSGRTSSWLVLRNL
      1500      1510      1520      1530      1540      1550       

            1530      1540      1550      1560      1570      1580 
pF1KA1 TPQIDGSTLRTLCLQHGPLITFHLNLTQGNAVVRYSSKEEAAKAQKSLHMCVLGNTTILA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TPQIDGSTLRTLCLQHGPLITFHLNLTQGNAVVRYSSKEEAAKAQKSLHMCVLGNTTILA
      1560      1570      1580      1590      1600      1610       

            1590      1600      1610      1620      1630      1640 
pF1KA1 EFAGEEEVNRFLAQGQALPPTSSWQSSSASSQPRLSAAGSSHGLVRSDAGHWNAPCLGGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EFAGEEEVNRFLAQGQALPPTSSWQSSSASSQPRLSAAGSSHGLVRSDAGHWNAPCLGGK
      1620      1630      1640      1650      1660      1670       

            1650      1660      1670      1680      1690
pF1KA1 GSSELLWGGVPQYSSSLWGPPSADDSRVIGSPTPLTTLLPGDLLSGESL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::    
CCDS45 GSSELLWGGVPQYSSSLWGPPSADDSRVIGSPTPLTTLLPGDLLSGESL
      1680      1690      1700      1710      1720      

>>CCDS10624.2 TNRC6A gene_id:27327|Hs108|chr16            (1962 aa)
 initn: 2313 init1: 631 opt: 2525  Z-score: 1378.7  bits: 268.4 E(32554): 1.8e-70
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                                             10        20        30
pF1KA1                               MATGSAQGNFTGHTKKTNGNNGTNGALVQS
                                     ::.:.. :.  :  ....: .. :  .: :
CCDS10 SAPGSDPELASECMDADSASSSESERNITIMASGNTGGEKDG-LRNSTGLGSQNKFVVGS
              250       260       270       280        290         

               40        50        60        70        80          
pF1KA1 PSNQSALGAGGANSNGSAARVWGVATGSSSGLAHCSVSGGDGKMDTMIGDGRSQNCWG--
        ::.    .: ..:.:     :: . :.  .  . ::.. ..: ..  ...: .: ::  
CCDS10 SSNN----VGHGSSTGP----WGFSHGAIISTCQVSVDAPESKSES--SNNR-MNAWGTV
     300           310           320       330         340         

       90        100       110       120       130           140   
pF1KA1 ASNSNAGINLN-LNPNANPAAWPVLGHEGTVATGNPSSICSPV----SAIGQNMGNQ--N
       .:.::.:.: . ::  .: .::::: ..: .  :  .:  : .    :.:::  .::  :
CCDS10 SSSSNGGLNPSTLNSASNHGAWPVLENNGLALKGPVGSGSSGINIQCSTIGQMPNNQSIN
      350       360       370       380       390       400        

               150       160       170       180          190      
pF1KA1 GNPTG--TLGAWGNLLPQESTEPQTSTSQNVSFSAQPQNLNTD--GPNNT-NPMNSS-PN
       .. .:  : :.::.:  ::. : ..: .:.::::.::::..:.  ::::: : :.:: ::
CCDS10 SKVSGGSTHGTWGSL--QETCESEVSGTQKVSFSGQPQNITTEMTGPNNTTNFMTSSLPN
      410       420         430       440       450       460      

         200         210       220       230       240         250 
pF1KA1 PINAMQTNGLP--NWGMAVGMGAIIPPHLQGLPGANGSSVSQVSGGSAE--GISNSVWGL
         ...:.: ::  : : :  ....  :..:.  : ::.:.:..:.: ..  :  ...:: 
CCDS10 S-GSVQNNELPSSNTG-AWRVSTMNHPQMQAPSGMNGTSLSHLSNGESKSGGSYGTTWG-
         470       480        490       500       510       520    

             260        270       280          290       300       
pF1KA1 SPGNPATGNSNSGFS-QGNGDTVNSALSAKQ-NGS-SSAVQ-KEGSGGNAWDSGPPAGPG
       . :.  .:.. :: . :.::::::..:     ::  ..  : . ..::..:.::  :.  
CCDS10 AYGSNYSGDKCSGPNGQANGDTVNATLMQPGVNGPMGTNFQVNTNKGGGVWESGA-ANSQ
           530       540       550       560       570        580  

       310       320       330       340         350       360     
pF1KA1 ILAWGRGSGNNGVGNIHSGAWGHPSRSTSNGVNG-EWGK-PPNQHSNSDINGKGST---G
         .:: :.: :. :. . : :: :...:.... . ::.: : :::::.. ::.:.:   :
CCDS10 STSWGSGNGANS-GGSRRG-WGTPAQNTGTNLPSVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNG
            590        600        610       620       630       640

            370       380       390       400       410       420  
pF1KA1 WESPSVTSQNPTVQPGGEHMNSWAKAASSGTTASEGSSDGSGNHNEGSTGREGTGEGRRR
       :.:    .:. ...  .:. . :::  ..::. :.::....:  .:     .::::.. :
CCDS10 WKSTEEEDQGSATSQTNEQSSVWAK--TGGTVESDGSTESTGRLEE-----KGTGESQSR
              650       660         670       680            690   

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pF1KA1 DKGIIDQGHIQLP----RNDLDPRVLSNTGWGQTPVKQNTAWEFEESPRSERKNDNGTEA
       :.  ::: :  :     :.:::::::::.::::::.::::::. : :::.:::.::::::
CCDS10 DRRKIDQ-HTLLQSIVNRTDLDPRVLSNSGWGQTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEA
           700        710       720       730       740       750  

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pF1KA1 WGCAATQASNSGGKNDGSIMNSTNTSSVSGWVNAPPAAVPANTGWGDSNNKAPSGPGVWG
       :: .:::. :::.  : .  :...::::::: .  ::       ::::  :. .  : : 
CCDS10 WGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSVSGWGDPKPA-----LRWGDS--KGSNCQGGWE
            760       770       780            790         800     

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pF1KA1 DSISSTAVSTAAAAKSGHAWSGAANQEDKSPTWGEPPKPKSQHWGDGQRSNPAWSAGGGD
       :. ..:..     .::.. :   .: .... .:..  : : : :::::.:. .::....:
CCDS10 DDSAATGM-----VKSNQ-W---GNCKEEKAAWNDSQKNK-QGWGDGQKSSQGWSVSASD
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pF1KA1 -WADSSSVLGHLGDGKKNGSGWDADSNRSGSGWNDTTRSGNSGWGNSTNTKANPGTNWGE
        :...:   .: :...:..:.  .::.:: ::::.  ....  :::. :   : ...: :
CCDS10 NWGETSRN-NHWGEANKKSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGNNIN--PNNSSGWDE
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pF1KA1 TLKPGPQQNWASKPQDNNVSNWGGA-----------------------ASVKQTGTGWIG
       . :: :.:.:.. :..:.  .:: .                       :. :  ::::.:
CCDS10 SSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNKQQDIVGSWGIPPATGKPPGTGWLG
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pF1KA1 GPVPVKQKDSSEATGWEEPSPPSIRRKMEIDDGTSAWGDPSNYNNKTVNMWDRNNPVIQS
       ::.:.  :.  : :::::::: :::::::::::::::::::.:: :.::::..: :    
CCDS10 GPIPAPAKEE-EPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNYKNVNMWNKNVP----
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pF1KA1 STTTNTTTTTTTTTSNTTHRVETPPPHQAGTQLNRSPLLGPGRKVSSGWGEMPNVHSKTE
             . .. .  .  .:.. ::    :..  :.    :      ::::: :       
CCDS10 ------NGNSRSDQQAQVHQLLTP----ASAISNKEASSG------SGWGE-P-------
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pF1KA1 NSWGEPSSPSTLVDNGTAAWGKPPSSGSGWGDHPAEPPVAFGRAGAPVAASALCKPASKS
         :::::.:.: :::::.::::: .:: .::.  :    .   ... :. .:: : . ::
CCDS10 --WGEPSTPATTVDNGTSAWGKPIDSGPSWGEPIAAASSTSTWGSSSVGPQALSKSGPKS
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pF1KA1 MQEGWGSGGDEMNLSTSQ---WEDEEGDV----WNNAASQESTSSCSSWGNAPKKGLQKG
       ::.::   ::.: :  ..   ::.:: ::    ::. .::: .:: . :    ::  .::
CCDS10 MQDGWC--GDDMPLPGNRPTGWEEEE-DVEIGMWNSNSSQELNSSLN-WPPYTKKMSSKG
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pF1KA1 ------------MKTSGKQDEAWIMSRLIKQLTDMGFPREPAEEALKSNNMNLDQAMSAL
                   :: ..::.:::: . ..::.....: :.  :: ..::.:.:. .:  :
CCDS10 LSGKKRRRERGMMKGGNKQEEAWI-NPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGM--L
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pF1KA1 LEKKVDVDKRGLGVTDHNGMAAKPLGCRPPISKESSVDRPTFLDKDGGLVEEPTPSPFLP
        .:....::..:.. :.:  ..:  : :: ::::::..:  ..:::: ...:     :. 
CCDS10 QDKRMEIDKHSLNIGDYNRTVGKGPGSRPQISKESSMERNPYFDKDGIVADESQNMQFMS
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       : :.::: :.::::.::::.:: ::::::::: ::  .:: .::: .. ::: : :::: 
CCDS10 SQSMKLPPSNSALPNQALGSIA-GLGMQNLNSVRQ--NGNPSMFGVGNTAAQPRGMQQP-
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         :.:::.::::.::::::  .::::: ..::..: .: :::: .     .::...::::
CCDS10 --PAQPLSSSQPNLRAQVPPPLLSPQVPVSLLKYAPNNGGLNPLF-----GPQQVAMLNQ
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pF1KA1 LYQL-QLAY----QRLQIQQQMLQAQRNVSGSMRQQEQQVARTITNLQQQIQQHQRQLAQ
       : :: ::.     :::  :::  :.::.: .. : :..: .: .. .:::..:..:::  
CCDS10 LSQLNQLSQISQLQRLLAQQQRAQSQRSVPSGNRPQQDQQGRPLS-VQQQMMQQSRQLDP
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pF1KA1 ALLVKQPPPPPPPPHLSLHPSAGKSAMDSFPSHPQTPGLPDLQTKEQQSSP-NTFAPYPL
        :::::  ::    .  ::  : :: .:.    :.:   :.::   .  :: :.:. .:.
CCDS10 NLLVKQQTPPS--QQQPLHQPAMKSFLDNV--MPHTT--PELQ---KGPSPINAFSNFPI
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        ::: :.::: :::.   :.:.:   :::: .::   ..:.. :. . :.:: :::::: 
CCDS10 -GLNSNLNVN-MDMN---SIKEP---QSRLRKWT---TVDSI-SVNTSLDQNSSKHGAIS
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       .:. .        .. .  ::....: :::::: ..  .: :::: .    ..::.::::
CCDS10 SGFRLE-------ESPFVPYDFMNSSTSPASPPGSIGDGWPRAKSPN----GSSSVNWPP
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       ::.:: ::::  :::::.:: :::::: .. .::: ...:..   ...:. :....:   
CCDS10 EFRPGEPWKGYPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINT-VREVDHLRDRNSGSSSSLNTTLPS
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pF1KA1 ---WSS----------------------------GPTSHTQASLSHELWKVP---RNSTA
          :::                            .: : :..::.:::::::   .: ::
CCDS10 TSAWSSIRASNYNVPLSSTAQSTSARNSDSKLTWSPGSVTNTSLAHELWKVPLPPKNITA
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pF1KA1 PTRPPPGLTNPKPS-STWGASPL----GWTSS---YSSGSAWSTDTSGRTSSWLVLRNLT
       :.:::::::. ::  :::  :::    :: .:   :. ::.:. ..::: ..::::.:::
CCDS10 PSRPPPGLTGQKPPLSTWDNSPLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLT
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       ::::::::::::.:::::::::::: .:::.::::::::..:::::::::::::::::::
CCDS10 PQIDGSTLRTLCMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAE
    1790      1800      1810      1820      1830      1840         

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pF1KA1 FAGEEEVNRFLAQGQALPPTSSWQSSSASSQPRLSAAGSSHGLV-RSDAGHWNAPCLGGK
       ::.:::..::.::.:.: :. .::: . ::: ::..   ::..  :.: .:::.  :.: 
CCDS10 FASEEEISRFFAQSQSLTPSPGWQSLG-SSQSRLGSLDCSHSFSSRTDLNHWNGAGLSGT
    1850      1860      1870       1880      1890      1900        

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pF1KA1 GSSEL----LWGGVPQYSSSLWGPPSADDSRVIGSPTPLTTLLPGDLLSGESL  
       . ..:    ::: .:.::.:::::::..: : :.::.:....:  : :.:     
CCDS10 NCGDLHGTSLWG-TPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM
     1910      1920       1930      1940      1950      1960  

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CCDS81 SAPGSDPELASECMDADSASSSESERNITIMASGNTGGEKDG-LRNSTGLGSQNKFVVGS
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CCDS81 SSNN----VGHGSSTGP----WGFSHGAIISTCQVSVDAPESKSES--SNNR-MNAWGTV
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pF1KA1 ASNSNAGINLN-LNPNANPAAWPVLGHEGTVATGNPSSICSPV----SAIGQNMGNQ--N
       .:.::.:.: . ::  .: .::::: ..: .  :  .:  : .    :.:::  .::  :
CCDS81 SSSSNGGLNPSTLNSASNHGAWPVLENNGLALKGPVGSGSSGINIQCSTIGQMPNNQSIN
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pF1KA1 GNPTG--TLGAWGNLLPQESTEPQTSTSQNVSFSAQPQNLNTD--GPNNT-NPMNSS-PN
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CCDS81 SKVSGGSTHGTWGSL--QETCESEVSGTQKVSFSGQPQNITTEMTGPNNTTNFMTSSLPN
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pF1KA1 PINAMQTNGLP--NWGMAVGMGAIIPPHLQGLPGANGSSVSQVSGGSAE--GISNSVWGL
         ...:.: ::  : : :  ....  :..:.  : ::.:.:..:.: ..  :  ...:: 
CCDS81 S-GSVQNNELPSSNTG-AWRVSTMNHPQMQAPSGMNGTSLSHLSNGESKSGGSYGTTWG-
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pF1KA1 SPGNPATGNSNSGFS-QGNGDTVNSALSAKQ-NGS-SSAVQ-KEGSGGNAWDSGPPAGPG
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CCDS81 AYGSNYSGDKCSGPNGQANGDTVNATLMQPGVNGPMGTNFQVNTNKGGGVWESGA-ANSQ
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pF1KA1 ILAWGRGSGNNGVGNIHSGAWGHPSRSTSNGVNG-EWGK-PPNQHSNSDINGKGST---G
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CCDS81 STSWGSGNGANS-GGSRRG-WGTPAQNTGTNLPSVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNG
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pF1KA1 WESPSVTSQNPTVQPGGEHMNSWAKAASSGTTASEGSSDGSGNHNEGSTGREGTGEGRRR
       :.:    .:. ...  .:. . :::  ..::. :.::....:  .:     .::::.. :
CCDS81 WKSTEEEDQGSATSQTNEQSSVWAK--TGGTVESDGSTESTGRLEE-----KGTGESQSR
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pF1KA1 DKGIIDQGHIQLP----RNDLDPRVLSNTGWGQTPVKQNTAWEFEESPRSERKNDNGTEA
       :.  ::: :  :     :.:::::::::.::::::.::::::. : :::.:::.::::::
CCDS81 DRRKIDQ-HTLLQSIVNRTDLDPRVLSNSGWGQTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEA
           700        710       720       730       740       750  

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pF1KA1 WGCAATQASNSGGKNDGSIMNSTNTSSVSGWVNAPPAAVPANTGWGDSNNKAPSGPGVWG
       :: .:::. :::.  : .  :...::::::: .  ::       ::::  :. .  : : 
CCDS81 WGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSVSGWGDPKPA-----LRWGDS--KGSNCQGGWE
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pF1KA1 DSISSTAVSTAAAAKSGHAWSGAANQEDKSPTWGEPPKPKSQHWGDGQRSNPAWSAGGGD
       :. ..:..     .::.. :   .: .... .:..  : : : :::::.:. .::....:
CCDS81 DDSAATGM-----VKSNQ-W---GNCKEEKAAWNDSQKNK-QGWGDGQKSSQGWSVSASD
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pF1KA1 -WADSSSVLGHLGDGKKNGSGWDADSNRSGSGWNDTTRSGNSGWGNSTNTKANPGTNWGE
        :...:   .: :...:..:.  .::.:: ::::.  ....  :::. :   : ...: :
CCDS81 NWGETSRN-NHWGEANKKSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGNNIN--PNNSSGWDE
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pF1KA1 TLKPGPQQNWASKPQDNNVSNWGGA-----------------------ASVKQTGTGWIG
       . :: :.:.:.. :..:.  .:: .                       :. :  ::::.:
CCDS81 SSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNKQQDIVGSWGIPPATGKPPGTGWLG
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pF1KA1 GPVPVKQKDSSEATGWEEPSPPSIRRKMEIDDGTSAWGDPSNYNNKTVNMWDRNNPVIQS
       ::.:.  :.  : :::::::: :::::::::::::::::::.:: :.::::..: :    
CCDS81 GPIPAPAKEE-EPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNYKNVNMWNKNVP----
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pF1KA1 STTTNTTTTTTTTTSNTTHRVETPPPHQAGTQLNRSPLLGPGRKVSSGWGEMPNVHSKTE
             . .. .  .  .:.. ::    :..  :.    :      ::::: :       
CCDS81 ------NGNSRSDQQAQVHQLLTP----ASAISNKEASSG------SGWGE-P-------
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pF1KA1 NSWGEPSSPSTLVDNGTAAWGKPPSSGSGWGDHPAEPPVAFGRAGAPVAASALCKPASKS
         :::::.:.: :::::.::::: .:: .::.  :    .   ... :. .:: : . ::
CCDS81 --WGEPSTPATTVDNGTSAWGKPIDSGPSWGEPIAAASSTSTWGSSSVGPQALSKSGPKS
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pF1KA1 MQEGWGSGGDEMNLSTSQ---WEDEEGDV----WNNAASQESTSSCSSWGNAPKKGLQKG
       ::.::   ::.: :  ..   ::.:: ::    ::. .::: .:: . :    ::  .::
CCDS81 MQDGWC--GDDMPLPGNRPTGWEEEE-DVEIGMWNSNSSQELNSSLN-WPPYTKKMSSKG
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pF1KA1 ------------MKTSGKQDEAWIMSRLIKQLTDMGFPREPAEEALKSNNMNLDQAMSAL
                   :: ..::.:::: . ..::.....: :.  :: ..::.:.:. .:  :
CCDS81 LSGKKRRRERGMMKGGNKQEEAWI-NPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGM--L
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pF1KA1 LEKKVDVDKRGLGVTDHNGMAAKPLGCRPPISKESSVDRPTFLDKDGGLVEEPTPSPFLP
        .:....::..:.. :.:  ..:  : :: ::::::..:  ..::.:.      :: :  
CCDS81 QDKRMEIDKHSLNIGDYNRTVGKGPGSRPQISKESSMERNPYFDKNGN------PSMF--
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CCDS81 -------------------GV-----------------------GNT-AAQPRGMQQP--
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pF1KA1 PPVQPLNSSQPSLRAQVPQ-FLSPQVQAQLLQFAAKNIGLNPALLTSPINPQHMTMLNQL
        :.:::.::::.::::::  .::::: ..::..: .: :::: .     .::...:::::
CCDS81 -PAQPLSSSQPNLRAQVPPPLLSPQVPVSLLKYAPNNGGLNPLF-----GPQQVAMLNQL
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pF1KA1 YQL-QLAY----QRLQIQQQMLQAQRNVSGSMRQQEQQVARTITNLQQQIQQHQRQLAQA
        :: ::.     :::  :::  :.::.: .. : :..: .: .. .:::..:..:::   
CCDS81 SQLNQLSQISQLQRLLAQQQRAQSQRSVPSGNRPQQDQQGRPLS-VQQQMMQQSRQLDPN
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pF1KA1 LLVKQPPPPPPPPHLSLHPSAGKSAMDSFPSHPQTPGLPDLQTKEQQSSP-NTFAPYPLA
       :::::  ::    .  ::  : :: .:.    :.:   :.::   .  :: :.:. .:. 
CCDS81 LLVKQQTPPS--QQQPLHQPAMKSFLDNV--MPHTT--PELQ---KGPSPINAFSNFPI-
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pF1KA1 GLNPNMNVNSMDMTGGLSVKDPSQSQSRLPQWTHPNSMDNLPSAASPLEQNPSKHGAIPG
       ::: :.::: :::.   :.:.:   :::: .::   ..:.. :. . :.:: :::::: .
CCDS81 GLNSNLNVN-MDMN---SIKEP---QSRLRKWT---TVDSI-SVNTSLDQNSSKHGAISS
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       :. .        .. .  ::....: :::::: ..  .: :::: .    ..::.:::::
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       :.:: ::::  :::::.:: :::::: .. .::: ...:..   ...:. :....:    
CCDS81 FRPGEPWKGYPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINT-VREVDHLRDRNSGSSSSLNTTLPST
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pF1KA1 --WSS----------------------------GPTSHTQASLSHELWKVP---RNSTAP
         :::                            .: : :..::.:::::::   .: :::
CCDS81 SAWSSIRASNYNVPLSSTAQSTSARNSDSKLTWSPGSVTNTSLAHELWKVPLPPKNITAP
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pF1KA1 TRPPPGLTNPKPS-STWGASPL----GWTSS---YSSGSAWSTDTSGRTSSWLVLRNLTP
       .:::::::. ::  :::  :::    :: .:   :. ::.:. ..::: ..::::.::::
CCDS81 SRPPPGLTGQKPPLSTWDNSPLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLTP
            1690      1700      1710      1720      1730      1740 

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       :::::::::::.:::::::::::: .:::.::::::::..::::::::::::::::::::
CCDS81 QIDGSTLRTLCMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEF
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pF1KA1 AGEEEVNRFLAQGQALPPTSSWQSSSASSQPRLSAAGSSHGLV-RSDAGHWNAPCLGGKG
       :.:::..::.::.:.: :. .::: . ::: ::..   ::..  :.: .:::.  :.: .
CCDS81 ASEEEISRFFAQSQSLTPSPGWQSLG-SSQSRLGSLDCSHSFSSRTDLNHWNGAGLSGTN
            1810      1820       1830      1840      1850      1860

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pF1KA1 SSEL----LWGGVPQYSSSLWGPPSADDSRVIGSPTPLTTLLPGDLLSGESL  
        ..:    ::: .:.::.:::::::..: : :.::.:....:  : :.:     
CCDS81 CGDLHGTSLWG-TPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM
             1870       1880      1890      1900      1910   

>>CCDS54533.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22            (1833 aa)
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pF1KA1                MATGSAQGNFTGHTKKTNGNNGTNGALVQSPSNQSALGAGGANSN
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CCDS54 TSPNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSEKSTLPGSTTSN
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pF1KA1 -GSAARVWGVATGSSSGLA-------HCSVSGGDGKMDTMIGDGRSQNCWGASNSNAGIN
        :....  ....:.  .:.         ::.....  ..  : :  .:  : .  . : .
CCDS54 KGKGSQCQSASSGNECNLGVWKSDPKAKSVQSSNSTTENNNGLGNWRNVSGQDRIGPGSG
      240       250       260       270       280       290        

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pF1KA1 L-NLNPNANPAAWPVLGHEGTVATGNPSSICSPVSAIGQNMGNQNGNPTGTLGAWGNLL-
       . :.:::.::.:::.: .:::   :               . ..:.: .. ... :.   
CCDS54 FSNFNPNSNPSAWPALVQEGTSRKGA--------------LETDNSNSSAQVSTVGQTSR
      300       310       320                     330       340    

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pF1KA1 PQESTEPQTSTSQNVSFSAQPQNLNTDGPNN--TNPMN-SSPNPINAMQTNGLPNWGMAV
        :.:   .....  ::   : :  :::::.:  :: .: :::::..        : ::  
CCDS54 EQQSKMENAGVNFVVSGREQAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNPME--------NKGMPF
          350       360       370       380       390              

            220       230       240       250           260        
pF1KA1 GMGAIIPPHLQGLPGANGSSVSQVSGGSAEGISNSVWGLSPG----NPATGNSNSGFSQG
       :::        :  . . .. :: .:    : : . :: . :    . ..:.:::: . .
CCDS54 GMGL-------GNTSRSTDAPSQSTGDRKTG-SVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGN
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pF1KA1 NG----DTVNSALSAKQNGSSSAVQKEG--SGGNAWDSGPPAGPGILAWGRGSGNNGVGN
       ::    :. ..:   :..::..    ..  : :..:. ::  .     ::.  ::. ...
CCDS54 NGKEREDSWKGASVQKSTGSKNDSWDNNNRSTGGSWNFGPQDSNDN-KWGE--GNKMTSG
      450       460       470       480       490          500     

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pF1KA1 IHSGAWGHPSRSTSNGVNGEWGKP--PNQHSNSDINGKGSTGWESPSVTSQNPTVQPGGE
       . .: : .:. :    . :::. :  ::. ...  : ::      :   .:      :. 
CCDS54 VSQGEWKQPTGSDELKI-GEWSGPNQPNSSTGAWDNQKGH-----PLPENQ------GNA
         510       520        530       540            550         

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pF1KA1 HMNSWAKAASSGTTASEGSSDGSGNHNEGSTGREGTGEGRRRDKGIIDQGHIQ--LPRND
       .   :....::  .   :.: :: ::. ::.  ...:.   :      :. .:  : :.:
CCDS54 QAPCWGRSSSSTGSEVGGQSTGS-NHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDCQAVLQTLLSRTD
           560       570        580       590       600       610  

      440       450       460       470       480       490        
pF1KA1 LDPRVLSNTGWGQTPVKQNTAWEFEESPRSERKNDNGTEAWGCAATQASNSGGKNDGSIM
       :::::::::::::: .::.:.:..:: :: : :.:.:::.:  ::::..:::: .:.   
CCDS54 LDPRVLSNTGWGQTQIKQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQTKNSGGWGDAP--
            620       630       640       650       660       670  

      500       510       520       530       540       550        
pF1KA1 NSTNTSSVSGWVNAPPAAVPANTGWGDSNNKAPSGPGVWGDSISSTAVSTAAAAKSGHAW
        : ...  :::     . . :.: : :     :.. : :.:  .... .          :
CCDS54 -SQSNQMKSGW-----GELSASTEWKD-----PKNTGGWNDYKNNNSSN----------W
               680            690            700                   

      560       570       580       590       600       610        
pF1KA1 SGAANQEDKSPTWGEPPKPKSQHWGDGQRSNPAWSAGGGDWADSSSVLGHLGDGKKNGSG
       .:.  .:    .:.: :. :.: :: :.. : .::.: . :       :.  :  :: :.
CCDS54 GGGRPDEKTPSSWNENPS-KDQGWGGGRQPNQGWSSGKNGW-------GEEVDQTKN-SN
     710       720        730       740              750        760

      620       630       640       650       660               670
pF1KA1 WDADSNRSGSGWNDTTRSGNSGWGNSTNTKANPGTNWGETLKPGPQQN--------WASK
       :......  :::..  ..  . :::. :..     .: :  : .:  :        : ..
CCDS54 WESSASKPVSGWGEGGQNEIGTWGNGGNASLASKGGW-EDCKRSPAWNETGRQPNSWNKQ
              770       780       790        800       810         

                          680            690       700       710   
pF1KA1 ------------PQDNNVSNWGGA-----ASVKQTGTGWIGGPVPVKQKDSSEATGWEEP
                   :: .  ..:::      ..:. ....: .:: :.  ::  : .:::::
CCDS54 HQQQQPPQQPPPPQPEASGSWGGPPPPPPGNVRPSNSSWSSGPQPATPKDE-EPSGWEEP
     820       830       840       850       860       870         

           720       730       740       750       760       770   
pF1KA1 SPPSIRRKMEIDDGTSAWGDPSNYNNKTVNMWDRNNPVIQSSTTTNTTTTTTTTTSNTTH
       :: :: :::.:::::::::::..:: :.::.::.:.   :..                  
CCDS54 SPQSISRKMDIDDGTSAWGDPNSYNYKNVNLWDKNS---QGG------------------
      880       890       900       910                            

           780       790       800       810       820       830   
pF1KA1 RVETPPPHQAGTQLNRSPLLGPGRKVSSGWGEMPNVHSKTENSWGEPSSPSTLVDNGTAA
           : :        : : : :           : . ::. . :.. . :.   ::::.:
CCDS54 ----PAP--------REPNL-P----------TP-MTSKSASVWSKSTPPAP--DNGTSA
           920                           930       940         950 

           840       850       860       870       880        890  
pF1KA1 WGKPPSSGSGWGDHPAEPPVAFGRAGAPVAASALCKPASKSMQEGWG-SGGDEMNLSTSQ
       ::.:  :. :::.       . : ...:. :    :: :::::.::: : :   .    .
CCDS54 WGEPNESSPGWGEMDDTGASTTGWGNTPANAPNAMKPNSKSMQDGWGESDGPVTGARHPS
             960       970       980       990      1000      1010 

             900       910         920       930       940         
pF1KA1 WEDEE-GDVWNNAASQESTSS--CSSWGNAPKKGLQKGMKTSGKQDEAWIMSRLIKQLTD
       ::.:: : :::...:: :.::   .:::.. :: .. ..:  : ....: :. : ::...
CCDS54 WEEEEDGGVWNTTGSQGSASSHNSASWGQGGKKQMKCSLK--GGNNDSW-MNPLAKQFSN
            1020      1030      1040      1050         1060        

     950       960       970       980       990      1000         
pF1KA1 MGFPREPAEEALKSNNMNLDQAMSALLEKKVDVDKRGLGVTDHNGMAAKPL-GCRPPISK
       ::.  .  ..   :..:.:  ....: .:: :::::.... : : .  :   : ::: ::
CCDS54 MGLLSQTEDNP--SSKMDL--SVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSK
     1070        1080        1090      1100      1110      1120    

      1010      1020              1030      1040      1050         
pF1KA1 E-SSVDRPTFLDK--------DGGLVEEPTPSPFLPSPSLKLPLSHSALPSQALGGIASG
       . ...:   ...:        :: : .:   ::: :::: ::  : :.::. .::.:..:
CCDS54 DMGTTDSGPYFEKLTLPFSNQDGCLGDEAPCSPFSPSPSYKLSPSGSTLPNVSLGAIGTG
         1130      1140      1150      1160      1170      1180    

    1060      1070      1080      1090      1100      1110         
pF1KA1 LGMQNLNSSRQIPSGNLGMFGNSGAAQARTMQQPPQPPVQPLNSSQPSLRAQVP-QFLSP
       :. ::. ..::  .:. :.:::: .::.: .. :    ::::::: :::::::: ::.::
CCDS54 LNPQNF-AARQ--GGSHGLFGNS-TAQSRGLHTP----VQPLNSS-PSLRAQVPPQFISP
         1190         1200       1210          1220       1230     

     1120       1130      1140        1150         1160            
pF1KA1 QVQAQLL-QFAAKNIGLNPALLT-SP-INPQHMTMLNQLYQL---QLAYQRL---QIQQQ
       ::.:..: ::   : ::.:.:.. .: ..::...::.:: :.   ::: : :   : :::
CCDS54 QVSASMLKQF--PNSGLSPGLFNVGPQLSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQ
        1240        1250      1260      1270      1280      1290   

    1170      1180       1190      1200      1210      1220        
pF1KA1 MLQAQRNVSGSMRQQ-EQQVARTITNLQQQIQQHQRQLAQALLVKQPPPPPPPPHLSLHP
       .:: ::..: ..::: :::.:: .. :::: ::.:::             :   :   ::
CCDS54 LLQNQRKISQAVRQQQEQQLARMVSALQQQQQQQQRQ-------------PGMKHSPSHP
          1300      1310      1320      1330                   1340

     1230      1240      1250      1260      1270      1280        
pF1KA1 SAGKSAMDSFPSHPQTPGLPDLQTKEQQSSPNTFAPYPLAGLNPNMNVNSMD--MTGGLS
        . :  .:..  .  . ::::::::         .: :  : . ... ..::  :.::  
CCDS54 VGPKPHLDNMVPNALNVGLPDLQTK---------GPIP--GYGSGFSSGGMDYGMVGG--
             1350      1360                 1370      1380         

       1290      1300      1310      1320      1330      1340      
pF1KA1 VKDPSQSQSRLPQWTHPNSMDNLPSAASPLEQNPSKHGAIPGGLSIGPPGKSSIDDSYGR
        :. . ..::. :::  . :..:::.:.  : :  :.::: .      :::.   . :..
CCDS54 -KE-AGTESRFKQWT--SMMEGLPSVATQ-EANMHKNGAIVA------PGKTRGGSPYNQ
        1390      1400        1410       1420            1430      

       1350       1360      1370        1380      1390      1400   
pF1KA1 YDLIQ-NSESPASPPVAVPHSWSRAKSD-SDKI-SNGSSINWPPEFHPGVPWKGLQNIDP
       .:.:  .. .  . :..   ::  :::  ..:: :..:. .:::::.:::::::.:::::
CCDS54 FDIIPGDTLGGHTGPAG--DSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDP
       1440      1450        1460      1470      1480      1490    

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pF1KA1 ENDPDVTPGSVPTGPTINTTIQDVNRYLLK------------------------------
       :.:: ::::::  : : .. : :... ::.                              
CCDS54 ESDPYVTPGSV-LGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWPYSASDNSFT
         1500       1510      1520      1530      1540      1550   

              1440      1450      1460         1470      1480      
pF1KA1 ----SGGKLSDIKSTWSSGPTSHTQASLSHELWK---VPRNSTAPTRPPPGLTNPKPSST
           ...:. : :::::  : .:. . ::...::     ::.:   ::::::::::::: 
CCDS54 NVHSTSAKFPDYKSTWSPDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKPSSP
          1560      1570      1580      1590      1600      1610   

       1490             1500      1510      1520      1530         
pF1KA1 WGAS-PL---GW---TSSYSSGSAWSTDTSGRTSSWLVLRNLTPQIDGSTLRTLCLQHGP
       :... :    ::    :  .:.:.::   : : : ::::.:::::::::::::.:.::::
CCDS54 WSSTAPRSVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGP
          1620      1630      1640      1650      1660      1670   

    1540      1550      1560      1570      1580      1590         
pF1KA1 LITFHLNLTQGNAVVRYSSKEEAAKAQKSLHMCVLGNTTILAEFAGEEEVNRFLAQGQ--
       :.:::::::::.:..:::.:.:::::: .:::::::::::::::: ..::.:::::.:  
CCDS54 LLTFHLNLTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPP
          1680      1690      1700      1710      1720      1730   

         1600         1610           1620      1630      1640      
pF1KA1 ---ALP--PTSSWQS-SSASSQ-----PRLSAAGSSHGLVRSDAGHWNAPCLGGKGSSEL
          : :  :...:::  ....:     : :.  :.: ::     :.:..   ::.....:
CCDS54 TPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGL-----GQWSSSA-GGSSGADL
          1740      1750      1760      1770            1780       

           1650      1660      1670      1680      1690  
pF1KA1 ----LWGGVPQYSSSLWGPPSADDSRVIGSPTPLTTLLPGDLLSGESL  
           :::  :.::::::: :...: . .:::.:   :::::::.: :   
CCDS54 AGASLWGP-PNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPAP---LLPGDLLGGGSDSI
      1790       1800      1810         1820      1830   

>>CCDS46713.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22            (1723 aa)
 initn: 1705 init1: 542 opt: 1046  Z-score: 578.5  bits: 120.1 E(32554): 6.6e-26
Smith-Waterman score: 2769; 35.4% identity (57.3% similar) in 1809 aa overlap (16-1689:209-1720)

                              10        20        30        40     
pF1KA1                MATGSAQGNFTGHTKKTNGNNGTNGALVQSPSNQSALGAGGANSN
                                     .....: :..  ...:.....   :...::
CCDS46 TSPNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSEKSTLPGSTTSN
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pF1KA1 -GSAARVWGVATGSSSGLA-------HCSVSGGDGKMDTMIGDGRSQNCWGASNSNAGIN
        :....  ....:.  .:.         ::.....  ..  : :  .:  : .  . : .
CCDS46 KGKGSQCQSASSGNECNLGVWKSDPKAKSVQSSNSTTENNNGLGNWRNVSGQDRIGPGSG
      240       250       260       270       280       290        

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pF1KA1 L-NLNPNANPAAWPVLGHEGTVATGNPSSICSPVSAIGQNMGNQNGNPTGTLGAWGNLL-
       . :.:::.::.:::.: .:::   :               . ..:.: .. ... :.   
CCDS46 FSNFNPNSNPSAWPALVQEGTSRKGA--------------LETDNSNSSAQVSTVGQTSR
      300       310       320                     330       340    

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pF1KA1 PQESTEPQTSTSQNVSFSAQPQNLNTDGPNN--TNPMN-SSPNPINAMQTNGLPNWGMAV
        :.:   .....  ::   : :  :::::.:  :: .: :::::..        : ::  
CCDS46 EQQSKMENAGVNFVVSGREQAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNPME--------NKGMPF
          350       360       370       380       390              

            220       230       240       250           260        
pF1KA1 GMGAIIPPHLQGLPGANGSSVSQVSGGSAEGISNSVWGLSPG----NPATGNSNSGFSQG
       :::        :  . . .. :: .:    : : . :: . :    . ..:.:::: . .
CCDS46 GMGL-------GNTSRSTDAPSQSTGDRKTG-SVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGN
        400              410       420        430       440        

      270           280       290         300       310       320  
pF1KA1 NG----DTVNSALSAKQNGSSSAVQKEG--SGGNAWDSGPPAGPGILAWGRGSGNNGVGN
       ::    :. ..:   :..::..    ..  : :..:. ::  .     ::.  ::. ...
CCDS46 NGKEREDSWKGASVQKSTGSKNDSWDNNNRSTGGSWNFGPQDSNDN-KWGE--GNKMTSG
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pF1KA1 IHSGAWGHPSRSTSNGVNGEWGKP--PNQHSNSDINGKGSTGWESPSVTSQNPTVQPGGE
       . .: : .:. :    . :::. :  ::. ...  : ::      :   .:      :. 
CCDS46 VSQGEWKQPTGSDELKI-GEWSGPNQPNSSTGAWDNQKGH-----PLPENQ------GNA
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pF1KA1 HMNSWAKAASSGTTASEGSSDGSGNHNEGSTGREGTGEGRRRDKGIIDQGHIQ--LPRND
       .   :....::  .   :.: :: ::. ::.  ...:.   :      :. .:  : :.:
CCDS46 QAPCWGRSSSSTGSEVGGQSTGS-NHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDCQAVLQTLLSRTD
           560       570        580       590       600       610  

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pF1KA1 LDPRVLSNTGWGQTPVKQNTAWEFEESPRSERKNDNGTEAWGCAATQASNSGGKNDGSIM
       :::::::::::::: .::.:.:..:: :: : :.:.:::.:  ::::..:::: .:.   
CCDS46 LDPRVLSNTGWGQTQIKQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQTKNSGGWGDAP--
            620       630       640       650       660       670  

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pF1KA1 NSTNTSSVSGWVNAPPAAVPANTGWGDSNNKAPSGPGVWGDSISSTAVSTAAAAKSGHAW
        : ...  :::     . . :.: : :     :.. : :.:  .... .          :
CCDS46 -SQSNQMKSGW-----GELSASTEWKD-----PKNTGGWNDYKNNNSSN----------W
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pF1KA1 SGAANQEDKSPTWGEPPKPKSQHWGDGQRSNPAWSAGGGDWADSSSVLGHLGDGKKNGSG
       .:.  .:    .:.: :. :.: :: :.. : .::.: . :       :.  :  :: :.
CCDS46 GGGRPDEKTPSSWNENPS-KDQGWGGGRQPNQGWSSGKNGW-------GEEVDQTKN-SN
     710       720        730       740              750        760

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pF1KA1 WDADSNRSGSGWNDTTRSGNSGWGNSTNTKANPGTNWGETLKPGPQQN--------WASK
       :......  :::..  ..  . :::. :..     .: :  : .:  :        : ..
CCDS46 WESSASKPVSGWGEGGQNEIGTWGNGGNASLASKGGW-EDCKRSPAWNETGRQPNSWNKQ
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pF1KA1 ------------PQDNNVSNWGGA-----ASVKQTGTGWIGGPVPVKQKDSSEATGWEEP
                   :: .  ..:::      ..:. ....: .:: :.  ::  : .:::::
CCDS46 HQQQQPPQQPPPPQPEASGSWGGPPPPPPGNVRPSNSSWSSGPQPATPKDE-EPSGWEEP
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pF1KA1 SPPSIRRKMEIDDGTSAWGDPSNYNNKTVNMWDRNNPVIQSSTTTNTTTTTTTTTSNTTH
       :: :: :::.:::::::::::..:: :.::.::.:                         
CCDS46 SPQSISRKMDIDDGTSAWGDPNSYNYKNVNLWDKN-------------------------
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                                 :.: :  :           ::. :.         
CCDS46 --------------------------SQG-GPAPR----------EPNLPT---------
                                      920                          

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pF1KA1 WGKPPSSGSGWGDHPAEPPVAFGRAGAPVAASALCKPASKSMQEGWG-SGGDEMNLSTSQ
           : .... .:                         :::::.::: : :   .    .
CCDS46 ----PMTSKSASD-------------------------SKSMQDGWGESDGPVTGARHPS
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pF1KA1 WEDEE-GDVWNNAASQESTSS--CSSWGNAPKKGLQKGMKTSGKQDEAWIMSRLIKQLTD
       ::.:: : :::...:: :.::   .:::.. :: .. ..:  : ....: :. : ::...
CCDS46 WEEEEDGGVWNTTGSQGSASSHNSASWGQGGKKQMKCSLK--GGNNDSW-MNPLAKQFSN
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pF1KA1 MGFPREPAEEALKSNNMNLDQAMSALLEKKVDVDKRGLGVTDHNGMAAKPL-GCRPPISK
       ::.  .  ..   :..:.:  ....: .:: :::::.... : : .  :   : ::: ::
CCDS46 MGLLSQTEDNP--SSKMDL--SVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSK
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pF1KA1 E-SSVDRPTFLDKDGGLVEEPTPSPFLPSPSLKLPLSHSALPSQALGGIASGLGMQNLNS
       . ...:   ...: :                     ::                      
CCDS46 DMGTTDSGPYFEKGG---------------------SH----------------------
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                :.:::: .::.: ..     :::::::: :::::::: ::.::::.:..: 
CCDS46 ---------GLFGNS-TAQSRGLH----TPVQPLNSS-PSLRAQVPPQFISPQVSASMLK
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       ::   : ::.:.:.. .: ..::...::.:: :.   ::: : :   : :::.:: ::..
CCDS46 QFP--NSGLSPGLFNVGPQLSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQLLQNQRKI
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pF1KA1 SGSMRQQ-EQQVARTITNLQQQIQQHQRQLAQALLVKQPPPPPPPPHLSLHPSAGKSAMD
       : ..::: :::.:: .. :::: ::.:::             :   :   :: . :  .:
CCDS46 SQAVRQQQEQQLARMVSALQQQQQQQQRQ-------------PGMKHSPSHPVGPKPHLD
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pF1KA1 SFPSHPQTPGLPDLQTKEQQSSPNTFAPYPLAGLNPNMNVNSMD--MTGGLSVKDPSQSQ
       ..  .  . ::::::::         .: :  : . ... ..::  :.::   :. . ..
CCDS46 NMVPNALNVGLPDLQTK---------GPIP--GYGSGFSSGGMDYGMVGG---KE-AGTE
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       ::. :::  . :..:::.:.  : :  :.::: .      :::.   . :...:.:  ..
CCDS46 SRFKQWT--SMMEGLPSVATQ-EANMHKNGAIVA------PGKTRGGSPYNQFDIIPGDT
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pF1KA1 ESPASPPVAVPHSWSRAKSD-SDKI-SNGSSINWPPEFHPGVPWKGLQNIDPENDPDVTP
        .  . :..   ::  :::  ..:: :..:. .:::::.:::::::.::::::.:: :::
CCDS46 LGGHTGPAG--DSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDPESDPYVTP
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pF1KA1 GSVPTGPTINTTIQDVNRYLLK----------------------------------SGGK
       :::  : : .. : :... ::.                                  ...:
CCDS46 GSV-LGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWPYSASDNSFTNVHSTSAK
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pF1KA1 LSDIKSTWSSGPTSHTQASLSHELWK---VPRNSTAPTRPPPGLTNPKPSSTWGAS-PL-
       . : :::::  : .:. . ::...::     ::.:   ::::::::::::: :... :  
CCDS46 FPDYKSTWSPDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKPSSPWSSTAPRS
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pF1KA1 --GW---TSSYSSGSAWSTDTSGRTSSWLVLRNLTPQIDGSTLRTLCLQHGPLITFHLNL
         ::    :  .:.:.::   : : : ::::.:::::::::::::.:.:::::.::::::
CCDS46 VRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGPLLTFHLNL
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       :::.:..:::.:.:::::: .:::::::::::::::: ..::.:::::.:     : :  
CCDS46 TQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSA
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pF1KA1 PTSSWQS-SSASSQ-----PRLSAAGSSHGLVRSDAGHWNAPCLGGKGSSEL----LWGG
       :...:::  ....:     : :.  :.: ::     :.:..   ::.....:    ::: 
CCDS46 PAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGL-----GQWSSSA-GGSSGADLAGASLWGP
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pF1KA1 VPQYSSSLWGPPSADDSRVIGSPTPLTTLLPGDLLSGESL  
        :.::::::: :...: . .:::.:   :::::::.: :   
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>>CCDS46712.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22            (1029 aa)
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         :   .  :  .:: . ...   : . . .: :   :.. . :.   ::::.:::.:  
CCDS46 LLGGGAGPPPCTAPGANPNNAQVTGALLQSESGTAPVWSKSTPPAP--DNGTSAWGEPNE
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       :. :::.       . : ...:. :    :: :::::.::: : :   .    .::.:: 
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       : :::...:: :.::   .:::.. :: .. ..:  : ....: :. : ::...::.  .
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         ..   :..:.:  ....: .:: :::::.... : : .  :   : ::: ::. ...:
CCDS46 TEDNP--SSKMDL--SVGSLSDKKFDVDKRAMNLGDFNDIMRKDRSGFRPPNSKDMGTTD
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          ...: :                     ::                            
CCDS46 SGPYFEKGG---------------------SH----------------------------
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          :.:::: .::.: .. :    ::::::: :::::::: ::.::::.:..: ::   :
CCDS46 ---GLFGNS-TAQSRGLHTP----VQPLNSS-PSLRAQVPPQFISPQVSASMLKQFP--N
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        ::.:.:.. .: ..::...::.:: :.   ::: : :   : :::.:: ::..: ..::
CCDS46 SGLSPGLFNVGPQLSPQQIAMLSQLPQIPQFQLACQLLLQQQQQQQLLQNQRKISQAVRQ
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        . ::::::::         .: :  : . ... ..::  :.::      . ..::. ::
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       :  . :..:::.:.  : :  :.::: .      :::.   . :...:.:  .. .  . 
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        : .. : :... ::.                                  ...:. : ::
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pF1KA1 -TSSYSSGSAWSTDTSGRTSSWLVLRNLTPQIDGSTLRTLCLQHGPLITFHLNLTQGNAV
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CCDS46 IRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPPTPAATPSAPAAGWQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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