FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1582, 1690 aa 1>>>pF1KA1582 1690 - 1690 aa - 1690 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4007+/-0.00106; mu= -3.1140+/- 0.063 mean_var=340.9493+/-70.665, 0's: 0 Z-trim(113.8): 68 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.069459 statistics sampled from 14302 (14359) to 14302 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.732), E-opt: 0.2 (0.441), width: 16 Scan time: 7.090 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS45798.1 TNRC6C gene_id:57690|Hs108|chr17 (1690) 11690 1186.7 0 CCDS45799.1 TNRC6C gene_id:57690|Hs108|chr17 (1726) 9965 1013.9 0 CCDS10624.2 TNRC6A gene_id:27327|Hs108|chr16 (1962) 2525 268.4 1.8e-70 CCDS81959.1 TNRC6A gene_id:27327|Hs108|chr16 (1913) 1352 150.8 4.2e-35 CCDS54533.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22 (1833) 1210 136.6 7.9e-31 CCDS46713.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22 (1723) 1046 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CCDS10 AYGSNYSGDKCSGPNGQANGDTVNATLMQPGVNGPMGTNFQVNTNKGGGVWESGA-ANSQ 530 540 550 560 570 580 310 320 330 340 350 360 pF1KA1 ILAWGRGSGNNGVGNIHSGAWGHPSRSTSNGVNG-EWGK-PPNQHSNSDINGKGST---G .:: :.: :. :. . : :: :...:.... . ::.: : :::::.. ::.:.: : CCDS10 STSWGSGNGANS-GGSRRG-WGTPAQNTGTNLPSVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNG 590 600 610 620 630 640 370 380 390 400 410 420 pF1KA1 WESPSVTSQNPTVQPGGEHMNSWAKAASSGTTASEGSSDGSGNHNEGSTGREGTGEGRRR :.: .:. ... .:. . ::: ..::. :.::....: .: .::::.. : CCDS10 WKSTEEEDQGSATSQTNEQSSVWAK--TGGTVESDGSTESTGRLEE-----KGTGESQSR 650 660 670 680 690 430 440 450 460 470 pF1KA1 DKGIIDQGHIQLP----RNDLDPRVLSNTGWGQTPVKQNTAWEFEESPRSERKNDNGTEA :. ::: : : :.:::::::::.::::::.::::::. : :::.:::.:::::: CCDS10 DRRKIDQ-HTLLQSIVNRTDLDPRVLSNSGWGQTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEA 700 710 720 730 740 750 480 490 500 510 520 530 pF1KA1 WGCAATQASNSGGKNDGSIMNSTNTSSVSGWVNAPPAAVPANTGWGDSNNKAPSGPGVWG :: .:::. :::. : . :...::::::: . :: :::: :. . : : CCDS10 WGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSVSGWGDPKPA-----LRWGDS--KGSNCQGGWE 760 770 780 790 800 540 550 560 570 580 590 pF1KA1 DSISSTAVSTAAAAKSGHAWSGAANQEDKSPTWGEPPKPKSQHWGDGQRSNPAWSAGGGD :. ..:.. .::.. : .: .... .:.. : : : :::::.:. .::....: CCDS10 DDSAATGM-----VKSNQ-W---GNCKEEKAAWNDSQKNK-QGWGDGQKSSQGWSVSASD 810 820 830 840 850 600 610 620 630 640 650 pF1KA1 -WADSSSVLGHLGDGKKNGSGWDADSNRSGSGWNDTTRSGNSGWGNSTNTKANPGTNWGE :...: .: :...:..:. .::.:: ::::. .... :::. : : ...: : CCDS10 NWGETSRN-NHWGEANKKSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGNNIN--PNNSSGWDE 860 870 880 890 900 910 660 670 680 690 pF1KA1 TLKPGPQQNWASKPQDNNVSNWGGA-----------------------ASVKQTGTGWIG . :: :.:.:.. :..:. .:: . :. : ::::.: CCDS10 SSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNKQQDIVGSWGIPPATGKPPGTGWLG 920 930 940 950 960 970 700 710 720 730 740 750 pF1KA1 GPVPVKQKDSSEATGWEEPSPPSIRRKMEIDDGTSAWGDPSNYNNKTVNMWDRNNPVIQS ::.:. :. : :::::::: :::::::::::::::::::.:: :.::::..: : CCDS10 GPIPAPAKEE-EPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNYKNVNMWNKNVP---- 980 990 1000 1010 1020 760 770 780 790 800 810 pF1KA1 STTTNTTTTTTTTTSNTTHRVETPPPHQAGTQLNRSPLLGPGRKVSSGWGEMPNVHSKTE . .. . . .:.. :: :.. :. : ::::: : CCDS10 ------NGNSRSDQQAQVHQLLTP----ASAISNKEASSG------SGWGE-P------- 1030 1040 1050 1060 820 830 840 850 860 870 pF1KA1 NSWGEPSSPSTLVDNGTAAWGKPPSSGSGWGDHPAEPPVAFGRAGAPVAASALCKPASKS :::::.:.: :::::.::::: .:: .::. : . ... :. .:: : . :: CCDS10 --WGEPSTPATTVDNGTSAWGKPIDSGPSWGEPIAAASSTSTWGSSSVGPQALSKSGPKS 1070 1080 1090 1100 1110 1120 880 890 900 910 920 pF1KA1 MQEGWGSGGDEMNLSTSQ---WEDEEGDV----WNNAASQESTSSCSSWGNAPKKGLQKG ::.:: ::.: : .. ::.:: :: ::. .::: .:: . : :: .:: CCDS10 MQDGWC--GDDMPLPGNRPTGWEEEE-DVEIGMWNSNSSQELNSSLN-WPPYTKKMSSKG 1130 1140 1150 1160 1170 930 940 950 960 970 pF1KA1 ------------MKTSGKQDEAWIMSRLIKQLTDMGFPREPAEEALKSNNMNLDQAMSAL :: ..::.:::: . ..::.....: :. :: ..::.:.:. .: : CCDS10 LSGKKRRRERGMMKGGNKQEEAWI-NPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGM--L 1180 1190 1200 1210 1220 1230 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KA1 LEKKVDVDKRGLGVTDHNGMAAKPLGCRPPISKESSVDRPTFLDKDGGLVEEPTPSPFLP .:....::..:.. :.: ..: : :: ::::::..: ..:::: ...: :. CCDS10 QDKRMEIDKHSLNIGDYNRTVGKGPGSRPQISKESSMERNPYFDKDGIVADESQNMQFMS 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KA1 SPSLKLPLSHSALPSQALGGIASGLGMQNLNSSRQIPSGNLGMFG-NSGAAQARTMQQPP : :.::: :.::::.::::.:: ::::::::: :: .:: .::: .. ::: : :::: CCDS10 SQSMKLPPSNSALPNQALGSIA-GLGMQNLNSVRQ--NGNPSMFGVGNTAAQPRGMQQP- 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KA1 QPPVQPLNSSQPSLRAQVPQ-FLSPQVQAQLLQFAAKNIGLNPALLTSPINPQHMTMLNQ :.:::.::::.:::::: .::::: ..::..: .: :::: . .::...:::: CCDS10 --PAQPLSSSQPNLRAQVPPPLLSPQVPVSLLKYAPNNGGLNPLF-----GPQQVAMLNQ 1360 1370 1380 1390 1400 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KA1 LYQL-QLAY----QRLQIQQQMLQAQRNVSGSMRQQEQQVARTITNLQQQIQQHQRQLAQ : :: ::. ::: ::: :.::.: .. : :..: .: .. .:::..:..::: CCDS10 LSQLNQLSQISQLQRLLAQQQRAQSQRSVPSGNRPQQDQQGRPLS-VQQQMMQQSRQLDP 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KA1 ALLVKQPPPPPPPPHLSLHPSAGKSAMDSFPSHPQTPGLPDLQTKEQQSSP-NTFAPYPL ::::: :: . :: : :: .:. :.: :.:: . :: :.:. .:. CCDS10 NLLVKQQTPPS--QQQPLHQPAMKSFLDNV--MPHTT--PELQ---KGPSPINAFSNFPI 1470 1480 1490 1500 1510 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KA1 AGLNPNMNVNSMDMTGGLSVKDPSQSQSRLPQWTHPNSMDNLPSAASPLEQNPSKHGAIP ::: :.::: :::. :.:.: :::: .:: ..:.. :. . :.:: :::::: CCDS10 -GLNSNLNVN-MDMN---SIKEP---QSRLRKWT---TVDSI-SVNTSLDQNSSKHGAIS 1520 1530 1540 1550 1560 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KA1 GGLSIGPPGKSSIDDSYGRYDLIQNSESPASPPVAVPHSWSRAKSDSDKISNGSSINWPP .:. . .. . ::....: :::::: .. .: :::: . ..::.:::: CCDS10 SGFRLE-------ESPFVPYDFMNSSTSPASPPGSIGDGWPRAKSPN----GSSSVNWPP 1570 1580 1590 1600 1610 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KA1 EFHPGVPWKGLQNIDPENDPDVTPGSVPTGPTINTTIQDVNRYLLKSGGKLSDIKST--- ::.:: :::: :::::.:: :::::: .. .::: ...:.. ...:. :....: CCDS10 EFRPGEPWKGYPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINT-VREVDHLRDRNSGSSSSLNTTLPS 1620 1630 1640 1650 1660 1450 1460 1470 pF1KA1 ---WSS----------------------------GPTSHTQASLSHELWKVP---RNSTA ::: .: : :..::.::::::: .: :: CCDS10 TSAWSSIRASNYNVPLSSTAQSTSARNSDSKLTWSPGSVTNTSLAHELWKVPLPPKNITA 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KA1 PTRPPPGLTNPKPS-STWGASPL----GWTSS---YSSGSAWSTDTSGRTSSWLVLRNLT :.:::::::. :: ::: ::: :: .: :. ::.:. ..::: ..::::.::: CCDS10 PSRPPPGLTGQKPPLSTWDNSPLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLT 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1530 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KA1 PQIDGSTLRTLCLQHGPLITFHLNLTQGNAVVRYSSKEEAAKAQKSLHMCVLGNTTILAE ::::::::::::.:::::::::::: .:::.::::::::..::::::::::::::::::: CCDS10 PQIDGSTLRTLCMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAE 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1590 1600 1610 1620 1630 1640 pF1KA1 FAGEEEVNRFLAQGQALPPTSSWQSSSASSQPRLSAAGSSHGLV-RSDAGHWNAPCLGGK ::.:::..::.::.:.: :. .::: . ::: ::.. ::.. :.: .:::. :.: CCDS10 FASEEEISRFFAQSQSLTPSPGWQSLG-SSQSRLGSLDCSHSFSSRTDLNHWNGAGLSGT 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1650 1660 1670 1680 1690 pF1KA1 GSSEL----LWGGVPQYSSSLWGPPSADDSRVIGSPTPLTTLLPGDLLSGESL . ..: ::: .:.::.:::::::..: : :.::.:....: : :.: CCDS10 NCGDLHGTSLWG-TPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM 1910 1920 1930 1940 1950 1960 >>CCDS81959.1 TNRC6A gene_id:27327|Hs108|chr16 (1913 aa) initn: 2269 init1: 631 opt: 1352 Z-score: 743.6 bits: 150.8 E(32554): 4.2e-35 Smith-Waterman score: 3914; 42.1% identity (65.6% similar) in 1819 aa overlap (1-1687:271-1908) 10 20 30 pF1KA1 MATGSAQGNFTGHTKKTNGNNGTNGALVQS ::.:.. :. : ....: .. : .: : CCDS81 SAPGSDPELASECMDADSASSSESERNITIMASGNTGGEKDG-LRNSTGLGSQNKFVVGS 250 260 270 280 290 40 50 60 70 80 pF1KA1 PSNQSALGAGGANSNGSAARVWGVATGSSSGLAHCSVSGGDGKMDTMIGDGRSQNCWG-- ::. .: ..:.: :: . :. . . ::.. ..: .. ...: .: :: CCDS81 SSNN----VGHGSSTGP----WGFSHGAIISTCQVSVDAPESKSES--SNNR-MNAWGTV 300 310 320 330 340 90 100 110 120 130 140 pF1KA1 ASNSNAGINLN-LNPNANPAAWPVLGHEGTVATGNPSSICSPV----SAIGQNMGNQ--N .:.::.:.: . :: .: .::::: ..: . : .: : . :.::: .:: : CCDS81 SSSSNGGLNPSTLNSASNHGAWPVLENNGLALKGPVGSGSSGINIQCSTIGQMPNNQSIN 350 360 370 380 390 400 150 160 170 180 190 pF1KA1 GNPTG--TLGAWGNLLPQESTEPQTSTSQNVSFSAQPQNLNTD--GPNNT-NPMNSS-PN .. .: : :.::.: ::. : ..: .:.::::.::::..:. ::::: : :.:: :: CCDS81 SKVSGGSTHGTWGSL--QETCESEVSGTQKVSFSGQPQNITTEMTGPNNTTNFMTSSLPN 410 420 430 440 450 460 200 210 220 230 240 250 pF1KA1 PINAMQTNGLP--NWGMAVGMGAIIPPHLQGLPGANGSSVSQVSGGSAE--GISNSVWGL ...:.: :: : : : .... :..:. : ::.:.:..:.: .. : ...:: CCDS81 S-GSVQNNELPSSNTG-AWRVSTMNHPQMQAPSGMNGTSLSHLSNGESKSGGSYGTTWG- 470 480 490 500 510 520 260 270 280 290 300 pF1KA1 SPGNPATGNSNSGFS-QGNGDTVNSALSAKQ-NGS-SSAVQ-KEGSGGNAWDSGPPAGPG . :. .:.. :: . :.::::::..: :: .. : . ..::..:.:: :. CCDS81 AYGSNYSGDKCSGPNGQANGDTVNATLMQPGVNGPMGTNFQVNTNKGGGVWESGA-ANSQ 530 540 550 560 570 580 310 320 330 340 350 360 pF1KA1 ILAWGRGSGNNGVGNIHSGAWGHPSRSTSNGVNG-EWGK-PPNQHSNSDINGKGST---G .:: :.: :. :. . : :: :...:.... . ::.: : :::::.. ::.:.: : CCDS81 STSWGSGNGANS-GGSRRG-WGTPAQNTGTNLPSVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNG 590 600 610 620 630 640 370 380 390 400 410 420 pF1KA1 WESPSVTSQNPTVQPGGEHMNSWAKAASSGTTASEGSSDGSGNHNEGSTGREGTGEGRRR :.: .:. ... .:. . ::: ..::. :.::....: .: .::::.. : CCDS81 WKSTEEEDQGSATSQTNEQSSVWAK--TGGTVESDGSTESTGRLEE-----KGTGESQSR 650 660 670 680 690 430 440 450 460 470 pF1KA1 DKGIIDQGHIQLP----RNDLDPRVLSNTGWGQTPVKQNTAWEFEESPRSERKNDNGTEA :. ::: : : :.:::::::::.::::::.::::::. : :::.:::.:::::: CCDS81 DRRKIDQ-HTLLQSIVNRTDLDPRVLSNSGWGQTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGTEA 700 710 720 730 740 750 480 490 500 510 520 530 pF1KA1 WGCAATQASNSGGKNDGSIMNSTNTSSVSGWVNAPPAAVPANTGWGDSNNKAPSGPGVWG :: .:::. :::. : . :...::::::: . :: :::: :. . : : CCDS81 WGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSVSGWGDPKPA-----LRWGDS--KGSNCQGGWE 760 770 780 790 800 540 550 560 570 580 590 pF1KA1 DSISSTAVSTAAAAKSGHAWSGAANQEDKSPTWGEPPKPKSQHWGDGQRSNPAWSAGGGD :. ..:.. .::.. : .: .... .:.. : : : :::::.:. .::....: CCDS81 DDSAATGM-----VKSNQ-W---GNCKEEKAAWNDSQKNK-QGWGDGQKSSQGWSVSASD 810 820 830 840 850 600 610 620 630 640 650 pF1KA1 -WADSSSVLGHLGDGKKNGSGWDADSNRSGSGWNDTTRSGNSGWGNSTNTKANPGTNWGE :...: .: :...:..:. .::.:: ::::. .... :::. : : ...: : CCDS81 NWGETSRN-NHWGEANKKSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGNNIN--PNNSSGWDE 860 870 880 890 900 910 660 670 680 690 pF1KA1 TLKPGPQQNWASKPQDNNVSNWGGA-----------------------ASVKQTGTGWIG . :: :.:.:.. :..:. .:: . :. : ::::.: CCDS81 SSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNKQQDIVGSWGIPPATGKPPGTGWLG 920 930 940 950 960 970 700 710 720 730 740 750 pF1KA1 GPVPVKQKDSSEATGWEEPSPPSIRRKMEIDDGTSAWGDPSNYNNKTVNMWDRNNPVIQS ::.:. :. : :::::::: :::::::::::::::::::.:: :.::::..: : CCDS81 GPIPAPAKEE-EPTGWEEPSPESIRRKMEIDDGTSAWGDPSKYNYKNVNMWNKNVP---- 980 990 1000 1010 1020 760 770 780 790 800 810 pF1KA1 STTTNTTTTTTTTTSNTTHRVETPPPHQAGTQLNRSPLLGPGRKVSSGWGEMPNVHSKTE . .. . . .:.. :: :.. :. : ::::: : CCDS81 ------NGNSRSDQQAQVHQLLTP----ASAISNKEASSG------SGWGE-P------- 1030 1040 1050 1060 820 830 840 850 860 870 pF1KA1 NSWGEPSSPSTLVDNGTAAWGKPPSSGSGWGDHPAEPPVAFGRAGAPVAASALCKPASKS :::::.:.: :::::.::::: .:: .::. : . ... :. .:: : . :: CCDS81 --WGEPSTPATTVDNGTSAWGKPIDSGPSWGEPIAAASSTSTWGSSSVGPQALSKSGPKS 1070 1080 1090 1100 1110 1120 880 890 900 910 920 pF1KA1 MQEGWGSGGDEMNLSTSQ---WEDEEGDV----WNNAASQESTSSCSSWGNAPKKGLQKG ::.:: ::.: : .. ::.:: :: ::. .::: .:: . : :: .:: CCDS81 MQDGWC--GDDMPLPGNRPTGWEEEE-DVEIGMWNSNSSQELNSSLN-WPPYTKKMSSKG 1130 1140 1150 1160 1170 930 940 950 960 970 pF1KA1 ------------MKTSGKQDEAWIMSRLIKQLTDMGFPREPAEEALKSNNMNLDQAMSAL :: ..::.:::: . ..::.....: :. :: ..::.:.:. .: : CCDS81 LSGKKRRRERGMMKGGNKQEEAWI-NPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGM--L 1180 1190 1200 1210 1220 1230 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KA1 LEKKVDVDKRGLGVTDHNGMAAKPLGCRPPISKESSVDRPTFLDKDGGLVEEPTPSPFLP .:....::..:.. :.: ..: : :: ::::::..: ..::.:. :: : CCDS81 QDKRMEIDKHSLNIGDYNRTVGKGPGSRPQISKESSMERNPYFDKNGN------PSMF-- 1240 1250 1260 1270 1280 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KA1 SPSLKLPLSHSALPSQALGGIASGLGMQNLNSSRQIPSGNLGMFGNSGAAQARTMQQPPQ :. ::. ::: : :::: CCDS81 -------------------GV-----------------------GNT-AAQPRGMQQP-- 1290 1300 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KA1 PPVQPLNSSQPSLRAQVPQ-FLSPQVQAQLLQFAAKNIGLNPALLTSPINPQHMTMLNQL :.:::.::::.:::::: .::::: ..::..: .: :::: . .::...::::: CCDS81 -PAQPLSSSQPNLRAQVPPPLLSPQVPVSLLKYAPNNGGLNPLF-----GPQQVAMLNQL 1310 1320 1330 1340 1350 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KA1 YQL-QLAY----QRLQIQQQMLQAQRNVSGSMRQQEQQVARTITNLQQQIQQHQRQLAQA :: ::. ::: ::: :.::.: .. : :..: .: .. .:::..:..::: CCDS81 SQLNQLSQISQLQRLLAQQQRAQSQRSVPSGNRPQQDQQGRPLS-VQQQMMQQSRQLDPN 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KA1 LLVKQPPPPPPPPHLSLHPSAGKSAMDSFPSHPQTPGLPDLQTKEQQSSP-NTFAPYPLA ::::: :: . :: : :: .:. :.: :.:: . :: :.:. .:. CCDS81 LLVKQQTPPS--QQQPLHQPAMKSFLDNV--MPHTT--PELQ---KGPSPINAFSNFPI- 1420 1430 1440 1450 1460 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KA1 GLNPNMNVNSMDMTGGLSVKDPSQSQSRLPQWTHPNSMDNLPSAASPLEQNPSKHGAIPG ::: :.::: :::. :.:.: :::: .:: ..:.. :. . :.:: :::::: . CCDS81 GLNSNLNVN-MDMN---SIKEP---QSRLRKWT---TVDSI-SVNTSLDQNSSKHGAISS 1470 1480 1490 1500 1510 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KA1 GLSIGPPGKSSIDDSYGRYDLIQNSESPASPPVAVPHSWSRAKSDSDKISNGSSINWPPE :. . .. . ::....: :::::: .. .: :::: . ..::.::::: CCDS81 GFRLE-------ESPFVPYDFMNSSTSPASPPGSIGDGWPRAKSPN----GSSSVNWPPE 1520 1530 1540 1550 1560 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KA1 FHPGVPWKGLQNIDPENDPDVTPGSVPTGPTINTTIQDVNRYLLKSGGKLSDIKST---- :.:: :::: :::::.:: :::::: .. .::: ...:.. ...:. :....: CCDS81 FRPGEPWKGYPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINT-VREVDHLRDRNSGSSSSLNTTLPST 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1450 1460 1470 pF1KA1 --WSS----------------------------GPTSHTQASLSHELWKVP---RNSTAP ::: .: : :..::.::::::: .: ::: CCDS81 SAWSSIRASNYNVPLSSTAQSTSARNSDSKLTWSPGSVTNTSLAHELWKVPLPPKNITAP 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KA1 TRPPPGLTNPKPS-STWGASPL----GWTSS---YSSGSAWSTDTSGRTSSWLVLRNLTP .:::::::. :: ::: ::: :: .: :. ::.:. ..::: ..::::.:::: CCDS81 SRPPPGLTGQKPPLSTWDNSPLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLTP 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1530 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KA1 QIDGSTLRTLCLQHGPLITFHLNLTQGNAVVRYSSKEEAAKAQKSLHMCVLGNTTILAEF :::::::::::.:::::::::::: .:::.::::::::..:::::::::::::::::::: CCDS81 QIDGSTLRTLCMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEF 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1590 1600 1610 1620 1630 1640 pF1KA1 AGEEEVNRFLAQGQALPPTSSWQSSSASSQPRLSAAGSSHGLV-RSDAGHWNAPCLGGKG :.:::..::.::.:.: :. .::: . ::: ::.. ::.. :.: .:::. :.: . CCDS81 ASEEEISRFFAQSQSLTPSPGWQSLG-SSQSRLGSLDCSHSFSSRTDLNHWNGAGLSGTN 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1650 1660 1670 1680 1690 pF1KA1 SSEL----LWGGVPQYSSSLWGPPSADDSRVIGSPTPLTTLLPGDLLSGESL ..: ::: .:.::.:::::::..: : :.::.:....: : :.: CCDS81 CGDLHGTSLWG-TPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFLSVDHLGGGGESM 1870 1880 1890 1900 1910 >>CCDS54533.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22 (1833 aa) initn: 1758 init1: 542 opt: 1210 Z-score: 667.0 bits: 136.6 E(32554): 7.9e-31 Smith-Waterman score: 3213; 37.6% identity (60.8% similar) in 1817 aa overlap (16-1689:209-1830) 10 20 30 40 pF1KA1 MATGSAQGNFTGHTKKTNGNNGTNGALVQSPSNQSALGAGGANSN .....: :.. ...:..... :...:: CCDS54 TSPNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSEKSTLPGSTTSN 180 190 200 210 220 230 50 60 70 80 90 pF1KA1 -GSAARVWGVATGSSSGLA-------HCSVSGGDGKMDTMIGDGRSQNCWGASNSNAGIN :.... ....:. .:. ::..... .. : : .: : . . : . CCDS54 KGKGSQCQSASSGNECNLGVWKSDPKAKSVQSSNSTTENNNGLGNWRNVSGQDRIGPGSG 240 250 260 270 280 290 100 110 120 130 140 150 pF1KA1 L-NLNPNANPAAWPVLGHEGTVATGNPSSICSPVSAIGQNMGNQNGNPTGTLGAWGNLL- . :.:::.::.:::.: .::: : . ..:.: .. ... :. CCDS54 FSNFNPNSNPSAWPALVQEGTSRKGA--------------LETDNSNSSAQVSTVGQTSR 300 310 320 330 340 160 170 180 190 200 210 pF1KA1 PQESTEPQTSTSQNVSFSAQPQNLNTDGPNN--TNPMN-SSPNPINAMQTNGLPNWGMAV :.: ..... :: : : :::::.: :: .: :::::.. : :: CCDS54 EQQSKMENAGVNFVVSGREQAQIHNTDGPKNGNTNSLNLSSPNPME--------NKGMPF 350 360 370 380 390 220 230 240 250 260 pF1KA1 GMGAIIPPHLQGLPGANGSSVSQVSGGSAEGISNSVWGLSPG----NPATGNSNSGFSQG ::: : . . .. :: .: : : . :: . : . ..:.:::: . . CCDS54 GMGL-------GNTSRSTDAPSQSTGDRKTG-SVGSWGAARGPSGTDTVSGQSNSGNNGN 400 410 420 430 440 270 280 290 300 310 320 pF1KA1 NG----DTVNSALSAKQNGSSSAVQKEG--SGGNAWDSGPPAGPGILAWGRGSGNNGVGN :: :. ..: :..::.. .. : :..:. :: . ::. ::. ... CCDS54 NGKEREDSWKGASVQKSTGSKNDSWDNNNRSTGGSWNFGPQDSNDN-KWGE--GNKMTSG 450 460 470 480 490 500 330 340 350 360 370 380 pF1KA1 IHSGAWGHPSRSTSNGVNGEWGKP--PNQHSNSDINGKGSTGWESPSVTSQNPTVQPGGE . .: : .:. : . :::. : ::. ... : :: : .: :. CCDS54 VSQGEWKQPTGSDELKI-GEWSGPNQPNSSTGAWDNQKGH-----PLPENQ------GNA 510 520 530 540 550 390 400 410 420 430 pF1KA1 HMNSWAKAASSGTTASEGSSDGSGNHNEGSTGREGTGEGRRRDKGIIDQGHIQ--LPRND . :....:: . :.: :: ::. ::. ...:. : :. .: : :.: CCDS54 QAPCWGRSSSSTGSEVGGQSTGS-NHKAGSSDSHNSGRRSYRPTHPDCQAVLQTLLSRTD 560 570 580 590 600 610 440 450 460 470 480 490 pF1KA1 LDPRVLSNTGWGQTPVKQNTAWEFEESPRSERKNDNGTEAWGCAATQASNSGGKNDGSIM :::::::::::::: .::.:.:..:: :: : :.:.:::.: ::::..:::: .:. CCDS54 LDPRVLSNTGWGQTQIKQDTVWDIEEVPRPEGKSDKGTEGWESAATQTKNSGGWGDAP-- 620 630 640 650 660 670 500 510 520 530 540 550 pF1KA1 NSTNTSSVSGWVNAPPAAVPANTGWGDSNNKAPSGPGVWGDSISSTAVSTAAAAKSGHAW : ... ::: . . :.: : : :.. : :.: .... . : CCDS54 -SQSNQMKSGW-----GELSASTEWKD-----PKNTGGWNDYKNNNSSN----------W 680 690 700 560 570 580 590 600 610 pF1KA1 SGAANQEDKSPTWGEPPKPKSQHWGDGQRSNPAWSAGGGDWADSSSVLGHLGDGKKNGSG .:. .: .:.: :. :.: :: :.. : .::.: . : :. : :: :. CCDS54 GGGRPDEKTPSSWNENPS-KDQGWGGGRQPNQGWSSGKNGW-------GEEVDQTKN-SN 710 720 730 740 750 760 620 630 640 650 660 670 pF1KA1 WDADSNRSGSGWNDTTRSGNSGWGNSTNTKANPGTNWGETLKPGPQQN--------WASK :...... :::.. .. . :::. :.. .: : : .: : : .. CCDS54 WESSASKPVSGWGEGGQNEIGTWGNGGNASLASKGGW-EDCKRSPAWNETGRQPNSWNKQ 770 780 790 800 810 680 690 700 710 pF1KA1 ------------PQDNNVSNWGGA-----ASVKQTGTGWIGGPVPVKQKDSSEATGWEEP :: . ..::: ..:. ....: .:: :. :: : .::::: CCDS54 HQQQQPPQQPPPPQPEASGSWGGPPPPPPGNVRPSNSSWSSGPQPATPKDE-EPSGWEEP 820 830 840 850 860 870 720 730 740 750 760 770 pF1KA1 SPPSIRRKMEIDDGTSAWGDPSNYNNKTVNMWDRNNPVIQSSTTTNTTTTTTTTTSNTTH :: :: :::.:::::::::::..:: :.::.::.:. :.. CCDS54 SPQSISRKMDIDDGTSAWGDPNSYNYKNVNLWDKNS---QGG------------------ 880 890 900 910 780 790 800 810 820 830 pF1KA1 RVETPPPHQAGTQLNRSPLLGPGRKVSSGWGEMPNVHSKTENSWGEPSSPSTLVDNGTAA : : : : : : : . ::. . :.. . :. ::::.: CCDS54 ----PAP--------REPNL-P----------TP-MTSKSASVWSKSTPPAP--DNGTSA 920 930 940 950 840 850 860 870 880 890 pF1KA1 WGKPPSSGSGWGDHPAEPPVAFGRAGAPVAASALCKPASKSMQEGWG-SGGDEMNLSTSQ ::.: :. :::. . : ...:. : :: :::::.::: : : . . 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CCDS54 -KE-AGTESRFKQWT--SMMEGLPSVATQ-EANMHKNGAIVA------PGKTRGGSPYNQ 1390 1400 1410 1420 1430 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KA1 YDLIQ-NSESPASPPVAVPHSWSRAKSD-SDKI-SNGSSINWPPEFHPGVPWKGLQNIDP .:.: .. . . :.. :: ::: ..:: :..:. .:::::.:::::::.::::: CCDS54 FDIIPGDTLGGHTGPAG--DSWLPAKSPPTNKIGSKSSNASWPPEFQPGVPWKGIQNIDP 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1410 1420 1430 pF1KA1 ENDPDVTPGSVPTGPTINTTIQDVNRYLLK------------------------------ :.:: :::::: : : .. : :... ::. CCDS54 ESDPYVTPGSV-LGGTATSPIVDTDHQLLRDNTTGSNSSLNTSLPSPGAWPYSASDNSFT 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KA1 ----SGGKLSDIKSTWSSGPTSHTQASLSHELWK---VPRNSTAPTRPPPGLTNPKPSST ...:. : ::::: : .:. . ::...:: ::.: ::::::::::::: CCDS54 NVHSTSAKFPDYKSTWSPDPIGHNPTHLSNKMWKNHISSRNTTPLPRPPPGLTNPKPSSP 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KA1 WGAS-PL---GW---TSSYSSGSAWSTDTSGRTSSWLVLRNLTPQIDGSTLRTLCLQHGP :... : :: : .:.:.:: : : : ::::.:::::::::::::.:.:::: CCDS54 WSSTAPRSVRGWGTQDSRLASASTWSDGGSVRPSYWLVLHNLTPQIDGSTLRTICMQHGP 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KA1 LITFHLNLTQGNAVVRYSSKEEAAKAQKSLHMCVLGNTTILAEFAGEEEVNRFLAQGQ-- :.:::::::::.:..:::.:.:::::: .:::::::::::::::: ..::.:::::.: CCDS54 LLTFHLNLTQGTALIRYSTKQEAAKAQTALHMCVLGNTTILAEFATDDEVSRFLAQAQPP 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1600 1610 1620 1630 1640 pF1KA1 ---ALP--PTSSWQS-SSASSQ-----PRLSAAGSSHGLVRSDAGHWNAPCLGGKGSSEL : : :...::: ....: : :. :.: :: :.:.. ::.....: CCDS54 TPAATPSAPAAGWQSLETGQNQSDPVGPALNLFGGSTGL-----GQWSSSA-GGSSGADL 1740 1750 1760 1770 1780 1650 1660 1670 1680 1690 pF1KA1 ----LWGGVPQYSSSLWGPPSADDSRVIGSPTPLTTLLPGDLLSGESL ::: :.::::::: :...: . .:::.: :::::::.: : CCDS54 AGASLWGP-PNYSSSLWGVPTVEDPHRMGSPAP---LLPGDLLGGGSDSI 1790 1800 1810 1820 1830 >>CCDS46713.1 TNRC6B gene_id:23112|Hs108|chr22 (1723 aa) initn: 1705 init1: 542 opt: 1046 Z-score: 578.5 bits: 120.1 E(32554): 6.6e-26 Smith-Waterman score: 2769; 35.4% identity (57.3% similar) in 1809 aa overlap (16-1689:209-1720) 10 20 30 40 pF1KA1 MATGSAQGNFTGHTKKTNGNNGTNGALVQSPSNQSALGAGGANSN .....: :.. ...:..... :...:: CCDS46 TSPNPIHIWDKVIVDGSDMEEWPCIASKDTESSSENTTDNNSASNPGSEKSTLPGSTTSN 180 190 200 210 220 230 50 60 70 80 90 pF1KA1 -GSAARVWGVATGSSSGLA-------HCSVSGGDGKMDTMIGDGRSQNCWGASNSNAGIN :.... ....:. .:. ::..... .. : : .: : . . : . 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