Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1592
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1592, 631 aa
1>>>pF1KA1592 631 - 631 aa - 631 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9069+/-0.00109; mu= 15.8118+/- 0.066
mean_var=66.7690+/-13.084, 0's: 0 Z-trim(103.0): 38 B-trim: 24 in 1/48
Lambda= 0.156959
statistics sampled from 7212 (7221) to 7212 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.584), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 2.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2024.2 CNNM4 gene_id:26504|Hs108|chr2 ( 775) 4075 932.2 0
CCDS44475.1 CNNM2 gene_id:54805|Hs108|chr10 ( 853) 2900 666.1 5.3e-191
CCDS44474.1 CNNM2 gene_id:54805|Hs108|chr10 ( 875) 2574 592.3 9e-169
CCDS7478.2 CNNM1 gene_id:26507|Hs108|chr10 ( 951) 1711 396.9 6.5e-110
CCDS7543.1 CNNM2 gene_id:54805|Hs108|chr10 ( 552) 1643 381.4 1.7e-105
CCDS2025.1 CNNM3 gene_id:26505|Hs108|chr2 ( 707) 1339 312.6 1.1e-84
CCDS2026.1 CNNM3 gene_id:26505|Hs108|chr2 ( 659) 530 129.4 1.5e-29
>>CCDS2024.2 CNNM4 gene_id:26504|Hs108|chr2 (775 aa)
initn: 4075 init1: 4075 opt: 4075 Z-score: 4981.3 bits: 932.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4075; 100.0% identity (100.0% similar) in 631 aa overlap (1-631:145-775)
10 20 30
pF1KA1 MKLYALCTRAQPDGPWLKWTDKDSLLFMVE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 LVVQQLVNVSRGNTSGVLVVLTKFLRRSESMKLYALCTRAQPDGPWLKWTDKDSLLFMVE
120 130 140 150 160 170
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 EPGRFLPLWLHILLITVLLVLSGIFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKERRYARKIEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 EPGRFLPLWLHILLITVLLVLSGIFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKERRYARKIEP
180 190 200 210 220 230
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 IRRKGNYLLCSLLLGNVLVNTSLTILLDNLIGSGLMAVASSTIGIVIFGEILPQALCSRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 IRRKGNYLLCSLLLGNVLVNTSLTILLDNLIGSGLMAVASSTIGIVIFGEILPQALCSRH
240 250 260 270 280 290
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 GLAVGANTILLTKFFMLLTFPLSFPISKLLDFFLGQEIRTVYNREKLMEMLKVTEPYNDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 GLAVGANTILLTKFFMLLTFPLSFPISKLLDFFLGQEIRTVYNREKLMEMLKVTEPYNDL
300 310 320 330 340 350
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 VKEELNMIQGALELRTKTVEDIMTQLQDCFMIRSDAILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 VKEELNMIQGALELRTKTVEDIMTQLQDCFMIRSDAILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEDE
360 370 380 390 400 410
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 QSNIVDILYVKDLAFVDPDDCTPLKTITRFYNHPVHFVFHDTKLDAMLEEFKKGKSHLAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 QSNIVDILYVKDLAFVDPDDCTPLKTITRFYNHPVHFVFHDTKLDAMLEEFKKGKSHLAI
420 430 440 450 460 470
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 VQKVNNEGEGDPFYEVLGLVTLEDVIEEIIKSEILDESDMYTDNRSRKRVSEKNKRDFSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 VQKVNNEGEGDPFYEVLGLVTLEDVIEEIIKSEILDESDMYTDNRSRKRVSEKNKRDFSA
480 490 500 510 520 530
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 FKDADNELKVKISPQLLLAAHRFLATEVSQFSPSLISEKILLRLLKYPDVIQELKFDEHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 FKDADNELKVKISPQLLLAAHRFLATEVSQFSPSLISEKILLRLLKYPDVIQELKFDEHN
540 550 560 570 580 590
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 KYYARHYLYTRNKPADYFILILQGKVEVEAGKENMKFETGAFSYYGTMALTSVPSDRSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 KYYARHYLYTRNKPADYFILILQGKVEVEAGKENMKFETGAFSYYGTMALTSVPSDRSPA
600 610 620 630 640 650
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 HPTPLSRSASLSYPDRTDVSTAATLAGSSNQFGSSVLGQYISDFSVRALVDLQYIKITRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 HPTPLSRSASLSYPDRTDVSTAATLAGSSNQFGSSVLGQYISDFSVRALVDLQYIKITRQ
660 670 680 690 700 710
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 QYQNGLLASRMENSPQFPIDGCTTHMENLAEKSELPVVDETTTLLNERNSLLHKASHENA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 QYQNGLLASRMENSPQFPIDGCTTHMENLAEKSELPVVDETTTLLNERNSLLHKASHENA
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 I
:
CCDS20 I
>>CCDS44475.1 CNNM2 gene_id:54805|Hs108|chr10 (853 aa)
initn: 2028 init1: 1974 opt: 2900 Z-score: 3542.6 bits: 666.1 E(32554): 5.3e-191
Smith-Waterman score: 2900; 72.2% identity (89.8% similar) in 626 aa overlap (12-627:224-845)
10 20 30
pF1KA1 MKLYALCTRAQPDGPWLK--WT---DKDSLLFMVEEPGRFL
: :: . : .:. ... :: .:
CCDS44 SLSTPALGAGGSGSTGGAVGGKGGSGVAGLPPPPWAETTWIYHDGEDTKMIVGEEKKFLL
200 210 220 230 240 250
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 PLWLHILLITVLLVLSGIFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKERRYARKIEPIRRKGN
:.::....:..:: :::.:::::::::::::::::::::::::::. ::..:::.::.::
CCDS44 PFWLQVIFISLLLCLSGMFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKEKNYAKRIEPVRRQGN
260 270 280 290 300 310
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 YLLCSLLLGNVLVNTSLTILLDNLIGSGLMAVASSTIGIVIFGEILPQALCSRHGLAVGA
:::::::::::::::.::::::.. ::::.::. :::::::::::.:::.::::::::::
CCDS44 YLLCSLLLGNVLVNTTLTILLDDIAGSGLVAVVVSTIGIVIFGEIVPQAICSRHGLAVGA
320 330 340 350 360 370
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 NTILLTKFFMLLTFPLSFPISKLLDFFLGQEIRTVYNREKLMEMLKVTEPYNDLVKEELN
:::.::::::..::: :.:.::::: ::::: ::::::::.:::.::.:::::::::::
CCDS44 NTIFLTKFFMMMTFPASYPVSKLLDCVLGQEIGTVYNREKLLEMLRVTDPYNDLVKEELN
380 390 400 410 420 430
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 MIQGALELRTKTVEDIMTQLQDCFMIRSDAILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEDEQSNIVD
.::::::::::::::.:: :.::::: ..::::::::::::::::::::::: :.:::::
CCDS44 IIQGALELRTKTVEDVMTPLRDCFMITGEAILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEGERSNIVD
440 450 460 470 480 490
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 ILYVKDLAFVDPDDCTPLKTITRFYNHPVHFVFHDTKLDAMLEEFKKGKSHLAIVQKVNN
.:.:::::::::::::::::::.:::::.::::.::::::::::::::::::::::.:::
CCDS44 LLFVKDLAFVDPDDCTPLKTITKFYNHPLHFVFNDTKLDAMLEEFKKGKSHLAIVQRVNN
500 510 520 530 540 550
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 EGEGDPFYEVLGLVTLEDVIEEIIKSEILDESDMYTDNRSRKRVSEKN-KRDFSAFKDAD
::::::::::::.::::::::::::::::::.:.:::::..:.:.... :.::::::..:
CCDS44 EGEGDPFYEVLGIVTLEDVIEEIIKSEILDETDLYTDNRTKKKVAHRERKQDFSAFKQTD
560 570 580 590 600 610
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 NELKVKISPQLLLAAHRFLATEVSQFSPSLISEKILLRLLKYPDVIQELKFDEHNKYYAR
.:.::::::::::: :::::::: :::: .::::::::::.:.::::::.::.:: .
CCDS44 SEMKVKISPQLLLAMHRFLATEVEAFSPSQMSEKILLRLLKHPNVIQELKYDEKNKKAPE
620 630 640 650 660 670
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 HYLYTRNKPADYFILILQGKVEVEAGKENMKFETGAFSYYGTMALTSVPSD-RSPAHPTP
.::: ::::.:::.::::::::::::::.::::..::::::.::::. :.. .:: .:
CCDS44 YYLYQRNKPVDYFVLILQGKVEVEAGKEGMKFEASAFSYYGVMALTASPGENKSPPRPCG
680 690 700 710 720 730
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 LSRSASLSYPDRTDVSTAATLAGSSNQFGSSVLGQYISDFSVRALVDLQYIKITRQQYQN
:..: ::: :: :. : ::..:.::..::.: :: :.::::: :::..::.::::::
CCDS44 LNHSDSLSRSDRIDAVTP-TLGSSNNQLNSSLLQVYIPDYSVRALSDLQFVKISRQQYQN
740 750 760 770 780 790
580 590 600 610 620 630
pF1KA1 GLLASRMENSPQFPIDGCTTHME-NLAEKSE-LPVVDETTTLLNERNSLLH-KASHENAI
.:.::::...:: :. .:..: .:.: . :: :::..::::.: . : ::.:
CCDS44 ALMASRMDKTPQSS-DSENTKIELTLTELHDGLP--DETANLLNEQNCVTHSKANHSLHN
800 810 820 830 840
CCDS44 EGAI
850
>>CCDS44474.1 CNNM2 gene_id:54805|Hs108|chr10 (875 aa)
initn: 2872 init1: 1974 opt: 2574 Z-score: 3143.5 bits: 592.3 E(32554): 9e-169
Smith-Waterman score: 2855; 69.8% identity (86.6% similar) in 648 aa overlap (12-627:224-867)
10 20 30
pF1KA1 MKLYALCTRAQPDGPWLK--WT---DKDSLLFMVEEPGRFL
: :: . : .:. ... :: .:
CCDS44 SLSTPALGAGGSGSTGGAVGGKGGSGVAGLPPPPWAETTWIYHDGEDTKMIVGEEKKFLL
200 210 220 230 240 250
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 PLWLHILLITVLLVLSGIFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKERRYARKIEPIRRKGN
:.::....:..:: :::.:::::::::::::::::::::::::::. ::..:::.::.::
CCDS44 PFWLQVIFISLLLCLSGMFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKEKNYAKRIEPVRRQGN
260 270 280 290 300 310
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 YLLCSLLLGNVLVNTSLTILLDNLIGSGLMAVASSTIGIVIFGEILPQALCSRHGLAVGA
:::::::::::::::.::::::.. ::::.::. :::::::::::.:::.::::::::::
CCDS44 YLLCSLLLGNVLVNTTLTILLDDIAGSGLVAVVVSTIGIVIFGEIVPQAICSRHGLAVGA
320 330 340 350 360 370
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 NTILLTKFFMLLTFPLSFPISKLLDFFLGQEIRTVYNREKLMEMLKVTEPYNDLVKEELN
:::.::::::..::: :.:.::::: ::::: ::::::::.:::.::.:::::::::::
CCDS44 NTIFLTKFFMMMTFPASYPVSKLLDCVLGQEIGTVYNREKLLEMLRVTDPYNDLVKEELN
380 390 400 410 420 430
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 MIQGALELRTKTVEDIMTQLQDCFMIRSDAILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEDEQSNIVD
.::::::::::::::.:: :.::::: ..::::::::::::::::::::::: :.:::::
CCDS44 IIQGALELRTKTVEDVMTPLRDCFMITGEAILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEGERSNIVD
440 450 460 470 480 490
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 ILYVKDLAFVDPDDCTPLKTITRFYNHPVHFVFHDTKLDAMLEEFKKGKSHLAIVQKVNN
.:.:::::::::::::::::::.:::::.::::.::::::::::::::::::::::.:::
CCDS44 LLFVKDLAFVDPDDCTPLKTITKFYNHPLHFVFNDTKLDAMLEEFKKGKSHLAIVQRVNN
500 510 520 530 540 550
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 EGEGDPFYEVLGLVTLEDVIEEIIKSEILDESDMYTDNRSRKRVSEKN-KRDFSAFKDAD
::::::::::::.::::::::::::::::::.:.:::::..:.:.... :.::::::..:
CCDS44 EGEGDPFYEVLGIVTLEDVIEEIIKSEILDETDLYTDNRTKKKVAHRERKQDFSAFKQTD
560 570 580 590 600 610
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 NELKVKISPQLLLAAHRFLATEVSQFSPSLISEKILLRLLKYPDVIQELKFDEHNKYYAR
.:.::::::::::: :::::::: :::: .::::::::::.:.::::::.::.:: .
CCDS44 SEMKVKISPQLLLAMHRFLATEVEAFSPSQMSEKILLRLLKHPNVIQELKYDEKNKKAPE
620 630 640 650 660 670
460 470 480 490 500
pF1KA1 HYLYTRNKPADYFILILQGKVEVEAGKENMKFETGAFSYYGTMALTSVP-----------
.::: ::::.:::.::::::::::::::.::::..::::::.::::. :
CCDS44 YYLYQRNKPVDYFVLILQGKVEVEAGKEGMKFEASAFSYYGVMALTASPVPLSLSRTFVV
680 690 700 710 720 730
510 520 530 540 550
pF1KA1 ------------SDRSPAHPTPLSRSASLSYPDRTDVSTAATLAGSSNQFGSSVLGQYIS
..:: .: :..: ::: :: :. : ::..:.::..::.: ::
CCDS44 SRTELLAAGSPGENKSPPRPCGLNHSDSLSRSDRIDAVTP-TLGSSNNQLNSSLLQVYIP
740 750 760 770 780 790
560 570 580 590 600 610
pF1KA1 DFSVRALVDLQYIKITRQQYQNGLLASRMENSPQFPIDGCTTHME-NLAEKSE-LPVVDE
:.::::: :::..::.::::::.:.::::...:: :. .:..: .:.: . :: ::
CCDS44 DYSVRALSDLQFVKISRQQYQNALMASRMDKTPQSS-DSENTKIELTLTELHDGLP--DE
800 810 820 830 840
620 630
pF1KA1 TTTLLNERNSLLH-KASHENAI
:..::::.: . : ::.:
CCDS44 TANLLNEQNCVTHSKANHSLHNEGAI
850 860 870
>>CCDS7478.2 CNNM1 gene_id:26507|Hs108|chr10 (951 aa)
initn: 1674 init1: 639 opt: 1711 Z-score: 2086.8 bits: 396.9 E(32554): 6.5e-110
Smith-Waterman score: 2144; 53.1% identity (76.4% similar) in 670 aa overlap (2-621:182-840)
10 20 30
pF1KA1 MKLYALCTRAQPDGPWLKWTDKDSLLFMVEE
::..:: : : . ..:. :.
CCDS74 GGVAGSALVQVRVRELRKGEAERGGAGGGGKLFSLC--AWDGRAWHHHGAAGGFLLRVRP
160 170 180 190 200
40 50 60 70 80
pF1KA1 ----PGRFL--PLWLHILLITVLLVLSGIFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKERRYA
:: : : ::. : .::.::..:::: :.:..:::.:::...: :. :.. :
CCDS74 RLYGPGGDLLPPAWLRALGALLLLALSALFSGLRLSLLSLDPVELRVLRNSGSAAEQEQA
210 220 230 240 250 260
90 100 110 120
pF1KA1 RKIEPIRRKGNYLLCSLLLGNVLVNTSL-----TILLDNLIGSG------------LMAV
:... .: .:..:::.::::.. .:..: : : .. :.: : :.
CCDS74 RRVQAVRGRGTHLLCTLLLGQAGANAALAGWLYTSLPPGFGGTGEDYSEEGIHFPWLPAL
270 280 290 300 310 320
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 ASSTIGIVIFG-EILPQALCSRHGLAVGANTILLTKFFMLLTFPLSFPISKLLDFFLGQE
. . : :..: :: : ..:::::::...... ::...: .::. .:...:::. : ::
CCDS74 VCT--GAVFLGAEICPYSVCSRHGLAIASHSVCLTRLLMAAAFPVCYPLGRLLDWALRQE
330 340 350 360 370 380
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 IRTVYNREKLMEMLKVTEPYNDLVKEELNMIQGALELRTKTVEDIMTQLQDCFMIRSDAI
: : :.::::.: :....::.::::::::.::::::::::.::...: : ::::.::::.
CCDS74 ISTFYTREKLLETLRAADPYSDLVKEELNIIQGALELRTKVVEEVLTPLGDCFMLRSDAV
390 400 410 420 430 440
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 LDFNTMSEIMESGYTRIPVFE-DEQSNIVDILYVKDLAFVDPDDCTPLKTITRFYNHPVH
::: :.:::..::::::::.: :.. ::::::.::::::::::::::: :.:::::.:.:
CCDS74 LDFATVSEILRSGYTRIPVYEGDQRHNIVDILFVKDLAFVDPDDCTPLLTVTRFYNRPLH
450 460 470 480 490 500
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 FVFHDTKLDAMLEEFKKGKSHLAIVQKVNNEGEGDPFYEVLGLVTLEDVIEEIIKSEILD
::.::.::..:::::::::::::::.:::::::::::::.:.:::::.:::::::::::
CCDS74 CVFNDTRLDTVLEEFKKGKSHLAIVQRVNNEGEGDPFYEVMGIVTLEDIIEEIIKSEILD
510 520 530 540 550 560
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 ESDMYTDNRSRKRVS--EKNKRDFSAFKDADNELKVKISPQLLLAAHRFLATEVSQFSPS
:.:.:::::...:: :....::: :: .:.:..::::::::::.:::.:::: :.
CCDS74 ETDLYTDNRKKQRVPQRERKRHDFSLFKLSDTEMRVKISPQLLLATHRFMATEVEPFKSL
570 580 590 600 610 620
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LISEKILLRLLKYPDVIQELKFDEHNKYYARHYLYTRNKPADYFILILQGKVEVEAGKEN
.::::::::::.:.:::::::::.:: .:::: ::.:.:::.:.::::::::.:::.
CCDS74 YLSEKILLRLLKHPNVIQELKFDEKNKKAPEHYLYQRNRPVDYFVLLLQGKVEVEVGKEG
630 640 650 660 670 680
490 500 510 520
pF1KA1 MKFETGAFSYYG------------------TMALTSVPSDRSPAHPTPLSRSASLSYPDR
..::.:::.::: ..: .:: .:::.. . :.:: : :.:
CCDS74 LRFENGAFTYYGVPAIMTTACSDNDVRKVGSLAGSSVFLNRSPSRCSGLNRSES---PNR
690 700 710 720 730 740
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 TDVSTAATLAGSSNQFGSSVLGQYISDFSVRALVDLQYIKITRQQYQNGLLASRMENSPQ
. ..::..:. :: . :. :.::. : :.:..:::::::::.: : .:..:::
CCDS74 ER----SDFGGSNTQLYSSSNNLYMPDYSVHILSDVQFVKITRQQYQNALTACHMDSSPQ
750 760 770 780 790 800
590 600 610 620 630
pF1KA1 FP-----IDGCTTHMENLAEKSELPVVDETTTLLNERNSLLHKASHENAI
: :: .:. . . : : . ::::.::::
CCDS74 SPDMEAFTDGDSTKAPTTRGTPQTPKDDPAITLLNNRNSLPCSRSDGLRSPSEVVYLRME
810 820 830 840 850 860
CCDS74 ELAFTQEEMTDFEEHSTQQLTLSPAAVPTRAASDSECCNINLDTETSPCSSDFEENVGKK
870 880 890 900 910 920
>>CCDS7543.1 CNNM2 gene_id:54805|Hs108|chr10 (552 aa)
initn: 1629 init1: 1629 opt: 1643 Z-score: 2007.5 bits: 381.4 E(32554): 1.7e-105
Smith-Waterman score: 1643; 77.3% identity (91.8% similar) in 317 aa overlap (12-323:224-540)
10 20 30
pF1KA1 MKLYALCTRAQPDGPWLK--WT---DKDSLLFMVEEPGRFL
: :: . : .:. ... :: .:
CCDS75 SLSTPALGAGGSGSTGGAVGGKGGSGVAGLPPPPWAETTWIYHDGEDTKMIVGEEKKFLL
200 210 220 230 240 250
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 PLWLHILLITVLLVLSGIFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKERRYARKIEPIRRKGN
:.::....:..:: :::.:::::::::::::::::::::::::::. ::..:::.::.::
CCDS75 PFWLQVIFISLLLCLSGMFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKEKNYAKRIEPVRRQGN
260 270 280 290 300 310
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 YLLCSLLLGNVLVNTSLTILLDNLIGSGLMAVASSTIGIVIFGEILPQALCSRHGLAVGA
:::::::::::::::.::::::.. ::::.::. :::::::::::.:::.::::::::::
CCDS75 YLLCSLLLGNVLVNTTLTILLDDIAGSGLVAVVVSTIGIVIFGEIVPQAICSRHGLAVGA
320 330 340 350 360 370
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 NTILLTKFFMLLTFPLSFPISKLLDFFLGQEIRTVYNREKLMEMLKVTEPYNDLVKEELN
:::.::::::..::: :.:.::::: ::::: ::::::::.:::.::.:::::::::::
CCDS75 NTIFLTKFFMMMTFPASYPVSKLLDCVLGQEIGTVYNREKLLEMLRVTDPYNDLVKEELN
380 390 400 410 420 430
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 MIQGALELRTKTVEDIMTQLQDCFMIRSDAILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEDEQSNIVD
.::::::::::::::.:: :.::::: ..::::::::::::::::::::::: :.:::::
CCDS75 IIQGALELRTKTVEDVMTPLRDCFMITGEAILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEGERSNIVD
440 450 460 470 480 490
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 ILYVKDLAFVDPDDCTPLKTITRFYNHPVHFVFHDTKLDAMLEEFKKGKSHLAIVQKVNN
.:.:::::::::::::::::::.:::::.::::.:::::::::::::
CCDS75 LLFVKDLAFVDPDDCTPLKTITKFYNHPLHFVFNDTKLDAMLEEFKKEHTNKKPKSYQH
500 510 520 530 540 550
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 EGEGDPFYEVLGLVTLEDVIEEIIKSEILDESDMYTDNRSRKRVSEKNKRDFSAFKDADN
>>CCDS2025.1 CNNM3 gene_id:26505|Hs108|chr2 (707 aa)
initn: 1678 init1: 808 opt: 1339 Z-score: 1633.6 bits: 312.6 E(32554): 1.1e-84
Smith-Waterman score: 1715; 49.3% identity (74.2% similar) in 617 aa overlap (24-627:115-690)
10 20 30 40
pF1KA1 MKLYALCTRAQPDGPWLKWTDKDSLLFMVEEPG-----RFLPLWLHILLITVL
.:: . ::: . : : : . :
CCDS20 GCREEAASPAGEWRALLRLRLRAEAVRPHSALLAVRVEPGGGAAEEAAPPWALGLGAAGL
90 100 110 120 130 140
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 LVLSGIFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKERRYARKIEPIRRKGNYLLCSLLLGNVL
:.:... ::.:. .:: : :...... :.: :: ::..:: :: .. : .::: :
CCDS20 LALAALARGLQLSALALAPAEVQVLRESGSEAERAAARRLEPARRWAGCALGALLLLASL
150 160 170 180 190 200
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 VNTSLTILLDNLIGSGLMAVASSTIGIVIF-GEILPQALCSRHGLAVGANTILLTKFFML
....:..:: :. . .. .. :.:.. ::..: :. .: ::.. .. :... .:
CCDS20 AQAALAVLLYRAAGQRAVPAVLGSAGLVFLVGEVVPAAVSGRWTLALAPRALGLSRLAVL
210 220 230 240 250 260
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 LTFPLSFPISKLLDFFLGQEIRTVYNREKLMEMLKVT-EPYNDLVKEELNMIQGALELRT
::.:...:...::.. : ::...:. . .::.:: : :.: :
CCDS20 LTLPVALPVGQLLEL----AARPGRLRERVLELARGGGDPYSDLSK-------GVL--RC
270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 KTVEDIMTQLQDCFMIRSDAILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEDEQSNIVDILYVKDLAFV
.::::..: :.::::. ....:::.... ::.::.:::::.:.:.:::::.::.::::::
CCDS20 RTVEDVLTPLEDCFMLDASTVLDFGVLASIMQSGHTRIPVYEEERSNIVDMLYLKDLAFV
320 330 340 350 360 370
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 DPDDCTPLKTITRFYNHPVHFVFHDTKLDAMLEEFKKGKSHLAIVQKVNNEGEGDPFYEV
::.:::::.:::::::::.::::.::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS20 DPEDCTPLSTITRFYNHPLHFVFNDTKLDAVLEEFKRGKSHLAIVQKVNNEGEGDPFYEV
380 390 400 410 420 430
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 LGLVTLEDVIEEIIKSEILDESDMYTDNRSRKRVSE-----KNKRDFSAFKDADNELKVK
::::::::::::::.:::::::. : :. ... . : :..:: :: .:.: ::
CCDS20 LGLVTLEDVIEEIIRSEILDESEDYRDTVVKRKPASLMAPLKRKEEFSLFKVSDDEYKVT
440 450 460 470 480 490
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 ISPQLLLAAHRFLATEVSQFSPSLISEKILLRLLKYPDVIQELKFDEHNKYYARHYLYTR
::::::::..:::. ::. ::: ::::.::.:::.:.: ::..::: :. ..:::: :
CCDS20 ISPQLLLATQRFLSREVDVFSPLRISEKVLLHLLKHPSVNQEVRFDESNRLATHHYLYQR
500 510 520 530 540 550
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 NKPADYFILILQGKVEVEAGKENMKFETGAFSYYGTMALTSVPSDRSPAHPTPLSRSASL
..:.:::::::::.:::: :::..:::.:::.:::. ::: :::. .: .:.: ::
CCDS20 SQPVDYFILILQGRVEVEIGKEGLKFENGAFTYYGVSALT-VPSS---VHQSPVS---SL
560 570 580 590 600
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 SYPDRTDVSTAATLAGSSNQFGSSVLGQYISDFSVRALVDLQYIKITRQQYQNGLLASRM
. : : :.. :.... ::. : :..:::: ::: ::.:: :: :.:::.:
CCDS20 Q-PIRHDLQPDP---GDGTH--SSA---YCPDYTVRALSDLQLIKVTRLQYLNALLATRA
610 620 630 640 650
590 600 610 620 630
pF1KA1 ENSPQFPIDGCTTHMENLAEKSELPVVDETTT-LLNERNSLLHKASHENAI
.: :: : :...: :. . : ::.:... .::
CCDS20 QNLPQSP------------ENTDLQVIPGSQTRLLGEKTTTAAGSSHSRPGVPVEGSPGR
660 670 680 690 700
CCDS20 NPGV
>>CCDS2026.1 CNNM3 gene_id:26505|Hs108|chr2 (659 aa)
initn: 1384 init1: 524 opt: 530 Z-score: 644.1 bits: 129.4 E(32554): 1.5e-29
Smith-Waterman score: 1355; 42.8% identity (67.6% similar) in 612 aa overlap (24-627:115-642)
10 20 30 40
pF1KA1 MKLYALCTRAQPDGPWLKWTDKDSLLFMVEEPG-----RFLPLWLHILLITVL
.:: . ::: . : : : . :
CCDS20 GCREEAASPAGEWRALLRLRLRAEAVRPHSALLAVRVEPGGGAAEEAAPPWALGLGAAGL
90 100 110 120 130 140
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 LVLSGIFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKERRYARKIEPIRRKGNYLLCSLLLGNVL
:.:... ::.:. .:: : :...... :.: :: ::..:: :: .. : .::: :
CCDS20 LALAALARGLQLSALALAPAEVQVLRESGSEAERAAARRLEPARRWAGCALGALLLLASL
150 160 170 180 190 200
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 VNTSLTILLDNLIGSGLMAVASSTIGIVIF-GEILPQALCSRHGLAVGANTILLTKFFML
....:..:: :. . .. .. :.:.. ::..: :. .: ::.. .. :... .:
CCDS20 AQAALAVLLYRAAGQRAVPAVLGSAGLVFLVGEVVPAAVSGRWTLALAPRALGLSRLAVL
210 220 230 240 250 260
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 LTFPLSFPISKLLDFFLGQEIRTVYNREKLMEMLKVT-EPYNDLVKEELNMIQGALELRT
::.:...:...::.. : ::...:. . .::.:: : :.: :
CCDS20 LTLPVALPVGQLLEL----AARPGRLRERVLELARGGGDPYSDLSK-------GVL--RC
270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 KTVEDIMTQLQDCFMIRSDAILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEDEQSNIVDILYVKDLAFV
.::::..: :.::::. ....:::.... ::.::.:::::.:.:.:::::.::.::::::
CCDS20 RTVEDVLTPLEDCFMLDASTVLDFGVLASIMQSGHTRIPVYEEERSNIVDMLYLKDLAFV
320 330 340 350 360 370
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 DPDDCTPLKTITRFYNHPVHFVFHDTKLDAMLEEFKKGKSHLAIVQKVNNEGEGDPFYEV
::.:::::.:::::::::.::::.::::::.:::::.: . .:.. : .
CCDS20 DPEDCTPLSTITRFYNHPLHFVFNDTKLDAVLEEFKRGDT---VVKR-------KPASLM
380 390 400 410 420
350 360 370 380 390 400
pF1KA1 LGLVTLEDVIEEIIKSEILDESDMYTDNRSRKRVSEKNKRDFSAFKDADNELKVKISPQL
: : :..:: :: .:.: :: :::::
CCDS20 APL---------------------------------KRKEEFSLFKVSDDEYKVTISPQL
430 440
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 LLAAHRFLATEVSQFSPSLISEKILLRLLKYPDVIQELKFDEHNKYYARHYLYTRNKPAD
:::..:::. ::. ::: ::::.::.:::.:.: ::..::: :. ..:::: :..:.:
CCDS20 LLATQRFLSREVDVFSPLRISEKVLLHLLKHPSVNQEVRFDESNRLATHHYLYQRSQPVD
450 460 470 480 490 500
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 YFILILQGKVEVEAGKENMKFETGAFSYYGTMALTSVPSDRSPAHPTPLSRSASLSYPDR
::::::::.:::: :::..:::.:::.:::. ::: :::. .: .:.: ::. : :
CCDS20 YFILILQGRVEVEIGKEGLKFENGAFTYYGVSALT-VPSS---VHQSPVS---SLQ-PIR
510 520 530 540 550 560
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 TDVSTAATLAGSSNQFGSSVLGQYISDFSVRALVDLQYIKITRQQYQNGLLASRMENSPQ
:.. :.... ::. : :..:::: ::: ::.:: :: :.:::.: .: ::
CCDS20 HDLQPDP---GDGTH--SSA---YCPDYTVRALSDLQLIKVTRLQYLNALLATRAQNLPQ
570 580 590 600 610
590 600 610 620 630
pF1KA1 FPIDGCTTHMENLAEKSELPVVDETTT-LLNERNSLLHKASHENAI
: :...: :. . : ::.:... .::
CCDS20 SP------------ENTDLQVIPGSQTRLLGEKTTTAAGSSHSRPGVPVEGSPGRNPGV
620 630 640 650
631 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 21:30:10 2016 done: Wed Nov 2 21:30:10 2016
Total Scan time: 2.530 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]