FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1597, 895 aa 1>>>pF1KA1597 895 - 895 aa - 895 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5131+/-0.00115; mu= 1.5141+/- 0.069 mean_var=203.5352+/-41.030, 0's: 0 Z-trim(109.0): 78 B-trim: 2 in 1/51 Lambda= 0.089899 statistics sampled from 10518 (10595) to 10518 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.325), width: 16 Scan time: 3.290 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31649.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 ( 910) 5909 779.9 0 CCDS76461.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 ( 902) 3536 472.1 2e-132 CCDS53688.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 ( 934) 3423 457.4 5.4e-128 CCDS53689.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 ( 935) 3411 455.9 1.6e-127 CCDS53687.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 ( 336) 2239 303.7 3.8e-82 CCDS41698.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 ( 365) 2175 295.4 1.3e-79 CCDS31652.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 ( 376) 2175 295.4 1.3e-79 CCDS298.1 SYTL1 gene_id:84958|Hs108|chr1 ( 550) 1110 157.3 6.9e-38 CCDS53286.1 SYTL1 gene_id:84958|Hs108|chr1 ( 562) 1102 156.3 1.4e-37 CCDS14472.1 SYTL4 gene_id:94121|Hs108|chrX ( 671) 975 139.9 1.5e-32 CCDS14244.1 SYTL5 gene_id:94122|Hs108|chrX ( 730) 539 83.3 1.7e-15 CCDS55399.1 SYTL5 gene_id:94122|Hs108|chrX ( 752) 502 78.6 4.9e-14 CCDS56458.1 SYTL3 gene_id:94120|Hs108|chr6 ( 610) 478 75.4 3.6e-13 CCDS34563.1 SYTL3 gene_id:94120|Hs108|chr6 ( 542) 474 74.9 4.6e-13 >>CCDS31649.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 (910 aa) initn: 5909 init1: 5909 opt: 5909 Z-score: 4154.1 bits: 779.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5909; 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93.7% identity (93.9% similar) in 936 aa overlap (1-895:16-935) 10 20 30 40 pF1KA1 MKVLQRDAALKRAEEERVRHLPEKIKDDQQLKNMSGQWFYEAKAK ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 MIDLSFLTEEEQEAIMKVLQRDAALKRAEEERVRHLPEKIKDDQQLKNMSGQWFYEAKAK 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KA1 RHRDKIHGADIIRASMRKKRPQIAAEQSKDRENGAKESWVNNVNKDAFLPPELAGVVEEP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 RHRDKIHGADIIRASMRKKRPQIAAEQSKDRENGAKESWVNNVNKDAFLPPELAGVVEEP 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KA1 EEDAAPASPSSSVVNPASSVIDMSQENTRKPNVSPEK-RKNPFNSSKLPEGHSSQQTKNE ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::: CCDS53 EEDAAPASPSSSVVNPASSVIDMSQENTRKPNVSPEKQRKNPFNSSKLPEGHSSQQTKNE 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KA1 QSKNGRTGLFQTSKEDELSESKEKSTVADTSIQKLEKSKQTLPGLSNGSQIKAPIPKARK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 QSKNGRTGLFQTSKEDELSESKEKSTVADTSIQKLEKSKQTLPGLSNGSQIKAPIPKARK 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KA1 MIYKSTDLNKDDNQSFPRQRTDSLKARGAPRGILKRNSSSSSTDSETLRYNHNFEPKSKI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 MIYKSTDLNKDDNQSFPRQRTDSLKARGAPRGILKRNSSSSSTDSETLRYNHNFEPKSKI 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KA1 VSPGLTIHERISEKEHSLEDNSSPNSLEPLKHVRFSAVKDELPQSPGLIHGREVGEFSVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 VSPGLTIHERISEKEHSLEDNSSPNSLEPLKHVRFSAVKDELPQSPGLIHGREVGEFSVL 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KA1 ESDRLKNGMEDAGDTEEFQSDPKPSQYRKPSLFHQSTSSPYVSKSETHQPMTSGSFPING :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 ESDRLKNGMEDAGDTEEFQSDPKPSQYRKPSLFHQSTSSPYVSKSETHQPMTSGSFPING 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KA1 LHSHSEVLTARPQSMENSPTINEPKDKSSELTRLESVLPRSPADELSHCVEPEPSQVPGG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 LHSHSEVLTARPQSMENSPTINEPKDKSSELTRLESVLPRSPADELSHCVEPEPSQVPGG 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KA1 SSRDRQQGSEEEPSPVLKTLERSAARKMPSKSLEDISSDSSNQAKVDNQPEELVRSAEDD ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 SSRDRQQGSEEEPSPVLKTLERSAARKMPSKSLEDISSDSSNQAKVDNQPEELVRSAED- 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 pF1KA1 EKPDQKPVTNECVPRISTVPTQPDNPFSHPDKLKRMSKSVPAFLQDE------------- .::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 ---------------VSTVPTQPDNPFSHPDKLKRMSKSVPAFLQDESDDRETDTASESS 540 550 560 570 580 580 590 600 pF1KA1 ---------------------------VSGSVMSVYSGDFGNLEVKGNIQFAIEYVESLK ::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 YQLSRHKKSPSSLTNLSSSSGMTSLSSVSGSVMSVYSGDFGNLEVKGNIQFAIEYVESLK 590 600 610 620 630 640 610 620 630 640 650 660 pF1KA1 ELHVFVAQCKDLAAADVKKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGKKKTLVVKKTLNPVYNEILRYK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 ELHVFVAQCKDLAAADVKKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGKKKTLVVKKTLNPVYNEILRYK 650 660 670 680 690 700 670 680 690 700 710 720 pF1KA1 IEKQILKTQKLNLSIWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDWDNKQNKQLRWYPLKRKTAPVA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 IEKQILKTQKLNLSIWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDWDNKQNKQLRWYPLKRKTAPVA 710 720 730 740 750 760 730 740 750 760 770 780 pF1KA1 LEAENRGEMKLALQYVPEPVPGKKLPTTGEVHIWVKECLDLPLLRGSHLNSFVKCTILPD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 LEAENRGEMKLALQYVPEPVPGKKLPTTGEVHIWVKECLDLPLLRGSHLNSFVKCTILPD 770 780 790 800 810 820 790 800 810 820 830 840 pF1KA1 TSRKSRQKTRAVGKTTNPIFNHTMVYDGFRPEDLMEVCVELTVWDHYKLTNQFLGGLRIG ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::: CCDS53 TSRKSRQKTRAVGKTTNPIFNHTMVYDGFRPEDLMEACVELTVWDHYKLTNQFLGGLRIG 830 840 850 860 870 880 850 860 870 880 890 pF1KA1 FGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLLIAKISK ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 FGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLLIAKISK 890 900 910 920 930 >>CCDS53687.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 (336 aa) initn: 2239 init1: 2239 opt: 2239 Z-score: 1588.3 bits: 303.7 E(32554): 3.8e-82 Smith-Waterman score: 2239; 99.7% identity (100.0% similar) in 336 aa overlap (560-895:1-336) 530 540 550 560 570 580 pF1KA1 KPVTNECVPRISTVPTQPDNPFSHPDKLKRMSKSVPAFLQDEVSGSVMSVYSGDFGNLEV :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 MSKSVPAFLQDEVSGSVMSVYSGDFGNLEV 10 20 30 590 600 610 620 630 640 pF1KA1 KGNIQFAIEYVESLKELHVFVAQCKDLAAADVKKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGKKKTLVV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 KGNIQFAIEYVESLKELHVFVAQCKDLAAADVKKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGKKKTLVV 40 50 60 70 80 90 650 660 670 680 690 700 pF1KA1 KKTLNPVYNEILRYKIEKQILKTQKLNLSIWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDWDNKQNK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 KKTLNPVYNEILRYKIEKQILKTQKLNLSIWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDWDNKQNK 100 110 120 130 140 150 710 720 730 740 750 760 pF1KA1 QLRWYPLKRKTAPVALEAENRGEMKLALQYVPEPVPGKKLPTTGEVHIWVKECLDLPLLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 QLRWYPLKRKTAPVALEAENRGEMKLALQYVPEPVPGKKLPTTGEVHIWVKECLDLPLLR 160 170 180 190 200 210 770 780 790 800 810 820 pF1KA1 GSHLNSFVKCTILPDTSRKSRQKTRAVGKTTNPIFNHTMVYDGFRPEDLMEVCVELTVWD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::: CCDS53 GSHLNSFVKCTILPDTSRKSRQKTRAVGKTTNPIFNHTMVYDGFRPEDLMEACVELTVWD 220 230 240 250 260 270 830 840 850 860 870 880 pF1KA1 HYKLTNQFLGGLRIGFGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 HYKLTNQFLGGLRIGFGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLL 280 290 300 310 320 330 890 pF1KA1 IAKISK :::::: CCDS53 IAKISK >>CCDS41698.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 (365 aa) initn: 2162 init1: 2162 opt: 2175 Z-score: 1542.9 bits: 295.4 E(32554): 1.3e-79 Smith-Waterman score: 2175; 95.6% identity (97.4% similar) in 342 aa overlap (554-895:24-365) 530 540 550 560 570 580 pF1KA1 DEKPDQKPVTNECVPRISTVPTQPDNPFSHPDKLKRMSKSVPAFLQDEVSGSVMSVYSGD :..: .:.: . :::::::::::: CCDS41 MSDDRETDTASESSYQLSRHKKSPSSLTNLSSSSGMTSLSSVSGSVMSVYSGD 10 20 30 40 50 590 600 610 620 630 640 pF1KA1 FGNLEVKGNIQFAIEYVESLKELHVFVAQCKDLAAADVKKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 FGNLEVKGNIQFAIEYVESLKELHVFVAQCKDLAAADVKKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGK 60 70 80 90 100 110 650 660 670 680 690 700 pF1KA1 KKTLVVKKTLNPVYNEILRYKIEKQILKTQKLNLSIWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 KKTLVVKKTLNPVYNEILRYKIEKQILKTQKLNLSIWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDW 120 130 140 150 160 170 710 720 730 740 750 760 pF1KA1 DNKQNKQLRWYPLKRKTAPVALEAENRGEMKLALQYVPEPVPGKKLPTTGEVHIWVKECL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 DNKQNKQLRWYPLKRKTAPVALEAENRGEMKLALQYVPEPVPGKKLPTTGEVHIWVKECL 180 190 200 210 220 230 770 780 790 800 810 820 pF1KA1 DLPLLRGSHLNSFVKCTILPDTSRKSRQKTRAVGKTTNPIFNHTMVYDGFRPEDLMEVCV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: CCDS41 DLPLLRGSHLNSFVKCTILPDTSRKSRQKTRAVGKTTNPIFNHTMVYDGFRPEDLMEACV 240 250 260 270 280 290 830 840 850 860 870 880 pF1KA1 ELTVWDHYKLTNQFLGGLRIGFGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWIEATL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 ELTVWDHYKLTNQFLGGLRIGFGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWIEATL 300 310 320 330 340 350 890 pF1KA1 PLRMLLIAKISK :::::::::::: CCDS41 PLRMLLIAKISK 360 >>CCDS31652.1 SYTL2 gene_id:54843|Hs108|chr11 (376 aa) initn: 2225 init1: 2162 opt: 2175 Z-score: 1542.7 bits: 295.4 E(32554): 1.3e-79 Smith-Waterman score: 2175; 95.6% identity (97.4% similar) in 342 aa overlap (554-895:35-376) 530 540 550 560 570 580 pF1KA1 DEKPDQKPVTNECVPRISTVPTQPDNPFSHPDKLKRMSKSVPAFLQDEVSGSVMSVYSGD :..: .:.: . :::::::::::: CCDS31 VPAFLQDESDDRETDTASESSYQLSRHKKSPSSLTNLSSSSGMTSLSSVSGSVMSVYSGD 10 20 30 40 50 60 590 600 610 620 630 640 pF1KA1 FGNLEVKGNIQFAIEYVESLKELHVFVAQCKDLAAADVKKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 FGNLEVKGNIQFAIEYVESLKELHVFVAQCKDLAAADVKKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGK 70 80 90 100 110 120 650 660 670 680 690 700 pF1KA1 KKTLVVKKTLNPVYNEILRYKIEKQILKTQKLNLSIWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 KKTLVVKKTLNPVYNEILRYKIEKQILKTQKLNLSIWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDW 130 140 150 160 170 180 710 720 730 740 750 760 pF1KA1 DNKQNKQLRWYPLKRKTAPVALEAENRGEMKLALQYVPEPVPGKKLPTTGEVHIWVKECL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 DNKQNKQLRWYPLKRKTAPVALEAENRGEMKLALQYVPEPVPGKKLPTTGEVHIWVKECL 190 200 210 220 230 240 770 780 790 800 810 820 pF1KA1 DLPLLRGSHLNSFVKCTILPDTSRKSRQKTRAVGKTTNPIFNHTMVYDGFRPEDLMEVCV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: CCDS31 DLPLLRGSHLNSFVKCTILPDTSRKSRQKTRAVGKTTNPIFNHTMVYDGFRPEDLMEACV 250 260 270 280 290 300 830 840 850 860 870 880 pF1KA1 ELTVWDHYKLTNQFLGGLRIGFGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWIEATL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS31 ELTVWDHYKLTNQFLGGLRIGFGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWIEATL 310 320 330 340 350 360 890 pF1KA1 PLRMLLIAKISK :::::::::::: CCDS31 PLRMLLIAKISK 370 >>CCDS298.1 SYTL1 gene_id:84958|Hs108|chr1 (550 aa) initn: 1225 init1: 645 opt: 1110 Z-score: 793.7 bits: 157.3 E(32554): 6.9e-38 Smith-Waterman score: 1141; 41.7% identity (68.7% similar) in 451 aa overlap (460-892:116-549) 430 440 450 460 470 480 pF1KA1 DKSSELTRLESVLPRSPADELSHCVEPEPSQVPGGSSRDRQ-----QGSEEEPSPVLKTL :.:: .::. . .:: : : : :. CCDS29 EARSQRHHNAHFGSDLVRASMRRKKSTRGDQAPG---HDREAEAAVKEKEEGPEPRL-TI 90 100 110 120 130 140 490 500 510 520 530 540 pF1KA1 ERSAARKMPSKSLEDISSDSSNQAKVD-NQPEELVRSAEDDEKPDQKPVTN-ECVPRIST ... ... . : . . ..::. : .: .. : . : : :. .:... : :: . CCDS29 DEAPQERL--RETEASDPEEASQAQEDPGQGDQQVCAEEAD--PELEPASGGEQEPRPQQ 150 160 170 180 190 550 560 570 580 590 pF1KA1 VPTQP---------DNPFSHP--DKLKRMSKSVPAFLQDEVSGSVMSVYSGDFGNLEVKG . :. . : : :.. :.:: .. .. .::: ::. ::: ..:.: CCDS29 AQTKAASQILENGEEAPGPDPSLDRMLSSSSSVSSLNSSTLSGSQMSL-SGDAEAVQVRG 200 210 220 230 240 250 600 610 620 630 640 650 pF1KA1 NIQFAIEYVESLKELHVFVAQCKDLAAADVKKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGKKKTLVVKK ...::..: . ::.: : ::. :::: ...:::::::.::::: :..:.:: : :. CCDS29 SVHFALHYEPGAAELRVHVIQCQGLAAA--RRRRSDPYVKSYLLPD--KQSKRKTAVKKR 260 270 280 290 300 310 660 670 680 690 700 710 pF1KA1 TLNPVYNEILRYKIEKQILKTQKLNLSIWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDWDNKQNKQL .::::.:: :::.. . :. . :.::.:::... :: ::::::. :.:::: .. . CCDS29 NLNPVFNETLRYSVPQAELQGRVLSLSVWHRESLGRNIFLGEVEVPLDTWDWGSEPT--- 320 330 340 350 360 720 730 740 750 760 770 pF1KA1 RWYPLKRKTAPVALEAENRGEMKLALQYVPEPVPGKKLPTTGEVHIWVKECLDLPLLRGS : ::. .. : . .:: . :.:.::: : :: .::.:.:::: :: ::.. CCDS29 -WLPLQPRVPPSPDDLPSRGLLALSLKYVPAGSEGAGLPPSGELHFWVKEARDLLPLRAG 370 380 390 400 410 420 780 790 800 810 820 830 pF1KA1 HLNSFVKCTILPDTSRKSRQKTRAVGKTTNPIFNHTMVYDGFRPEDLMEVCVELTVWDHY :...:.: .::: :. :::.::.: .. .:.:::::::::: : :: ..:.::..::: CCDS29 SLDTYVQCFVLPDDSQASRQRTRVVRRSLSPVFNHTMVYDGFGPADLRQACAELSLWDHG 430 440 450 460 470 480 840 850 860 870 880 890 pF1KA1 KLTNQFLGGLRIGFGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLLIA :.:. ::: :...:::.::: .: ::::: :: ::. ....: :... :::: : CCDS29 ALANRQLGGTRLSLGTGSSYGLQVPWMDSTPEEKQLWQALLEQPCEWVDGLLPLRTNLAP 490 500 510 520 530 540 pF1KA1 KISK . CCDS29 RT 550 >>CCDS53286.1 SYTL1 gene_id:84958|Hs108|chr1 (562 aa) initn: 1225 init1: 645 opt: 1102 Z-score: 787.9 bits: 156.3 E(32554): 1.4e-37 Smith-Waterman score: 1140; 40.9% identity (69.5% similar) in 440 aa overlap (456-892:135-561) 430 440 450 460 470 480 pF1KA1 NEPKDKSSELTRLESVLPRSPADELSHCVEPEPSQVPGGSSRDRQQGSE--EEPSPVLKT ::: . . ..: . .: . ::: . CCDS53 SMRRKKSTRGDQAPGHDREAEAAVKEKEEGPEPRLTIDEAPQERLRETEGPDFPSPSVPL 110 120 130 140 150 160 490 500 510 520 530 540 pF1KA1 LERSAARKMPSKSLEDISSDSSNQAKVDNQPE-ELVRSAEDDEKPDQKPVTNECVPRIST ... . :.. :: .. ... . .:: : . ..:.. .:.: . .. . .: CCDS53 --KASDPEEASQAQEDPGQGDQQVCAEEADPELEPASGGEQEPRPQQ--AQTKAASQILE 170 180 190 200 210 220 550 560 570 580 590 600 pF1KA1 VPTQPDNPFSHPDKLKRMSKSVPAFLQDEVSGSVMSVYSGDFGNLEVKGNIQFAIEYVES . .: :.. :.:: .. .. .::: ::. ::: ..:.:...::..: . CCDS53 NGEEAPGPDPSLDRMLSSSSSVSSLNSSTLSGSQMSL-SGDAEAVQVRGSVHFALHYEPG 230 240 250 260 270 610 620 630 640 650 660 pF1KA1 LKELHVFVAQCKDLAAADVKKQRSDPYVKAYLLPDKGKMGKKKTLVVKKTLNPVYNEILR ::.: : ::. :::: ...:::::::.:::::: ..:.:: : :..::::.:: :: CCDS53 AAELRVHVIQCQGLAAA--RRRRSDPYVKSYLLPDK--QSKRKTAVKKRNLNPVFNETLR 280 290 300 310 320 330 670 680 690 700 710 720 pF1KA1 YKIEKQILKTQKLNLSIWHRDTFKRNSFLGEVELDLETWDWDNKQNKQLRWYPLKRKTAP :.. . :. . :.::.:::... :: ::::::. :.:::: .. . : ::. .. : CCDS53 YSVPQAELQGRVLSLSVWHRESLGRNIFLGEVEVPLDTWDWGSEPT----WLPLQPRVPP 340 350 360 370 380 390 730 740 750 760 770 780 pF1KA1 VALEAENRGEMKLALQYVPEPVPGKKLPTTGEVHIWVKECLDLPLLRGSHLNSFVKCTIL . .:: . :.:.::: : :: .::.:.:::: :: ::.. :...:.: .: CCDS53 SPDDLPSRGLLALSLKYVPAGSEGAGLPPSGELHFWVKEARDLLPLRAGSLDTYVQCFVL 400 410 420 430 440 450 790 800 810 820 830 840 pF1KA1 PDTSRKSRQKTRAVGKTTNPIFNHTMVYDGFRPEDLMEVCVELTVWDHYKLTNQFLGGLR :: :. :::.::.: .. .:.:::::::::: : :: ..:.::..::: :.:. ::: : CCDS53 PDDSQASRQRTRVVRRSLSPVFNHTMVYDGFGPADLRQACAELSLWDHGALANRQLGGTR 460 470 480 490 500 510 850 860 870 880 890 pF1KA1 IGFGTGKSYGTEVDWMDSTSEEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLLIAKISK ...:::.::: .: ::::: :: ::. ....: :... :::: : . CCDS53 LSLGTGSSYGLQVPWMDSTPEEKQLWQALLEQPCEWVDGLLPLRTNLAPRT 520 530 540 550 560 >>CCDS14472.1 SYTL4 gene_id:94121|Hs108|chrX (671 aa) initn: 738 init1: 438 opt: 975 Z-score: 697.7 bits: 139.9 E(32554): 1.5e-32 Smith-Waterman score: 988; 35.4% identity (64.0% similar) in 536 aa overlap (375-886:155-661) 350 360 370 380 390 400 pF1KA1 ESDRLKNGMEDAGDTEEFQSDPKPSQYRKPSLFHQSTSS---PYVSKSETHQPMTSGSFP ::.::. . : . . .: : : CCDS14 NRFAYRTGSEIIRMSLRHKPAVSKRETVGQSLLHQTQMGDIWPGRKIIQERQKEPSVLFE 130 140 150 160 170 180 410 420 430 440 450 460 pF1KA1 INGLHSHSEVLTARPQSMENSPTINEPKDKSSELTRLESVLPRSPADELSHCVEPEPSQV . :.: . .: :. .:... . .. .. . : . ...: : .. :. ::: CCDS14 VPKLKSGKSALEAESESLDSFTADSDSTSRRDSLDK-SGLFP-----EWKKMSAPK-SQV 190 200 210 220 230 470 480 490 500 510 pF1KA1 PGGSSRDRQQGSE-----EEPSPVLKTLERSAARKMPSKSLEDISSDSSNQAKVDNQPEE .. : :.. .: ..: :. : ::. ... .: .::. CCDS14 ----EKETQPGGQNVVFVDEGEMIFKKNTRKILR--PSEYTKSV---------IDLRPED 240 250 260 270 280 520 530 540 550 560 570 pF1KA1 LVR-SAEDDEKPDQKPVTNECVPRISTVPTQPDNPFSHPDKLKRMSKSVPAFLQDEVS-- .:. :. .. . : : .. . .. ..: ::.:. : . . .:. : CCDS14 VVHESGSLGDRSKSVPGLN-----VDMEEEEEEEDIDHLVKLHRQ-KLARSSMQSGSSMS 290 300 310 320 330 580 590 600 610 620 pF1KA1 --GSVMSVYS--GDFGNLEVKGNIQFAIEYVESLKELHVFVAQCKDLAAADVKKQRSDPY ::.::.:: :::::. : : : :...: .. . : : : .:..:: :: :.::.:: CCDS14 TIGSMMSIYSEAGDFGNIFVTGRIAFSLKYEQQTQSLVVHVKECHQLAYADEAKKRSNPY 340 350 360 370 380 390 630 640 650 660 670 680 pF1KA1 VKAYLLPDKGKMGKKKTLVVKKTLNPVYNEILRYKIEKQILKTQKLNLSIWHRDTFKRNS ::.::::::...::.:: . . :.::.:.: :::.: ...: . :..:.::. : ::. CCDS14 VKTYLLPDKSRQGKRKTSIKRDTINPLYDETLRYEIPESLLAQRTLQFSVWHHGRFGRNT 400 410 420 430 440 450 690 700 710 720 730 740 pF1KA1 FLGEVELDLETWDWDNKQNKQLRWYPLKRKTAPVALEAENRGEMKLALQYVPE---PVPG ::::.:.....: :.: .. : . .:..: . ..::. ..:.:.: :: : CCDS14 FLGEAEIQMDSWKLDKKLDHCLPLHGKISAESPTGLPS-HKGELVVSLKYIPASKTPVGG 460 470 480 490 500 510 750 760 770 780 790 800 pF1KA1 KKLPTTG----EVHIWVKECLDLPLLR-GSHLNSFVKCTILPDTSRKSRQKTRAVGKTTN . . : :...:.:: .: . :. .:::: .:: .. :..:: .. :: : CCDS14 DRKKSKGGEGGELQVWIKEAKNLTAAKAGGTSDSFVKGYLLPMRNKASKRKTPVMKKTLN 520 530 540 550 560 570 810 820 830 840 850 860 pF1KA1 PIFNHTMVYDGFRPEDLMEVCVELTVWDHYKL-TNQFLGGLRIGFGTGKSYGTEVDWMDS : .:::.::.: : :::...:.::::::. : .:.::::.:.: ::: : : :::::: CCDS14 PHYNHTFVYNGVRLEDLQHMCLELTVWDREPLASNDFLGGVRLGVGTGISNGEVVDWMDS 580 590 600 610 620 630 870 880 890 pF1KA1 TSEEVALWEKMVNSPNTWIEATLPLRMLLIAKISK :.:::.::.:: . :..: :.:: :: CCDS14 TGEEVSLWQKMRQYPGSWAEGTLQLRSSMAKQKLGL 640 650 660 670 895 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Wed Nov 2 21:30:47 2016 done: Wed Nov 2 21:30:47 2016 Total Scan time: 3.290 Total Display time: 0.190 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]