Result of FASTA (ccds) for
pF1KA1621
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1621, 776 aa
1>>>pF1KA1621 776 - 776 aa - 776 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8966+/-0.00092; mu= 17.0729+/- 0.055
mean_var=73.1474+/-14.834, 0's: 0 Z-trim(105.2): 195 B-trim: 523 in 1/52
Lambda= 0.149960
statistics sampled from 8117 (8312) to 8117 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.255), width: 16
Scan time: 4.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4251.1 PCDHB16 gene_id:57717|Hs108|chr5 ( 776) 4983 1087.9 0
CCDS4250.1 PCDHB8 gene_id:56128|Hs108|chr5 ( 801) 3987 872.4 0
CCDS4256.1 PCDHB14 gene_id:56122|Hs108|chr5 ( 798) 3963 867.2 0
CCDS4245.1 PCDHB3 gene_id:56132|Hs108|chr5 ( 796) 3961 866.8 0
CCDS4255.1 PCDHB13 gene_id:56123|Hs108|chr5 ( 798) 3944 863.1 0
CCDS4257.1 PCDHB15 gene_id:56121|Hs108|chr5 ( 787) 3940 862.2 0
CCDS4244.1 PCDHB2 gene_id:56133|Hs108|chr5 ( 798) 3921 858.1 0
CCDS4248.1 PCDHB6 gene_id:56130|Hs108|chr5 ( 794) 3917 857.3 0
CCDS4247.1 PCDHB5 gene_id:26167|Hs108|chr5 ( 795) 3896 852.7 0
CCDS4246.1 PCDHB4 gene_id:56131|Hs108|chr5 ( 795) 3844 841.5 0
CCDS4253.1 PCDHB11 gene_id:56125|Hs108|chr5 ( 797) 3839 840.4 0
CCDS4254.1 PCDHB12 gene_id:56124|Hs108|chr5 ( 795) 3828 838.0 0
CCDS75328.1 PCDHB9 gene_id:56127|Hs108|chr5 ( 797) 3804 832.8 0
CCDS4252.1 PCDHB10 gene_id:56126|Hs108|chr5 ( 800) 3732 817.2 0
CCDS4249.1 PCDHB7 gene_id:56129|Hs108|chr5 ( 793) 3723 815.3 0
CCDS78067.1 PCDHB6 gene_id:56130|Hs108|chr5 ( 658) 3384 741.9 7.7e-214
CCDS4243.1 PCDHB1 gene_id:29930|Hs108|chr5 ( 818) 2656 584.4 2.4e-166
CCDS75336.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 817) 2185 482.5 1.1e-135
CCDS54927.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 932) 2185 482.6 1.3e-135
CCDS75335.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 818) 2179 481.2 2.8e-135
CCDS54926.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 932) 2179 481.3 3.1e-135
CCDS75343.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 850) 2167 478.7 1.7e-134
CCDS47292.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 936) 2167 478.7 1.9e-134
CCDS75332.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 811) 2156 476.3 8.7e-134
CCDS54924.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 931) 2156 476.3 9.8e-134
CCDS54922.1 PCDHGA1 gene_id:56114|Hs108|chr5 ( 931) 2137 472.2 1.7e-132
CCDS47289.1 PCDHGA2 gene_id:56113|Hs108|chr5 ( 932) 2129 470.5 5.6e-132
CCDS75341.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5 ( 828) 2123 469.1 1.3e-131
CCDS58981.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5 ( 932) 2123 469.2 1.4e-131
CCDS75333.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 813) 2122 468.9 1.4e-131
CCDS54925.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 931) 2122 468.9 1.6e-131
CCDS75340.1 PCDHGB5 gene_id:56101|Hs108|chr5 ( 818) 2118 468.0 2.6e-131
CCDS75339.1 PCDHGB5 gene_id:56101|Hs108|chr5 ( 923) 2118 468.1 2.9e-131
CCDS75346.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 820) 2101 464.4 3.4e-130
CCDS4260.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 932) 2101 464.4 3.8e-130
CCDS75345.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 837) 2099 463.9 4.6e-130
CCDS47294.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 935) 2099 464.0 5.1e-130
CCDS75331.1 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 851) 2093 462.6 1.2e-129
CCDS58979.2 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 962) 2093 462.7 1.3e-129
CCDS75338.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5 ( 820) 2085 460.9 3.7e-129
CCDS47291.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5 ( 932) 2085 460.9 4.1e-129
CCDS75337.1 PCDHGB4 gene_id:8641|Hs108|chr5 ( 803) 2084 460.7 4.2e-129
CCDS75329.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5 ( 829) 2084 460.7 4.3e-129
CCDS54928.1 PCDHGB4 gene_id:8641|Hs108|chr5 ( 923) 2084 460.7 4.8e-129
CCDS47290.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5 ( 932) 2084 460.7 4.8e-129
CCDS75342.1 PCDHGB6 gene_id:56100|Hs108|chr5 ( 820) 2077 459.2 1.2e-128
CCDS54929.1 PCDHGB6 gene_id:56100|Hs108|chr5 ( 930) 2077 459.2 1.4e-128
CCDS75344.1 PCDHGB7 gene_id:56099|Hs108|chr5 ( 808) 2071 457.9 3e-128
CCDS47293.1 PCDHGB7 gene_id:56099|Hs108|chr5 ( 929) 2071 457.9 3.4e-128
CCDS75330.1 PCDHGB1 gene_id:56104|Hs108|chr5 ( 810) 2045 452.3 1.5e-126
>>CCDS4251.1 PCDHB16 gene_id:57717|Hs108|chr5 (776 aa)
initn: 4983 init1: 4983 opt: 4983 Z-score: 5821.1 bits: 1087.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4983; 99.0% identity (99.5% similar) in 776 aa overlap (1-776:1-776)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MEIGWMHNRRQRQVLVFFVLLSLSGAGAELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTEMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MEIGWMHNRRQRQVLVFFVLLSLSGAGAELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTEMS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQAE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LRVIDINDHSPMFTEKEMILKIPENSPLGTEFPLNHALDLDVGSNNVQNYKISPSSHFRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LRVIDINDHSPMFTEKEMILKIPENSPLGTEFPLNHALDLDVGSNNVQNYKISPSSHFRV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LIHEFRDGRKYPELVLDKELDREEEPQLRLTLTALDGGSPPRSGTAQVRIEVVDINDNAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LIHEFRDGRKYPELVLDKELDREEEPQLRLTLTALDGGSPPRSGTAQVRIEVVDINDNAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 EFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 VRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPENS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPENS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 PEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LTVTDMGTPRLKTEHNITVQISDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LTVTDMGTPRLKTEHNITVQISDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 GINAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALREFEFRVSATDRGSPA
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :::::.::::::::
CCDS42 GTNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGATDRGSPA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSREALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPCSATATLHV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::: ::::::::
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKQRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LLVDGFSQPFLPLPEAAPGQTQANSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVVVRLCRRSRAA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS42 LLVDGFSQPFLPLPEAAPGQTQANSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KA1 SVGRCSMPEGPFPGRLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETSEFKFLKPIIPNFSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SVGRCSMPEGPFPGRLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETSEFKFLKPIIPNFSP
730 740 750 760 770
>>CCDS4250.1 PCDHB8 gene_id:56128|Hs108|chr5 (801 aa)
initn: 3927 init1: 3927 opt: 3987 Z-score: 4656.3 bits: 872.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3987; 79.3% identity (92.4% similar) in 765 aa overlap (10-773:10-774)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MEIGWMHNRRQRQVLVFFVLLSLSGAGA-ELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTEM
:::::: :.::.:: ::: : ::::::::: .:::.::.::::: :.
CCDS42 MEASGKLICRQRQVLFSFLLLGLSLAGAAEPRSYSVVEETEGSSFVTNLAKDLGLEQREF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 STRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQA
: : .:..:.::: ::::. .:.:::.:::::::.::: ::::.:.::::.:.:.:.:::
CCDS42 SRRGVRVVSRGNKLHLQLNQETADLLLNEKLDREDLCGHTEPCVLRFQVLLESPFEFFQA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 ELRVIDINDHSPMFTEKEMILKIPENSPLGTEFPLNHALDLDVGSNNVQNYKISPSSHFR
::.:::::::::.: .:.:..:. :.:: :: :::..: :::.:.::..:: :::.:.::
CCDS42 ELQVIDINDHSPVFLDKQMLVKVSESSPPGTAFPLKNAEDLDIGQNNIENYIISPNSYFR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 VLIHEFRDGRKYPELVLDKELDREEEPQLRLTLTALDGGSPPRSGTAQVRIEVVDINDNA
:: .. :::::::::::: :::::: .::::::::::::::::::::: :::::.::::
CCDS42 VLTRKRSDGRKYPELVLDKALDREEEAELRLTLTALDGGSPPRSGTAQVYIEVVDVNDNA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 PEFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTG
::::::.:.::: :.::.. ::. ::: :.: :.::.:::.::: :..::::..:. .::
CCDS42 PEFEQPFYRVQISEDSPISFLVVKVSATDVDTGVNGEISYSLFQASDEISKTFKVDFLTG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 EVRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPEN
:.::.::.::: :::: :.: :.::.:::::.:.::.::::. :.:::::.:::::::
CCDS42 EIRLKKQLDFEKFQSYEVNIEARDAGGFSGKCTVLIQVIDVNDHAPEVTMSAFTSPIPEN
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 SPEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNI
.:: :::.::::: :::.::: ::::::::::: :: :::::.:: ::::.:::::.
CCDS42 APETVVALFSVSDLDSGENGKISCSIQEDLPFLLKSSVGNFYTLLTETPLDRESRAEYNV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 TLTVTDMGTPRLKTEHNITVQISDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRD
:.::::.::::: :. :.:: .::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TITVTDLGTPRLTTHLNMTVLVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRD
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 SGINAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALREFEFRVSATDRGSP
:: :::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::. :::::.:.:::::
CCDS42 SGTNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINTDNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGASDRGSP
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 ALSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ALSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQN
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 AWLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPCSATATLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS42 AWLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKQRLVVLVKDNGEPPCSATATLH
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 VLLVDGFSQPFLPLPEAAPGQTQANSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVVVRLCRRSRA
::::::::::.::::::::.: ::.:::::::::::::::::::::::::.: :::::::
CCDS42 VLLVDGFSQPYLPLPEAAPAQGQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVLLCRRSRA
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 ASVGRCSMPEGPFPGRLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETSEFKFLKPIIPNFSP
:::::::.:::::::.:::: :::.:::.:::::::.::: :.::..:::..::
CCDS42 ASVGRCSVPEGPFPGHLVDVRGTGSLSQNYQYEVCLAGGSGTNEFQLLKPVLPNIQGHSF
730 740 750 760 770 780
CCDS42 GPEMEQNSNFRNGFGFSLQLK
790 800
>>CCDS4256.1 PCDHB14 gene_id:56122|Hs108|chr5 (798 aa)
initn: 3963 init1: 3963 opt: 3963 Z-score: 4628.3 bits: 867.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3963; 77.1% identity (91.6% similar) in 774 aa overlap (1-774:1-774)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MEIGWMHNRRQRQVLVFFVLLSLSGAGAELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTEMS
::: . :.::::.:.:::.:: ::.: . :::.:::: :::::::..:::::. :.:
CCDS42 MEIRGALDLRKRQVLIFLVLLGLSRAGTESAHYSVAEETEIGSFVANLARDLGLGVEELS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQAE
.:.::..:. ::..:.: ::.::.::::::.:::: ::::.:::::..::::..:. :
CCDS42 SREARVVSDDNKKYLHLDLLTGNLLLNEKLDRDELCGSTEPCVLHFQVVLENPLQFFRFE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LRVIDINDHSPMFTEKEMILKIPENSPLGTEFPLNHALDLDVGSNNVQNYKISPSSHFRV
: : ::::::: : .::...:: :.. .:. : .. : :::::::..::: :::.::: .
CCDS42 LCVKDINDHSPTFLDKEILIKISEGTTVGATFLMESAQDLDVGSNSLQNYTISPNSHFYI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LIHEFRDGRKYPELVLDKELDREEEPQLRLTLTALDGGSPPRSGTAQVRIEVVDINDNAP
: . : . :::::::. :: :.: .:::::::.::::::.:::. : :.:.:::::::
CCDS42 KIPDSSDRKIYPELVLDRALDYEQEAELRLTLTAVDGGSPPKSGTTLVLIKVLDINDNAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 EFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTGE
:: : .:.::.::. :::: .::.::.:::.: ::::::.:. :::: ::.:.::..::
CCDS42 EFPQSLYEVQVPEDRPLGSWIATISAKDLDAGNYGKISYTFFHASEDIRKTFEINPISGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 VRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPENS
: ::. .:::.. :: . :.::::::::::::::..:.:.:::::.::.:..:. ::::.
CCDS42 VNLRSPLDFEVIQSYTINIQATDGGGLSGKCTLLVKVMDINDNPPEVTISSITKRIPENA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 PEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNIT
: .::.::. : :::.::. : :::..:::.:::. :::.:::.:.:::::..::::::
CCDS42 SETLVALFSILDQDSGDNGRMICSIQDNLPFFLKPTFKNFFTLVSEKALDRESQAEYNIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LTVTDMGTPRLKTEHNITVQISDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
.::::.::::::::.:::: .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITVTDLGTPRLKTEYNITVLLSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 GINAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALREFEFRVSATDRGSPA
: ::::.:::::::: ::::::::::::::::::::::::::::.::::::.::::::::
CCDS42 GTNAQVNYSLLPPQDRHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQEFEFRVGATDRGSPA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPCSATATLHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LLVDGFSQPFLPLPEAAPGQTQANSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVVVRLCRRSRAA
:::::::::.::::::::.:.::.:::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KA1 SVGRCSMPEGPFPGRLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETSEFKFLKPIIPNFSP
::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::: :.::::::::::::
CCDS42 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFQVHDTG
730 740 750 760 770 780
CCDS42 RNMGEIENFRNSFGLNIQ
790
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10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MEIGWMHNRRQRQVLVFFVLLSLSGAGAELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTEMS
:: : . ::::::..::.:. : ::.: :::.:: :.: ..:::.::::: . :..
CCDS42 MEAGGERFLRQRQVLLLFVFLGGSLAGSESRRYSVAEEKEKGFLIANLAKDLGLRVEELA
10 20 30 40 50 60
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pF1KA1 TRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQAE
.: :...:.:::::.::. ::::::.:::::::::::::::::::::.:..:::.. :
CCDS42 ARGAQVVSKGNKQHFQLSHQTGDLLLNEKLDREELCGPTEPCILHFQILLQNPLQFVTNE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LRVIDINDHSPMFTEKEMILKIPENSPLGTEFPLNHALDLDVGSNNVQNYKISPSSHFRV
::.::.:::::.: :.:: ::: :.. :: .::..: ::::: :..::: :.:.:::.:
CCDS42 LRIIDVNDHSPVFFENEMHLKILESTLPGTVIPLGNAEDLDVGRNSLQNYTITPNSHFHV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LIHEFRDGRKYPELVLDKELDREEEPQLRLTLTALDGGSPPRSGTAQVRIEVVDINDNAP
: . ::::::::::::: :: ::.:.: ::::::::::::::::::. :.:.:::::::
CCDS42 LTRSRRDGRKYPELVLDKALDPEEQPELSLTLTALDGGSPPRSGTAQINIQVLDINDNAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 EFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTGE
:: ::.:.: . ::.:..:...:::: ::: :. : :::..:. ::.: ::...::.::.
CCDS42 EFAQPLYEVAVLENTPVNSVIVTVSASDLDTGSFGTISYAFFHASEEIRKTFQLNPITGD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 VRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPENS
..: : ..:: ..:::: :.: :::::::: :...::::::::::..:.:...:::::::
CCDS42 MQLVKYLNFEAINSYEVDIEAKDGGGLSGKSTVIVQVVDVNDNPPELTLSSVNSPIPENS
310 320 330 340 350 360
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pF1KA1 PEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNIT
: :.::::::: :::.::... ::...:::.:::::.::::::.: :::::.:.:::::
CCDS42 GETVLAVFSVSDLDSGDNGRVMCSIENNLPFFLKPSVENFYTLVSEGALDRETRSEYNIT
370 380 390 400 410 420
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pF1KA1 LTVTDMGTPRLKTEHNITVQISDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
.:.::.:::::::..:::: .::::::::.::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITITDLGTPRLKTKYNITVLVSDVNDNAPAFTQISYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 GINAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALREFEFRVSATDRGSPA
: ::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::. :::::.::::::::
CCDS42 GTNAQVTYSLLPPQDPHLPLSSLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGATDRGSPA
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pF1KA1 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPCSATATLHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LLVDGFSQPFLPLPEAAPGQTQANSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVVVRLCRRSRAA
:::::::::.::::::::.:.::. ::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADLLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KA1 SVGRCSMPEGPFPGRLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETSEFKFLKPIIPNFSP
::::::.:::::::..::::::::::::::::::::::: :.::::::::::::
CCDS42 SVGRCSVPEGPFPGQMVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFVAQGAE
730 740 750 760 770 780
CCDS42 RVSEANPSFRKSFEFS
790
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10 20 30 40 50
pF1KA1 MEIGWMHNRRQRQVLVFFVLLSLSGAGA-ELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTEM
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CCDS42 MEASGKLICRQRQVLFSFLLLGLSLAGAAEPRSYSVVEETEGSSFVTNLAKDLGLEQREF
10 20 30 40 50 60
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pF1KA1 STRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQA
: : .:..:.::: ::::. .:.:::.:::::::.::: ::::.:.::::.:.:.:.:::
CCDS42 SRRGVRVVSRGNKLHLQLNQETADLLLNEKLDREDLCGHTEPCVLRFQVLLESPFEFFQA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 ELRVIDINDHSPMFTEKEMILKIPENSPLGTEFPLNHALDLDVGSNNVQNYKISPSSHFR
::.:::::::::.: .:.:..:. :.:: :: :::..: :::::.::..:: :::.:.::
CCDS42 ELQVIDINDHSPVFLDKQMLVKVSESSPPGTTFPLKNAEDLDVGQNNIENYIISPNSYFR
130 140 150 160 170 180
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pF1KA1 VLIHEFRDGRKYPELVLDKELDREEEPQLRLTLTALDGGSPPRSGTAQVRIEVVDINDNA
:: .. :::::::::::: :::::: .::::::::::::::::::::: :::.:.::::
CCDS42 VLTRKRSDGRKYPELVLDKALDREEEAELRLTLTALDGGSPPRSGTAQVYIEVLDVNDNA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 PEFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTG
::::::.:.::: :.::.: ::. ::: :.: :.::.:::.::: ::.:.::...::.::
CCDS42 PEFEQPFYRVQISEDSPVGFLVVKVSATDVDTGVNGEISYSLFQASEEIGKTFKINPLTG
250 260 270 280 290 300
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pF1KA1 EVRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPEN
:..:.::.::: . :::: :.: :.: .:::::.:.::.::::. :.:::::.:::::::
CCDS42 EIELKKQLDFEKLQSYEVNIEARDAGTFSGKCTVLIQVIDVNDHAPEVTMSAFTSPIPEN
310 320 330 340 350 360
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pF1KA1 SPEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNI
.:: :::.::::: :::.::: ::::::::::: :..:::::.::: ::::.::::::
CCDS42 APETVVALFSVSDLDSGENGKISCSIQEDLPFLLK-SAENFYTLLTERPLDRESRAEYNI
370 380 390 400 410
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pF1KA1 TLTVTDMGTPRLKTEHNITVQISDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRD
:.::::.::: : :. :.:: :.:::::::.:::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS42 TITVTDLGTPMLITQLNMTVLIADVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIRSVSATDRD
420 430 440 450 460 470
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pF1KA1 SGINAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALREFEFRVSATDRGSP
:: ::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::. :.:::.:.:.:::
CCDS42 SGTNAQVTYSLLPPQDPHLPLTSLVSINADNGHLFALRSLDYEALQGFQFRVGASDHGSP
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 ALSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQN
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ALSSEALVRVVVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQN
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 AWLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPCSATATLH
:::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS42 AWLSYQLLKATELGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLH
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 VLLVDGFSQPFLPLPEAAPGQTQANSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVVVRLCRRSRA
::::::::::.:::::::: :.::. ::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS42 VLLVDGFSQPYLPLPEAAPTQAQADLLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRA
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 ASVGRCSMPEGPFPGRLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETSEFKFLKPIIPNFSP
:::::: .::::.::.:::.::: ::::::::::::.::: :.:::::::::::: :
CCDS42 ASVGRCLVPEGPLPGHLVDMSGTRTLSQSYQYEVCLAGGSGTNEFKFLKPIIPNFPPQCP
720 730 740 750 760 770
CCDS42 GKEIQGNSTFPNNFGFNIQ
780 790
>>CCDS4257.1 PCDHB15 gene_id:56121|Hs108|chr5 (787 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MEIGWMHNRRQRQVLVFFVLLSLSGAGAELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTEMS
:::::....:: .. :: : :::.::::::::::::..:::::. :..
CCDS42 MEPAGERFPEQRQVLILLLLLEVTLAGWEPRRYSVMEETERGSFVANLANDLGLGVGELA
10 20 30 40 50 60
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pF1KA1 TRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQAE
: ::..:. :.: ::: :::.:..:::::::.:::::::::.:::::...:::.:.::
CCDS42 ERGARVVSEDNEQGLQLDLQTGQLILNEKLDREKLCGPTEPCIMHFQVLLKKPLEVFRAE
70 80 90 100 110 120
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pF1KA1 LRVIDINDHSPMFTEKEMILKIPENSPLGTEFPLNHALDLDVGSNNVQNYKISPSSHFRV
: : ::::::: : :.:: :::::.: ::: :::..: ::::::::::::.:::.:::.:
CCDS42 LLVTDINDHSPEFPEREMTLKIPETSSLGTVFPLKKARDLDVGSNNVQNYNISPNSHFHV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LIHEFRDGRKYPELVLDKELDREEEPQLRLTLTALDGGSPPRSGTAQVRIEVVDINDNAP
. ::::::::::: ::::::. .:::::::.::::::::::.:. : :.: :::::
CCDS42 STRTRGDGRKYPELVLDTELDREEQAELRLTLTAVDGGSPPRSGTVQILILVLDANDNAP
190 200 210 220 230 240
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pF1KA1 EFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTGE
:: : .:.::.:::::.::::. ::::::: :.::.:::.:. :..:.: .:.. ..::
CCDS42 EFVQALYEVQVPENSPVGSLVVKVSARDLDTGTNGEISYSLYYSSQEIDKPFELSSLSGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 VRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPENS
.:: :..::: ..::.. :.:.:::::::::.. ..:.::::: :....:.:::::::::
CCDS42 IRLIKKLDFETMSSYDLDIEASDGGGLSGKCSVSVKVLDVNDNFPELSISSLTSPIPENS
310 320 330 340 350 360
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pF1KA1 PEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNIT
:: ::.: . : :::.::: : :::.:.:: :::::.::: :::: :::::.:::::::
CCDS42 PETEVALFRIRDRDSGENGKMICSIQDDVPFKLKPSVENFYRLVTEGALDRETRAEYNIT
370 380 390 400 410 420
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pF1KA1 LTVTDMGTPRLKTEHNITVQISDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
.:.::.::::::::..::: .::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITITDLGTPRLKTEQSITVLVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 GINAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALREFEFRVSATDRGSPA
: :::::::::::.::::::.::::::.::::::::.:::::::. :::::.::::: ::
CCDS42 GTNAQVTYSLLPPRDPHLPLTSLVSINTDNGHLFALQSLDYEALQAFEFRVGATDRGFPA
490 500 510 520 530 540
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pF1KA1 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPCSATATLHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: ::::::.:
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDVAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLQV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LLVDGFSQPFLPLPEAAPGQTQANSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVVVRLCRRSRAA
:::::::::.::::::::.:.::.:::::::::::::::::::::.:::.::::::::::
CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVFLFVAVRLCRRSRAA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KA1 SVGRCSMPEGPFPGRLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETSEFKFLKPIIPNFSP
::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::...:::::::.::
CCDS42 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSESNDFKFLKPIFPNIVSQDSR
730 740 750 760 770 780
CCDS42 RKSEFLE
>>CCDS4244.1 PCDHB2 gene_id:56133|Hs108|chr5 (798 aa)
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pF1KA1 MEIGWMHNR--RQRQVLVFFVLLSLSGAGAELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTE
:: : ..: .:::::.:::::... :. . :::.:::: ::::::: ::::: . :
CCDS42 MEAGEGKERVPKQRQVLIFFVLLGIAQASCQPRHYSVAEETESGSFVANLLKDLGLEIGE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 MSTRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQ
...: ::..:.:.:.:::. ::::::.::::::::::::::::.: ::::.::::..::
CCDS42 LAVRGARVVSKGKKMHLQFDRQTGDLLLNEKLDREELCGPTEPCVLPFQVLLENPLQFFQ
70 80 90 100 110 120
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pF1KA1 AELRVIDINDHSPMFTEKEMILKIPENSPLGTEFPLNHALDLDVGSNNVQNYKISPSSHF
::::. :.:::::.: .::..:::::. :: : ...: :::::.:..::: :::. ::
CCDS42 AELRIRDVNDHSPVFLDKEILLKIPESITPGTTFLIERAQDLDVGTNSLQNYTISPNFHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 RVLIHEFRDGRKYPELVLDKELDREEEPQLRLTLTALDGGSPPRSGTAQVRIEVVDINDN
.. ... :: :.:::.. :::::.:..:::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS42 HLNLQDSLDGIILPQLVLNRALDREEQPEIRLTLTALDGGSPPRSGTALVRIEVVDINDN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 APEFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMT
.::: . .:.:::::.::.:: :: ::::::: :.::.:::.. : :::: ::.... .
CCDS42 VPEFAKLLYEVQIPEDSPVGSQVAIVSARDLDIGTNGEISYAFSQASEDIRKTFRLSAKS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 GEVRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPE
::. ::...::: . .: : :.::::::::: :....::.:.:::::..:::.: . :::
CCDS42 GELLLRQKLDFESIQTYTVNIQATDGGGLSGTCVVFVQVMDLNDNPPELTMSTLINQIPE
310 320 330 340 350 360
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CCDS42 PALSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQ
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CCDS42 AASVGRCSVPEGPFPGQMVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFVAQG
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CCDS42 AERVSEANPSFRKSFEFT
790
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CCDS42 MMQTKVQNKKRQV-AFFILLMLWGEVGSESIQYSVLEETESGTFVANLTKDLGLRVGEL
10 20 30 40 50
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pF1KA1 STRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQA
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CCDS42 ASRGARVVFKGNRQHLQFDPQTHDLLLNEKLDREELCGSTEPCVLPFQVLLENPLQFFQA
60 70 80 90 100 110
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pF1KA1 ELRVIDINDHSPMFTEKEMILKIPENSPLGTEFPLNHALDLDVGSNNVQNYKISPSSHFR
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CCDS42 SLRVRDINDHAPEFPAREMLLKISEITMPGKIFPLKMAHDLDTGSNGLQRYTISSNPHFH
120 130 140 150 160 170
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pF1KA1 VLIHEFRDGRKYPELVLDKELDREEEPQLRLTLTALDGGSPPRSGTAQVRIEVVDINDNA
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CCDS42 VLTRNRSEGRKFPELVLDKPLDREEQPQLRLTLIALDGGSPPRSGTSEIQIQVLDINDNV
180 190 200 210 220 230
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pF1KA1 PEFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTG
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CCDS42 PEFAQELYEAQVPENNPLGSLVITVSARDLDAGSFGKVSYALFQ-VDDVNQPFEINAITG
240 250 260 270 280 290
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pF1KA1 EVRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPEN
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CCDS42 EIRLRKALDFEEIQSYDVDVEATDGGGLSGKCSLVVRVLDVNDNAPELTMSFFISLIPEN
300 310 320 330 340 350
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pF1KA1 SPEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNI
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CCDS42 LPEITVAVFSVSDADSGHNQQVICSIENNLPFLLRPSVENFYTLVTEGALDRESRAEYNI
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pF1KA1 VLLVDGFSQPFLPLPEAAPGQTQANSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVVVRLCRRSRA
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CCDS42 VLLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRA
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CCDS42 EREMEETPTSRNSFPFS
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pF1KA1 MEIGWMHNRRQRQVLVFFVLLSLSGAGAELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTEMS
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CCDS42 TRGARMHYKGNKELLQLDIKTGNLLLYEKLDREVMCGATEPCILHFQLLLENPVQFFQTD
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CCDS42 LQLTDINDHAPEFPEKEMLLKIPESTQPGTVFPLKIAQDFDIGSNTVQNYTISPNSHFHV
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CCDS42 ATHNRGDGRKYPELVLDKALDREERPELSLTLTALDGGAPPRSGTTTIRIVVLDNNDNAP
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pF1KA1 EFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTGE
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CCDS42 EFLQSFYEVQVPENSPLNSLVVVVSARDLDAGAYGSVAYALFQ-GDEVTQPFVIDEKTAE
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pF1KA1 VRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPENS
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CCDS42 IRLKRALDFEATPYYNVEIVATDGGGLSGKCTVAIEVVDVNDNAPELTMSTLSSPTPENA
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CCDS42 PETVVAVFSVSDPDSGDNGRMICSIQNDLPFLLKPTLKNFYTLVTQRTLDRESQAEYNIT
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pF1KA1 MEIGWMHNRRQRQVLVFFVLLSLSGAGAELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTEM
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CCDS42 ELLIQDINDHSPIFPEREVLLKILENSQPGTLFPLLIAEDLDVGSNGLQKYTISPNSHFH
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CCDS42 ILTRNHSEGKKYPDLVQDKPLDREEQPEFSLTLVALDGGSPPRSGTVMVRILIMDINDNA
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pF1KA1 PEFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTG
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CCDS42 PEFVHTPYGVQVLENSPLDSPIVRVLARDIDAGNFGSVSYGLFQASDEIKQTFSINEVTG
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pF1KA1 EVRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPEN
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CCDS42 EILLKKKLDFEKIKSYHVEIEATDGGGLSGKGTVVIEVVDVNDNPPELIISSLTSSIPEN
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pF1KA1 SPEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNI
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CCDS42 APETVVSIFRIRDRDSGENGKMICSIPDNLPFILKPTLKNFYTLVTERPLDRETSAEYNI
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CCDS42 TIAVTDLGTPRLKTQQNITVQVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRD
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CCDS42 SGTNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGASDRGSP
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CCDS42 ALSSEALVRVLVLDTNDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQN
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CCDS42 AWLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLH
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CCDS42 VLLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRA
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CCDS42 ASVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGDSGTGEFKFLKPIFPNLLVQDT
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CCDS42 GREVKENPKFRNSLVFS
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776 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]