Result of FASTA (omim) for
pF1KA1621
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1621, 776 aa
1>>>pF1KA1621 776 - 776 aa - 776 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7326+/-0.000406; mu= 18.1442+/- 0.025
mean_var=79.2376+/-16.235, 0's: 0 Z-trim(112.2): 420 B-trim: 253 in 2/52
Lambda= 0.144082
statistics sampled from 20644 (21065) to 20644 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.607), E-opt: 0.2 (0.247), width: 16
Scan time: 10.440
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_066008 (OMIM: 606345) protocadherin beta-16 pre ( 776) 4983 1046.1 0
NP_061993 (OMIM: 606334) protocadherin beta-8 prec ( 801) 3987 839.1 0
NP_061760 (OMIM: 606329) protocadherin beta-3 prec ( 796) 3971 835.8 0
NP_061757 (OMIM: 606340) protocadherin beta-14 pre ( 798) 3963 834.1 0
NP_061756 (OMIM: 606339) protocadherin beta-13 pre ( 798) 3944 830.2 0
NP_061758 (OMIM: 606341) protocadherin beta-15 pre ( 787) 3940 829.3 0
NP_061759 (OMIM: 606328) protocadherin beta-2 prec ( 798) 3921 825.4 0
NP_061762 (OMIM: 606332) protocadherin beta-6 isof ( 794) 3917 824.6 0
NP_056484 (OMIM: 606331) protocadherin beta-5 prec ( 795) 3896 820.2 0
NP_061761 (OMIM: 606330) protocadherin beta-4 prec ( 795) 3844 809.4 0
NP_061754 (OMIM: 606337) protocadherin beta-11 pre ( 797) 3839 808.4 0
NP_061755 (OMIM: 606338) protocadherin beta-12 pre ( 795) 3828 806.1 0
NP_061992 (OMIM: 606335) protocadherin beta-9 prec ( 797) 3804 801.1 0
NP_061753 (OMIM: 606336) protocadherin beta-10 pre ( 800) 3732 786.1 0
NP_061763 (OMIM: 606333) protocadherin beta-7 prec ( 793) 3723 784.2 0
NP_001290074 (OMIM: 606332) protocadherin beta-6 i ( 658) 3384 713.7 6.1e-205
NP_037472 (OMIM: 606327) protocadherin beta-1 prec ( 818) 2656 562.5 2.6e-159
NP_114476 (OMIM: 606294) protocadherin gamma-A7 is ( 817) 2185 464.5 7.8e-130
NP_061743 (OMIM: 606294) protocadherin gamma-A7 is ( 932) 2185 464.6 8.6e-130
NP_114475 (OMIM: 606293) protocadherin gamma-A6 is ( 818) 2179 463.3 1.8e-129
NP_061742 (OMIM: 606293) protocadherin gamma-A6 is ( 932) 2179 463.3 2.1e-129
NP_114479 (OMIM: 606297) protocadherin gamma-A10 i ( 850) 2167 460.8 1.1e-128
NP_061736 (OMIM: 606297) protocadherin gamma-A10 i ( 936) 2167 460.8 1.2e-128
NP_115267 (OMIM: 606300) protocadherin gamma-B2 is ( 811) 2156 458.5 5e-128
NP_061746 (OMIM: 606300) protocadherin gamma-B2 is ( 931) 2156 458.6 5.6e-128
NP_114382 (OMIM: 606288) protocadherin gamma-A1 is ( 823) 2137 454.6 7.9e-127
NP_061735 (OMIM: 606288) protocadherin gamma-A1 is ( 931) 2137 454.6 8.7e-127
NP_114398 (OMIM: 606289) protocadherin gamma-A2 is ( 823) 2129 452.9 2.5e-126
NP_061738 (OMIM: 606289) protocadherin gamma-A2 is ( 932) 2129 452.9 2.8e-126
NP_114478 (OMIM: 606296) protocadherin gamma-A9 is ( 828) 2123 451.7 5.9e-126
NP_061744 (OMIM: 606296) protocadherin gamma-A9 is ( 932) 2123 451.7 6.6e-126
NP_114443 (OMIM: 606292) protocadherin gamma-A5 is ( 813) 2122 451.5 6.8e-126
NP_061741 (OMIM: 606292) protocadherin gamma-A5 is ( 931) 2122 451.5 7.6e-126
NP_115270 (OMIM: 606302) protocadherin gamma-B5 is ( 818) 2118 450.6 1.2e-125
NP_061748 (OMIM: 606302) protocadherin gamma-B5 is ( 923) 2118 450.7 1.3e-125
NP_115265 (OMIM: 603059) protocadherin gamma-A12 i ( 820) 2101 447.1 1.4e-124
NP_003726 (OMIM: 603059) protocadherin gamma-A12 i ( 932) 2101 447.1 1.6e-124
NP_114480 (OMIM: 606298) protocadherin gamma-A11 i ( 837) 2099 446.7 1.9e-124
NP_061737 (OMIM: 606298) protocadherin gamma-A11 i ( 935) 2099 446.7 2.1e-124
NP_114442 (OMIM: 606291) protocadherin gamma-A4 is ( 851) 2093 445.4 4.6e-124
NP_061740 (OMIM: 606291) protocadherin gamma-A4 is ( 962) 2093 445.5 5.1e-124
NP_054723 (OMIM: 606295) protocadherin gamma-A8 is ( 820) 2085 443.8 1.4e-123
NP_114477 (OMIM: 606295) protocadherin gamma-A8 is ( 932) 2085 443.8 1.6e-123
NP_115269 (OMIM: 603058) protocadherin gamma-B4 is ( 803) 2084 443.6 1.6e-123
NP_114400 (OMIM: 606290) protocadherin gamma-A3 is ( 829) 2084 443.6 1.6e-123
NP_003727 (OMIM: 603058) protocadherin gamma-B4 is ( 923) 2084 443.6 1.8e-123
NP_061739 (OMIM: 606290) protocadherin gamma-A3 is ( 932) 2084 443.6 1.8e-123
NP_115271 (OMIM: 606303) protocadherin gamma-B6 is ( 820) 2077 442.1 4.5e-123
NP_061749 (OMIM: 606303) protocadherin gamma-B6 is ( 930) 2077 442.1 4.9e-123
NP_115272 (OMIM: 606304) protocadherin gamma-B7 is ( 808) 2071 440.8 1e-122
>>NP_066008 (OMIM: 606345) protocadherin beta-16 precurs (776 aa)
initn: 4983 init1: 4983 opt: 4983 Z-score: 5595.6 bits: 1046.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4983; 99.0% identity (99.5% similar) in 776 aa overlap (1-776:1-776)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MEIGWMHNRRQRQVLVFFVLLSLSGAGAELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTEMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 MEIGWMHNRRQRQVLVFFVLLSLSGAGAELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTEMS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 TRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQAE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LRVIDINDHSPMFTEKEMILKIPENSPLGTEFPLNHALDLDVGSNNVQNYKISPSSHFRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 LRVIDINDHSPMFTEKEMILKIPENSPLGTEFPLNHALDLDVGSNNVQNYKISPSSHFRV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LIHEFRDGRKYPELVLDKELDREEEPQLRLTLTALDGGSPPRSGTAQVRIEVVDINDNAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 LIHEFRDGRKYPELVLDKELDREEEPQLRLTLTALDGGSPPRSGTAQVRIEVVDINDNAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 EFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 EFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 VRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPENS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 VRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPENS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 PEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 PEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LTVTDMGTPRLKTEHNITVQISDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 LTVTDMGTPRLKTEHNITVQISDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 GINAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALREFEFRVSATDRGSPA
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :::::.::::::::
NP_066 GTNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGATDRGSPA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 LSREALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPCSATATLHV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::: ::::::::
NP_066 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKQRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 LLVDGFSQPFLPLPEAAPGQTQANSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVVVRLCRRSRAA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
NP_066 LLVDGFSQPFLPLPEAAPGQTQANSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KA1 SVGRCSMPEGPFPGRLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETSEFKFLKPIIPNFSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 SVGRCSMPEGPFPGRLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETSEFKFLKPIIPNFSP
730 740 750 760 770
>>NP_061993 (OMIM: 606334) protocadherin beta-8 precurso (801 aa)
initn: 3927 init1: 3927 opt: 3987 Z-score: 4476.5 bits: 839.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3987; 79.3% identity (92.4% similar) in 765 aa overlap (10-773:10-774)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MEIGWMHNRRQRQVLVFFVLLSLSGAGA-ELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTEM
:::::: :.::.:: ::: : ::::::::: .:::.::.::::: :.
NP_061 MEASGKLICRQRQVLFSFLLLGLSLAGAAEPRSYSVVEETEGSSFVTNLAKDLGLEQREF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 STRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQA
: : .:..:.::: ::::. .:.:::.:::::::.::: ::::.:.::::.:.:.:.:::
NP_061 SRRGVRVVSRGNKLHLQLNQETADLLLNEKLDREDLCGHTEPCVLRFQVLLESPFEFFQA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 ELRVIDINDHSPMFTEKEMILKIPENSPLGTEFPLNHALDLDVGSNNVQNYKISPSSHFR
::.:::::::::.: .:.:..:. :.:: :: :::..: :::.:.::..:: :::.:.::
NP_061 ELQVIDINDHSPVFLDKQMLVKVSESSPPGTAFPLKNAEDLDIGQNNIENYIISPNSYFR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 VLIHEFRDGRKYPELVLDKELDREEEPQLRLTLTALDGGSPPRSGTAQVRIEVVDINDNA
:: .. :::::::::::: :::::: .::::::::::::::::::::: :::::.::::
NP_061 VLTRKRSDGRKYPELVLDKALDREEEAELRLTLTALDGGSPPRSGTAQVYIEVVDVNDNA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 PEFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTG
::::::.:.::: :.::.. ::. ::: :.: :.::.:::.::: :..::::..:. .::
NP_061 PEFEQPFYRVQISEDSPISFLVVKVSATDVDTGVNGEISYSLFQASDEISKTFKVDFLTG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 EVRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPEN
:.::.::.::: :::: :.: :.::.:::::.:.::.::::. :.:::::.:::::::
NP_061 EIRLKKQLDFEKFQSYEVNIEARDAGGFSGKCTVLIQVIDVNDHAPEVTMSAFTSPIPEN
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 SPEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNI
.:: :::.::::: :::.::: ::::::::::: :: :::::.:: ::::.:::::.
NP_061 APETVVALFSVSDLDSGENGKISCSIQEDLPFLLKSSVGNFYTLLTETPLDRESRAEYNV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 TLTVTDMGTPRLKTEHNITVQISDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRD
:.::::.::::: :. :.:: .::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 TITVTDLGTPRLTTHLNMTVLVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRD
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 SGINAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALREFEFRVSATDRGSP
:: :::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::. :::::.:.:::::
NP_061 SGTNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINTDNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGASDRGSP
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 ALSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 ALSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQN
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 AWLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPCSATATLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
NP_061 AWLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKQRLVVLVKDNGEPPCSATATLH
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 VLLVDGFSQPFLPLPEAAPGQTQANSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVVVRLCRRSRA
::::::::::.::::::::.: ::.:::::::::::::::::::::::::.: :::::::
NP_061 VLLVDGFSQPYLPLPEAAPAQGQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVLLCRRSRA
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 ASVGRCSMPEGPFPGRLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETSEFKFLKPIIPNFSP
:::::::.:::::::.:::: :::.:::.:::::::.::: :.::..:::..::
NP_061 ASVGRCSVPEGPFPGHLVDVRGTGSLSQNYQYEVCLAGGSGTNEFQLLKPVLPNIQGHSF
730 740 750 760 770 780
NP_061 GPEMEQNSNFRNGFGFSLQLK
790 800
>>NP_061760 (OMIM: 606329) protocadherin beta-3 precurso (796 aa)
initn: 3971 init1: 3971 opt: 3971 Z-score: 4458.5 bits: 835.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3971; 77.4% identity (92.1% similar) in 774 aa overlap (1-774:1-774)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MEIGWMHNRRQRQVLVFFVLLSLSGAGAELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTEMS
:: : . ::::::..::.:. : ::.: :::.:: :.: ..:::.::::: . :..
NP_061 MEAGGERFLRQRQVLLLFVFLGGSLAGSESRRYSVAEEKEKGFLIANLAKDLGLRVEELA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 TRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQAE
.: :...:.:::::.::. ::::::.:::::::::::::::::::::.:..:::.. :
NP_061 ARGAQVVSKGNKQHFQLSHQTGDLLLNEKLDREELCGPTEPCILHFQILLQNPLQFVTNE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 LRVIDINDHSPMFTEKEMILKIPENSPLGTEFPLNHALDLDVGSNNVQNYKISPSSHFRV
::.::.:::::.: :.:: ::: :.. :: .::..: ::::: :..::: :.:.:::.:
NP_061 LRIIDVNDHSPVFFENEMHLKILESTLPGTVIPLGNAEDLDVGRNSLQNYTITPNSHFHV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LIHEFRDGRKYPELVLDKELDREEEPQLRLTLTALDGGSPPRSGTAQVRIEVVDINDNAP
: . ::::::::::::: :::::.:.: ::::::::::::::::::. :.:.:::::::
NP_061 LTRSRRDGRKYPELVLDKALDREEQPELSLTLTALDGGSPPRSGTAQINIQVLDINDNAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 EFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTGE
:: ::.:.: . ::.:..:...:::: ::: :. : :::..:. ::.: ::...::.::.
NP_061 EFAQPLYEVAVLENTPVNSVIVTVSASDLDTGSFGTISYAFFHASEEIRKTFQLNPITGD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 VRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPENS
..: : ..:: ..:::: :.: :::::::: :...::::::::::..:.:...:::::::
NP_061 MQLVKYLNFEAINSYEVDIEAKDGGGLSGKSTVIVQVVDVNDNPPELTLSSVNSPIPENS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 PEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNIT
: :.::::::: :::.::... ::...:::.:::::.::::::.: :::::.:.:::::
NP_061 GETVLAVFSVSDLDSGDNGRVMCSIENNLPFFLKPSVENFYTLVSEGALDRETRSEYNIT
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430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LTVTDMGTPRLKTEHNITVQISDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
.:.::.:::::::..:::: .::::::::.::: ::::::::::::::::::::::::::
NP_061 ITITDLGTPRLKTKYNITVLVSDVNDNAPAFTQISYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
430 440 450 460 470 480
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: ::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::. :::::.::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
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pF1KA1 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPCSATATLHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
NP_061 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
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:::::::::.::::::::.:.::. ::::::::::::::::::::::::.::::::::::
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::::::.:::::::..::::::::::::::::::::::: :.::::::::::::
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.:.::..:. ::..:.: ::.::.::::::.:::: ::::.:::::..::::..:. :
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: : ::::::: : .::...:: :.. .:. : .. : :::::::..::: :::.::: .
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: . : . :::::::. :: :.: .:::::::.::::::.:::. : :.:.:::::::
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pF1KA1 PEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNIT
: .::.::. : :::.::. : :::..:::.:::. :::.:::.:.:::::..::::::
NP_061 SETLVALFSILDQDSGDNGRMICSIQDNLPFFLKPTFKNFFTLVSEKALDRESQAEYNIT
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.::::.::::::::.:::: .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
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pF1KA1 SVGRCSMPEGPFPGRLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETSEFKFLKPIIPNFSP
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pF1KA1 MEIGWMHNRRQRQVLVFFVLLSLSGAGA-ELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTEM
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pF1KA1 STRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQA
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NP_061 SRRGVRVVSRGNKLHLQLNQETADLLLNEKLDREDLCGHTEPCVLRFQVLLESPFEFFQA
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pF1KA1 ELRVIDINDHSPMFTEKEMILKIPENSPLGTEFPLNHALDLDVGSNNVQNYKISPSSHFR
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:: .. :::::::::::: :::::: .::::::::::::::::::::: :::.:.::::
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:..:.::.::: . :::: :.: :.: .:::::.:.::.::::. :.:::::.:::::::
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pF1KA1 SPEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNI
.:: :::.::::: :::.::: ::::::::::: :..:::::.::: ::::.::::::
NP_061 APETVVALFSVSDLDSGENGKISCSIQEDLPFLLK-SAENFYTLLTERPLDRESRAEYNI
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:: ::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::. :.:::.:.:.:::
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::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
NP_061 AWLSYQLLKATELGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLH
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NP_061 VLLVDGFSQPYLPLPEAAPTQAQADLLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRA
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pF1KA1 MEIGWMHNRRQRQVLVFFVLLSLSGAGAELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTEMS
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NP_061 ERGARVVSEDNEQGLQLDLQTGQLILNEKLDREKLCGPTEPCIMHFQVLLKKPLEVFRAE
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NP_061 LLVTDINDHSPEFPEREMTLKIPETSSLGTVFPLKKARDLDVGSNNVQNYNISPNSHFHV
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. ::::::::::: ::::::. .:::::::.::::::::::.:. : :.: :::::
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.:: :..::: ..::.. :.:.:::::::::.. ..:.::::: :....:.:::::::::
NP_061 IRLIKKLDFETMSSYDLDIEASDGGGLSGKCSVSVKVLDVNDNFPELSISSLTSPIPENS
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pF1KA1 PEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNIT
:: ::.: . : :::.::: : :::.:.:: :::::.::: :::: :::::.:::::::
NP_061 PETEVALFRIRDRDSGENGKMICSIQDDVPFKLKPSVENFYRLVTEGALDRETRAEYNIT
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pF1KA1 LTVTDMGTPRLKTEHNITVQISDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
.:.::.::::::::..::: .::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 ITITDLGTPRLKTEQSITVLVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
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NP_061 GTNAQVTYSLLPPRDPHLPLTSLVSINTDNGHLFALQSLDYEALQAFEFRVGATDRGFPA
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NP_061 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
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pF1KA1 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPCSATATLHV
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NP_061 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDVAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLQV
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pF1KA1 LLVDGFSQPFLPLPEAAPGQTQANSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVVVRLCRRSRAA
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NP_061 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVFLFVAVRLCRRSRAA
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pF1KA1 SVGRCSMPEGPFPGRLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETSEFKFLKPIIPNFSP
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NP_061 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSESNDFKFLKPIFPNIVSQDSR
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NP_061 RKSEFLE
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pF1KA1 MEIGWMHNR--RQRQVLVFFVLLSLSGAGAELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTE
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NP_061 MEAGEGKERVPKQRQVLIFFVLLGIAQASCQPRHYSVAEETESGSFVANLLKDLGLEIGE
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pF1KA1 MSTRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQ
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NP_061 LAVRGARVVSKGKKMHLQFDRQTGDLLLNEKLDREELCGPTEPCVLPFQVLLENPLQFFQ
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NP_061 AELRIRDVNDHSPVFLDKEILLKIPESITPGTTFLIERAQDLDVGTNSLQNYTISPNFHF
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pF1KA1 RVLIHEFRDGRKYPELVLDKELDREEEPQLRLTLTALDGGSPPRSGTAQVRIEVVDINDN
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NP_061 HLNLQDSLDGIILPQLVLNRALDREEQPEIRLTLTALDGGSPPRSGTALVRIEVVDINDN
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NP_061 VPEFAKLLYEVQIPEDSPVGSQVAIVSARDLDIGTNGEISYAFSQASEDIRKTFRLSAKS
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pF1KA1 GEVRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPE
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NP_061 GELLLRQKLDFESIQTYTVNIQATDGGGLSGTCVVFVQVMDLNDNPPELTMSTLINQIPE
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360 370 380 390 400 410
pF1KA1 NSPEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYN
: . ..:::::::::::.::. . :::.::::.:::::.:::::: :::::.:.:::
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::.::::.::::::::::::: .::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 ITITVTDFGTPRLKTEHNITVLVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDR
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::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::. :::::.:.::::
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NP_061 PALSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQ
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:::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::::::::::::: ::::::
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:::::::::::.: ::::::.:.::. ::::::::::::::::::::::::.::::::::
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790
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pF1KA1 STRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQA
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NP_061 ASRGARVVFKGNRQHLQFDPQTHDLLLNEKLDREELCGSTEPCVLPFQVLLENPLQFFQA
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pF1KA1 ELRVIDINDHSPMFTEKEMILKIPENSPLGTEFPLNHALDLDVGSNNVQNYKISPSSHFR
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NP_061 SLRVRDINDHAPEFPAREMLLKISEITMPGKIFPLKMAHDLDTGSNGLQRYTISSNPHFH
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pF1KA1 VLIHEFRDGRKYPELVLDKELDREEEPQLRLTLTALDGGSPPRSGTAQVRIEVVDINDNA
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NP_061 VLTRNRSEGRKFPELVLDKPLDREEQPQLRLTLIALDGGSPPRSGTSEIQIQVLDINDNV
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pF1KA1 PEFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTG
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NP_061 PEFAQELYEAQVPENNPLGSLVITVSARDLDAGSFGKVSYALFQ-VDDVNQPFEINAITG
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pF1KA1 EVRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPEN
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NP_061 EIRLRKALDFEEIQSYDVDVEATDGGGLSGKCSLVVRVLDVNDNAPELTMSFFISLIPEN
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pF1KA1 SPEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNI
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NP_061 LPEITVAVFSVSDADSGHNQQVICSIENNLPFLLRPSVENFYTLVTEGALDRESRAEYNI
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NP_061 ALSSEALVRLLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQN
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NP_061 AWLSYQLLKATELGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLH
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NP_061 VLLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRA
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NP_061 ASVGRYSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYKVCLTGGSETNEFKFLKPIMPNFPPQGT
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pF1KA1 MEIGWMHNRRQRQVLVFFVLLSLSGAGAELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTEMS
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NP_056 TRGARMHYKGNKELLQLDIKTGNLLLYEKLDREVMCGATEPCILHFQLLLENPVQFFQTD
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pF1KA1 LRVIDINDHSPMFTEKEMILKIPENSPLGTEFPLNHALDLDVGSNNVQNYKISPSSHFRV
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NP_056 ATHNRGDGRKYPELVLDKALDREERPELSLTLTALDGGAPPRSGTTTIRIVVLDNNDNAP
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NP_056 EFLQSFYEVQVPENSPLNSLVVVVSARDLDAGAYGSVAYALFQ-GDEVTQPFVIDEKTAE
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pF1KA1 VRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPENS
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NP_056 PETVVAVFSVSDPDSGDNGRMICSIQNDLPFLLKPTLKNFYTLVTQRTLDRESQAEYNIT
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: ::::::::::::.::: :::::::::::::::::::::::::. :::::.::::::::
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pF1KA1 MEIGWMHNRRQRQVLVFFVLLSLSGAGAELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTEM
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NP_061 ELLIQDINDHSPIFPEREVLLKILENSQPGTLFPLLIAEDLDVGSNGLQKYTISPNSHFH
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pF1KA1 VLIHEFRDGRKYPELVLDKELDREEEPQLRLTLTALDGGSPPRSGTAQVRIEVVDINDNA
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NP_061 ILTRNHSEGKKYPDLVQDKPLDREEQPEFSLTLVALDGGSPPRSGTVMVRILIMDINDNA
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pF1KA1 PEFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTG
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NP_061 PEFVHTPYGVQVLENSPLDSPIVRVLARDIDAGNFGSVSYGLFQASDEIKQTFSINEVTG
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pF1KA1 EVRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPEN
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NP_061 EILLKKKLDFEKIKSYHVEIEATDGGGLSGKGTVVIEVVDVNDNPPELIISSLTSSIPEN
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pF1KA1 SPEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNI
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NP_061 APETVVSIFRIRDRDSGENGKMICSIPDNLPFILKPTLKNFYTLVTERPLDRETSAEYNI
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pF1KA1 TLTVTDMGTPRLKTEHNITVQISDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRD
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NP_061 TIAVTDLGTPRLKTQQNITVQVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRD
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pF1KA1 SGINAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALREFEFRVSATDRGSP
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NP_061 ALSSEALVRVLVLDTNDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQN
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pF1KA1 VLLVDGFSQPFLPLPEAAPGQTQANSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVVVRLCRRSRA
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NP_061 VLLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRA
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NP_061 GREVKENPKFRNSLVFS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]