FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA1622, 873 aa 1>>>pF1KA1622 873 - 873 aa - 873 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3504+/-0.000422; mu= 11.3712+/- 0.027 mean_var=130.1301+/-26.299, 0's: 0 Z-trim(114.2): 28 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.112431 statistics sampled from 23890 (23914) to 23890 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.28), width: 16 Scan time: 7.970 The best scores are: opt bits E(85289) NP_478144 (OMIM: 616790) serine/threonine-protein ( 873) 5672 932.3 0 XP_011535340 (OMIM: 616790) PREDICTED: serine/thre ( 792) 5148 847.3 0 XP_016877017 (OMIM: 616790) PREDICTED: serine/thre ( 786) 5037 829.3 0 XP_016877018 (OMIM: 616790) PREDICTED: serine/thre ( 766) 4982 820.4 0 XP_005267987 (OMIM: 616790) PREDICTED: serine/thre ( 766) 4982 820.4 0 XP_016877019 (OMIM: 616790) PREDICTED: serine/thre ( 766) 4982 820.4 0 XP_011535342 (OMIM: 616790) PREDICTED: serine/thre ( 766) 4982 820.4 0 XP_011535341 (OMIM: 616790) PREDICTED: serine/thre ( 766) 4982 820.4 0 NP_066009 (OMIM: 616790) serine/threonine-protein ( 120) 635 114.8 2.5e-25 >>NP_478144 (OMIM: 616790) serine/threonine-protein phos (873 aa) initn: 5672 init1: 5672 opt: 5672 Z-score: 4978.5 bits: 932.3 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5672; 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